1UR2A

Xylanase xyn10b mutant (e262s) from cellvibrio mixtus in complex with arabinofuranose alpha 1,3 linked to xylotriose
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
351
structure length
351
Chain Sequence
TGLKSAYKDNFLIGAALNATIASGADERLNTLIAKEFNSITPENCMKWGVLRDAQGQWNWKDADAFVAFGTKHNLHMVGHTLVWHSQIHDEVFKNADGSYISKAALQKKMEEHITTLAGRYKGKLAAWDVVNEAVGDDLKMRDSHWYKIMGDDFIYNAFTLANEVDPKAHLMYNDYNIERTGKREATVEMIERLQKRGMPIHGLGIQGHLGIDTPPIAEIEKSIIAFAKLGLRVHFTSLDVDVLPSVWELPVAEVSTRFEYKPERDPYTKGLPQEMQDKLAKRYEDLFKLFIKHSDKIDRATFWGVSDDASWLNGFPIPGRTNYPLLFDRKLQPKDAYFRLLDLKRLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Cellvibrio mixtus
publication title The Mechanisms by which Family 10 Glycoside Hydrolases Bind Decorated Substrates
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOXYLANASE
total genus 141
structure length 351
sequence length 351
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ur2A00
1E5NA 1GUVA 3U5UA 4D1JA 4BS0A 3VM7A 2WANA 4YHGA 3WL0A 1BQCA 2CBIA 4AEEA 1JI2A 2EXOA 1PX4A 3VX1A 5IHRA 4PMXA 1EHAA 2VUYA 5EFFA 3U7VA 4EAMA 1OGGA 3VIKA 1LQ0A 3VD5A 2Y2WA 2VJXA 3OZOA 1JF5A 3CMJA 3CZGA 2Z1SA 1IT0A 3AXIA 3VIJA 2YBTA 4YHEA 2JF6A 4QDMA 3MUZ1 4KGLA 1D3CA 3SUWA 4H41A 2WLZA 2X05A 1B3ZA 3IJ8A 1NM9A 1W1TA 2IXUA 1DWAM 2G3NA 4U33A 2XWEA 3OGRA 2BV9A 2XSBA 1M04A 3D3AA 3VD9A 2WSKA 2V3DA 2J62A 5LA0A 1CZ1A 5BXTA 4B9ZA 2QMJA 4FMVA 3IK2A 5HPCA 2PWHA 2QLYA 4J28A 5FOOA 2XPKA 5I2UA 1BSIA 4P8XA 1MFUA 2VC9A 4J3WA 2J25A 4LYPA 3NYDA 1C8XA 3MV11 2WB5A 3NSNA 3W4RA 1ZBWA 1C7SA 5A6AA 1K9TA 4E2OA 3JUGA 1HKMA 3K4AA 3WN6A 1LLOA 4HMEA 1CGXA 1XYFA 4PRWA 2DSWA 2BY1A 2XFYA 1WKYA 4MNLA 7A3HA 2D24A 1ZJAA 1FH8A 3ARQA 4J27A 2D22A 1NOWA 2AMGA 3AZSA 1GORA 2DEPA 2OYKA 3SCOA 4TVUA 3O9NA 4M56A 3SCWA 2GJXB 1WCGA 4U5KA 1C8QA 3VMOA 1ITCA 1CLVA 1CNVA 2VCBA 1NOUA 3RILA 4C7GA 4JHZA 2DGAA 1W1VA 3VDAA 2ZIDA 3F4VA 2E8YA 