1UUO | Genus

Total Genus 133

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	133
sequence length	363
structure length	351
Chain Sequence	DDHFYAEYLMPGLQRLLDPESAHRLAVRVTSLGLLPQDSDMLEVKVLGHKFRNPVGIAAGFDKNGEAVDGLYKLGFGFVEVGSVTPQPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAQLTADGLPLGINLGKNKTSEDAAADYAEGVRTLGPLADYLVVNVSSPQGKTELRHLLSKVLQERDALKGTRKPAVLVKIAPDLTAQDKEDIASVARELGIDGLIVTNTTVSRPVGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRIPIIGVGGVSSGQDALEKIQAGASLVQLYTALIFLGPPVVVRVKRELEALLKERGFTTVTDAIGADHRR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Inhibitor Binding in a Class 2 Dihydroorotate Dehydrogenase Causes Variations in the Membrane-Associated N-Terminal Domain pubmed doi rcsb
molecule keywords	DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Rattus rattus
total genus	133
structure length	351
sequence length	363
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2004-01-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1uuoA00

5E0KA 3QMSA 3TXVA 1YXYA 3W83A 4EOUA 4BWLA 4PA8A 1AL8A 3LOTA 3U2OA 2XN0A 3W86A 1O4UA 4CQ8A 4ORMA 3BW4A 5CSSA 2Y6ZA 3S1WA 1AW5A 1W5OA 3SZ8A 3PULA 3ZR4A 1TCDA 1V7YA 4NUWA 5D05A 5HUPA 2E1DA 1GTEA 3RFAA 3W1QA 2V5LA 1N8FA 4N9EA 4ZL1A 1G69A 3S1VA 2ZA2A 3NVTA 1EIXA 1X8FA 2P10A 4FIRA 3ABSA 3TUUA 4Y96A 3P8IA 3SIZA 1QOPA 3MWAA 4ML9A 3DAQA 4RX0A 4OE7A 4WY0B 1H62A 3LHUA 3MHUA 2ZZ6A 3F03K 4IUOA 1TPB1 3NQAA 4A2SA 3W7RA 3HQ1A 2OMAA 2FPTA 3EX6A 2G96A 3MP3A 3N14A 3OA3A 3LXAA 5HR6A 5HQEA 4MZYA 4O4WA 5CGQA 4N4QA 4RK8A 4HNTA 2LLEA 4QAIA 3OVQA 3W87A 3PVFA 1TJRA 5DY3A 5AOUA 3BW2A 1XBYA 4UTLA 1WBJA 3BLIA 3IVUA 4FNUA 1DQXA 5C55A 2R94A 1JUBA 4Y6GA 4UR8A 3HBLA 3NQGA 1FCUA 2YPIA 5LGZA 3F1QA 1OFPA 5MHBA 3W7EA 1NF0A 2OJPA 5LGXA 3G3MA 1LORA 3SY5A 1W31A 3W72A 4XKYA 3NDOA 4LVDA 3TAKA 4RJEA 2C3ZA 5G1TA 4X3ZA 4PEKA 3C52A 4LV9A 3HMJG 1EP3A 3QSRA 1W8SA 4O19A 3SJ3A 