1UP2A

Structure of the endoglucanase cel6 from mycobacterium tuberculosis in complex with glucose-isofagomine at 1.9 angstrom
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
293
structure length
291
Chain Sequence
ANPLAGKPFYVDPASAAVAARNANPPNAELTSVANTPQSYWLDQAFPPATVGGTVARYTGAAQAAGAMPVLTLYGIPHRDCGSYASGGFATGTDYRGWIDAVASGLGSSPATIIVEPDALAADCLSPDQRQERFDLVRYAVDTLTRDPAAAVYVDAGHSRWLSAEAMAARLNDVGVGRARGFSLNVSNFYTTDEEIGYGEAISGLTNGSHYVIDTSRNGAGPAPDAPLNWCNPSGRALGAPPTTATAGAHADAYLWIKRPGESDGTCGRGEPQAGRFVSQYAIDLAHNAGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Mycobacterium Tuberculosis Strains Possess Functional Cellulases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELA1 PROTEIN
total genus 108
structure length 291
sequence length 293
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01341 Glyco_hydro_6 Glycosyl hydrolases family 6
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.40 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel 1, 4-beta cellobiohydrolase 1up2A00
3A64A 3RPTA 4AX6A 4AX7A 1UP0A 3ABXA 3VOFA 3VOHA 2BOGX 1OCBA 1DYSA 1OCJA 3RU8X 4AVNA 1BVWA 1GZ1A 4B4HA 3VOJA 4I5UA 4AU0A 3VOGA 1QK2A 4A05A 2BOEX 1HGYA 2BOFX 4AVOA 1QK0A 1UP2A 1CB2A 1OCNA 1HGWA 1UOZA 1OC7A 1TMLA 1OC6A 1UP3A 4I5RA 3A9BA 1QJWA 4B4FA 3VOIA 2BVWA 2BODX 1OC5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VHLA 2J27A 3PBVA 4GBUA 3STFA 3UGRA 2ZKMX 1UKQA 2ZRYA 4X0VA 4DZIA 4XIMA 4ZFCA 4OQVA 3IIXA 2PE4A 3A5FA 4PBGA 1X39A 1V3JA 1YW1A 4Q7NA 4QHRA 3D3AA 1NOFA 1NVMA 2ZX9A 3G1AA 4NYYA 3RPTA 1XD0A 2O9PA 3MP5A 4IG2B 1D2KA 3QPZA 1UB3A 1C29A 2NQLA 1J12A 2AAMA 1WDQA 2FHCA 4HCHA 4GYKA 1EA9C 4PRTA 3A9BA 3MQTA 4WXYA 4LRSA 2HSAA 1ISVA 3NG3A 4AEOA 1UWIA 5CC3A 1SFTA 3WH5A 1KC7A 2OVLA 3F03K 1BTMA 1V02A 3FYPA 4QFUA 2V9DA 1GOIA 3P74A 4Q4PA 4KWOA 3SM0A 4LUTB 2WSKA 1EJRC 4GGHA 1OK4A 2VEPA 