1TA3B

Crystal structure of xylanase (gh10) in complex with inhibitor (xip)
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
ASLNDLFVAAGKSYFGTCSDQALLQNSQNEAIVASQFGVITPENSMKWDALEPSQGNFGWSGADYLVDYATQHNKKVRGHTLVWHSQLPSWVSSIGDANTLRSVMTNHINEVVGRYKGKIMHWDVVNEIFNEDGTFRNSVFYNLLGEDFVRIAFETARAADPDAKLYINDYNLDSASYAKTQAMASYVKKWLAEGVPIDGIGSQAHYSSSHWSSTEAAGALSSLANTGVSEVAITELDIAGAASSDYLNLLNACLNEQKCVGITVWGVSDKDSWRASDSPLLFDGNYQPKDAYNAIVNALS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Hydrolase inhibitor/hydrolase
source organism Emericella nidulans
publication title The Dual Nature of the Wheat Xylanase Protein Inhibitor XIP-I: STRUCTURAL BASIS FOR THE INHIBITION OF FAMILY 10 AND FAMILY 11 XYLANASES.
pubmed doi rcsb
molecule keywords xylanase inhibitor protein I
total genus 124
structure length 301
sequence length 301
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2004-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ta3B00
3CGTA 3CZGA 2XSAA 3MUAA 3OBAA 1WO2A 4C7DA 3KEHA 3ALFA 1B3XA 1E55A 5DF0A 2ZUWA 1Q4NX 1QI3A 1V0LA 3W25A 3W28A 1L8NA 2G8ZA 4Z2HA 4AZGA 2HVMA 3WQ5A 3WH8A 3CTTA 1H2JA 1GONA 4PSRA 2GJXA 5ABFA 2J7CA 3AMDA 2VR5A 4AISA 4CCCA 5BCAA 4FLSA 2X0YA 3MMWA 4V27A 3W53A 4Z2GA 2GJPA 4UTFA 2PBGA 1CBGA 1AVAA 1UUQA 3ZMRA 3EDEA 5CJ5A 1HN1A 3FAWA 4CVUA 2WMIA 3WD3A 1V3HA 4GINA 4FMVA 1QBBA 4FK9A 3AZTA 2NW0A 1PJ9A 5CPQA 3RMEA 1PPIA 5A6AA 1MQPA 3E1F1 3WIJA 1M53A 3VINA 1QW9A 4GO8A 2A3AA 1R7OA 1UKOA 5HOSA 1C93A 6A3HA 1WDSA 1CGUA 4AMCA 3AROA 3PZIA 3AI0A 3AXIA 1VJZA 1BHGA 3BAKA 4AZBA 1C90A 3WDRA 2VQTA 1QI2A 4KH2A 1NWRA 4QCFA 2CERA 1VFOA 3U5UA 4HOWA 1JYWA 4WJXA 1RP8A 4ZE5A 4U31A 1QVBA 2CKSA 1K6AA 3K8KA 5I0DA 3VX0A 3T2QA 1KBBA 1F4AA 1E71M 2WWCA 1JI1A 3SCPA 1CTNA 2GFTA 3N9KA 2W66A 4LQ1A 2GJXB 4UQDA 1ZU8A 3N13A 1GORA 2WHLA 1ECEA 1FFRA 4A4AA 5E0CA 5E70A 3ZSTA 1W9DM 4N42A 3WF2A 1W9XA 3MV01 2FGLA 