1SUXA

Crystallographic analysis of the complex between triosephosphate isomerase from trypanosoma cruzi and 3-(2-benzothiazolylthio)-1-propanesulfonic acid
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
ASKPQPIAAANWKCNGSESLLVPLIETLNAATFDHDVQCVVAPTFLHIPMTKARLTNPKFQIAAQNAITRSGAFTGEVSLQILKDYGISWVVLGHSERRLYYGETNEIVAEKVAQACAAGFHVIVCVGETNEEREAGRTAAVVLTQLAAVAQKLSKEAWSRVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEVHELLRRWVRSKLGTDIAAQLRILYGGSVTAKNARTLYQMRDINGFLVGGASLKPEFVEIIEATK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Trypanosoma cruzi
publication title Inactivation of triosephosphate isomerase from Trypanosoma cruzi by an agent that perturbs its dimer interface.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase, glycosomal
total genus 91
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2004-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1suxA00
4NU7A 3G1VA 3IVTA 3BV4A 3TNOA 3RF9A 3C2VA 3PUDA 3CEPA 3W7CA 1NF0A 1WOAA 5CGQA 1J4EA 1N7KA 4UTLA 2QCMA 3A9IA 4JDBA 3NL3A 1F74A 3QQ1A 5D09A 3W2MA 3QRHA 4PL1A 2E6AA 4GC4A 3TDFA 1WYIA 3LHWA 4GUGA 1VCVA 2VFIA 3GNNA 3QM3A 1KLYA 4IMDA 2YR1A 2NZLA 4Z0JA 1JUBA 1UASA 3DFSA 2RDUA 5D30A 1XL9A 1JCXA 1OYCA 3GDTA 3TU9A 1NF7A 1SZFA 1TJRA 1K7EA 1Q6LA 1YXCA 4XTDA 1ICSA 5EY5A 1XUUA 2QUUA 3E02A 3ELFA 1GJPA 5AHEA 5L9FA 3EX3A 2QDGA 3W1QA 3ZR4A 4MUZA 2GOUA 1ONRA 2CLFA 3QSTA 4LVBA 4NX0A 1TCDA 3MYOA 1LLWA 1FY6A 3DHDA 4MY1A 5D37A 3HG3A 4XKYB 3I6RA 1GVFA 2X1SA 3HIJA 4RXFA 3LXAA 5D32A 5LGZA 3GDKA 3M43A 1KV8A 3OIXA 4J9JA 7TIMA 5C6MA 1I2PA 5C54A 2EPHA 1DV7A 2ZRVA 2J27A 1KM1A 2IQTA 2ZA1A 4UFJA 1DL3A 4YL2A 3P84A 2J9YA 1KM2A 4KWWA 5G4EA 1BKSA 3W2NA 3ATYA 1DKWA 2QUVA 4CQ8A 3PVFA 1MO0A 5AHIA 2Z6JA 1FWWA 4JX5A 2PE4A 3I7QA 5CSRA 3SI9A 4XWUA 2HTMA 1W5OA 2OJPA 1QMLA 3LBCA 4D2JA 3TQKA 1RQEA 5HMSA 1UBSA 4RZ6A 3PBWA 3TQVA 2OX1A 1VCGA 3KRSA 1QFEA 4MYAA 2H3DA 1B9BA 3NO5A 5K3VA 2ISVA 3N2XA 4UTWA 5LKYA 1EEPA 3PB2A 3MI3A 1PHWA 2YCEA 3EWWA 4O14A 3A22A 2A7PA 4O1CA 5LNUA 3QJAA 3W71A 4GUHA 3SR7A 4DO5A 2DJLA 4UNKA 2FQIA 1DOSA 1VR6A 