1SZG | Genus

Total Genus 135

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	135
sequence length	412
structure length	391
Chain Sequence	GETKEDIARKEQLKSLLPPLDNIINLYDFEYLASQTLTKQAWAYYSSGANDEVTHRENHNAYHRIFFKPKILVDVRKVDISTDMLGSHVDVPFYVSATGLCKLGNPLEGEKDVARGCGQGVTKVPQMISTAASCSPEEIIEAAPSDKQIQWYQLYVNSDRKITDDLVKNVEKLGVKALFVTVDAPSLGQREKDMKLKFSNALSKFIDPSLTWKDIEELKKKTKLPIVIKGVQRTEDVIKAAEIGVSGVVLSNHGGRQLDFSRAPIEVLAETMPILEQRNLKDKLEVFVDGGVRRGTDVLKALCLGAKGVGLGRPFLYANSCYGRNGVEKAIEILRDEIEMSMRLLGVTSIAELKPDLLDLSTLKARTVGVPNDVLYNEVYEGPTLTEFEDA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Saccharomyces cerevisiae
publication title	Altered Substrate Specificity in Flavocytochrome b(2): Structural Insights into the Mechanism of l-Lactate Dehydrogenation pubmed doi rcsb
molecule keywords	Cytochrome b2, mitochondrial
total genus	135
structure length	391
sequence length	412
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.1.2.3: L-lactate dehydrogenase (cytochrome).
pdb deposition date	2004-04-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00173	Cyt-b5	Cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain
A	PF01070	FMN_dh	FMN-dependent dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1szgA01

5G2WA 5AYZA 1GG0A 1QOPA 1ZCOA 4QM1A 3GZ3A 2V2CA 3KVJA 2YZRA 4YXGA 1YPIA 1OYAA 1PV8A 3NQ2A 1A53A 1OVDA 3MI2A 3MP4A 4I7WA 1Z48A 3NZ1A 4HIBA 4J9JA 4K6AA 2YYTA 3NDOA 2VELA 3A5VA 1B3OA 3KRZA 3S1XA 2OCZA 4Y8FA 2JGQA 2QCEA 1H7OA 2ISSA 3GNNA 1JJKA 4HPJA 5CSSA 2TMDA 4O16A 1B9BA 3HGSA 1N55A 4AH7A 2FPVA 3DFQA 5LNRA 1NF0A 3DFSA 5DBTA 1T99A 3B8DA 3RLVA 1FWWA 4IWWA 2JBMA 1KFBA 4GUIA 4Z1DA 3M16A 1QPQA 2HSAA 2A7RA 2GJLA 2YGYA 3WJWA 3NQGA 1QDSA 1PCKA 3SY5A 4M6VA 3NL6A 4WUIA 1KW1A 3OEXA 4CQ9A 5DCDA 3ABSA 