1UWIA

Crystal structure of mutated beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus, working at moderate temperature
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
489
structure length
489
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDLNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHNNAQKMGLKIARLNSEWSRQFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFIQNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYTAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTGKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSSLVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus solfataricus
publication title Comparative Study and Mutational Analysis of Distinctive Structural Elements of Hyperthermophilic Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
total genus 195
structure length 489
sequence length 489
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2004-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uwiA00
2F61A 3CUFA 4R5EA 4CGTA 4GI6A 3VM5A 3T2OA 3VD4A 2C0HA 4E2OA 2BVTA 1EHAA 3K8LA 5LA2A 1TVPA 1E3ZA 1I75A 3QHNA 1VAHA 1GQLA 3MMWA 4PTXA 5CXPA 3NSMA 3OLEA 1MFVA 5ABEA 2J7HA 3IAQA 3ZR6A 1TMQA 4H04A 1XSJA 3WL0A 1E4NA 1R7OA 1E4IA 4P8XA 3CHDA 4AWEA 4WKHA 2JALA 2EJ1A 4XUYA 1BYDA 1JZ4A 3EDDA 1DTUA 5I3DA 1LF1A 2WKLA 3RMEA 3WBEA 4MJ2A 3ZM8A 4UZSA 4AD2A 4P7OA 1XH2A 3I3DA 4CN1A 3VIOA 2WLYA 1UH3A 4E8DA 3NCOA 4GZEA 3LPOA 1C8XA 2D3LA 2E8ZA 3PZMA 3CUIA 2VJXA 1LL6A 2ZXBA 1BSIA 4QLKA 4J7RA 3WKZA 5BXRA 1R85A 3M7SA 4HA1A 1VB9A 1HNYA 2EPMX 1E6RA 3CO4A 4MB3A 4KRUA 3CGTA 1BFNA 3UG4A 4NSBA 1UH2A 1XCXA 3U5UA 2ZXQA 2WBKA 5I77A 2PB1A 3HU7A 3U5YA 1GOIA 2Y8VA 2WMFA 2ZIDA 3OGSA 5I78A 3NDYA 2VX4A 3CBWA 2VCCA 3WN6A 3FHAA 1EH9A 2JIWA 4MNLA 4RE2A 2GVYA 4TVUA 1TG7A 1PPIA 1BYCA 1OWQA 4AW7A 4RE4A 1WZKA 2CBIA 2E3ZA 4XZWA 3MUY1 2ZUNA 4PBGA 1MW0A 1H49A 2VX5A 1HL9A 5A6MA 1GOOA 