3B0VC 3GNDA 3W2JA 2E5CA 3SSJA 5HR6A 4AWTA 1B4EA 2W6RA 1SFLA 3P5ZA 3FEMA 4M19A 3WK1A 1ZAIA 2ZZ3A 3U8GA 3TUUA 4QNEA 3TROA 2C15A 5HUPA 3TSMA 3W1NA 3CU2A 3TAOA 5HULA 4C1LA 2R94A 2H8ZA 3W73A 1I8JA 4XTIA 3HQ1A 3EKLA 4M6VA 2B7OA 2Y61A 2Z2UA 3OG3A 3W85A 1G4SA 1FQ0A 2CLEA 4AWSA 1P1XA 3HB9A 3U2OA 3FJ6A 1IGSA 1PV8A 3E9AA 1K3UA 1KFJA 3NQ7A 1BEUA 2FPVA 1TPWA 3PBVA 3W75A 3W7KA 3PBYA 4FHAA 2WSQA 5K9DA 4O10A 5KINA 5CZ0A 3M6YA 3MBFA 4Z0SA 4XKYA 1G67A 1NEYA 5E1QA 3NXFA 4MJZA 1JCNA 5K4XA 4AHQA 4TMCA 4O8RA 2BX7A 4HT3A 4OV4A 1ICPA 4LC6A 4UFHA 3FFSA 2G97A 2X1TA 4UFLA 3B06A 4IXXA 4JTGA 4ZQRA 1PVNA 1J2WA 4IPJA 4FEZA 3BK0A 2Z6IA 4MZ8A 1JVNA 2NUWA 2PRMA 3PB0A 1HUVA 1W5MA 1SSGA 1T96A 1ZAHA 3O05A 1EA0A 1RV8A 3IEBA 3M41A 4KFNA 1SSDA 2JBMA 3C3NA 3LHTA 3V1PA 3GZ3A 4IXHA 1SFJA 4WXZA 3LHZA 3A21A 3M5VA 4K6AA 5AB3A 4NT0A 1X1ZA 4RCXA 4MOZA 1OF6A 4FB7A 1X6UA 1HTIA 4FNSA 4RK8A 3UPBA 3IIOA 1OJXA 2V2CA 3USBA 5BOOA 3IV3A 4ZVJA 5KTLA 4CCEA 4ZL1A 3W1LA 3L5MA 2AAMA 2XN0A 1KA9F 3MWAA 3LCLA 5AFDA 3IVSA 2ZZ7A 4P61A 3MHGA 3STFA 1YPIA 3W1PA 5F1VA 3C0JA 1VC4A 2ZBTA 2YYUA 2X2GA 5KSWA 4IMGA 3KFTA 1KM6A 3G3MA 1CI1A 1P4CA 2X1RA 1JCLA 1L9WA 5I3HA 1ZNNA 3KRUA 2Y70A 2E77A 3LOTA 2AGKA 1SW0A 4K8EA 1JJKA 3G0XA 1H7OA 1HO4A 2BZNA 3QEZA 1K7FA 2D73A 4IJBA 2UV8G 1MXSA 4NJIA 4ML9A 4BF9A 1N55A 3G1XA 3C56A 3B03A 3TCEA 5E0KA 1TQXA 2KZHA 1FDYA 1VHCA 1TPEA 3EEGA 3TJLA 2TRSA 2WSRA 2ZFAA 3NAVA 4OT7A 4PC8A 5K7JA 3FKKA 4FNUA 3PWAA 4JR5A 1Z42A 1H1ZA 1KM3A 2CZEA 1OFAA 1SU5A 5KZEA 2WO5A 2J9ZA 3TFXA 3PULA 2QCDA 3O6YX 4PFMA 3LM7A 1G4TA 1DHPA 2GJNA 3PC0A 3NL2A 3O15A 4UTMA 3F1QA 5DY3A 3DI1A 4IMEA 4A3UA 2BWGA 5HWMA 4O54A 4FNTA 5H91A 2X1UA 5I3JA 4RZ4A 3NOEA 3P67A 3T4CA 3WJZA 2QCLA 3GDMA 2J24A 2C16A 1YADA 2FDSA 3W6YA 1O4UA 1OFPA 3GAYA 2C3ZA 2NXGA 4BI7A 3TIMA 4ZQOA 1O5XA 4NUWA 1JULA 4MKNA 2RH9A 4JICA 4TIMA 2V0TA 2ZZ1A 3DHFA 1EIXA 2R91A 3NM1A 2Y7FA 3UWYA 1KM4A 4WY0F 1QWGA 1OX6A 1U83A 4JX4A 3EWZA 1H63A 4QNWA 3YPIA 2TYSA 4OGZA 2V9DA 3W7GA 4MLJA 5T26A 3H55A 3BARA 3FYPA 1KFKA 2F84A 4RZ5A 5LHEA 3LDVA 1EP1A 1XDLA 3G24A 1DJNA 3IVUA 3OVQA 3GXTA 4UTHA 