1TPWA

Triosephosphate isomerase drinks water to keep healthy
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
245
structure length
245
Chain Sequence
RKFFVGGNWKMNGDKKSLGELIHTLNGAKLSADTEVVCGAPSIYLDFARQKLDAKIGVAAQNCYKVPKGAFTGEISPAMIKDIGAAWVILGHPERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKAIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKTHVSDAVAQSTRIIYGGSVTGGNCKELASQHDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The role of water in the catalytic efficiency of triosephosphate isomerase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
molecule tags Isomerase(intramolecular oxidoreductase)
source organism Gallus gallus
total genus 89
structure length 245
sequence length 245
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 1994-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1tpwA00
2C0AA 1Q6OA 2BLEA 2QCHA 4POCA 3CM4A 5CSRA 1VR6A 1W37A 2RFGA 1FCVA 1NF0A 1KBJA 1TTJA 3EXSA 2Y89A 2ZRZA 2CZEA 4GUIA 3OIXA 3BK0A 1D3HA 1YDOA 3HPSA 3R5EA 5K7JA 1F6PA 5CPMA 1H1ZA 1F73A 1LTDA 2C13A 1XDMA 1XCFA 5CPNA 4LVDA 3HG2A 3WK0A 4FNPA 1S5VA 4UTTA 3W1PA 2QAPA 5T26A 4GUJA 1OFRA 3P62A 2R14A 1OX4B 5TQLA 4UTUA 5CZSA 5AYZA 1LDCA 1TQXA 3B05A 4ZQMA 4Z08A 2E6DA 1VRDA 3L5AA 4FF7A 5BMWA 3W6YA 1Z42A 3MI3A 2YFNA 1ZNNA 4JDBA 4AMAA 4JGDA 3I7RA 2V30A 2H3DA 4BFAA 4IX0A 5IBXC 5EYWA 1BWLA 4MY9A 1XUUA 4DO5A 1A5SA 1SQ7A 1WXJA 1H7WA 1JCXA 4NZFA 2WNNA 1GG0A 3NDOA 2AQWA 3LGEA 2GUUA 3HJZA 3F03K 2V8ZA 3G0UA 3T7VA 1RR2A 1B57A 3EX4A 3W7IA 3NQDA 3W22A 4UTWC 4JTLA 2XN0A 3NNTA 2OX1A 4X2RA 4AWSA 4WXZA 2OMAA 1YXDA 2WSYA 2X30A 2V2CA 4XBSA 3KVMA 2YX0A 4IX2A 3LCXA 1ZAHA 2FIQA 4IUOA 3WFAA 1AG1O 3I6RA 4FIRA 3PUDA 4FNQA 1R2SA 1O5XA 1I4NA 1UUMA 1FDZA 3FYOA 1N7KA 3Q58A 1J5TA 1BWKA 3NL6A 1OFAA 4R33A 3IVTA 3W7CA 1H62A 1LOLA 1PVNA 1M7PA 1XC4A 4O0KA 3E49A 1TJRA 1H7XA 3U2OA 5L9FA 2PRMA 4MZ8A 1FCUA 2NUWA 2G96A 3RLVA 3W70A 1FWWA 2W6RA 3TU9A 2A7PA 1K8XA 1L2UA 2WSRA 5FI8A 2YW4A 3W3OA 4WXYA 3FA5A 2QF7A 4UFMA 4MYAA 4PCFA 4HIBA 5DBTA 1SSGA 2NX1A 3SZ8A 4NJJA 5D2YA 4Z1BA 1ICSA 