1UBSA

Tryptophan synthase (e.c.4.2.1.20) with a mutation of lys 87->thr in the b subunit and in the presence of ligand l-serine
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
268
structure length
257
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of a mutant (betaK87T) tryptophan synthase alpha2beta2 complex with ligands bound to the active sites of the alpha- and beta-subunits reveal ligand-induced conformational changes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE
molecule tags Lyase/peptide
source organism Salmonella typhimurium
total genus 89
structure length 257
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 1995-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ubsA00
3PB0A 3EX1A 1F5ZA 1I8JA 1H50A 1G67A 3P5ZA 4JS3A 3W85A 3W07A 4ZQRA 2X1RA 2A2IA 1JCNA 4NVTA 2WSYA 5BNKA 5G1TA 3W2MA 2QCGA 4DO6A 2EF9A 3NVTA 3RF9A 3QW4B 1G4EA 4XUGA 4JXCA 3A5VA 4GUFA 4LC8A 4JD4A 2WSRA 3W7MA 4ALDA 4DEFA 3LXCA 1SO6A 3LBCA 3NEVA 3BW3A 4BWLA 2QCDA 2WKJA 5HMSA 3K30A 3MP3A 1OK6A 1ICPA 4YL2A 5DCBA 4MY9A 3QFEA 1SSDA 1OX4B 4BI5A 3OVRA 1ZAIA 1SW0A 4GNJA 2JBMA 3S5NA 3W7HA 1VCFA 3CU2A 3MYOA 3WK0A 1XDMA 3FKKA 3OVQA 4BR1A 2X1SA 2Y85A 4O10A 3NL2A 4FX6M 3DXIA 4R53A 4HNVA 3SGZA 3S8HA 4PA8A 3BG5A 4YCPA 3ABSA 4K7YA 3TH6A 5E0KA 3W1AA 4K39A 5I3FA 1IGSA 5KZDA 5IBXA 5HUOA 1X1OA 4OE7A 2NWSA 4WQ6A 2C16A 2DP3A 3LDVA 2WSQA 5EBUA 3RMJA 4K8HA 4FX7A 3UD6A 3NPVA 3VE9A 1YTEA 1FWRA 5C2XA 2A6NA 2VFHA 4JYEA 2R14A 3NQEA 5FESA 4JYFA 3TSMA 3GDTA 3QZEA 3UWVA 5BRBA 3P60A 1YXDA 2KZHA 4KFNA 1WXJA 4YMZA 2V81A 1I2PA 5CZTA 2CU0A 3T55A 3EX3A 4FNPA 3W2LA 1SPQA 1YDNA 1B3OA 2YGYA 4ADSA 1OFBA 1VS1A 4FF7A 3DENA 1QR7A 1XBVA 3LCLA 3CWNA 4N6EA 4FNTA 5D05A 1PIIA 3TQVA 4DBEA 2E77A 1HL2A 1H7WA 3KAOA 1TYGA 2G96A 1VPXA 4O16A 3W7NA 3TFXA 4A2SA 5HINA 3TMQA 2W79A 2NUYA 4KFOA 4KWVA 5H91A 2V82A 3G24A 1XDLA 1ZCOA 2QUTA 1G7VA 2CZDA 1TPC1 1QOPA 3R8RA 3W73A 4N2YA 1KFBA 2OCZA 4FNUA 5DBTA 4A3UA 5C54A 1X8FA 2OT1A 1JCMP 1W5OA 3JR2A 4Y96A 3N9SA 4HPJA 2QF7A 3MBFA 3UWYA 