1TYGA

Structure of the thiazole synthase/this complex
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
MLTIGGKSFQSRLLLGTGKYPSFDIQKEAVAVSESDILTFAVRRMNIFEASQPNFLEQLDLSKYTLLPNTAGASTAEEAVRIARLAKASGLCDMIKVEVIGCSRSLLPDPVETLKASEQLLEEGFIVLPYTSDDVVLARKLEELGVHAIMPGASPIGSGQGILNPLNLSFIIEQAKVPVIVDAGIGSPKDAAYAMELGADGVLLNTAVSGADDPVKMARAMKLAVEAGRLSYEAGRIPLKQY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Thiamin Biosynthesis in Bacillus subtilis: Structure of the Thiazole Synthase/Sulfur Carrier Protein Complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords yjbS
molecule tags Biosynthetic protein
source organism Bacillus subtilis
total genus 71
structure length 242
sequence length 242
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.8.1.10: Thiazole synthase.
pdb deposition date 2004-07-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05690 ThiG Thiazole biosynthesis protein ThiG
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1tygA00
5LNSA 3QH2A 1VYRA 2Z2UA 3I7SA 2HS6A 2WOQA 3O06A 3GDRA 5HWJA 1XBXA 4HKPA 3TSDA 2NX3A 5AHNA 3TIMA 1HO4A 3KRZA 2A6LA 1W5QA 1ZAIA 1SW3A 2J88A 5DY3A 2P10A 3L68A 1AL7A 5EY5A 4O12A 2WKJA 4GRSA 1R47A 4O0ZA 3WK3A 3MMTA 3PG9A 2A21A 4PL1A 4O57A 4N4PA 3TJXA 3B03A 2C3ZA 3N3MA 3TROA 1TQXA 3ATZA 1A53A 3M44A 3W2KA 3UWUA 2BSLA 1FY6A 3G18A 5FF2A 5CSRA 5AN7A 3GX9A 1TJPA 2NUYA 1CW2A 3HIJA 4LC6A 1F73A 1QFEA 4CCEA 5F4SA 2NUXA 3OHIA 3W85A 1DORA 2R91A 3DAQA 4TX9A 1LCOA 3PY2A 3IIZA 4EVZA 3TC7A 1FBAA 4IPJA 2CLEA 3GNDA 3LCFA 1Q6LA 1HTIA 2VEIA 4MUZA 3IIOA 2JGQA 1JCNA 4LOCA 2CW6A 3ZWTA 1ZNNA 4HN4A 1LDCA 5CPMA 1BEUA 4Z08A 2YFNA 1WYIA 1FDYA 1W3TA 4OT7A 4YMZA 3R2GA 4UFLA 3W7QA 5I3IA 4GUGA 5EPDA 4MZYA 1NEYA 4S1FA 3LHTA 5U7SA 1P0NA 1PS9A 5HWMA 3N9SA 1DBTA 2QCFA 2ZDRA 1ME7A 3NPUA 1ZFJA 1VYPX 3LBCA 4UUIA 3N2MA 4BI6A 3ZFHA 4DPPA 1Q6QA 1X6UA 1JQXA 2V5LA 1FQ0A 3B06A 4MIMA 3LHUA 3NZ1A 1GZGA 2B7QA 4AWTA 1VYSX 4AXKA 1JCMP 1O95A 3QSTA 3WK1A 1KFKA 1KM3A 1H7WA 3EKLA 3LXAA 3O8AA 3M5ZA 1W37A 1JCYA 2ZZ2A 2CLMA 3GAKA 3BG3A 1SO4A 1XDLA 3T40A 1W5OA 1G4TA 4LV4A 1GQNA 1TV8A 3EXTA 