1TA3A

Crystal structure of xylanase (gh10) in complex with inhibitor (xip)
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
AGGKTGQVTVFWGRNKAEGSLREACDSGMYTMVTMSFLDVFGANGKYHLDLSGHDLSSVGADIKHCQSKGVPVSLSIGGYGTGYSLPSNRSALDLFDHLWNSYFGGSKPSVPRPFGDAWLDGVDLFLEHGTPADRYDVLALELAKHNIRGGPGKPLHLTATVRCGYPPAAHVGRALATGIFERVHVRTYESDKWCNQNLGWEGSWDKWTAAYPATRFYVGLTADDKSHQWVHPKNVYYGVAPVAQKKDNYGGIMLWDRYFDKQTNYSSLIKYYA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Dual Nature of the Wheat Xylanase Protein Inhibitor XIP-I: STRUCTURAL BASIS FOR THE INHIBITION OF FAMILY 10 AND FAMILY 11 XYLANASES.
pubmed doi rcsb
molecule keywords xylanase inhibitor protein I
molecule tags Hydrolase inhibitor/hydrolase
source organism Emericella nidulans
total genus 99
structure length 274
sequence length 274
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ta3A00
2XVKA 1UH4A 2XWDA 2AAAA 4WIWA 2G3MA 1UHVA 1BF2A 4PMXA 1JNDA 2WCGA 3AIWA 4PCTA 2X2YA 2MANA 3APGA 1AMYA 5IHSA 1B3VA 4D6IA 5M5DA 1C90A 3PTMA 4ACYA 1HP5A 3AYRA 1UKSA 3ARQA 5CLTA 6CGTA 4U5IA 3FHAA 5KEZA 1FH9A 3AS0A 4DWSC 4OZOA 1J18A 1UD3A 4QLJA 3ARYA 3OZPA 3HJEA 5CPSA 2WCAA 1QW9A 1VFOA 5D9MA 2GJXB 3WFLA 4F79A 4WKHA 4J3VA 5AYIA 3SCOA 1DEDA 3OGRA 1H11A 1JDAA 4D6EA 4W86A 3VD4A 3T08A 1K9EA 5LA1A 4EE9A 3VNZA 1H09A 4KRUA 4AD5A 5BROA 1JZ8A 2OYLA 3W27A 3ZSSA 1JZ4A 4K68A 2EO7A 1W1VA 2J78A 1UWRA 3OGSA 5A1AA 4QCEA 4HOWA 1H49A 1ODZA 1VEPA 4BZYA 1I75A 1R87A 3ARXA 2JE8A 3EDDA 3BGAA 4AEEA 1EDQA 1XSKA 3O9NA 2ZX7A 1H0GA 3WDHA 2YIHA 3OLGA 3K8KA 4PCSA 2VQTA 4U2ZA 4UTFA 5FOOA 1OCQA 1CXEA 1OB0A 2J7FA 3KWXA 1RP9A 1LLOA 3K4AA 3CZGA 4DWSA 2ZOXA 4AZGA 4KGLA 3ARUA 3L2LA 1ZBKA 4AZ5A 3ALGA 4CN1A 1W1PA 1OGGA 3VGFA 4L4OA 3DC0A 3VIIA 5FL1A 3VX1A 1B2YA 1VFUA 4GI9A 1ISWA 4BQ5A 2FGLA 2ZUWA 4Z2HA 1WPCA 4CU7A 2WHMA 4AD3A 3AIUA 1Q6GA 4OIFA 5DFAA 4LX4A 1Z32X 4QP0A 2YA0A 1CYGA 