2YFOA 5G1YA 3TSDA 1O5KA 3MJYA 1GEQA 3PUOA 2Z0IA 2V2HA 2YSWA 3OVPA 4NZJA 3LB0A 1JUEA 4L4LA 1YYAA 3G0XA 3UWZA 4N02A 5LNWA 1B9BA 5DBUA 4Q32A 1SW3A 2QCFA 3M41A 4WZHA 1VH7A 3Q2DA 4X3ZA 5CSRA 5E1QA 2E6FA 4N4QA 2AAMA 1ZENA 1W31A 1H62A 4QJ1A 3LCXA 2YX0A 3FJ6A 3TJLA 2TPSA 5CSSA 5KZEA 4MJZA 3C6CA 1ZHAA 4MFEA 4MY8A 4Y9AA 3S5ZA 3N19B 4CNPA 3W1XA 2WNNA 4IXHA 1Z48A 2WOQA 2A1YA 1CX9A 4R33A 3C2FA 3H54A 1GG0A 3QMRA 1TO3A 4O0ZA 3W1PA 4GUHA 3E12A 3PC0A 4OBTA 5FEWA 1TPUA 3MHUA 3NL5A 3W9ZA 1OFDA 5G5IA 3S1WA 2C1HA 1JULA 3LRMA 2DZVA 4L4MA 4O4WA 4ORMA 1H60A 1SO4A 3TFCA 1YXCA 5KZMA 2VEMA 1W3IA 3W75A 1JCXA 2DZUA 3LGEA 3IIXA 2EKCA 2A85A 3TW7A 2OJPA 2FPYA 5LNUA 3E49A 1ZY9A 3LCIA 3W1RA 4FEZA 4NXKA 4GJ1A 1FCBA 3C3NA 1AW1A 2I1OA 5F1UA 3NQGA 4POCA 3W23A 3MI2A 3BGJA 4Z1AA 3YPIA 2YW4A 2BLEA 3A5FA 3M5VA 3PVFA 1R47A 1ICSA 3NZ1A 1H1YA 4UXDA 4OHQA 3EXRA 4QQ3A 1GJPA 3T78A 3QPYA 3TC7A 1YXYA 1T99A 4LOCA 4UCGA 4U28A 2Z2UA 2QJHA 4AH7A 4NJHA 3LV5A 3Q37A 5F2MA 1BKSA 4LRTA 2VFIA 4O50A 1H1ZA 1IF2A 4FNSA 1TRDA 3W1MA 2C13A 1H7NA 4JTJA 4BI6A 1AW5A 2C6QA 3TR2A 2JKPA 2CW6A 4QNWA 3A9IA 2A21A 2PE4A 3LI1A 4I7UA 4UTTC 3EWBX 1JJKA 3S5OA 3TW6A 5KMYA 4MY1A 3FEMA 1KTNA 3MMTA 1A5SA 2VOMA 3MWAA 1OF6A 5K9DA 3KRZA 1R2SA 1J4EA 5L9FA 3WK3A 4RKAA 4HSNA 3STFA 2E6AA 1NSJA 3I68A 4UFHA 4G1KA 1JRCA 5CZSA 4MYXA 3LRKA 4NXSA 3ZWTA 4NX0A 1GPWA 1KM2A 5CZ0A 1RV8A 3PUEA 3EX6A 1VYSX 3CT7A 3GNNA 3NA8A 4NU7A 3BARA 4U4MA 4DF2A 1UCWA 1NEYA 5A5WA 3W2KA 1Q6RA 3T40A 2F7FA 1GZGA 1JUBA 1TCDA 3GK0A 3WJYA 3GIYA 1K8XA 2DJLA 2FB2A 3NNTA 4Z08A 4A21A 1OFAA 3EXTA 4BF9A 3QSTA 4IX2A 1K7EA 1EP3A 1HO4A 2NX1A 2ZA2A 3L67A 3E02A 1B57A 3FYOA 1W3NA 3LTYA 4YXGA 3HF3A 1GVQA 4LT9A 1MEIA 4MKNA 1IIGA 1QO5A 3O05A 3GYEA 1MZHA 4M19A 4WY0F 4CCCA 4E38A 4UTJA 4DF0A 3NYZA 3B03A 1QAPA 1AL8A 1XI3A 4PL1A 2CFFA 4LC6A 4WJEA 4JY8A 5AYYA 2QAFA 3P8JA 2TMDA 2VFEA 1PCWA 4QNEA 5SWUA 1FCQA 3W7KA 4EF8A 3IEBA 2HTMA 1VJIA 5K4XA 1K7XA 3C2VA 4I7WA 3M0ZA 3P84A 3M47A 2NXHA 1FCUA 2Y89A 2EPHA 3HMJG 5BOOA 5HJLA 1OFEA 3KRSA 3F1QA 2NXIA 3PAJA 3QMTA 3PF3A 