1UWTA

Structure of beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus in complex with d-galactohydroximo-1,5-lactam
Total Genus 200
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
200
sequence length
489
structure length
485
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITREKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural studies of the beta-glycosidase from Sulfolobus solfataricus in complex with covalently and noncovalently bound inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 200
structure length 485
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2004-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uwtA00
1OM0A 3W53A 3AMKA 5TD4A 1NQ6A 2VVNA 3KWXA 1JDCA 5A2CA 3MUZ1 3SCUA 2GJRA 4EKJA 1EOKA 3OIHA 5A6JA 1VFMA 5A6MA 1CTNA 4GKLA 1Q6DA 1JNEA 5E6YA 4M29A 4XZBA 4FLSA 1IZJA 1E1EA 1VFOA 2A3BA 3WDRA 3BXWA 2VZTA 3VOCA 3SCQA 2DT3A 1H5VA 1KXHA 2ZUWA 5AYBA 4J27A 4AY1A 5I6SA 3L4XA 3WN6A 5HXMA 5CGTA 1CGYA 3VDAA 1E15A 5I2UA 4AD1A 5BWFA 1JNDA 2ZX5A 3CHDA 3RPMA 2XFFA 4LXFA 3MSDA 2WKGA 2E8ZA 4WKHA 3ZT5A 1LWHA 1UD8A 3MS8A 4UFHA 4TTGA 1WE5A 3WD2A 5E70A 1OGBA 4Z2JA 4GO9A 7TAAA 1VEPA 3L4UA 2ZUMA 4BZYA 2W92A 1CYGA 7A3HA 3GDBA 3WF3A 3GNRA 3WD0A 3WDPP 1Q6FA 4UQ9A 5LYRA 2VURA 3WENA 4AIUA 5DFAA 2VCBA 1NH6A 1U30A 3A4XA 1MQPA 1LG2A 2J79A 1ZL1A 6A3HA 5A6KA 4PMZA 1H4PA 1GQLA 2PWEA 3UETA 3OGRA 3PTKA 4JCLA 4OIFA 2YL5A 5A2AA 3ARRA 1R85A 3CHFA 1QVBA 2GJPA 3PBGA 2WVUA 3TOPA 4UTFA 2YDQA 4AISA 1QI0A 3WNOA 4D1IA 5E6ZA 3AISA 3GM8A 3T08A 3MU7A 1GOOA 2BNJA 4W8BA 1BSIA 1GOIA 6CGTA 4TX8A 4PCTA 5M3WA 1KXTA 2YL8A 1OT2A 4GI9A 3EDKA 4CU8A 1J0YA 3FHAA 1E3ZA 1IV8A 4D6EA 1KB3A 5D9PA 4QLLA 1PZ2A 3AFBA 4NF7A 3ZJKA 3ARYA 3FNDA 4J3VA 3DYMA 5FL0A 1CGXA 2DSZA 4AD4A 2XWDA 3KZSA 2WMJA 5DT5A 1H09A 1OGSA 1XSJA 1E4IA 1UHVA 3W29A 4PUDA 4A3HA 