4H8HA 1CGWA 2BHZA 1OBAA 2OWCA 5GNYA 1FA2A 4AZHA 5M03A 4C7FA 3VDHA 2WKLA 1V3HA 1ZB5A 1KQYA 4MDOA 5JBDA 4AZBA 2CITA 3UR7A 1RPKA 1GVIA 3PZMA 1K6AA 2UY5A 2WHMA 4UQDA 3WD1A 2FHCA 2EPOA 4KH2A 4S3KA 4CVWA 4LGXA 2WC4A 2HISA 4LPCA 2WKGA 5BXSA 4PTWA 3B9DA 1E4NA 1ZBCA 3BCFA 2QMKA 3WENA 4TX8A 1EGZA 1TCMA 2YJQA 1UH2A 2VX7A 2XIIA 1MQRA 1UA7A 3UEQA 4W87A 3UERA 4R27A 1V0KA 1CYGA 2C7FA 2ZE0A 2VZTA 4DUXA 3WSUA 1LWJA 1E70M 1LG2A 2BXYA 3PHAA 3GXDA 4CCDA 1Q6DA 3RM8A 1BAGA 1W3LA 1ITXA 1G01A 4FLSA 2W5FA 3WQ5A 3BMVA 3L2LA 3SUSA 4UFLA 3VDCA 4E8DA 3VMPA 3AZRA 1VAHA 1Q4NX 2WHJA 2DSVA 3AS2A 4TX6A 4H8UA 2O9RA 2UY4A 1UKSA 1C93A 4UOQA 3ZSTA 2PWFA 4F9DA 1J01A 1V6VA 3BLKA 1I1XA 1PX3A 1HT6A 1LWHA 1Q6FA 2D0FA 1IZKA 3WQ6A 4OZOA 2GJPA 1H41A 4D6EA 2Y4SA 2NT1A 3CZJA 4UQEA 5CSUA 4CU8A 4PMUA 2XFRA 1UWTA 1GOWA 4AD0A 1KR0A 7CGTA 4W93A 4BQ4A 4PTMA 2YL6A 3WH9A 4MDPA 3M07A 4BZYA 4W7VA 1CENA 3FNDA 1W3HA 1V03A 2YL8A 4CN1A 1WZAA 1HJSA 1FP8A 2DH3A 4DWSB 5CPSA 3WH7A 1DWHM 1JFXA 1B2YA 3N1AA 2JF7A 1H09A 2JE8A 1R86A 4CCCA 2WC3A 6TAAA 3K46A 3VGFA 2ZICA 2FH6A 3VGEA 1HX0A 2PI6A 3FY1A 2FGZA 1OM0A 3ARZA 4AY1A 5GPRA 1AMYA 4DM1A 4ZE4A 2WWCA 2ZWYA 4W8AA 4GQQA 3L4YA 3NJ3A 3ARPA 1G1YA 1JXKA 3W28A 3A4WA 4JAWA 1E4MM 4GI9A 2WBGA 2E9MA 5A8QA 2VTFA 3MMDA 3VD3A 3S6TA 1V6WA 3CZ8A 1MFVA 3GM8A 3BGAA 1EOMA 2J75A 5FCZA 1VRXA 3WBEA 1C8YA 1RP8A 1V3JA 2VNCA 1ISXA 3SUTA 3KL0A 2W67A 1BG9A 3KL3A 3NSXA 2ZX9A 1MQQA 4XX6A 1OD8A 1W9XA 4GINA 2VX5A 1KXTA 3DECA 3VD4A 1CLXA 1XRVA 4MB1A 4M24A 2RGLA 1JYVA 1FHLA 1ZS2A 3CPUA 4D6FA 3W81A 1L8NA 5LA1A 4E8CA 5DO8A 1W2VA 4IPNB 1J0HA 3AI0A 3ZT5A 1K9EA 2WHKA 3BAWA 4MJ2A 4U5IA 4P7LA 1TUXA 1EO7A 2J79A 1V0MA 2OSYA 3EMCA 4GPNA 3BAJA 2G3JA 2E9BA 4AZ7A 3PZQA 1EXPA 5D8WA 1H1NA 4AZ6A 2YDQA 3RJYA 3G6MA 1C91A 4J3UA 3PZNA 4ZXOA 1UWIA 1WE5A 4PMZA 2BY3A 2WVTA 1C7TA 1PX8A 4CVUA 5BRQA 3WF3A 3WF4A 1HF6A 1QHPA 3SCSA 2J74A 2DT3A 1B0IA 1UD8A 4NSBA 