1R2RA 3L2IA 4A29A 3HG5A 1P5BA 3P8IA 3SECA 1AW2A 3PG9A 3D0CA 3S5OA 3W22A 4M7SA 4JTJA 4PL2A 1P0KA 3S1VA 5KMYA 4NVTA 1JQVA 2A0NA 2VFEA 3PR2A 1H51A 1LLZA 3W72A 1ZCOA 3LCGA 4GWEA 5D2TA 3IIPA 4X2RA 3M5YA 5AC6A 3S5NA 3EWBX 3HPXA 3ABOA 3O16A 1FWTA 4WUIA 1KM5A 4IGHA 3LV6A 1H7PA 2RDTA 3RFAA 3TSDA 3CEUA 3T7VA 1LROA 4UMBA 3P7YA 3A5FA 2Q3RA 3LXCA 3LTPA 1EWDA 4NQ1A 3QPYA 2GVGA 3M44A 3LLFA 1I45A 1TQJA 1M7PA 1SR9A 2Y62A 1AL8A 1W0MA 5EBUA 1S5WA 4RJEA 4DPPA 1OFDA 4UR8A 4O57A 3S42A 2V30A 4OV9A 3HPZA 5FEPA 5D04C 1EP2A 1D3HA 1ZHAA 1BWLA 3LCIA 1ZAJA 2ABAA 2FIQA 2HMCA 4JXCA 2NXIA 3NYZA 3CT7A 4ZQMA 1KTNA 4UTTA 1I2RA 3LI1A 2WNZA 3M9YA 3U6WA 2PRLA 3M7WA 4OWGA 4UTWC 4UC5A 5D38A 3GDLA 3KOFA 3I68A 3TC7A 4LVAA 2VKZG 1GG0A 2F7FA 4N2YA 2LLEA 1TPVA 1OVDA 3L68A 3G0UA 3W1MA 3CM4A 3OVRA 3V75A 3HG4A 3QMRA 1J5TA 4S1FA 1X8FA 3NL5A 4HPXA 5CG7A 1OX5A 1VPXA 4HSOA 2VEIA 5FF2A 4LRSA 2ABBA 4N02A 1TPH1 1SZGA 3PAJA 2VFDA 1AL7A 1F05A 4ADUA 4DEFA 2YZRA 4LVDA 3CHVA 3L5LA 2C14A 2NX1A 2VENA 4G1KA 2JKEA 4JTEA 4JYDA 3W1UA 4I7UA 3LTYA 4UXDA 3A5VA 1FWNA 3K30A 3QFEA 2CW6A 5F4SA 3HO8A 1OX4A 3ABQA 4JTSA 1GYLA 5FI8A 1C29A 4S2CA 1W8SA 2OT1A 3HJZA 2WNQA 5C5YA 3ZWTA 4EIVA 2GVJA 2DZWA 4AH7A 4YXGA 1EPXA 1TPUA 1NSJA 3WK0A 2FJKA 3NEVA 1L2UA 4FXSA 1SO4A 2QCEA 4I7WA 4QITA 4WOZA 2DP3A 5FEZA 3CPRA 2JKPA 5EKYA 3L67A 4ORMA 1FX6A 1LRNA 5AN7A 1M5WA 1JQXA 4AF0A 2Q3OA 1ME7A 1XFBA 1F2JA 2DZXA 3E0IA 3C8FA 4N6EA 1AW1A 1SQ7A 2FB2A 1VQTA 3C4UA 3N19B 3NGJA 2CZFA 1W37A 1R46A 3IGUA 3MJYA 3NPWA 4NZJA 2CFFA 3LCXA 3O06A 3S5YA 1MEIA 4Y96A 4JDYA 1JR1A 4NZFA 2CZDA 2NXHA 4R7JA 3TE9A 1IXPA 2NUYA 1LYXA 4HNNA 1VJIA 1TYGA 3ANYA 1ADOA 4N9EA 1MZHA 4UFMA 3R12A 2QR6A 3N2MA 2Y7DA 3G8EA 2E5BA 4UTKA 3B0UX 3GXNA 4JY8A 4POCA 3SY5A 1CW2A 1K8ZA 4Z1AA 3EX2A 3LGEA 5K9XA 3T44A 3KRZA 5LGXA 2QF7A 2AQWA 1GTHA 1Z48A 4PEKA 1W3NA 1VZWA 4JTIA 3LCWA 2CWNA 1BWKA 4LC8A 1T0OA 4DBEA 3NQVA 2WV8A 3W1AA 3LRMA 1H60A 2EGZA 4LW7A 3EXRA 1TPC1 2C0AA 3C2OA 3PUEA 2DZPA 2QJGA 5E93A 3NQMA 1Z44A 1FCQA 4LY8A 4UUIA 4TO8A 2A5HA 3G1DA 4LV4A 4ONVA 3KVLA 2J6XA 1SZEA 5CKSA 2FPYA 1XDMA 4RKAA 4JIPA 