1W3LA

Endoglucanase cel5a from bacillus agaradhaerens in complex with cellotri derived-tetrahydrooxazine
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus agaradhaerens
publication title Structural, Thermodynamic, and Kinetic Analyses of Tetrahydrooxazine-Derived Inhibitors Bound to {Beta}-Glucosidases
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE 5A
total genus 121
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2004-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1w3lA00
5GNYA 1DWHM 4P7OA 1NOFA 1VBRA 3BLKA 3TOPA 1XV8A 1JD9A 4F8XA 2WLZA 3SUWA 5TD4A 3RO8A 1G0CA 2D0GA 4AIUA 4AEEA 4NF7A 3WIJA 1B9ZA 4U5IA 1EOKA 1DP0A 4AZBA 2VZOA 1HNYA 2VNCA 4M80A 1J0JA 2HVMA 1ISZA 1QOXA 2X1IA 2GJPA 4H04A 2WZIA 3CZ8A 2O9PA 3L4XA 7A3HA 2ZWYA 3EDFA 1PBGA 3VX0A 2NT0A 1KXVA 1E6SM 2OYLA 2ZXAA 3VNYA 5M17A 4B9ZA 3CUFA 1WDSA 4U33A 5BROA 2DQXA 4UZSA 3MSDA 3AHXA 3WKZA 2JIWA 2JIEA 2D0HA 2PWHA 2NW0A 3ZJ8A 3CHEA 3CZGA 2RGMA 1N82A 1UD5A 4PSPA 4X0VA 2A3EA 3PHAA 5BRPA 4F9DA 2GK1B 3ZJ6A 1VAHA 2VX6A 1JZ8A 1V3LA 2HISA 2J25A 3WD0A 3L4ZA 4AZ6A 3APGA 1XH2A 1B0IA 2XSBA 3I3DA 2V3DA 3T09A 2WWCA 3MS8A 4PYSA 1UH2A 3N11A 1BYBA 4RE4A 2DIEA 5EBAA 2XYLA 3AHYA 5E09A 3AQUA 4XZBA 1C7SA 3PTKA 1V08A 1HJUA 2OYMA 2EQDA 1HL9A 4NI3A 2A3CA 2E9LA 2WVVA 3K4AA 3UEQA 3BXWA 2YL9A 4PMUA 1UZ1A 2CCRA 3ZT7A 2E8YA 1OBAA 1H0IA 3WF3A 3ZJ7A 2DGAA 1FH9A 3CUGA 1O6IA 3CO4A 2FDMA 3WNOA 4XB3A 2DPEA 1M03A 2EPKX 2BVDA 5FOOA 1WZKA 2PWEA 1JXKA 3ZR6A 2VQUA 4HU8A 1EHNA 2ZXQA 2WHKA 3WSUA 3RM8A 1GOMA 3DYOA 3AHTA 2WZEA 3MV01 3UG4A 3RJXA 2ZX9A 2DT1A 3WH7A 5A2BA 1WE5A 5A6AA 4UQEA 3SCOA 2GFTA 1H3GA 2NSXA 2CIPA 3AICA 4E4PA 1SMAA 3WF1A 1AVAA 1GOQA 1ZB5A 4W8AA 5FKYA 2IXUA 1ODUA 5DF0A 4B15A 4AWEA 4JZ5A 3ARXA 1E0XA 3FW6A 3SEPA 3N9KA 2ZWZA 1JYVA 2FHFA 3AS1A 1GOWA 1CXFA 2EXOA 2J7FA 3SCTA 1LG1A 1SFSA 2ZX6A 4JHOA 1VF8A 1E0VA 1CDGA 3QHOA 2XGBA 2DEPA 2WCGA 4D6HA 5A6KA 2DSVA 2X8RA 3FHAA 1AQMA 1CGUA 2W61A 1UD4A 4ATLA 4JL1A 1XSJA 1MQRA 4W8LA 3ALGA 4P8UA 1UHVA 4PUEA 4H7VA 3MUAA 2BY2A 