1TUX | Genus

Total Genus 116

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	116
sequence length	301
structure length	301
Chain Sequence	AAAQSVDQLIDARGKVYFGVATDQNRLTTGKNAAIIQADFGQVTPENSMKWDATEPSQGNFNFAGADYLVNWAQQNGKLIRGHTLVWHSQLPSWVVSITDKNTLTNVMKNHITTIMTRYIGKIRAWDVVNEAFNEDGSLRQTVFNNVIGEDYIPIAFRTARAADPNAKLYINDYNLDSASKPKTSAIVKRVKKWRAAGVPIDGIGSQTHLSAGQGASIDAALPNLASAGTPEVAITELDIAGATSTDYVDVVNACLDVDSCIGITVWGVADPDSWRASTTPLLFDGNFNPKPAYNAIVQLL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure at 1.8 A resolution and proposed amino acid sequence of a thermostable xylanase from Thermoascus aurantiacus. pubmed doi rcsb
molecule keywords	XYLANASE
molecule tags	Hydrolase
total genus	116
structure length	301
sequence length	301
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	1998-10-29

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1tuxA00

3SUSA 1E71M 1CGWA 1Q6FA 3WQ5A 5HPOA 4HOZA 1W2PA 4CCCA 3ARTA 4GO9A 1OIFA 3NSXA 3VX0A 3VDHA 3GDBA 4V2XA 2VRKA 3B8SA 5JBDA 1OGSA 3TTQA 3T2PA 3OLGA 3I3EA 2PWEA 1TZ7A 1FH8A 4P7LA 4DUVA 1RP9A 3WFLA 3GBEA 1UD5A 3VNZA 1YHTA 2G41A 1H0IA 2RGLA 1MFUA 3APGA 3VD5A 2ZXQA 3THDA 2YL6A 3CUGA 4BCEA 4MAZA 1I1WA 3BLKA 1GVYA 1E40A 1ITCA 3WDQA 1UWTA 1VIWA 3WH8A 3NJ3A 2OYLA 3ZSTA 4WKFA 1G94A 4AD1A 1J12A 3WH9A 2XVPA 2FHFA 2J7HA 3BAKA 2CKSA 1EH9A 1GJWA 3CUJA 2IXUA 5HDRA 1KFWA 4D6DA 1DTUA 2J78A 2ZUWA 7A3HA 4QAWA 4HA1A 3WD3A 4JHOA 1CGXA 1GONA 1VJSA 2WVUA 2DH2A 1NP2A 4YHEA 2TAAA 1WZLA 4ZE4A 4U2YA 1UA3A 5CXPA 1J10A 3L4YA 1KXQA 2X09A 1FH7A 4FLQA 4M8UA 1CXHA 3N04A 8CGTA 3TTSA 1HT6A 5JBFA 3DC0A 4RE3A 2XPKA 4CGTA 4LGXA 1C92A 1UR8A 5BXSA 1OD8A 1UWRA 4P7NA 3K8KA 3HN3A 3U5YA 3DYMA 4XZWA 1XC6A 2EEXA 4GQQA 5F7UA 1H2JA 2C0HA 3F5LA 1WO2A 4J3SA 2Z1SA 2VNCA 3EMZA 1JNDA 3BGAA 1J0YA 2GVYA 3EMCA 4M29A 1BYAA 3AMLA 4HA3A 1ODZA 3L2LA 4N42A 1VRXA 2J74A 1UUQA 