1VRXA

Endocellulase e1 from acidothermus cellulolyticus mutant y245g
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
358
structure length
358
Chain Sequence
AGGGYWHTSGREILDANNVPVRIAGINWFGFETCNYVVHGLWSRDYRSMLDQIKSLGYNTIRLPYSDDILKPGTMPNSINFYQMNQDLQGLTSLQVMDKIVAYAGQIGLRIILDRHRPDCSGQSALWYTSSVSEATWISDLQALAQRYKGNPTVVGFDLHNEPHDPACWGCGDPSIDWRLAAERAGNAVLSVNPNLLIFVEGVQSYNGDSYWWGGNLQGAGQYPVVLNVPNRLVYSAHDYATSVGPQTWFSDPTFPNNMPGIWNKNWGYLFNQNIAPVWLGEFGTTLQSTTDQTWLKTLVQYLRPTAQYGADSFQWTFWSWNPDSGDTGGILKDDWQTVDTDKDGYLAPIKSSIFDPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Catalytically enhanced endocellulase Cel5A from Acidothermus cellulolyticus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOCELLULASE E1 FROM A. CELLULOLYTICUS
molecule tags Hydrolase
source organism Acidothermus cellulolyticus
total genus 137
structure length 358
sequence length 358
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2005-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1vrxA00
4B16A 4TVUA 3VIKA 1C7TA 1UG6A 3OZOA 4MB4A 3OIHA 3F5KA 3PZQA 2VI0A 1OIMA 4ZE4A 5A8NA 4AWEA 1JZ3A 1ZBKA 3T0BA 3WN6A 1E4MM 3MMWA 3CIVA 1G9HA 4OIFA 4AYSA 2G3MA 1E9LA 1MQPA 1UR2A 1OSEA 5JIWA 1ZS2A 3VU2A 3BAXA 4EKJA 1ISVA 3UG4A 2VC9A 5IDIA 4NRSA 1HP4A 1IT0A 1QNQA 2OSYA 3WH6A 2XGIA 2VX5A 3SURA 2GVYA 4QAWA 2ZWYA 4GZEA 1PX8A 3DHUA 2CIPA 5ECUA 4F8XA 1H1NA 1JYWA 2XIBA 1KR0A 4UNIA 2VQUA 3G6MA 2ZOXA 4JFUA 6A3HA 4V27A 1CGYA 3ZR6A 2E9LA 3EDJA 5E6ZA 5CSYA 1EOMA 2D0FA 3BLPX 2XVNA 2BHUA 4OJYA 4IISA 1E73M 3AJ7A 2QMJA 3SCVA 2OWWA 1QVBA 4WSKA 1NARA 2DEPA 5I77A 3SCNA 1EHNA 9CGTA 4W85A 4CD6A 5I79A 1M53A 4J27A 2XWEA 3CTTA 1H0IA 5CXPA 1B3WA 4E8DA 3IJ7A 1J9YA 2GJXA 3VTRA 1JYXA 4MB5A 5HDRA 3KE0A 3VM5A 4AZCB 5A6JA 1FHDA 3GH4A 2EXOA 5FKYA 1HJXA 2B31A 4Z2KA 2CXGA 5FL0A 1X6LA 1LJYA 3QHNA 5D4YA 1UR8A 2JIEA 3PZMA 4AZ7A 2EBNA 2UY3A 4HPGA 3L4TA 2CCRA 1VEOA 4NZCA 