3VNDA 2Y62A 1QO2A 1VLIA 3H55A 3HGJA 2W0UA 4LRSA 4M7TA 3G1FA 1VCFA 4TR9A 4JTKA 4HNNA 2ZFAA 5AYZA 4LUIA 1PCKA 3MHFA 1QO5A 1H1ZA 1GVRA 1RV8A 2G97A 3M1ZA 2V2DA 4O4VA 3CWOX 1P5BA 2BXVA 2X1SA 4NNCA 3O6DA 1XI3A 3NL3A 2QEZA 2D73A 3RU6A 5DBUA 3C8FA 4NJGA 1KM1A 5L6UA 1YDNA 1LYXA 4DO5A 1W5MA 1SU5A 4UFKA 4EVZA 1FCBA 1J5TA 2CZEA 5D02A 3S42A 3TMLA 3TX9A 1GEQA 4UTKA 5IBXA 5LNWA 2Z2UA 4DQWA 1P0NA 3NA8A 2QJHA 3LCWA 4H6KA 4MFEA 4X2RA 1VYSX 1K7FA 3G8EA 3CEUA 3TKFA 5K9DA 1ZY9A 4UFLA 2HSAA 5I3HA 3PSVA 1KM0A 2J24A 3N19B 3OEXA 4O1BA 3G0XA 5G2HA 4UFHA 4O15A 4K36A 1EEPA 3R2GA 5G5IA 3HO8A 3THAA 3KVLA 4E38A 4CNPA 4AHOA 1WA3A 2B7PA 3JS3A 3MI6A 5T26A 3A23A 3DXIA 4IX0A 1SFLA 4JTHA 4I7UA 2DU2A 4LS2A 4XZ9A 3DFPA 4NNAA 3W1AA 3W3OA 4RV8A 4FEZA 4K7YA 3PF3A 5DCEA 1TPDA 1LOQA 1VYPX 2V82A 1VLWA 1F76A 1VJIA 2DJXA 4O17A 4O11A 4WY0A 2GQAA 4FO4A 2V2HA 3UZ5A 4AF0B 2C0AA 1YLVA 3P74A 3NAVA 5LHEA 1JQVA 3LCFA 3DFNA 2E5DA 4U4MA 2CLOA 4LRTA 1FY6A 1TTPA 4DBDA 2A21A 5D03A 4UCGA 1JCLA 4NJIA 3RLVA 3PUDA 4KWVA 3NQVA 3SGZA 3PM6A 5U4NA 1L2UA 4BI5A 4JIQA 4AHQA 1YTEA 3W1PA 4YCPA 3HG5A 2WJZA 4K38A 5U7SA 1RPXA 3NQEA 4N4PA 3N73A 5LNSA 1W3IA 4XQ6A 4UTTC 2W79A 4M5PA 4AB4A 3P67A 3G1XA 5EL1A 3SSJA 1KFJA 3M5YA 3A9IA 1JCXA 1K7XA 2R14A 5I3GA 3E0IA 1QFEA 5J5DA 3MHGA 3GR8A 3NQ2A 2GJNA 4JTJA 2ZRYA 3EX2A 5BNKA 3OHIA 3PY2A 2YFOA 4NJJA 3NM1A 2OT0A 4UTJA 3WJZA 3T7VA 4BFAA 1G4SA 5K4XA 5H91A 4L4MA 5KZDA 3DZ1A 2NXHA 2QR6A 1XKYA 1LRNA 3LHWA 4K8HA 3TAOA 5BW6A 3PUEA 3HGOA 4KFPA 2ZZ3A 3W7GA 4AVFA 3LCXA 1KFLA 3IIZA 2ALDA 2Y61A 3GKAA 2DZSA 3WK1A 2EAWA 1QR7A 2BWGA 3M0ZA 1T8XA 4FX6M 3BLEA 3UPBA 3CT7A 2CFFA 4O28A 3N3MA 2DZXA 4GBUA 2E09A 4QQ3A 1VS1A 1DORA 2NWSA 4QITA 2CZFA 2BX7A 4B5NA 4M19A 1W54A 3TR2A 4A22A 5HWMA 5LKYA 5FEXA 3C2RA 4UUIA 1KM6A 1AL7A 2ZZ7A 1GJPA 1KV5A 3TFXA 3O16A 1Q6RA 2DZWA 1Z44A 5FESA 1LBMA 4DF2A 3L5MA 3ABRA 2ZDRA 3ZWTA 1I2OA 3NL2A 2Y70A 1TYGA 1JR1A 1UJPA 1K8YA 