3WUGA 1D2KA 3W6MA 1R7AA 4HA4A 3S2CA 3PZTA 1K6AA 1UD2A 4W8LA 1I75A 1V0LA 4MADA 2HVMA 1BF2A 3LPFA 3DC0A 3UESA 2WVTA 1BFNA 3UG5A 1PEZA 1EDGA 3AYRA 2G8ZA 4MB4A 4AZ7A 1MW2A 2BY1A 3BAYA 2W63A 3ZT7A 1W1YA 3EMZA 2W62A 1TVPA 1E43A 1QNQA 1DWHM 3LPGA 3MMWA 1OIFA 4S3JA 3WQWA 1CNVA 2Q8XA 1DWIM 4M82A 1CXFA 1JZ5A 4RL3A 4KRUA 1W91A 3EYPA 4HOXA 1QW9A 1BG4A 4U3CA 3KL5A 3AZSA 1QHZA 1RP9A 2DT2A 3T2QA 4W5UA 1MW1A 1E3XA 3SURA 1JD9A 3CZEA 2WVSA 3VIKA 4W7WA 2YA0A 4C7GA 3N15A 3PZNA 3AS3A 2WHKA 3J7HA 2Y24A 4L4PA 3AROA 1UR1A 5A6BA 2W67A 4TVUA 1V6XA 3U5UA 3QOKA 5LA2A 4C7FA 2E9BA 1J10A 4DM2A 2X2YA 2WC3A 3ZSTA 3WH5A 1EQPA 1CGUA 1GOMA 1W9DM 3U7VA 4XB3A 1RPKA 1LJYA 3WY1A 2WAGA 2QV4A 1PIGA 4YPJA 4EK7A 5ABGA 3UEQA 1CXHA 4E8DA 2ZUNA 3MKKA 3EDFA 1VF8A 2QPUA 2CHNA 4WIWA 1HNYA 3NDYA 1CBGA 2WLZA 3WQ6A 1SMDA 3T09A 3LMYA 2Y8VA 3U7BA 3BCDA 3WQ8A 1LL6A 2WHJA 3VKKA 4TVCA 1OCQA 5JBEA 2BS9A 4HMCA 4JKKA 3RO8A 1WCGA 1UZ1A 4W88A 1V3JA 3VVGA 4DM1A 1WO2A 4ACYA 1QW8A 2WKLA 1JZ4A 3CUHA 4AD2A 4PTXA 5E0CA 3SUUA 2XTKA 5AC4A 4IPNB 4UOZA 4JL1A 1MVYA 3W82A 1E6PA 3D5HA 1VENA 5FL1A 2A3AA 5A94A 4U5IA 1QBBA 1ZJBA 2VMFA 1W2VA 1HVQA 1C7TA 4PMXA 5E09A 2W61A 2WNWA 3TTOA 1Q6GA 4UFKA 3W6LA 2PWHA 1F4HA 2WSKA 4OKDA 1C8YA 2BY2A 2OWCA 1HL9A 3AHXA 2AMGA 1E0VA 1NM9A 3F5LA 1C92A 1BLIA 2CPUA 2TAAA 1QPKA 2XIBA 4V2XA 4JFUA 3EMCA 3MSGA 3ECQA 4DWSA 1ISZA 4IISA 1WZAA 4ATWA 4AZCA 1W3HA 3AHVA 1QNSA 1I1XA 1HKJA 1CXKA 2WMIA 1MW0A 1XD0A 3L4WA 2O9PA 1EO7A 3QHNA 3WH8A 1MQRA 2WZEA 5FCZA 3RM8A 4YHEA 4U31A 3VIOA 3WQVA 1UD5A 4LYRA 1XH2A 1ZBWA 4UQDA 2XGIA 5A1AA 2XSBA 4MDPA 1DWAM 4AZGA 2D0GA 2XIIA 1CLVA 3MO4A 1QHPA 2FHFA 2NT1A 4U3AA 3SIMA 3HU7A 3ZJ6A 4MNKA 1XD1A 4CN4A 1JZ8A 1EH9A 3WEOA 1WNOA 2DGAA 2CYGA 2VZUA 2NT0A 1W9BM 4M80A 1UWSA 3ARZA 3SCOA 1JL8A 4AZHA 1F4AA 3WBEA 3OLEA 1EA9C 1GCYA 4B3KA 1UOKA 3BCFA 3T2PA 1B3XA 5I5RA 3SCTA 