1VBUA 3M07A 4U31A 3VNYA 4GI9A 2DT2A 4Q22A 4Z2IA 4U5IA 3WDIA 4GI8A 4BA0A 2WWDA 4ATWA 3AFBA 3AICA 1PEZA 3VIHA 4J27A 1B9ZA 1EGZA 2OWWA 1W3KA 3MUZ1 5A95A 2ZWYA 1DWJM 5M17A 1BHGA 4FLRA 3B9DA 7CGTA 1KWGA 1QBAA 3HJEA 5CZKA 3AZSA 3UG5A 1GOMA 2PB1A 4MNMA 3CHEA 3LPOA 5A6MA 1FA2A 3OG2A 3QOKA 5I79A 3WBAA 2ZICA 3VDAA 4HZ7A 4EKJA 4HU0A 5AC5A 4N0RA 2QF8A 5I6SA 1OT1A 1PZ3A 1TMQA 4J28A 1ISXA 3FN9A 2CYGA 3WUEA 2J7BA 3WKZA 5CSYA 3DECA 5IHSA 4BF7A 1J01A 4X0NA 4OUEA 2CBJA 2YDRA 5ABGA 4KGLA 4AD4A 3ZJ7A 2D2OA 4FLSA 4WSKA 5CPQA 1HJUA 5KZ6A 1E6SM 3WDRA 2J8GA 1W2VA 3GH7A 2J62A 5CSUA 4UQEA 3S2CA 3PZTA 3ZT7A 1WB0A 4ZXOA 1ZBWA 2WVVA 2D22A 2RGMA 1G0CA 2ZUVA 2YL9A 3ZMRA 1H4PA 4B3KA 1UKOA 3O9NA 2VZVA 2WKGA 4HOWA 2DH3A 3L4WA 5FKYA 3OGRA 5EBAA 5A2CA 3PTKA 1HKMA 5A6JA 5DT7A 1VEMA 4UCFA 4X0VA 4LX4A 3GBDA 2VZUA 1UQZA 4GIAA 3MMDA 1VEPA 1E1EA 2UY4A 4S3KA 4D1JA 1Q6EA 2HVMA 1BQCA 5A1AA 4BQ2A 4F79A 5JIPA 4XX6A 1J0HA 2EPLX 4HMEA 1QI5A 1GOWA 1W9PA 1E3ZA 1B30A 3VMNA 1KB3A 3GM8A 1XSKA 3T2OA 5TD4A 5IHRA 1ISZA 3AZRA 3AHTA 4XUYA 1GOKA 2VCAA 3WNOA 2BS9A 4QLLA 3VD4A 2DT1A 2VVNA 1H09A 3VTRA 1DEDA 4GZJA 4FF5A 4J3TA 1OBAA 1XYZA 3A6OA 3K4AA 4CCEA 3RIKA 1OD0A 4AZGA 2QHAA 1QI3A 3AJ7A 4A3HA 1UWSA 4MNJA 1GQIA 2E4TA 1HL8A 3PZGA 4P8UA 1E1FA 2CKRA 1NOFA 3VD3A 1GQLA 5BRQA 1ESWA 1G5AA 2BHZA 2PWGA 2E9LA 3IJ8A 1B2YA 1KQZA 1TCMA 2J7FA 1P6WA 2WB5A 1KBBA 1E15A 3CH9A 4W84A 1ZBVA 3WUBA 4PUDA 2DGAA 2J4GA 1CXLA 1BYCA 1B1YA 4R27A 4UOJA 3WUGA 2DIJA 6CGTA 4PTWA 2YOCA 5A2AA 4E4PA 3VIMA 3NUKA 4BZYA 1V6YA 1LG1A 4U2ZA 4ZE5A 3WH6A 5FCZA 1QI2A 2DSVA 1Z32X 4NF7A 1JZ8A 3U5UA 5D8WA 1JL8A 3AMCA 1H0GA 1U33A 3AMDA 2J7CA 1WZAA 1J11A 2VVSA 3ZO9A 3ARZA 2OLHA 1PIFA 4AY1A 1DWIM 3VD9A 2DT3A 1D3CA 1NWTA 3PZOA 4TX6A 3TA9A 1V3MA 2J25A 1V0MA 1M04A 2BXYA 2WNWA 2UY5A 3DHPA 5DO8A 3WDJA 4DWSA 3RPMA 3ZR5A 3TP4A 3GNRA 1F4AA 1V02E 1OWQA 1MQQA 1PBGA 4W7UA 1B3ZA 