4JEQA 2GQ9A 4AEOA 2I9EA 3S5ZA 4FO4A 5DBUA 1NFBA 3I7RA 1YXYA 2A7NA 1FWSA 4XBKA 2VFGA 1YPFA 5LSMA 1WOBA 4UFIA 1FXPA 1GG1A 1G69A 4N6FA 3WK3A 5HWNA 1H7WA 2YX0A 3W1XA 2QCGA 5AHNA 3BGJA 2NX9A 1GT8A 4C1KA 3HGJA 4MY8A 1PCWA 1G4EA 2W79A 1IXOA 3HBLA 3QPZA 2FFCA 3ZS4A 1OFRA 5F2LA 3B8DA 3F4NA 2DU2A 3P61A 1VCFA 3PM6A 4YMZA 1DBTA 4PA8A 2A1YA 1W5PA 2HS6A 4MVAA 1NAL1 3TR2A 5TIMA 5DXYA 4O17A 2XN1A 4AAJA 1JRBA 1GOXA 3OVPA 4GUFA 2VFFA 1XBZA 2C1HA 1R30A 2YYTA 5D2WA 3UNDA 2GPTA 3P81A 1YTEA 2V5LA 4IOTA 3L0KA 5L6UA 1H1YA 4JNMA 5DCBA 1VGAA 3CLMA 4XQ6A 4NXKA 5LNSA 3VKJA 3SZ8A 3H53A 4Z1BA 3WJSA 3B0PA 3SJ3A 2OZ0A 2V8ZA 5DY2A 5TQLA 4YWIA 2G95A 3DKLA 2EAWA 2Y63A 1LM1A 3Q58A 3P62A 3W9ZA 3IGXA 4Y8FA 4JY9A 2ZZ2A 1K8YA 1LOSA 1HL2A 3DBPA 2QCDB 1A5AA 3M0ZA 3GKFA 3KVJA 5D2VA 1PE1A 2ZZ4A 1Q6RA 2GJLA 2BSLA 4LVGA 1WAUA 1G4PA 5GVJA 3WJXA 1I2OA 1LORA 3SIZA 3GK0A 3C52A 5SWUA 2Q8ZA 4JD4A 4JIQA 4HNVA 5LNWA 4O15A 3W7HA 1K8XA 3MO7A 4DPQA 1QOPA 1LBLA 5BRBA 2C6QA 2GQAA 3W7EA 4ADSA 1GVSA 4QM1A 4OU1A 5MHBA 3HPSA 5HJLA 3CIWA 2FLIA 4ZQCA 3GVGA 4BK9A 4BWLC 2QEZA 3QF0A 3KX6A 3M1ZA 5EPDA 4IUOA 4NJJA 3O6DA 1OFBA 4NJGA 3RK8A 3UD6A 3G0SA 2BTMA 2Q8LA 3E12A 5EYWA 1L6SA 4K8HA 4O11A 4UNLA 1H7RA 4N4QA 4ALDA 1CX9A 4NNCA 3RLVA 1V7YA 1QPOA 1LDCA 1PIIA 4O13A 4I7VA 4NJKA 1QR7A 3W7JA 5FF0A 4UTTC 4WY0A 1OABA 1XBXA 1C8VA 3G1SA 3L0GA 2QAFA 4QAIA 3LHUA 3THQA 2Y88A 2V2DA 4HNTA 3F03K 3SGZA 2YPIA 1ICQA 4ADTA 4JS3A 3LRLA 3EX6A 2P1FA 4PCFA 4I9AA 4MFEA 4GJ1A 2ZTKA 1DVJA 2H3BA 1X1OA 3THAA 4RLIA 4HIBA 3KVKA 3LXBA 4N9BA 3DGRA 3W7QA 1THFD 4EVZA 2PC4A 3GAKA 1TRDA 4O0KA 1FWRA 1GQNA 4XBSA 1T8XA 3W2KA 3M5ZA 1K03A 1RQHA 5D33A 5H2ZA 1BTMA 4TR9A 3W7MA 1W31A 2BLEA 1TTIA 5BW6A 3TC6A 5F2MA 3MHFA 3PY2A 1WDWA 3LTSA 1EUNA 4ZZ9A 3S0CA 4M7TA 5AYXA 4U28A 1GEQA 5CPOA 1JCYA 1LTDA 3LERA 1WX0A 4DF0A 5AYZA 5CZSA 3DH7A 3T40A 3C2FA 3UWWA 4EOUA 2QCFA 3LV5A 4JN6A 1UUMA 4GXMA 3VE7A 3P82A 4Z08A 2E68A 3TMQA 3EWUA 1L6WA 1VYSX 3CQ0A 3O6CA 4CCDA 1HFBA 1QPNA 2JKAA 5I3IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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