3VIPA 1TG7A 2FGZA 1E6SM 1ECEA 3K8MA 5CLTA 1CIUA 4JFVA 1QNRA 5A3HA 1FH9A 3ARWA 2VTFA 3WDQA 5ABFB 1KR0A 4R27A 5HPOA 2J7EA 4PMRA 3WMBA 2GK1A 4P7OA 3UCQA 4GI8A 1ZU8A 5LA1A 3NJ3A 4GO8A 2XGBA 4DWSD 2QHAA 4PSRA 1HJVA 2BVTA 4K68A 2BXZA 5BXPA 3CGTA 1E56A 1SYTA 1H0IA 3N18A 3VGEA 4D6GA 2WVVA 3II1A 3VIGA 3WQ5A 1TCMA 2VJXA 4KWUA 3EMQA 4HA1A 2WPGA 1XV8A 2F8QA 4UQEA 3ZIZA 1XH1A 5M5DA 2EBNA 3FAXA 2RGMA 1JI1A 5JIWA 3ZJ7A 4CVUA 3CO4A 2YDSA 3HJEA 2QF8A 4OUEA 5C8BB 5EFFA 4KH2A 1VFFA 3WMCA 4L4OA 3SCSA 3CLWA 3KL0A 1FA2A 1VFUA 3CH9A 4PN2A 2WYSA 2W5FA 4IPLA 3GNPA 2ZUTA 1V3KA 3AHZA 1JZ6A 3WMSA 1HX0A 3AHYA 3ZT6A 3L2MA 4CN1A 4NI3A 1V6UA 2GJXA 2O92A 3VU2A 2PC8A 2ZXAA 3AMCA 1EHNA 1UA3A 2OLHA 3G6LA 1I1WA 4PMUA 1B0IA 2B31A 4MPKA 1XCXA 4DUVA 1TA3B 3CPUA 1E0WA 1VBRA 1XSIA 3FW6A 4PYSA 5E9AA 4AIEA 5I77A 2DSKA 1CLXA 4ZXLA 3B9AA 1GUVA 1CXLA 5EBAA 4D6JA 4FF5A 2J25A 3WEMA 4HMEA 1J0IA 3PZIA 1KGXA 1C90A 2X8RA 5FKYA 4GZIA 3AXHA 1IT0A 2WK2A 1JFXA 1M01A 5CG0A 3F5JA 1ESWA 5HOSA 3IJ7A 1CEOA 4P7RA 1BYDA 4CN6A 3VX0A 3T0DA 4OBSA 1JZ7A 2DT0A 3JUGA 3MUY1 1R87A 4X0VA 3PN8A 4JKMA 1E9LA 4MNJA 1JYNA 4MB1A 2UY4A 2OYLA 4JHOA 2YA1A 4URIA 4PMNA 4IUGA 1KWKA 4E4PA 4CU6A 2G3NA 3NUKA 1NWRA 2PB1A 2OYMA 2VL4A 3OZPA 3NSMA 4H2CA 4E2OA 1TZ7A 4X9YA 4D6HA 2WC4A 1HJWA 3FHQA 3DHUA 4HTYA 2CBVA 2WW5A 1PBGA 2WHLA 4U5KA 2VUYA 2JFEX 2CEQA 1MFUA 2XM2A 1CDGA 1PIFA 3T0AA 3K8LA 4TUFA 1ZBVA 2FHCA 3VIMA 5CPTA 1UKOA 3DYOA 8A3HA 1U33A 2ZX9A 4AWEA 1FHLA 1BG9A 2YOCA 1LG1A 4HZ8A 3POCA 1G01A 3M7SA 3WIJA 3VM7A 2XJ7A 1TMQA 1K9EA 1HJSA 3AMDA 4F9DA 3ALGA 2J47A 4W87A 5BXRA 4OOUA 2VRQA 3THCA 3VD7A 3HN3A 5I79A 4MDOA 1B30A 5ECUA 3VM5A 1EHAA 2J77A 4GXPA 1UWUA 1OBAA 1WZKA 3A47A 2BY3A 3A4AA 1C8XA 3WFLA 2DSVA 2CXGA 2OWWA 1TR1A 1V0KA 4HPGA 5I24A 3AMGA 5D9NA 2WCGA 1WDRA 2WCAA 2F2HA 1DEDA 5CGMA 2WBGA 1HKIA 3BMWA 2ZXBA 3WQ4A 1UWTA 