3LPFA 1A3HA 5HDRA 4HMCA 2DH2A 2J7BA 1HNYA 5GQBA 3VNZA 2PB1A 1WPCA 9CGTA 1KBBA 2VCCA 3I3BA 5I0DA 5CLWA 3APGA 1QI4A 1F4AA 3EDEA 2VL4A 5C70A 2WC7A 1BHGA 1JF6A 3VPLA 1BYCA 3WQ8A 1G0CA 1E3XA 3GBDA 4HTYA 1V02E 3W37A 1E9LA 3M46A 3W25A 2QF8A 1OT2A 4JFSA 1UQYA 5D8ZA 2FH8A 1PJ9A 1E4IA 1US2A 4PTXA 5BROA 1E43A 3GH4A 4HA4A 1CEOA 1OB0A 5C8BB 1W32A 1W91A 1P6WA 2XSAA 4KGJA 3CZEA 1JIBA 4PMOA 1L0PA 4GIAA 2EPKX 3CUJA 3EDDA 1GOIA 4GKLA 3TONA 3N04A 3WMBA 3VIIA 1BYDA 4Z2JA 3BXWA 1LL6A 1Q6CA 1E6NA 2ZXDA 1PPIA 1W3KA 1J0YA 1QPKA 3VGDA 1H2JA 1G5AA 2VRJA 1TG7A 1V0LA 2BVDA 4UFKA 1V3MA 4CKQA 5CPTA 3GH5A 3WEOA 3DYMA 3UETA 3F5JA 3DYOA 5A8OA 3U7BA 1ODUA 4D1IA 4B3KA 5A2BA 1MW1A 1WB0A 2CBJA 3TOPA 2FDMA 1YQ2A 1JNDA 1F4HA 4WSJA 4HMDA 5BCAA 4AISA 2EPLX 3CHCA 3CHEA 4HOZA 2WBKA 3CH9A 2GK1A 3W27A 4AC1X 3AMGA 2OLHA 8A3HA 1MVYA 2JEQA 1J18A 3J7HA 2J78A 1E4LA 2WXDM 2NSXA 1UR0A 3SCNA 2IXVA 1OD0A 5ABFB 4E4PA 1UOKA 4LX4A 3UR8A 3ZM8A 4X0VA 2E0PA 2WMFA 1KBKA 2VX4A 5LYRA 2J7HA 3TTSA 1KFWA 2F8QA 4QLKA 2ESCA 3SURA 3BSHA 4AZIA 3VGHA 1GHRA 1JAKA 3OLIA 5I6SA 5I3DA 3PZGA 1JAEA 2XG9A 4ZE5A 3VO0A 1KB3A 2WPGA 4QLJA 5D9OA 4M80A 4MPKA 5A2AA 2C8NA 2YA1A 1UD5A 4Z2IA 2DDXA 4AIOA 4ZXLA 1LJYA 5E70A 4IM4A 4J3TA 1JZ4A 2VZVA 5C71A 4GZEA 3IAPA 4JZ5A 4NRSA 3SCRA 3I3EA 2Y5EA 2W92A 4CD4A 2YIHA 1HVXA 1VFMA 2XGBA 4U2YA 3QHOA 4PSPA 4JFTA 4W8BA 1HJVA 1KXVA 1E1EA 1FHDA 4Q7NA 4D6GA 5A6MA 1EQPA 3A6OA 1EIBA 2W61A 3WDPP 2BY2A 1NQ6A 5A6KA 1VBRA 1J11A 1MXGA 5A8NA 1ZU8A 2VX6A 2YBUA 1H4PA 1XSJA 4AW7A 3AZTA 2WW5A 1ISVA 3HMCA 3K8LA 2ZUNA 1GQJA 3PZ9A 2WAGA 3ZJ6A 4DWSC 1CWYA 1W9BM 3WEMA 1UZ1A 2WM0A 4LYQA 1GQIA 4H2CA 2D0GA 2J8FA 1H0IA 3L4TA 1QBAA 2A3EA 2CHOA 1QW9A 3VMNA 3GXFA 3QGVA 1Q6GA 5GNXA 1SMDA 3CO4A 4B9YA 4PSRA 1XSKA 5A1AA 3WIJA 4CCEA 3CZLA 2D1ZA 2X2YA 1JZ8A 1GCYA 4WSKA 4UQAA 3T08A 3A4AA 1J9YA 1UKQA 2PWGA 1HVQA 4AEFA 1K9FA 5EBAA 3WMCA 5CGMA 2O9TA 3WH5A 5I23A 