4CUCA 2YIHA 4UOJA 4PMYA 4KRTA 3HN3A 2E3ZA 4HZ6A 2UY2A 1GQKA 4JKKA 4GI9A 4AIOA 5DMYA 3WNPA 2FGZA 5A69A 1K9TA 4R5EA 2YDRA 1H09A 2XFYA 4W8AA 3AHXA 1O7AA 1BSIA 2NSXA 5IFPA 4S3KA 4D6JA 1JF6A 3GTNA 5EFFA 1FH8A 4XZWA 1G1YA 5GNXA 1KGUA 2WAGA 5DF0A 1KQZA 5A6MA 1B30A 1QNOA 4Z2JA 3VGDA 1A47A 3NDYA 1BYDA 1A3HA 2CBIA 3WQ5A 4U2ZA 3W6MA 3ZSTA 3WBAA 3RDKA 3KL0A 1ITCA 3L2MA 4FMVA 2D24A 4UQEA 1I1WA 2W63A 4W7UA 3UESA 4W86A 4GQQA 5M5DA 1E43A 1VEMA 1ZJAA 3K8LA 2YL5A 4B15A 4P7NA 2VMFA 2XIIA 2ZX8A 2A3AA 1V0MA 1VENA 3WNMA 1PJ9A 1AQMA 4AEFA 2GDVA 1Q4NX 1R87A 3UCQA 1GW1A 4LGXA 5ABFB 3WBEA 4CKQA 4UOQA 4W7VA 1B3VA 2WKGA 3GH5A 4AZ6A 4CN4A 4D72A 3VIGA 1C90A 1XH1A 2W5FA 3PZTA 4MNMA 2V3EA 5I6SA 1GOOA 1GQJA 4M29A 4LYQA 3BMVA 5BCAA 4MJ2A 1HJSA 1CLVA 4IPNB 1JZ8A 3ARTA 4FLOA 5BRQA 1C8XA 1UA3A 1JYNA 3M6DA 2WWDA 2J74A 3MMDA 2X2YA 3POCA 2NW0A 4UQ9A 1E40A 4J3WA 4M82A 4IUGA 3AI0A 1OGBA 3ZJ7A 1IZJA 4TVDA 3AIWA 3UG5A 4J3UA 3RO8A 4P8VA 1W2PA 3CUFA 4MNJA 1KB3A 2D0GA 4ML4A 1CGTA 2PWEA 2DSWA 4WSJA 4HOXA 3AMLA 4MPKA 2CKRA 1EXPA 5A8OA 1W9DM 3UETA 1DEDA 1DWGM 1XH2A 2J7HA 5CLTA 1UZ1A 1K9EA 2EEXA 2X0HA 2VTFA 1CDGA 1VRXA 4HU0A 1JAEA 5JBFA 4LQ1A 2F2HA 1LQ0A 5KEZA 3OG2A 3BGAA 4ZE5A 4NF7A 3VGEA 4GINA 1K9FA 5AC5A 4GI6A 2X8RA 1UYQA 3SUTA 1WCGA 2WLZA 2QLYA 3THDA 4BS0A 1E3XA 3VIIA 5HOSA 3AIBA 1QW8A 3TTQA 2ZX9A 4PMVA 3RPMA 1NWTA 2F8QA 2AMGA 1F4HA 1PPIA 3WUFA 4TX6A 2JF6A 4WJXA 1JDCA 5CLWA 4P8UA 3NDZA 4UFHA 5DO8A 4RE4A 4H8UA 4J3SA 1SYTA 4CU7A 3ZQ9A 3FAXA 4BF7A 4Z2GA 3AYRA 3N04A 3ARRA 3AIRA 4B3KA 2YL9A 4PSRA 3AS2A 1XRVA 3TTYA 5HPOA 1ZBCA 1C3FA 4PMXA 4V2XA 3L2LA 2E9MA 2WNWA 2GDUA 4MADA 1JL8A 1V08A 1EDQA 2YL6A 3L4YA 4W88A 2DT0A 4JIEA 3MANA 2CKSA 1W3JA 4PMOA 3U5UA 1EOKA 3ZO9A 1J12A 3O2LA 3AHYA 4J3VA 4UFJA 3B8SA 5FD0A 1QI0A 2VT0A 1DP0A 1UWSA 2V38A 4UQCA 5CJ5A 5E70A 4BQ2A 1UWRA 2YBUA 1JI2A 3VIPA 3AISA 3ZM8A 3OA5A 2YL8A 3ARQA 7A3HA 1GNXA 2E9BA 2ZUUA 3PTKA 4JAWA 