1UWIA

Crystal structure of mutated beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus, working at moderate temperature
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
489
structure length
489
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDLNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHNNAQKMGLKIARLNSEWSRQFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFIQNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYTAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTGKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSSLVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Comparative Study and Mutational Analysis of Distinctive Structural Elements of Hyperthermophilic Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 195
structure length 489
sequence length 489
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2004-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uwiA00
3MMWA 1LQ0A 3RPMA 4OIFA 4H2CA 3WDHA 3PZNA 3A4AA 4D6HA 1IZJA 1UOKA 1W9VA 2VNCA 3VVGA 5FD0A 2J74A 4BQ3A 3UG5A 4UQ9A 1KR1A 2G8ZA 3ZT5A 3NYDA 3K8MA 2A3BA 2PWFA 1BHGA 3BAJA 2ZICA 1J0KA 3VDCA 3BMVA 1JAKA 2FHBA 2V3EA 1E1FA 1S46A 2Z1SA 2XM1A 3WEOA 4BQ2A 3WF3A 1BGAA 5DT7A 4UTFA 4FMVA 1UD2A 4ATLA 1FOBA 1ZB5A 1R7AA 1ZBWA 4M29A 2WVSA 1WB0A 3WEZA 2VTFA 3CO4A 5A2BA 2BVYA 5KZ6A 4BS0A 1FH7A 5CGTA 3GXDA 4D72A 3WELA 2MANA 5A6MA 3IK2A 3APGA 2JEPA 1E3XA 1VFUA 3SCWA 1B9ZA 1AMYA 5E9AA 4AWEA 5KEZA 3PZVA 2X09A 2WMKA 3KWXA 1PEZA 5D9PA 1J10A 5DEZA 2YA2A 2GJXA 1CECA 1HKJA 4JFVA 4TVCA 4AC1X 2XYLA 2CHNA 2ZX7A 4W7UA 2VZSA 1CLVA 1UKTA 1J0IA 1FH9A 3WNOA 1UD3A 4GZJA 1AQ0A 4CGTA 1HL8A 3GYCA 1GJWA 3AYRA 3VM5A 3T0AA 2D24A 1MYRA 4ZENA 1ODZA 4U33A 3AZTA 2PC8A 3WBEA 2BFGA 3LPPA 4GO9A 3VX0A 2BY0A 2PF0A 3OG2A 3QOMA 3QHOA 3OA5A 3VIJA 5ABGA 2XSBA 3WQWA 2UY3A 4V28A 2AOSA 3OBAA 5ABFB 3AHZA 2YA1A 3L4UA 3AHVA 1VBRA 