1UQYA

Xylanase xyn10b mutant (e262s) from cellvibrio mixtus in complex with xylopentaose
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
GLKSAYKDNFLIGAALNATIASGADERLNTLIAKEFNSITPENCMKWGVLRDAQGQWNWKDADAFVAFGTKHNLHMVGHTLVWHSQIHDEVFKNADGSYISKAALQKKMEEHITTLAGRYKGKLAAWDVVNEAVGDDLKMRDSHWYKIMGDDFIYNAFTLANEVDPKAHLMYNDYNIERTGKREATVEMIERLQKRGMPIHGLGIQGHLGIDTPPIAEIEKSIIAFAKLGLRVHFTSLDVDVLPSVWELPVAEVSTRFEYKPERDPYTKGLPQEMQDKLAKRYEDLFKLFIKHSDKIDRATFWGVSDDASWLNGFPIPGRTNYPLLFDRKLQPKDAYFRLLDLKRLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Cellvibrio mixtus
publication title The Mechanisms by which Family 10 Glycoside Hydrolases Bind Decorated Substrates
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOXYLANASE
total genus 142
structure length 347
sequence length 347
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uqyA00
4LYPA 3VTRA 4ZFMA 5CSUA 1H09A 3VKKA 4BZYA 3SCUA 4TUFA 2Y8VA 4ZXLA 3S2CA 3N15A 3VPLA 5F7UA 5D9PA 1CGXA 1SMDA 2A3BA 2GFTA 2ZXAA 1J10A 1UZ4A 3POCA 1HX0A 3AXXA 4QP0A 3CUJA 4MNMA 4M80A 1WDQA 1E6NA 2WYSA 3WDPP 4OIFA 4LXFA 4TTGA 2X2YA 3FNDA 4AZGA 1CECA 4H41A 1HJWA 1UH4A 1GUVA 1MW1A 3BAYA 3APGA 3W27A 4ZXOA 1W9BM 4DWSB 1E55A 4J3SA 4AWEA 1B30A 4AZBA 3U7BA 4K68A 2OSYA 5BCAA 5I0DA 3CZGA 1G01A 1OB0A 1V6WA 4AIEA 3QGVA 1Q6GA 3G6MA 2WMKA 4Z2JA 1B3XA 1C91A 4LQ1A 4MDPA 4PMVA 4BF7A 3BCFA 4TTUA 4YHGA 1W1VA 1GQLA 3O9NA 2VNCA 2J7CA 3BAIA 3EMCA 3RMEA 3WH7A 1UR2A 2TAAA 2FHBA 3L4VA 1QNSA 1CGWA 1JF5A 2JEPA 5A6LA 2IXVA 3F4VA 1M04A 2OLHA 4W5ZA 5I78A 4OBSA 5IFTA 2OWWA 1EHNA 4PMNA 3ECQA 2QHAA 1WE5A 3MMUA 2GK1B 3GBEA 3IK2A 3WIJA 1US3A 4A3HA 5BXRA 3AXIA 2BNJA 4TX6A 4FLRA 4M82A 3DYOA 2NSXA 2J75A 1V0MA 4GO9A 4OOZA 1H11A 1B0IA 4EE9A 4IUGA 5BRPA 4PMXA 6TAAA 4CCEA 4NI3A 1OINA 1E4MM 1HT6A 1XHGA 2C0HA 1LL6A 1HKMA 4OKDA 1VJSA 2EJ1A 2E3ZA 3CBWA 1XD0A 1WCGA 3JUGA 1V3MA 2WMFA 1KR0A 4MDOA 4KH2A 2ZUWA 1XSJA 3OGVA 1ZJAA 2UY2A 2GJRA 1RP9A 1CGYA 1EH9A 1C90A 2WLYA 1ISZA 3KL0A 3WF1A 2GJPA 4HP5A 1PPIA 2GJXA 1E1FA 2VR4A 3HJEA 3O2LA 2GDUA 1E40A 1BVZA 2BV9A 4AZ5A 1EO5A 3VDBA 3EDJA 3EDKA 2XJ7A 