1TA3B

Crystal structure of xylanase (gh10) in complex with inhibitor (xip)
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
ASLNDLFVAAGKSYFGTCSDQALLQNSQNEAIVASQFGVITPENSMKWDALEPSQGNFGWSGADYLVDYATQHNKKVRGHTLVWHSQLPSWVSSIGDANTLRSVMTNHINEVVGRYKGKIMHWDVVNEIFNEDGTFRNSVFYNLLGEDFVRIAFETARAADPDAKLYINDYNLDSASYAKTQAMASYVKKWLAEGVPIDGIGSQAHYSSSHWSSTEAAGALSSLANTGVSEVAITELDIAGAASSDYLNLLNACLNEQKCVGITVWGVSDKDSWRASDSPLLFDGNYQPKDAYNAIVNALS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Dual Nature of the Wheat Xylanase Protein Inhibitor XIP-I: STRUCTURAL BASIS FOR THE INHIBITION OF FAMILY 10 AND FAMILY 11 XYLANASES.
pubmed doi rcsb
molecule keywords xylanase inhibitor protein I
molecule tags Hydrolase inhibitor/hydrolase
source organism Emericella nidulans
total genus 124
structure length 301
sequence length 301
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2004-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ta3B00
1EQCA 2IXVA 4P7LA 1J0YA 1E4MM 3KZSA 1GOWA 4B9YA 4AD4A 2WHLA 1BYBA 2YL6A 1LF1A 5BXTA 4XB3A 2ZE0A 1QHOA 1UD8A 5KEZA 4H8UA 1UD4A 3BAWA 3WELA 1CGUA 1UR2A 5A6BD 1R8LA 1W1PA 2XVPA 4W8AA 3A4AA 4PCSA 2CHNA 4F79A 3SCQA 1EQPA 1UR8A 2G3JA 4YN5A 1UR4A 3SURA 2D2OA 4QP0A 4C7FA 3OG2A 2GVYA 2V38A 3QOMA 1D7FA 1FH8A 3EMQA 3WQ5A 3W37A 4QCEA 4WSKA 2BY1A 3ARUA 1UKOA 2OWWA 4TTUA 2VOTA 1JZ6A 3LPPA 1PPIA 1XH2A 3WUBA 1TA3B 1V3MA 4AD5A 1XSJA 4OZOA 3WQ4A 2GK1A 5CGMA 4DUWA 1C3FA 3PBGA 2WB5A 1EHAA 1B0IA 2DSZA 2AMGA 1B3XA 2FH8A 2OSXA 1HIZA 1VRXA 2J79A 3CHDA 4JFSA 1GUVA 3WH6A 5D8WA 3AS1A 1CNVA 2J47A 3VGEA 4JIEA 1E3XA 4M24A 1QNSA 2F8QA 1IT0A 4AXNA 1KQZA 1US2A 3OGSA 4CD8A 2YJQA 1RP9A 1LJYA 4AC1X 4GZEA 3UG3A 1NP0A 3BXWA 5JBFA 2O9PA 4XX6A 1JYNA 3GDBA 3MS8A 3CZLA 4AY1A 3L4ZA 2D0GA 4DUVA 2O92A 2BXYA 2X0HA 4KRUA 3VIKA 4W8LA 1E56A 5FIPA 3NIYA 1D3CA 1ODZA 2WZHA 1HN1A 1OINA 4LYPA 2VX7A 1BVNP 2EPNA 3BAYA 