4O1BA 2E77A 2WSQA 1Q3NA 3SFKA 3BG5A 3QMSA 4YMZA 4QISA 4A21A 1LRNA 3LBMA 3C2RA 1F74A 3W7GA 2PRMA 2CWNA 3WJYA 5DY3A 3O15A 2VEMA 3PUEA 1OFDA 2FFCA 2RFGA 3EX1A 1TPEA 3M1ZA 3W7HA 3R2GA 3W2NA 1LDCA 1YPFA 4FNTA 1KBIA 3NR0A 4RXGA 3B0UX 2E68A 2DZTA 4N9BA 4DF0A 1W5NA 4JIPA 2OX1A 1EIXA 4R34A 3CPRA 4RK8A 1NEYA 2FLIA 2J24A 3LERA 2ZZ6A 3IVUA 1WXJA 2OT1A 4RZ4A 3UY7A 5G1YA 1IGSA 3UXDA 5CPNA 3HF3A 3TW7A 2E5CA 3C3NA 1W3NA 3O05A 4OE7A 4RX0A 2Z6IA 4BWLA 2FQIA 3W1PA 2Z0IA 1FDJA 4K39A 3FJLA 1UBSA 1NSJA 2WPBA 4O0ZA 4BI6A 1J5TA 3GDMA 2C14A 1SO3A 3LHUA 3CIWA 1WYIA 3S1UA 4AWTA 4WXYA 5D33A 3EWWA 4M6QA 3I7QA 4BK9A 1H1ZA 1XCFA 3QQ1A 3VE7A 3R13A 1UUMA 1D3HA 3LGEA 3DXIA 4JYEA 5A8GA 2DZSA 4IMDA 1EWDA 1GYLA 3ELFA 1DQXA 3HGOA 5G4EA 2ZFAA 5F1VA 1W3IA 4JY9A 4MZ8A 2A21A 2YCEA 3LM7A 1KM5A 3W1MA 1LOSA 3TJXA 1FWSA 2QDGA 3VI2A 3OA3A 2FDSA 4AB4A 4UMBA 2YSWA 3MO7A 1H7NA 1ICPA 3SIZA 2GPTA 1MEHA 4JDBA 5LSMA 2H3BA 3W74A 3M41A 4I7VA 4NX0A 3BW3A 4OV4A 3N9RA 1KFEA 3LCHA 3B04A 3CT7A 1H5YA 4UTTC 1WAUA 4FF7A 2ZRUA 4LTSA 3VNDA 4HSOA 1TSIA 4UNKA 4O28A 3U6WA 5AHFA 1OJXA 1DQWA 3TNOA 5CPMA 3M47A 1B4EA 3EX6A 1FQ0A 2QCHA 2ZBTA 3IIXA 4JTEA 1SFLA 4N9EA 3EWYA 2GQ9A 3H55A 3SI9A 2JKAA 1TV5A 3GK0A 1GVFA 1RV8A 2P0OA 4IMGA 4HT3A 4Y90A 4XZ9A 3G0XA 3HPZA 4OT7A 4E38A 2JKPA 1WDWA 4Z1BA 2PC4A 2QDHA 4KFNA 4O1CA 1RPXA 1TTQA 1IXQA 3F03K 2Y6ZA 4FB7A 4Y6GA 3O16A 2Q8LA 2H8ZA 1R2RA 4N6EA 1XXXA 4OGZA 4IGHA 5LNVA 2DU2A 2NXIA 1GQNA 4X9SA 5ABTA 3T44A 2WNQA 3NPUA 3N2MA 4JX4A 3C56A 3TXVA 1LOLA 2QCMA 1CX9A 4O57A 1QO2A 4P2VA 1KTCA 4BR1A 4LUJA 2FPYA 2GUUA 2H6RA 2QAFA 2WJZA 3LTPA 5EY5A 1KV5A 5KITA 1WQ5A 8TIMA 3QPYA 4ZVJA 1TTJA 2B0MA 3G1DA 1A5BA 3LTYA 4X2RA 1F7BA 1CW2A 4XQ6A 5G4WA 5IBXC 2A6NA 4L4LA 4LY8A 2PURA 3NO5A 1DL3A 3ZR4A 6TIMA 3GXNA 2ZTJA 2ZA1A 2XN0A 3L67A 3W23A 4JGDA 