4TVDA 2XFRA 3BAYA 4A3HA 3SIMA 2VOTA 1R87A 4CU6A 1HKIA 4PTWA 2DSZA 2WC3A 2G3MA 4MAZA 4C7FA 2Y2WA 1GORA 4J3WA 4GIAA 2DT2A 4HMCA 1JZ5A 3QGVA 2ZXDA 2DDXA 3CUHA 1CTNA 4Y7EA 3T0BA 1FP9A 3B8SA 3VIJA 2D23A 4OOUA 4C7GA 1HL8A 2W91A 4AZHA 1GOKA 1CGYA 4Z2JA 3NSNA 4MDOA 1JNDA 1JIBA 4AIOA 5C8BB 4PMQA 3WFLA 2WHMA 4B16A 1IV8A 4CCDA 2CNCA 1E6NA 4M8UA 4PUDA 4Z2KA 1B31A 1ZBWA 4UNIA 3AOFA 1WZMA 4CN1A 3DHPA 2CKRA 4JIEA 3EDKA 1M04A 1WP6A 3PBGA 1DWAM 1NWRA 1XH0A 2V3FA 5ABHA 1EHAA 3F5LA 2D24A 4OBRA 3RJYA 3WELA 2VMFA 4MB5A 3TP4A 2IXVA 4MPKA 1E72M 6CGTA 1E55A 1QI2A 4CVWA 1EOMA 2ZE0A 1FFQA 2PC8A 1NOUA 4AIEA 1RPKA 5BXTA 4KGJA 1H1NA 4M56A 2FHCA 1DHKA 1PIGA 1MYRA 2F8QA 4DUWA 4CGTA 1UKQA 1EA9C 1B30A 4CKQA 4RL3A 1UKPA 3BGAA 1GVIA 3PZGA 4QDMA 4CD7A 1HKJA 2WB5A 1KXQA 4HPHA 4MNJA 2D3LA 3AFBA 4GI9A 5CSUA 2JFEX 1LL6A 2PI6A 3HMCA 4V28A 1NOWA 3CHDA 4J3TA 5LA1A 1BPLB 1FHDA 5F7UA 1GQLA 1VRXA 5A6SA 4C7DA 3VDHA 1WAWA 1XHGA 1CGWA 4UFJA 3B9AA 1W9VA 1JL8A 3KWXA 4HTYA 3S2CA 4ML4A 3VKKA 4LXFA 1E5NA 4TVCA 2J7GA 1QW9A 1UD6A 4N0RA 4PMNA 3F5KA 4HA1A 1QI4A 4Q7NA 4Z2IA 2XFFA 1NP2A 1WNOA 3T2QA 5HPOA 1JZ2A 5CXPA 2VZSA 1HJSA 3B9EA 5A6BD 3AS2A 5M5DA 1CPUA 5HDRA 1GHRA 2VZTA 1I1WA 1BGGA 2X0YA 2ZXBA 2VVSA 3L4WA 5E70A 1FHLA 2X0HA 3NDZA 5HPCA 4P8WA 2YA1A 1MXGA 2V38A 5BWFA 5C71A 1UR8A 1KCLA 1C92A 3TONA 4PEEA 4AC1X 2DIJA 3POHA 1W1YA 1JG9A 4E8DA 3AHZA 1TA3B 3UR7A 1KB3A 1NWTA 1KWGA 2W92A 3VIOA 2Y24A 1LJYA 4LGXA 5D9NA 3BMVA 1MFUA 1E6XM 1E43A 3GH4A 2UY3A 1GJUA 4IM4A 1E9LA 4P7RA 4GO9A 8CGTA 2ZX8A 1H09A 4L4PA 4AEFA 2DSKA 4ZXOA 2RGLA 4W85A 5CPTA 3W4RA 3ZQ9A 2X2YA 3W25A 1HKKA 1CENA 2XWDA 4WKHA 1QI5A 5A3HA 2F2HA 1K9FA 1LQ0A 4JHZA 2EPOA 3WL0A 3SCNA 2XHYA 1TG7A 4JFWA 2BHZA 2CBVA 2W4XA 1TFVA 4AMCA 3SCUA 1E4MM 3EMZA 3BAXA 2NT1A 3WF0A 3WQ5A 3BSHA 5AC5A 5DFAA 1R7OA 1UD2A 2JE8A 1V6WA 5HNNA 5KZ6A 4PCSA 3U57A 2VX7A 5HXMA 4F79A 2E8ZA 3L4YA 4UFIA 1LF1A 3T2OA 4RE2A 1E70M 2WVVB 3AZSA 3D3AA 3G6MA 2VRKA 4ACZA 3FAXA 4EK7A 1CWYA 1B3XA 4QLKA 3AXXA 1MW0A 1W3KA 4B3KA 4TX8A 9CGTA 2GVYA 2XVLA 2V5CA 3W38A 