4D6EA 3FAWA 4UQAA 4QFUA 1E5NA 2J8FA 4KMQA 3OBAA 2PB1A 3AIQA 2E9MA 4IM4A 5E6ZA 2UY4A 3WDQA 1B3VA 2DH3A 3LPOA 5I6SA 1B3WA 1M53A 2CETA 3WMSA 1NARA 4JKLA 3AIWA 3AZSA 2YBUA 5M3WA 3VIIA 1GORA 2EQDA 3ALGA 2WC3A 3VIJA 1DWGM 2J77A 3CIVA 2XVLA 3WNPA 3WD0A 4PCSA 1WDRA 1UKOA 2G3MA 3WNOA 1DTUA 4PYSA 2ZX6A 4JHZA 1JNDA 2EPKX 3N12A 4M8UA 2J7EA 1JYXA 5JBFA 3KWXA 3PZTA 1CIUA 4R27A 1NOFA 3WF2A 2F61A 4BQ5A 4IPLA 4MNKA 4PUDA 5FD0A 4CD7A 4MB1A 4AEEA 3QR3A 3KEHA 5DEZA 1C3FA 1B3ZA 4UQEA 4D6DA 3GYCA 3MUY1 1B9ZA 1W91A 4URIA 3WMCA 2WZEA 1G0CA 4AY1A 4U3AA 2J62A 4WKHA 3RO8A 1GCYA 3VUPA 4CU6A 5KEZA 1XYFA 3VIMA 2VQTA 3VMNA 1I1WA 4CVUA 1OSEA 4GPNA 4KRTA 2BHZA 3NJ3A 4M1RA 1UUQA 2NW0A 2G3JA 3A4WA 1QI5A 2PWFA 4CD6A 2E8ZA 2O9RA 4C7FA 5A95A 2EXOA 2WW5A 3MUZ1 4W86A 1JAKA 2ZUVA 4HOZA 1GQIA 4HMCA 5A2CA 4CN4A 1JZ6A 1MQPA 3D5HA 3PZVA 4D71A 4J7RA 5A8MA 5ABFA 4F8XA 1SMAA 1D3CA 2EPNA 2PWHA 4JCMA 1O7AA 4LX4A 1H3GA 1MW2A 1ZB5A 2BY1A 4TX8A 4MNLA 3SCWA 1BFNA 3W53A 4WK9A 2AMGA 4PEEA 1UZ1A 4MB5A 1GQKA 5AC4A 5CQ1A 3UR7A 4UNIA 1FA2A 3VGFA 2J25A 1MFVA 4B9YA 4RE4A 3VGHA 4FF5A 5ABGA 1GOKA 3WUGA 1UR1A 1EIBA 3CZ8A 3AQUA 5JBDA 4Q22A 3WQWA 4GQQA 1EA9C 5A6BD 5IXEA 5FIPA 4AD3A 3CZJA 1BYCA 4QLJA 2WKGA 2J79A 4BQ3A 4ACZB 2BFGA 5DT5A 4AZIA 3HMCA 4AC1X 3T08A 2X0HA 3PTMA 1QNOA 4DUWA 4ZENA 3EDDA 1HXJA 5FL1A 3ZO9A 2XTKA 3GNRA 1ISXA 4XX6A 1QHZA 3WBAA 1KB3A 4HMDA 1S46A 1KXTA 2PBOA 3GNOA 1DP0A 2ZUSA 1UD3A 1Q6EA 2D3LA 4P7QA 1UD4A 1MVYA 1H2JA 1AVAA 3I3EA 3POHA 4J28A 1KWGA 3PZ9A 2CNCA 1VRXA 3RJYA 1E73M 1PAMA 2GSJA 3WDJA 1Q4NX 3AHXA 2PBGA 1W2VA 2DSWA 1H4PA 5FL0A 3WQ5A 1R87A 1HKIA 2YKKA 1NQ6A 3N9KA 2WMJA 1CZ1A 2VT0A 3I3BA 4DM2A 4PCTA 4U5IA 1XD1A 3U7VA 1DWHM 1HIZA 4CVWA 5E6YA 1NWSA 3VD7A 3ZM8A 3E1F1 2D20A 1JI1A 3GH7A 2GUYA 3AMKA 1L8NA 5DF0A 2CERA 1NP2A 4ATDA 3W0KA 1W9UA 1I75A 4DWSC 4H7VA 2VCAA 3CHEA 2XIIA 4CN1A 1ZBCA 4QAWA 1E0VA 5AYBA 1W9DM 2WANA 2PWEA 4PTMA 3CZKA 4TVCA 4OUEA 1KWKA 3WF4A 4AMCA 1QPKA 1JXJA 1GJWA 1YHTA 1WO2A 2OSXA 1DHKA 4JIEA 4Z2LA 2V3EA 1E6SM 2BY3A 2XHYA 6CGTA 1H5VA 5A6BA 1JL8A 1G9HA 3W6MA 1TZ7A 3K46A 1OGSA 3I3DA 3WH8A 