1J9YA 1LG1A 4HZ7A 1O7AA 2GJPA 1TVNA 4UOQA 2CBJA 1HP5A 5CSYA 4P8XA 2VZTA 3I3DA 4P7LA 2W66A 2OSYA 4XX6A 1I1XA 5AYIA 3WNKA 2J7EA 4WSKA 4OUEA 5A6SA 1J11A 1F4AA 1HJQA 2EJ1A 2J8FA 1AVAA 3AYSA 2DSUA 3MUZ1 2J62A 4HMEA 1GW1A 2WVVA 3WDJA 3VIGA 1KXTA 3RJXA 2DGAA 1GHRA 3ZM8A 1UHVA 2G3IA 2ZXBA 4W85A 2XFFA 1DEDA 5CLTA 1Q4NX 2WSPA 3AHYA 3EDKA 2J25A 4QDMA 3ZO9A 3II1A 3CUGA 1JDCA 4CD4A 1XYZA 5DF0A 2ZWYA 4U31A 1DWAM 1FHLA 1BYDA 3WL0A 1US3A 1E6XM 2OWXA 4HMDA 4LYPA 1KCKA 5I3DA 1JYNA 1FFRA 3WMCA 5FOOA 1LL7A 4CN4A 1H1NA 3M46A 4AZCA 3GM8A 1E4NA 1BPLB 3WF2A 4OOZA 5ABEA 1GPFA 1HVXA 3VD3A 2ZUWA 3CUIA 4UZUA 6TAAA 1DWJM 1CGTA 1GHSA 1V08A 1FFQA 4MB4A 2WMIA 4D6JA 1PPIA 1FH8A 5DO8A 1VEOA 1OCQA 2WMFA 2XJ7A 1C90A 3MUAA 5HNNA 3SCOA 3W53A 4H8HA 1SMAA 2GK1A 4LXFA 5A3HA 1HJWA 2EQDA 4UFMA 3VNZA 5E6ZA 1Q6GA 2BY1A 2CETA 2XSAA 3LMYA 1UA3A 3VX1A 2E3ZA 5E0CA 4UFHA 2Y5EA 3WEMA 5AYBA 1UD5A 1PAMA 3KZSA 5I2UA 1MFUA 2W61A 1KFWA 1C8XA 3JUGA 5JUVA 3OGVA 2YA0A 3WKZA 2NW0A 2X0HA 1E43A 2OLHA 4PSRA 3AJ7A 1BGGA 4FF5A 3EDJA 2VX7A 5HOSA 5TD4A 2J79A 7CGTA 1JD7A 4W88A 3KEHA 3OLIA 4GIAA 2ZX6A 1JAEA 1CXLA 1JFXA 1KGUA 1UWIA 1X6NA 3SUVA 3VMNA 1K9TA 3NCOA 3AS1A 2YIHA 1M7XA 1QVBA 3BXWA 1GVIA 3L4TA 1NWTA 3D3AA 4TX6A 4HA4A 4CU6A 3BAYA 5JIPA 3WQ4A 1JF6A 3L4VA 1WKYA 3N15A 4UQAA 3L4ZA 2QPUA 4PMQA 1W2PA 2D0FA 3VM7A 1JZ7A 2Y8VA 1UKOA 3VIPA 3AZRA 3SCNA 2OWWA 3GH4A 3T0DA 1W9PA 4UQEA 1L8NA 1V3LA 1QBBA 4HZ8A 3T08A 3WDIA 3ZJ7A 4IPLA 1R85A 1V6UA 1LL4A 4MDOA 2ZUUA 3WQ8A 1Y7VA 1GOMA 3WNMA 3PHAA 1ISXA 1L0PA 3A4XA 4EANA 1UWUA 2CKSA 2QLYA 5ABHA 3CMJA 3WNLA 3VIOA 3T2OA 3VD4A 3ARZA 3L4YA 3CUFA 3PN8A 3T09A 3MUY1 3MSGA 3WUBA 4HOXA 4LX4A 4QFUA 5AC4A 4CD8A 4CVWA 4MADA 5JBEA 1KXQA 2EPLX 2BY2A 3A4WA 1MXDA 1JXKA 4PSPA 3WNNA 3CHFA 2WKLA 1K9EA 2ZUNA 5HBFA 3RM9A 5FCZA 4WJXA 2ESCA 3SUSA 1GONA 1CYGA 1WO2A 2DEPA 1HJXA 1NWRA 3W28A 4TVDA 5EFDA 3CZKA 2JFEX 2VR5A 3TTOA 2D2OA 3T0BA 