2ZX8A 4M29A 2PF0A 1V6WA 1TCMA 4UQEA 3RCNA 4AIEA 3FAXA 2D0HA 5I24A 3AIUA 2A3AA 2W66A 1UKTA 3MUY1 3ZR6A 1AQHA 4W86A 1V08A 2AAAA 1S46A 3AS0A 1G01A 1VENA 1ISWA 3TP4A 4EAMA 1W3HA 1D2KA 1QI4A 3K8LA 2BY2A 3ZJKA 2PBGA 1FFQA 3ZJ6A 4W93A 1I1XA 1KXVA 3TA9A 2OLHA 5CSUA 3GXFA 4QCFA 1MQQA 3CO4A 1V3IA 3KE0A 2W67A 2VZOA 4J3TA 3T09A 1OM0A 4EKJA 3WN6A 1KBBA 1A3HA 2WXDM 2XFRA 1NWUA 1HP5A 5CSYA 3KL0A 5HNNA 1UR1A 3CTTA 4MNLA 4Z2HA 1W9XA 1E71M 1CLXA 2BVDA 2V5DA 2YOCA 4KH2A 4TXEA 3ARWA 3WDJA 1PX8A 1JF6A 4PTVA 3UR7A 3U5UA 1UWRA 2E3ZA 4DM1A 1OD0A 1M04A 3O9NA 3BAIA 1C91A 2JF7A 5GQBA 1E15A 4AISA 2JE8A 1E6ZA 3VD9A 4CVWA 3SCUA 5IXEA 5A6SA 2WMFA 3KL3A 9CGTA 2WVVA 3ZO9A 5HDRA 3L2LA 4ATLA 5A2CA 4B15A 1ITCA 4MAVA 4CU6A 1J18A 1E6SM 1GOQA 4V2XA 4IISA 1BYAA 4IPNB 4J3SA 3I3EA 4KGJA 3BCDA 5JBDA 3WDQA 3GTNA 1BG4A 1E0WA 5DF0A 2CBIA 3PTKA 4ZE4A 4JCLA 1GJWA 4P7NA 5DMYA 3POHA 3CMGA 5JUVA 1CGWA 1J0KA 1G0CA 1UD6A 4D1JA 1FOBA 4UOQA 2WKLA 2WZEA 1E72M 1R85A 2VX5A 2ZX6A 2XVLA 2WAGA 4IUGA 3ARSA 2JALA 1CXLA 5ABHA 5BYWA 1E4NA 1PZ3A 3VD5A 4CVUA 2WBGA 3PHAA 4IPLA 1V6YA 2BHZA 4HPGA 1F4HA 1FP8A 3VU2A 2D24A 1HJVA 2XJ7A 4ZENA 4MAZA 3ZM8A 3UEQA 1WDRA 1CECA 2DPEA 3AIWA 1ISYA 4HPHA 3MMWA 4AD2A 1XCXA 3TOPA 2GK1B 1K6AA 1EA9C 2QHAA 1JZ4A 1OT1A 1W1TA 2CPUA 4H8HA 2XVGA 1XYFA 1FH7A 2XUCA 1W9VA 2BNJA 2CHOA 3UG5A 3T2OA 1WZLA 2Y2WA 2DT2A 5DFAA 3AMCA 1VEOA 3A4WA 3VVGA 5JBEA 4TVCA 4MTVA 3GNRA 5A8QA 4CU7A 2CNCA 3EMCA 4EANA 4MB4A 2DSVA 1KXHA 4DWSC 1UD2A 5HXMA 2PB1A 1C8YA 3WF3A 8A3HA 3K8MA 3WUFA 1HJQA 4S3JA 4Q7NA 3PTMA 4TVDA 4JAWA 7TAAA 2VRQA 4LGXA 5BRQA 3BH4A 4CU8A 1SMDA 2WC3A 2XPKA 4MDPA 2YBUA 5KZ6A 3CUJA 4ZXLA 4URIA 1C7SA 3F4VA 4FLSA 3DECA 3BC9A 3WH8A 1SMAA 4E4PA 3WF1A 2ZUNA 2WHKA 2ZUUA 1V3JA 3WFLA 1JAKA 3AICA 4PMRA 5ABEA 1HKJA 4Q22A 1OGBA 1VBRA 2VNCA 1LG1A 4U3AA 5HPOA 3AXIA 2CKSA 3F5JA 1GQLA 1OIFA 2WMKA 3SCWA 1G94A 3MU7A 3CUGA 5JIWA 2XHYA 5E6YA 3VIIA 3OA5A 