1W3LA

Endoglucanase cel5a from bacillus agaradhaerens in complex with cellotri derived-tetrahydrooxazine
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural, Thermodynamic, and Kinetic Analyses of Tetrahydrooxazine-Derived Inhibitors Bound to {Beta}-Glucosidases
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE 5A
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus agaradhaerens
total genus 121
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2004-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1w3lA00
1OIMA 1V6VA 4CCDA 5A1AA 1JXJA 2DSUA 3AIEA 4MB3A 1J0JA 2YL9A 1NQ6A 1HT6A 2WKGA 4AZ7A 1OINA 2VZOA 4DWSC 1PBGA 3A3HA 1UKSA 3ZIZA 2WVTA 2WC3A 4FMVA 1CGVA 3GZAA 5A95A 3SCOA 1UWIA 3VX1A 4D6DA 2WC7A 1W2PA 4KRUA 2HISA 1TA3A 2FHFA 2G3MA 2UY2A 3ARSA 4CN1A 3PTKA 3N1AA 1QBAA 2XIIA 1E4MM 1CXKA 3ZOAA 3ARYA 1HIZA 3FHAA 4WIWA 2ZUUA 3MV11 3MKKA 2Y2WA 3IJ8A 1H49A 3VMNA 4DWSB 2XVKA 3GNRA 3QHMA 1UH3A 4S3JA 1VBRA 3K8LA 4YHEA 4PUDA 4MAVA 4F9JA 3WUFA 3NSNA 4F9DA 4GZIA 2XG9A 4DWSD 2DT2A 4GXPA 1OCQA 6A3HA 3AROA 1H41A 4ML4A 2YOCA 1UR1A 4K68A 4UQEA 1BLIA 2IXVA 4GO9A 1US2A 4LYPA 3AHZA 2VZTA 1JYWA 1QNOA 3L2MA 1JG9A 4P7NA 3WENA 3CUJA 1QNRA 1SYTA 1BAGA 3G6MA 4OIFA 3W0KA 1SR0A 4HPGA 2YL8A 5AY7A 2CYGA 2X1IA 4B9YA 5F7UA 1E3XA 3UERA 2VRJA 3HN3A 2J62A 2VRKA 4NRRA 3RM4A 4OBSA 5FL0A 5LA2A 1DWAM 4MTVA 4OKDA 1UWUA 5A3HA 2VZVA 3AIBA 2DH2A 4D72A 4GQRA 2ZUWA 1TMQA 2NSXA 2WKLA 3VDCA 1BGGA 4TUFA 2EPOA 5DFAA 5FOOA 2XIBA 4PBGA 2JF7A 2CBVA 1E4NA 3ARRA 2CCRA 5A8NA 2C8NA 3CZ8A 2QMJA 5CQ1A 3A4AA 1W91A 1W1PA 4GI9A 4U5KA 5M3WA 4ATDA 5IHRA 4GI8A 1B2YA 1RD6A 3AMGA 1NWTA 1JL8A 4MJ4A 4V28A 3CBWA 5JIWA 3WNOA 2BVYA 5HDRA 3UG5A 1WDRA 2WMGA 1BYBA 3SCQA 3VIIA 4QDMA 1ZBVA 2VX4A 1JGIA 1UA3A 2JALA 1VEPA 3RM9A 3W37A 3QOKA 2BNJA 1VENA 3PZQA 4PUEA 