1UP3A

Structure of the endoglucanase cel6 from mycobacterium tuberculosis in complex with methyl-cellobiosyl-4-deoxy-4-thio-beta-d-cellobioside at 1.6 angstrom
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
ANPLAGKPFYVDPASAAMVAARNANPPNAELTSVANTPQSYWLDQAFPPATVGGTVARYTGAAQAAGAMPVLTLYGIPHRDCGSYASGGFATGTDYRGWIDAVASGLGSSPATIIVEPDALAMADCLSPDQRQERFDLVRYAVDTLTRDPAAAVYVDAGHSRWLSAEAMAARLNDVGVGRARGFSLNVSNFYTTDEEIGYGEAISGLTNGSHYVIDTSRNGAGPAPDAPLNWCNPSGRALGAPPTTATAGAHADAYLWIKRPGESDGTCGRGEPQAGRFVSQYAIDLAHNAGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mycobacterium Tuberculosis Strains Possess Functional Cellulases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords PUTATIVE CELLULASE CEL6
total genus 114
structure length 293
sequence length 293
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01341 Glyco_hydro_6 Glycosyl hydrolases family 6
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.40 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel 1, 4-beta cellobiohydrolase 1up3A00
1OCBA 3RU8X 1UP3A 4B4FA 1HGYA 1UP2A 4I5UA 3RPTA 1DYSA 1BVWA 3VOIA 2BOFX 4B4HA 1GZ1A 3VOJA 1OC6A 4AVNA 4AVOA 2BODX 1OCJA 1HGWA 1TMLA 4A05A 1QK0A 1OCNA 2BOEX 1UOZA 1QJWA 1QK2A 1OC7A 3VOFA 1CB2A 2BVWA 1OC5A 4AX7A 4I5RA 4AU0A 3A64A 3VOHA 3A9BA 4AX6A 1UP0A 2BOGX 3ABXA 3VOGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OF8A 4FX6M 4P8XA 2O9PA 2XN2A 4QSFA 3GXDA 4EXAA 2DZTA 1FWHC 2F38A 2J9YA 3W27A 3AHXA 4QITA 1GPWA 1ME8A 2QZRA 3MBFA 1TPDA 3GVGA 1X6LA 1Z6KA 3LZ5A 4J3XA 1A5OC 4TQTA 3VZXA 3RM8A 3SRHA 1M01A 3EMQA 1I9CB 4JFVA 2VJXA 2WSRA 4DX3A 3VZZA 4C6BA 2Z1WA 1WXYA 1ONXA 3JS3A 3OZYA 4W84A 2GPTA 1BGAA 2G3NA 3HGRA 2VDGA 2PBGA 3A24A 3WIJA 1WZMA 4E3TA 1VLIA 4KWVA 3N2MA 2NV2A 3XIMA 3WNMA 1S46A 2E6FA 3MCOA 2RFGA 1BF6A 2W9MA 2XGIA 2DT1A 2GFTA 9RUBA 5E0KA 1WZLA 1QASA 1H11A 4N6FA 1UB3A 2DP3A 1RLDA 2CHNA 3EX1A 2OJPA 1MDLA 1LF1A 