1AW2A 3TJXA 4A2SA 2V0TA 1OFBA 3G1DA 3MMTA 1KM0A 3KFTA 3W7QA 4N4QA 1AL8A 3QQ0A 3NZ1A 2VFHA 3TSBA 5I3GA 4RV8A 3TXZA 1I2PA 3A24A 3QF0A 2OJPA 3P7YA 5D09A 3OA3A 1NSJA 4HNUA 2A5HA 5F2GA 3HB9A 2NV1A 4NJHA 3GR8A 3FOKA 3NXFA 4WY0A 1UBSA 5CPOA 3Q37A 2ZZ4A 3LHUA 4Q32A 3SY5A 3JR2A 2J88A 3W1NA 1JCLA 4JTHA 4Y8FA 2QDHA 1Q45A 3P8JA 2A85A 2DZTA 4DO6A 3F1QA 3E96A 1CX9A 3C3NA 4OWGA 4CCDA 3P81A 2NLIA 5LNWA 5LGXA 1SW7A 3AJXA 5DELA 4Z0JA 1O95A 4LWWA 5HWMA 2YZRA 3O63A 1FCQA 4QITA 3BLEA 3BG5A 5CZ0A 4MLRA 3GDRA 3SI9A 2DZVA 4R34A 2CLKA 3PBWA 2QJHA 3TX9A 1PIIA 1XI3A 3LBMA 1ML1A 3JS3A 1OX6A 3S5NA 1TPFA 1GVOA 1I2OA 4JIQA 2Y62A 2QAFA 1PS9A 3PG9A 1EB3A 1NF7A 4QNEA 2YGYA 1H7PA 1KFLA 3LRKA 4LVAA 3HG5A 3WK3A 1FXPA 3NQ8A 1P1XA 3MBFA 3GDLA 1KW1A 2KZHA 3W7PA 2XN2A 3SW6A 1TIMA 2ZZ3A 1OFDA 4FNTA 3FS2A 5KZEA 5GVJA 4RLIA 1OFQA 3NO5A 5G1YA 3O6YX 2WPBA 2ZRVA 5BMXA 1EEPA 4LU0A 3UWWA 5LHEA 4X9SA 4Q33A 2NXGA 2R94A 3GVGA 1K7EA 2E68A 3H55A 4TMBA 3MP3A 2FPVA 1ZJIA 3GKAA 1FQ0A 3QMSA 1ZAIA 3DAQA 3OG3A 4JTKA 1DOSA 4MPQA 3H53A 4WZHA 2BX7A 1XFBA 4LVGA 3PB0A 2VEMA 1X1ZA 2J24A 3I65A 4WD0A 2A0NA 1O94A 1QPQA 2CLLA 3DFNA 1XKYA 5J5DA 1T96A 5D2TA 2QCFA 2H3BA 5DLCA 4A21A 1LLZA 3UZJA 3B0PA 2B7OA 4PL1A 3IVSA 4CCEA 5HMSA 3LHYA 2ALDA 3KVKA 4IXHA 1H60A 1YADA 5HULA 3NG3A 5EKYA 3KAOA 1ONRA 3LCWA 4ORMA 1ALDA 1T0OA 3LCFA 3HQ1A 4FXSA 4UTJA 1DL3A 5G2IA 3P82A 3BVJA 3S5ZA 4ADUA 3UQNA 2XFWA 2V5BA 1FBAA 4M6VA 4EIVA 2JKPA 3W87A 1F05A 3NQCA 5C2XA 5G1TA 2H6RA 2X2GA 3A5VA 1TQJA 3TE9A 1GVFA 4QJ1A 3QRHA 2H90A 4A2RA 1G4SA 5AHFA 2VEKA 1UUOA 1FDYA 1U83A 3DHFA 3HPXA 4E0CA 3P84A 4BI6A 4QISA 4O17A 5HUPA 1OX4A 3NL3A 3W07A 3SGZA 2J6XA 4FXRA 3LBCA 2ZTJA 2QCGA 1GVQA 4MVAA 2JBMA 1F2JA 4IMEA 2C15A 3WK1A 1WOBA 1QFEA 1QPNA 2TPSA 5D05A 1W3NA 3UPWA 3STFA 4Y96A 5D04C 4L4LA 4N9CA 1SFJA 1KM2A 3MI6A 1YXYA 1VCVA 3G1XA 3E12A 3IGSA 3LX9A 3HG4A 5F1UA 3W23A 3DBPA 1R2TA 3VCRA 3HGRA 3TKFA 1PHWA 1EA0A 1WBJA 1TREA 5FESA 4O52A 4TMCA 3TXVA 3W7RA 3PUOA 3TC7A 4LRSA 2V9DA 2EAWA 4ZQNA 4JD4A 3MW7A 4DBEA 3QM3A 4JNMA 2VFFA 4JXCA 4RJEA 3W72A 2A2IA 3SR7A 2ZZ6A 4AHQA 