3CZLA 5AC5A 3BMVA 3CUIA 4UFMA 1P6WA 5A8QA 1L0PA 3BAKA 3AIUA 1CGVA 3PZUA 2OWXA 1E6QM 3WBAA 3CBWA 1MQQA 2V3DA 7CGTA 2XWEA 1B2YA 1Q6EA 1BYBA 2OSYA 2D24A 3RM4A 4Z2IA 1C7SA 3ARQA 4WKAA 4AD3A 4HP5A 1PZ3A 1SFSA 4W89A 3ARUA 3W24A 3VMOA 4UFJA 3VPLA 1B3ZA 1VEOA 2QMJA 4D6CA 1LF1A 1H2JA 2X09A 1CZ1A 2D22A 1UWIA 2YLLA 3TTQA 3K46A 2YJQA 5CSUA 4MNMA 3M46A 4GZEA 2FH6A 2E0PA 2BV9A 3D3AA 2F61A 4WK9A 1X6NA 1U2YA 1ISVA 1TVNA 1JYVA 3KEHA 3VGHA 4PSPA 1MXDA 2E4TA 2ZXQA 4JCMA 2JALA 3WNLA 4HA3A 3TTYA 1CGWA 3ARSA 4OJYA 3HMCA 4UCFA 1GJUA 4XX6A 1GQJA 4NSBA 3W26A 4AW7A 3ARXA 1W1VA 5D9OA 1WDQA 1K9TA 2VI0A 1JXKA 1UG6A 1KWGA 3N12A 1HT6A 1UWRA 4S3KA 4MNLA 4Q7NA 4LGXA 1JG9A 1J0HA 2IXVA 4W85A 1KXQA 3VD4A 2CESA 2WHMA 1AVAA 2XYLA 5IFPA 1VJSA 3BSHA 1B90A 1GQKA 2VQTA 3DHPA 2GSJA 3ALFA 1G94A 1WZLA 3BAXA 5ABEA 3VTRA 2Z1KA 1ITXA 3LPPA 1E0XA 2D2OA 1SMAA 2J7CA 4M8UA 1KBKA 3O9NA 4P8XA 1CXEA 3SCRA 1K9DA 1JAKA 3PZVA 1FH8A 4H7VA 2EPNA 3VDCA 3AIVA 1W3LA 2G3IA 1L8NA 5DT7A 4D6FA 1EDQA 4PTWA 2EPKX 3OLIA 1FOBA 4MB5A 1ISYA 1GORA 1GW1A 5D8WA 1GOQA 5I23A 3F4VA 4GINA 1H3GA 5D4YA 1KQZA 4BQ4A 1J18A 2WSPA 1CXIA 3GXFA 4AZ5A 1V02A 2CNCA 3WKZA 1E70M 5A8MA 4GPNA 1QOXA 4J7RA 1OT1A 4H8VA 2VX5A 3WD4A 3OGVA 2V5DA 2E8YA 1XSKA 4D6IA 1M7XA 4QDMA 4WSJA 3CIVA 3WUBA 4PEEA 5M17A 3E1F1 1M04A 3AQUA 3ZSSA 3PHAA 4W84A 1J11A 2WB5A 3GXDA 1UKPA 2OSXA 2J78A 2V5CA 1QHOA 4AD0A 1NOFA 2E40A 2D20A 1GVYA 4WSKA 1V3LA 1R8LA 3WNMA 5CSYA 3VIIA 4NZCA 4PTMA 2XPKA 4GZJA 1HJQA 1WB0A 3DECA 1KGUA 2D3NA 1IZKA 4BF7A 1LQ0A 2BHZA 2XSAA 2YLAA 4ACZB 2GVYA 4MJ2A 3W27A 3ZR6A 3CZ8A 1V3IA 4Q22A 1M53A 2AOSA 5BYWA 2W91A 5CJ5A 3ZR5A 2X1IA 2WMGA 3GXMA 4LQ1A 4XUYA 4ATDA 3UR7A 1NP0A 2WXDM 1FP9A 2CITA 1OB0A 5EFDA 3RILA 3BC9A 4V28A 2ZXDA 3IJ8A 5E0FA 1JIBA 1ZS2A 1QI4A 2IXUA 2ZUUA 2VR5A 3WH9A 2D3LA 5EMYA 4GI6A 3VD5A 1E5NA 5GPRA 2E9MA 3K1DA 1QNPA 