3VDHA 1GQKA 1HP4A 2QMKA 1KWGA 4MB1A 4HZ8A 3NJ3A 4PTWA 1QBBA 3U7VA 3APGA 1KQZA 4HMDA 2YIHA 2J7HA 4LYRA 1DWIM 5BXRA 2J74A 1RP8A 1ZBCA 4BZYA 2VRQA 1EHNA 2VCCA 5DT7A 4U2YA 1G94A 9CGTA 2O9TA 4P8XA 4F66A 3OLGA 1PIFA 1C7SA 1XSIA 1RPKA 5D4YA 2PC8A 1D2KA 2WYSA 3BLKA 1UH4A 1EDGA 2EPLX 2JE8A 1B1YA 1MQRA 1UKQA 1WB0A 4C7DA 3GH7A 1HKIA 4DUXA 1H4PA 3CMJA 1UKPA 1UR4A 2BY1A 2VQTA 4HOZA 3BAXA 2GJXA 4CN4A 3OIHA 2D3LA 3BAWA 1A3HA 2X0YA 3FAWA 3A4XA 5I24A 3PHAA 3VD9A 1S46A 1F4HA 1BG9A 2YBUA 2W5FA 2O92A 3WQWA 2EO7A 1MYRA 3UG4A 5A2BA 2XVPA 4PMRA 2CHOA 2WMFA 3EDEA 1HL8A 4NRSA 5CSUA 2W66A 3VGFA 1AQHA 2NT0A 2A3AA 3SCWA 3FY1A 1VFUA 1MW2A 3MMUA 4PSRA 1ZBKA 3VGGA 4QAWA 2XUCA 1EGZA 3WD3A 4EAMA 3HJEA 3A4WA 2XTKA 2DH3A 4AIEA 1W1YA 1E6XM 1GCYA 3VMOA 2UY4A 1E0XA 4QP0A 4PMXA 3T2PA 5EMYA 4UZUA 4P8VA 5CPQA 4YHGA 2VMFA 1KFWA 1MQQA 3AMLA 4GKLA 2WZHA 3EYPA 3VIFA 3F5KA 3AFBA 5IFTA 2VT0A 4J3XA 4UCFA 2V3EA 3CLWA 4U5IA 2PF0A 4AMCA 1W1TA 3PZGA 1HJUA 2PWFA 2ZX5A 3MUZ1 4HU0A 1TVNA 2VJXA 2YA1A 4Z2IA 8CGTA 3WUEA 1W2VA 2V38A 2A3CA 2ZUMA 1KR0A 4Z2GA 4Y7EA 2VR4A 2NW0A 4J3WA 2YDRA 3WD4A 1MXGA 3WF3A 1WZLA 1J0ZA 3AS2A 4MDOA 4MAZA 2VL4A 3MSGA 2EPMX 1K9TA 2EPNA 1CGYA 1NWSA 2Q8XA 3U5UA 1M53A 3WBEA 2J25A 1QNSA 4HP5A 1TVPA 2WMIA 2YA2A 4HMCA 2VI0A 4Z2LA 3SUWA 4C7FA 5A8MA 3WMSA 3K4DA 3I3BA 1WO2A 3NDZA 4W85A 1LQ0A 4B3KA 1QI4A 1XRVA 2BFGA 3VGDA 2J47A 3T0AA 2WCSA 3LPPA 3CIVA 1YHTA 2ZXBA 4W88A 3W29A 5E09A 1ITXA 2J8FA 1OM0A 1WZMA 3GBDA 5HOSA 1XH0A 4JAWA 1XCXA 2A3HA 4J3UA 1O6IA 4M1RA 3U5YA 1PAMA 1E73M 4B16A 2G8ZA 2ZXAA 5GNYA 1TE1A 1BYAA 3T2OA 4CKQA 4A4AA 1IT0A 1KXHA 1K9EA 1UKOA 4IM4A 3AHXA 4OOZA 2D24A 3BAYA 1GOOA 2QF8A 1V0NA 1F4AA 1ZJBA 3AIQA 1BG4A 4TTGA 4PTXA 4CU6A 1E0WA 1JAKA 3GDBA 4ATWA 3PZVA 3WQVA 4UOJA 1B3YA 3UG3A 1NP0A 3KWXA 1WDSA 3WDHA 4W86A 5A6BD 1UD5A 4XZBA 4HMEA 