1J0IA 2XM2A 4FF5A 4UR9A 4OBRA 5D9MA 1O6IA 2XTKA 2WMGA 3T0AA 3WUEA 2E8YA 4Q22A 5BWFA 4D6HA 1KCKA 1SFSA 5AC4A 1IV8A 1M01A 1W9XA 1WO2A 5BXTA 2ZWZA 2TAAA 1BAGA 5HNNA 1HL8A 4P7RA 4EE9A 4FLRA 1JNEA 4IPLA 4MB1A 1E6SM 1GCYA 1V0LA 4MJ4A 4YHEA 3NUKA 1B2YA 3ZT7A 1BGGA 5CSUA 2GJRA 2O9OA 4MDOA 5AY7A 5M17A 4JHOA 3SUUA 1JZ4A 3ZT6A 1KXHA 4UCFA 2Y24A 1H4PA 1E15A 1H3GA 2VZSA 4EK7A 5I0DA 5E9AA 3II1A 3WUGA 1XC6A 3GXMA 3WMSA 4TTGA 4D6IA 3SUWA 4AD2A 1JD9A 3PZVA 1MW2A 2XVLA 4L4OA 3VO0A 1C93A 1PZ3A 1JZ5A 4B9YA 4CVWA 2DPEA 3FW6A 2PBGA 1R8LA 2BXZA 4AEEA 2V3DA 3OZPA 3PZUA 3W28A 3WEOA 1RH9A 1GONA 3NIYA 3ARXA 1Q6FA 4YHGA 1CPUA 3BCDA 3AXHA 1JNDA 2Y8VA 5D9PA 5DT7A 3WH9A 1V3IA 2A3HA 4AD4A 1KWKA 4H8VA 4Y7EA 5EBAA 3W29A 1RD6A 1MVYA 3ZSSA 1MW3A 2GK1B 3AXIA 1D7FA 3N11A 1I1XA 4B3LA 3WNNA 3VGHA 3MS8A 1UR9A 2GJPA 3K1DA 4UFLA 5CG0A 4M80A 1CXEA 4M1RA 4AIUA 1BTCA 3PZGA 3L4XA 1MFUA 8CGTA 3AOFA 5HXMA 1H49A 4X9YA 3ARYA 3IAPA 1OM0A 1V03A 3A4XA 3JUGA 3QGVA 1WP6A 5BROA 5IFTA 3W27A 5A3HA 2FH6A 1MQQA 3CHFA 1LL7A 3RM9A 4E2OA 1SMAA 1V0NA 1WKYA 1UKQA 1EO7A 1FOBA 3CZLA 3BC9A 2D1ZA 2WZEA 1BF2A 5CGMA 1W9UA 1TVNA 4DWSB 1JIBA 2OYMA 1NWRA 2BS9A 4KGJA 3WEMA 1KWGA 3UG3A 4DM2A 2J7GA 4FK9A 1FFQA 4W8BA 3DHPA 1UD2A 3VIMA 3IK2A 2XGBA 3RCNA 1ESWA 2JFEX 2PWDA 2XG9A 3W81A 5GPRA 3GXFA 2D22A 3AHTA 2V3FA 4KRUA 1EDGA 3ZMRA 2EPNA 1XHGA 2WMKA 3CUGA 1LG1A 3K8MA 5CPTA 3VM7A 3WNOA 1UD8A 1BQCA 3AROA 3TONA 3W82A 4HPHA 4AZCA 1EQPA 5HBFA 3OLIA 1U33A 3WSUA 1XSIA 3FHQA 5D8ZA 1HN1A 3U57A 4UQDA 3TTOA 5LA1A 4A4AA 1EQCA 3MO4A 3U7BA 2WM0A 3PZ9A 1E56A 4XB3A 5A2BA 4EAMA 1PX4A 2J77A 2Y8KA 1FFRA 4YN5A 4OBSA 4AZ5A 3WL0A 3W25A 3F4VA 2V3GA 1SR0A 2WLYA 3BMWA 3UR8A 2VL4A 3ARWA 3B9DA 6CGTA 4ZXOA 4H7VA 2BY1A 3FAWA 2ZUWA 3PZNA 1TA3B 2BV9A 3BAYA 1GOQA 3BAIA 3KL5A 1OINA 4UOZA 2DIEA 1CENA 1IZKA 1LL6A 1UKOA 2W91A 4TUFA 3UEQA 2VQTA 2WVSA 3AS1A 4QLKA 2G3JA 2F61A 4JCLA 4N0RA 1WNOA 3TTSA 1UA7A 1QI2A 