1UWIA

Crystal structure of mutated beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus, working at moderate temperature
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
489
structure length
489
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDLNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHNNAQKMGLKIARLNSEWSRQFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFIQNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYTAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTGKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSSLVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Comparative Study and Mutational Analysis of Distinctive Structural Elements of Hyperthermophilic Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 195
structure length 489
sequence length 489
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2004-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uwiA00
1KGWA 2XUCA 3THCA 3AMKA 4EAMA 5A8MA 4UQEA 5JIWA 1UD8A 5E70A 2XSBA 4EKJA 1NWRA 1U33A 2JIEA 3CBWA 3SCTA 4YHGA 4AIUA 1XRVA 2WNWA 3A4WA 2W91A 3POCA 3PTMA 1BF2A 4N42A 5DF0A 3VIFA 3L4YA 5A6LA 1LLOA 3W37A 4Z2GA 1ISYA 1QBBA 1US3A 1E55A 2WMGA 3WQ6A 4BQ4A 1SFSA 3MSGA 4W8BA 4GI9A 3PZTA 4AZHA 1PBGA 4H7VA 2WZIA 2YBTA 3GXIA 3WNOA 3WELA 4BQ5A 1V08A 4H8UA 2XSAA 1UYQA 2UY5A 3CMJA 3K8KA 1FFQA 1W3HA 1QI5A 2V3FA 4OOUA 2OWXA 4NRRA 3W6LA 1VIWA 3PZIA 4YPJA 2FGLA 1H11A 2Y2WA 1H0GA 2PWDA 1TE1A 2GJRA 3AHVA 1WDSA 2YDQA 3ARZA 5BXRA 1JL8A 4UTFA 1FHDA 1J0IA 3WF2A 3T0AA 3U57A 3WQ4A 4V27A 4JHZA 2A3AA 2O9OA 3EDEA 4CN6A 2CXGA 3WH5A 3BCDA 2XFFA 1ZU8A 1JZ4A 4H41A 3O2LA 3I3DA 1BYDA 1N82A 3ARYA 3TTQA 1H4PA 2EPMX 5HNNA 1W2VA 4UNIA 4AWEA 4S3JA 4AIEA 5ABFA 5AC4A 1VRXA 2XIBA 3TTOA 2YBUA 2AOSA 2V3GA 2VMFA 1VENA 3CHDA 3EMCA 1V6UA 1GPFA 1EH9A 1R7AA 4CU7A 5A6KA 5ABFB 5A6AA 1WDQA 2CEQA 4UFKA 4U3CA 1E4IA 3FY1A 1J0YA 