1U83A

Psl synthase from bacillus subtilis
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
249
structure length
225
Chain Sequence
DFSLELPVRTNKPRETGQSILIDNGYPLQFFKDAIAGASDYIDFVKFGWGTSLLTKDLEEKISTLKEHDITFFFGGTLFEKYVSQKKVNEFHRYCTYFGCEYIEISNGTLPMTNKEKAAYIADFSDEFLVLSEVGSKDQSSEEWLEYIVEDMEAGAEKVITEQIVDDIISSDIDINRLIFEAPNKTLQQGFIQKIGPNVNLANIPFHDAIALETLRLGLRSDTFF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title PSL synthase from Bacillus subtilis
rcsb
molecule tags Lyase
source organism Bacillus subtilis
molecule keywords Phosphosulfolactate synthase
total genus 79
structure length 225
sequence length 249
ec nomenclature ec 4.4.1.19: Phosphosulfolactate synthase.
pdb deposition date 2004-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02679 ComA (2R)-phospho-3-sulfolactate synthase (ComA)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1u83A00
4N2YA 3PUOA 4N9DA 4PTNA 2JKEA 3GR8A 3MO7A 4UTWA 2F84A 5D2XA 1X8FA 2VEIA 1X7FA 4O17A 1H50A 1LOLA 1VLWA 1VPXA 3W72A 1THFD 1LTDA 1JUEA 3CQ0A 2WOQA 1DQXA 5LGXA 4UNKA 5AFDA 1J5TA 4M19A 4UFLA 3NQ8A 1H7WA 4NZFA 3NO5A 3G8EA 3LERA 3W7KA 2TMDA 3GKAA 4DF2A 3D0CA 2GQ9A 4KKXA 5H91A 5AHIA 4CCDA 5LZLA 3O6YX 3M6YA 3IIXA 3LV6A 1W5PA 1OYBA 1EPXA 1XDMA 3IIOA 1UUOA 2G97A 1PCWA 2VXNA 3GYEA 3QQ1A 1BWKA 2VC6A 3EXRA 3P82A 2H3BA 3WFAA 5HR7A 1FXPA 4Y8FA 1W56A 2Y7DA 3RFAA 3FJLA 3SJ3A 1TPDA 1M6JA 3L66A 1TIMA 1LBFA 4LS2A 1DJQA 1L2UA 5G5IA 5G2WA 1JUBA 1LM1A 3M5YA 3N9SA 5DY3A 2RKXA 2WSRA 4WY0B 3RMJA 4UNLA 4TU1A 2WQPA 3S42A 3TH6A 5DBTA 3TFXA 1GJPA 4MPQA 2ZRXA 4A22A 4E0CA 3HF3A 1LYXA 1ZNNA 3DI0A 3TMLA 5CZ0A 3TKFA 4Z0SA 2NLIA 4OWGA 4PH6A 1AW5A 5HWMA 2FIQA 3FKKA 3SY5A 3L65A 1IIGA 3W7PA 2Y85A 3GB6A 3E49A 2VFEA 2B7OA 1F74A 4JTKA 1HUVA 2Q3OA 4K7VA 5CZSA 4GUIA 1TB3A 5ABTA 1UUMA 3ABQA 3MJYA 3HQ1A 3DKLA 4A2SA 2BZNA 2QKFA 1SUXA 1NSJA 6TIMA 2QDGA 1PVNA 1R2TA 1H7RA 2CLFA 2CLEA 3MHFA 1BTMA 1B3OA 3NPXA 4CQAA 3R2GA 1S5VA 1EWEA 2CZDA 3KOFA 1IXOA 3PVFA 3ELFA 2Y6ZA 3NG3A 1UCWA 4QNWA 2E68A 2ZYFA 5EL1A 3MBDA 3SIZA 3IEBA 2V5LA 3THAA 3DFSA 1Z48A 3W7GA 