1XYFA 3E1F1 4EE9A 1PX3A 1EDGA 1WPCA 4PYSA 4P7OA 5EFFA 1MQRA 4UOJA 5BROA 1QOXA 3CPUA 5FKYA 5A8QA 2VT0A 4C7DA 1J12A 4EKJA 1KXVA 2VVNA 4U2YA 4CUCA 2BXYA 1XCXA 1JZ6A 3NIYA 2BY3A 4S3KA 1KBKA 3N9KA 5HPOA 3GH5A 4M82A 4U3AA 2VURA 3AIWA 2FH6A 1UZ1A 1R7OA 3VKKA 1TE1A 4J27A 4QLLA 3VGFA 4HA3A 4UCFA 3THDA 4J3SA 4W7WA 3VIHA 1C8QA 2WLYA 2WHKA 2OSXA 1VRXA 1SYTA 2E0PA 2X0YA 1OSEA 5E09A 4PMNA 3ECQA 4BZYA 2VUYA 4F66A 1TA3B 1JNEA 1E1EA 1V0NA 5A6BA 1G1YA 1YQ2A 4H8UA 5I78A 4WK9A 4P7NA 4H41A 3OLGA 4E2OA 4CU7A 1CGWA 3W26A 1RD6A 1XSIA 4CD6A 4JHZA 2ZXAA 3GNRA 2BXZA 1ISWA 1R86A 3ZJKA 5D4YA 3TONA 1ZJAA 1OM0A 4A3HA 3A3HA 1GQKA 4OOUA 1JXJA 1W9BM 3U5UA 4WKFA 3NUKA 2WW5A 2A3AA 2YOCA 4D1JA 2GDUA 2XG9A 4E8DA 5IXEA 2O92A 1M53A 1V02A 4M56A 4CN6A 3RO8A 4ATWA 4RL3A 1J01A 2XVGA 1W9XA 3PZUA 1G94A 4E4PA 2YLLA 3PZTA 4TTUA 2ZUVA 1UKSA 3PBGA 1QNRA 1K9DA 3WD2A 3WD4A 1MXGA 4UOZA 5D8ZA 3CIVA 3WDQA 1Q6CA 1OB0A 4HPHA 2J7HA 4PUEA 1V3JA 2DSVA 2ZX5A 4U5IA 1RP8A 1BF2A 4J3UA 1NWUA 2D3NA 2Y4SA 3I3EA 5DT5A 1TVPA 5JIWA 2VOTA 2PI6A 1CDGA 4ZXLA 2CXGA 2BVDA 2FH8A 2YDRA 3SUUA 4NRSA 2WCGA 1JYXA 2IUZA 4FK9A 1XC6A 5M3WA 4AEEA 1W32A 4U5KA 4D6CA 2G41A 3RCNA 3ARPA 4UFLA 3CGTA 4JL2A 1KR0A 1B3VA 2F8QA 2CERA 2V38A 4MNJA 1OIFA 1JZ8A 4F8XA 1W9UA 2GJRA 2WWDA 3CTTA 4X0VA 3ARXA 1WDQA 3J7HA 4WKHA 3VOCA 5A2CA 2JE8A 4AIOA 3NSXA 1D7FA 1EOMA 3FW6A 4PMYA 3BH4A 5GNYA 1WZAA 5DFAA 5CLWA 1A3HA 3UETA 1V0MA 2CHOA 1E72M 2W63A 2V3DA 5I5RA 1ZS2A 4JHOA 1CWYA 1CZ1A 4J3XA 1MW3A 4AIUA 2J47A 1UR0A 4CN1A 2XVLA 5BXSA 4DWSD 1JYVA 3WH7A 3W82A 3NJ3A 2GVYA 4HU8A 2XVPA 4OKDA 3IJ7A 3O2LA 4CVUA 5LA2A 4QAWA 4MJ2A 1JG9A 3VUPA 4BA0A 1X6LA 3N04A 2GUYA 4MNLA 5I24A 3AIUA 2GJXB 1KGWA 2D20A 3A47A 5A6LA 2VX4A 1VENA 3QGVA 2Y24A 1B3YA 3TTSA 4W93A 1LF1A 3AZSA 5CG0A 1E56A 2OYMA 4AMCA 1E0WA 1JZ5A 5BCAA 3AXIA 2NSXA 4KRTA 3WFZA 3SCPA 1CIUA 1JDDA 4JL1A 1JNDA 4Y7EA 3B9AA 4JCLA 3IANA 1B90A 1QHZA 5I77A 