4Z1DA 1FCQA 4K8HA 4ZQCA 2X2GA 4IJBA 2DORA 2YXGA 3RU6A 1GOXA 4QJ1A 1TO3A 1F6PA 2FPYA 2V9DA 2VXNA 1H1YA 4ML9A 5F1VA 4OE7A 2ATSA 1TV7A 1SFLA 3S1VA 1FXQA 2RDWA 3EWYA 3TW6A 1YXYA 3STEA 4NJIA 2VFDA 1KM0A 1ML1A 2NXHA 3MI2A 3PUDA 4KFPA 5C54A 4B5NA 1X1OA 3W07A 4S2CA 1H7RA 4NJJA 1G6CA 1XUUA 1IF2A 3KHJA 3KRUA 3SJ3A 3NQDA 2B0MA 4UTMA 3W1NA 4GJ1A 1QO5A 3G1DA 1R2TA 3JR2A 1B4KA 1NF0A 3DFSA 1I2QA 1WBHA 4HIBA 5CGQA 2JK2A 4O13A 4DEFA 4L4LA 4Q33A 5HR6A 1PL9A 1TSIA 4UTKA 3TC6A 1TYGA 4FO4A 2XN0A 3W1UA 3W1TA 1WXJA 5EBUA 4PA8A 4Z1BA 1VPXA 4O1CA 4IUOA 3NA8A 1DJQA 4JIPA 2QCNA 2GJNA 3NDOA 3IV3A 3SFKA 4GUFA 3TDFA 5LKYA 4FXSA 4DPQA 1VGAA 1XBZA 2C14A 4NQ1A 2KZHA 2DZTA 2VC6A 1O60A 4LS2A 3EB2A 3S0CA 3CU2A 1KFJA 4C1LA 3B04A 3GKAA 5EKYA 4AHPA 1CX9A 4AWSA 1YTDA 1EP1A 1FWNA 2ZTJA 2NX1A 3PSWA 2ZZ6A 3T7VA 3M43A 3UPWA 1OABA 2C0AA 5AHEA 5E0KA 1R46A 4ZQMA 3LM7A 2ALDA 4AHQA 3TXZA 1WOBA 3UNDA 2A7RA 3VKJA 1LYXA 4I7WA 2DJXA 5LNUA 3W9ZA 3W70A 1QPQA 3TJLA 4AF0A 2Z6JA 2DZVA 2PRHA 1A5SA 1Z48A 2NX9A 3A9IA 1OFQA 3QZEA 4O4VA 3JRKA 1XBVA 4XZ9A 3NL5A 3EWUA 1TPC1 5FF7A 8TIMA 1R2SA 3EX6A 5E1QA 3T78A 3SGZA 3W83A 2WSQA 4DF1A 4WX2A 1LORA 1OG0A 5G2HA 3BPWA 4MOZA 1G67A 4A29A 3W1QA 1K7FA 3W1PA 2ABAA 1TTJA 3LLDA 3PUOA 2ZRUA 4RXGA 1YDOA 3UXDA 1BTMA 4LUJA 3W84A 2CZ5A 5K3VA 3C0JA 5K2ZA 1HL2A 4G1KA 1M7OA 5FESA 4XQ6A 3W2LA 5HMSA 1K3UA 1R30A 1EPXA 2YW3A 1D9EA 3GVGA 4QISA 2E77A 4RKAA 4UR8A 3S6DA 3NYZA 4LUIA 1ONRA 2YCEA 4MPQA 5E93A 3LDVA 5DELA 1YLVA 5DN1A 4N9EA 3WJSA 3DKLA 2G97A 3W2UA 1K02A 2J9YA 2AQWA 2TYSA 2IQTA 1FX6A 1B57A 1YXDA 4E38A 4A21A 5FEXA 1FWTA 1XM3A 3P82A 4JTJA 4KWWA 2CU0A 3FS2A 1S5VA 4LRSA 1QOQA 1QO2A 4FX6M 5FI8A 3BW4A 5J5RA 3LHWA 5MHBA 3L2IA 4O4WA 2TRSA 4CQAA 1ZY9A 1ZCOA 3ELFA 4GE8A 5D33A 4JS3A 4O8RA 2YDAA 4D2JA 4ADSA 3NL6A 5K4ZA 3EX1A 3LCLA 1KBIA 4BWLC 4PTNA 1H7NA 2Q8LA 3W75A 3TAOA 2Y7FA 3LB0A 4K6AA 5DCEA 1VR6A 1OFAA 3W7RA 3SGUA 3A5VA 1AW5A 2W6RA 4GXMA 5I3HA 1J5TA 3HGJA 4N9BA 3I6RA 1SSDA 2B4GA 5HR7A 2ATMA 3G24A 2X1SA 4WY0A 4PFMA 3EXRA 3PUEA 1QCWA 1W3IA 1GYLA 3LERA 5CG7A 1JCLA 4FF7A 2FB2A 5FF3A 3LHVA 3PS7A 3G8RA 4RV8A 1QPNA 1Q6RA 