2PURA 3L21A 3HGSA 4NQ1A 4UFJA 3BK0A 3PG9A 4R53A 2ZBTA 3EX4A 5KITA 3FLUA 3LTPA 3S1XA 3UPWA 3USBA 1EP1A 1WOBA 1VR6A 2A4AA 1ZFJA 3MP5A 3TW7A 3PB2A 4LWWA 5L9FA 2NUYA 1TPH1 3H54A 5DELA 4ZQPA 4POCA 1FQ0A 4UC5A 2NXIA 3VCRA 4DO4A 2RHGA 3F4NA 1IF2A 3DFTA 1TV7A 2ZQ0A 3WK0A 3TQVA 1CX9A 4JX6A 5D30A 1I4NA 4O0KA 3O05A 4LW7A 4J9JA 3C4UA 4MY1A 4O57A 5DBTA 1PHWA 3B4UA 3HG4A 4AF0A 1T96A 1R2SA 3M5VA 5AC6A 1FWSA 3CU2A 4WOZA 3W2LA 5HULA 2QCMA 2B7QA 3T40A 1H1YA 5EA9A 1SPQA 2WNNA 3KX6A 1WX0A 3R13A 3TROA 3C2FA 3W75A 2J9XA 2QF7A 5KINA 4AH7A 3CPRA 3ABQA 1H7XA 3GAYA 3DFSA 3EB2A 1BTMA 2QUVA 5CPNA 2CLFA 3O07A 3NPUA 3IRDA 3G0UA 2ATMA 1MEIA 4FF7A 3UWQA 2OCZA 1IXQA 2FTPA 4A21A 4ZQRA 3GXTA 5F2IA 2Z1BA 1WYIA 3PAJA 5AC7A 1LCOA 4WUIA 3DFQA 5TBOA 1KTNA 2BTMA 1EX5A 4O16A 1I8JA 3N2XA 1MEWA 3TFCA 5LHFA 3TA6A 1LZOA 4NVTA 1TIMA 3THQA 1IIHA 4FNQA 1GWJA 3R5EA 4JR5A 1BKSA 4TU1A 4RLIA 1S5WA 2BSLA 1W37A 1K8ZA 4NJHA 4W9TA 1THFD 1GVSA 2QCLA 2ZRWA 3UY8A 2OX1A 2VFHA 1ME8A 4O53A 1IXOA 5FF3A 4AWSA 2DZVA 1FDZA 3CIXA 4IWWA 2QUTA 3TC6A 1ZAHA 1L6YA 1HO1A 1PV8A 4I7WA 3DU0A 5HUOA 1EB3A 3R89A 4IX2A 3N9RA 4JTFA 1AMKA 3GB6A 2TMDA 2V30A 3NM3A 5KZEA 3DI0A 5GVJA 2HMCA 3LCGA 1YPFA 2A5HA 1OFEA 1MZHA 4O12A 1W5PA 4LS1A 5EMUA 4LS0A 2NV2A 3DBPA 3GLCA 1M7PA 1DOSA 3HG3A 2NZLA 3L0GA 3DENA 4XUGA 3E12A 3MO7A 3MW7A 4BI6A 4O1AA 5FF2A 5HINA 3W2JA 4ADUA 1M5WA 2X16A 2V9DA 4CLMA 2QJGA 1FDYA 5LNVA 2YR1A 1ME9A 2WSRA 1OFBA 1S3HA 3W7MA 5K2ZA 3LXBA 3HPSA 3IGXA 1I2NA 3STEA 4FX8A 1HL2A 1QPOA 5AHLA 3YPIA 1D9EA 4D2JA 4O8RA 3L5LA 4MKNA 3VE9A 1OFRA 3NYZA 3ZWSA 3I7RA 3B06A 1PS9A 3FS2A 3W71A 1H5YA 3LRLA 2BLEA 4GC4A 5HR7A 1WQ5A 2YSWA 2FIQA 1TTQA 2OZ0A 4UMBA 3G1VA 3OG3A 4ICNA 3BG3A 3O06A 3HPXA 2J9YA 1R2RA 2JBMA 5D2WA 2WPBA 3ABOA 1YXCA 3P84A 1YDVA 2FB3A 3O1NA 3W7KA 3S5ZA 2C13A 1SW3A 1FXQA 3M5ZA 4ORIA 2XFWA 3W74A 3G22A 3SR7A 4A2RA 3HF3A 1IXNA 4PTNA 3RLUA 1H63A 1V5XA 4KWWA 2YYUA 1S5VA 2GPTA 