3C8FA 5TQLA 3W7IA 5G2HA 1KLZA 5K4ZA 5EA9A 1TPH1 2VEPA 4N9CA 3CT7A 3LCHA 1W8SA 3NNTA 2ABAA 3FYOA 3I7SA 8TIMA 2GUUA 3PSWA 1WBJA 3OVPA 1VC4A 3NYZA 2B7PA 1NAL1 3PAJA 3TXZA 3LI0A 3DFPA 2QJHA 3QF0A 4JEQA 2Z1BA 3CPRA 2ZA2A 2JGYA 4NUWA 4Q4KA 3HBLA 4R33A 3EX6A 1DL3A 1ME7A 2DJXA 5DCEA 3W07A 3C56A 5K9XA 3NL3A 3P62A 3EX2A 5MHBA 4LY8A 3LLDA 4O1DA 4O57A 3EWWA 3NQDA 1WBHA 4R7JA 2BWGA 2C16A 5E1QA 4XUGA 3PS7A 4CQ8A 3ZR4A 1FUYA 3USBA 1YTKA 3YPIA 4JDBA 4GUGA 1VCGA 5LNWA 5IM51 5FEXA 4IX2A 3M5VA 4W9TA 3S5YA 3HG3A 3BO9A 2VENA 3UQNA 3HB9A 1QFEA 1T8XA 1W3NA 2QCDA 1CI1A 4XKYA 2UV8G 4WY0F 2B7NA 1YXDA 1WA3A 1ADOA 3RLUA 1WYIA 5K2ZA 3THQA 3B8DA 1SO4A 1PHQA 3G3DA 2CW6A 4FIQA 1YDVA 2GQ8A 1TV8A 4O52A 3W6YA 2AAMA 1I2RA 3A24A 3NPWA 5G4EA 1KA9F 1IXNA 4ADSA 3LLFA 1TMHA 1F7BA 1RVGA 1W37A 3W7NA 4DEFA 2DZTA 2ISWA 3L0NA 1W5MA 1XCFA 4EF8A 5LSMA 3SZ8A 2VELA 3L9CA 1W1ZA 3CTLA 4K7YA 4YXGA 1LOQA 3L67A 3KRZA 4IMFA 2RDTA 3N19B 2TPSA 3W1AA 2G5WA 1XDLA 3MI6A 1ZAJA 1W0MA 4FNPA 1WX0A 4MVAA 2ATSA 3UY8A 3NQFA 4BI5A 2WNZA 4XWUA 1FCUA 1TYGA 3NQAA 4UMCA 1VCVA 3L5LA 4O1CA 1SFLA 2NWSA 4MJZA 3HGSA 3FKRA 2C13A 3C4UA 3ABSA 4CCEA 3F1QA 3LX9A 4FX8A 3TMQA 1H5YA 1XL9A 1FWNA 3F03K 4MLJA 2CLHA 3UPWA 4CLMA 5D03A 4FO4A 3O15A 3T78A 3RK8A 4NT0A 4O14A 5F2LA 4AMAA 1SW3A 5I3KA 2DJLA 2XN0A 1FCBA 1TV7A 3M5ZA 3S9YA 4UTTA 1K7FA 2Y7FA 4FNRA 4WOZA 4H6KA 3GDMA 1S5WA 2ZRYA 3ABRA 4LRSA 5CG7A 4LRTA 4MLRA 3LRKA 3LHYA 4GWEA 1QO2A 1JCYA 5I3JA 3HG5A 2ZRZA 3W1MA 5BOOA 4IWWA 1EX5A 2C14A 2YYTA 1JCXA 1X1OA 2VKZG 2O7SA 2ZZ2A 3PG9A 1VRDA 1I8JA 2LLEA 4GBUA 3GNNA 1WAUA 1RQEA 4HNVA 1ZENA 1K8YA 3UYCA 5HMSA 1F6KA 2NX3A 1ZAHA 1TV5A 4S2CA 3HIJA 2V30A 2VFFA 4KWWA 4WY0A 4KFOA 3BVJA 3TU9A 1G7VA 4UMAA 3T7VA 3MWAA 4DF1A 3W85A 4YCPA 3MHUA 5D37A 4HKPA 4JN6A 4UIOA 1Z41A 4I9AA 4UFKA 2XN2A 3N3MA 5AC6A 3M43A 3OA3A 2CLOA 4ZZ9A 2H3DA 1TTQA 3INPA 1OYAA 5DXYA 5DCDA 3T44A 1VQTA 1SO6A 2V9DA 3QM3A 4O8RA 4O1AA 4DO4A 4JIPA 4O53A 3BLIA 5AHMA 1M7OA 4N6EA 4NNAA 4Z08A 3LV5A 4LWWA 1RV8A 1QMLA 3G22A 4CNOA 4E2DA 1RD5A 3DFTA 4QIUA 3TSDA 2QCMA 2PE4A 3NL5A 3IIZA 1L6YA 1W54A 3P7YA 