4HOZA 2IXVA 3AIBA 4UQBA 1OSEA 2IUZA 2J7HA 3B9DA 2J78A 3T0BA 1J10A 3ARQA 2W92A 4MB3A 1RH9A 7TAAA 1QHOA 4FLSA 4PTXA 3WBAA 2VX5A 4J3VA 2WC3A 2ZUWA 3M7SA 4R27A 1HX0A 2ZXAA 3OIHA 2D3NA 2DQXA 4KRUA 4CD6A 4AMCA 2D20A 1ZS2A 2WYSA 1JDDA 3AMDA 1J0ZA 2J75A 4OBSA 2DEPA 3BAWA 2Z1SA 3W82A 1V02E 2DT1A 1BAGA 3DYMA 1UOKA 3WNPA 4QP0A 1PPIA 4ACYA 5JBDA 4XZWA 1M04A 1VFFA 3FHQA 1R8LA 4GO8A 1ISXA 1SMDA 3NCOA 4HZ7A 2YDSA 7CGTA 3WH9A 1HVQA 2E9BA 4FLRA 1TG7A 5A6BD 3AIRA 2VCBA 1V3KA 3B9AA 1GCYA 1KGXA 4ZENA 2J7FA 2CETA 2VCCA 5CJ5A 1XV8A 3WL1A 1EO7A 1FA2A 4LX4A 2J62A 2GJPA 1GNXA 3ZOAA 4Z2IA 4QLJA 2WAGA 2Y8KA 1W1VA 5ABHA 2PBGA 1K9FA 2D24A 2ZXQA 1B2YA 2VRKA 1R87A 5GNYA 3N04A 4HP5A 3MMWA 1JAEA 2O9RA 3CO4A 4GQRA 1V0NA 1DEDA 1QNRA 4P7QA 3MSDA 1W9UA 3QOKA 4P7OA 2JEQA 1KWKA 1WE5A 5ABGA 2OWWA 2G3IA 1M53A 2CHNA 2BHYA 5HOSA 3IJ7A 2E8ZA 2PWFA 5CGTA 3MMUA 4PSRA 2CPUA 4AD3A 2XVNA 3WDJA 3SCRA 4W7VA 4CVWA 1ITCA 3VGFA 4F66A 1HKIA 3WKZA 3BMVA 3MMDA 3F5KA 1UKOA 3N9KA 2EEXA 2WMIA 2FGZA 4UFJA 1FH9A 2VC9A 1MW1A 4UFLA 4J3UA 3MKKA 1KGUA 5A6JA 2Y5EA 3HMCA 1FH7A 4QCFA 1YQ2A 3CUHA 2YDRA 4WSKA 3U5UA 5EB8A 3ZJ6A 3EYPA 2BHUA 3VMOA 4M82A 2NSXA 4JZ5A 3VIHA 2E3ZA 4F9DA 5C70A 2EO7A 3LPGA 3OBAA 5FIPA 3EDJA 4A3YA 5BCAA 1K9EA 4QLKA 3N12A 2WKGA 4MB5A 3FXYA 1JDAA 1GQLA 1JYWA 2VOTA 3ARPA 3ZM8A 3BAYA 5LA0A 1CDGA 1CGWA 3RJYA 1VFUA 2EPKX 2XIIA 5HXMA 2WSPA 1UR1A 1C92A 4BQ3A 1OM0A 1JXKA 1ZB5A 2J7DA 1TUXA 3PZOA 1CTNA 3II1A 5A6SA 1QOXA 1U30A 3J7HA 1G94A 1VB9A 3AYRA 2ZXDA 1OT1A 2WVVA 3VMPA 5IXEA 1W1YA 2J4GA 4EANA 3NDYA 2ZX6A 3VGGA 2WKLA 4MDOA 4W7UA 1W3JA 5BRPA 2WVVB 3DHUA 4U33A 4JIEA 5A8QA 3A6OA 1Z32X 3VPLA 2G3MA 1V6WA 3GH4A 5JBFA 1EHNA 1UH4A 1CZ1A 2G3NA 1W3KA 2YL8A 2QPSA 1H09A 1D7FA 1MW0A 2PWEA 2C7FA 3NDZA 3ZT6A 1QNOA 2CESA 1EOKA 4OZOA 2XYLA 3AIQA 4FK9A 2X1IA 1H5VA 1DWGM 1UWUA 1EDQA 4HMEA 1W32A 6TAAA 2XHYA 1O7AA 1MQPA 5LA1A 3W0KA 3CUGA 3AFBA 2XWEA 3FHAA 