3W7JA 2FPVA 3N3MA 1EEPA 1YTKA 3W1TA 3NAVA 1FBAA 1KLYA 2H90A 4IPJA 3GX9A 3EX2A 3E9AA 1ME9A 4JNMA 2D73A 1G4SA 1TTJA 3TQ0A 4ZVJA 1LTDA 3L2IA 1N55A 4O12A 4R34A 1FXPA 1LDCA 3O1NA 1KBJA 3CTLA 1D3GA 3LXAA 2V5BA 1OHLA 1F2JA 1EIXA 1W1ZA 3W84A 1P5BA 4JGDA 3G1VA 2QAPA 3NQ6A 2NV2A 1W8SA 4DPPA 5HNRA 2B4GA 1H63A 2HMCA 5F2GA 3LXBA 1RVGA 1TJRA 1M7PA 1GYNA 1W56A 4EIVA 4LS1A 1TTPA 5A8GA 4AWTA 1F7BA 2QCCA 4IUOA 4W9TA 4AEOA 2TSYA 4P61A 3MO7A 1FWNA 4HNTA 3W7RA 4A22A 3W87A 4EF9A 1WQ5A 2QJIA 5AHLA 3GDLA 5F2IA 2JKAA 2FIQA 3S6DA 4JTFA 1W3TA 3TJXA 4CNOA 1C8VA 4CCDA 5HR7A 4S2CA 3IGSA 1MEHA 1XL9A 3L0KA 4MJMA 3CQ0A 4C1KA 1Z41A 2WQPA 4NX5A 1LROA 3DFOA 3EWUA 3N14A 1PVNA 1QDSA 1O4UA 5EL1A 2RDWA 3NXFA 3VFLA 4N9DA 3MP4A 1FX6A 1LLZA 3FJLA 1I2RA 3TX9A 3MBDA 3LBMA 2GVLA 2CLEA 4IMDA 1XKYA 3O8AA 3VE7A 2DZSA 5CPNA 3NGJA 1HFBA 3HO8A 4JX5A 3S5YA 3TV8A 1T96A 1EA0A 3PS7A 4S1FA 1QPOA 1OYAA 4HHPA 3S42A 1M5WA 1JQVA 2ZTJA 3EKLA 3IVTA 3BK0A 1O60A 2FB3A 4AB4A 4GUJA 3HG2A 4LS2A 4O1CA 1VR6A 4GE8A 3A22A 3GR7A 5K2ZA 1WOAA 3STEA 4ONVA 4YLWA 1K03A 2QJGA 4LVAA 1TTIA 4S2BA 3SSJA 1KV8A 3G18A 2FTPA 1QNVA 1SFJA 1TRIA 2GUUA 1H7OA 2RHGA 3TA6A 2VENA 4GC4A 5LGZA 4HT3A 2QDGA 2YFNA 4WY0B 5D38A 2YPIA 5FI8A 2GPTA 3E96A 2OX1A 1K3UA 1H51A 3DFSA 1DJNA 1TB3A 1I4NA 2NX3A 1ZALA 4NJGA 5D2WA 3W2NA 1P1XA 4O19A 1WBHA 3BV4A 4J9JA 3BG9A 2X1UA 1ME8A 3FLUA 3IVSA 3S1UA 1AW2A 3EB2A 1TMHA 1IXOA 3GXNA 2VFDA 4UNKA 3M16A 2XN1A 4MFDA 3W71A 4ZQPA 1OF8A 3W1UA 2Y70A 4OGZA 3TU9A 3IRDA 4HNNA 3LLFA 2NUWA 3G3MA 3P62A 1YLVA 4DXVA 2YW3A 3NPUA 5F4SA 4O0KA 1NVMA 3RK8A 7TIMA 1M7OA 1DJQA 4O28A 4NJIA 3E0IA 1QOQA 2BWGA 2ZRYA 3P80A 5J5RA 4NT0A 3BPWA 2A4AA 3PSVA 1DKWA 3HIJA 3HPZA 1G4TA 4FXRA 3FA5A 4AVFA 1EUNA 2B7PA 4N4PA 3W7OA 5DN1A 2BX7A 4D2JA 5AHFA 3UWQA 3G0UA 3HGSA 4LVBA 3GAKA 3O07A 1LOSA 3GXTA 2C14A 1HTIA 1JCYA 3O63A 3LCHA 1S5WA 2B7QA 3EWZA 3CB8A 1WDWA 3L66A 3FS2A 1MO0A 3TQKA 2H3BA 3LCFA 3N34A 2RKXA 3DKLA 4O14A 1AL7A 4GUGA 1DORA 2G5WA 4QAIA 2ISVA 3UWUA 1KFLA 2ZRXA 1X1ZA 5AHEA 2ZZ1A 2ALDA 4FIQA 5K3VA 2QCDB 1Q45A 1VCGA 