3O6CA 1KFKA 5FI8A 4AHPA 5U4NA 4HIBA 3BLEA 4NX0A 1TTIA 3W1LA 5HNRA 4O13A 4X9SA 5FF3A 1DORA 4IXHA 2JBMA 5CPMA 1OF8A 3GNDA 2ABBA 4H3DA 4IGHA 2V82A 2V2HA 4UFHA 2JK2A 3UZ5A 1QOPA 4DPQA 4JS3A 3CIWA 1XBYA 4LS0A 1E51A 2CWNA 3HOJA 5D33A 3EB2A 1CW2A 3NQGA 2ZCGA 4MOZA 4AWUA 3FOKA 4JTHA 3N9RA 3NQ6A 3ZWTA 1ICQA 1BWLA 2DZXA 1KFCA 4O1BA 1SSDA 3VFLA 1K3UA 4JTSA 3S1UA 5K3VA 3W22A 3KFTA 4BK9A 4GJ1A 3TCEA 2J6XA 2QAPA 3ATZA 3I7QA 1GEQA 5HWJA 1H7XA 3ABOA 3O8AA 5AHEA 1I2NA 2Q8ZA 4FX7A 3DENA 1KW1A 1FBAA 1LROA 1U5JA 5AYXA 1A5SA 4UTHA 3TAOA 2E77A 5EYWA 1XKYA 2Q3RA 2V5BA 3PG8A 1F5ZA 2C15A 3P67A 1KM4A 2V81A 1XBXA 3PBWA 2CZEA 4IMCA 3GR7A 3DHFA 2YZRA 4X3ZA 4NJIA 3BW2A 2OZ0A 4WD0A 5AC7A 1IIHA 4TIMA 2ZRWA 5LNVA 2QCCA 5LHEA 4Y9AA 1V7YA 3UPBA 4AF0B 4O18A 2FQIA 4A21A 4TR9A 3WJZA 3W1RA 2RH9A 1HTIA 1NFBA 4GE8A 1FXQA 4FXRA 4BFAA 4UTTC 3S0CA 5F2GA 3NPUA 3NM3A 3TX9A 4LV9A 3TFCA 4X2RA 4ZVJA 4RLIA 3W1UA 1KTBA 1XC4A 3UZJA 1GOXA 3M47A 3UWVA 2YR1A 4RV8A 1HL2A 3B03A 3B04A 2JKAA 4JDYA 3L21A 2Y63A 3MP5A 3G24A 3TC7A 1K8ZA 1QOQA 4PC8A 3HPXA 1R2SA 3A5FA 1GYNA 1SZFA 4S1FA 2V2DA 5FF2A 4JY8A 1EIXA 3C61A 3NQEA 4HNUA 4BF9A 1GWJA 1C8VA 4XBSA 3EWBX 3MI2A 1YYAA 4WJEA 1EUNA 2OT1A 2FFCA 3KAOA 3L2IA 5D2WA 3G3MA 4AWTA 3NQ7A 2RDUA 1XBZA 1LDCA 2ZZ3A 3TIMA 4D2JA 5BRBA 4LUIA 2OJPA 2X2GA 1OFRA 3C2RA 1VHCA 3NQVA 1YLVA 4OU1A 1LCOA 1QAPA 1VS1A 1HO4A 3L0KA 1KFBA 3H53A 4FX6M 1OJXA 2W0UA 3CC1A 2VFIA 1XXXA 4JTEA 5AB3A 2B0MA 4MY8A 2G95A 4Q32A 2NXIA 5DN1A 1W31A 3G1FA 5CKSA 4NXKA 4XTDA 4ZQMA 4HNNA 4LVAA 1A5CA 4A29A 3MUXA 4BI6A 4K8EA 3LTSA 4PODA 3Q94A 5EKYA 3BW3A 3DI1A 4QAIA 4X22A 4WXZA 3HGOA 3ATYA 4XBKA 1PCKA 1JJKA 5FEWA 1FDZA 5K9CA 4J9JA 3W83A 4R34A 2QR6A 3G1XA 4RZ5A 2KZHA 4GFSA 2I14A 3MW7A 2DZSA 3W87A 3TUUA 3KXQA 1LBLA 2EAWA 3W76A 1H61A 3TC6A 2YPIA 3O16A 3B0PA 1LZOA 2A21A 2ALDA 2B4GA 1SPQA 3BG5A 2YGYA 1P1XA 1TQXA 4AEOA 5DCBA 1ONRA 3FS2A 2WJZA 2J24A 2NWRA 2TYSA 3Q37A 4Z0JA 2ZZ6A 5HINA 3BGJA 3S5OA 1GZGA 4ZMGA 4LV4A 2QUVA 2WO5A 3C52A 4IMDA 1OK6A 2X1UA 1SR9A 4PL1A 5CZJA 4FEZA 4IPIA 3CEUA 4MZ8A 1O5XA 4WZHA 1ZCOA 3MP4A 1SFJA 4O50A 