4PMQA 4J3XA 2OYMA 2ZUUA 3SEPA 3VINA 3UCQA 1E6ZA 5I0DA 3WH6A 1CXHA 4H8VA 1J9YA 4OIFA 1B9ZA 4TTUA 1JF5A 3LPFA 1PX4A 1HL8A 1HXJA 1CWYA 2PWGA 2VVNA 3K8LA 3BGAA 1E1FA 4HTYA 3EDDA 1UWTA 1DWHM 2DDXA 4E2OA 3CZEA 2WK2A 3PTKA 2O9PA 4WKAA 4XZBA 3U5YA 1HP4A 2BNJA 3VILA 3WN6A 2A3HA 1BGAA 4AEFA 1NQ6A 1LQ0A 2BVTA 2OLHA 3GBEA 4Y7EA 4V28A 4P7RA 4JFUA 2ZUVA 1NOWA 5D9NA 1CECA 3TTYA 1K9TA 3WENA 3VIGA 4PMZA 1H41A 4GQQA 5CSYA 3ARWA 3KE0A 4PTMA 1E73M 1V0KA 2W5FA 4RE2A 5KEZA 1EOMA 1W2PA 3VMNA 1IZJA 3MUAA 1W9VA 4P7LA 4UFHA 3DC0A 3CZJA 1QW8A 2VL4A 5D8WA 3BH4A 4B3LA 5GNXA 1QW9A 3PTQA 2ZWYA 4D6DA 1PEZA 3L4TA 4TX8A 1RPKA 5A6BA 1TA3A 3WQ8A 4W7WA 1SR0A 1B1YA 1OBAA 3WUEA 4D72A 1UD4A 2ZE0A 2BY1A 4KGLA 2XM2A 1NOFA 3W28A 3NIYA 4AZCA 1JNEA 1TA3B 6A3HA 5AY7A 2A3BA 4PTWA 1DWJM 4F79A 3LMYA 1BVZA 4UCFA 3HU7A 1OCQA 2VRJA 2X0HA 1Q6CA 4NF7A 4D6JA 4MPKA 1GZJA 3U7BA 2BVDA 2XFRA 3L2MA 2EPOA 3WNKA 2VR5A 3F5JA 2MANA 4HZ8A 2XWDA 4W87A 2OYLA 3WMBA 1ESWA 5EMYA 2F2HA 4MAVA 1LG1A 3GNRA 3WY1A 1TVPA 1VEPA 4Z2LA 1MVYA 2WHKA 2W4XA 4MDPA 5C8BB 4QLLA 4JFSA 1CGTA 1K6AA 4M1RA 2CBVA 3AS1A 1E4LA 3ZO9A 3RILA 2XG9A 3AOFA 1MXGA 1R85A 3I3EA 1HKJA 2D0HA 2D1ZA 1JZ3A 3MS8A 3FW6A 4LYPA 3WUGA 4PMUA 1FH8A 4TX6A 1G01A 1YHTA 3RCNA 1HF6A 3TA9A 3LPPA 3WF0A 5M03A 2A3CA 4ACZA 4J28A 1M03A 1CNVA 2VQTA 4HA1A 1LWJA 1C8YA 3W53A 1P6WA 2JF6A 2BXYA 4L4OA 3PBGA 2GDUA 4JAWA 4JL1A 4ACZB 1KXQA 3IAPA 4AD5A 3NUKA 1JNDA 4TVCA 4R5EA 1CXKA 3SUVA 1JGIA 3BC9A 2WMFA 2ZICA 5CSUA 5E0CA 4PUDA 1NWTA 5CZKA 3SUWA 1XSKA 2ZWZA 4WLCA 4HU8A 2X05A 5D4YA 1UZ1A 2CBIA 1W9PA 5HBFA 1HT6A 3WDIA 3VGEA 1C8QA 3ZSSA 4FLQA 2J77A 4U31A 4KMQA 3SCUA 3SURA 3VVGA 3WQ5A 1OGBA 3VIMA 4X0VA 1KCLA 5CPQA 4URIA 4YN5A 2YLLA 4HMDA 2UY3A 2WWCA 4PEEA 5JIPA 2XM1A 1GQKA 4S3KA 3WNMA 2HVMA 1CIUA 4H8HA 1HL9A 3AXIA 3WUFA 1CEOA 2PBOA 2GVYA 1ODZA 2WANA 1W1PA 3AIWA 1DTUA 4F8XA 2DSWA 1DP0A 5I6SA 1PIGA 2Q8XA 4X0NA 5LYRA 3SCVA 