1X97A 3Q67A 4LYKA 3A4JA 1NVMA 1PKMA 2W61A 3CHDA 4HZ7A 2ZZ2A 3B0YA 1ZAJA 5AHEA 4C6PA 2WMKA 1EF3A 3BANA 4LC8A 3M0VA 3W7EA 3CWOX 1Q6FA 5F2IA 1HIZA 4WKFA 4DJDD 2EPHA 3UXDA 1J0JA 2NQJA 4HU0A 5D05A 3E6EA 1XBVA 5H2ZA 1UD3A 1XCFA 4GZIA 5EMJA 3VGHA 3OO2A 3TZFA 1O5XA 3L5AA 5A69A 5I0DA 3L4XA 1UA7A 5FJOA 3EOOA 5CGTA 4NZ3A 2TODA 3LGDA 4W93A 1VCVA 1CENA 4FI4A 6ENLA 1D7FA 2PRHA 1JQVA 3WZ0E 1I6NA 3TUUA 1H61A 3V35A 3W73A 5EMLA 2TRSA 4A6GA 1WO2A 2D20A 3FVDA 3GC2A 1P0KA 5I00A 1RVKA 1OJXA 3QR0A 1CPUA 3TW6A 1GG0A 4JDBA 5CZSA 3IUDA 3N18A 1G69A 1PL9A 2HV5A 1UZ4A 1OM0A 1JYXA 2HROA 3KVLA 2YL8A 4JCMA 3A22A 3QC0A 3H2OA 3TTQA 4QE1A 1ODUA 3ITVA 3N2CA 1BPLB 2WJZA 3T07A 5EMUA 3PUDA 4M3PA 4O10A 2PWUA 8RUCA 1V6UA 4WXZA 1ZFJA 4IH3A 4Z2HA 1A5BA 4DF1A 3LEPA 2QVNA 3IS4A 1RBOB 1C90A 4E8CA 4DJFA 5HR7A 3GNXA 3PM6A 2ODOA 4PMDA 4U2YA 4AHQA 2BZNA 3EB2A 3MHGA 4OWGA 3IUHA 3PULA 1GJWA 1GOIA 4O15A 5AC5A 1TG7A 1RY8A 1NDYA 4AIEA 1H1NA 2XH7A 1HGWA 2P53A 3PB0A 2HVMA 4BWLA 4PTXA 2LLEA 4HK7A 4GUFA 2PFHA 1E73M 4HCHA 1OINA 2CBIA 1REQB 3UXIA 1OHLA 1BYCA 4R9XA 3U57A 4GXWA 4NL1A 3SN1A 3VGFA 2PDIA 2JKAA 2HXUA 5FOOA 3RN6A 3FHAA 1PIFA 4RXFA 2NQHA 1PTAA 4ERIA 1H7PA 1B90A 4O50A 1IZJA 1F4AA 4AUBA 4XBJA 1EGVA 5FAJA 1MQQA 2UY3A 1WZAA 4L6HA 1VAHA 3V1HA 2C3ZA 3BICA 3BG9A 2E25A 5A3HA 1OK6A 5CBIA 3LPGA 3RCYA 1WE5A 2FDMA 3QRHA 5FKYA 3VZYA 3H54A 2DVXA 4NJJA 4YXGA 4IMGA 3PG9A 4H7ZA 2B7QA 4I9JA 4U3CA 3WSUA 1KBLA 3TXVA 3VFCA 3KBWA 4Z08A 3ORWA 3MHUA 1UQZA 2VEGA 4PEEA 3FCPA 1UR2A 4YJ5A 3S2MA 4Z1BA 1L6SA 3WF4A 2DU2A 2V3FA 3D3FA 3TN3A 3H70A 2VEKA 2J8GA 3C8FA 3VOFA 1VBJA 3HA1A 2VQTA 2Z25A 5I3DA 2BGSA 4IGMA 4B5VA 4X9YA 2CFFA 2PWFA 1HGYA 3DXIA 1DPMA 3CMFA 3NQ6A 3SQMA 3KWXA 4CLMA 4GVHA 4WDTA 1LP6A 5REQA 4MWAB 3PANA 4U10A 1RBLA 4UNKA 4S3BA 3UVAA 1G4EA 4Q6JA 4XVEA 4IPPA 3RO8A 3WD2A 2YLLA 3WLMA 1UWUA 2CITA 2Y8VA 2CBUA 3OHMB 1E9YB 1KFBA 1CZ1A 3M16A 1H5VA 1IEIA 4NAEA 1A5SA 4HJWA 3PZQA 3UFYA 