1W3TA

Sulfolobus solfataricus 2-keto-3-deoxygluconate (kdg) aldolase complex with d-kdgal, d-glyceraldehyde and pyruvate
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
PEIITPIITPFTKDNRIDKEKLKIHAENLIRKGIDKLFVNGTTGLGPSLSPEEKLENLKAVYDVTNKIIFQVGGLNLDDAIRLAKLSKDFDIVGIASYAPYYYPRMSEKHLVKYFKTLCEVSPHPVYLYNYPTATGKDIDAKVAKEIGCFTGVKDTIENIIHTLDYKRLNPNMLVYSGSDMLIATVASTGLDGNVAAGSNYLPEVTVTIKKLAMERKIDEALKLQFLHDEVIEASRIFGSLSSNYVLTKYFQGYDLGYPRPPIFPLDDEEERQLIKKVEGIRAKLVELKILKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Sulfolobus solfataricus
publication title The structural basis for substrate promiscuity in 2-keto-3-deoxygluconate aldolase from the Entner-Doudoroff pathway in Sulfolobus solfataricus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-KETO-3-DEOXY GLUCONATE ALDOLASE
total genus 114
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.55: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate/2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate
pdb deposition date 2004-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1w3tA00
2WO5A 3DFQA 3MHUA 4NJGA 4M5PA 1KFJA 3TJXA 3VKJA 3P62A 1LM1A 5AHIA 3QQ0A 3KVMA 2NX3A 3CIWA 3SJ3A 2NUWA 5FEWA 2TSYA 1EP2A 3K30A 4PH6A 3NPXA 1ZENA 2RKXA 3S5ZA 5BW6A 4MZ1A 1U83A 4JN6A 3DKLA 1DQWA 3W7PA 3LV6A 3EX3A 4FX6M 4L4MA 3DAQA 2ZDRA 3ATZA 2HMCA 1QPOA 3E02A 3EXRA 5FF2A 3UD6A 4LVGA 2QCCA 3IIOA 3RNDA 4OBTA 1F2JA 3W74A 4C1LA 1WX0A 3QMRA 4PL1A 3ZS4A 4KFPA 3DFPA 2X1UA 1GVSA 5D33A 3PF3A 3UWZA 2P1FA 2H6RA 1MZHA 3QW3A 5D2TA 1SW3A 2VC6A 4IXXA 4MY9A 1M7PA 4BK9A 3W23A 2CFFA 2WJZA 1YXYA 5L9FA 2WPBA 3Q2DA 5F2LA 3S0CA 3W22A 4A22A 4CCDA 5KZMA 1A5SA 3ZR4A 3C2RA 2C6QA 5F4XA 2C14A 5E0KA 4JY8A 2QCHA 1C29A 2YW3A 2FTPA 2QCLA 4UFLA 3EX1A 5CPLA 1WOBA 3GIYA 3WJWA 3NL3A 3NDOA 2Y89A 1B9BA 2PRHA 4YCOA 3NA8A 3M5ZA 1LOLA 3M5YA 4JTIA 5A5WA 3SGZA 4ADTA 5F2MA 5KINA 4O54A 1RVGA 2IQTA 1JR1A 2A7RA 2AAMA 1KM0A 4E2BA 3GDKA 2FB2A 2ISWA 1KFKA 2H90A 4UNLA 5FEPA 1M7OA 4JYEA 2TRSA 4JYFA 4TU1A 4AF0B 1F74A 