1V3HA 2VX5A 1K9FA 1W2PA 1QNOA 4WKAA 3WH6A 1W3KA 3CZKA 2W5FA 1KWKA 3BAJA 3WDJA 4JL2A 1UD6A 3NCOA 1KXVA 2A3AA 5E6ZA 3CH9A 3RDKA 1KFWA 3F5LA 1BPLB 4J7RA 5I23A 2YL9A 4WSJA 1W9VA 3A47A 4AIEA 2E40A 5HPOA 3CPUA 1BSIA 3NSNA 3CZJA 5HNNA 1VF8A 1E6XM 2XSAA 2WXDM 5ABFB 4E2OA 1XGZA 2HISA 2WZHA 1UR9A 2J8GA 3A4WA 3SCQA 2VO5A 3EYPA 2UY3A 4CN4A 4P7QA 1ZS2A 1MW0A 2VCCA 1E70M 2JEQA 1F4AA 5FD0A 3CUFA 1L8NA 3NJ3A 1XD0A 4E8DA 4Z2LA 3W81A 2DT1A 2JIEA 3WL1A 1CEOA 1U33A 1V6VA 2CHOA 1VRXA 1UG6A 3VIMA 4AW7A 4DM2A 4PMVA 3GNRA 5FCZA 4M8UA 1E55A 4MNMA 2PWGA 1Y7VA 2WWDA 1ZU8A 1K9TA 4W7VA 1XSIA 5HOSA 1UH2A 1U30A 2EPNA 2XVPA 1WZMA 3DHPA 1E4IA 1XCWA 3WDQA 5F7UA 1B1YA 3AJ7A 3L4YA 4CD5A 1TG7A 4A4AA 2VR4A 3GZAA 5E0CA 1GHRA 2VC9A 1WCGA 3ZQ9A 4P8UA 2BFGA 1ITCA 4TVUA 2J4GA 1QPKA 1LL6A 1GONA 3K8MA 2G41A 1PBGA 3D3AA 2XIBA 2J47A 4PTWA 4ZEPA 2UWFA 1FHLA 3FHQA 5JBEA 1W9BM 1B9ZA 1B30A 2TAAA 1M04A 4Q22A 3RILA 2XHYA 5BRPA 2WMFA 4UOJA 1UUQA 1WNOA 2DH2A 3WNLA 1BLIA 3N1AA 2FDMA 1DWJM 4ACZA 4ATWA 1HL8A 4P8VA 1JZ3A 2XGIA 1DWGM 2EXOA 4PSRA 4GZJA 2EJ1A 1E43A 5LA2A 5A6SA 2EBNA 1AQHA 2ZX8A 3ARZA 4AY1A 2B31A 4OJYA 3IK2A 4P7RA 4OUEA 3WH8A 1WDQA 4KH2A 2CNCA 3WDIA 1BYDA 1V3IA 2YDSA 2WKLA 2YBTA 1GOKA 3T2OA 3W38A 3A4XA 2VJXA 5A2BA 1OT2A 1R86A 4PEEA 5JBDA 3M07A 1Q6DA 1UZ4A 4LYRA 2GJRA 3VGGA 1NH6A 1VFFA 2VZSA 2A3HA 3MMWA 1E6RA 3RCNA 1IZKA 3OGVA 2WK2A 1KQYA 2WANA 3AMCA 3G6MA 4ZE4A 4LYQA 3B9AA 2VT0A 3BMVA 1P6WA 3NUKA 4U5KA 3WD2A 4WK9A 4R27A 3I3BA 1V3MA 4GO9A 1W1TA 2WZEA 4CKQA 4NSBA 1FFQA 2NW0A 2JEPA 3OIHA 3AISA 5BYWA 1EQPA 1ISXA 1E0WA 3CUIA 1XV8A 4PRWA 1M03A 3GBDA 1QBAA 2O9TA 1FH7A 4W84A 2DQXA 1EO7A 3EBVA 2D1ZA 1XH1A 2V3EA 1NQ6A 4UQEA 3SUWA 2DT2A 3WH5A 5JIWA 1R8LA 1RP8A 3AYSA 4IM4A 3SIMA 4EK7A 3MV01 1RH9A 4RE3A 4PTMA 1GW1A 3AMGA 3UR7A 2CETA 1O7AA 2PI6A 3ZMRA 2VZOA 3WL0A 1DHKA 1KQZA 1EIBA 3ZOAA 1H1NA 2DIEA 1HVXA 2G3JA 4UQ9A 5C71A 