2EXOA 3FXYA 4GO9A 5IDIA 4H04A 3UCQA 1G94A 1WKYA 2ZWYA 1C7TA 4L4OA 2WWDA 4IPNB 4B3KA 1UQYA 2WMIB 1O6IA 2B31A 1WZLA 3T0AA 1E0WA 1XCXA 5BRPA 3OA5A 3VX1A 1FH7A 3O6AA 1B31A 3WDJA 5A2BA 4QLKA 4S3KA 3CMGA 3K1DA 3CZKA 5DMYA 1HJWA 4ACYA 1LL6A 3OIHA 3ALGA 4E4PA 1JI2A 1KXQA 1UKPA 2OSXA 3VGGA 1HL8A 1E40A 4C7GA 4W5UA 3L2LA 3VMOA 3DECA 3TTSA 1VFUA 5A8OA 2ZIDA 4A3HA 3OZOA 5GNZA 3FN9A 4IPLA 2X09A 1H1NA 4HZ8A 3ZQ9A 3MUY1 4AIEA 4PUDA 1W32A 4UR9A 4NF7A 4H7VA 1LL7A 4QAWA 3VNZA 4MB4A 4JIEA 4HA1A 4MJ4A 3B9EA 2WVTA 2VRJA 4HPGA 1JFHA 1JZ6A 2ZUMA 4URIA 3B8SA 5A8QA 4TTUA 5D9PA 1UWTA 1VEPA 3K46A 2VRQA 2F8QA 1X1NA 4ML4A 4PMVA 4UNIA 3WMBA 4UFIA 3N12A 1QNPA 1TE1A 3ARVA 4OZOA 1V02A 3CHFA 3POHA 1EOKA 1JG9A 2VL4A 2VO5A 2Q8XA 5M03A 3ZJ7A 1XSJA 2YL8A 2J7BA 4W8LA 1J10A 1J0KA 3U7VA 1R86A 2PB1A 3UG5A 3WL0A 3OLDA 9CGTA 4IUGA 4QP0A 1UG6A 2E9LA 1XH0A 3SCUA 2YOCA 3A4WA 3UR7A 1DWJM 3EYPA 1UD8A 1HKJA 3KZSA 2G3IA 3NSXA 3AMGA 1IV8A 1QHZA 1PIFA 5A6KA 5GNXA 1GZJA 3M6DA 4B9ZA 3NDZA 4OBRA 3A47A 1J12A 4UQCA 4MDOA 3L2MA 4KMQA 2YA0A 2QPSA 3MUZ1 2VR4A 1KGWA 3F5LA 4JHOA 4H8VA 8A3HA 3MSDA 3ARYA 3AYSA 1GOKA 1CXKA 5TD4A 3SURA 3WEMA 2WKGA 4OBSA 3MANA 4TOQA 5IHSA 4F66A 4AEFA 7TAAA 1F4HA 4DUVA 4LX4A 4CU7A 5FCZA 4CD5A 1M03A 1W1PA 5E6ZA 4H41A 3RIKA 2OSWA 5EB8A 1EO7A 4TTGA 1V3JA 1JGIA 1QHPA 2Z1KA 2XG9A 1V3KA 5EMYA 1UA7A 3WD1A 1E72M 2X8RA 1E0VA 3ARQA 1D2KA 1MVYA 1R8LA 4B9YA 1B9ZA 1W3JA 4J3TA 3SCQA 3FY1A 4TVDA 4GI9A 5I23A 2G41A 4N0RA 4GPNA 3L4ZA 2J77A 4K68A 5LYRA 3TTYA 1E6PA 3O2LA 3I3EA 3WQ4A 4UFJA 1TMQA 4RL3A 4HU0A 5IHRA 1EXPA 4JKMA 4HZ7A 4DWSC 4DUXA 3M7SA 2EPLX 5BXRA 5A3HA 1DWHM 4Z2JA 1E9LA 1H49A 2CBIA 4UZSA 5A6JA 1PAMA 2D3LA 1QI5A 1E73M 4MB1A 1H5VA 2GK1A 3ZJ6A 5JUVA 1B0IA 3UR8A 5JIPA 2BV9A 3PZQA 1EQPA 3CHDA 2VZOA 3AHZA 2XPKA 4A3YA 1U2YA 3VIPA 1OGSA 1KGUA 3GBDA 4MTVA 1FHLA 1WE5A 4L4PA 2ZUTA 3CHCA 3VIHA 1WDRA 4J28A 1UYQA 1V0KA 1BG4A 3UETA 1HVQA 3TA9A 