1TJPA

Crystal structure of wild-type tryptophan synthase complexed with 1-[(2-hydroxylphenyl)amino]3-glycerolphosphate
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
267
structure length
267
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
publication title On the structural basis of the catalytic mechanism and the regulation of the alpha subunit of tryptophan synthase from Salmonella typhimurium and BX1 from maize, two evolutionarily related enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
total genus 99
structure length 267
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2004-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1tjpA00
2Y7GA 3L0GA 4TO8A 3AO0A 5AFDA 4XUGA 1WBHA 1OF8A 3VE7A 2X1RA 2DJXA 1EUNA 4O15A 1LRNA 3CIXA 3LLFA 4ML9A 4N6EA 5DY3A 4FNSA 4IPJA 2NX9A 3L9CA 3NG3A 2TMDA 3S1XA 2ZRYA 3DHFA 4D2JA 3S0CA 2P10A 2QR6A 3C3NA 3NL6A 3SFKA 3G0XA 3NPVA 4L4LA 1KFCA 3JR2A 3L68A 1VLIA 4NXKA 1JUEA 1B3OA 4GNJA 5HWJA 3W7OA 1OJXA 1TJRA 1KM4A 4AHOA 3UZJA 4FXRA 2H8ZA 3GVGA 4MKNA 1TTPA 1OVDA 3V1PA 2V5BA 5DCDA 3GAKA 3OVQA 1WOAA 3E12A 4MOZA 1YDVA 5CG7A 4NXSA 1I2OA 3W7EA 3W7CA 1K3UA 1LOLA 3JRKA 3OEXA 1I2NA 2C1HA 2VFGA 2YDAA 3KRSA 4JGDA 1T96A 4WD0A 4LV4A 1I45A 4CCCA 4M7SA 2ZRVA 1S5TA 4AHPA 4LV9A 2H90A 4M19A 2I1OA 2VXNA 4K37A 4CCEA 3DFSA 4A2RA 4LW7A 4Z1DA 5KSWA 5LNRA 1GG0A 4Y90A 3LLDA 1NEYA 4JD4A 4RCXA 1Z42A 3TC7A 3GNNA 1AL7A 2J27A 4BWLC 1S3HA 3WK2A 1EIXA 5IBXA 3UWQA 5AB3A 3NQDA 3GKFA 3IGSA 4NJIA 4RXFA 5I3GA 3GB6A 2GQ8A 1DQWA 2C0AA 2TRSA 3ABQA 1OFAA 4GRSA 3OG3A 5MHBA 5BW6A 3W2JA 1KBJA 2NWRA 2NXHA 2C18A 4NUWA 4QNWA 2ZZ7A 1ICSA 1DBTA 3SZ8A 2YPIA 2CLKA 2RDWA 3L5LA 3PBYA 2A85A 5G4WA 2Z1BA 3N9SA 2ZDRA 3IIOA 3F1QA 1GOXA 1UBSA 4U4MA 2YYTA 1P1XA 1W8SA 4FIRA 4YMZA 1C9DA 4JTTA 1TPEA 1FX6A 2Y88A 4GUJA 3BGGA 