3VDAA 2J7BA 1C7SA 1WZLA 2OYLA 2PWGA 4HTYA 5I5RA 4J7RA 4Z2IA 1H11A 3IANA 4UZSA 1DWIM 3QR3A 2ZUSA 1F4AA 2BVYA 5A6BD 4EANA 1UR4A 4HA3A 1UQZA 4GXPA 2XM1A 1NWSA 4PBGA 2DT3A 3N1AA 4W87A 4D1IA 3T08A 3S2CA 4KWUA 4HMCA 2WWCA 5ABFA 4PMNA 1G01A 4QFUA 1UKSA 2FH8A 3AZRA 1HL9A 2BY0A 3ZJ8A 3AQUA 1TG7A 3SUSA 5I24A 1US3A 2UWFA 3RJYA 4OKDA 1UD3A 2WMIA 4WLCA 1V3JA 4RE3A 4MNKA 5LYRA 2YBTA 1JZ6A 1EGZA 4CCCA 5I2UA 3AICA 5KZ6A 3WNKA 3CZKA 3N17A 1CLXA 1JAKA 3LMYA 1XSJA 5BXSA 4HMEA 2E0PA 3B9EA 1RP8A 1WZMA 3SUVA 2VUYA 1CNVA 1JYVA 1V02A 3IJ9A 5D8WA 2V5DA 3SCWA 4BZYA 1KXTA 1J01A 2WHMA 2BHYA 1MWOA 4QCFA 2CBJA 1BVZA 4CU8A 1NP2A 3MUAA 4PN2A 4M56A 1GQIA 4M24A 2QF8A 1QHOA 3RM8A 3FNDA 2WKLA 5DEZA 5FOOA 1W2VA 2VX4A 1JDAA 1V6VA 1UD5A 4CD4A 3E1F1 3VDBA 2O9TA 2OWCA 2XVKA 3U7VA 3EDKA 2VX6A 2XUCA 5M3WA 2GUYA 4AIEA 2EPLX 3HU7A 3VD7A 3VDCA 4B9ZA 3BSHA 4H04A 5GQBA 4UQAA 3SCSA 3MUY1 4JL2A 1M7XA 1Z32X 2QPSA 4PTVA 3ALFA 2UY5A 1BPLB 3D3AA 1QNSA 3M46A 1JI1A 1FP9A 3WENA 4AXNA 4GI8A 3FY1A 2J78A 3WFLA 1DWAM 3ZOAA 1BYAA 2YA1A 4LYPA 3WH7A 2DSUA 2ZXAA 1HP5A 4NRRA 3AMKA 2WC3A 2WMIB 1Q6DA 4ACYA 3VIHA 4W89A 3T2OA 4P8WA 3VILA 2VRKA 2EPOA 3WF2A 2FHFA 1JZ7A 1OCQA 3WL1A 1PZ2A 1GOIA 2Z1KA 1OT2A 3WDJA 1HJWA 5BYWA 3QOMA 2EJ1A 1HKJA 2XVPA 2CNCA 2BHZA 3DYPA 4MAVA 1S46A 2BXYA 2VX7A 1BG4A 3K4DA 1V6XA 1E5JA 1HVXA 1KXQA 4MNLA 1QHPA 2MANA 1OB0A 2C8NA 4FLSA 2A3EA 3MKKA 8A3HA 1KR1A 3QHOA 2WHLA 1W9PA 3EDFA 3MSDA 3BH4A 3WDRA 2GFTA 4U33A 3ZIZA 2E4TA 4W93A 3UERA 3CZ8A 3CO4A 5AYBA 4Z2HA 3WD0A 1R7OA 1JGIA 2EPMX 1VF8A 3KL3A 3NSNA 1ISWA 1L8NA 4OUEA 1U30A 1KFWA 1WPCA 1XYZA 3VGBA 2VR4A 2GSJA 1VFFA 2A3BA 3WNLA 2RGLA 3MU7A 5E6YA 1CYGA 1E0VA 3EBVA 1JG9A 2J4GA 2WYSA 3AHVA 4M81A 1JDDA 3PHAA 1GHRA 4D71A 1V6YA 4BCEA 1JZ2A 1UH4A 5I3DA 1J18A 5JBDA 3DYOA 2BVDA 1PAMA 1PX3A 2DT2A 3VNYA 1UR0A 4HU8A 5E0FA 5A94A 1LWHA 4AY1A 3RMEA 1NP0A 1VEPA 2OSXA 1CZ1A 5FCZA 3HMCA 5E0CA 3CZEA 1V3HA 4AW7A 