4GO8A 1JXKA 2XHYA 1J0HA 5M5DA 3GZAA 1E70M 2XVGA 4Z2KA 2XYLA 2BV9A 3A3HA 1UR1A 3SCPA 3TTQA 2VURA 1JI1A 1F4HA 1SMAA 3ARRA 3SCOA 2G3MA 5EFDA 4XV0A 1M04A 1Q6FA 2G41A 2XUCA 4EKJA 1JYWA 4GINA 3S6TA 3ZIZA 3MU7A 1QI5A 4MDPA 5EMYA 1VFUA 3VMNA 2BY3A 3WDJA 4ATDA 1JI2A 1V3MA 1JF5A 1NWUA 2OYKA 2ZUUA 4C7FA 1V6UA 1UR8A 3K8MA 2VQUA 3ARVA 1UD6A 4J27A 3WF0A 5I2UA 1Q6GA 2WHKA 4D72A 1EGZA 3W82A 1GQJA 2ZUSA 3WH5A 2QHAA 3AROA 4QDMA 4J3TA 2J79A 5HOSA 4XX6A 5AC4A 3MKKA 4HA4A 2X2YA 3L4XA 3AHVA 3E1F1 2VZTA 5IFPA 3AS2A 4NZCA 1CNVA 5CLTA 4ZFMA 1QHPA 3ZSTA 1MW3A 5D9NA 3UR8A 1W1YA 1LJYA 3G6MA 4JAWA 1GVYA 1KWGA 1W9UA 1LG1A 3K8KA 1NP0A 3DHPA 3K4DA 5JBEA 2XFYA 4DM2A 2YL6A 2WM0A 5CZKA 1QNQA 1AMYA 1UH4A 3F5JA 2D24A 3IANA 2VMFA 4HZ7A 3FN9A 4UQDA 3N9KA 5D8ZA 1FH7A 3DYMA 3POCA 3L2LA 1H3GA 1HJVA 3FXYA 3WF2A 1GHSA 3WQ4A 2WVTA 4PUEA 3B9DA 4CCEA 3CZ8A 1BGGA 3UESA 1UYQA 1KXTA 3WSUA 1V3KA 3IJ7A 4D6HA 3AZRA 3N13A 1V6VA 2XVPA 1H09A 3EMCA 4P8WA 1JZ6A 2B31A 2VOTA 3RJXA 3F5KA 1UG6A 2E9MA 4JCMA 3VDBA 1WKYA 5E09A 4TTGA 4BCEA 5IHRA 4AZ6A 1JDCA 2XPKA 1KBKA 3NSXA 3GBEA 1YHTA 1GONA 2X0HA 1HKKA 3BXWA 4M1RA 4ATWA 1EDQA 5M3WA 2VUYA 1CDGA 3BGAA 2J4GA 4PTVA 4URIA 2D0HA 4CD6A 2VRQA 1J0ZA 5DFAA 3WL1A 4MADA 1GOMA 1LQ0A 3TONA 4UZUA 1H1NA 4CU7A 2EQDA 3K1DA 4AZGA 4AIEA 2E9BA 3PTKA 1Q6DA 5I24A 3ZR5A 4D6CA 4WKFA 3A47A 4FF5A 2PWDA 4U3CA 2V3EA 1V6YA 4LXFA 3CMGA 2QMJA 4GZIA 4V28A 2NT1A 2VX7A 3WMSA 2D23A 2CKSA 1UR4A 1E6PA 5CPSA 3TTYA 3OLDA 1MXDA 2RGMA 4FLSA 2YLAA 4UCFA 3UG3A 2JFEX 3ARQA 1E6XM 3BAWA 5I5RA 1GZJA 5JUVA 5BRQA 2DSKA 3VVGA 1HJQA 4OIFA 1OD8A 4H8VA 2W67A 3G6LA 1XH1A 2E8YA 4FLRA 5LYRA 4W93A 1JGIA 1IZKA 3J7HA 2XIBA 1JAKA 1VEOA 2OLHA 2WYSA 3VNYA 4HMDA 1E6ZA 1QHZA 1XD1A 1E0WA 1EXPA 3OBAA 3GM8A 3BAYA 2WZEA 2YL9A 2XM1A 1C7TA 1V02A 3MSDA 3VD9A 1N82A 3RPMA 1KXVA 1OB0A 1OCQA 1SYTA 3PTMA 1FH9A 2YKKA 4M56A 2WAGA 3VIHA 3VD5A 2A3AA 1B9ZA 2A3HA 1B1YA 4HZ8A 2DSZA 3AI0A 