4R7JA 4UTWC 2G5WA 5BMXA 1SQ7A 5DXXA 1G4EA 3MHGA 1SZGA 2A7PA 1LBMA 3W3OA 3PBVA 1W0MA 5HUOA 4QQ3A 1H7XA 1C9DA 5FEWA 3FEMA 1LOQA 3C8FA 5F2IA 3PULA 1SW0A 4BI7A 1IIGA 1P1XA 1FXQA 1GOXA 3KRSA 3G1FA 2ZYFA 4UTUA 3NQMA 2Y61A 4KFPA 5D2TA 4M19A 4NX5A 2Y62A 5HWNA 1TRDA 3NQCA 4WX2A 1KTBA 1G7UA 5AB3A 3TFXA 1VS1A 3GR8A 3LXCA 3KRUA 1JUEA 1HO1A 4BF9A 4AWSA 1LRQA 1TTPA 4A2SA 2NWRA 3DU0A 4QJ1A 1DBTA 3W7PA 4DPPA 1X1OA 3VE9A 4ADSA 3WK1A 1QWGA 1PCWA 1F6PA 4LWWA 4PH6A 3P82A 4UNLA 4WOZA 2A85A 3ABQA 3HMJG 3W9ZA 4JTTA 4MKNA 5H2ZA 3N14A 4GUGA 3G3DA 1VLIA 2BX7A 3BGJA 4JTKA 4CLMA 4IUOA 2PCQA 3HOJA 3OVQA 5CGQA 1M5WA 3W1XA 3Q58A 1H51A 3GB6A 2CLFA 3EWBX 3G24A 3UQNA 5D09A 3PVFA 1RZMA 4XKYB 5G2HA 4OU1A 1GTHA 3T40A 5EMUA 4WY0A 1OX4A 1LTDA 1KFJA 3NG3A 4IXHA 2QCCA 4UTMA 1ZAJA 5F2MA 4K38A 3GR7A 2E6YA 1S3HA 2ZDRA 3OG3A 1U83A 1TJRA 3QPZA 3FA5A 1ZALA 1DKWA 5EBUA 1JCXA 3CB8A 5CPOA 3NXFA 3C0JA 1L6SA 3W7QA 1UB3A 2AGKA 4NNCA 5MHBA 4LNYA 2QAPA 3NQ8A 1R2TA 1ZHAA 4P61A 4NXKA 1YDNA 5U4NA 3QW3A 4O52A 3W75A 1IXOA 3EXSA 2C16A 1VC4A 4HNNA 1P0NA 1MZHA 1TPB1 3EWUA 4C1KA 3ANYA 1F2JA 3GDLA 1VCVA 5I3HA 1DHPA 3I7RA 1YXCA 1LBFA 4MY1A 2OZ0A 3ZS4A 2XFWA 2AAMA 3UWYA 1KM6A 1JUKA 3W7JA 3GDKA 3LXBA 1NFBA 1FUYA 1JUBA 5F4WA 1QO5A 1SZFA 4UXDA 5G1TA 6ALDA 3N2XA 5D32A 1GVQA 3DKJA 3DFOA 3MWAA 1L6WA 4MYXA 4XUGA 3EWXA 3NL2A 5H91A 1MSSA 1Q6QA 4IJBA 1I2PA 3SZ8A 4JNMA 3DENA 4O12A 3TMQA 4JTSA 3TXZA 1C8VA 3PC0A 4FXSA 3TCEA 1QAPA 2JGYA 3W73A 3PUDA 3TJLA 3TAOA 5AC7A 1R46A 2QCDB 3W85A 3ZWSA 2NLIA 3STGA 1ME8A 3IVTA 3C52A 1Z44A 3MMTA 1O94A 2A7NA 2TPSA 1IIHA 4GUHA 4R53A 3NQEA 1I2RA 2YDAA 1EP1A 5AHEA 4FNUA 4NXSA 3LCWA 1K8XA 3W76A 1QNVA 2V0TA 4FNSA 2R14A 1AK5A 4TO8A 5CZSA 3UNDA 1TPFA 4N2YA 4FNQA 4I7UA 1SPQA 1GPWA 4YLWA 1Q6RA 2QCNA 3NZRA 1ME9A 4DO6A 4MY9A 1TPC1 1KFLA 5CZJA 