1TYGA

Structure of the thiazole synthase/this complex
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
MLTIGGKSFQSRLLLGTGKYPSFDIQKEAVAVSESDILTFAVRRMNIFEASQPNFLEQLDLSKYTLLPNTAGASTAEEAVRIARLAKASGLCDMIKVEVIGCSRSLLPDPVETLKASEQLLEEGFIVLPYTSDDVVLARKLEELGVHAIMPGASPIGSGQGILNPLNLSFIIEQAKVPVIVDAGIGSPKDAAYAMELGADGVLLNTAVSGADDPVKMARAMKLAVEAGRLSYEAGRIPLKQY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Thiamin Biosynthesis in Bacillus subtilis: Structure of the Thiazole Synthase/Sulfur Carrier Protein Complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords yjbS
molecule tags Biosynthetic protein
source organism Bacillus subtilis
total genus 71
structure length 242
sequence length 242
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.8.1.10: Thiazole synthase.
pdb deposition date 2004-07-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05690 ThiG Thiazole biosynthesis protein ThiG
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1tygA00
2J9YA 3T44A 3ZS4A 3ZFHA 2QUUA 1UB3A 4QAIA 3TXVA 1KFCA 3AJXA 4UTWA 2NUYA 1KTCA 1JUEA 1TPVA 2CLOA 1XKYA 2JKEA 4OWGA 1FWWA 5I3HA 4LC8A 2ABBA 1H62A 3G3MA 3L67A 2YYUA 3NO5A 4K38A 1Z44A 1OFQA 1W56A 3GIYA 3L9CA 4S2CA 5D2WA 3UYCA 3ELFA 2W6RA 1VYRA 3IIXA 3DHFA 1EUNA 1GOXA 1N7KA 4O4VA 2V82A 2C3ZA 2QDGA 3HG4A 3W72A 2EAWA 2YX0A 2ZZ1A 2E6YA 4IX0A 4K7YA 2YSWA 3QRHA 3W75A 2YYTA 5CPMA 1H7OA 4KWWA 1WYIA 3VCRA 4WUIA 4X3ZA 3HPZA 3GNNA 4NT0A 1GG1A 2V2CA 4TU1A 3PBYA 1BEUA 1LRTA 3E96A 5HQEA 1KM3A 4UFHA 3M7WA 3GXPA 1M7OA 2E77A 2NWRA 3MW7A 4Q32A 1KM5A 3P80A 4K7VA 5D05A 5L6UA 1SFJA 3GDRA 3LCXA 1CI1A 1GEQA 2VEPA 1FQ0A 3PULA 2C15A 3LBCA 5KZMA 3W7NA 3H54A 4MFDA 4YMZA 4BI5A 1G67A 2X1UA 1OK4A 2X2GA 4H4IA 1L6WA 1DORA 1XFBA 3C8FA 1TCDA 1LP6A 2YW4A 2Z6JA 2AAMA 1ICPA 2NLIA 1U83A 3CM4A 4GUGA 1ONRA 4PH6A 3W2NA 2YR1A 1TPUA 1W0MA 2A21A 1LZOA 4JTLA 1SO3A 4AF0B 3G1FA 8TIMA 4X2RA 3M47A 3CWOX 5D2VA 2E09A 3O06A 1MO0A 2FIQA 4AWSA 2CZDA 3W1XA 1P0NA 1FBAA 1HG3A 2ALDA 4CQ8A 3GDTA 2A1YA 3W87A 1AG1O 3W7HA 1H7RA 4JY8A 1DOSA 3K30A 4JTIA 1XBXA 3Q58A 1EPXA 4UTTC 4RXFA 3W7EA 3L0GA 