4WLCA 2XFYA 1DWAM 4S3KA 3UESA 1ZBVA 3DHUA 2C7FA 2CESA 4CUCA 1WP6A 3CHDA 2D3LA 2XWEA 1HKMA 1VEMA 1PPIA 3UEQA 1X1NA 1NWRA 4PUEA 3NDYA 1EXPA 4HZ6A 2GK1A 4W88A 3VDHA 1L0PA 1E4NA 3ZR5A 2WLYA 2GJXA 2ZXDA 2QMJA 1B0IA 4HOZA 3WH9A 1VJSA 1JZ2A 2Z1SA 2BY2A 2FH6A 2NSXA 3OG2A 5A6LA 1MXDA 4P7OA 1GVYA 4D6GA 4UFMA 3CZLA 4UQDA 5DO8A 4P7NA 2WSPA 3K4DA 1CGTA 3AI0A 1PZ3A 2GJPA 4HA3A 3GYCA 2WM0A 3ARRA 5D8ZA 1G94A 3L4UA 4HPHA 1PIGA 1MVYA 4JCLA 1EA9C 2YDRA 1GOWA 2HVMA 3TTYA 3UG3A 4A3HA 4FLOA 2OWCA 2IXUA 5IXEA 4URIA 5DF0A 1V02A 3CHEA 4LPCA 2JF7A 1QI3A 3MU7A 3VKKA 1JI2A 2WVVA 2WKGA 2DT0A 2WVUA 1KXQA 3WMCA 3WEZA 2PWFA 2FHBA 4N42A 4F8XA 5C8BB 4OOZA 2DT3A 1KBKA 3CLWA 1WE5A 3KE0A 2W66A 1ECEA 1ZL1A 2BHZA 1H3GA 3UERA 2CERA 2W67A 1CXHA 3KL3A 2YLAA 2VMFA 1EGZA 1OGSA 1G0CA 5CSUA 4BQ4A 4NRSA 1E4LA 4V27A 4Z2JA 3PZ9A 1FA2A 3TP4A 3NSXA 5JUVA 1W2VA 1V0KA 4JFUA 4D6CA 1XH2A 3WH7A 2EPMX 1MXGA 1GJUA 2OYMA 5CPQA 1EHAA 2ZIDA 1UR2A 4AD1A 1M01A 9CGTA 1GNXA 5M17A 1JIBA 4DUXA 3RMEA 1QNPA 5A8MA 2YA1A 2ZE0A 1G5AA 4D71A 5A2AA 4CVUA 3DYOA 1E71M 4D1JA 2J8FA 2BHYA 3ZJ7A 2DPEA 1C3FA 4PMOA 3E1F1 4H8HA 2PF0A 4AXNA 2ZUVA 2E4TA 1KGUA 3AXHA 1H0IA 2QF8A 2DSKA 3GH5A 3CUJA 4CU8A 1FH8A 4ZFMA 2D24A 1OM0A 3WD4A 3T2QA 1BFNA 2V5DA 5CXPA 4PSPA 1WB0A 3VNYA 1US3A 1NOFA 1UD5A 4B3KA 2J7CA 3L4VA 4CU6A 1W3HA 4HZ7A 2WHJA 1V3JA 3J7HA 3ZSTA 4GO8A 2ZWYA 3F5JA 1DWIM 2D0HA 3QHMA 2FGZA 3FXYA 4W93A 1J9YA 4FF5A 2WCSA 1WAWA 2E9MA 1E73M 4NI3A 5BXSA 1RD6A 3SCNA 1TCMA 3II1A 4AMCA 4BQ3A 3WNOA 1HJSA 1HJUA 2QV4A 1RPKA 4MJ2A 3W6MA 2Y8VA 4F9JA 4H04A 3ZM8A 1W9XA 3OZOA 5BXRA 1W3JA 4BCEA 4PMZA 1HJWA 1WZLA 3MANA 1GORA 3EDFA 4FLRA 3VD3A 4UFIA 1ZJAA 1KXTA 4B16A 1GOIA 3IJ9A 4D6JA 4UFKA 4X9YA 2YLLA 2BHUA 1BYBA 1J10A 3VGDA 1JZ6A 1CZ1A 1ISVA 5BXPA 2ZX9A 4FLQA 1XYZA 5AY7A 1VEOA 1CGYA 4E8CA 1CXFA 4HU0A 1K6AA 2GDVA 4UFLA 1QHOA 4PBGA 2O9RA 1TMQA 3BCDA 3VM5A 2W63A 1OIFA 1BQCA 