2QV4A 3NCOA 5BXTA 2WK2A 5I77A 3QGVA 2D24A 2XJ7A 4OOUA 4V27A 4HU8A 4Y7EA 1EOKA 2CBVA 4ACZB 1NWSA 2Y4SA 2XIIA 4UOQA 1H3GA 2XGBA 5A6AA 1QI0A 3MSGA 1EQCA 2AAAA 3VMPA 2FH6A 4D1IA 5A6LA 3WBEA 4V28A 3W0KA 1QNRA 3KE0A 4GI6A 1HJSA 1JYNA 1MWOA 2VRJA 1VFFA 3PZNA 4Z2KA 2BY1A 4J3XA 1B3VA 1F4HA 4PMXA 5C70A 4AIEA 2NT1A 3AIUA 4J3VA 5E0FA 5FD0A 1UWIA 2O9TA 1BF2A 3L4ZA 3FNDA 4MJ4A 1BPLB 2WWCA 2D0GA 2OYMA 2OWXA 2EPNA 5E70A 2FHCA 1QI4A 3QHNA 3ZR6A 4MDPA 2A3HA 1WKYA 2C7FA 1E4IA 3VGBA 2FHBA 3LPGA 3GZAA 1V3IA 3GTNA 1RP8A 1C7TA 1JGIA 2UY2A 2MANA 4RE4A 4Z2LA 3WDHA 3AISA 1J0KA 4AC1X 3VIPA 1MXDA 1SMAA 1CNVA 2BVTA 2OSYA 5HOSA 2D1ZA 4UQAA 3WEMA 1A3HA 2CHNA 1GW1A 2D20A 2VURA 3VD7A 3WQ8A 3MANA 3O6AA 4YN5A 1QNPA 1SMDA 2EO7A 2XFFA 3EDFA 1J0ZA 4KWUA 2QLYA 3MS8A 4KH2A 1XH2A 3OLDA 2X0HA 3WF1A 4IUGA 4UNIA 1DHKA 3WH5A 3T2QA 1M01A 4TX8A 3OLEA 5AYIA 2D0HA 2DQXA 2ZX9A 1BVZA 2BNJA 1H5VA 1WNOA 3DYPA 1L8NA 2ZX7A 5E0CA 1MVYA 2WAGA 1UHVA 1E4LA 3BMWA 1HF6A 1UD2A 4U3AA 1JI1A 3MU7A 5FIPA 1EO5A 1UH3A 5I78A 4JCLA 3GNOA 3VINA 1K9TA 4Z2JA 3GH4A 3MO4A 1E0WA 1KXHA 3ZSSA 3ARPA 4D6IA 4W88A 2CEQA 1J18A 5I24A 3WNMA 2A3CA 3UG4A 3AIQA 3RCNA 3ARWA 4J3UA 1EHAA 2WLYA 3W28A 2CCRA 1Q6GA 4EAMA 3QR3A 5BRPA 2ZUNA 2CITA 2G3IA 2OYKA 1W9UA 4HMCA 4LXFA 3VIGA 4AWEA 3BAIA 3S6TA 1IT0A 1KXTA 1KGWA 2PI6A 4P7OA 3UCQA 1UZ4A 1E43A 4E8CA 2J75A 1FOBA 2XFYA 3ALGA 4TVUA 3VOCA 1CYGA 1WZMA 2XG9A 4RL3A 1WPCA 2O92A 3M7SA 5A94A 2XSBA 3BC9A 1JXKA 2AMGA 2XSAA 4TVCA 1EQPA 1MW1A 2VQTA 3W24A 2VCBA 4MNLA 2JF6A 1QNSA 1BYBA 4M1RA 5ABFA 2CIPA 1OINA 2A3EA 2D23A 2CPUA 3VILA 4PMOA 4HZ6A 4ZEPA 4PEEA 1GVIA 1M53A 1EOMA 4D6JA 3GNPA 1B3XA 5BWFA 3PZQA 1JG9A 1QPKA 3GH5A 1GQKA 3F5KA 2IUZA 1L0PA 1PIGA 5A8PA 4WSJA 4UFLA 3N1AA 2BVYA 2Y24A 2QPUA 3RM4A 4BQ5A 4CD8A 3WY1A 2WMIA 2ZX6A 3MSDA 2YLAA 1C8YA 1GHSA 4AZ5A 4UR9A 2FGZA 1XSJA 2JFEX 6A3HA 1WAWA 2W66A 1NOUA 5ABHA 3ZOAA 