1FWTA 1FWNA 3E96A 3ZFHA 2QJIA 1RQHA 2CLHA 4JX4A 4UFIA 3PC0A 3T78A 1UUMA 4QNEA 3TQ0A 1LDCA 3NEVA 2E6DA 2X1UA 3MUXA 4UTMA 3GVGA 1G6CA 2DZPA 4JEQA 1OFDA 4NNBA 1YYAA 4UMCA 3PBYA 1TTIA 3W73A 3KOFA 3W85A 2YX0A 3FYOA 2ZZ2A 1B9BA 2ISVA 5IBXC 4HSNA 4UXDA 5KTLA 3TDFA 3NO5A 2YXGA 2RFGA 3CC1A 4LOCA 1N55A 1BEUA 3W7QA 1H7WA 1W1ZA 3WJXA 1G67A 1TPUA 5CZ0A 2E77A 4UTWA 3CTLA 1ZCOA 1OHLA 4K39A 4GUJA 3LBMA 4H3DA 3EKZA 3RF9A 3W1UA 3P80A 1TV8A 4GUFA 2TRSA 2QCEA 3U8GA 4XBKA 4N6EA 3MJYA 1GVOA 5AC8A 4X9SA 3HG2A 1VHCA 2Q3OA 3S9YA 5AHNA 3BVJA 4JXCA 3OIXA 2YZRA 4ZQNA 1A5SA 3W7IA 1KBJA 4DEFA 1K7EA 1KFKA 4Z0SA 1QOQA 3QFEA 1Z41A 5K9CA 1C8VA 1VCVA 4WD0A 3VI2A 4DPQA 4Y9AA 3G18A 2TYSA 1TO3A 3CEPA 5D09A 5I3IA 5FF7A 3B0UX 2V5BA 1E51A 4FXRA 1TPWA 1DVJA 2NX1A 5DXYA 1OG0A 1XL9A 3OVRA 1CI1A 1JUKA 4PH6A 4O0ZA 4TX9A 1F2JA 3EXTA 2VENA 2ABBA 5C6MA 3HPZA 3S5NA 5D2YA 4H4IA 2C18A 5FI8A 1JCNA 4DBEA 1HUVA 2GVJA 2YW4A 5A5WA 5BMWA 3L9CA 2JKPA 2Z6JA 4JDBA 4LVFA 5G1YA 4O54A 4WXYA 1ZNNA 3O63A 3Q58A 3TU9A 1FWWA 3G1YA 2FJKA 1UASA 4Z08A 1J4EA 4JY9A 3W84A 4NX0A 2AGKA 1VHNA 4NXSA 4LTSA 3W76A 1H60A 3W7LA 3HOJA 3HJZA 4O52A 4XWUA 4DXVA 1ICPA 5FEZA 1OFQA 1DBTA 4Z1DA 5G4EA 3W2NA 2CLIA 1EUNA 2J9ZA 2PE4A 4DO6A 4MOZA 4HIBA 1IGSA 3T4CA 1KA9F 5I3KA 4CCDA 3LHYA 3PB0A 4HKPA 1BWKA 4P61A 3LRMA 3KRUA 1H7PA 2Z6IA 3FFSA 2C14A 4UNKA 1TTJA 1TPEA 1S5TA 1Y0EA 4IMFA 1T0OA 4RZ6A 5I3JA 2E6AA 3NPVA 5LZLA 3RNDA 2C15A 3KHJA 2C6QA 3W22A 4OQVA 4JNMA 1Z48A 2QUUA 3QMTA 1OYAA 4JTEA 1A5CA 5CSRA 4LVGA 3FKKA 3LTYA 4O1CA 4WXZA 1RVGA 2FLIA 3F4WA 4LUJA 2WKJA 5CZTA 3IGSA 1QDSA 4O10A 3S5OA 4WX2A 3G1HA 2QCDB 2WSYA 1EP2A 1RD5A 5F2MA 2Y7FA 3NZ1A 3ATZA 3S0CA 1GQNA 1H7OA 5D33A 1IXPA 4XTDA 3W70A 3QM3A 5DN1A 4GE8A 4QIUA 4UIOA 1WAUA 2NX3A 4PCFA 2DZTA 3L67A 3MMTA 4C1LA 3NOEA 4FHAA 2XN2A 4MLJA 1R2TA 4U28A 1KFCA 3C61A 3M43A 5D37A 3LRKA 4JN6A 5C2XA 5HWNA 3L0KA 1XM3A 1LOSA 4JS3A 1MXSA 3EXRA 1W56A 