4YCPA 1AW5A 3G3MA 2Y61A 3LTPA 5K9XA 3GK0A 1SUXA 1I2PA 1EA0A 1UUOA 1HUVA 1JCYA 3N3MA 2WQPA 4UTKA 3MO7A 3GZ3A 4IXHA 3TSMA 4JYFA 4CQAA 2OJPA 1OFPA 5FF4A 2YFOA 3L5MA 3PULA 2ZBTA 3G18A 1XBVA 1FWWA 4AH7A 4ZQMA 4PFMA 1W54A 1P4CA 1JJKA 3LCHA 3GXNA 2B7PA 2ZA1A 3W2MA 2A2IA 2E77A 2A6NA 3TQVA 1XCFA 3RLUA 3EX3A 1OK4A 3UWWA 5BNKA 5A5WA 1S5WA 2GUUA 2DJLA 4UUIA 3RMJA 3OVRA 3PUOA 5D09A 1SU5A 2QDGA 2VENA 2A0NA 3SGUA 3BG3A 3O05A 2YW3A 1P5BA 5HMSA 3L2IA 3ABRA 4Y6GA 3I65A 5FF0A 1TCDA 1YDNA 4X3ZA 4DO5A 3GX9A 2FDSA 1VCVA 1MXSA 2EKCA 4UR7A 3NQ8A 3H55A 1ICQA 1K7EA 1I4NA 1RPXA 3A21A 1F74A 4LOCA 3W7LA 3N2MA 3I68A 3W7NA 1E51A 1HO4A 4UTTC 4HT3A 1UUMA 2ZRWA 4O12A 3TV8A 4JTFA 1VC4A 3VNDA 1WQ5A 3W1MA 3EWBX 4O10A 3CQ0A 3DU0A 3NDOA 1ZHAA 4R33A 1YTEA 4E0CA 1EP1A 3P82A 1KM0A 1VYPX 1JVNA 3NL2A 4CQ9A 3C56A 4GUHA 4RK8A 1BTMA 4JTJA 4M5PA 2CLHA 4MYAA 3N9RA 4MPQA 1R46A 3GDMA 3TSDA 1H61A 1OX4A 1VYSX 1ME8A 2ABAA 1TQXA 4O1CA 2B7OA 3RLVA 4LVDA 3FJ6A 4X22A 3LV6A 3QJAA 4E2BA 2J24A 2RDTA 2Y70A 5AN7A 1GJPA 1KTBA 1RQHA 1LBFA 1K8YA 5CZSA 4XBKA 3M47A 1LLZA 2DP3A 4WQ6A 4LC8A 3G1SA 4ONVA 3HPZA 1DV7A 2HMCA 1LOQA 3EX4A 3G1FA 4JDBA 2J9YA 1OYBA 4JTLA 4CQ8A 1TRDA 1W31A 2Y6ZA 3S9YA 3IGUA 4QSHA 5FF3A 3NZ1A 5I3JA 2QCEA 3ZWTA 1HG3A 4OHQA 3W22A 4UTUA 1NF7A 1LP6A 3QZEA 2C13A 1QR7A 3N2XA 1T99A 3UPBA 4XQ6A 1A53A 5EY5A 2H3DA 4M7TA 1CX9A 1ZNNA 1R47A 3SI9A 3LXCA 4AEOA 3QMTA 4AVFA 4K7YA 1P0KA 4QNEA 3QSRA 4Z1BA 1THFD 3ABSA 4Y8FA 3DFNA 4JEQA 3P8IA 5CKSA 3S1WA 4QJ1A 3STCA 2BX7A 4YLWA 2GVGA 1RQBA 5EMUA 1H1ZA 2O7QA 4JTKA 1XI3A 2OMAA 3EKLA 5J5RA 1LM1A 1KLYA 3NQEA 3O07A 3DXIA 5K3VA 1CW2A 3C2EA 3C6CA 2RHGA 1TQJA 2XN0A 3MI6A 3TQ0A 4FNTA 5HR6A 5AYZA 4FX7A 1FWNA 3GXPA 4WJEA 1R30A 3TAOA 3M43A 4ALDA 3N34A 5SWUA 1GTEA 3NOEA 5LSMA 3CB8A 1GVFA 4LVFA 3SGZA 1GVRA 1BWKA 2H8XA 4ZL1A 4UR8A 3A9IA 3LX9A 