1P4CA 2RDTA 8TIMA 5EMUA 1KTBA 3S6DA 3W9ZA 4RZ4A 4UNLA 3VFLA 3IGUA 1M7OA 2VC6A 1GPWA 2Z1BA 4JYDA 5AYXA 4K8EA 4I7WA 1VC4A 3TQVA 3G1HA 4PH6A 1H1YA 3OVPA 1A5AA 4JYFA 3S42A 4GWEA 1SUXA 3EX1A 3WK2A 3W7JA 1K7FA 1GTHA 1JRCA 3QW4B 4RZ5A 4KFOA 4U4MA 1JR1A 2ZRXA 3S1WA 3BW4A 2BZNA 2CLEA 3HBLA 3QSTA 4CNPA 2QCDB 4HPXA 1KA9F 2QUTA 3L0GA 1TCDA 1L6YA 4NQ1A 1A5CA 4R7JA 2DORA 2UV8G 1DV7A 1JCNA 3QSRA 5HNRA 1GT8A 1TTPA 1M5WA 3LHVA 3GDTA 2ZYFA 5DBUA 1VH7A 4HNNA 4XBKA 3PY2A 3MYPA 3OVRA 4JY9A 2GJNA 3MJYA 4M19A 2ZZ5A 3G0XA 4AXKA 2CZFA 3IIOA 4K7VA 3T4CA 3W7EA 4LY8A 3TAOA 1B4KA 1H7RA 1HTIA 3IIZA 3P8IA 3L2IA 2BSLA 3P61A 4JTJA 1L6SA 1QPOA 1OJXA 5I3KA 3GLCA 4NX5A 3GIYA 4HT3A 4M7TA 3DENA 4U28A 4ZMGA 3RLUA 2WKJA 3PBVA 1OF8A 1KFCA 4O1CA 4Z0SA 3W86A 4JS3A 4UC5A 1TB3A 4O10A 4NNCA 2A6LA 4UTIA 4BK9A 4K36A 1TPDA 2W0UA 4FHAA 5EBUA 3HGSA 4LNYA 4N02A 5D03A 4RKAA 1W0MA 3W73A 1OK6A 1VQTA 1K7XA 3K30A 3G1VA 2GVJA 4UR7A 3EWBX 1FWTA 3VNDA 4FNRA 5AOUA 2Z6JA 1R46A 1QNVA 1RD5A 1YPIA 4JEQA 3KHJA 5DY2A 1VHNA 2AAMA 2W79A 1HO1A 4IWWA 1XBXA 1S5TA 2GVLA 2OT0A 2A6NA 3LCIA 5CZJA 4IMDA 4OV4A 3VI2A 2QR6A 3GDKA 5FF3A 3PG8A 3TFXA 3PBUA 3UZ5A 1GWJA 2DZUA 3THAA 3IVUA 3I7SA 3LTSA 4MJMA 3S5YA 3CIXA 1SZNA 3WJSA 1F7BA 2E6AA 2PRHA 5KITA 3LV5A 3E9AA 4W9TA 4K7YA 3O07A 1CI1A 3S1XA 4BR1A 2FQIA 3PULA 4UTLA 3LLDA 1TTQA 3STCA 5KZMA 2BXVA 1WOAA 3M5YA 1MEHA 4GE8A 2ZQ0A 3PB2A 3ZR4A 1CW2A 1WBHA 2TRSA 4PTNA 3B0UX 1KTNA 2B7NA 5AHIA 3TR2A 3TMQA 1K8YA 2J27A 3LRLA 3P74A 4LVFA 2X16A 3DXIA 3HMJG 4BWLA 1VGAA 3TIMA 1OYCA 3TW6A 5LGZA 1UB3A 4N2YA 1AW5A 1JCMP 1G4PA 2RKXA 5FF7A 3C56A 4UTTC 4JTIA 2LLEA 3QW3A 1OG0A 4NX0A 4O4VA 1JVNA 4JICA 1TPB1 2QCLA 3KRZA 3MHUA 3ABSA 2CLMA 3W7LA 1YTKA 4PA8A 2Y63A 4RK8A 4PC8A 1KM1A 5FF0A 3NR0A 4NZJA 3E0IA 3INPA 2AGKA 4FX7A 4CNNA 1TPUA 3NQ2A 4OQVA 1NEYA 3N2XA 3R12A 3G1SA 2Y88A 1OYAA 2F84A 3KX6A 3STEA 3NQ7A 4N9BA 4JX4A 4UTWA 1SR9A 5AHLA 5AHMA 1SO3A 4DF1A 4AF0A 1BEUA 1GVRA 2VXNA 4ZQPA 1W5PA 1S5WA 3W1UA 1W54A 4IQLA 1JJKA 2OCZA 3PAJA 3KVLA 3W7HA 3FKKA 3UY8A 3ELFA 5H91A 4S1FA 4AB4A 2YSWA 1KTCA 2B7PA 4M6PA 1N8FA 