3WMBA 1QOXA 4MB3A 5M5DA 5CPQA 1GOWA 4PMQA 1FP8A 3KL3A 3NDYA 3IJ8A 4MNJA 1OIFA 3W82A 4CCCA 3TONA 5DMYA 2XFYA 2CCRA 2UWFA 2VX6A 3A47A 2ZXDA 1FH8A 2CESA 4L4OA 4HA1A 4H8VA 3CMJA 1LF1A 2O9PA 3RJXA 4M24A 2CHNA 2ZX8A 3K4AA 3PZMA 1E70M 1UG6A 5AY7A 1M7XA 3ALFA 4JCLA 2WMIA 1OD0A 3SCOA 3PZGA 3RILA 4B3LA 1CNVA 1W1TA 1K9TA 4E8DA 1TUXA 1V02A 1SR0A 1J0HA 1XYZA 2F2HA 2WB5A 5ECUA 1UH3A 2X09A 1CBGA 1KFWA 3AXHA 1PX3A 3CUFA 1H1NA 2JIWA 4CD8A 1OM0A 1XCWA 3THCA 2VVSA 1HN1A 1KXHA 1TE1A 1GOIA 4BQ4A 3WD3A 1R7OA 4PMRA 1XSIA 3AHVA 1NH6A 2YLAA 5A6SA 2ZUMA 2WSPA 1PJ9A 4DUXA 2QPSA 1OGBA 1WDPA 1VEOA 4WIWA 4DWSD 1IV8A 3CHCA 2WVSA 4PMOA 4ATLA 1BPLB 2ZX5A 4UZSA 3T2PA 5A8OA 1Y7VA 3WNNA 4W8BA 2WVVA 3MANA 1JNEA 1BVNP 1OCQA 5E0FA 3L2LA 2BHUA 1PEZA 2VUYA 3UR8A 4UFIA 2J4GA 2WC4A 1NWTA 4JKKA 2CHOA 4ML4A 1FP9A 1G94A 1Z32X 1J0JA 7A3HA 9CGTA 4WJXA 4CU7A 2DGAA 1C8YA 2EBNA 4NSBA 1CXKA 2VCCA 1UWSA 3BGAA 2VQUA 1TA3B 3N11A 5GQBA 4GIAA 3AHTA 4JFTA 1JDAA 2XVKA 2CKRA 4P8WA 2VX7A 4PN2A 4MAVA 2CITA 5AYIA 1F4HA 5A94A 2VOTA 4OZOA 1JIBA 2VMFA 4LGXA 3K4DA 2WMGA 4H04A 3D3AA 1U2YA 4CD5A 4P7NA 5IFPA 5C71A 3WH9A 3OLGA 1UR9A 2XSAA 3CMGA 1W9XA 1QW9A 4W84A 5LA2A 3WQ4A 5CJ5A 3ZOAA 1RD6A 2VTFA 2X8RA 2XIBA 1J01A 1UD6A 2VX4A 1G5AA 4CD4A 2G8ZA 2OYMA 4UFHA 2UY3A 3MKKA 2DSZA 4FLQA 3NSXA 4U31A 1E6QM 3SCRA 1EDTA 4H8UA 3VMOA 1N82A 2VX5A 4CN6A 1UWQA 2F8QA 1IZJA 1V03A 4JAWA 3L4YA 2Y5EA 4AZHA 2ZOXA 1E4LA 2ZUNA 3PZUA 1RPKA 1CENA 1WZMA 2YDRA 5LA1A 3VGGA 4UTFA 2E40A 1E6RA 1C8XA 4RE3A 3ZR5A 3UG5A 3DHUA 4DWSA 4EANA 2FH6A 3FN9A 1ISWA 1IZKA 2BXYA 5GNXA 1CYGA 2D0FA 2Y8KA 4HA3A 3AHZA 3ZT7A 1VIWA 5EMYA 2W91A 4W5UA 1JFHA 2XWEA 1GZJA 2ZX7A 1OD8A 3OIHA 3AIUA 1E3ZA 1J0IA 3W38A 1OT1A 2D22A 4KGJA 1ECEA 4IISA 1CGTA 2WCSA 3WL0A 1E5JA 1GHSA 5M17A 3W24A 1J18A 3T2QA 3SCQA 1BTCA 1JYNA 3W29A 4AD5A 5BROA 4AXNA 2DT1A 2WHJA 3B8SA 1V0LA 4U3CA 2UY5A 1QNQA 1E1EA 3PTKA 3PZQA 2DH2A 2GK1A 1BLIA 2J7FA 3WQVA 3WQ6A 1FH7A 4BA0A 1ISYA 1E6XM 4IPNB 1JZ2A 1KGWA 2VZOA 1HL8A 1TR1A 2ESCA 1K9EA 4W7UA 1TVNA 4JFUA 3ARZA 2VURA 4BCEA 1WKYA 1E15A 4N42A 1VAHA 2WSKA 1UH2A 2J8GA 7TAAA 3ZMRA 