1B57A 5HDRA 3WLSA 4QP0A 2PWDA 3VD7A 3W88A 1TWWA 3BV4A 1YXYA 3K8LA 5FL1A 3R79A 4UR8A 4L6OA 1ZY9A 3ATYA 3AIQA 2WV8A 3WD2A 5JBFA 1PYMA 1V79A 5C8BB 4QITA 3TQPA 2PDHA 4L4OA 2EPMX 1GG0A 3EKZA 4GINA 5KITA 3CH9A 1K8ZA 1XW8A 1B4EA 1DHPA 4ICNA 2JIWA 1PPIA 2ISWA 3N34A 4H83A 3S83A 5CBBA 5E9AA 1US0A 4WZHA 4XZMX 1JJKA 3TQKA 2E77A 3JRKA 1UR8A 2CU0A 3PSVA 4GI9A 4CU7A 3FW6A 5A6KA 2W27A 1CB7B 1J0ZA 1PEZA 2WSPA 4HIBA 3ABQA 3WMSA 5I3GA 1QTWA 1LP6A 4FEZA 2I14A 1JUKA 2MNRA 4O4WA 3HM7A 4LVFA 1F2JA 2WMFA 1VCFA 4PMRA 2XWDA 3QHMA 3GY1A 3F5JA 1S5MA 3WBAA 2YCLB 1QI2A 1H0GA 2PLCA 3I3DA 4CQ8A 1YBQB 4LH8A 5BRPA 3R13A 4PMDA 1QO5A 3IIPA 1UR3M 3T2QA 1DP0A 2YL6A 4MLJA 3E74A 3MS8A 4O1EA 2JF7A 4AY1A 4DBDA 4PE8A 1GZGA 1C8VA 1GOQA 4AVOA 5HULA 2HDJA 1E9LA 3MYPA 2QF8A 1ONRA 2ZE3A 3W0KA 4W7WA 1EFZA 1R9YA 3S6DA 1PSCA 4H9UA 3ZT7A 1DKWA 1BYAA 1JIBA 1G4SA 3S47A 4Z2LA 2QUNA 2O56A 1E0VA 4EXBA 3BANA 1DWHM 3QOMA 2PD9A 5MKGB 4X3ZA 2PWUA 4O14A 1PTGA 1K7XA 2C0HA 3V0UA 2WMKA 4HOWA 1YHTA 5CXPA 4AZCA 1NOUA 4ADUA 2YL8A 1SPQA 2A79A 1YRRA 3N18A 4ATDA 3VFCA 1XDJA 1UD4A 3HZ3A 1UJPA 5EFFA 1Y8BA 3W1AA 3ZQ9A 2XIMA 3ZZ1A 3THDA 2V5CA 1E6QM 1MWOA 1VF8A 2H3BA 3DXIA 4J3TA 3B06A 1PS9A 3WSUA 3W7JA 4MB3A 3BGGA 2IPJA 4P7LA 3GVRA 4JZ5A 1AH4A 3RJYA 1H11A 3GBEA 4UQAA 3B9EA 3FY1A 4H8VA 1OFAA 1QW9A 1CW2A 3RPDA 4IFRA 3NQGA 5D9MA 9RUBA 1SO4A 1KM6A 1ZU8A 1M7XA 2OX1A 4FX7A 3WLOA 4RE3A 5CSSA 4IX0A 3BLOA 5E6YA 1SZEA 5MHBA 4HA4A 4K1GA 4DYKA 4OBSA 2ZDRA 4TVCA 4GMEA 2C8NA 5FI8A 1OEPA 4MY9A 1LLWA 2QPUA 2YLLA 3TYDA 3MI2A 2WXDM 4A3QA 1EJWC 1EC8A 1TX2A 3AIEA 3N29A 4E2VA 2YA1A 2YXGA 3UFYA 5CZKA 3B9OA 5JH1A 2OOFA 3WNPA 4O1CA 2X7VA 4RZBA 1JPKA 3QYSA 1IZJA 3CZEA 1V77A 3F4VA 3PTDA 4E8CA 1LWHA 2BZNA 3WIJA 3OBKA 3T09A 5D33A 3SECA 5F4XA 3W2UA 1UP0A 2OLSA 4I9JA 2FPTA 1E70M 4JOMA 2VFEA 4C6CA 4PC8A 4HNUA 4ZSUA 4PMNA 4LBRA 1JQXA 3WDRA 1AQMA 5AC8A 4EWJA 4GVIA 