3PN8A 4OUEA 5E0FA 2DQXA 1TVNA 3ZT7A 5A3HA 4GO9A 3WFLA 1VEPA 4DM2A 3D5HA 3W29A 1ISZA 1KQZA 4PMQA 1EDQA 4PMRA 3GDBA 1EDGA 1TVPA 5D9PA 2QPSA 1QI5A 4AYSA 3BSGA 5A8MA 4AXNA 3MV01 2F61A 1UD2A 2JEPA 4PBGA 3SIMA 1VEMA 1R8LA 4AZ5A 3RM9A 1DWIM 1GVYA 3PTKA 3UG4A 4U3CA 4HOXA 4XZBA 1ODZA 3PZOA 5HXMA 4AZCA 2B31A 2CKRA 2F2HA 4XZWA 1TA3B 1HKKA 2X0HA 1O7AA 3WY1A 1OT1A 4TVDA 1MQPA 3FN9A 1S46A 1PZ3A 4ACYA 1WZKA 5AY7A 2QV4A 1W3JA 4LYRA 1CGVA 2O92A 5E09A 1PIFA 4JL1A 2XGIA 4QCFA 3ARXA 3E1F1 1HJUA 3K1DA 4JFWA 1BFNA 2WSPA 2VRKA 3NDZA 4UCFA 1QNRA 2Q8XA 1VJSA 3RM4A 1GZJA 4XV0A 2XYLA 3CUFA 4UR9A 4TUFA 3CUHA 1M7XA 2BFGA 4ACZB 1PZ2A 1CTNA 2ZXBA 1HJWA 3L2MA 4FF5A 4W85A 4F9JA 3WNMA 3AIVA 1UQZA 1UR4A 1OWQA 4URIA 5CPQA 3POCA 1JG9A 4W86A 3SCUA 4NF7A 1EQCA 1VF8A 4YPJA 2VI0A 7TAAA 4P8UA 4MTVA 3LMYA 1B3VA 3AHVA 4NI3A 3WH8A 4TTUA 4ZEPA 3NDYA 3NUKA 3W0KA 3AS3A 2EO7A 1CXEA 4MAVA 2CPUA 3SUUA 5DT5A 4CUCA 4DUVA 2WVSA 3AQUA 1E55A 3ZR5A 3AHXA 4P8VA 3AIUA 2DT1A 1JZ5A 2A3BA 1Q6EA 4QCEA 1XSIA 1VFFA 3A47A 2GJRA 4PCTA 3CZKA 1UA3A 4RE4A 1WP6A 1GNXA 3OZPA 1PIGA 4V2XA 3UESA 1JDDA 2WMIA 5CG0A 3CBWA 3BCDA 5ABEA 2VZUA 3OLDA 4FLQA 3GZAA 1JDCA 1UYQA 3L4ZA 1AQ0A 3W6LA 1RP9A 2XM2A 3LPGA 4WKAA 2CKSA 2X0YA 3BC9A 2WVVA 3MKKA 1R7AA 1B3YA 3RJXA 1XD0A 4JKKA 4AD1A 2ZUVA 3L4WA 2X1IA 4RE3A 4QP0A 2PBGA 3RIKA 2D20A 3W82A 3WDRA 1QVBA 4HU0A 1GOQA 4AD5A 5AC4A 3LPPA 4M8UA 2W63A 5D9MA 5CGTA 3THDA 4MB4A 4MB5A 3F5KA 1CXHA 3K8MA 2J7GA 1KR1A 3T09A 4P7OA 2VQUA 2BXZA 3KL5A 1OCQA 1JDAA 6A3HA 3THCA 1JD9A 4H8VA 4PUDA 2CBVA 3MU7A 5A6SA 4X0NA 1MYRA 1B31A 2WNWA 3ZR6A 3GH7A 4D6IA 4V28A 1CXIA 2JIEA 5JIPA 4MAZA 4B15A 3VM5A 3UG3A 1E40A 3OGSA 3CLWA 1DWGM 1NOFA 4WF7A 3AS0A 1D2KA 2X8RA 1E73M 3ZO9A 3VIOA 4N42A 5M17A 5M3WA 1TFVA 3RO8A 2D3LA 3MO4A 3VTRA 1QNPA 5A8PA 3CHFA 2E8ZA 3EYPA 5BXRA 3TA9A 1BPLB 1UR8A 4V27A 4WLCA 1GQKA 1M53A 2O9PA 2WZIA 4QAWA 3IAQA 4CGTA 3II1A 3AROA 4W84A 