1J18A 1XH2A 2A3HA 3N1AA 3WNPA 3L4WA 3SEPA 3U5YA 2PWGA 1TUXA 1W3LA 3OLDA 1JF5A 1GOOA 1MW0A 3W6MA 3HJEA 3CH9A 4IUGA 4RE4A 3ZR5A 3BAIA 3RIKA 3AFBA 1RH9A 4V27A 1QI4A 1G9HA 2DSWA 5F7UA 1KBBA 3WBAA 2ZE0A 3WDPP 4MJ4A 3MU7A 3VIFA 1XRVA 1B3WA 1DWGM 3AROA 5D8WA 1E73M 2EPNA 1MFVA 1C3FA 2QF8A 4UR9A 1OGBA 3VMOA 2XWDA 2WVVB 3WH6A 4PMRA 3ARVA 2D0GA 4QP0A 4HZ6A 4B16A 1SMDA 3W29A 4H8VA 4FLQA 4XV0A 3OLEA 1GVYA 2O9PA 3SCRA 2CPUA 4BQ4A 2W62A 3ZQ9A 1IZKA 5GPRA 1GOIA 3OGSA 4GZIA 2PWHA 1MW2A 1QNPA 2BHZA 1V6VA 4ZEPA 3UG3A 2V5DA 4L4OA 2VMFA 3ZIZA 1OBAA 3FNDA 4P8VA 4AD4A 4NF7A 1E6ZA 1XSKA 4Z2HA 2YLAA 2DIEA 3RM4A 4AZCB 1CPUA 3SCTA 4BQ5A 1C7TA 3BMWA 2XFYA 2XVKA 2UY4A 1UYQA 1C8YA 4N42A 6CGTA 3AQUA 3EBVA 1B31A 2WWCA 3ARRA 4OBRA 4KGJA 4Q7NA 3MV11 3AOFA 3DC0A 5A8NA 2WYSA 2PWEA 3G6MA 4J7RA 1E9LA 2WMIB 3WD3A 3GBEA 4HOWA 4J3TA 5CSUA 3F5KA 2J8GA 2WSKA 3AMCA 3S6TA 4KRUA 1ZBKA 1GNXA 4AD1A 2XUCA 4F79A 1ISZA 2PBOA 1LWJA 2EXOA 2Z1KA 4LYRA 1UR8A 2GK1B 1XHGA 5CPTA 4NSBA 4W87A 5CGMA 2WKGA 1X1NA 1E40A 1GQIA 2CBVA 2WC4A 1GOKA 2E9LA 1ODUA 4QLKA 1GZJA 3PZQA 2X2YA 5I6SA 3B9EA 1PX4A 3BCFA 3VDBA 1M04A 1UKQA 4B3KA 4AW7A 1JZ3A 3MMUA 4Z2KA 1V03A 4UFJA 5E6YA 2E9BA 4RE3A 3OGRA 3F4VA 3PZOA 4MAVA 2XIBA 1UWSA 5AC5A 3MANA 3EDDA 1CGUA 3WSUA 2J77A 2DIJA 2YBTA 4D6EA 1DP0A 3RMEA 5AY7A 1Q6DA 4YN5A 1OT1A 2VC9A 3VGHA 3KE0A 3QHNA 2HISA 4MNMA 5BXTA 3PZGA 1P6WA 2WANA 1UWRA 4OBSA 5D9NA 3MO4A 4MB1A 2W67A 2B31A 1WP6A 3RDKA 3WMBA 4HP5A 3N13A 4IM4A 3T2QA 1BYCA 5CPQA 4IISA 3VIKA 1C92A 2EPKX 1DWFM 2D23A 4P7QA 1XGZA 2G4FA 2GFTA 4M24A 3W27A 3VGGA 2PBGA 3DYOA 4W5UA 1QHOA 4GKLA 1VEMA 1DTUA 4E8CA 2WHJA 1JFHA 2ZOXA 3AIBA 4W8AA 4F9DA 3W24A 5A94A 1ZL1A 1PIGA 2QV4A 1CLXA 1E6NA 4EK7A 1GOQA 4AD2A 3M7SA 2DDXA 2WMHA 4URIA 4ACZA 4WLCA 3UEQA 2C7FA 3MUIA 3AXHA 3AS3A 1E3ZA 1G0CA 1QNSA 1VFFA 3BC9A 3GTNA 3RILA 3ZSTA 4CCCA 1C7SA 1B3XA 2J75A 3WN6A 4JKMA 2HVMA 1HF6A 3EMZA 2V3GA 