3BLLA 1Q13A 4GHRA 2ZUSA 3W7QA 1LBMA 2PMQA 2GJRA 3N3MA 3HQNA 2NV1A 3LCWA 2WZIA 3BSMA 2PGEA 3SBFA 3UZJA 3TYBA 1XSKA 4LUIA 1SW3A 1MZRA 4MZYA 2E3ZA 1K8XA 4P2VA 4PRWA 1WKYA 3PZMA 1Q6QA 1KFCA 3NZRA 1V02E 3HMCA 3PTQA 3DESA 2Y5SA 3PR2A 3W7GA 3THQA 1P6WA 2OGJA 4F2UA 1S2VA 3F2DA 1UQYA 2Y2WA 4BEUA 1E3XA 4QCEA 1EHAA 5EBAA 4DAFA 3MSDA 2Y88A 3S5NA 2RDWA 2P0OA 1TJ1A 1RA0A 2EPLX 1RVKA 4KEMA 4Y9AA 1HJXA 1O68A 8XIMA 1PZ3A 1CEOA 1W8GA 1XR2A 2GJXA 1DYSA 1N2VA 3N6QA 1EC9A 3ARUA 4JL2A 4AZCB 2YW4A 2NUYA 1RCXB 2HCVA 4GG9A 2TPSA 3WK2A 3ZSTA 3VUPA 2Z2UA 5KSWA 4MAZA 3W7RA 5D2VA 3WDPP 1GYLA 5D2YA 2ZICA 3O05A 3AHZA 1S3TC 1QDSA 4ORMA 4IICA 1OFPA 4AD5A 2YSWA 3WQPA 2PAJA 1F73A 1H60A 1ZENA 1F6PA 3DZ1A 4R88A 3FCPA 3TR9A 8TIMA 1R47A 4PMUA 5D2TA 5C9XA 3ITOA 2FFCA 3DGRA 1PX8A 4QIUA 1JD9A 2BY3A 1Z44A 4PUUA 4FOUA 1MW2A 1A49A 4HU4A 4Z17A 1VR6A 4EF9A 1NOWA 3WD3A 1ODZA 1H1NA 1TZ7A 4HZ6A 3OBEA 1XCXA 5PTDA 1Y0EA 1GVQA 5CPLA 5HWMA 2XVNA 2VURA 5KZDA 2X2YA 4QTGA 3QQ1A 4GUHA 4NAEA 3L0KA 3WY1A 4PUMA 2G95A 4JL1A 2WVSA 4PUKA 4L80A 4PEKA 4WX2A 3WG6A 2AL1A 1GTEA 2WCAA 2FTPA 1K7EA 1I1XA 3W6MA 3P2VA 2WANA 1GJUA 1TTIA 1XLBA 4XX6A 3PNUA 3DI0A 5HA7A 3E96A 3W74A 1GOKA 4LGXA 1RHCA 3S1GA 3V1PA 1M7OA 4RXGA 3CUHA 1K1DA 3W1TA 4O4VA 2Z00A 5U4NA 1FWAC 1QATA 2CLIA 2UZ9A 4EACA 3PAJA 1XUUA 1UUOA 2CYGA 4M1RA 4NX0A 3DFNA 3OO2A 3W2LA 5J5DA 5A6TC 2GL5A 2ZX6A 1R3RA 3U7VA 3W70A 1MO0A 3LQGA 4E8DA 3K13A 3MJYA 2ZUWA 4FO4A 1TTJA 4URIA 3T08A 4IL0A 4F79A 3H55A 1HKMA 1JF6A 1SR0A 4A29A 3BK0A 4HT3A 1PJ9A 1AL8A 3TN5A 3QZAA 1LJYA 3SCNA 4AEEA 1BG9A 3PZOA 2GWNA 1TE1A 2PEVA 2WO5A 1KTBA 3TA9A 4U5IA 3ISIX 3LNPA 4L9ZA 1RCOB 1UP2A 2F7FA 1GQNA 4RL3A 2YPIA 1YDNA 1SUXA 1B4KA 5E6ZA 4B91A 4KMQA 1TCMA 2INEA 2FZ9A 1XLMA 3HOJA 2A6LA 4IJCA 3WF3A 2X09A 5BWFA 1HNYA 2YB1A 5H8MA 4HZ7A 4ADSA 5IBXC 4QDMA 3AMLA 4REQA 3U5UA 3RCNA 4PRRA 4WY0A 2WC3A 3N6JA 3VCCA 1KCZA 