2PB1A 4LPCA 3T0AA 3M6DA 1G5AA 2WCAA 3CBWA 4QLJA 2WVTA 3LPFA 2VRQA 2EEXA 1JZ6A 2YA2A 3MU7A 3W81A 1GOIA 4S3KA 2UY2A 1V6YA 1KR1A 3MANA 3VGHA 3EBVA 3MUZ1 5LYRA 1E5JA 4H41A 4PRWA 5CSYA 1UR0A 1E4LA 4URIA 1CZ1A 3NCOA 4WF7A 1GNXA 1HJQA 2J7EA 4WK9A 1J9YA 3GNPA 4WSKA 3ZJKA 1Q4NX 3ZM8A 4RE3A 2ZUUA 4AZ5A 3MV11 3VDAA 4FF5A 1VFMA 2ESCA 2V3GA 3GZAA 1OT2A 3AIRA 3QR3A 1GQJA 1UR9A 2VZVA 2WHLA 3N1AA 2CKSA 2WMFA 1QPKA 1GUVA 2YDQA 3U5YA 4U2ZA 1XD1A 1QNSA 1K9TA 1LWJA 1BYDA 1E71M 3KL0A 1QHZA 1QNQA 4GZJA 3SUTA 3OGRA 4AZGA 1E3ZA 3M07A 2OYKA 2VC9A 1E4IA 1VENA 4R5EA 5HOSA 1ZBKA 3AMGA 4CD8A 3WDJA 5I0DA 3ZSTA 5ABFB 1C8QA 4HOWA 1OIMA 4LYPA 3N12A 5EFDA 4XUYA 1KQZA 4PTVA 4YPJA 3VD9A 4HA4A 4AD5A 5E6ZA 4W7WA 3WDRA 3NSMA 1PJ9A 3MUY1 1KQYA 2EPLX 1H49A 2G3IA 4PCTA 3ARWA 2E9MA 4ZXLA 6TAAA 5EMYA 2J4GA 3THCA 1XRVA 3VNZA 5I3DA 3WNLA 3AYSA 2J8FA 1D2KA 4M1RA 2J7BA 2J7DA 2YLAA 1H0GA 4X0NA 2ZX7A 1CYGA 4H2CA 1V3HA 1F4AA 2WXDM 2XPKA 2QPSA 4H8UA 3IAQA 4JFTA 1H11A 1NP0A 3GXMA 3II1A 2W66A 4ATWA 2XVKA 4NRSA 2GDVA 3CMJA 4AYSA 2GUYA 2VR5A 1UH4A 4W84A 4EE9A 3OG2A 2CEQA 3TTOA 5AY7A 3ZR5A 1J12A 5GPRA 4P8VA 1E1FA 5BXSA 3NDYA 3WEZA 4W89A 3RM4A 3QHNA 3A4WA 3WQVA 4U5KA 1I75A 1BQCA 4W8BA 2ZUWA 2VCAA 1BHGA 3WQWA 5IHSA 1D3CA 1FFRA 1W9BM 4IUGA 4U31A 3UG5A 2J74A 2O9OA 3OA5A 1CGVA 5IDIA 4F9JA 1C93A 4JAWA 1S46A 3GXFA 1UQYA 1EDGA 3AIVA 4GQQA 5A95A 5I5RA 1JZ3A 5A6LA 3LMYA 1A47A 4MB4A 1HF6A 3BC9A 1XCWA 2BY0A 3AIUA 1K9EA 3OLDA 1M53A 1VB9A 4BS0A 4OZOA 4TXEA 4NZCA 2TAAA 1EIBA 1VFUA 2D1ZA 1OSEA 1XD0A 1WPCA 2XVGA 1NWUA 5CG0A 2J7HA 4MTVA 5IFTA 2VUYA 2PWGA 4DM1A 2GSJA 4OUEA 1DWFM 3NUKA 3K46A 3VGFA 2J75A 3N17A 2WHJA 2BFGA 5M03A 4YHGA 1J10A 2G3JA 1QVBA 3MO4A 1VBUA 3KL3A 3GXDA 5A1AA 2ZOXA 2WMKA 1EQPA 1UG6A 3DHUA 1R85A 1UQZA 1CGTA 1GPFA 1PX3A 2ZX5A 4HA3A 2YJQA 1V3IA 4QCFA 2WMHA 2WM0A 4CVUA 1W1TA 5AC4A 2EPMX 1HVXA 2A3HA 1E56A 3VIKA 1JF6A 3CHFA 3ZMRA 1HP5A 4UOJA 4NRRA 4CD6A 1HIZA 4DWSB 5FL1A 2VI0A 1C8YA 3AZRA 3W53A 4HP5A 3CUIA 3SCPA 1R86A 1KBBA 5A8QA 1U33A 2WLYA 4IPNB 3WDPP 2OLHA 3PZ9A 