4HPHA 2J7FA 3PTQA 3WD1A 2YL9A 3CZKA 4Z2GA 1OSEA 4MJ4A 4M56A 5DO8A 5ABFA 1W9VA 1VRXA 4RE4A 3WNPA 3AI0A 1V6WA 1DWFM 1MWOA 4D6DA 1G1YA 2AAAA 2WC7A 4AZ6A 4BS0A 3QHMA 3OGSA 2FHBA 1E6ZA 4UZUA 1HN1A 3BLKA 4F8XA 1GOWA 1J0ZA 5FIPA 4MAZA 4P7LA 3CMJA 3MV11 1A3HA 1NARA 2VRKA 3ZO9A 2YBUA 3VMNA 3N1AA 2G41A 1XRVA 4ZEPA 3A3HA 3VD3A 3OB8A 4AC1X 4UR9A 4JFTA 2G3MA 5HPCA 5DMYA 1E6NA 2BHYA 4QFUA 1B3YA 1FH7A 2YBTA 3MUIA 2D1ZA 3VIFA 1GPFA 3ZQ9A 4X0NA 3T0BA 2PBGA 1EDTA 3WEZA 3K4DA 4HZ6A 5CQ1A 3VGBA 1UH4A 3OA5A 3MUAA 4P8WA 2X0YA 3AOFA 4EE9A 2BVYA 2WMFA 1JD7A 1OWQA 2WMIB 2C0HA 3GH4A 3ARTA 1EQCA 2YIHA 1BYAA 3I3DA 3VIHA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1OM0 A;  3W53 A;  3AMK A;  5TD4 A;  1NQ6 A;  2VVN A;  3KWX A;  1JDC A;  5A2C A;  3MUZ 1;  3SCU A;  2GJR A;  4EKJ A;  1EOK A;  3OIH A;  5A6J A;  1VFM A;  5A6M A;  1CTN A;  4GKL A;  1Q6D A;  1JNE A;  5E6Y A;  4M29 A;  4XZB A;  4FLS A;  1IZJ A;  1E1E A;  1VFO A;  2A3B A;  3WDR A;  3BXW A;  2VZT A;  3VOC A;  3SCQ A;  2DT3 A;  1H5V A;  1KXH A;  2ZUW A;  5AYB A;  4J27 A;  4AY1 A;  5I6S A;  3L4X A;  3WN6 A;  5HXM A;  5CGT A;  1CGY A;  3VDA A;  1E15 A;  5I2U A;  4AD1 A;  5BWF A;  1JND A;  2ZX5 A;  3CHD A;  3RPM A;  2XFF A;  4LXF A;  3MSD A;  2WKG A;  2E8Z A;  4WKH A;  3ZT5 A;  1LWH A;  1UD8 A;  3MS8 A;  4UFH A;  4TTG A;  1WE5 A;  3WD2 A;  5E70 A;  1OGB A;  4Z2J A;  4GO9 A;  7TAA A;  1VEP A;  3L4U A;  2ZUM A;  4BZY A;  2W92 A;  1CYG A;  7A3H A;  3GDB A;  3WF3 A;  3GNR A;  3WD0 A;  3WDP P;  1Q6F A;  4UQ9 A;  5LYR A;  2VUR A;  3WEN A;  4AIU A;  5DFA A;  2VCB A;  1NH6 A;  1U30 A;  3A4X A;  1MQP A;  1LG2 A;  2J79 A;  1ZL1 A;  6A3H A;  5A6K A;  4PMZ A;  1H4P A;  1GQL A;  2PWE A;  3UET A;  3OGR A;  3PTK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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