4R33A 5AYXA 1ML1A 3U8GA 3LHTA 4S2BA 2ZRYA 1EP2A 3LRMA 3NM3A 4GFSA 2I1OA 3NYZA 3INPA 2PRHA 4AEOA 1T0OA 4O4VA 1AW2A 1N7KA 1JQXA 4LUIA 4Z08A 3GDRA 1YDOA 3O1NA 3L5LA 2WSRA 2V2HA 2CLEA 4AF0A 3HGJA 4HNUA 5F1UA 1GG1A 1EB3A 3DKLA 4ADTA 2E5BA 4MYAA 2GVGA 4HSNA 3QSRA 5AHMA 3QSTA 3B0VC 4NJGA 3TUUA 3B4UA 3G22A 1FCVA 4AWUA 1Y0EA 2UV8G 5TQLA 3W88A 3CEUA 3TU9A 2HS6A 5DBUA 4HNVA 2DZVA 2HS8A 3O8AA 4MUZA 3MBDA 2Y70A 4PC8A 3W1QA 1VYPX 3RFAA 1XC4A 5K9CA 4X3ZA 4GNJA 2DJLA 2B7OA 1H50A 3S9YA 1WV2A 2E6AA 2GJNA 5HULA 4CNPA 1XFBA 3LCLA 3RF9A 2YW3A 3HIJA 3OVPA 3NGJA 3PBWA 3H54A 1THFD 3PSVA 3W2UA 4Q32A 1YTEA 2CLIA 3TSBA 3IGUA 5KSWA 1W54A 3TIMA 4MIMA 4O4WA 3IGXA 1EX5A 4ZQCA 1OG0A 1FDZA 1XL9A 1OK4A 1W1ZA 2YFOA 3SJ3A 3GIYA 3HJZA 3G8RA 4ZZ9A 4NNBA 1OYCA 3KX6A 3L65A 3SECA 3LI0A 2GOUA 1RR2A 3TSMA 3S0CA 1QPOA 4OV9A 3W1LA 5TIMA 3MI3A 1YLVA 1NAL1 4K36A 4YCOA 4ZQPA 1AL8A 3GNDA 4DO5A 2W0UA 3W87A 2CLKA 4O0KA 4RLIA 4DXVA 3IV3A 3BG3A 4WZHA 1KBJA 3G0UA 3PB2A 2VOMA 3P7YA 3W7OA 2VENA 3NQ6A 3LRLA 5AYYA 1OX6A 4JDYA 4PL2A 3FYOA 3NNTA 5D2VA 1G6CA 2DZPA 1LP6A 1P0KA 2G96A 5L6UA 2DZXA 3NPVA 2ATMA 1TTIA 1VYRA 1VQTA 4JICA 2W6RA 4HPXA 4UR7A 2C15A 3HBLA 2QEZA 3G1SA 4JY8A 1L9WA 1TV8A 2HTMA 2CLLA 5DELA 3WK0A 3I65A 3DHFA 3W7IA 3EKZA 5K9XA 3C61A 4AMAA 4IMFA 3LX9A 4KKXA 3IRDA 3BLIA 3NAVA 1L6YA 1FY6A 3PF3A 1LRTA 3GVGA 1XBZA 3QC3A 1S5WA 3LHWA 1EPXA 2WV8A 3W7NA 3W1RA 1DJNA 3PBYA 4ML9A 2EKCA 4EWND 5IBXA 4KWWA 4Z1AA 3BLEA 2Q8ZA 1EA0A 3MW7A 1R47A 4XWUA 4LT9A 4IPJA 5HINA 1A5CA 1SFJA 4K8EA 5HWMA 3IIZA 3PWAA 3R89A 3LHVA 5BW6A 2B7NA 3T78A 3STEA 5D38A 5FESA 1TIMA 4M7SA 3N73A 4G1KA 4O15A 2ABBA 4ZL1A 3L21A 2BWGA 3G8EA 2GQAA 3QQ0A 3QF0A 3CIXA 5SWUA 4OHQA 4O8RA 3C2OA 1G69A 2ZRVA 2ZZ5A 1MO0A 2P10A 4JTGA 1XBXA 4JD4A 1BEUA 1GTEA 4JX6A 1AMKA 1KFCA 3O6YX 1H7PA 3G1YA 