1V6YA 5CXPA 1UA7A 4HA4A 3RM9A 1J0ZA 3VIFA 3MMWA 5D8WA 1M03A 1ITCA 3WEMA 1ZS2A 3OB8A 5DFAA 1OGGA 4W8AA 2YA2A 4E2OA 2ZWZA 3AS0A 4V27A 3BLKA 1WZKA 1VJZA 2ZXQA 5HBFA 4JZ5A 3CHFA 4D6FA 1JZ3A 2XFFA 4W87A 2ZUUA 3GH5A 1VF8A 3BMVA 4AIOA 1V08A 3GNPA 4AISA 4FK9A 2E8YA 4R5EA 4CGTA 4YHEA 3U5YA 4AZ6A 3EYPA 1R86A 1E9LA 4QLLA 3OZPA 3SUTA 2XPKA 3CUIA 2WK2A 1EQPA 4P8XA 3ARQA 4D6IA 3A3HA 1BSIA 2CBUA 1E0XA 1L0PA 5A6JA 5JIWA 3CHDA 4TVUA 2YIHA 1HVQA 2CXGA 4NRRA 2YL8A 1BG9A 1NM9A 3VD4A 4HOWA 2WMHA 5GPRA 4WKAA 2D0HA 1CEOA 1X1NA 3AI0A 4UQBA 3VD5A 1R85A 3FY1A 4ATWA 2DIJA 3IAPA 4AD4A 3SUUA 1C92A 2VRKA 1LG1A 3W28A 3ARXA 1EXPA 1PX4A 3BH4A 1QI4A 4AZCB 1WAWA 4HZ6A 4P7RA 2BVYA 1TFVA 5CSYA 1AQHA 1KR1A 5E0CA 1J12A 2CKSA 1UKQA 2GDVA 3VM5A 3WDIA 1KBKA 1CXIA 1P6WA 1W1YA 4EAMA 3VNZA 5EBAA 1J0KA 1XC6A 3WDHA 5HXMA 2FH8A 3A4XA 3AMLA 4QCFA 4ACYA 2JF7A 5M03A 1PZ3A 3B9EA 1BG4A 5HDRA 3WF3A 1B31A 1JI2A 1AQMA 4LYQA 4LYRA 4WSJA 1XV8A 3AOFA 1JZ8A 3II1A 2VRJA 4HMEA 2J78A 1DWFM 3IJ7A 1H0GA 3THDA 3BAJA 4PBGA 1WB0A 4F9JA 4RE2A 2CPUA 4GQRA 2V3GA 3ARSA 3VM7A 1H49A 3RCNA 2JEQA 3VO0A 2E0PA 2EPOA 1LL7A 1VEMA 1WNOA 1DWIM 1KCKA 2VCBA 3WD4A 1UQYA 3UETA 2B31A 5HPCA 2VZUA 1UWUA 1VFOA 1VFUA 2A3AA 3BSHA 2JF6A 3GXMA 4AEFA 2AAAA 4UQDA 3VIPA 3UESA 1UD8A 3K1DA 3CZLA 5BRQA 2ZUTA 3SUVA 1C7SA 1FFRA 2G41A 1CLXA 4AW7A 2VZTA 3WKZA 2WM0A 1QBAA 1CPUA 1XH2A 3CUHA 2CBVA 2VR5A 3AIVA 2OWCA 3AISA 1FFQA 3GTNA 2ZIDA 4ACZA 4UOJA 2VJXA 1JYWA 4J3WA 2WCAA 3PZIA 4AIUA 1CGVA 2XM2A 3OG2A 3WDRA 3RPMA 4PMDA 3KE0A 3ZSTA 3NYDA 5CGMA 3BAXA 3GM8A 1DWJM 1Q6CA 1EHAA 2PWGA 1CGUA 4JFVA 4W93A 1VFFA 2C8NA 5I2UA 2C7FA 5EB8A 1O6IA 1R7AA 1VB9A 3VGDA 4Q7NA 2A3HA 4RL3A 5BXTA 4E4PA 1GOMA 1GJUA 2NT1A 2FGLA 2IUZA 3AS2A 3AZTA 1RP8A 2W61A 3WD2A 2WWCA 4PMUA 1NP0A 3SIMA 5LYRA 2HISA 2OSWA 1XRVA 1XSKA 3BXWA 5I5RA 4AD0A 1CDGA 1K9FA 2FHCA 2WKLA 5D4YA 3OLDA 2YL6A 4UFMA 3OLEA 3SURA 1D7FA 2DQXA 5I77A 2FHFA 3VX0A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4LYP A;  3VTR A;  4ZFM A;  5CSU A;  1H09 A;  3VKK A;  4BZY A;  3SCU A;  4TUF A;  2Y8V A;  4ZXL A;  3S2C A;  3N15 A;  3VPL