3WF2A 2WMIA 4GZEA 2A3AA 4QCEA 2BY1A 1UA7A 1VIWA 5IXEA 3CLWA 4YN5A 4IISA 2BVYA 3AI0A 4AISA 2XGIA 2YL6A 3ARUA 4P8XA 2CERA 3HJEA 3EMCA 1XC6A 4PN2A 1LG2A 3NYDA 2GJXB 4WKFA 4LYRA 4H8VA 3OZOA 4HOZA 5JIWA 3GTNA 1MW2A 2BV9A 2VR4A 4UR9A 1E0WA 4CCEA 4H8HA 1OCQA 2UY4A 4JKKA 1J0ZA 2XUCA 5I6SA 2VX5A 1FH8A 1B3ZA 3DYPA 1V3MA 5ECUA 1TR1A 5ABGA 1E6PA 2PWFA 4UFLA 4GI8A 2XVPA 4JFSA 3CIVA 3AYRA 1OINA 4J28A 3ZIZA 1IZJA 3ARRA 2WPGA 4PTXA 7CGTA 1Q6FA 3A4XA 3RILA 2E40A 3VGDA 3W29A 4MNKA 1A3HA 2WSKA 1QNPA 2G41A 2WBGA 3DC0A 3G6LA 4BQ3A 1L0PA 3ARSA 4UQBA 2OSXA 1XH1A 3WH9A 3OIHA 4PMXA 3WMBA 2VCCA 1TVPA 1V3JA 5GQBA 2YA0A 4AD4A 1VFFA 1V6VA 2YDRA 3WD1A 1QHOA 4PBGA 4EAMA 3TTYA 4ZENA 1BVNP 5LA2A 2WYSA 2Y8VA 1AMYA 4U3AA 2BXYA 5KEZA 1MQQA 3I3BA 3BSGA 5GNZA 5CJ5A 3RDKA 4PMRA 1KGWA 2AAAA 2FGLA 4R27A 4W86A 3EDDA 3CZEA 2UY5A 3W24A 1JYWA 4K68A 3VX1A 4ACZB 2J62A 5E0CA 1YHTA 2G4FA 3EDJA 3CTTA 4OKDA 1KFWA 4TVUA 2O92A 2XM2A 4FMVA 2BNJA 2WWDA 5A94A 3KEHA 2G3NA 4BQ4A 1E4NA 4UQ9A 1JAEA 4DUVA 1UYQA 3PTQA 3WBAA 3VVGA 1BLIA 2VVNA 3W28A 4AXNA 1YQ2A 2CYGA 4OOZA 2GJRA 1WO2A 4J27A 3WNMA 1BG9A 1OGGA 4X9YA 2CITA 3ARYA 3QOKA 4DWSC 1WDRA 2WANA 1EXPA 2VL4A 3WUFA 4ACYA 1LL4A 3ARVA 1PPIA 2AMGA 4PTMA 1GW1A 1X6NA 3VIFA 4U2YA 2J78A 5BRQA 3RCNA 4MDPA 1CLXA 1JFHA 3MSGA 4D71A 3PN8A 4W88A 4D72A 1PAMA 1EDTA 1KCKA 2J47A 4PMZA 1EGZA 4GO8A 5BYWA 2YOCA 3RPMA 5BXRA 4AZCA 4Z2LA 1GQIA 1EO7A 5A8OA 1W32A 3ARZA 5A6BA 1V6UA 3N15A 1J0HA 4OIFA 1UH3A 2G8ZA 1GQKA 4M81A 2VTFA 4GXPA 1QBAA 1JI1A 3GDBA 1US2A 5I78A 2VT0A 3WD3A 1XCXA 3WQ4A 1UA3A 3ARQA 1EH9A 1HJXA 2JEPA 3O6AA 1Z32X 1U2YA 2VCBA 4P7NA 4U3CA 2JEQA 1Q6CA 3K1DA 3WH5A 1M01A 3BAWA 4M29A 2WK2A 4CD5A 5AYIA 1FOBA 1ISXA 1H41A 3IK2A 3WD2A 5FL0A 3OBAA 4KRUA 4CU8A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5GNY A;  1DWH M;  4P7O A;  1NOF A;  1VBR A;  3BLK A;  3TOP A;  1XV8 A;  1JD9 A;  4F8X A;  2WLZ A;  3SUW A;  5TD4 A;  3RO8 A;  1G0C A;  2D0G A;  4AIU A;  4AEE A;  4NF7 A;  3WIJ A;  1B9Z A;  4U5I A;  1EOK A;  1DP0 A;  4AZB A;  2VZO