2OYMA 4GINA 1JFXA 1GZJA 3WH9A 4RE4A 4CVUA 2WK2A 4FLRA 5IFPA 2WBGA 3WF4A 3NSMA 2FH6A 4LQ1A 2XFFA 4W7VA 1V6XA 4QFUA 3CO4A 3L4WA 3VKKA 4AZIA 3VD3A 5I23A 4Q22A 1UUQA 4OBRA 4H41A 2J7GA 5CPSA 2VX6A 2WVVB 1C92A 5ABFB 3IK2A 1X6LA 1XD1A 1MVYA 2ZXQA 4JIEA 4AZCA 2D0FA 2XSBA 4TXEA 5A6JA 1IV8A 2NT1A 4W5ZA 3AMCA 5HBFA 3W38A 1GJWA 5DMYA 5A69A 4CU8A 2J7CA 3ZSSA 3LPFA 1ISVA 3MANA 2J77A 3WFLA 2G41A 1JXKA 3VD7A 3GH4A 4OJYA 1I1XA 5D9PA 4BS0A 3ZR6A 1ZS2A 4RL3A 3ZM8A 4JKLA 4TTUA 5E9AA 3BC9A 1BHGA 3EDKA 3TA9A 4UQBA 5GPRA 1PZ3A 1RH9A 2DEPA 4HA1A 1JYXA 3OGRA 3TTYA 4ACYA 1VFOA 1DEDA 2ZE0A 1CBGA 3SUSA 3W81A 4XV0A 3EDJA 1M03A 3IJ7A 2Z1KA 3PN8A 5AC5A 1ISZA 3OZOA 1V3JA 1FP9A 2D3NA 1LF1A 4JFTA 1E40A 4AZ5A 1KWKA 4QLJA 3VDAA 2VQUA 3N12A 4FLSA 1M7XA 3W28A 1XD0A 4J3SA 1DP0A 3M07A 4C7GA 3GH5A 5I0DA 4BQ4A 1HF6A 1DWHM 2WZEA 1EQPA 3POCA 1EOKA 2ZIDA 4KRTA 2ZOXA 4JZ5A 4URIA 4D6CA 3WNPA 2XJ7A 1B90A 1G5AA 4WK9A 3CZJA 4LX4A 5E70A 1LG1A 5A6MA 3OA5A 2E4TA 4W89A 2BV9A 2J7FA 1JI2A 4CN6A 2EEXA 3GNPA 5AYBA 3RO8A 3MSDA 4W7UA 4WJXA 4UQCA 1R8LA 3VGEA 1EA9C 3ZJKA 3WDPP 1EO7A 1PX8A 2JFEX 5A8PA 3WH8A 4WKHA 2JF6A 1QVBA 4JFVA 1V03A 2DQXA 4MJ2A 1QI5A 5ABEA 3ARPA 1W3LA 3OGSA 2XFRA 1LWHA 1W9XA 3L4ZA 4PMOA 5LA0A 3LPOA 2PWHA 1UWRA 3VIKA 3WMCA 1WPCA 4Z2HA 1C93A 2OYLA 4IISA 1JZ6A 3DHPA 1KXVA 2XWDA 5C70A 1E43A 4U33A 1UQZA 4HOWA 3T0DA 1WE5A 5CXPA 5ABGA 4CD8A 1W9BM 3AIRA 3KL5A 4GZJA 3IANA 1H3GA 1OBAA 2XFYA 5I3DA 2TAAA 2JIWA 3SCPA 5I79A 2VO5A 1E4LA 2CEQA 3AOFA 3ECQA 4JCLA 3AHYA 3CHCA 1E15A 1FA2A 1BFNA 3T08A 3QGVA 3O6AA 4YPJA 3A47A 3N13A 2W91A 3N15A 4CD7A 5KZ6A 3BMWA 2XGBA 3PZ9A 3SUVA 1KQYA 4R5EA 2B31A 5BXSA 1HKKA 3WEZA 3SUUA 1JYVA 2UY5A 3WDJA 4AD0A 1UHVA 1UR0A 4W87A 3IAPA 2DIJA 3AXXA 1NOWA 1TFVA 1ITCA 2WMHA 5IHSA 1Q4NX 4JFWA 3U57A 5A6KA 4WSJA 1BYDA 1Q6CA 1LLOA 2EJ1A 1FFQA 