4FEZA 3RF9A 5FEPA 1ZCOA 3N14A 3G0SA 5F4WA 2OZ0A 3TE9A 1N7KA 3K30A 4RZ6A 3NQVA 2CLFA 3UWYA 4M6QA 4L4MA 3G24A 3ANYA 5BOOA 3T4CA 3E02A 1AMKA 2E1DA 2QCNA 5EBUA 3GKAA 4DPPA 3KRZA 3WK1A 1FWRA 5D03A 3E49A 4Q4KA 3NL3A 3W1LA 3U8GA 3OHIA 3JS3A 3TC6A 1TV7A 4LUJA 2J88A 5C5YA 1KM5A 1EPXA 5CSSA 3P8JA 4W9TA 3HGRA 4YXGA 3L0NA 1SFLA 3TAKA 1TYGA 3NYZA 3LV5A 3UXDA 2P1FA 2A5HA 5E0KA 1JCXA 2PRMA 3A24A 3G1XA 5D33A 1VLWA 4BWLA 3ZR4A 4LVBA 1Z41A 3SECA 1ICPA 2NX3A 1F05A 1Z48A 4K38A 1X8FA 3LCWA 1KM1A 1MEHA 3EKZA 3FIGA 5D38A 1ZJIA 4IMEA 4UC5A 2QF7A 3F4NA 5IM51 4LS0A 4O28A 4NNBA 3QQ0A 1WV2A 3BPWA 3UYCA 4DELA 1YXCA 1TPUA 2R91A 1DJNA 3TFXA 3CEPA 4OBTA 2JKEA 5E1QA 4NJJA 2AAMA 3W71A 1A5CA 2TSYA 3FEMA 3BLIA 2RH9A 3NAVA 3QPYA 1KTNA 1CI1A 2HTMA 4O53A 3W2LA 3LXBA 3WK3A 3GAYA 1JR1A 4JY9A 1KM6A 1NSJA 1K8ZA 1KLZA 1GTHA 3CPRA 1OYAA 4UFMA 3LM7A 1O95A 2Q8LA 2CFFA 3BO9A 1W3TA 3O16A 1OX4B 1DL3A 2Y7EA 2NWSA 4IOTA 4HPJA 2NX1A 2QUVA 3C4UA 3QM3A 1U83A 4OU1A 1JUBA 4JTHA 3VE9A 1U5JA 3PUEA 2W79A 5KZDA 1EP3A 3D0CA 4FNPA 1B57A 3LRKA 4NX5A 2XFWA 3NQ7A 3IEBA 4JYDA 1DORA 1O5KA 4JN6A 4I9AA 1VCGA 3NXFA 4FX6M 3WJXA 3W72A 3Q37A 3EX1A 1QNVA 1H51A 2CLMA 3V75A 4UFHA 3L66A 1K03A 1UASA 4O0ZA 3GR7A 1SZGA 3S5YA 2FTPA 2OT1A 1JRCA 2YW4A 3G1AA 3MWAA 3VI2A 1H1YA 3EX2A 3LCLA 3M5XA 1JRBA 4UMCA 1NF0A 3T7VA 1XFBA 5KITA 1JCLA 2GJLA 3W74A 1W37A 1R2SA 3C2RA 3IGXA 3IIVA 4JS3A 3TSBA 3CTLA 2ZRUA 4IMCA 2FB3A 1LYXA 1LZOA 1D9EA 2B7QA 3CT7A 2XN2A 4E2DA 1XBYA 3G0UA 5G1YA 2VFHA 1H7PA 1AL8A 1TV8A 5EKYA 2NLIA 2V30A 4P61A 2WNNA 5AHNA 3T78A 2FB2A 3EWWA 4O1DA 1KFJA 3TMQA 3PG9A 5HNRA 1GQNA 3EWZA 2V0TA 3NA8A 3LERA 4HSOA 5D04C 4XKYA 2RFGA 5D02A 1KM2A 1SZNA 3NQAA 5D05A 4LS2A 3MHGA 3THQA 1MZHA 1H60A 4XTDA 3LCXA 4N6FA 3MBFA 3W1XA 2OCZA 4UNLA 1D3GA 2G5WA 2NXIA 4WX2A 4JICA 3W6YA 1FUYA 1G7UA 3HGOA 3TW6A 