1UWTA

Structure of beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus in complex with d-galactohydroximo-1,5-lactam
Total Genus 200
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
200
sequence length
489
structure length
485
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITREKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural studies of the beta-glycosidase from Sulfolobus solfataricus in complex with covalently and noncovalently bound inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 200
structure length 485
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2004-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uwtA00
1E1EA 2E9LA 3AMGA 2GK1B 3VIIA 4H04A 4TX8A 1BAGA 4OZOA 4JCMA 3K46A 1X1NA 2GVYA 3FAWA 3CUIA 3K1DA 3U5YA 3VUPA 4UZSA 4HMDA 1UA3A 4U5KA 5GQBA 5JUVA 2WMIA 1QI0A 1CZ1A 1GUVA 1C7SA 4MNKA 3BAXA 1HJWA 3CZGA 3WUEA 4EAMA 2VR4A 1BTCA 5DEZA 3GH4A 3UR7A 5EMYA 2WVVB 4OOZA 4HU0A 6TAAA 3L4ZA 4RE3A 3WMBA 4AZCA 3SCOA 5HDRA 1HJUA 2FDMA 3UESA 1VIWA 3ZOAA 2XPKA 3S6TA 4AZ7A 2CXGA 4JFWA 5FL1A 2O9TA 4BZYA 2YLAA 2Y5EA 3CBWA 1IZJA 5IXEA 1ESWA 3ARYA 3WQ8A 4OUEA 1LJYA 2GDUA 3OBAA 3WMSA 3AIUA 3KL5A 4UFHA 4ATLA 1BPLB 2DT0A 3THCA 1OBAA 3UG4A 1DEDA 1HJXA 3QOMA 2DH3A 2XG9A 3GBEA 1C8YA 2BHZA 2ZUMA 2QMKA 1HKKA 3O2LA 1MFVA 1UKPA 4QCEA 2JF7A 1CGTA 1J0HA 4H7VA 2CKSA 1TMQA 3LPGA 4K68A 1B3YA 4UQEA 2J62A 4TVUA 1HKJA 3AS3A 4TTGA 4AIOA 1C90A 3PZNA 4PMRA 5D8WA 2G3MA 4HOZA 2IXVA 1WE5A 2ZUTA 4PMXA 1VB9A 3EDFA 4F9JA 5TD4A 1EOMA 5JIPA 3EMCA 5CPTA 4GO8A 2CPUA 2E3ZA 2OSWA 3WIJA 1R7AA 1VF8A 4WKHA 4Q7NA 3VMPA 3BCDA 3WDJA 3CMGA 1LF1A 2UY5A 4HPHA 1CGVA 1C3FA 3W26A 1NWSA 1WZKA 1QNRA 5ABEA 2YL9A 2J4GA 2J78A 3PZVA 4BQ5A 1QW9A 4IM4A 4KGLA 2A3EA 4AZIA 2X8RA 3A6OA 5ABHA 1V3IA 3VNYA 4J7RA 2G3IA 3AHZA 4FLOA 3RDKA 4MJ2A 2WCAA 2YDSA 1ISVA 