1MW3A 3BAKA 3VGDA 3WIJA 4GIAA 5CXPA 3DYPA 1WCGA 4GZJA 1HJQA 4CUCA 3W38A 3RM8A 2EPNA 3IANA 4DM1A 4MTVA 4DUXA 4E8DA 5BYWA 5HPCA 3GYCA 3MV11 3GZAA 2XTKA 4CVUA 2FDMA 4M24A 2PWHA 4EK7A 3MU7A 3QOMA 3AYSA 1WDRA 4AD1A 4UZUA 1MXDA 4OJYA 4B9YA 1C93A 1X1NA 2J7EA 3CH9A 3VDHA 1JFXA 1OGGA 2PF0A 3L4VA 4KGJA 1JYNA 1OIMA 3AIUA 3K46A 3AS2A 1BVNP 6CGTA 3GM8A 3CGTA 1J0JA 3BAJA 4CD8A 4FMVA 4MADA 1DWFM 1JZ5A 4WSJA 3TP4A 4J3WA 1BYAA 3T09A 1M7XA 3RM4A 2VUYA 2DIEA 3AIEA 4GO9A 4D6CA 1E4NA 1X6LA 4JFWA 1GORA 3OA5A 4CD7A 5HPOA 1E72M 2WMKA 3ALFA 4IPNB 5D8ZA 5I78A 4HA3A 4IM4A 1UD6A 3WD2A 4AD0A 2C8NA 2CITA 3BAIA 3CZLA 4CU8A 3SIMA 3JUGA 3N17A 4A3HA 5A8OA 2XPKA 3VIJA 4ZEPA 1K9DA 5BXTA 1NOUA 1XYFA 4HPGA 4ATLA 3AICA 1CXFA 4AZIA 2D23A 1LL4A 1Q6DA 3M07A 1RP8A 3VO0A 4CN4A 2DGAA 1XH0A 1UD3A 1XCWA 1GOIA 1BTCA 1C90A 1GHRA 4QDMA 3SCNA 3GXMA 1EQCA 1VFMA 3MUY1 1A3HA 1VJSA 1BYCA 3AS0A 1BQCA 1LJYA 2BXZA 1RD6A 5ABEA 5M17A 3EBVA 5CG0A 3B9EA 2O92A 1JZ8A 1E5NA 3BMWA 1A47A 2YIHA 5A8NA 2WVSA 3CLWA 1D3CA 2ZX9A 4FF5A 1C7SA 4MNJA 3W25A 3F5LA 3VUPA 3W4RA 5F7UA 1MWOA 4CCDA 1J11A 4WKHA 1UKPA 2VX6A 2V38A 1Q6FA 3PN8A 5DT7A 1QI3A 3O6AA 3T2OA 3WH8A 4OUEA 3I3BA 4DWSD 4JHOA 3GXFA 4LYQA 2BVYA 1OT2A 1UUQA 2UY2A 2D0GA 2X0YA 1QBAA 4P8XA 1QHZA 3VU2A 4IPLA 1H0IA 3BSGA 4JKKA 4PTVA 3U7VA 1PZ3A 3VDBA 3OZOA 3WUBA 1X6NA 3GTNA 4GKLA 4KRTA 1V3HA 2Y24A 1S46A 3VM7A 3ZT5A 1BPLB 1J12A 2XVKA 2RGMA 1Q6EA 4BS0A 3W6MA 3ZR6A 5M3WA 3POHA 3AHXA 4CKQA 1UH3A 4JCMA 1IV8A 4AD4A 1GOWA 3WFLA 1HP5A 1KBBA 2WWDA 4AISA 1W9XA 1JI1A 3HJEA 3O9NA 3SUUA 1CBGA 2WHLA 2EPLX 1ISWA 4GI8A 4ZE5A 3SUTA 1ZBCA 3FAWA 4AEEA 1W91A 3SUSA 3WF4A 1WNOA 4F9JA 4TUFA 4GI6A 3FNDA 1U2YA 1E9LA 2QMKA 3DECA 1V6YA 2DSUA 4H04A 4ATDA 5FL0A 5FCZA 1KXVA 1KQYA 3KL3A 4GINA 3T08A 1BLIA 1IZKA 2Y4SA 1CENA 2DSZA 1NWSA 3WMSA 5FKYA 4KH2A 5EFDA 4MB1A 2XGIA 4MJ2A 2UWFA 2YA1A 1HJXA 1UR9A 3ARSA 1E0VA 5FOOA 2D2OA 4D6HA 1FFRA 