4TOQA 3GTNA 2WAGA 5JUVA 1QNPA 2WHKA 3VIPA 3L2LA 4GPNA 4M8UA 4A3HA 2VURA 3OG2A 4H8HA 5FD0A 2ZX8A 3W82A 3ARTA 2BY3A 1W9DM 2WC4A 2WMKA 2WBKA 1HJSA 3UR8A 1E0VA 3K8MA 1K9FA 4D6JA 1LL7A 3UESA 1XYFA 2DT1A 4ZXLA 4IPLA 4ACZA 3WL1A 2XHYA 2PWGA 1CXLA 3L4TA 4AZBA 3TONA 4MNMA 3FW6A 4L4OA 2BY0A 1TA3B 2ZX6A 3SCTA 4GO8A 2G4FA 3J7HA 4ZFMA 3SCVA 1IZKA 3PTQA 1GVIA 1PX3A 2CHNA 4D71A 4WF7A 2FHBA 5M17A 5CLTA 3LPGA 2G3IA 1GQJA 4NZCA 2MANA 3WN6A 4N0RA 1UYQA 2BXZA 1HKJA 5BYWA 1GHRA 3ARQA 3VM7A 4TVUA 1Y7VA 2YL5A 5BXPA 2CXGA 1H1NA 1VBUA 4J27A 1D3CA 1O7AA 4D1JA 5IXEA 4HTYA 5E0CA 1MW0A 4M82A 1B30A 2W67A 1RP9A 3CZGA 1E5JA 1J0YA 1OIFA 1PJ9A 2YDSA 5AC4A 4P8UA 4PMUA 1FFRA 3SCRA 4D6IA 1CXIA 2YLAA 3WQ6A 1WDPA 4B9ZA 1FH8A 1C7TA 1JNEA 3K46A 1I1WA 2WHJA 4XUYA 5BROA 2OYKA 1HX0A 4AD1A 2V3FA 2WVUA 4X9YA 4IUGA 5E6ZA 1FH9A 4D1IA 2VOTA 3VGHA 1G9HA 4Z2KA 4J3VA 4WSKA 4AIUA 1EOMA 5CPTA 2YA0A 3D5HA 1SMAA 3FXYA 1XCWA 3QHNA 4QLKA 3RDKA 2ZWYA 4ACZB 1QW8A 3WEOA 4QLLA 1MFUA 2WHMA 4EANA 1QW9A 5HPOA 3AZRA 4P7OA 1R7AA 1KR1A 2WSKA 1MW3A 4V27A 2GSJA 3M46A 1GOWA 3B9AA 4M81A 1OD8A 4AISA 5BRPA 3AHVA 3T0BA 1U33A 1UOKA 2WSPA 1W9UA 3RM8A 3DHUA 3VD4A 3VM5A 1AMYA 4JFUA 3AMDA 4AYSA 3DYOA 3L4UA 2W4XA 2HVMA 4HA3A 4PMYA 1ISXA 3PZOA 4NSBA 5BWFA 2J7EA 2W61A 1EXPA 3AI0A 1JZ3A 2O9RA 1Q6GA 3FAXA 5A6SA 3VD5A 1TCMA 3GYCA 3PZTA 4A3YA 1FOBA 4H04A 3BAIA 3MMWA 2ESCA 1R87A 1C3FA 3WY1A 2VX5A 1SMDA 5D9OA 1GONA 4AD2A 1IZJA 3ZT7A 2V3GA 3RJXA 3WQ4A 1V02E 1HL9A 3KL3A 8A3HA 1N82A 5FIPA 2W62A 1HNYA 7TAAA 2D0GA 2WZIA 4RE3A 5EB8A 1JZ2A 3QHOA 5EFFA 3AIWA 3GNOA 3N18A 1AVAA 2CPUA 5D9MA 5JIPA 2CKSA 5C8BB 1J9YA 1R86A 1VJSA 1BVZA 2WHLA 4H2CA 1V6UA 1JYNA 3WDQA 2OSXA 1OGGA 3KL0A 3PZUA 1ODZA 3BSGA 1J12A 2X09A 2WVSA 1H09A 3N17A 1J0HA 1C8QA 1V3HA 2GJXB 3ARVA 1HJVA 4X0VA 3WDIA 1LL6A 4OUEA 3W53A 2ZUNA 