3B9EA 3WQVA 5DT7A 2BXYA 1W1PA 1W2PA 4MB4A 1JFHA 3LPGA 1H5VA 4P7QA 1NOWA 2FHFA 4FLOA 5CJ5A 2GJXA 4GI8A 1DHKA 1HJSA 4NI3A 1PBGA 1TCMA 3EDEA 4UOQA 9CGTA 3IK2A 1QPKA 2W91A 1HVXA 2W62A 3THDA 4AC1X 2WB5A 1BTCA 3PZQA 2OWXA 1WDPA 3MV01 3NDZA 2CERA 4Z2LA 1VEMA 1JD7A 1JYXA 2PWEA 3PZ9A 1GORA 1W91A 1JFXA 3WY1A 4WKAA 1CGVA 1JZ2A 5I0DA 4V2XA 1V03A 4H7VA 2YL5A 4GZJA 3MMUA 3PHAA 3L2MA 4UOJA 1NH6A 3POHA 4E4PA 1ISZA 3TTSA 1ZBKA 1G5AA 1Y7VA 5HPOA 4UQEA 4WLCA 1GVIA 3ARYA 4H8HA 2JF7A 3KEHA 3KE0A 3BAJA 4D1IA 3EDFA 5GQBA 2WWDA 2DT0A 2FDMA 4PEEA 1JDDA 1W9BM 2QMKA 4UTFA 3WMCA 4NRSA 4HMEA 3CHCA 2WC3A 2OWCA 2DH3A 8A3HA 4MTVA 2XTKA 2HVMA 2WLZA 4YHGA 3RIKA 2BVYA 2PI6A 1QW8A 1KXQA 4GO9A 2YLLA 5BCAA 1CBGA 3AOFA 5E70A 5A1AA 1C3FA 1H0GA 1TFVA 3M6DA 1H0IA 1C8YA 1QBBA 1XSKA 3ZJ8A 3SCRA 3CLWA 4HPHA 3CZGA 2PC8A 3AYSA 1UA7A 1JDAA 1W1TA 1Z32X 2PWHA 2W61A 4PSPA 4YHEA 2CEQA 4AIUA 2G3NA 3IJ8A 1HP4A 2V3FA 1X6NA 3OIHA 1JD9A 4W8AA 1FP9A 3GXFA 4H2CA 1MQRA 3N1AA 3BAIA 5C71A 1E6NA 3BCFA 4QCEA 2J62A 3L4YA 4HOXA 3CHFA 1V0MA 1K9DA 3VGGA 4AEFA 1H2JA 1E0XA 1W9PA 4B16A 5E9AA 4MDOA 3GNPA 4F66A 1K9TA 4IPNB 4NF7A 3T0DA 1AQ0A 1RP8A 5ABHA 2O9OA 1J0JA 3U57A 3MANA 2WVVB 7TAAA 5FL1A 3WELA 1UWTA 4J3VA 2GDUA 3BH4A 3FW6A 2WMGA 1GOWA 3U7VA 1SMDA 3VPLA 3T09A 1UWIA 5FOOA 3QHMA 4L4PA 1UKTA 3QOMA 4MPKA 4IISA 3AXXA 2DIJA 1O7AA 1OT1A 1ODUA 1UD2A 2EO7A 3VDCA 1CIUA 1PIGA 2O9RA 1CXEA 5A6SA 4Z2JA 1UKQA 1HJXA 3AHXA 3ARSA 3QHOA 3NYDA 2J7GA 3QOKA 3BLPX 1VJZA 4W7VA 4GPNA 1OBAA 1Q6CA 3WUBA 3T08A 3UEQA 2F8QA 2PF0A 1WDSA 1E5NA 4KRTA 1V3IA 4MNKA 3AMLA 1ISXA 1CENA 4PN2A 1QI3A 2ZX9A 5A6LA 4OKDA 1E1FA 1HJWA 1UD8A 2Q8XA 2VI0A 1L8NA 2A3CA 3ZSSA 1E72M 8CGTA 2JIEA 2BVDA 4PTMA 1FA2A 3ECQA 2NW0A 3W0KA 4TXEA 4GIAA 3SEPA 3MV11 3N04A 4CVUA 2IXUA 4OOUA 3GYCA 2DH2A 2Z1KA 2JF6A 4LGXA 4CVWA 5A2AA 1XYFA 4BS0A 1NWTA 2WXDM 4TTUA 1KWKA 4CD5A 1NM9A 3GH4A 3PZVA 1NARA 5GNYA 4WF7A 2G3IA 3AIWA 