3SGUA 4MJMA 3LXAA 1OFAA 2TYSA 4N6FA 1C29A 3W1AA 5K2ZA 3KVLA 3ATYA 3MJYA 2E09A 4RZ5A 1EUAA 2WO5A 4GE8A 3QZEA 2ZQ0A 3D0CA 2TRSA 2X1TA 1XUZA 4H4IA 1HO4A 3L2IA 3W86A 5C55A 1CI1A 3KOFA 3N9SA 1H1YA 2J88A 1KM1A 2C18A 1K7FA 1VH7A 1OFBA 5CSRA 5AC6A 1PVNA 4FX8A 4DF2A 1B4KA 3IIOA 3L0NA 2J9ZA 4UTLA 3M5XA 4LC6A 4DQWA 4FIRA 3M43A 3DH7A 3MUXA 5D2XA 1OFQA 1TPDA 2QJGA 1HL2A 1QR7A 3SSJA 4UFLA 5LNWA 3EEGA 1TPVA 2RKXA 3WK2A 3LV6A 1ALDA 1H7WA 2X30A 2E6DA 3HPXA 4IX2A 4Q33A 1WBHA 4LU0A 3MP3A 3BW4A 4ORMA 2QJHA 1VGAA 1TMHA 1X1ZA 3TX9A 3P61A 2O7QA 3TH6A 2EGZA 4IPIA 1I8JA 4Z1CA 2V9DA 4A2RA 3KHJA 4Y96A 1VCFA 3PAJA 5AHIA 3CU2A 4DF1A 2NXHA 4OBTA 1VRDA 3MHUA 2RH9A 3R8RA 2V2DA 4JYDA 5AC8A 4PODA 5EPDA 5CPLA 2QJIA 1G4PA 4EVZA 1D3GA 3C6CA 1H63A 1TQXA 3TSDA 4JN6A 3NL3A 2QCGA 3E12A 1JRCA 4O18A 3L66A 3HG5A 2G95A 4UTKA 1AL7A 4DO4A 1TQJA 3TMLA 3LDVA 2YX0A 4IMCA 2HMCA 2E6FA 5LNUA 4UTJA 4GRSA 1O60A 2JKEA 5DXYA 1ZAIA 3QEZA 3TKFA 3RU6A 4GJ1A 1PL9A 1EWEA 3GKFA 3GAYA 3FLUA 3SR7A 3IIPA 1TV7A 2ZRWA 1Z42A 3WK3A 5CKSA 5BOOA 3PY2A 2Q3OA 4CCDA 5I3FA 3VCRA 2C13A 3EX4A 4WY0F 1XDLA 2ALDA 4QNEA 1YXDA 2EAWA 1KLZA 1G7VA 3V1PA 1VCGA 2EPHA 5K4XA 3TQ0A 2CZFA 3DBPA 3WJZA 3GYEA 3LTSA 1K8ZA 1DOSA 5FEXA 3TE9A 3W83A 5FF0A 4EOUA 1BWKA 1TPH1 3FJ6A 3KXQA 1P5BA 1NF7A 1XBYA 3P5YA 1FDYA 3UZJA 2O7SA 2VEPA 1R2SA 3S1WA 1Z41A 1Q6OA 2EF9A 2ISVA 1F05A 4RZ6A 2NV2A 2ZZ1A 2CLHA 3GX9A 1QFEA 3OHIA 4NUWA 3GLCA 4N9CA 1OX4B 1FWNA 3CC1A 3S8HA 3GAKA 3C2FA 3W7KA 3G1VA 4A29A 2ABAA 3A5FA 1UUOA 3P74A 3KVKA 2YR1A 2X1SA 3NQDA 1M7PA 3L68A 3NA8A 5U7SA 4EIVA 2VXNA 5F4SA 1SW7A 5HMSA 4LRTA 3SGZA 3P67A 5EKYA 2V8ZA 4LV4A 2Y63A 3L0KA 3E02A 1D9EA 3BG9A 4C1LA 3G0SA 2AQWA 5CG7A 4XBSA 1IXPA 3W7EA 3RNDA 3TDFA 1RVGA 4UR8A 3EX2A 3CM4A 2DJXA 2V5BA 2NV1A 4NJJA 2Y89A 2YW4A 3TC7A 1WBJA 1LZOA 2Z2UA 