2DUAA 3WQ5A 4C1LA 2W0UA 3FXGA 4WY0B 1JNDA 1H49A 3M4HA 1UC5A 1V79A 3W7PA 3CTTA 3TP4A 2DQWA 1QW9A 3WNNA 3NQ2A 4F2BA 3H53A 3S5OA 1RLCL 4M19A 4HN8A 1XG3A 3AUOA 4GKLA 4US6A 4LVGA 2X1RA 2X40A 3S9ZA 2HDJA 4PMJA 1XRVA 3FKKA 3SAZA 1W1VA 1JDDA 3T0AA 4GUHA 3LPFA 4OFCA 5BXPA 4DJED 1R85A 1EGMA 3FYYA 4KFOA 4XV0A 3ALGA 4JX6A 3R10A 4MNJA 3DZ1A 1XCWA 2EKCA 1OFAA 1PUDA 3BSMA 3W1QA 2YZRA 4S3AA 1A5NC 1J2WA 2FJUB 1R3VA 3TYAA 1NH6A 2BY1A 3EWYA 4H01A 2WC7A 2WBKA 5LIUX 1XYAA 3S42A 3N11A 4FB7A 5EMMA 4IIHA 3NA8A 3OOQA 4JX4A 3QHOA 3F2BA 1FOBA 5H91A 4C6FA 3GUGA 1UHVA 4AWEA 2GZXA 1FP8A 2Z24A 3M5XA 2QYGA 4GNJA 1MUWA 3KVMA 3WQDA 3FX4A 3SADA 4UFMA 1CDGA 1XLJA 3L7RA 4E8GA 4GO9A 3LB0A 1SO3A 4H2CA 2DSUA 1BRLB 4JFUA 3S9YA 1V3HA 1CTNA 3S46A 3O9NA 2PGEA 1MVYA 1TA3B 2I7GA 2GGIA 5HINA 2BY3A 3CPRA 3WQFA 5A2CA 3LNPA 3SDOA 5I3JA 5A8OA 3FGCB 1CW2A 5LIXX 3TU9A 3NXLA 1QDSA 3M0MA 4DIAA 2GDUA 1I1XA 1X1OA 1FXQA 3BCJA 1H0IA 2P50A 3RRXA 1OX4A 3RLVA 5H8PA 4UTWC 3TW7A 3MKCA 3M1ZA 5LHEA 4UFLA 1PEZA 3IIVA 2ZCGA 3L4ZA 4WJ8A 1UKSA 2IQDA 1DHKA 3AFBA 5G2IA 2XZ9A 4RKAA 3WUFA 1EXPA 3GH5A 3GLCA 4Q7BA 3NCOA 2XISA 1FWIC 3NM3A 4CNOA 3AS3A 3MDWA 4E4PA 3CV6A 4NAFB 3P3BA 1X7FA 4ML9A 1RHCA 1FBAA 4S3DA 3R79A 4PMXA 4FEZA 3N2BA 1YYAA 4MJZA 2XSBA 2E5CA 1GZGA 4HB7A 2DGAA 5DXYA 2B4GA 1M9HA 3E38A 1IR2A 2AAAA 1FH7A 5HQMA 5LNUA 2FZ8A 5F1UA 2PDMA 1K8YA 2PWEA 3HFYA 4B15A 4URIA 3IJIA 4N9EA 2CKSA 3M0IA 2QIIA 4D1JA 1TTQA 3BOXA 4CD4A 5G2WA 2OTDA 1ITXA 1O12A 1QCWA 4LF1A 2HNEA 2PDHA 1I0BA 3V0TA 4LS0A 3UWYA 2J8FA 1P0DA 4O13A 2PCQA 2WKLA 3R13A 3IJQA 1RCXB 4I8DA 5A8GA 3ATZA 4PMZA 3T05A 3TSDA 4W5UA 1TWIA 3PBMA 4DUWA 2GGJA 1DIEA 2MANA 4KMQA 3KRSA 4WOZA 3KW3A 3NQ7A 4XQ6A 1TMLA 5DCEA 3CYJA 4C6EA 3C0SA 1DL3A 2HVOA 1S3HA 1OFQA 1M03A 1TPB1 4PULA 4RW3A 4QRNA 3FA3A 1KBKA 1OX5A 3WUGA 3ISIX 3ZVIA 2FB3A 4K8GA 5AFDA 1G5AA 3F5JA 1VKFA 3U3HA 5IXEA 1A47A 3EWBX 4GA8A 3VDCA 3NQBA 2D73A 5J5DA 3DC0A 4GNVA 1R2TA 2EG6A 