1W2VA 4PTWA 4DUVA 1H41A 2CESA 4LX4A 4M8UA 3RM4A 3GDBA 4QAWA 1E6SM 1TR1A 4W87A 2WMJA 1E43A 2FHBA 1MWOA 1OIFA 1HIZA 1AQHA 1EIBA 4M81A 1KR0A 1B30A 1V3HA 3WQ6A 3VINA 2J7BA 3VOCA 3PZTA 3SCSA 4CN6A 2PBGA 5A2BA 2DSVA 5LA0A 1V0LA 4ML4A 4KGLA 3PZUA 5FL0A 3AS1A 2ZXAA 1W3JA 5F7UA 1J0KA 1UR9A 3N11A 2VNCA 4AD1A 2DT3A 3ARUA 1EQPA 2XGIA 3VO0A 4AZHA 1ZBCA 1EHNA 1LWHA 1QVBA 3WEOA 1VFOA 4H41A 2D22A 1KR1A 2E4TA 2ZXDA 4AD0A 3WMBA 1UHVA 2CBJA 3OA5A 4Q7NA 3CZEA 5BYWA 5A3HA 1ISVA 5BROA 3SCNA 5A69A 2VRJA 3WQWA 1LL7A 3VIKA 1R87A 3L4WA 3O2LA 3WDHA 4MB5A 2BY1A 3L4UA 5C8BB 4U2ZA 1LL4A 4B3LA 4ZE4A 3VDHA 1OD0A 1U30A 1C7SA 1CLXA 2BXZA 2WNWA 1KBBA 4D71A 5A8NA 1G9HA 4JKKA 1FHDA 2AMGA 2VX6A 2XIIA 5A2CA 3DC0A 1HVQA 1GQKA 2GK1A 1CPUA 1EO5A 4MB1A 2YA2A 5E0CA 3OZPA 4P8VA 1GNXA 3KZSA 4YPJA 4BF7A 4M24A 4AMCA 2CPUA 1DWGM 3EMZA 3ARTA 3W81A 3N18A 3TTOA 4XZBA 1FH8A 4JL2A 1GQIA 3HMCA 3JUGA 2J47A 4X0NA 3WEZA 5LA1A 3AIVA 1X6LA 1W3KA 2YBTA 3WIJA 5BWFA 1EDGA 1G94A 2ZICA 3AMDA 5CSUA 1AVAA 1WCGA 1QOXA 4GXPA 3RM8A 1BPLB 1JNDA 3AZSA 1D7FA 1FFRA 2E9LA 2YDSA 1PZ3A 5D8WA 1SR0A 2J7DA 5D9PA 3CZJA 2HISA 2WC4A 2Y8KA 1M7XA 3ALFA 3ZQ9A 4P7LA 2J78A 4B9ZA 2W5FA 1W1VA 1OIMA 4UFJA 4FLQA 1UWUA 2WMIA 3AIRA 1M53A 4XB3A 1EA9C 4LYQA 2WMIB 5CPTA 1KCKA 1JZ8A 1DEDA 3LPPA 5A94A 5IDIA 2XJ7A 1UUQA 1ZS2A 1CLVA 2D2OA 5D9MA 1VENA 4JFTA 4IM4A 1NWSA 4V27A 1HL8A 3BMWA 1H4PA 4F9DA 4DWSC 1B31A 4WSKA 1ITXA 1JNEA 4HA3A 3EMQA 3EYPA 4D6IA 1BF2A 2V38A 1XGZA 4E8CA 2ZX5A 1K6AA 1OGBA 4TVCA 3QGVA 4ACZA 3NUKA 5CLWA 3VIMA 1W3LA 4MNMA 1BQCA 3IJ9A 1BVZA 2XG9A 1V3LA 1HX0A 1GCYA 1HKJA 5JIPA 1KGXA 1XH0A 2QPSA 1MYRA 1QNSA 3BLKA 1EQCA 1C8QA 3VTRA 4LQ1A 1UWRA 4A3YA 7A3HA 4WK9A 4AZBA 4LPCA 3CUHA 3WF3A 4PMRA 3EDKA 4CKQA 2BHUA 3IAPA 5DO8A 1NWRA 2WSKA 3L4VA 3N12A 1KB3A 4N42A 3WD3A 5E6ZA 1RP9A 1K9FA 1DWIM 2O9TA 4ATLA 2WK2A 4HU8A 1GJUA 1IZJA 4DWSA 2WVUA 5A6BA 4Q22A 3GTNA 2IXVA 5M03A 1WB0A 4GQQA 1E56A 