2V3EA 2CXGA 4JKKA 1BG4A 1VJZA 2WVVB 4ZENA 1R86A 3EDDA 3AS0A 4AXNA 5A8NA 4CN6A 1D2KA 1S46A 4MB4A 3WMSA 2VR4A 3BCDA 3CHDA 1VFUA 5A3HA 4E8DA 2WZIA 1UYQA 5D8ZA 3WN6A 3WQ4A 1C8QA 3NSNA 3WMCA 4PUEA 4NSBA 3E1F1 4KMQA 4CVUA 4AZCA 3EMQA 4JKMA 1Y7VA 1NH6A 3EDJA 3VM5A 1NWUA 2VX4A 4PMQA 3FY1A 3J7HA 1AMYA 2WBKA 3DYOA 2XWDA 4OZOA 5BCAA 2EPOA 4XZBA 1NWRA 3U57A 3SUTA 1W9XA 3PTQA 5I23A 5LA2A 2GJXA 1ZJAA 1OIMA 1DWAM 4PTVA 4DUXA 1J0IA 3BAJA 3CGTA 4OOZA 2ZX5A 1W9BM 4HA4A 4CCDA 4P7RA 3SUWA 3DHUA 1TUXA 3CTTA 1EDQA 1E72M 1US2A 1W1PA 2YBTA 4PN2A 4XB3A 3CZ8A 4UFIA 4M24A 1UOKA 1UD6A 3ZM8A 1E5JA 4MAVA 4URIA 3A4WA 1XV8A 1PX8A 4JFUA 3AMGA 1AQMA 1EDGA 1NARA 1DWFM 2CESA 1V03A 1UKSA 1E6RA 1OB0A 2A3BA 3FAXA 4GINA 1R7AA 2WW5A 1LJYA 2ZX8A 2ZUUA 2X8RA 1XH0A 1TFVA 1LG2A 3W37A 4GPNA 5DMYA 2WCSA 2J79A 3MV11 1VENA 3SUUA 4BQ4A 1GNXA 1ODUA 2YL5A 2D3LA 3WL0A 3W4RA 1HVQA 4ML4A 3AHYA 2DSKA 3RJXA 5A8QA 3WSUA 1JIBA 3MV01 3T0AA 1B31A 2GJRA 2G3NA 1UH4A 3PZVA 2HISA 4PMVA 3HU7A 4U33A 2O9PA 4LYRA 4H2CA 1MQPA 5CLTA 3BLPX 1V6VA 3KL0A 1RD6A 2VUYA 3KL5A 3SCNA 2G3MA 4U5KA 3N9KA 4RE2A 2XVKA 3SUVA 4PTXA 3ARXA 1C3FA 3CUHA 4W85A 3SCRA 3UETA 1W32A 1WDQA 1ZBCA 5GPRA 2WZHA 1ISYA 3CHFA 4F9DA 4DWSB 4IM4A 1W9VA 3AI0A 1EXPA 5BXPA 3U7BA 4H7VA 2YA1A 1W9DM 2F2HA 2WPGA 2XHYA 4W8LA 1I75A 4Z2HA 1LL7A 1ZJBA 4UTFA 1UR4A 2DEPA 1JZ2A 3CLWA 4AZ6A 1GOQA 3A4AA 4W7VA 4C7FA 2YL8A 2BFGA 1CEOA 3LPPA 3HMCA 2F8QA 1O6IA 3W29A 1E0VA 1FP8A 1KWKA 1HJQA 4PSPA 2WLZA 2EBNA 2PWDA 3T0BA 1GJUA 2DSUA 8A3HA 1HN1A 3SCUA 1TG7A 2WXDM 1GCYA 4J7RA 1IZKA 3ECQA 1UR1A 1C7SA 4HZ8A 1JFXA 3UEQA 5IFPA 2B31A 1UKQA 2A3AA 1W3LA 4W86A 5FL0A 1WE5A 3BXWA 1UKPA 4WJXA 2VTFA 3FAWA 2JEQA 1MW2A 1V3KA 4B16A 1XD1A 2OSXA 3UG3A 1CXFA 1GORA 2BVDA 4PCSA 5FOOA 3SIMA 4GQRA 3VKKA 3ARUA 4CKQA 2WYSA 4WKAA 3A3HA 5LA0A 1V0NA 2E3ZA 1QBBA 4D72A 3VIKA 2WC3A 4TTUA 4P8XA 5IXEA 1UD8A 2BY2A 