4ZE4A 2W63A 3GNRA 1JYXA 4J3SA 2F2HA 4NI3A 2D1ZA 5AYBA 4P7OA 5FKYA 4AIUA 5KZ6A 2W62A 1BYBA 1KR0A 1OGGA 2ZE0A 4S3JA 1GJWA 3GH4A 3VGDA 4HPHA 4PN2A 3IANA 1AQ0A 2Y24A 2DSKA 1J9YA 3VMPA 2WZIA 2YLAA 3L4UA 1OWQA 2AAAA 1J0IA 1B30A 1VBRA 2TAAA 3AXXA 4HMEA 2VZVA 4HMCA 1O7AA 2VNCA 3WD0A 3WFLA 5FOOA 1TVNA 1JFXA 1JYNA 1C8QA 3ARSA 4DM1A 1PZ3A 3RJYA 5E09A 3AIQA 3AHYA 3QOKA 3LPGA 3BAYA 5D9NA 1NP2A 3W6MA 3MV11 2BHZA 3KL0A 1OT1A 3AHVA 1BFNA 2WLYA 3UG3A 2A3CA 2GK1B 1E5NA 1IZKA 1W1TA 2CXGA 4J3UA 1LL4A 1GOWA 3VNYA 5A8PA 3WENA 4X0NA 3BMWA 2YDSA 4X0VA 1HKIA 1W9VA 4LYPA 1NWUA 2VURA 1E4IA 5I78A 2BHUA 3GYCA 4W86A 1OM0A 1OD8A 3ZR6A 4D6FA 4JZ5A 2CEQA 2XWDA 4BCEA 2ZICA 3TONA 1EDGA 3AZRA 3W27A 1KBKA 5A6BA 3GM8A 1U30A 2CESA 4LXFA 1E6RA 2J8FA 1LQ0A 3WF4A 3WDHA 3BSGA 1E3XA 2EPKX 3SCTA 5ABEA 2WLZA 1XD0A 2D0GA 5HXMA 1XSKA 4CD6A 4JFSA 5I6SA 4UZUA 4JFUA 3BXWA 1BF2A 3BCFA 1FFQA 1IT0A 3AIBA 1XRVA 1HXJA 3OG2A 4Q7NA 4CU6A 3LPPA 1E15A 3DHPA 2J78A 3PN8A 3ARPA 1HJSA 1KXTA 1M04A 2D24A 3AS2A 4WIWA 2XVNA 1BLIA 2BNJA 3OZPA 5LA1A 3QHNA 1H3GA 4NRRA 5AC5A 4H8UA 1US2A 1HIZA 1FH8A 1J0ZA 3LPFA 1AQHA 3RM4A 1EHAA 2A3BA 1ZBVA 1EHNA 4RE2A 4MPKA 4GZEA 1E56A 1KXVA 4ATDA 1I75A 1NM9A 1ZL1A 1UWSA 1W1VA 4XUYA 5GQBA 3N18A 3AHXA 3UESA 3WNLA 4TX6A 1J0YA 2WC7A 3FW6A 1QI0A 1NOUA 4DWSA 3CMJA 3RO8A 1CXEA 3F5JA 3VKKA 4GI8A 1LJYA 3PZNA 1DWIM 2GDVA 4MB3A 3W37A 2DH3A 3PZUA 2WMGA 4C7FA 1PEZA 1EH9A 5I2UA 3MKKA 2QLYA 5C8BB 2XHYA 4J7RA 1MW0A 2XM1A 2VJXA 3WMSA 5A8MA 5A95A 5A2CA 1E1EA 1GPFA 3HJEA 1JAKA 3U7BA 6TAAA 3IJ8A 3L4TA 4QFUA 1ISYA 5BRQA 3W4RA 4AD1A 2FGZA 1N82A 1CGXA 1VENA 3WKZA 4V2XA 3VU2A 4AD5A 1UA3A 5CPTA 1MFVA 1JNDA 4DUWA 3VILA 4TX8A 2WSKA 4ZENA 5CSUA 2VCBA 1UWIA 1PX3A 2BHYA 2O9TA 1WZKA 3K4DA 4V28A 3PZTA 1OINA 5JIWA 4P8VA 1BVNP 3VD5A 3QHMA 2W91A 3CZEA 2WHMA 1K9TA 1IZJA 1V0MA 3GNPA 5HNNA 1NQ6A 3RILA 3NIYA 4OJYA 1E70M 3GDBA 3OGVA 4AC1X 2WPGA 5EBAA 1SR0A 