1CEOA 4QCFA 3MUIA 3PZIA 2QPSA 4P7RA 3UETA 3GXFA 1OT1A 1VJZA 3WF0A 2IXUA 1UG6A 3OLEA 1XGZA 1K6AA 3GXMA 1EO5A 2VTFA 4CD5A 3II1A 4HOXA 1H11A 1PIGA 1HJQA 1CNVA 3B9DA 1XV8A 4EKJA 3FHQA 2FDMA 4KWUA 3WMBA 1E9LA 1QI3A 1H0IA 2BHUA 1WKYA 6CGTA 5FCZA 1LJYA 3N11A 1H2JA 2X05A 1W1VA 2D22A 5DT5A 1UR9A 2UY3A 1UA7A 4H7VA 2J8GA 3SIMA 2CBJA 3CUFA 3WFZA 4TX8A 2CESA 3OZPA 4D6HA 4PSPA 4PMZA 2C0HA 2WWDA 1ZJAA 3AMKA 2ZX7A 2BVDA 2XVGA 3ARWA 4JL2A 4NI3A 3WKZA 3T09A 7CGTA 2E0PA 1A47A 3W4RA 3ZJ6A 1ODUA 4E2OA 2XSAA 1MWOA 3GXIA 3GBEA 1G0CA 4J3TA 3SCNA 5I77A 4PMNA 3BGAA 3WL0A 1CWYA 4LYQA 3NSXA 1HP5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1OIM A;  1V6V A;  4CCD A;  5A1A A;  1JXJ A;  2DSU A;  3AIE A;  4MB3 A;  1J0J A;  2YL9 A;  1NQ6 A;  1HT6 A;  2WKG A;  4AZ7 A;  1OIN A;  2VZO A;  4DWS C;  1PBG A;  3A3H A;  1UKS A;  3ZIZ A;  2WVT A;  2WC3 A;  4FMV A;  1CGV A;  3GZA A;  5A95 A;  3SCO A;  1UWI A;  3VX1 A;  4D6D A;  2WC7 A;  1W2P A;  4KRU A;  2HIS A;  1TA3 A;  2FHF A;  2G3M A;  2UY2 A;  3ARS A;  4CN1 A;  3PTK A;  3N1A A;  1QBA A;  2XII A;  1E4M M;  1CXK A;  3ZOA A;  3ARY A;  1HIZ A;  3FHA A;  4WIW A;  2ZUU A;  3MV1 1;  3MKK A;  2Y2W A;  3IJ8 A;  1H49 A;  3VMN A;  4DWS B;  2XVK A;  3GNR A;  3QHM A;  1UH3 A;  4S3J A;  1VBR A;  3K8L A;  4YHE A;  4PUD A;  4MAV A;  4F9J A;  3WUF A;  3NSN A;  4F9D A;  4GZI A;  2XG9 A;  4DWS D;  2DT2 A;  4GXP A;  1OCQ A;  6A3H A;  3ARO A;  1H41 A;  4ML4 A;  2YOC A;  1UR1 A;  4K68 A;  4UQE A;  1BLI A;  2IXV A;  4GO9 A;  1US2 A;  4LYP A;  3AHZ A;  2VZT A;  1JYW A;  1QNO A;  3L2M A;  1JG9 A;  4P7N A;  3WEN A;  3CUJ A;  1QNR A;  1SYT A;  1BAG A;  3G6M A;  4OIF A;  3W0K A;  1SR0 A;  4HPG A;  2YL8 A;  5AY7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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