1W3LA 2W4XA 4PUEA 4X9YA 2VQTA 5IFTA 2BY3A 2E0PA 6A3HA 1EOKA 1WAWA 2ZOXA 1PIGA 8A3HA 1HNYA 1H41A 4D6JA 3MUIA 1U33A 2J7EA 5A3HA 2CEQA 1OB0A 3IK2A 1QOXA 2FHFA 5C8BB 2BVYA 4MB1A 1B3WA 1TUXA 2AOSA 1TA3B 1G0CA 4MNMA 4WIWA 2XVKA 4AC1X 4TXEA 3KL0A 1V02A 1TCMA 1HKIA 2VX5A 4DUVA 1JI1A 3PTKA 5CLTA 4KWUA 3VD3A 3WNOA 2VQUA 2VJXA 3BAIA 3L4XA 4PMDA 4QLJA 3FY1A 4P8UA 2BY2A 3EYPA 3K8KA 2J7BA 2ZXDA 3ARTA 3PZ9A 4QLKA 1PZ2A 2WZIA 5AYIA 4MNLA 2WVUA 3GNRA 3IAQA 3KE0A 3ZSTA 2WHKA 4AIUA 3KWXA 2NSXA 2QLYA 1BF2A 2BNJA 4XX6A 1JDDA 3AIBA 3L4WA 5CJ5A 1CXFA 2DSUA 2OSXA 1C93A 2WMJA 3DYMA 3VGBA 5HBFA 3SCVA 2GJXA 2VZVA 2YJQA 3AROA 3T0BA 2EJ1A 1JXJA 1WZAA 3ARSA 4JZ5A 2JE8A 1S46A 1UKQA 4V2XA 1LL7A 4JL2A 1UR1A 3FNDA 1IV8A 2WVVA 3SEPA 3BSGA 4DWSC 4L4PA 3DYPA 1VFFA 3WFLA 5A2AA 3FXYA 4HA3A 4HPGA 2F8QA 3MU7A 1V02E 2FH8A 2CHOA 4PTWA 3SIMA 3VDCA 1XV8A 4UOQA 1NARA 1LL6A 2EO7A 1CTNA 1CLXA 3QHOA 1SMAA 4GINA 1J0ZA 4GI9A 1GNXA 3WF2A 9CGTA 1V03A 1KGXA 2PWFA 3VIHA 1PJ9A 2JIWA 3ZQ9A 1Y7VA 3WFZA 1KQYA 2VO5A 4GZJA 1IT0A 1Q6DA 4EKJA 5FOOA 1JF6A 4PTVA 3PZMA 4HP5A 3FHQA 3W6MA 1UD6A 1E4MM 3APGA 4H2CA 3VD4A 1BYDA 3NYDA 3WBAA 4U3AA 4PSPA 2W92A 4ACZB 4JAWA 2Y24A 1NOWA 1TZ7A 4PMYA 3SCSA 2YLLA 3GZAA 2G41A 3NDYA 1E6QM 5A6JA 3VM7A 1KB3A 3QHNA 1GOQA 3NSXA 4LYPA 2VNCA 5E09A 1EGZA 2X09A 3PTMA 4UR9A 4MB5A 3T2OA 2VCBA 4JCLA 1CYGA 3N1AA 2YL6A 4AZBA 2EPOA 1JNEA 1GJWA 3IJ8A 4J27A 1M53A 1Q6CA 3CPUA 1E3ZA 3GM8A 2D0HA 3OGVA 4FLSA 2Y2WA 2J7HA 2DT2A 3BAWA 2E8ZA 4JKLA 1GHSA 2X0HA 1B3ZA 4B9ZA 4KMQA 4DUXA 2QHAA 1AMYA 3ARPA 3W38A 3WQVA 3GBDA 5FL0A 1GJUA 2JEQA 1XHGA 2XVGA 3QR3A 5DT7A 1FHLA 4UTFA 4CN4A 3EDEA 2VOTA 1QHPA 1HL9A 4D1JA 1E5JA 3GYCA 1E6XM 4PEEA 3AICA 3TOPA 1M01A 4PMUA 1WZLA 3FHAA 5I24A 4UZUA 5BXSA 3ZT7A 2V3DA 3A4XA 3LPFA 2YA2A 1JFXA 2CIPA 3A4WA 3B8SA 1VEPA 1BYCA 3VIFA 2DGAA 5HOSA 2WCGA 4WF7A 4OJYA 1LG1A 