3NQ7A 4HT3A 3LX9A 2A0NA 3KAOA 3DHFA 2PC4A 4PL2A 3PM6A 2CLLA 4GUHA 4UTIA 1OF6A 2D73A 3O63A 1B4EA 1FCVA 1YXCA 4ZQPA 5I3JA 2YYUA 3QF0A 3MW7A 3EXSA 4EF8A 3W2MA 1DJNA 5F2IA 3PULA 1VHCA 3NQEA 1OF8A 4JIQA 3SSJA 1X7FA 1DV7A 3EWXA 3O6YX 4DO4A 4FXRA 2BWGA 1SU5A 1KTCA 1SUXA 1Q6OA 3KXQA 3STFA 2DP3A 2E5CA 2FLIA 3S8HA 3TQ0A 1L9WA 3M6YA 3W7KA 1SSGA 1UASA 1SO5A 3SIZA 3G1SA 2G95A 3DU0A 3RLUA 1W5PA 2QDHA 1BKSA 1OX5A 1WV2A 1X8FA 3DI0A 4MKNA 3A24A 1QAPA 4NT0A 4HHPA 4ICNA 2CLIA 3NG3A 3A22A 4ZQRA 3RLVA 3H55A 3G1YA 2VEKA 4IPIA 2ZFAA 5G1TA 4RZ5A 1EUAA 3DZ1A 3S5OA 4BI5A 2GJLA 4ONVA 4DF2A 1TTPA 3O6CA 3TK7A 3QW3A 3ZR4A 1B3OA 4WQ6A 4WUIA 4JNMA 4O54A 1GJPA 3GDMA 1UCWA 4M6PA 4R34A 1P0KA 1W5MA 1V5XA 4OU1A 1B9BA 2VFGA 3PBUA 1X1ZA 4LY8A 2DZUA 5D2XA 3T55A 3WJYA 3P60A 1FWSA 2YR1A 1GTHA 3BGJA 4DXVA 3ABQA 3GLCA 4Z0JA 3KVLA 4LTSA 3FJ6A 1K7EA 1P1XA 4AHOA 2FQIA 4JTFA 1W0MA 5HNRA 2ZA3A 1ZAHA 3NXFA 5LNWA 3IIPA 4H3DA 4UTLA 1TPH1 3W7LA 4DO6A 2HMCA 2X1TA 4H6KA 4IGHA 1TQJA 2E6FA 5LNRA 1O94A 1GTEA 2B7PA 2BX7A 3M41A 3QSRA 4BF9A 4GUJA 1KFLA 1SZEA 2HS8A 1GVSA 3G1FA 4U4MA 3FJLA 1JUBA 3KOFA 4JTIA 4N4QA 3DBPA 2YZRA 3B0VC 1NSJA 2EF9A 1VHNA 4WOZA 4K7YA 3PR2A 3M16A 1AW1A 1L6YA 3Q58A 1XC4A 1GG0A 4O18A 3VI2A 4JYDA 1G7VA 2DZWA 3G1VA 2Y6ZA 1EP3A 2NWSA 2A1YA 1VRDA 3G22A 4MFDA 4M5PA 1GVRA 3L0GA 1H61A 1KLYA 2Y85A 3C52A 4WZHA 1AL8A 1VJIA 3UZJA 1OX4A 1N7KA 3LOTA 2TPSA 3MO7A 3MHFA 3SR7A 1M7PA 3YPIA 5K7JA 2QCDA 3KVMA 4YCOA 4HPXA 1GT8A 3L5AA 3QYQA 2JGYA 1KTBA 1QWGA 3Q2DA 4ZZ9A 1T0OA 3DI1A 3NQCA 1OYBA 1WQ5A 3PB2A 3GXPA 1TRDA 2RDTA 5EYWA 2BTMA 2C13A 3R13A 1W54A 3IVUA 1PCKA 4FX7A 3LCIA 4CNPA 4BK9A 5D38A 3GIYA 3B4UA 2ZA2A 3TW7A 1KM2A 2BXVA 4CQ8A 4N02A 3VE9A 1LZOA 1U5JA 1LOLA 3TCEA 1VZWA 3BLIA 3FEMA 4BWLA 4UTWC 1ICQA 1XI3A 1JVNA 2W0UA 1QMLA 5AC8A 1C29A 1VS1A 4XWUA 3P8IA 2NZLA 2C15A 4R33A 1W1ZA 3E49A 1BWKA 4M19A 5CPNA 1XBYA 3E96A 3HG2A 2TMDA 4NNAA 2E6YA 3Q94A 4O16A 1XFBA 3C6CA 4N6EA 2O7SA 2Z6IA 3IGUA 3C2OA 4LVBA 5KITA 1SW7A 4TO8A 4QQ3A 2V5BA 3KVKA 5LGXA 4LVDA 2Y7GA 1NF7A 2VEMA 1QR7A 3H53A 3HPZA 3T4CA 3TAKA 5CPOA 1OVDA 1D3GA 3VFLA 3N2XA 4AAJA 4DBDA 