1LBMA 2QCDB 3FKKA 3W88A 4PL2A 1KTCA 2JGYA 1IIHA 3PB0A 3T7VA 1LBFA 1WV2A 1R2RA 4FNQA 4QM1A 3NQFA 5DXYA 4JXCA 3NM3A 5EBUA 4EWND 5E93A 3VNDA 1TPUA 4CQAA 3LI1A 3N34A 1S3HA 3PSVA 2EGZA 4O1DA 4BI6A 3DHFA 1TCDA 1VYSX 3FEMA 5EL1A 1JCYA 3WJYA 3G18A 3RU6A 4UTWC 5AC8A 3P81A 1XCFA 3EXTA 1SSGA 4LOCA 1LOQA 1DL3A 2CZEA 3SY5A 4O12A 2PE4A 4OWGA 2X2GA 3PC0A 4KFNA 5K3VA 4O53A 5D2VA 3G3DA 4Q4KA 5DBUA 4I9AA 2PRMA 1PVNA 1JUBA 3ANYA 4R53A 4AWSA 4S2BA 3T4CA 1BTMA 3EXSA 2H3BA 2VEIA 4OE7A 1PL9A 3JRKA 1SO3A 4CLMA 2ZZ2A 1VLWA 4O57A 4FB7A 1NSJA 1PHQA 3ZWTA 4RZ6A 1W3TA 4WUIA 2DJXA 4AVFA 5I3JA 5LNWA 1JCMP 2PURA 3QFEA 1T96A 4GNJA 3MYOA 2YYTA 3KXQA 4L4LA 2X1TA 1GG1A 4X22A 3W7KA 2ZRWA 4P61A 1BWKA 1HTIA 3ABRA 3IIPA 3UYCA 1FDYA 4RZ5A 1NAL1 1R47A 4DBDA 2J27A 3EWYA 2ZRZA 5FI8A 4UFHA 4DF1A 3H53A 4RR4A 1ALDA 2B7PA 3BGJA 3HG5A 3UWVA 1X1OA 2BSLA 5IM51 3SSJA 4JD4A 1SZGA 3NQMA 2E6YA 4WOZA 3FJLA 3G1YA 3WJZA 3OEXA 3MYPA 3OIXA 4FX7A 1FBAA 1QO5A 1Q6QA 3C3NA 4IQLA 3B03A 4NXKA 4NNBA 2R14A 4NXSA 2C0AA 4MZYA 4M6VA 3RFAA 1G67A 2JGQA 1LLZA 1LRQA 1W31A 5C55A 1SO5A 3CU2A 4NX0A 2V82A 4TMBA 1T0OA 5BMWA 1EWDA 1K3UA 3NXFA 4CQ9A 2E6AA 4ADSA 2XN1A 1K7EA 3QM3A 3OVPA 5C54A 3M43A 4K38A 1WDWA 3H55A 3W7QA 1D9EA 1XKYA 3L2IA 5D30A 5K9CA 2CU0A 4AHPA 4MFEA 4GUGA 1KLYA 3RF9A 1A53A 3SFKA 5I3FA 1UB3A 4I7WA 2A6NA 2QCEA 3TDFA 3TSMA 1MXSA 1ZJIA 1X1ZA 3OA3A 4PTNA 1IXNA 1Z41A 3GKAA 1AW1A 4E0CA 4DQWA 4Q32A 3UQNA 3UWWA 2V81A 3O05A 2A21A 2Z2UA 1KBIA 3G0SA 4CCEA 1L6WA 4UFJA 2DU2A 3NQ7A 3W7HA 1QWGA 4HKPA 1OFBA 4PCFA 3NOEA 3TSBA 2ZZ6A 1VJIA 5D02A 3PBVA 3LBMA 4ICNA 2GVJA 3LM7A 4RJEA 3UPWA 5LGZA 3G0UA 3NPUA 3NQ8A 3W7JA 4BWLC 3I7SA 1GTHA 4AWTA 4JTTA 1R2SA 1WYIA 3MP3A 3P60A 1AMKA 5AN7A 2NXGA 1QO2A 1LLWA 3W3OA 1G4EA 1OHLA 3W2UA 5D09A 1OFDA 1TPC1 3KVJA 4K36A 1MEWA 1KW1A 3G24A 1X7FA 4IPIA 3U8GA 1JRCA 3QMTA 1FY6A 1KM5A 1LRNA 3TQ0A 4ZZ9A 1OK4A 3SIZA 4UTHA 4JGDA 2ABAA 5HMSA 3Q94A 1SW0A 1H61A 1F05A 1DHPA 2ZZ5A 5FF0A 1H1YA 1ZAHA 4I7VA 4WXZA 1XUZA 1QAPA 2NLIA 3IRDA 1GOXA 3W76A 4K7VA 3W2JA 3W70A 3UWUA 1J2WA 2J88A 