4Z2HA 5IFPA 5M3WA 2RGMA 2X1IA 1H49A 2WXDM 4F66A 2D2OA 4TX6A 5A1AA 1HIZA 1NOFA 1RH9A 2W61A 3D5HA 4WKAA 1EXPA 1XGZA 4GO9A 2VX4A 5HXMA 1RD6A 4XB3A 2ZWZA 4C7DA 3WH5A 2ZUNA 1E43A 1PX4A 4P8XA 1JAEA 1B1YA 1US2A 3BGAA 3JUGA 4ZE4A 2PC8A 3N04A 2W62A 3K8LA 3VOCA 2VR5A 4AD3A 4UFJA 2W67A 2V5CA 4M56A 4GQRA 3BCFA 1CBGA 4J3VA 1PAMA 1ITCA 5E6YA 1XSIA 1E3XA 1NWUA 2WVSA 2WKGA 5CSYA 2FH6A 1J12A 1OIMA 1UD3A 1ZS2A 5E0FA 3SCTA 2BVTA 1H1NA 5F7UA 4AEFA 1BYAA 1CECA 4J28A 1JNDA 2TAAA 2VCCA 1XYZA 1CENA 5DF0A 2PWDA 1E73M 3VD7A 2BV9A 1Q6EA 4PCSA 3OLDA 4AZ5A 1GVYA 1KXHA 4HA1A 5A6MA 1Z32X 1M04A 3WNPA 3T0AA 4UFMA 4NI3A 3RMEA 3W81A 2EPMX 4UOJA 2CERA 1UD4A 2FGLA 3N9KA 4F79A 1E6PA 2WBGA 1YQ2A 1J9YA 1JZ4A 1HJVA 4HZ7A 1UQZA 5D9OA 1KBKA 1VENA 1GPFA 1C91A 5D9NA 1UKTA 2DSVA 1EDGA 2QPUA 2WAGA 3IJ9A 1EA9C 1CPUA 5A6KA 2YL8A 1WNOA 1D7FA 1AQHA 4M29A 2XIBA 3OLGA 3AHTA 3AJ7A 2D24A 4D72A 1B9ZA 1V3LA 1CGYA 1H2JA 1W3HA 2J74A 1G94A 2J7GA 3ZO9A 1HP5A 1FOBA 3ZIZA 3CO4A 4R5EA 2G8ZA 1UWQA 3WQ6A 2YA0A 1W3JA 3AMKA 2AMGA 3VIOA 1WP6A 1V3KA 1D2KA 2FHBA 5ABFA 5EFFA 1ZBCA 3W28A 1NP0A 1WDPA 3ARVA 1UQYA 5A6AA 1KWKA 1G01A 3U57A 3E1F1 1DWJM 2W63A 1E55A 2IXUA 1ISWA 1GQIA 3TTQA 4GKLA 3OZPA 2D3LA 2WC3A 2JEPA 3LPOA 3VINA 4IISA 1CIUA 5FCZA 3ZR6A 1HP4A 2V38A 3W25A 5HNNA 2VX7A 5BYWA 3TTOA 1Q6GA 3SCNA 4CN1A 1AQMA 4QCFA 1NQ6A 3AIRA 3F5KA 2VCAA 3N13A 1E71M 2BHUA 2CBJA 3B9EA 2BXYA 1W9DM 4P7RA 4JKKA 3GXFA 3W4RA 2A3BA 1UR4A 4S3JA 4ZXOA 3WF0A 3GXIA 2NT1A 5KZ6A 1M03A 4AYSA 2WC4A 3AOFA 3U7BA 2DEPA 4JHOA 5I78A 3AMDA 1V3HA 1CXEA 1W9VA 3ZJKA 2XFYA 2OYLA 4DWSD 1JZ5A 3WF1A 1DWAM 1MXDA 4U5IA 3N12A 4W5ZA 7CGTA 3ZJ7A 2W5FA 4CD6A 2XJ7A 2D23A 3B9DA 4J3XA 3OLIA 5BCAA 5EB8A 1ZB5A 1GOIA 1QI4A 4MB4A 1GQJA 3VIJA 4BS0A 2XM2A 3RM4A 3PHAA 2J8GA 3WNMA 4IPLA 1J0JA 1EQCA 1UH3A 4MAVA 3CH9A 4FK9A 1E40A 3U5UA 2EXOA 1OGGA 3SCUA 5M5DA 