1U5JA 2EF9A 2QCNA 4DF2A 1KM6A 3TCEA 4NJIA 3FYPA 2C19A 4FX8A 5C5YA 3AO0A 2WJZA 4N4PA 4O12A 5K4XA 4IPIA 2GQAA 4N9EA 2YFOA 3EX2A 1LORA 3LERA 5LSMA 4ADSA 3ZWSA 1YTEA 4XTIA 2H8XA 1GG1A 1T99A 4FNUA 1G6CA 1V5XA 5CGQA 1WYIA 3IGXA 2GQ9A 4WQ6A 1GTEA 5HWNA 2QKFA 4O14A 4EF8A 3W1QA 5U7SA 1GEQA 1K03A 2BWGA 3BPWA 1H50A 5HR7A 2IQTA 3TA6A 4YCPA 2Y7EA 1W5MA 3HG3A 4QM1A 3IEBA 2CFFA 5HJLA 1DHPA 4WUIA 1IXQA 3OHIA 5KMYA 1B4EA 4PL2A 3R89A 4K37A 4MFEA 1QOPA 4KWVA 3TUUA 1XL9A 3TMLA 3C61A 3F4WA 1I8JA 4O18A 4O1DA 3G1YA 2HS8A 4JX6A 1M6JA 1ME7A 1TMHA 2P0OA 3IIXA 4UIOA 4UMBA 3NPWA 4WOQA 3W2LA 1FUYA 1HFBA 1XBVA 3BARA 1KFBA 4EWND 4HNTA 2WNZA 5K3VA 3EX3A 1LCOA 4HSNA 1ZCOA 3P5ZA 1EIXA 4Z1AA 2ISVA 4JY8A 2ISWA 4JX5A 3P67A 2E5CA 4MZYA 3O1NA 3S1VA 3NOEA 4XZ9A 3QC3A 1NVMA 4M7SA 2RDUA 2ABAA 3NQ6A 3BGJA 4AWTA 1BTMA 1XBZA 2J9XA 2G97A 1H51A 2FPTA 1WA3A 3LLFA 3LV6A 3NAVA 1ZY9A 5AN7A 1TRDA 2Q3RA 1EP3A 3SECA 5AFDA 3QEZA 2VEPA 3KRUA 1ZFJA 3N73A 4A29A 1OFPA 2P10A 4NU7A 2ZFAA 2ZRWA 1DJNA 1YYAA 2O7QA 2QJGA 3F4NA 2QDGA 1VCGA 1JCJA 4KFNA 3DGRA 2YDAA 3CIWA 2TMDA 3B04A 3W2JA 3O05A 2C14A 1GQNA 4DELA 1GZGA 2QCDA 3BLIA 3LXCA 4K39A 5AB3A 3TW7A 4FIQA 1NAL1 3W1AA 2YYTA 4LC6A 4YCOA 1OYBA 3LTYA 5F1VA 1TO3A 4LTSA 1MEIA 4K6AA 2E77A 3C6CA 5AC6A 3RF9A 1FWSA 5HR6A 2Q8LA 4AEOA 4X3ZA 3OVQA 3QH2A 4FB7A 3W1LA 3P5YA 3CHVA 1YPFA 2B7QA 4GJ1A 3W1MA 1IXOA 3HGOA 4O1AA 5D02A 3UWZA 5F2IA 2WOQA 3LCHA 1LM1A 2JGQA 4CQAA 1JUKA 2FFCA 5FEZA 1KFKA 1WX0A 1H63A 2ZZ7A 4NUWA 3EXRA 2TSYA 3IRDA 2JK2A 3MHFA 3QQ1A 1LP6A 3IIPA 4CQ9A 1AK5A 2B4GA 4AF0B 4D2JA 1QCWA 1MXSA 1KV8A 2C1HA 4O15A 1H7OA 4UTHA 3CEUA 5AHNA 3C52A 1C8VA 4H4IA 1AMKA 1W31A 3G8RA 3W2MA 5FEPA 4DO4A 4LV9A 1Q6QA 2G5WA 1I2QA 4BI7A 2PRLA 4QQ3A 4HSOA 5AC7A 4EVZA 3HO8A 4GFSA 5F2MA 4Q4KA 4O4WA 1TPC1 3A21A 2ZZ1A 3CC1A 4TR9A 4JDYA 3LCGA 3N34A 5F4WA 2Q8ZA 1I2NA 3ANYA 4OV9A 1G7UA 3TC6A 1JUBA 4R53A 3IV3A 3M41A 5C54A 4O57A 5G2WA 1LLWA 3TDFA 3M7WA 4L4MA 3GKFA 3B03A 2A4AA 1LOQA 2ZRYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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