1AL8A 1KLYA 1TJRA 1GVFA 4N02A 4FNSA 5SWUA 3LXAA 1QPNA 4LC8A 5F2IA 3UWYA 5DY2A 5BNKA 1XBVA 5G4WA 5KITA 1G67A 1K02A 1QNVA 3MMTA 2EPHA 3MYPA 4A3UA 5F4WA 4B5NA 4LTSA 1SO3A 3PSVA 4Z1DA 4IJBA 1GQNA 3QW4B 1PS9A 3HMJG 4RK8A 1JUKA 2GVLA 4ONVA 3W73A 1OFPA 1KM3A 1ZY9A 1TJPA 1OFBA 4WOQA 2AQWA 1SZNA 4UR7A 3IGUA 4Y90A 2YX0A 3R12A 3RU6A 4QQ3A 4UTUA 5KZMA 1J2WA 3LHVA 3A9IA 3HG2A 2B7QA 3BK0A 3W7QA 3H55A 1H62A 2EHHA 4TMBA 2R91A 5HQEA 1FWTA 2DP3A 3LHTA 1A5AA 1EA0A 5HUOA 5KTLA 4HN4A 5AHFA 3W74A 3SECA 1FX6A 4CCCA 5FF4A 5D04C 2E6YA 3W7JA 3WK1A 3DFOA 2WV8A 1O94A 4NQ1A 3EKZA 2CLLA 5C5YA 2E1DA 1G4SA 5J5DA 1NF0A 4QJ1A 3AO0A 3BARA 4K36A 5FF0A 4PEKA 4UCGA 3W1XA 2NX9A 1D9EA 3FLUA 1KTNA 4N9EA 2CLMA 3MHGA 3STEA 2J9ZA 4UTMA 3A21A 3NM1A 3TQKA 1TTJA 2QCEA 2JKPA 2V2CA 5D02A 3S1WA 4JYDA 5C55A 2I1OA 1YDNA 4AF0A 7TIMA 2ZTJA 3LB0A 1NEYA 1CX9A 1M5WA 2A6NA 4N6FA 1XI3A 3IV3A 3JS3A 2WPBA 3F4WA 5EY5A 2CZFA 2Y62A 1OFDA 1UBSA 4AWSA 3CEPA 4IMEA 3B0UX 1T99A 1KBJA 4M6QA 2YYUA 3HJZA 1ML1A 3CWNA 4ORIA 3HPSA 1ALDA 4YMZA 4IMGA 1FQ0A 5F1VA 1LP6A 1TCDA 5DELA 3R13A 4I7UA 1DKWA 4JTUA 3SR7A 1Q6RA 1EUAA 3PBVA 4OGZA 3EX1A 1C29A 3EXTA 3C2OA 3LRMA 1W5OA 1M7PA 3CM4A 3M1ZA 3KVKA 3P5YA 4YWIA 3W7HA 3W7LA 5LNUA 3OIXA 4WUIA 3EXSA 3LXBA 1PHWA 1F6PA 2QUTA 3CWOX 4O0KA 1ME8A 1Q3NA 3G1VA 3SW6A 3UXDA 1GT8A 3EKLA 2Y7GA 4UTLA 3FIGA 1LRTA 4JYEA 1SZEA 3SI9A 3CB8A 4UFMA 3SSJA 1AW1A 3W71A 1JCMP 2C0AA 4P2VA 4EOUA 1OFAA 4RKAA 3EX3A 3EWXA 1FCVA 2TRSA 2VEMA 5CSSA 4NJHA 3M16A 3W1QA 1KFJA 4HSNA 3P84A 2NXGA 5FEZA 3BPWA 3VE7A 3TNOA 3W7OA 3W1NA 4DO5A 2YSWA 3A5VA 1TQJA 2GQAA 1R30A 3LCWA 3HGRA 4JXCA 4OT7A 1GPWA 4N4QA 3F4NA 5CGQA 3P61A 3GAYA 1LBMA 4RXGA 4O4WA 3E02A 2YFOA 4MZ1A 3W7CA 3C0JA 3M0ZA 5F4SA 4QISA 2A1YA 3N34A 2XFWA 2O7QA 2ZRVA 3GDRA 3WJWA 2A6LA 4WXYA 5KINA 4QNEA 5DBUA 4AH7A 2QCLA 4NVTA 3N2MA 1EWDA 5CPLA 5AN7A 1JR1A 2BX7A 5BW6A 1JRBA 4HPXA 3HO8A 3DFQA 3IIPA 4MJMA 4DXVA 2Y88A 2YW3A 4MYAA 4PCFA 3DGRA 2ZZ5A 4RZ6A 1MEHA 3KX6A 3PF3A 1PIIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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