2X1SA 2WKJA 4BWLA 3GXNA 3IV3A 1JJKA 2KZHA 4BWLC 3QF0A 4HT3A 2ZQ0A 4O16A 3THAA 3PR2A 1ML1A 2I1OA 2PRLA 2GQ8A 4EOUA 1B4EA 2Y70A 3INPA 1ZJIA 1KM1A 1WV2A 1M5WA 2E5BA 4QNWA 2R8WA 1Z48A 2XN2A 1VH7A 3IVUA 2ATMA 1H63A 3S5NA 1Q6OA 3OA3A 1XBVA 4PA8A 5HR6A 4MZYA 3P8JA 3O07A 3N9RA 4JR5A 3LHUA 3TSDA 2E6AA 3NQAA 1TV8A 1IIHA 4AMAA 5DXXA 3LGEA 4NNBA 4NU7A 3P82A 2OJPA 3GKAA 3D0CA 4AVFA 1K8YA 2OCZA 1OFDA 3PS7A 2J88A 2RDWA 5AHNA 2CU0A 3CEPA 3L66A 1QDSA 2WPBA 4Q4KA 1W1ZA 2F7FA 1LOSA 3BG5A 2WJZA 4E2DA 1A53A 1QO2A 2A4AA 2OT1A 1VRDA 4M7TA 4DELA 1Y0EA 3HGRA 3GXTA 3L5LA 5TIMA 2DZVA 2B7QA 1UCWA 3I7RA 2H3BA 2QCGA 4XUGA 1O94A 4N6FA 1SPQA 3A24A 3UZ5A 1EWEA 4XTDA 4AB4A 1K8XA 3NQ2A 3MHGA 1O4UA 3HGJA 3TKFA 3SZ8A 1FUYA 3RMJA 2V2DA 2ZZ7A 4Y9AA 4LRTA 1C9DA 3KHJA 5KMYA 4JNMA 1EP3A 5G5IA 3O8AA 3MI3A 4FXRA 3G0XA 3QH2A 4Q33A 1K02A 2C16A 1W31A 3CQ0A 4UFMA 2BLEA 3C2FA 3L5AA 3LXCA 4Z08A 1THFD 4AHOA 4JX5A 3N14A 3W1RA 3T55A 1X6UA 1WDWA 4JYEA 3QMRA 4WXZA 3FKRA 1R2TA 3HIJA 3KFTA 3N34A 4IOTA 1GVQA 3W2MA 2QKFA 3BLEA 4CCDA 1I8JA 5KTLA 3PF3A 2GQAA 2ZRYA 3FJ6A 4JTFA 2FFCA 4FB7A 3W7JA 1N55A 3PBWA 2AQWA 3SR7A 1ZNNA 5G4WA 2FPTA 3GNDA 1KTNA 3OIXA 1EA0A 1P0KA 4UMCA 2Y7EA 3EXRA 1I2NA 4K39A 4QSHA 4OQVA 3FA5A 4JIPA 4BI6A 2ZRWA 1QFEA 3VE7A 5BMXA 4FHAA 4LNYA 4LWWA 3QMTA 3G18A 4NUWA 1W8SA 3H53A 1A5SA 4XWUA 2NXGA 4UTHA 3NL3A 1YPIA 1R46A 3OBKA 3ZWSA 2QJIA 3N73A 2Y88A 5MHBA 3DH7A 2QF7A 2V5LA 1GVRA 4FNSA 4IMEA 1I2OA 3TSMA 4ALDA 4ZZ9A 3NL6A 5AOUA 3C3NA 5LNSA 1ZY9A 1HUVA 4MLRA 1YADA 3A23A 4JTTA 4NNCA 1HL2A 5K7JA 2NUXA 4MZ1A 4KFNA 3TR2A 1B57A 2PRMA 1QPNA 2Y62A 3M41A 3VNDA 2JK2A 4GUJA 4WQ6A 5F2IA 4UMAA 4A29A 4UXDA 4Y8FA 1NF7A 3G1SA 2CZFA 5EYWA 3U8GA 3P5YA 4AXKA 1B4KA 1FWNA 4IWWA 4J9JA 4AWUA 4NJHA 1Z41A 3L65A 4O8RA 1QAPA 3GZ3A 5D33A 3NQDA 3W71A 5CG7A 4LOCA 3A5FA 1DQXA 1MEHA 2QCCA 2VFGA 5D30A 3UWQA 4NZJA 3BW2A 1SW0A 4EF8A 4L4LA 3MJYA 2CZ5A 2VFIA 3LDVA 4UFKA 5AC6A 1XM3A 4JTEA 3PVFA 5LGZA 4MPQA 3STCA 1G6CA 1XCFA 1QCWA 4FIRA 3KX6A 1LBMA 4R53A 5K2ZA 4ONVA 3MI6A 2DZXA 4E2BA 5FF4A 3DZ1A 4O17A 1OX4B 4WOZA 4XKYA 2NWSA 3NG3A 3KXQA 3SI9A 1TTPA 2A5HA 2VEKA 