3CC1A 3W1PA 3LCIA 3HGSA 4ORMA 2J6XA 3SW6A 4GUFA 3RFAA 2QCLA 5DXYA 1F5ZA 2VKZG 3GDLA 4KFOA 5J5DA 1FDJA 2DZTA 3MBDA 2JKAA 4LUIA 3I6RA 5C6MA 4A3UA 4MY9A 3L0KA 3SR7A 5LZLA 3G1HA 3EWYA 2V9DA 5KZMA 2V8ZA 1QFEA 1NFBA 3TH6A 5CPMA 5LGZA 3LHVA 1L6YA 3O1NA 4OE7A 1LRTA 2ZTKA 1W3NA 2QKFA 3W07A 3O06A 4IUOA 4NQ1A 3U6WA 3VCRA 5DCEA 2FQIA 2ISVA 4LNYA 5I3KA 3UQNA 2VEKA 2ZQ0A 3BG9A 3EXSA 3KVMA 5DBTA 5DCBA 5K9CA 1ALDA 2VEPA 4TMBA 3RU6A 4YCOA 3HPXA 3M5YA 3SJ3A 3W87A 1SO3A 4LS1A 3P60A 4FF7A 2UV8G 3O63A 5EL1A 4Z1CA 4DPQA 1IF2A 4BFAA 3ZFHA 5LNWA 3KXQA 5I3HA 1M6JA 3R12A 1GVQA 4QM1A 4AHQA 2ATMA 1Q6LA 1G7VA 2WPBA 3C8FA 4CNPA 3TFCA 2EGZA 2YZRA 3DFQA 3T55A 2PRLA 4PL1A 1SW3A 4O11A 5A8GA 1XUUA 4IWWA 4ZQPA 5HQEA 1X1ZA 3PBWA 3PBUA 3QH2A 1G4EA 5BMXA 2QCDA 3NPXA 4MIMA 1G4PA 2P0OA 4JTEA 4GBUA 2A7RA 3M6YA 1Y0EA 4ZQOA 3RK8A 1FCQA 2ZZ4A 4EWND 1HTIA 3R13A 1YTKA 5DLCA 1QPRA 4NJGA 3W2KA 2Y7DA 4IXXA 3OA3A 2QJHA 3L5AA 1VPXA 2BSLA 2KZHA 3PSVA 5LGXA 2E6AA 4UTMA 4HIBA 1H62A 1ADOA 1ONRA 1KM3A 3EXTA 4K39A 2CW6A 2VOMA 1HO1A 2GVJA 1TRIA 2IQTA 3C2VA 1SW0A 3W7RA 3BV4A 1W3IA 5T26A 5FESA 3MP3A 3FYPA 2ZYFA 3O6DA 3L21A 3A5FA 2Y62A 5H2ZA 4OWGA 6TIMA 3W7JA 3TCEA 3KAOA 1K8XA 1T8XA 1OX5A 3S1VA 2B4GA 1QPNA 3B8DA 3W88A 1TPH1 2FFCA 5G5IA 4DEFA 4WY0F 1V7YA 2C14A 4LRTA 5D2YA 3NQ6A 4BK9A 1LROA 3EX6A 3DHDA 1G6CA 2W6RA 1RD5A 4A2SA 4UFKA 4GUGA 3DI0A 1YLVA 2PURA 3HG2A 3LDVA 3B04A 3WJSA 3INPA 4DQWA 2HSAA 3W7IA 1RQEA 3W7GA 5TBOA 1OABA 3LBMA 3ELFA 3S5OA 2NZLA 2J9ZA 3C0JA 4XKYB 1PIIA 4LU0A 1SQ7A 3GR8A 3UD6A 3W1UA 1RR2A 3WFAA 2E6FA 3E96A 3O6CA 3W73A 1PVNA 3FFSA 4X9SA 4NX0A 2DZXA 4PCFA 1KFBA 1Q45A 4OGZA 1TTIA 4GXMA 3BGJA 2E6DA 3UPWA 1PHQA 1R2TA 2Z0IA 3THAA 4RJEA 5HUPA 3HF3A 3A22A 1FCUA 2I9EA 3LCFA 4RLIA 3LHWA 3DENA 4WOQA 5K7JA 2QCGA 1OFRA 3S6DA 1WYIA 1KV8A 4H3DA 2V81A 5CZTA 3QPZA 4H4IA 