9CGTA 2NQZA 4UOQA 3STGA 1UOZA 2GJXB 2FB2A 2XU2A 3SRFA 2EQDA 2QKFA 1O5KA 3FV9A 2VZUA 1F8IA 4HMNA 4C6MA 3AYTA 3EWWA 4LV4A 3VKKA 1XLLA 1TWZA 2FZDA 2BY1A 3QY7A 3A23A 2BLEA 2JGQA 4M6PA 2H8ZA 4H6KA 3ARPA 1RVGA 5TBOA 5HWJA 3SN4A 1ZHAA 2CC0A 4ZO8A 2J25A 4Q7IA 5H8PA 1Q5MA 1R2RA 1ZBCA 2BXZA 4Z2JA 1UROA 1XYZA 1IF2A 3BGAA 4X2RA 1E40A 4QLLA 4FX6M 3EKGA 4D6GA 2Y61A 2J66A 5HQEA 4LCRA 4NJGA 3VABA 5TQLA 3PANA 5CH9A 2YB4A 3UWUA 4ASTA 5LIKX 2RGMA 5K9CA 5CKSA 4NZFA 4NG3A 4QE1A 1A5LC 4FF5A 1AH0A 2GDQA 1UCWA 4AZGA 4CD7A 1FWTA 5JH2A 1TPB1 2AQWA 2Y8VA 3FYOA 1HJVA 1DORA 1EKOA 2E1WA 2OELA 1G0CA 2QMKA 5CG0A 3UGVA 2I17A 3B8WA 1CIUA 5C9ZA 5ABFA 3QMTA 3TYAA 1JGIA 1QJWA 4UCFA 4I6VA 3LGEA 3SY8A 4A22A 3PPFA 3E38A 1EUAA 1JDCA 3HJZA 4OTKA 4MJMA 3GZAA 2R1PA 2D2OA 4ZVJA 3CNYA 4S3GA 3HQPA 4HNLA 4QBXA 4FLSA 1MXDA 4N7QA 3CL8A 3QTGA 1HGWA 3THAA 4JFTA 4CCDA 2ZOXA 3LXCA 4ACZB 3HQ1A 2DV0A 1IT0A 2E7FA 4HOXA 4TVDA 3EWZA 1R7AA 1M1BA 1FHLA 3EPNA 2VEIA 4L64A 4D6IA 3H6OA 2YZRA 2QMJA 2HVOA 4LXFA 1D3GA 4GCAA 1QXLA 2PGWA 1UOKA 1XGZA 4OGZA 4BFAA 3PUGA 1SZGA 1G94A 3F1QA 4ENLA 5DBUA 8RUCA 1I0BA 3AJXA 1IXQA 2F8QA 3N25A 3R11A 4ACYA 6REQB 1HKVA 4CNOA 3LCFA 2WNZA 4LWWA 4YN5A 1X8CA 5DT7A 3CZGA 4X9SA 1LM1A 2VM8A 1GQKA 3IARA 1Q45A 2IQTA 4QQUA 3AXMA 4O1AA 1BG4A 3RUBL 1BD0A 1ZJHA 4WEVX 3BW3A 3GIYA 5FF0A 3W75A 1JPIA 1N8WA 1H61A 3IJDA 2WM0A 3EX1A 3KRZA 5HBFA 2E6AA 1FWDC 3QF0A 3QQ0A 2PI6A 2ACUA 1BXNA 4IT1A 2Y6ZA 5F4SA 3PP7A 2POZA 1NP2A 4C7FA 4YCOA 2W61A 4REQB 3W7NA 3FSUA 4WY0B 4BJHA 4B3ZA 2J9YA 1F9CA 4PUJA 2PGRA 5D03A 4UQBA 3M47A 1XINA 2XZ7A 2ISFA 1NDZA 3N12A 4OJYA 2VGIA 4KGLA 3EX6A 1QPKA 1XBVA 3WO8A 1UUQA 4IPJA 1JPDX 1KBBA 1XIEA 2WMJA 1P1XA 3PTMA 4HK7A 2XH0A 3KTSA 4GBDA 4AX6A 1AW2A 2AKMA 2GGJA 1E9YB 3H12A 1L8PA 3GK0A 2J47A 2I9UA 2ICSA 1K8CA 2WSYA 1JDAA 3KWXA 4ATLA 1QBBA 3C2VA 2CZFA 4UTLA 3GDMA 2Q6ZA 1PIFA 4AU0A 1K6AA 2X42A 