3MV11 4NF7A 3M07A 3B9AA 3GXDA 1DWAM 2CIPA 2ZUMA 3VDAA 1V03A 2ZIDA 3K46A 4WKFA 3QHOA 1OCQA 2VZVA 1E6XM 1ZS2A 3VIFA 1ZJAA 5AY7A 5C8BB 1VJZA 4AW7A 3PZUA 2ZX5A 2NT0A 1NP2A 3RMEA 3T0AA 4Z2LA 4HP5A 3SCPA 1JZ5A 1TG7A 5EFDA 4UZSA 2DH2A 4WK9A 1FHLA 3WDIA 1E73M 5D9PA 3HN3A 4HU8A 3CLWA 4OBSA 3G6LA 2VL4A 4ZXOA 3AISA 3CMJA 1TVNA 1E3ZA 2WK2A 4CCDA 4P7RA 4PMNA 1H1NA 2VCBA 1UWIA 1UYQA 2QPUA 3W6LA 1KR0A 1H0IA 4PYSA 1J10A 2WVVB 5M03A 1HP4A 2PWFA 2WBKA 2NSXA 4JKLA 1G1YA 4U5IA 3VDHA 1JF5A 1SYTA 2GJRA 3CZKA 2DGAA 3WMSA 3FW6A 3GXIA 3CUFA 4HMCA 2OSWA 4D6HA 1QW9A 5E6ZA 2VZSA 5A2AA 3SCSA 1MXDA 4LYRA 3W26A 1H49A 1NOUA 2XM2A 4AD3A 3WQVA 4J7RA 2XTKA 2FDMA 2EO7A 5BCAA 4PBGA 1QNQA 3CZ8A 2ZUSA 3M7SA 1AMYA 1B3ZA 3SUWA 2XWDA 1UA7A 1GOMA 2D20A 4UFHA 3THDA 1X1NA 1VFFA 4CD7A 1PX3A 4ACZA 2NW0A 3AHTA 1J11A 3T08A 4UQBA 5CPSA 1GHRA 3MMDA 1UOKA 4J27A 1DTUA 2G4FA 1HF6A 1C8QA 5IFPA 2JF6A 2CERA 3GH5A 1EGZA 3L4XA 3DHPA 4UR9A 3WD2A 3FHQA 3QGVA 4ATDA 2EEXA 1E40A 3HMCA 1WB0A 5I0DA 1B1YA 3CHCA 3EDDA 5M17A 4CCCA 2VCCA 1JDAA 2PI6A 4H8VA 2MANA 4CUCA 1VF8A 2C7FA 3AXXA 1GPFA 1XRVA 4UQCA 1OWQA 3II1A 1GORA 3BGAA 3VUPA 1QNRA 3VIJA 3T2PA 1X6NA 2W62A 2XM1A 4W7UA 1QI5A 2FGZA 2QMKA 1UKQA 6A3HA 1E1FA 2FHBA 1NARA 2YBTA 3GH4A 2CBUA 1ISVA 1XSIA 3AHXA 1Y7VA 5CPTA 2YL9A 1E6NA 1HJXA 3TTSA 1V6XA 1ESWA 1FA2A 3ZMRA 1CDGA 1MYRA 4HTYA 2J7DA 3PZQA 2XFFA 4NI3A 3FNDA 4JHZA 1E1EA 1JNEA 2J7HA 3F5LA 2GJPA 4GKLA 1FHDA 5DT5A 3OIHA 2JFEX 1ZJBA 4DUXA 5AC5A 1M01A 4D71A 3AIVA 3A6OA 3UR8A 4BZYA 5CLWA 1J9YA 4U5KA 1A47A 3ARVA 1E70M 3ZR5A 1ZBVA 2J74A 1MFUA 1UH2A 1WNOA 3WL1A 4NZCA 2G41A 3K1DA 3AZSA 1GOKA 1B9ZA 1GNXA 1JGIA 2V3EA 1V0NA 5HOSA 3OZOA 1B2YA 3UG4A 3B8SA 4LPCA 1QW8A 5JIPA 3SCTA 2E9LA 3NYDA 3DYMA 4R5EA 1W9BM 1JNDA 1M7XA 4HMDA 3VM7A 2J4GA 5BRPA 3WL0A 2XWEA 2O9TA 1AVAA 1HVQA 2DSKA 3SCVA 2F2HA 1XV8A 1KGWA 3EYPA 1CXHA 1TVPA 3SUVA 3AMLA 4GI8A 2V3FA 2GSJA 2GDVA 3WEMA 