1GQIA 1CNVA 3SCOA 2IXUA 2D20A 2ZUVA 1NOFA 2V5CA 3KL3A 4CU8A 3L4WA 2ZXQA 4D1IA 2J7DA 5A6SA 4M8UA 1CGTA 2VRKA 4DWSB 1W2PA 2YJQA 1UD4A 1FHDA 3WH6A 5A8NA 5ABFB 5HDRA 3VMNA 1CGVA 2XFYA 1UH2A 3WF3A 1A47A 3RM8A 1ZBCA 2YDQA 1KQZA 3K8MA 1PX8A 3WH5A 2VVNA 1HP5A 1BQCA 2V3DA 4D6JA 1OBAA 2ZWZA 3KL5A 4LGXA 1TA3A 2XVKA 1ODUA 2GSJA 4HA4A 2WMHA 5HBFA 2CYGA 2ZX5A 3K8LA 5I5RA 3AIEA 3NCOA 1QW8A 1H09A 1HKKA 4TUFA 4XX6A 3VM7A 1DWAM 2UY3A 2W61A 3L4VA 4UQAA 4B3LA 2Y5EA 1HJXA 5A6LA 4M56A 1Q6DA 1E6QM 1R7AA 3OLEA 1KQYA 4CVWA 2ZUSA 4W85A 4KWUA 2WAGA 2WHJA 1MWOA 1JDDA 1GVIA 4IISA 3FNDA 1WZMA 1JD9A 3I3BA 1MFUA 3AQUA 4QCEA 1GOMA 5IXEA 5I3DA 4U33A 1QI4A 3WMCA 1PZ2A 3L4XA 5JBDA 2JFEX 5ABHA 1BGGA 5BXTA 4PEEA 3ZSSA 2G3JA 2WM0A 1NARA 3B9AA 4PTMA 4YHGA 5JBFA 1RD6A 2J7EA 3QHOA 2BVTA 1JZ2A 4P8WA 1JDAA 2WK2A 3CLWA 1DEDA 2WMJA 2Y4SA 4F9DA 5A1AA 4JFWA 1W9BM 3J7HA 5DO8A 3GXDA 1LG1A 5CGMA 1BSIA 2YA2A 1E6SM 3O9NA 2D23A 2ESCA 2VOTA 4JL1A 3CUHA 5EFDA 4PMQA 4AZ5A 3ECQA 4PMZA 5C70A 1R87A 1TA3B 2Y2WA 3S2CA 3IAPA 4BQ2A 4PBGA 3ZIZA 3BH4A 4PTXA 2YL6A 1XGZA 4TXEA 5FL0A 1ITXA 2CPUA 2WCGA 4M80A 2UY5A 1QNRA 1EOMA 4HP5A 3HMCA 2XM2A 3NSNA 1X6LA 3WUFA 3CZ8A 2EBNA 1E6NA 2E8YA 4UFLA 4WSJA 1UD3A 1MW2A 2D0HA 3LPOA 2UY4A 1JZ3A 4OOUA 5A2AA 1L0PA 4EAMA 2WVSA 4BQ4A 3WF1A 1BVZA 3VO0A 4F79A 3AFBA 1V3MA 1QOXA 1SYTA 4CCEA 3NJ3A 4U5KA 3M46A 3QOMA 3SUWA 4LYQA 1HVXA 4PMYA 3VVGA 2IXVA 1QNSA 5BROA 1GOIA 3POCA 2XFRA 6CGTA 4PMUA 1W9UA 4Z2KA 2PWDA 2BY1A 3WQ8A 2BFGA 2CIPA 2IUZA 4U5IA 4ACZA 1EQCA 2UWFA 4W89A 2XVLA 1VFFA 4QLJA 1M7XA 2C0HA 1KCKA 1ZBKA 2OWXA 1V3LA 2DEPA 4KGJA 4AXNA 5LA2A 4Q22A 1BTCA 4CN6A 2JIWA 2D22A 3VTRA 3CHEA 3G6MA 3IJ9A 1QNQA 3AICA 4Z2LA 2DDXA 3VDAA 1M01A 2W92A 1HP4A 1W1YA 4J3XA 4XZWA 3VDHA 1ZS2A 4D6IA 2OYLA 1CGWA 2VQUA 5A6MA 2XSBA 2WMKA 3IAQA 3ARTA 1XYZA 2D2OA 4CKQA 5BXSA 2XGIA 1RH9A 3BC9A 3OLIA 2BXYA 4OOZA 4W88A 2CETA 1E4NA 4JFTA 4JKLA 3T09A 4Z2IA 