3RLGA 3C2EA 3FFSA 2WMGA 4XAFA 2VWSA 1W31A 1V6WA 3DYMA 5C55A 3T07A 2PDWA 4GJJA 1W1VA 3LRKA 1AK5A 1KLZA 3LHTA 2PP1A 5AVHA 3NM1A 1MNSA 4H9MA 3UG3A 3NO5A 2UY4A 3K2GA 3G0UA 3O9NA 1B9ZA 1VD6A 5E09A 3N1AA 2J7CA 1SU5A 2ZZ3A 2BXYA 1GQLA 1AL7A 2AQOA 1BKHA 4HZMA 1I75A 3RRXA 5F2IA 4ZMGA 1IIGA 1E9IA 5ABFB 1KCXA 5FSDC 2ZA3A 3KWSA 4Q8UA 4UQCA 1YDOA 3EEGA 1U5HA 2PDLA 3DFQA 2WB5A 3OZPA 2X30A 3RIKA 3PB0A 5I6SA 1UWSA 3KBNA 1DTNA 1L9WA 3L65A 3F2BA 1NDVA 2QNEA 5HWNA 1OZMA 3NQDA 1I8JA 1RQHA 4FLOA 1QNVA 2QJIA 3KHDA 2TAAA 2NSXA 3U3HA 3T7VA 2Z2BA 2QUMA 4WGHA 2BGSA 1E73M 2OWCA 1RV8A 1E5NA 4NKCA 1ZBKA 1ODUA 4ZXLA 3PN8A 3E02A 2BB0A 2OOGA 5I09A 2OCZA 1YEYA 1E0WA 3RX3A 4Q4SA 1OABA 1E55A 5LA0A 3CM4A 2YR1A 3GXTA 3N2BA 4PUEA 4JD4A 4DO7A 4D6HA 2DUAA 3VU2A 2NT1A 4PTDA 3REQA 4ZQPA 3B04A 3MI3A 3LHUA 1E6SM 3VKDA 1NARA 2HRWA 3I6TA 2A7RA 5D2WA 1H50A 4MOZA 1GCYA 4IP4A 1FHDA 2WKJA 2XFRA 1G7UA 1KBJA 1XICA 1ZBVA 3URNA 1GG1A 4L9YA 4W7VA 3BPWA 1RXOB 3W24A 2PU1A 5I3DA 1YTKA 5G2WA 3C56A 3H2MA 1WBHA 3D5HA 3AISA 4PTWA 3PNZA 2XH4A 4H7VA 1AODA 1M04A 2FFIA 5DXXA 3B0XA 1TPH1 1G01A 3E2RA 3DHDA 3GXMA 5G1YA 4MDPA 4PMOA 4XSLA 1CGYA 4UNIA 2VCBA 1XCWA 5A8GA 1V4YA 2GVEA 3UNDA 2F2KA 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3A64A 3RPTA 4AX6A 4AX7A 1UP0A 3ABXA 3VOFA 3VOHA 2BOGX 1OCBA 1DYSA 1OCJA 3RU8X 4AVNA 1BVWA 1GZ1A 4B4HA 3VOJA 4I5UA 4AU0A 3VOGA 1QK2A 4A05A 2BOEX 1HGYA 2BOFX 4AVOA 1QK0A 1UP2A 1CB2A 1OCNA 1HGWA 1UOZA 1OC7A 1TMLA 1OC6A 1UP3A 4I5RA 3A9BA 1QJWA 4B4FA 3VOIA 2BVWA 2BODX 1OC5A
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 2WPB A;  1WX0 A;  3WD0 A;  2J24 A;  1ZUA X;  6ENL A;  5REQ B;  4LUT A;  4L4M A;  3ZVI A;  1A0D A;  3VDA A;  3S5O A;  3VZZ A;  3M0M A;  1V7A A;  1X6U A;  3VI2 A;  1UH4 A;  5EML A;  2FMN A;  4CQB A;  4R7J A;  1OSE A;  2YJQ A;  1GJW A;  1DED A;  5FF4 A;  3CPU A;  3TWA A;  