1CGYA 2GK1A 3BSHA 4OBSA 3AYRA 1R87A 2X0YA 3CUIA 7TAAA 5A8OA 5A2BA 1DWHM 1TVNA 1U30A 3MUAA 1MW0A 1JI2A 4GZEA 1EO7A 1UG6A 2NW0A 4BS0A 3AIBA 1UD3A 3WL1A 1QW8A 3MUY1 4DM2A 2V3FA 5FL1A 4D71A 1KGUA 4QLJA 1HX0A 5I0DA 5A8MA 1XSIA 3N13A 2FH8A 4CN4A 1U2YA 3CUFA 5D4YA 1BYDA 5D9PA 2W5FA 3QHMA 1VBRA 2X1IA 5A6SA 2VRQA 2DSZA 1V3HA 3TOPA 2DSWA 2BV9A 4PRWA 4MADA 2EPKX 3VO0A 4AD5A 2J7EA 2WCAA 3FW6A 3SCPA 4AISA 1HP4A 1MQRA 1GPFA 2WHLA 3AHVA 1E0XA 3IAPA 1K9DA 1LQ0A 3VGHA 3CMGA 1CXIA 4M80A 1C93A 1FFQA 1HKIA 3BSGA 3CIVA 4LYPA 2ZXBA 5AC4A 1CWYA 2BHYA 4KGJA 5E6YA 1TA3A 3A47A 4FMVA 4UQCA 4PMZA 3AIWA 1CBGA 1DP0A 4OJYA 3VGDA 3WH7A 1CZ1A 3W82A 1CPUA 1TR1A 5DT5A 4PSRA 4A4AA 2W63A 5LA1A 1JYWA 1BAGA 1CTNA 1W1TA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2CBU A;  4JL2 A;  5EB8 A;  2W62 A;  1CGT A;  2CBI A;  3NIY A;  3MKK A;  3THC A;  1C8X A;  1JAK A;  2JIW A;  4JAW A;  1OGB A;  2V5C A;  4MPK A;  3AHX A;  3M6D A;  5DFA A;  4HTY A;  3UR8 A;  3AS2 A;  2YBU A;  4U3C A;  1JDD A;  3BAW A;  3OZO A;  3POH A;  2VC9 A;  4QFU A;  2XM2 A;  3AS3 A;  4JHZ A;  1LF1 A;  2Y8V A;  5EMY A;  4OKD A;  3IJ9 A;  3EYP A;  1G01 A;  3I3D A;  1V3L A;  2WHM A;  3RM8 A;  1ZBK A;  3W27 A;  4TTG A;  4X9Y A;  5LYR A;  4HP5 A;  5I2U A;  3PN8 A;  1W3H A;  2GSJ A;  3KZS A;  2CET A;  1K9E A;  3CZK A;  1BLI A;  1V0K A;  3CHC A;  1KXV A;  3PZU A;  3N15 A;  5JUV A;  2X05 A;  3RIL A;  2V38 A;  3PBG A;  4AMC A;  3VUP A;  1LWJ A;  1CGV A;  4HOX A;  2XTK A;  1QNO A;  1ITX A;  1E70 M;  1NOW A;  4CU6 A;  4JKL A;  4WKH A;  4BQ3 A;  3MMU A;  5CGT A;  4IPN B;  4NI3 A;  3ARQ A;  3AIE A;  3OGS A;  1TA3 B;  1Q6D A;  2ZWZ A;  3CZE A;  3BMV A;  3ALF A;  4TUF A;  3WD0 A;  2Q8X A;  4QDM A;  2WMF A;  3ZJ6 A;  3WFZ A;  4WLC A;  2XWE A;  4F9J A;  1HVX A;  2F61 A;  4M82 A;  4WIW A;  2FDM A;  1X6L A; 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 