4OBRA 3OGRA 1YQ2A 5A95A 3T2QA 1BGAA 4QCFA 2YOCA 4MAZA 3GNRA 2QLYA 2Y24A 1ZJAA 3KL3A 5ECUA 1BYBA 1CXLA 1R8LA 3WDRA 2VZVA 2OWWA 3PZIA 2IUZA 5CGTA 2RGLA 1HT6A 1V0NA 1UZ1A 2V3GA 2FH6A 6A3HA 2JEQA 2XFRA 4EAMA 1E15A 4AIOA 1M01A 2J8FA 3RJYA 1E5JA 1C93A 4K68A 4UOZA 3SCQA 1CECA 2YDRA 1H11A 1JAEA 2X09A 3APGA 4QLLA 4IUGA 5AY7A 2WMHA 5ABGA 1WP6A 1GOKA 1VBRA 3VKKA 1XV8A 1JZ5A 3BC9A 4W5ZA 3W6MA 1B90A 3UETA 2ZUVA 5BXTA 3W26A 1WZMA 4UFIA 1L0PA 3VM7A 1PEZA 3WH7A 3A4XA 1MQQA 5ABFA 3UG5A 3CMJA 1DP0A 4AEEA 5JBDA 1G0CA 1QI4A 1W9VA 3GH7A 2BY2A 4AZ7A 1JZ3A 1B3VA 1E73M 5ABFB 3ZJ6A 1WDRA 4L4OA 2GJXB 3W4RA 5JBFA 1KGUA 3AIQA 2C8NA 1GJWA 4BQ2A 1ZBVA 4Z2HA 4P7RA 3ARWA 5A6JA 1PJ9A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2F61 A;  3CUF A;  4R5E A;  4CGT A;  4GI6 A;  3VM5 A;  3T2O A;  3VD4 A;  2C0H A;  4E2O A;  2BVT A;  1EHA A;  3K8L A;  5LA2 A;  1TVP A;  1E3Z A;  1I75 A;  3QHN A;  1VAH A;  1GQL A;  3MMW A;  4PTX A;  5CXP A;  3NSM A;  3OLE A;  1MFV A;  5ABE A;  2J7H A;  3IAQ A;  3ZR6 A;  1TMQ A;  4H04 A;  1XSJ A;  3WL0 A;  1E4N A;  1R7O A;  1E4I A;  4P8X A;  3CHD A;  4AWE A;  4WKH A;  2JAL A;  2EJ1 A;  4XUY A;  1BYD A;  1JZ4 A;  3EDD A;  1DTU A;  5I3D A;  1LF1 A;  2WKL A;  3RME A;  3WBE A;  4MJ2 A;  3ZM8 A;  4UZS A;  4AD2 A;  4P7O A;  1XH2 A;  3I3D A;  4CN1 A;  3VIO A;  2WLY A;  1UH3 A;  4E8D A;  3NCO A;  4GZE A;  3LPO A;  1C8X A;  2D3L A;  2E8Z A;  3PZM A;  3CUI A;  2VJX A;  1LL6 A;  2ZXB A;  1BSI A;  4QLK A;  4J7R A;  3WKZ A;  5BXR A;  1R85 A;  3M7S A;  4HA1 A;  1VB9 A;  1HNY A;  2EPM X;  1E6R A;  3CO4 A;  4MB3 A;  4KRU A;  3CGT A;  1BFN A;  3UG4 A;  4NSB A;  1UH2 A;  1XCX A;  3U5U A;  2ZXQ A;  2WBK A;  5I77 A;  2PB1 A;  3HU7 A;  3U5Y A;  1GOI A;  2Y8V A;  2WMF A;  2ZID A;  3OGS A;  5I78 A;  3NDY A;  2VX4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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