3QGK C;  4HTY A;  3RR1 A;  4YTR A;  3R0K A;  5CBJ A;  4NAF B;  2ZRZ A;  4E8G A;  3GHR A;  4YLW A;  5M3W A;  2XG9 A;  1XL9 A;  3H4X A;  3MHF A;  1OD8 A;  4AIB A;  3W7M A;  3TYU A;  4GQB A;  1BFN A;  3EAU A;  4PMX A;  1J0I A;  3W2N A;  3FN9 A;  3FKR A;  2G0W A;  4D1J A;  1JCM P;  1CGU A;  1LRQ A;  3L5L A;  2QCD A;  3MJM A;  1C8X A;  3TX9 A;  4WJ8 A;  1R6W A;  1LG2 A;  1KB3 A;  3GWQ A;  3W85 A;  3IVT A;  3J7H A;  3IK4 A;  3C2F A;  3SCS A;  1W9U A;  2RFG A;  2YXX A;  4AZ5 A;  2XUC A;  3M4H A;  5LIW X;  5HME A;  2UV8 G;  1MSS A;  1FWJ C;  1XQL A;  2BHZ A;  1XLF A;  1VQT A;  1U2Y A;  3G6M A;  1CGW A;  2BDQ A;  3NPX A;  1OQF A;  4W87 A;  2YCL A;  5LHF A;  3VD9 A;  2A7N A;  3PSW A;  4J5N A;  2CXE A;  3VE9 A;  3AYS A;  3C0S A;  1EL3 A;  4JQA A;  2ZZ7 A;  3BG9 A;  1EWE A;  2D2J A;  2WMH A;  1E72 M;  1JD7 A;  4ICC X;  1ICQ A;  1HO4 A;  4XO6 A;  5HAO A;  3FXG A;  2W62 A;  4HZ8 A;  1V8E A;  3LZ3 A;  3TTQ A;  4FLQ A;  3KOF A;  2BVD A;  4PUL A;  4J2M A;  4D2J A;  2HE8 A;  4MM1 A;  1EOK A;  4IQD A;  3HTW A;  2Q3R A;  1AFS A;  3VD4 A;  4ZEN A;  5CCZ A;  3IUD A;  1KGX A;  2PCE A;  5MKG A;  3RF9 A;  4NJH A;  4NXK A;  5AYY A;  3TFX A;  1LBF A;  2FVM A;  1RPX A;  4CNS A;  2G3N A;  3KL5 A;  3UR7 A;  1DE6 A;  3HPA A;  4AEF A;  3SY1 A;  1VLI A;  3F4N A;  1QVB A;  2REQ B;  3OHI A; 
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 3A64 A;  3RPT A;  4AX6 A;  4AX7 A;  1UP0 A;  3ABX A;  3VOF A;  3VOH A;  2BOG X;  1OCB A;  1DYS A;  1OCJ A;  3RU8 X;  4AVN A;  1BVW A;  1GZ1 A;  4B4H A;  3VOJ A;  4I5U A;  4AU0 A;  3VOG A;  1QK2 A;  4A05 A;  2BOE X;  1HGY A;  2BOF X;  4AVO A;  1QK0 A;  1UP2 A;  1CB2 A;  1OCN A;  1HGW A;  1UOZ A;  1OC7 A;  1TML A;  1OC6 A;  1UP3 A;  4I5R A;  3A9B A;  1QJW A;  4B4F A;  3VOI A;  2BVW A;  2BOD X;  1OC5 A; 
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