5D2TA 1TPVA 2V2HA 1TREA 4DXVA 1T0OA 4NZFA 5C2XA 2AQWA 1K02A 5L6UA 1GG1A 3G22A 3PB0A 3HPSA 3QC3A 1PCWA 1OF6A 1VRDA 1IXPA 3NGJA 2WO5A 4C1KA 4AXKA 2GVLA 2YGYA 4FIQA 1QCWA 2A1YA 3BW2A 4QITA 4AMAA 5K9DA 2WNQA 4N4QA 1R2RA 4X2RA 2C19A 4RKAA 4N9DA 4A22A 1XM3A 4MUZA 2I14A 1FCBA 3IVTA 5H91A 4JDYA 4ADUA 2JK2A 4ZQRA 3KHJA 1EWEA 4PODA 3QRHA 3CIWA 3B05A 4AAJA 1H7OA 1QWGA 5F2IA 3M1ZA 1W5QA 4MZ8A 4JX4A 4YL2A 3P67A 1H63A 1XXXA 3S42A 4MY1A 1A5AA 4UFJA 1XBXA 1A5SA 1SO5A 5F1VA 3LHZA 2RDUA 4I7VA 1FY6A 2Z6IA 4UMBA 4QAIA 5EPDA 4FNUA 3PR2A 4XWUA 2QCDB 4I7UA 4OV9A 1NVMA 2FPTA 4R53A 4HN4A 5KINA 4IQLA 3STGA 5K2ZA 1MEIA 3WJZA 3KX6A 4Q33A 3UZ5A 4PEKA 3QQ1A 1P0NA 1XKYA 4DBEA 3I7QA 3M7WA 1LLWA 1SZFA 4ZQNA 3GNDA 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 3W84 A;  1O5X A;  4O57 A;  1VQT A;  2CLL A;  4JIP A;  1JCM P;  2OX1 A;  3GDR A;  3R89 A;  1VGA A;  3ATY A;  4ICN A;  3TUU A;  1GVS A;  2DZS A;  3PG8 A;  3MMT A;  4E38 A;  3UWV A;  4O13 A;  3HG5 A;  1WOB A;  5U4N A;  1ZFJ A;  4IMF A;  1EWD A;  4AWU A;  1LOR A;  2Q8Z A;  3G1V A;  3A23 A;  3OBK A;  3LB0 A;  3LXA A;  3B0V C;  4FHA A;  3NL5 A;  1YPI A;  4MZY A;  7TIM A;  3GYE A;  3C61 A;  4GE8 A;  2CWN A;  3G8E A;  2Z6J A;  3GLC A;  3HMJ G;  1YPF A;  1OG0 A;  4RX0 A;  2CLE A;  2VFI A;  1QPQ A;  4IPI A;  3NPW A;  3F03 K;  4O14 A;  5KZE A;  4AWT A;  2QCH A;  4HSN A;  2QCM A;  4DF2 A;  5C54 A;  3W2U A;  3MHF A;  1B4K A;  3BAR A;  2YCE A;  1G4S A;  5FEX A;  5HUO A;  1LCO A;  3Q2D A;  4IMG A;  2JKP A;  3HBL A;  3IIX A;  2O7S A;  4O52 A;  4Y9A A;  2CU0 A;  3PY2 A;  2FIQ A;  3DFP A;  1W0M A;  2QAF A;  1J2W A;  4EVZ A;  3S8H A;  2Y89 A;  1ZEN A;  5AC8 A;  3CLM A;  1L6S A;  3DAQ A;  4MFE A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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