1QI0A 4UZUA 1WDQA 5D9NA 4ATWA 4A3HA 1JL8A 1BF2A 2YA2A 4MNMA 2CETA 5ABHA 3VKKA 3VU2A 1E6ZA 1RD6A 1O6IA 1KWKA 4N0RA 4IISA 1KGXA 5A2CA 4AD3A 3OB8A 2BVTA 3GBEA 2V3EA 4J3VA 1I1WA 2CNCA 4TVCA 2YOCA 4JCMA 5EFDA 2GJXA 3ZJ7A 3U57A 1BG4A 4HPHA 2AOSA 1VIWA 3BLPX 3W26A 1HKIA 3FW6A 2ZUMA 4AWEA 1HKJA 1SFSA 4XB3A 2MANA 4M82A 4HOWA 3AIRA 4L4PA 4W7UA 1GOMA 1HP4A 2OWXA 4TOQA 5E6ZA 1J0ZA 3AHZA 1JYXA 1QNSA 3BAYA 3WDIA 3VX0A 4L4OA 1UR2A 1B90A 5AYBA 4UTFA 4Z2LA 4HZ6A 3FAWA 3BH4A 4Y7EA 2E9LA 2XVNA 3ALGA 1UD3A 2QPUA 2EPMX 2J7DA 1X6NA 1W9PA 2WHLA 3MUIA 3GTNA 4F79A 1GPFA 3GXIA 1VFOA 3FXYA 4X9YA 2XHYA 1HL8A 5BWFA 2VZSA 1FOBA 3WD3A 1TE1A 3KEHA 4D72A 4CD7A 1PBGA 3W38A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1E5N A;  1GUV A;  3U5U A;  4D1J A;  4BS0 A;  3VM7 A;  2WAN A;  4YHG A;  3WL0 A;  1BQC A;  2CBI A;  4AEE A;  1JI2 A;  2EXO A;  1PX4 A;  3VX1 A;  5IHR A;  4PMX A;  1EHA A;  2VUY A;  5EFF A;  3U7V A;  4EAM A;  1OGG A;  3VIK A;  1LQ0 A;  3VD5 A;  2Y2W A;  2VJX A;  3OZO A;  1JF5 A;  3CMJ A;  3CZG A;  2Z1S A;  1IT0 A;  3AXI A;  3VIJ A;  2YBT A;  4YHE A;  2JF6 A;  4QDM A;  3MUZ 1;  4KGL A;  1D3C A;  3SUW A;  4H41 A;  2WLZ A;  2X05 A;  1B3Z A;  3IJ8 A;  1NM9 A;  1W1T A;  2IXU A;  1DWA M;  2G3N A;  4U33 A;  2XWE A;  3OGR A;  2BV9 A;  2XSB A;  1M04 A;  3D3A A;  3VD9 A;  2WSK A;  2V3D A;  2J62 A;  5LA0 A;  1CZ1 A;  5BXT A;  4B9Z A;  2QMJ A;  4FMV A;  3IK2 A;  5HPC A;  2PWH A;  2QLY A;  4J28 A;  5FOO A;  2XPK A;  5I2U A;  1BSI A;  4P8X A;  1MFU A;  2VC9 A;  4J3W A;  2J25 A;  4LYP A;  3NYD A;  1C8X A;  3MV1 1;  2WB5 A;  3NSN A;  3W4R A;  1ZBW A;  1C7S A;  5A6A A;  1K9T A;  4E2O A;  3JUG A;  1HKM A;  3K4A A;  3WN6 A;  1LLO A;  4HME A;  1CGX A;  1XYF A;  4PRW A;  2DSW A;  2BY1 A;  2XFY A;  1WKY A;  4MNL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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