A;  5F7U A;  5D9P A;  1CGX A;  1SMD A;  2A3B A;  2GFT A;  2ZXA A;  1J10 A;  1UZ4 A;  3POC A;  1HX0 A;  3AXX A;  4QP0 A;  3CUJ A;  4MNM A;  4M80 A;  1WDQ A;  1E6N A;  2WYS A;  3WDP P;  4OIF A;  4LXF A;  4TTG A;  2X2Y A;  3FND A;  4AZG A;  1CEC A;  4H41 A;  1HJW A;  1UH4 A;  1GUV A;  1MW1 A;  3BAY A;  3APG A;  3W27 A;  4ZXO A;  1W9B M;  4DWS B;  1E55 A;  4J3S A;  4AWE A;  1B30 A;  4AZB A;  3U7B A;  4K68 A;  2OSY A;  5BCA A;  5I0D A;  3CZG A;  1G01 A;  1OB0 A;  1V6W A;  4AIE A;  3QGV A;  1Q6G A;  3G6M A;  2WMK A;  4Z2J A;  1B3X A;  1C91 A;  4LQ1 A;  4MDP A;  4PMV A;  4BF7 A;  3BCF A;  4TTU A;  4YHG A;  1W1V A;  1GQL A;  3O9N A;  2VNC A;  2J7C A;  3BAI A;  3EMC A;  3RME A;  3WH7 A;  1UR2 A;  2TAA A;  2FHB A;  3L4V A;  1QNS A;  1CGW A;  1JF5 A;  2JEP A;  5A6L A;  2IXV A;  3F4V A;  1M04 A;  2OLH A;  4W5Z A;  5I78 A;  4OBS A;  5IFT A;  2OWW A;  1EHN A;  4PMN A;  3ECQ A;  2QHA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4LYP A;  3VTR A;  4ZFM A;  5CSU A;  1H09 A;  3VKK A;  4BZY A;  3SCU A;  4TUF A;  2Y8V A;  4ZXL A;  3S2C A;  3N15 A;  3VPL A;  5F7U A;  5D9P A;  1CGX A;  1SMD A;  2A3B A;  2GFT A;  2ZXA A;  1J10 A;  1UZ4 A;  3POC A;  1HX0 A;  3AXX A;  4QP0 A;  3CUJ A;  4MNM A;  4M80 A;  1WDQ A;  1E6N A;  2WYS A;  3WDP P;  4OIF A;  4LXF A;  4TTG A;  2X2Y A;  3FND A;  4AZG A;  1CEC A;  4H41 A;  1HJW A;  1UH4 A;  1GUV A;  1MW1 A;  3BAY A;  3APG A;  3W27 A;  4ZXO A;  1W9B M;  4DWS B;  1E55 A;  4J3S A;  4AWE A;  1B30 A;  4AZB A;  3U7B A;  4K68 A;  2OSY A;  5BCA A;  5I0D A;  3CZG A;  1G01 A;  1OB0 A;  1V6W A;  4AIE A;  3QGV A;  1Q6G A;  3G6M A;  2WMK A;  4Z2J A;  1B3X A;  1C91 A;  4LQ1 A;  4MDP A;  4PMV A;  4BF7 A;  3BCF A;  4TTU A;  4YHG A;  1W1V A;  1GQL A;  3O9N A;  2VNC A;  2J7C A;  3BAI A;  3EMC A;  3RME A;  3WH7 A;  1UR2 A;  2TAA A;  2FHB A;  3L4V A;  1QNS A;  1CGW A;  1JF5 A;  2JEP A;  5A6L A;  2IXV A;  3F4V A;  1M04 A;  2OLH A;  4W5Z A;  5I78 A;  4OBS A;  5IFT A;  2OWW A;  1EHN A;  4PMN A;  3ECQ A;  2QHA A; 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