4D72A 4W87A 1XSKA 5C70A 4PUDA 1GVYA 1NOFA 2J7BA 3ARRA 1H11A 4M8UA 1MW1A 4OJYA 4D6DA 5AYIA 2ZXQA 5LA0A 3WBEA 2BV9A 1BSIA 2Y4SA 1AQ0A 1V3LA 2WVUA 1DWHM 1TR1A 3IAQA 5LA2A 4LYQA 1UH3A 3NSMA 4U3CA 2PWEA 1I75A 1CEOA 3BCFA 1CWYA 2OSYA 2WCGA 4J3WA 1V0LA 3M6DA 5E09A 3AZRA 5A69A 4JFWA 2V5CA 1BGAA 2D1ZA 2ZUWA 3L4WA 5BXPA 1LWHA 4L4PA 5AC4A 4CKQA 1H3GA 2Q8XA 4QLJA 4AZGA 1KR1A 4X0VA 1CGTA 1GJUA 3MSGA 1F4AA 1HJWA 3G6MA 4OKDA 4PMXA 2XG9A 1CBGA 1R7AA 4JZ5A 1H41A 3VIPA 1TUXA 4UCFA 3W6MA 1EH9A 3SCNA 4ACZB 3AOFA 1GOIA 3ALFA 3AFBA 1VFUA 2GDUA 1V0KA 3WQ8A 2YL5A 1JZ3A 3MSDA 2V3GA 4AZCB 1ZBWA 2X1IA 3WDPP 4PMUA 4P7OA 4HA3A 3O2LA 3RM4A 3S2CA 1VFMA 3BLKA 3AS2A 1MW0A 1E4IA 5EMYA 2WSKA 1HJSA 1OBAA 2Z1KA 3WDRA 1W9DM 3W29A 4PEEA 3BAJA 3AROA 2Y8VA 3CIVA 3AQUA 1E5NA 1XYZA 1V02E 4DWSA 3VGFA 1CLVA 1BGGA 1H0GA 4P8XA 3GNPA 3IJ7A 3PZTA 4F8XA 3K4AA 2WMIA 4HZ6A 4ML4A 4M56A 4HU0A 3N13A 3WH5A 3W53A 1B90A 3NSXA 3WSUA 5I2UA 4GQRA 1ZB5A 1W3JA 5CJ5A 2O9RA 1JYWA 1UD3A 1LLOA 3UESA 3B9DA 3T0DA 5E0FA 4CCEA 1Q6CA 2G3NA 1R86A 1WDQA 3RM9A 4RL3A 4H7VA 2VVSA 1JZ2A 4AZHA 3CH9A 3L4YA 4BQ2A 2CBJA 3BMVA 4V27A 1E6QM 3VGBA 4C7GA 1EDQA 3MMUA 1UWSA 3RIKA 5FKYA 3I3BA 2OWCA 1QVBA 3OLGA 1B31A 3PZNA 1KB3A 4PUEA 3N17A 4MNKA 5A2BA 1XCWA 3ARZA 3AIEA 3RJYA 2J25A 2BS9A 4DWSD 1LL6A 2VI0A 3J7HA 1V6UA 3DYOA 1E6PA 4PMOA 2ZWYA 3ZOAA 4E8DA 1CXKA 1R87A 4U2YA 4ATWA 2GFTA 3CHEA 1WDPA 1LQ0A 3WENA 2EQDA 1PX4A 4WLCA 1JYXA 4PMQA 1L8NA 4UFKA 1MW3A 1HL9A 3DYPA 1JI1A 1VEPA 1GCYA 5GNXA 3WUGA 2WPGA 3NCOA 3WD0A 4GINA 3BAKA 1XGZA 4GIAA 1K9FA 1BYDA 2BXZA 2XVNA 4QFUA 1KCKA 3ZJ8A 1R7OA 1NOWA 2VMFA 4UFLA 3HJEA 4JL1A 3WQWA 3WUEA 1PEZA 3PZVA 3RILA 3VX0A 4HZ7A 2ZX7A 2EPMX 2W92A 2YDRA 1L0PA 1UH4A 4P8WA 2J7EA 1QHZA 4J3UA 2VJXA 1CXFA 2Z1SA 3RO8A 4D6IA 2WMJA 4AZ6A 3RPMA 3L4VA 3CUIA 4HA4A 4PMZA 1ZBCA 2WNWA 4BF7A 4OUEA 2FHFA 2X09A 3L4TA 3N18A 4KWUA 3L4UA 3FN9A 1XH0A 2VX4A 3FAWA 3L2MA 