A;  1HNY A;  2VNC A;  4M80 A;  1J0J A;  2HVM A;  1ISZ A;  1QOX A;  2X1I A;  2GJP A;  4H04 A;  2WZI A;  3CZ8 A;  2O9P A;  3L4X A;  7A3H A;  2ZWY A;  3EDF A;  1PBG A;  3VX0 A;  2NT0 A;  1KXV A;  1E6S M;  2OYL A;  2ZXA A;  3VNY A;  5M17 A;  4B9Z A;  3CUF A;  1WDS A;  4U33 A;  5BRO A;  2DQX A;  4UZS A;  3MSD A;  3AHX A;  3WKZ A;  2JIW A;  2JIE A;  2D0H A;  2PWH A;  2NW0 A;  3ZJ8 A;  3CHE A;  3CZG A;  2RGM A;  1N82 A;  1UD5 A;  4PSP A;  4X0V A;  2A3E A;  3PHA A;  5BRP A;  4F9D A;  2GK1 B;  3ZJ6 A;  1VAH A;  2VX6 A;  1JZ8 A;  1V3L A;  2HIS A;  2J25 A;  3WD0 A;  3L4Z A;  4AZ6 A;  3APG A;  1XH2 A;  1B0I A;  2XSB A;  3I3D A;  2V3D A;  3T09 A;  2WWC A;  3MS8 A;  4PYS A;  1UH2 A;  3N11 A;  1BYB A;  4RE4 A;  2DIE A;  5EBA A;  2XYL A;  3AHY A;  5E09 A;  3AQU A;  4XZB A;  1C7S A; 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 3TON A;  4PEE A;  4AC1 X;  2DIJ A;  3POH A;  1W1Y A;  1JG9 A;  4E8D A;  3AHZ A;  1TA3 B;  3UR7 A;  1KB3 A;  1NWT A;  1KWG A;  2W92 A;  3VIO A;  2Y24 A;  1LJY A;  4LGX A;  5D9N A;  3BMV A;  1MFU A;  1E6X M;  1E43 A;  3GH4 A;  2UY3 A;  1GJU A;  4IM4 A;  1E9L A;  4P7R A;  4GO9 A;  8CGT A;  2ZX8 A;  1H09 A;  4L4P A;  4AEF A;  2DSK A;  4ZXO A;  2RGL A;  4W85 A;  5CPT A;  3W4R A;  3ZQ9 A;  2X2Y A;  3W25 A;  1HKK A;  1CEN A;  2XWD A;  4WKH A;  1QI5 A;  5A3H A;  2F2H A;  1K9F A;  1LQ0 A;  4JHZ A;  2EPO A;  3WL0 A;  3SCN A;  2XHY A;  1TG7 A;  4JFW A;  2BHZ A;  2CBV A;  2W4X A;  1TFV A;  4AMC A;  3SCU A;  1E4M M;  3EMZ A;  3BAX A;  2NT1 A;  3WF0 A;  3WQ5 A;  3BSH A;  5AC5 A;  5DFA A;  1R7O A;  1UD2 A;  2JE8 A;  1V6W A;  5HNN A;  5KZ6 A;  4PCS A;  3U57 A;  2VX7 A;  5HXM A;  4F79 A;  2E8Z A;  3L4Y A;  4UFI A;  1LF1 A;  3T2O A;  4RE2 A;  1E70 M;  2WVV B;  3AZS A;  3D3A A;  3G6M A;  2VRK A;  4ACZ A;  3FAX A;  4EK7 A;  1CWY A;  1B3X A;  4QLK A;  3AXX A;  1MW0 A;  1W3K A;  4B3K A;  4TX8 A;  9CGT A;  2GVY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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