1L8NA 4AIEA 2VVNA 4P7QA 4AY1A 4WSKA 1GOMA 2DQXA 1JF5A 3BSHA 3T2PA 1FH7A 4PMNA 2QMJA 1MW2A 2ZXBA 3OB8A 4DUWA 4TUFA 1JD9A 5CG0A 1V3MA 4JHZA 2DSZA 2J7CA 3AISA 1ISXA 2PF0A 1HVXA 1UG6A 5E70A 3GH7A 1J10A 5I77A 1QI2A 2ZUSA 3AFBA 1J0KA 2VZUA 1XYFA 4RE2A 1UYQA 3UEQA 3S2CA 2YBTA 4FLQA 5CXPA 1U30A 1J0YA 1V0KA 1R87A 3BC9A 4HMEA 3NCOA 2JF6A 4ACYA 1WO2A 1E15A 1JIBA 4GZEA 3G6MA 2MANA 1BSIA 1SMDA 5JIWA 4NZCA 2XHYA 1K9DA 1MYRA 3RJXA 3RO8A 3WNLA 3VU2A 5CGTA 2J8FA 4W85A 4H8VA 2ZE0A 3CMJA 1EQPA 2J75A 2E9MA 2ZX6A 3SUSA 4GIAA 1EH9A 4E8DA 4HOXA 1ZJBA 3ARXA 1FH9A 5M03A 1X6LA 1PIFA 2ZX9A 2BY1A 4D1IA 3UG3A 3WD1A 2A3HA 2F61A 3BXWA 3PBGA 2UY4A 2BVDA 3L2LA 5DO8A 2VT0A 4B16A 3CTTA 4AD1A 4J3SA 3TP4A 2GK1A 1UA7A 3M7SA 3MO4A 5A94A 4U33A 1UD8A 2WWCA 2ZXQA 4E4PA 1VBUA 3WMCA 1H09A 1ZJAA 4E2OA 1GZJA 2Y8KA 1HJQA 3MMUA 1HXJA 1H4PA 5C71A 3DECA 4NRRA 4N0RA 4QLLA 2DDXA 2CBUA 5BXRA 2DT3A 2CETA 1GVIA 2EQDA 4PCTA 3CHDA 3HMCA 1C8QA 3CUHA 1QBBA 1HT6A 3RM9A 1F4AA 3WEZA 1OIFA 4JIEA 3F5LA 1OINA 4DM1A 3WBEA 4B15A 2WZHA 3ARRA 4W8BA 1XD1A 4Z2JA 3PTQA 3I3BA 1VFUA 1WZMA 4M1RA 3WUFA 2XTKA 1P6WA 4KRTA 3WH9A 4P8WA 3THDA 1V6UA 1WCGA 2O9PA 1U2YA 3DC0A 5A8MA 2OWWA 4CD4A 1DWGM 1VRXA 4CU6A 3WL0A 2BHYA 4BQ3A 1JG9A 3AZSA 4AD2A 3VPLA 2VX6A 5JBDA 4AZGA 1BGGA 1JZ8A 2V5DA 1JAKA 3AXXA 4W88A 1GCYA 1HL8A 3BMWA 2XWDA 3WDRA 2OSYA 5GNXA 1KQZA 1B3XA 3VVGA 3VKKA 4XZWA 3WSUA 3SUWA 4UQ9A 2YDQA 5HPCA 4BCEA 3MUY1 1GHRA 1XH1A 1XSKA 5A8NA 2WSPA 5I79A 3L4VA 1UWTA 1PX8A 1JZ7A 2BS9A 4W86A 3PZOA 3WH6A 5I6SA 4L4OA 4D6GA 3WF4A 3SUVA 4V27A 2NW0A 3WENA 3RPMA 1C8XA 3WH7A 1CXKA 1K9EA 5DT5A 1FA2A 1K9TA 2CESA 1UR0A 1NOUA 3VGDA 1QNOA 1JD7A 1ZBVA 2ZXAA 1B0IA 3WQ5A 4TOQA 1V0LA 4WSJA 3VNZA 5A6BA 2VUYA 2XYLA 1DWIM 4YPJA 1CGWA 3BAKA 1XH0A 4Z2KA 2EPKX 3I3EA 1TG7A 4BA0A 1JXKA 2C7FA 1XSJA 1E6ZA 1K6AA 2V3EA 2WMHA 2XGIA 2ESCA 3NDZA 