1G7UA 2VEMA 3QC3A 3LM7A 2ZRVA 1OVDA 3G1AA 4OBTA 3A5FA 2FPYA 1XDLA 4JDYA 3UXDA 4WQ6A 1FBAA 1KM5A 3IVSA 4P2VA 3W1XA 4OV9A 3LHVA 1NEYA 1TQXA 2E68A 3QW4B 2ABAA 1QPQA 3EWZA 1NFBA 3EWXA 1GYLA 4O18A 4BK9A 4UMAA 2X2GA 5EBUA 1B4KA 2ZZ5A 5FEWA 4NXKA 3LI0A 2EKCA 3TIMA 4JTSA 2P1FA 4MIMA 1A50A 1VC4A 4TO8A 4TMCA 2PC4A 4AHPA 1GTHA 1X6UA 2WOQA 3ANYA 5D2XA 3GNDA 4EF9A 4M6VA 3A21A 3NPWA 2E6YA 3TJLA 1KLZA 4JD4A 3T55A 3I7QA 3O8AA 5F1UA 3QPZA 3BGGA 3E9AA 5DCBA 4JTGA 1PE1A 5CPMA 3GR7A 3WJYA 3HIJA 4E0CA 2RH9A 5EYWA 2ZRXA 1LLZA 1AW2A 4WJEA 1I2PA 4O50A 3TV8A 3LB0A 1WV2A 5I3FA 3W23A 3IEBA 4C1KA 4NX5A 2VFGA 2NV1A 3U6WA 3N34A 3LV6A 4GRSA 1W5NA 4K6AA 1PCWA 1UUOA 1W3TA 5C54A 1GT8A 1JQXA 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1F74A 2KZHA 1Q45A 2FDSA 3NQFA 3GNNA 2JK2A 5CKSA 1LP6A 2FQIA 3CIWA 2A7PA 3VE7A 2J6XA 2CW6A 4JTUA 3V1PA 4G1KA 1YADA 4MFDA 3C2OA 4Z1BA 3W2UA 3DI1A 1G4EA 3CQ0A 3GXNA 3BG5A 3STGA 3NR0A 2W6RA 1YPIA 3QF0A 1M6JA 3VKJA 4MYAA 3UYCA 3NG3A 1R47A 2RDUA 3DKJA 4I7VA 1B57A 4N9DA 2CLMA 3Q2DA 3M47A 4XBSA 3LHTA 3LCHA 2GUUA 1R46A 7TIMA 2NWRA 1LM1A 1I2QA 3C0JA 3P5YA 4RZ4A 4CCEA 2A1YA 4UTWC 4MPQA 3FIGA 2ZCGA 1JVNA 4FB7A 4S1FA 1P1XA 1VYRA 1Q3NA 2NXGA 3B04A 4IMCA 4JX5A 1FCVA 1K02A 2CLLA 4A3UA 2ZRUA 4FNRA 1OJXA 4FIQA 4CNOA 3QQ1A 3GK0A 5E93A 1TPC1 2H6RA 2IQTA 2GOUA 1KTCA 1QAPA 3KAOA 2WV8A 2YDAA 3UWVA 3PSWA 1K8XA 3UWUA 1XUZA 2Q3RA 1GOXA 5AHIA 1Q6LA 4LT9A 3SGUA 4PL2A 3S1UA 1LRQA 1U5JA 3MYOA 1AW1A 3K30A 2HS8A 4JYFA 1G4TA 2JKAA 3CB8A 4CQAA 3W2KA 3TXZA 4UTHA 3M44A 2VEIA 4HHPA 3NXFA 2JKEA 3UQNA 2JGYA 2Y85A 3TMQA 1VZWA 1HG3A 1JCYA 1WDWA 4YCOA 3UD6A 1OX4A 2OT1A 3A22A 5BRBA 4WZHA 3SFKA 4NZFA 4Q4KA 3FYPA 3LXCA 1NAL1 3W1NA 2VELA 5DCDA 4ADSA 1C9DA 5K9XA 3EX1A 4CNNA 3BGJA 1B3OA 4FNTA 2X30A 4MUZA 4M7SA 3SI9A 3P82A 4ZQMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1UUOA

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