2J47A 3T09A 5BWFA 1ONEA 4JHZA 5BU9A 1VF8A 4ZBCA 3HM7A 1N2VA 1YNPA 1XKJA 3HMCA 1YQ2A 1SJCA 1S2WA 4GI8A 3VA8A 4Q8MA 1K9FA 1MQRA 3VD5A 1HL2A 3Q2DA 3RR4A 3N2XA 1RCQA 3IGSA 4O11A 3BLPX 4EF8A 3W7NA 2WJDA 3R11A 1NFGA 1PWMA 1ZGDA 3HOJA 3QPZA 3U8GA 4W8AA 4P8VA 1PKLA 3LBMA 4C1NA 1WKFA 2NV1A 4J3UA 1RV8A 2F8QA 3EMZA 1WDDA 3S47A 2Z6JA 3BV7A 3C0QA 2MNRA 1A4LA 4AZCA 6REQB 4QP0A 2BOFX 4IF2A 5FI8A 4UTTA 1W9BM 2VC7A 4AMAA 4YL2A 1RD5A 3GFZA 3PPHA 4P7NA 2CW6A 3TYZA 1FDJA 4PFMA 2ZBTA 3HV8A 4TV5A 1KM5A 2OPJA 4G6CA 3WMSA 1AQ0A 1L9WA 2GDQA 1PKNA 4G7EA 3WJWA 1W3LA 1VFHA 5LNVA 1OYBA 3G2GA 3AICA 1XKYA 3BLFA 1S1RA 4A29A 3QW4B 3H12A 3V36A 2ONEA 2X7VA 4FLSA 4OV4A 2HQAA 3N4AA 3T8QA 1XIJA 2XFRA 3CWNA 2PLKA 1XLBA 4LJ3A 4DJFD 1O68A 3WL0A 4CNTA 1VC4A 3OVGA 4CNSA 3AO0A 1LYXA 3G1DA 4EP8C 4F0SA 3PBYA 1ZBVA 5ECUA 3OW1A 2GWNA 3WLIA 1QATA 2DSWA 3FLUA 5A1AA 3VUPA 3AMCA 1YADA 4B9ZA 4GUGA 4I5UA 3OZMA 3UZZA 4MWAC 1JF5A 3ZLHA 3CQJA 3GHSA 3O63A 3VE9A 4IJBA 3I4KA 3NVDA 3CHFA 1OGGA 1P6BA 3CEPA 3K30A 3CPUA 1KM1A 2ICSA 4LFYA 4Q7NA 2PLJA 1IXOA 2VRQA 1UD5A 1GZJA 2Y89A 2GGHA 3BV4A 3GG7A 1V4YA 3IJDA 3S1XA 4Q8OA 3A64A 3QHNA 4AIOA 4ZSTA 4G9PA 1GOOA 4L64A 1UUOA 2Y70A 4EAMA 5AHLA 5A8QA 1W1IE 2X0HA 1LUCA 4I3GA 4FOKA 4HA0A 4IFKB 3VNJA 3WQCA 1E0TA 4N4QA 3LHZA 4FIQA 3MW7A 1V6YA 1R3TA 1BWKA 1D3CA 2QJHA 3T8LA 3WNPA 3RILA 3S3GA 4IWWA 4GFIA 3F4DA 4ZGYA 4JIRA 4L1WA 5DBUA 4MLRA 1M41A 4JTAA 4IQLA 1DJNA 3PTMA 4CD7A 2FPYA 3C3UA 3L4TA 3BDKA 3G1VA 3T44A 1I45A 3NQAA 5J8LA 5I03A 4U28A 3UPBA 4N9DA 1JPDX 4FAMA 1W0MA 3EXSA 3V5CA 2QUUA 2WBGA 1QNOA 1D2KA 1OADA 3TWBA 2OO6A 4FNTA 3H7RA 4Q8VA 2D1ZA 2OKTA 3P0XA 1EP3A 2A7RA 1WOBA 1KR0A 3W28A 4JHOA 4X22A 3BOFA 5TBOA 4ZCWA 5GVJA 4FP1A 4CNUA 2PGFA 4K3ZA 4C6KA 1WKYA 1XIEA 2IXVA 4F0KA 5E0CA 3B8WA 6CGTA 1OFBA 2V5CA 1NY1A 1CB2A 1VFMA 3EWCA 4J9JA 4PE8A 4OBRA 1I2NA 4ZVJA 3U0HA 3WNLA 4GGHA 4QGCA 2CLKA 2I9UA 3SM0A 3AXXA 1XLHA 2PEVA 3AYRA 3P62A 3U2ZA 