1CDGA 3WF1A 1VIWA 5CPTA 4MB3A 3POHA 1HJVA 4CD7A 3GXFA 1BTCA 1V6YA 4JHZA 3ECQA 2X0HA 5E09A 1QHZA 1JGIA 4QDMA 1KGWA 2PBOA 3GXIA 1B31A 1E6ZA 1HN1A 1ZBCA 3WUEA 2Y4SA 2WBGA 3M6DA 3N17A 4YPJA 4AD2A 1LF1A 4IPNB 4CD4A 2V3FA 3U7VA 5D9PA 4TUFA 3VMPA 1UWIA 2W92A 1VJZA 1TE1A 4UNIA 4JKKA 4FK9A 4UZSA 3VIFA 5JIPA 1H2JA 4MB1A 4ZENA 4LXFA 1BAGA 1HKJA 2WC3A 4YN5A 4TTUA 1BYCA 1NARA 2GSJA 2O9OA 3WUGA 1JD9A 1M53A 3AIQA 3W82A 4GQQA 4OKDA 1V08A 1XYFA 1E6NA 3VIHA 2WWCA 3CHCA 3VX0A 3WNPA 1I1WA 2OSYA 3EMCA 1JFXA 2WVSA 1UYQA 2YDQA 4JKLA 2D23A 4LGXA 1VB9A 4AZ7A 3AZSA 3A4AA 1VAHA 4QFUA 3N04A 1XCXA 5I77A 1UD4A 3W6LA 2E8ZA 2XTKA 3F5KA 2XYLA 5A6MA 1Q6FA 1B90A 4MNKA 3VGBA 1GJWA 4WF7A 5DEZA 4AEFA 3RIKA 1CWYA 4Z2KA 4H7VA 1FOBA 2WPGA 4L4PA 3UG4A 3ZIZA 4GKLA 4JL1A 4OBRA 3DYPA 1HKIA 3NIYA 1UKTA 1JL8A 2D20A 1OIMA 1E15A 2XIIA 2O9PA 3VDBA 1Q4NX 4KMQA 5GQBA 2J25A 5A94A 1GQIA 3K1DA 1OSEA 2X05A 1IZJA 4W5ZA 1J12A 7TAAA 4Q7NA 3BAYA 1TR1A 4B15A 1JXJA 3WEMA 4PTVA 3T2PA 3GTNA 1CGVA 4AD4A 1IV8A 1UWSA 2ZXQA 1JDDA 3F4VA 5I3DA 1PIFA 5E0FA 1S46A 2VR5A 1WO2A 4W7UA 4KGJA 1HX0A 1JG9A 2ZX5A 1XSJA 4J28A 4Z2GA 3AS2A 1E0XA 5HBFA 2X8RA 4DUWA 3ZT6A 2BVDA 4GI6A 4JKMA 1DP0A 1BHGA 1E9LA 2VRQA 4MPKA 3GH4A 2WHKA 1C93A 2W4XA 1TVNA 3AFBA 5DT5A 1UA3A 1G9HA 4AZIA 3RJXA 3VINA 4AYSA 2CXGA 3ZJKA 3UCQA 3S6TA 4WKFA 1MW3A 1NWTA 4UFJA 3SCVA 3EMZA 2X09A 2CIPA 3EMQA 1CPUA 1JYVA 2QMKA 1CLVA 3VGEA 4GQRA 1UKOA 3ARSA 1OT1A 2D0FA 1EO5A 3W37A 2ZUMA 1PEZA 4ZXOA 3PTQA 4D6FA 5E70A 2CEQA 4DWSB 2V5CA 2J75A 1ODUA 3GXDA 2RGMA 3OBAA 3K46A 4QAWA 1CGWA 4V2XA 5E9AA 4A3YA 1EOKA 4XX6A 2VVNA 2WBKA 2EPLX 3PZUA 2BY0A 2VZVA 2J79A 3WQ4A 4HA4A 2D22A 2E8YA 3VVGA 3WNKA 3VD7A 2CPUA 2YKKA 5FKYA 1GOQA 4M56A 4YHGA 3QR3A 1SYTA 4OBSA 3A3HA 3CBWA 3OLDA 1UD8A 1J0ZA 2D2OA 3QOKA 1OD8A 4AD0A 1E4MM 2VX4A 1FP8A 4RL3A 3UG5A 5A6KA 3WD0A 4F9DA 2BNJA 2WSKA 3ZR6A 1KR1A 3W26A 2VURA 4BF7A 