3GVGA 4LU0A 2WNQA 4YCOA 1OF6A 5FEPA 2ZZ2A 4MZ8A 3S1XA 3T40A 4DPPA 2ZA3A 5DCEA 3DKLA 1TPC1 4NJKA 4FEZA 5EPDA 4RJEA 3Q2DA 4LW7A 5D2TA 3U2OA 3G1DA 1OFEA 1ZALA 1FDJA 5HWMA 3O6DA 4AAJA 2E5DA 5D03A 3M5ZA 3SJ3A 2JGYA 4LV4A 4D2JA 2Z1BA 1JCYA 2J27A 3CIXA 4LS2A 1O95A 1G7VA 5D02A 4JD4A 2PCQA 4HPXA 5LNVA 1CW2A 2A2IA 3G1XA 5C54A 2C19A 3C2OA 4O18A 1D9EA 1X7FA 3SY5A 3C56A 2DP3A 3MP4A 3M44A 1TRDA 1TV7A 4LT9A 2EHHA 2JBMA 5CGQA 3G0SA 1Q45A 1XUUA 1U5JA 4EIVA 1M6JA 1R2SA 5AHFA 5HUPA 1VS1A 2VXNA 2E1DA 4E0CA 2FJKA 3HBLA 4RV8A 5J5RA 3LRKA 5HWNA 1OF8A 1L9WA 1NF0A 4RCXA 5DCDA 5D04C 1YXCA 4WY0B 3WJSA 3UXDA 3OVPA 3B0PA 1YLVA 1GTHA 3MBDA 2VENA 4Z1AA 5H2ZA 2C6QA 3LRMA 1KV8A 1H7PA 2CLKA 4O15A 3LX9A 3W9ZA 3TE9A 5K4XA 3BG9A 2CLMA 2YDAA 2B7PA 1AL8A 1JQVA 5HWJA 4O50A 2YW3A 2QR6A 3W7RA 4LRSA 4M6VA 4QIUA 1BWKA 3HB9A 3BLFA 3B03A 4P61A 1T0OA 3W6YA 1YTKA 4UTIA 4O0KA 5DY2A 4G1KA 3ATZA 4IPJA 5DBTA 1XC4A 1G4PA 1PE1A 5AHEA 4RZ4A 3O16A 4M5PA 3BV4A 3NPWA 5D09A 3I7QA 1FDYA 4GFSA 3VE9A 4BI7A 4TO8A 4ZQCA 2E6FA 4AF0A 5DCBA 3U6WA 2G97A 3FS2A 3PAJA 3C2EA 4OT7A 1ZAIA 1FWSA 3P84A 4XTIA 5AB3A 1AK5A 3PY2A 3N19B 1LLZA 1T8XA 3ABSA 4UTWC 2I14A 5CZ0A 3E02A 3QC3A 3NPXA 2Q3RA 2ZFAA 3LXBA 4O1BA 3TJXA 5IBXA 3QW3A 3BW3A 3HPSA 1HO4A 2WNNA 3C6CA 4PC8A 5IBXC 4AH7A 5E0KA 1I2PA 3KOFA 3QM3A 4I7UA 1FXQA 2H3DA 1W54A 2QUVA 3GR7A 1S5VA 3I68A 3MP5A 1F05A 5LGXA 1QMLA 4I7VA 3S6DA 3DFSA 1AMKA 3L21A 3L68A 3SW6A 4OV9A 3FEMA 1TIMA 2QCFA 1NAL1 3KVJA 2VEMA 2XFWA 3STGA 3DGRA 2Y7GA 4O28A 2VELA 1ZENA 4TIMA 4IXHA 4NX5A 4QJ1A 2J9ZA 5BOOA 2RDTA 2UV8G 3PM6A 4EF9A 5K9CA 4B5NA 4FNUA 1IGSA 1KLYA 3BK0A 2TMDA 4ZVJA 3NQCA 4O57A 4NVTA 3NNTA 5CSSA 3B04A 5E1QA 2P0OA 1IF2A 3CTLA 5FF7A 3S42A 1OFRA 2DZPA 2HMCA 5HJLA 3W23A 1TRIA 3NYZA 4LY8A 3W1NA 4O52A 3SFKA 1EP1A 5A8GA 1C8VA 1G4SA 5CPOA 1JUKA 4IMFA 1LOLA 1S3HA 1LLWA 5DN1A 2B7NA 5AHLA 4CNNA 1FWRA 1VCGA 3E9AA 3QJAA 4JTUA 1DJNA 1L6SA 3T4CA 2ABAA 3PUOA 3PB0A 4O1DA 5CPLA 1Q6RA 1TPEA 3W86A 4BR1A 1JRCA 1YPFA 2VFHA 3R13A 2G96A 2VOMA 3BO9A 3DFOA 3F4NA 4N02A 5G4EA 4GJ1A 3RLVA 2QJGA 3G0UA 4IMCA 2FB3A 5E93A 3P61A 3W2LA 3QEZA 3STEA 4XZ9A 