2WSKA 2ZICA 3WQWA 3IAQA 4NI3A 2DIJA 4PMZA 1QNRA 1WB0A 4P7QA 1TFVA 3EDEA 3PTQA 1W3KA 1MXGA 1QHZA 5DT5A 3LPFA 4JHZA 1GQLA 2CHNA 2GK1A 2ZIDA 3MSGA 3QHMA 4ZFMA 5CPSA 2X1IA 3CUHA 1OWQA 4QCEA 3VOCA 3W26A 1EA9C 4X0VA 4X0NA 2IXVA 3DYMA 4N42A 3OBAA 4BA0A 1HVQA 2VZUA 3AMGA 2CYGA 3VDHA 2O9PA 3VD9A 1H0GA 1Q6CA 3FN9A 1MQRA 3DC0A 4U5IA 2PF0A 1X6NA 4PYSA 2FGLA 1VB9A 1TR1A 3OGRA 3CH9A 1ISZA 4QLJA 4TVCA 1W1VA 1UUQA 2VNCA 1GPFA 1KQYA 2PB1A 4GZJA 5D9NA 4PUDA 3T0DA 2E8ZA 2ZUMA 2ZX6A 1QBAA 4WKHA 1DWFM 4U5KA 1U2YA 4GKLA 2D23A 4CN6A 3M07A 1QI3A 1UH3A 4DWSA 1HKKA 2J8FA 1B9ZA 2W62A 1W1YA 3B9AA 4UQBA 1ZL1A 1HF6A 1UWTA 2J47A 1WDQA 3DECA 3QOKA 4AISA 1UKTA 1VFUA 2G41A 2XJ7A 1ODUA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4B16 A;  4TVU A;  3VIK A;  1C7T A;  1UG6 A;  3OZO A;  4MB4 A;  3OIH A;  3F5K A;  3PZQ A;  2VI0 A;  1OIM A;  4ZE4 A;  5A8N A;  4AWE A;  1JZ3 A;  1ZBK A;  3T0B A;  3WN6 A;  1E4M M;  3MMW A;  3CIV A;  1G9H A;  4OIF A;  4AYS A;  2G3M A;  1E9L A;  1MQP A;  1UR2 A;  1OSE A;  5JIW A;  1ZS2 A;  3VU2 A;  3BAX A;  4EKJ A;  1ISV A;  3UG4 A;  2VC9 A;  5IDI A;  4NRS A;  1HP4 A;  1IT0 A;  1QNQ A;  2OSY A;  3WH6 A;  2XGI A;  2VX5 A;  3SUR A;  2GVY A;  4QAW A;  2ZWY A;  4GZE A;  1PX8 A;  3DHU A;  2CIP A;  5ECU A;  4F8X A;  1H1N A;  1JYW A;  2XIB A;  1KR0 A;  4UNI A;  2VQU A;  3G6M A;  2ZOX A;  4JFU A;  6A3H A;  4V27 A;  1CGY A;  3ZR6 A;  2E9L A;  3EDJ A;  5E6Z A;  5CSY A;  1EOM A;  2D0F A;  3BLP X;  2XVN A;  2BHU A;  4OJY A;  4IIS A;  1E73 M;  3AJ7 A;  2QMJ A;  3SCV A;  2OWW A;  1QVB A;  4WSK A;  1NAR A;  2DEP A;  5I77 A;  3SCN A;  1EHN A;  9CGT A;  4W85 A;  4CD6 A;  5I79 A;  1M53 A;  4J27 A;  2XWE A;  3CTT A;  1H0I A;  5CXP A;  1B3W A;  4E8D A;  3IJ7 A;  1J9Y A;  2GJX A;  3VTR A;  1JYX A;  4MB5 A;  5HDR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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