3MSDA 2J7GA 4U2YA 1UR0A 1PX3A 3AIBA 3VIGA 5TD4A 1XC6A 2VZUA 5I5RA 4YHEA 4PN2A 2IXVA 5A69A 3QHOA 4Z2IA 3N12A 5A6AA 3CUGA 4MAZA 3ZO9A 1CENA 1K9DA 1CTNA 1CXLA 8CGTA 1A3HA 1E1EA 5EFFA 5ABEA 4ATLA 4AZHA 5CQ1A 4UQAA 2XPKA 2WNWA 3ARTA 4C7GA 4DM1A 1QI2A 3AIEA 1AQMA 1BG9A 2NT0A 1MYRA 3WQ5A 1E1FA 4S3JA 3CTTA 1D2KA 1HL9A 3BAXA 4MNJA 3MMUA 4GI8A 4CGTA 5CGTA 3T0BA 1I1XA 3AHTA 2CBUA 5IFTA 4UFHA 2PWEA 1ESWA 1E6SM 5M3WA 3U5UA 2E3ZA 1UA7A 1VFMA 4UOQA 5AC4A 2WB5A 2Z1KA 3AROA 3BAKA 4BS0A 4F66A 2BVTA 2XM1A 5BXTA 2J7DA 3RM9A 1JZ7A 2OYKA 3GNPA 4EKJA 3WF3A 3TONA 1CECA 3ZJ8A 3G6LA 5A6JA 2CBVA 5LYRA 1LG2A 1UKPA 1C7TA 2GDUA 1E6QM 2DSVA 3VU2A 1AQ0A 3B9EA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2XVK A;  1UH4 A;  2XWD A;  2AAA A;  4WIW A;  2G3M A;  1UHV A;  1BF2 A;  4PMX A;  1JND A;  2WCG A;  3AIW A;  4PCT A;  2X2Y A;  2MAN A;  3APG A;  1AMY A;  5IHS A;  1B3V A;  4D6I A;  5M5D A;  1C90 A;  3PTM A;  4ACY A;  1HP5 A;  3AYR A;  1UKS A;  3ARQ A;  5CLT A;  6CGT A;  4U5I A;  3FHA A;  5KEZ A;  1FH9 A;  3AS0 A;  4DWS C;  4OZO A;  1J18 A;  1UD3 A;  4QLJ A;  3ARY A;  3OZP A;  3HJE A;  5CPS A;  2WCA A;  1QW9 A;  1VFO A;  5D9M A;  2GJX B;  3WFL A;  4F79 A;  4WKH A;  4J3V A;  5AYI A;  3SCO A;  1DED A;  3OGR A;  1H11 A;  1JDA A;  4D6E A;  4W86 A;  3VD4 A;  3T08 A;  1K9E A;  5LA1 A;  4EE9 A;  3VNZ A;  1H09 A;  4KRU A;  4AD5 A;  5BRO A;  1JZ8 A;  2OYL A;  3W27 A;  3ZSS A;  1JZ4 A;  4K68 A;  2EO7 A;  1W1V A;  2J78 A;  1UWR A;  3OGS A;  5A1A A;  4QCE A;  4HOW A;  1H49 A;  1ODZ A;  1VEP A;  4BZY A;  1I75 A;  1R87 A;  3ARX A;  2JE8 A;  3EDD A;  3BGA A;  4AEE A;  1EDQ A;  1XSK A;  3O9N A;  2ZX7 A;  1H0G A;  3WDH A;  2YIH A;  3OLG A;  3K8K A;  4PCS A;  2VQT A;  4U2Z A;  4UTF A;  5FOO A;  1OCQ A;  1CXE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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