4GI6A 3VIOA 2J75A 4MJ4A 2J8GA 3ZIZA 4XZBA 5A8NA 1K9TA 4AZ7A 1E5JA 4H41A 1KWGA 5IFTA 1HKIA 1RD6A 2BY3A 1OGGA 3EDEA 1ZL1A 3K8KA 1EIBA 4NRSA 5D9NA 5BXRA 4AZBA 3ARQA 1B3YA 4UQ9A 5I3DA 2D3LA 1E43A 5FCZA 1Q6DA 3BAXA 4UOJA 2W5FA 1J0ZA 1XC6A 4PTXA 2A3BA 2YA1A 3AXHA 3AHYA 5FL0A 3WNMA 4B3LA 3CZJA 2O9OA 4PRWA 5A6LA 1RPKA 1W1YA 3E1F1 4QAWA 2EBNA 1B3WA 3GXMA 4BA0A 3TTQA 3VIGA 5E70A 5C71A 2YA2A 1KFWA 1QI0A 3LMYA 4F9JA 2VTFA 2HVMA 1PIFA 3OGVA 4E2OA 4AWEA 1CTNA 5EBAA 5IHRA 1VFOA 3PZ9A 3SIMA 1W9UA 4GZIA 2DQXA 4DWSB 2JEQA 7A3HA 4MPKA 3QR3A 1H09A 3A4XA 2DIJA 2E0PA 2WW5A 4GXPA 1BPLB 4MNMA 3WD4A 4UFMA 3AIBA 2IXUA 2WMIB 2UY3A 1WZKA 3EBVA 3OBAA 2XYLA 2YL8A 4X0NA 5ECUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1EQC A;  2IXV A;  4P7L A;  1J0Y A;  1E4M M;  3KZS A;  1GOW A;  4B9Y A;  4AD4 A;  2WHL A;  1BYB A;  2YL6 A;  1LF1 A;  5BXT A;  4XB3 A;  2ZE0 A;  1QHO A;  1UD8 A;  5KEZ A;  4H8U A;  1UD4 A;  3BAW A;  3WEL A;  1CGU A;  1UR2 A;  5A6B D;  1R8L A;  1W1P A;  2XVP A;  4W8A A;  3A4A A;  4PCS A;  2CHN A;  4F79 A;  3SCQ A;  1EQP A;  1UR8 A;  2G3J A;  4YN5 A;  1UR4 A;  3SUR A;  2D2O A;  4QP0 A;  4C7F A;  3OG2 A;  2GVY A;  2V38 A;  3QOM A;  1D7F A;  1FH8 A;  3EMQ A;  3WQ5 A;  3W37 A;  4QCE A;  4WSK A;  2BY1 A;  3ARU A;  1UKO A;  2OWW A;  4TTU A;  2VOT A;  1JZ6 A;  3LPP A;  1PPI A;  1XH2 A;  3WUB A;  1TA3 B;  1V3M A;  4AD5 A;  1XSJ A;  4OZO A;  3WQ4 A;  2GK1 A;  5CGM A;  4DUW A;  1C3F A;  3PBG A;  2WB5 A;  1EHA A;  1B0I A;  2DSZ A;  2AMG A;  1B3X A;  2FH8 A;  2OSX A;  1HIZ A;  1VRX A;  2J79 A;  3CHD A;  4JFS A;  1GUV A;  3WH6 A;  5D8W A;  3AS1 A;  1CNV A;  2J47 A;  3VGE A;  4JIE A;  1E3X A;  4M24 A;  1QNS A;  2F8Q A;  1IT0 A;  4AXN A;  1KQZ A;  1US2 A;  3OGS A;  4CD8 A;  2YJQ A;  1RP9 A;  1LJY A;  4AC1 X; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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