4ZQMA 3QMSA 1ZFJA 3S5OA 4POCA 4AWTA 2DZWA 2R91A 1JCMP 3TROA 3F4WA 3WK2A 1W3NA 3HO8A 5CPNA 4JTHA 1TQJA 1X1OA 1LRNA 5FEZA 3LTYA 3W85A 3NPUA 1LBLA 1EEPA 2NXHA 5HUOA 1LROA 3P81A 3EWWA 4LVDA 4NJIA 4DF2A 3WK3A 2ISVA 3A5VA 5T26A 1AW5A 3SECA 3HF3A 1NVMA 3GYEA 4CCCA 1QPOA 3RF9A 2CLEA 2FDSA 4JGDA 5FF3A 1DQWA 1VLWA 1G69A 2HS6A 2DU2A 3M43A 4MY8A 4R7JA 1UJPA 2B7OA 3CLMA 3AO0A 2XN0A 4N9EA 2TSYA 3BG3A 1TPFA 1QPQA 3R89A 3P5ZA 1KBIA 3WK1A 3W7OA 1QOPA 4E38A 2Y63A 1A5BA 1IXPA 3B4UA 1KM6A 4FIQA 5BNKA 2GJLA 5A5WA 3TQVA 3EKLA 1OK6A 3IIPA 1JCJA 1DL3A 1KM2A 5AYXA 2A7NA 5J5DA 1KM4A 3EX6A 4GBUA 1EX5A 3EWYA 4IGHA 1IXNA 3NGJA 3TUUA 4O54A 3FLUA 3TQKA 2VFFA 3UNDA 2YFOA 1SSGA 1W5NA 1OFPA 3BGGA 3RU6A 3PG9A 1WXJA 2C1HA 3KAOA 2NUWA 5D38A 1I45A 3I6RA 4DXVA 3LHYA 3CIWA 1F76A 3G1AA 1VHCA 3TIMA 1BTMA 1GPWA 1LYXA 4UTUA 3H55A 3IRDA 1IXQA 4GNJA 1W5MA 3CC1A 1DJQA 3O63A 2ZZ6A 3OG3A 2E5CA 2C0AA 3USBA 5HNRA 2GVLA 2GQ9A 4WX2A 1PHWA 2GVGA 3DKJA 4JXCA 3JRKA 5I3FA 5AFDA 2DZUA 3PUDA 4U4MA 4QITA 5F4XA 1YXDA 2TYSA 2V81A 2QCDB 1ME8A 4HNNA 1PCKA 3W2JA 1VPXA 1LORA 3P60A 3PG8A 4OU1A 4M7SA 1EIXA 1P1XA 4KFPA 1UUMA 3HG5A 4RZ6A 1H60A 3DFQA 3W7MA 4K8EA 1ZAJA 1RZMA 5KINA 3M5YA 5FI8A 1W5OA 2NX9A 2FLIA 3B8DA 4I9AA 5FEXA 1PHQA 1LM1A 3LTPA 4JYDA 3BVJA 2X1RA 1OX4A 4JS3A 4ZMGA 3UXAA 3W7PA 4TMCA 1QOQA 1TO3A 2DORA 2NX3A 3L5MA 2PC4A 1KFEA 4IMGA 5CZSA 3EWBX 3HGOA 2ZCGA 3NQ8A 5LNWA 5BMWA 3B05A 1RPXA 4Y96A 4CLMA 4R34A 1PV8A 4KWVA 3HPXA 5I3IA 2GOUA 3LHZA 3M16A 1NFBA 2QAPA 3THQA 1L2UA 4W9TA 5EY5A 2WOQA 3UPBA 3R8RA 1G7UA 3W7IA 4GE8A 2A6LA 1FCVA 1ICQA 3PBVA 3CEUA 4O19A 2WSRA 4UFJA 3UWUA 4UIOA 3ZR4A 4UUIA 3N2MA 3C4UA 5F2GA 4K6AA 1TV5A 4NNAA 2JKAA 3LI0A 3NQVA 4N4PA 3S1UA 3LLDA 3LBMA 4O14A 1PL9A 3Q94A 4NZFA 5KZEA 3FIGA 1X1ZA 3B06A 2OZ0A 3RLUA 1OYCA 3E0IA 4WOQA 4UC5A 4Z0JA 1K03A 3TXZA 1I2QA 4OE7A 4UFLA 4ORMA 3EX4A 4N2YA 4JX4A 5U7SA 3TX9A 2ZA1A 2EGZA 4H3DA 3CB8A 3NQ7A 3W84A 4N4QA 3WFAA 3PSVA 1O5XA 3B0UX 3G22A 4P2VA 1FDZA 1H5YA 5AN7A 4IQLA 1L6YA 3G1HA 3NA8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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