3CZKA 3GNOA 5DFAA 3WD0A 4AEEA 1H0GA 1OCQA 1MFUA 4DWSB 4U2ZA 3ZM8A 3WD3A 5E6ZA 4PMVA 3EMZA 2G4FA 5GPRA 1ZBKA 4OKDA 5IDIA 1GQKA 1GQLA 3M6DA 2XUCA 3NUKA 3DYOA 1I75A 5GNYA 4CCEA 4RE4A 2CHNA 3W24A 2G3NA 1TA3A 1FFQA 3T2QA 4X0NA 2YA1A 2WHLA 1EDTA 2A3AA 1X6NA 3N15A 3T08A 4W93A 3L4YA 1CLVA 1OSEA 3BMVA 2DIEA 5CPQA 3PZIA 2QV4A 1ZBWA 2OWCA 4ML4A 4J3TA 4UQAA 2A3CA 2BFGA 2J7FA 4AXNA 3F5JA 1QNSA 3K8MA 4CD8A 2WMIB 1CGUA 2GJPA 3QHMA 4LQ1A 1R7OA 4CCCA 4A4AA 1E4NA 4UCFA 2YIHA 3VIPA 2EEXA 4CKQA 1BG4A 4MNJA 1CNVA 2HVMA 3POHA 1BVZA 5E9AA 2XFFA 3MSDA 2WANA 1W1VA 1R85A 4AZCB 2E4TA 4F9DA 2W66A 3FAXA 3MV11 4AWEA 3WQWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1E1E A;  2E9L A;  3AMG A;  2GK1 B;  3VII A;  4H04 A;  4TX8 A;  1BAG A;  4OZO A;  4JCM A;  3K46 A;  1X1N A;  2GVY A;  3FAW A;  3CUI A;  3K1D A;  3U5Y A;  3VUP A;  4UZS A;  4HMD A;  1UA3 A;  4U5K A;  5GQB A;  5JUV A;  2WMI A;  1QI0 A;  1CZ1 A;  1GUV A;  1C7S A;  4MNK A;  3BAX A;  1HJW A;  3CZG A;  3WUE A;  4EAM A;  2VR4 A;  1BTC A;  5DEZ A;  3GH4 A;  3UR7 A;  5EMY A;  2WVV B;  4OOZ A;  4HU0 A;  6TAA A;  3L4Z A;  4RE3 A;  3WMB A;  4AZC A;  3SCO A;  5HDR A;  1HJU A;  2FDM A;  3UES A;  1VIW A;  3ZOA A;  2XPK A;  3S6T A;  4AZ7 A;  2CXG A;  4JFW A;  5FL1 A;  2O9T A;  4BZY A;  2YLA A;  2Y5E A;  3CBW A;  1IZJ A;  5IXE A;  1ESW A;  3ARY A;  3WQ8 A;  4OUE A;  1LJY A;  2GDU A;  3OBA A;  3WMS A;  3AIU A;  3KL5 A;  4UFH A;  4ATL A;  1BPL B;  2DT0 A;  3THC A;  1OBA A;  3UG4 A;  1DED A;  1HJX A;  3QOM A;  2DH3 A;  2XG9 A;  3GBE A;  1C8Y A;  2BHZ A;  2ZUM A;  2QMK A;  1HKK A;  3O2L A;  1MFV A;  1UKP A;  4QCE A;  2JF7 A;  1CGT A;  1J0H A;  4H7V A;  2CKS A;  1TMQ A;  3LPG A;  4K68 A;  1B3Y A;  4UQE A;  2J62 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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