3VFLA 3VDAA 1G4TA 2YCLA 3BSHA 1CXKA 1SO6A 1XX1A 3RCNA 4Z2LA 4O1EA 4FXJA 4GGBA 4JIEA 4I7WA 1EYWA 2BY2A 1NDVA 4IIFA 5JVLA 2VR2A 3W29A 1VIWA 1MI3A 4MDPA 3THAA 3CMGA 1E6XM 1EJVC 1V3LA 3K1DA 3ZT5A 4XKMA 1GQNA 3CAKA 3LCWA 2AKZA 1QI0A 3QXBA 3PPCA 3L9CA 4UR8A 1XGEA 1OG6A 4LCSA 3MVIA 3E0VA 2INZA 3RM9A 1B3YA 4RE2A 4X63A 3PG8A 3PSVA 4NZ5A 2IPGA 3UR5A 1E5NA 3AXHA 1C8VA 2WZIA 4IFOA 2E77A 2QIWA 5M2FX 6ALDA 3C6CA 1EHAA 2D69A 3FS2A 4GXMA 1EX5A 2V68A 3RFAA 3DIPA 3DDMA 4QBXA 1EZWA 4LBUA 3GFYA 2J7DA 4MB4A 3ATYA 5BMWA 1N8IA 5D8WA 3K2GA 4AY8A 4ZOCA 1DJGA 2WB5A 2XSXA 3SO7A 5FSEC 1JQXA 1X8CA 4CEUC 4PSRA 2XVKA 4RE0A 4AZ5A 3R25A 4DI9A 1AG1O 3NYDA 4ZFMA 3HG2A 5C5YA 3KTCA 4RDWA 4GIAA 4LV9A 2QUNA 3QVQA 1XQLA 5AKQA 5D32A 3GVQA 4C6MA 1NDZA 1V7AA 4DI8A 2ANUA 3MMDA 4GJIA 3T1GA 4CQAA 3CB3A 3OU8A 2NXGA 4HPXA 4X3ZA 3O6AA 4ZQCA 4Q4OA 3SY8A 3TQPA 4YTTA 1QO5A 1C7TA 3NURA 5HWJA 2PTWA 5E93A 3L0NA 3WNOA 2POZA 2PP0A 3R7MA 4DUVA 2CC0A 4UQ9A 3ANUA 3P5YA 1H5YA 5F4XA 4JICA 5A6KA 2J7EA 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chains in the Genus database with same CATH topology
1OCBA 3RU8X 1UP3A 4B4FA 1HGYA 1UP2A 4I5UA 3RPTA 1DYSA 1BVWA 3VOIA 2BOFX 4B4HA 1GZ1A 3VOJA 1OC6A 4AVNA 4AVOA 2BODX 1OCJA 1HGWA 1TMLA 4A05A 1QK0A 1OCNA 2BOEX 1UOZA 1QJWA 1QK2A 1OC7A 3VOFA 1CB2A 2BVWA 1OC5A 4AX7A 4I5RA 4AU0A 3A64A 3VOHA 3A9BA 4AX6A 1UP0A 2BOGX 3ABXA 3VOGA
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1OCB A;  3RU8 X;  1UP3 A;  4B4F A;  1HGY A;  1UP2 A;  4I5U A;  3RPT A;  1DYS A;  1BVW A;  3VOI A;  2BOF X;  4B4H A;  1GZ1 A;  3VOJ A;  1OC6 A;  4AVN A;  4AVO A;  2BOD X;  1OCJ A;  1HGW A;  1TML A;  4A05 A;  1QK0 A;  1OCN A;  2BOE X;  1UOZ A;  1QJW A;  1QK2 A;  1OC7 A;  3VOF A;  1CB2 A;  2BVW A;  1OC5 A;  4AX7 A;  4I5R A;  4AU0 A;  3A64 A;  3VOH A;  3A9B A;  4AX6 A;  1UP0 A;  2BOG X;  3ABX A;  3VOG A;
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