2QMJA 5D8ZA 1ZBWA 5JBEA 1DTUA 1QBAA 3OGSA 2DSZA 1GOQA 3MO4A 1NP0A 2CBUA 1B3ZA 1GHSA 3D5HA 1JIBA 4MAVA 3OLGA 4PYSA 4NRSA 4E8CA 5E0FA 1YQ2A 4P8UA 2DSVA 2GVYA 2J74A 1GQLA 4JCMA 4HA3A 2BY0A 3NDYA 4GKLA 4F9JA 4RE4A 3CH9A 4M24A 1GCYA 4HOZA 2O92A 2VTFA 3HU7A 4E8DA 3WNPA 4PMRA 1NWTA 1ZB5A 1J11A 3GBEA 4BA0A 4M1RA 5DT7A 2EEXA 4BZYA 2CNCA 2VX6A 3MMDA 2ZX8A 3WUGA 1D7FA 1KWKA 1OIFA 1E3ZA 1SFSA 3MS8A 1UKTA 2MANA 1EDTA 3GXMA 3ZM8A 3N17A 1K9DA 3A4AA 3T2OA 1UZ1A 4PTWA 4ZFMA 4W87A 3BLKA 1HJUA 4J3WA 4ATLA 2EO7A 2OYKA 4KGLA 1US3A 1KCLA 1HNYA 1LF1A 4J27A 4OIFA 4CCDA 2WANA 4W8AA 2QV4A 1JXKA 2WSPA 3EMQA 1BYDA 4YN5A 2O9OA 4JAWA 1V08A 2DT2A 4D6DA 3BAIA 5CLWA 1VBUA 3SCSA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CGT A;  3CZG A;  2XSA A;  3MUA A;  3OBA A;  1WO2 A;  4C7D A;  3KEH A;  3ALF A;  1B3X A;  1E55 A;  5DF0 A;  2ZUW A;  1Q4N X;  1QI3 A;  1V0L A;  3W25 A;  3W28 A;  1L8N A;  2G8Z A;  4Z2H A;  4AZG A;  2HVM A;  3WQ5 A;  3WH8 A;  3CTT A;  1H2J A;  1GON A;  4PSR A;  2GJX A;  5ABF A;  2J7C A;  3AMD A;  2VR5 A;  4AIS A;  4CCC A;  5BCA A;  4FLS A;  2X0Y A;  3MMW A;  4V27 A;  3W53 A;  4Z2G A;  2GJP A;  4UTF A;  2PBG A;  1CBG A;  1AVA A;  1UUQ A;  3ZMR A;  3EDE A;  5CJ5 A;  1HN1 A;  3FAW A;  4CVU A;  2WMI A;  3WD3 A;  1V3H A;  4GIN A;  4FMV A;  1QBB A;  4FK9 A;  3AZT A;  2NW0 A;  1PJ9 A;  5CPQ A;  3RME A;  1PPI A;  5A6A A;  1MQP A;  3E1F 1;  3WIJ A;  1M53 A;  3VIN A;  1QW9 A;  4GO8 A;  2A3A A;  1R7O A;  1UKO A;  5HOS A;  1C93 A;  6A3H A;  1WDS A;  1CGU A;  4AMC A;  3ARO A;  3PZI A;  3AI0 A;  3AXI A;  1VJZ A;  1BHG A;  3BAK A;  4AZB A;  1C90 A;  3WDR A;  2VQT A;  1QI2 A;  4KH2 A;  1NWR A;  4QCF A;  2CER A;  1VFO A;  3U5U A;  4HOW A;  1JYW A;  4WJX A;  1RP8 A;  4ZE5 A;  4U31 A;  1QVB A;  2CKS A;  1K6A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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