1FBAA 1Q6LA 2Y7FA 3NPXA 2DZWA 3TR2A 3TW6A 4UTHA 1WX0A 1A5SA 1O5XA 1VLWA 3G1XA 3FS2A 4XKYA 2J27A 3NM1A 3B03A 3RMJA 3A24A 3UD6A 5D37A 2ZZ7A 4GBUA 5E93A 3H53A 3UY8A 4H3DA 5D30A 3O06A 3U2OA 1MXSA 5D05A 2WQPA 3PS7A 3M6YA 4JTJA 1LBLA 4TX9A 4Z0SA 1I2NA 1WA3A 3S6DA 4JTUA 3W7RA 2C1HA 4DBDA 2IQTA 5FEZA 3EKLA 3LHZA 1EEPA 4O19A 3W2LA 1W37A 4AHOA 1P4CA 3B06A 5LHFA 2C0AA 4BI5A 3ABRA 4O10A 4IQLA 1JCJA 4ICNA 3DFPA 5BNKA 4XTIA 2YXGA 3W1NA 1I45A 3C4UA 4UFHA 3HG3A 4Q4KA 3Q37A 2QCFA 4TIMA 3VFLA 4ZQMA 2CZ5A 3G3MA 3WJXA 2F84A 1K8YA 4MLRA 2H8XA 4LV9A 3R5EA 3TFCA 2FIQA 5LNSA 2BSLA 4PTNA 1U5JA 1V7YA 2QUUA 1HFBA 2Y7DA 1GVSA 3CTLA 4JTIA 1S5TA 1O95A 3I68A 3HG2A 4M5PA 1H7RA 1SO5A 1L2UA 3FOKA 4N4QA 3THQA 4FX7A 1FWRA 2D73A 4U28A 2NX3A 5I3GA 3DI1A 1ZY9A 3UYCA 3QMTA 3IVSA 4LOCA 4FIQA 3W6YA 5EL1A 3QRHA 1J2WA 4AAJA 2QCDA 1N8FA 2J9YA 1E51A 4N02A 2E5DA 3W7DA 3W7CA 1QPRA 4JX5A 3M9YA 4RKAA 3UWQA 3TAKA 3NEVA 3P81A 2OJPA 3JR2A 4WOQA 4CCEA 4H6KA 3PG9A 3DGRA 3QW4B 3M44A 3RK8A 3TROA 2BXVA 3LOTA 3YPIA 4GXMA 4S1FA 4YL2A 3W72A 3ZFHA 4PA8A 2VFIA 4MLJA 3BARA 2QR6A 1ONRA 2VFHA 3FFSA 5G2IA 3A21A 2VFGA 1VHNA 4O54A 1GVOA 1W56A 1Q45A 1SZEA 3N34A 4UUIA 4TU1A 4PEKA 1V5XA 4LVGA 2A0NA 1QPNA 4PCFA 3LCGA 1OFPA 4YWIA 4FHAA 1DJQA 4Y9AA 1O4UA 1RQBA 2B7PA 2ZZ4A 2F7FA 4HKPA 1UASA 4NNAA 4L4MA 1OHLA 2ISWA 2A4AA 5HJLA 4W9TA 5J5RA 3G1HA 5AN7A 5HWJA 1AG1O 1M6JA 2PE4A 1SO4A 3IGSA 1GYNA 1KM3A 2Y7EA 3LLFA 1SR9A 2X16A 2BZNA 3NOEA 4UMAA 3BLFA 5KZEA 1OFOA 2VC6A 4LVBA 5HNRA 5I3KA 2RDUA 3FYPA 1XBVA 3R12A 3I6RA 3M5ZA 3O6CA 3PR2A 2I14A 3G1AA 2ZCGA 1W5QA 1MEWA 4A22A 1K03A 1ME7A 4MZYA 1SZNA 2XN1A 4DEFA 1F5ZA 4UTTA 4O1AA 1FWTA 3E0IA 1FCQA 1G4SA 1VHCA 1GT8A 1JCMP 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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