5BMXA 3OVQA 1EWDA 5AC6A 3W2NA 2RHGA 3DHDA 3LCGA 2VEPA 1OFOA 3HG5A 5AC7A 4XKYA 4UFHA 3LCXA 1H51A 4NJGA 1YTEA 5KSWA 5C2XA 4NJHA 2VENA 3LCWA 2WO5A 1PVNA 3USBA 2G96A 1KV5A 3DFOA 1V7YA 1KLZA 4LS0A 1TPB1 2H8ZA 5DXXA 1QOPA 4JTHA 1TV5A 4S2BA 3UWQA 4P61A 3A21A 4GFSA 4PH6A 4RZ6A 1L2UA 1LBMA 3P7YA 3NR0A 2ZZ7A 3L0NA 1OFBA 1LRQA 3NVTA 5LHFA 1KFCA 3TMQA 1TPWA 4K36A 3GB6A 1IIGA 2VELA 4KWVA 1A5AA 3F4WA 1OFPA 4IX0A 5FEPA 2Y88A 5C6MA 1F05A 2X1RA 2QEZA 5AYYA 2QUVA 2WPBA 1S5WA 4XBKA 3NL2A 1NAL1 2ZZ3A 3CWOX 5DCBA 5KZEA 4A22A 3LXCA 2YPIA 3W76A 2BZNA 4RXFA 1JULA 3TX9A 4Y9AA 3LV5A 3HB9A 2NLIA 4N9CA 2JKAA 3CLMA 2HSAA 3G3MA 4UTTA 2JKPA 3L21A 5GVJA 2DZXA 3DFQA 4BR1A 3M7WA 4O10A 3LRMA 1YPFA 3CEPA 3LRLA 3OVRA 3PWAA 4NVTA 1F6KA 3BGGA 3TQKA 4OWGA 4MJZA 4ALDA 3LGEA 1G69A 2G5WA 4RJEA 3QMSA 5AOUA 3S1WA 3L67A 1OK4A 3RNDA 2RDUA 3L65A 2OCZA 1LROA 2WV8A 2C1HA 3UWZA 1DOSA 1ZHAA 3DENA 4I9AA 4A2RA 3T44A 2GVJA 4E2DA 1GEQA 3CEUA 3W7EA 1LLWA 1TPUA 1SW0A 3QMTA 1JR1A 2ZRVA 3E12A 5DBUA 4POCA 3EKZA 4LRTA 4AVFA 3E02A 2ZQ0A 2H8XA 1TJRA 3MJYA 3W22A 3SZ8A 3NL3A 2LLEA 2X1UA 3UY8A 1W3NA 3BLEA 1JUEA 4PC8A 4QNWA 4WD0A 4YXGA 5F2MA 4KKXA 1RD5A 2AGKA 3PF3A 4UNLA 2EGZA 5I3FA 5FEWA 3R8RA 1EX5A 4XUGA 4WY0B 3UWWA 3W7JA 2E1DA 3IIXA 2VOMA 4TMBA 1TPDA 4WY0F 4X3ZA 3C56A 1QNVA 5KZDA 3O05A 1G4SA 2WSRA 5L9FA 1EIXA 1YDVA 3B05A 3I7RA 2AAMA 1FWRA 2E6DA 1QPOA 4O11A 5F4XA 3SW6A 3QRHA 4UR7A 1RQHA 3GXNA 3NQ2A 2DZPA 2Z1BA 4IXHA 1C9DA 5BRBA 2I1OA 4UTWA 2J9XA 1RR2A 1K8YA 1S5TA 3C61A 1DHPA 4J9JA 5C55A 3ATYA 3PSVA 3WFAA 2ISVA 5FF0A 3THAA 4WXYA 1T96A 2B7OA 2CWNA 3S5YA 3SECA 2XFWA 1OFDA 4FNQA 3CQ0A 3R89A 5HUPA 1UJPA 4JTEA 1KM1A 1IXNA 5CSSA 1WBJA 5D05A 3QMRA 1XXXA 3OBKA 3LV6A 3HQ1A 3STGA 3EX2A 1MXSA 1RQBA 5G4WA 3W1AA 3CM4A 5C5YA 4UTHA 3SY5A 1KM5A 3DFTA 4HNTA 4NNBA 3HGOA 3MYPA 1L6SA 4O1DA 3W7HA 3W74A 1FXPA 1ZJIA 3C4UA 1U83A 2CZFA 5AYZA 1J4EA 2J24A 3P84A 5K9CA 2EKCA 2Y63A 2FB3A 2DU2A 3GDKA 4MLJA 4IMCA 3O1NA 1HFBA 2ABBA 5KMYA 4JD4A 3GYEA 4XBSA 4GUIA 1TREA 2ISSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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