5AYB A;  4MDO A;  5D9O A;  1W3J A;  1VFM A;  2V3G A;  4ATL A;  3N17 A;  4CU8 A;  9CGT A;  3L4V A;  2D0F A;  3QHO A;  2YDS A;  1ZU8 A;  4HPH A;  2EXO A;  2DT0 A;  3NDY A;  5EFD A;  3UER A;  1HJW A;  1WDR A;  3T0D A;  2JEP A;  4MTV A;  1RPK A;  1N82 A;  1MYR A;  3N12 A;  1BVN P;  2VT0 A;  2VL4 A;  3SCV A;  4PBG A;  4ACY A;  1E4M M;  3VGE A;  1AQH A;  4NZC A;  4XV0 A;  2BY0 A;  4P7Q A;  4KRU A;  3WEO A;  1NP0 A;  3II1 A;  3VVG A;  3AQU A;  4PMN A;  4W7W A;  1FHL A;  1W91 A;  3L4U A;  1WP6 A;  2UWF A;  1XD0 A;  2XFR A;  1HNY A;  3VGF A;  4UFM A;  1TVP A;  3ZT5 A;  4M81 A;  4CD4 A;  1NM9 A;  2Y2W A;  4H8H A;  3SCO A;  2E40 A;  4AIO A;  3WEN A;  4HMD A;  4PCT A;  3VIO A;  3CBW A;  2WHK A;  4H04 A;  1JXJ A;  5KEZ A;  3AS1 A;  3W81 A;  3K4D A;  5ABF B;  4R5E A;  4F66 A;  1IZJ A;  2XIB A;  2FGL A;  2ZUM A;  3KL3 A;  1QHO A;  1ECE A;  2YKK A;  1UQY A;  5E6Z A;  3BCF A;  2YIH A;  4UZU A;  4W5U A;  5I3D A;  1V0L A;  1E3X A;  1W1V A;  2NSX A;  1JZ7 A;  3N11 A;  1CXK A;  2WC4 A;  5A69 A;  5EFF A;  1B0I A;  2VZT A;  2WAN A;  2VX7 A;  3POC A;  3ARS A;  3WQV A;  3AOF A;  4JFV A;  2WMI B;  4ACZ A;  4QP0 A;  1GZJ A;  5CGM A;  2EPM X;  1WDP A;  4AZ7 A;  4PMU A;  1H41 A;  2WMG A;  3VM7 A;  4AW7 A;  5D9N A;  2D3N A;  4UOZ A;  4S3J A;  4AZB A;  2PC8 A;  1WDS A;  2PBO A;  1D7F A;  1UWU A;  2DDX A;  1M03 A;  2PF0 A;  1MXG A;  3WQW A;  5GQB A;  1VB9 A;  4WF7 A;  3SCT A;  4A3Y A;  5M3W A;  4Z2G A;  1HJV A;  4JFS A;  1CIU A;  3AXI A;  3SEP A;  1AVA A;  3FHQ A;  1OSE A;  5C71 A;  2ZUS A;  2BXZ A;  3CPU A;  1HP5 A;  1PAM A;  3WF4 A;  3WQ6 A;  3F5J A;  3JUG A;  3WEZ A;  5ECU A;  2VZO A;  1TE1 A;  2GDU A;  1UR2 A;  4GXP A;  3K46 A;  2PWF A;  3AXH A;  1UKT A;  3K8L A;  2YJQ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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