1NP2A 3AIRA 3GBDA 1H49A 1CXIA 3AXXA 4FLOA 3ZOAA 1OT2A 1E0XA 5C70A 1ESWA 2J7GA 2JIWA 2OSWA 4AZGA 2VL4A 4A4AA 3DYMA 3PZ9A 1BAGA 2CESA 1GOWA 1D3CA 3FY1A 3WF0A 5JBDA 1XV8A 2WZHA 4LGXA 1W91A 4D6FA 1HKKA 1VAHA 3EYPA 3F5JA 4HPGA 1E6SM 4R5EA 3VGEA 1HNYA 1U33A 2WVTA 2YL8A 3GXFA 1Z32X 3WQ6A 1QI5A 2J78A 1EO7A 1UR4A 1H11A 4YHEA 2WZIA 1BVZA 1KWGA 3NDYA 4QLJA 3PTQA 1G5AA 4JFWA 2DH2A 1W1YA 1OGSA 1E6RA 2C0HA 1UR9A 5M17A 1E4IA 1XD1A 3AS0A 3THCA 3EDEA 1LJYA 3EDFA 4PMVA 1FA2A 1WCGA 2UY2A 1PX8A 1KWKA 2VVSA 3N17A 4W8LA 1V6WA 3CBWA 3VPLA 1CXHA 2WC7A 3WUEA 3CHCA 1QNQA 2W5FA 4PBGA 1OD0A 3TP4A 3WQ5A 2XVNA 3ZT6A 1JGIA 1KXHA 1H0IA 1VJSA 4TOQA 1GQJA 3VD7A 2ZX9A 1NOWA 5IFTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3MMW A;  1LQ0 A;  3RPM A;  4OIF A;  4H2C A;  3WDH A;  3PZN A;  3A4A A;  4D6H A;  1IZJ A;  1UOK A;  1W9V A;  2VNC A;  3VVG A;  5FD0 A;  2J74 A;  4BQ3 A;  3UG5 A;  4UQ9 A;  1KR1 A;  2G8Z A;  3ZT5 A;  3NYD A;  3K8M A;  2A3B A;  2PWF A;  1BHG A;  3BAJ A;  2ZIC A;  1J0K A;  3VDC A;  3BMV A;  1JAK A;  2FHB A;  2V3E A;  1E1F A;  1S46 A;  2Z1S A;  2XM1 A;  3WEO A;  4BQ2 A;  3WF3 A;  1BGA A;  5DT7 A;  4UTF A;  4FMV A;  1UD2 A;  4ATL A;  1FOB A;  1ZB5 A;  1R7A A;  1ZBW A;  4M29 A;  2WVS A;  1WB0 A;  3WEZ A;  2VTF A;  3CO4 A;  5A2B A;  2BVY A;  5KZ6 A;  4BS0 A;  1FH7 A;  5CGT A;  3GXD A;  4D72 A;  3WEL A;  2MAN A;  5A6M A;  3IK2 A;  3APG A;  2JEP A;  1E3X A;  1VFU A;  3SCW A;  1B9Z A;  1AMY A;  5E9A A;  4AWE A;  5KEZ A;  3PZV A;  2X09 A;  2WMK A;  3KWX A;  1PEZ A;  5D9P A;  1J10 A;  5DEZ A;  2YA2 A;  2GJX A;  1CEC A;  1HKJ A;  4JFV A;  4TVC A;  4AC1 X;  2XYL A;  2CHN A;  2ZX7 A;  4W7U A;  2VZS A;  1CLV A;  1UKT A;  1J0I A;  1FH9 A;  3WNO A;  1UD3 A;  4GZJ A;  1AQ0 A;  4CGT A;  1HL8 A;  3GYC A;  1GJW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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