2WCGA 1QI2A 3L4WA 2BS9A 1DWIM 1E0XA 1EXPA 1V3JA 2WMHA 5E09A 3AS3A 5A94A 3ECQA 3UEQA 5I23A 5HDRA 1DWAM 5BROA 3GDBA 3RIKA 4RE4A 1E6PA 3AROA 4M56A 2OWCA 1FP9A 4FLOA 3VX1A 3MO4A 4OKDA 4P8VA 1GOMA 5I79A 5DMYA 1E71M 2BHZA 2J7CA 4UQAA 1HNYA 1GHSA 2D22A 4PMDA 3UERA 4MB4A 4LQ1A 1E56A 2W63A 2YL6A 2WC7A 4K68A 3WD4A 1HKKA 1JXJA 4Q22A 4PRWA 3AXXA 1CLVA 4YHEA 3NSXA 2JE8A 2GUYA 5A8PA 4B3KA 4D71A 1OB0A 1E0WA 5JUVA 2OYKA 5IFTA 3A4AA 2AMGA 1B3WA 3WQVA 3VD9A 3ZSTA 4JFVA 1OD0A 2GK1A 2EQDA 1MQRA 1OD8A 1UKTA 1XCXA 4JKMA 4XB3A 2X09A 3UG5A 3W24A 1E43A 1V6XA 1JYXA 1UA7A 2GK1B 1E3XA 1XH1A 4PCSA 4XX6A 1J0KA 1Y7VA 2BV9A 3BLPX 1HJUA 1QPKA 1QI4A 1UG6A 2VURA 5A2BA 1PX3A 1ODUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1KGW A;  2XUC A;  3THC A;  3AMK A;  4EAM A;  5A8M A;  4UQE A;  5JIW A;  1UD8 A;  5E70 A;  2XSB A;  4EKJ A;  1NWR A;  1U33 A;  2JIE A;  3CBW A;  3SCT A;  4YHG A;  4AIU A;  1XRV A;  2WNW A;  3A4W A;  2W91 A;  3POC A;  3PTM A;  1BF2 A;  4N42 A;  5DF0 A;  3VIF A;  3L4Y A;  5A6L A;  1LLO A;  3W37 A;  4Z2G A;  1ISY A;  1QBB A;  1US3 A;  1E55 A;  2WMG A;  3WQ6 A;  4BQ4 A;  1SFS A;  3MSG A;  4W8B A;  4GI9 A;  3PZT A;  4AZH A;  1PBG A;  4H7V A;  2WZI A;  2YBT A;  3GXI A;  3WNO A;  3WEL A;  4BQ5 A;  1V08 A;  4H8U A;  2XSA A;  1UYQ A;  2UY5 A;  3CMJ A;  3K8K A;  1FFQ A;  1W3H A;  1QI5 A;  2V3F A;  4OOU A;  2OWX A;  4NRR A;  3W6L A;  1VIW A;  3PZI A;  4YPJ A;  2FGL A;  1H11 A;  2Y2W A;  1H0G A;  2PWD A;  1TE1 A;  2GJR A;  3AHV A;  1WDS A;  2YDQ A;  3ARZ A;  5BXR A;  1JL8 A;  4UTF A;  1FHD A;  1J0I A;  3WF2 A;  3T0A A;  3U57 A;  3WQ4 A;  4V27 A;  4JHZ A;  2A3A A;  2O9O A;  3EDE A;  4CN6 A;  2CXG A;  3WH5 A;  3BCD A;  2XFF A;  1ZU8 A;  1JZ4 A;  4H41 A;  3O2L A;  3I3D A;  1BYD A;  1N82 A;  3ARY A;  3TTQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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