4GWEA 2YXGA 2ZZ7A 3DH7A 4Z0JA 2NXGA 3LHYA 3M5XA 3MW7A 3C56A 1UJPA 2Y7EA 1C29A 3KX6A 3RFAA 4JTUA 1OFPA 1O95A 3QF0A 1QFEA 4IQLA 1VGAA 4ZQMA 4AHOA 3PSWA 1I2QA 2ZZ4A 1LCOA 3HGRA 3CIWA 3IV3A 2BTMA 4ZMGA 5LZLA 4PFMA 1UUMA 3UY7A 5I3JA 2GQ9A 5KINA 4HPXA 3SGUA 3M44A 2CLFA 1ONRA 4K37A 1F05A 1JVNA 1VZWA 2NV1A 2H6RA 3FKRA 3P5YA 1A5CA 4WUIA 3MI3A 5CPMA 1C9DA 1SR9A 1LYXA 3VI2A 3D0CA 3EEGA 3L9CA 4RR4A 2QUVA 1TPEA 2DORA 3LCWA 1ALDA 2PCQA 2CLIA 4ZL1A 2GOUA 3GXPA 2ATMA 3PULA 1QMLA 3TKFA 4X9SA 2Q8ZA 3MP5A 4A29A 1W0MA 3DFNA 1OX5A 4Y6GA 3QQ0A 4B5NA 3PB2A 3IGUA 3SECA 3L0GA 4UTWC 2V5LA 2ISSA 2CLHA 3G1YA 4M6PA 4MZYA 3W74A 2J24A 5I3GA 2FLIA 1IXNA 3LHTA 4UC5A 3W22A 1TTQA 1YPIA 3R12A 2J27A 1EP2A 2ABAA 1VLWA 2P10A 4K8EA 3W7PA 2YYTA 1BTMA 2X30A 4IX0A 1GTEA 2BZNA 1E51A 3HB9A 3G0SA 3SIZA 2VEPA 3O6DA 4OWGA 1TPB1 2G97A 3PG8A 4GBUA 3WJWA 2R91A 1ZAJA 4IMEA 5AC6A 2C0AA 4O54A 4TU1A 4K38A 4O18A 3QW3A 1EUAA 4MLJA 1LORA 5HULA 1FWTA 4LUJA 5FEZA 3W2JA 1R46A 3QM3A 3G1XA 2HS8A 2V2CA 4LY8A 2BSLA 1XC4A 2ZCGA 2A6LA 3GKFA 5EMUA 2JGQA 4PODA 4OU1A 4RXGA 5D37A 3F03K 5FF0A 1D3HA 2PRMA 3GKAA 3W88A 2B0MA 2JGYA 5FF3A 2RH9A 4JIQA 1DOSA 5FEPA 1F6PA 4Z1DA 1L6WA 4NNBA 4IMFA 4HNUA 3G3DA 5HR6A 4JTHA 4UFIA 4UTUA 2JK2A 4O57A 1UUOA 2A7RA 5FF7A 1MSSA 4N9EA 4EWND 1MEWA 3W72A 3ZWSA 3O15A 1FWSA 1SFLA 2ZA1A 5EA9A 2W0UA 2ZRVA 2AQWA 4RJEA 3ANYA 1EX5A 1JCJA 2FFCA 3HPXA 1PHQA 1VC4A 3P81A 5AB3A 1PE1A 2DZPA 4WX2A 1OG0A 1Z44A 4M5PA 4UTWA 4Z0SA 5U7SA 5DXYA 1YDVA 1FDZA 5K7JA 4N9CA 1KFEA 4LUIA 1OFRA 1TPVA 1W54A 1K7FA 3R13A 1ICQA 4OQVA 4KWWA 4UMBA 1KM6A 3S1XA 1OABA 4DQWA 2J6XA 1JQXA 3GDRA 1TQJA 2GVJA 5F2LA 3F4NA 2YCEA 2QUUA 4P2VA 3W86A 4JYDA 4UMAA 4GXMA 3NQCA 1XUUA 2Y63A 1R2RA 4PCFA 5H2ZA 1RQBA 3P67A 4Q4KA 1R30A 1UASA 3NQMA 4DF1A 4LVFA 1PV8A 3DHDA 4RX0A 3TUUA 4JDBA 4HIBA 4R7JA 5IM51 4Y90A 2Y88A 3QEZA 3LERA 1PCKA 1BWKA 3SFKA 3OHIA 3M5YA 3IIPA 3I7SA 5CPOA 1XM3A 4EVZA 4LS0A 3P61A 3P8IA 1GYLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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