1I2QA 5CZSA 1OJXA 4IMDA 3BLEA 1P5BA 3EWWA 2GPTA 3FOKA 2QR6A 3QW4B 1KTNA 3LCWA 4N4QA 3T78A 1NFBA 3STEA 3A24A 4K37A 1VYRA 3NZ1A 3GR7A 3L5MA 1LDCA 4ALDA 2J6XA 1ZAJA 3OVQA 4ZQMA 4AF0A 2QCDA 3W6YA 5HULA 1U5JA 4MY1A 4M6PA 5AHLA 1G7VA 3O06A 3DKJA 3E9AA 4M6QA 3TXZA 4XBSA 4XQ6A 4Z1BA 2NXIA 4QNEA 3W07A 4O10A 3G1FA 3F4WA 3PUEA 5AC6A 2VFFA 3BVJA 2QJGA 4CNOA 2ZRVA 1KBJA 5K9XA 2YSWA 4A2SA 4LC6A 4MJMA 1O60A 3LB0A 4BFAA 1TQXA 3A22A 3PSWA 4HNNA 1FCQA 3DFNA 3EWUA 4RLIA 4DF0A 3VE9A 4LV9A 1VHCA 4IWWA 2VEPA 1MSSA 4JX5A 3RLUA 3O63A 3W7IA 3PR2A 5J5DA 4Q33A 2R94A 4NJHA 4I7UA 4Y9AA 2H8XA 5CG7A 4CNNA 3UWQA 1TIMA 3MW7A 1EP1A 1VGAA 2QUTA 5C2XA 1FWWA 4Z1CA 5AYXA 3DZ1A 2V5LA 4MLJA 4O50A 4Y96A 5K4XA 4O4VA 3M7WA 2HSAA 3LHVA 1E51A 2FFCA 3M1ZA 4R33A 2DORA 5U4NA 1SFLA 5K9DA 2Y7FA 3NQCA 4X9SA 2ZZ3A 4O28A 3GXTA 4NQ1A 3A23A 3BV4A 1JCJA 4FIRA 4O0ZA 1AL7A 3MUXA 1O94A 1GVQA 4PC8A 3W2LA 5EA9A 1IGSA 3W84A 2GUUA 2J9XA 2E5CA 1SO4A 3MI3A 1P0KA 1OF6A 1J4EA 4NJKA 3P8IA 1H60A 3EX4A 3LTPA 1EB3A 5F4WA 2H8ZA 3DXIA 4PA8A 2OT1A 3LXBA 3W1MA 3HGSA 3H54A 1FCBA 5CZ0A 4GWEA 1FXQA 4M7TA 4M7SA 3W1PA 3N3MA 4WXYA 2QEZA 3TSDA 3DGRA 4WY0B 2RHGA 3EB2A 3G1SA 2FJKA 1A5AA 2RDTA 4TX9A 2VFDA 3HIJA 2Y70A 4DPPA 2FQIA 4O0KA 3U2OA 2ZZ1A 5KZDA 2VELA 3N73A 1FDZA 4JTKA 4UTUA 2EAWA 4O4WA 5AHMA 1F5ZA 1NEYA 4JR5A 5G4EA 1IXOA 3MMTA 4LV4A 4E2DA 1ONRA 2Y7GA 1QDSA 3M16A 3A5FA 3S6DA 2Z0IA 1TPB1 3ABQA 1OX4B 4Z08A 4K39A 3W85A 3LBCA 5D32A 1H51A 1L6YA 3EX6A 3LTSA 2H3DA 1I4NA 2F84A 2QAFA 3C6CA 4IMGA 2CLIA 3BGGA 3SI9A 3IVTA 1YTDA 2CLLA 3N2MA 4FXSA 4H3DA 3KOFA 1DBTA 3LHWA 4Z1DA 3EWXA 2GJLA 3VCRA 3TXVA 3BLIA 5DELA 4UTTC 2X16A 5LHFA 1OYAA 3LX9A 4FXRA 2FLIA 3L0GA 5AHNA 3P80A 3DHDA 5F4SA 5HINA 3DENA 3IIVA 1HUVA 3W7NA 2QAPA 5G2IA 3HO8A 4WX2A 2X30A 2ISSA 2RDUA 1Q6LA 3OVRA 2XFWA 5D2XA 1WA3A 3CQ0A 2E6FA 1YADA 4MKNA 1KTBA 3KHJA 3W9ZA 2QCFA 4JTUA 1XI3A 1FCUA 4QAIA 1Q6OA 2G95A 5EPDA 3TW7A 3PVFA 5G5IA 3HMJG 2NV1A 3SECA 4UMCA 1B57A 1JQVA 2XN2A 3UXDA 2CW6A 1ZCOA 3MP5A 1FDJA 4WY0F 5BNKA 1SZFA 1ZAIA 1XBYA 3CEPA 4FHAA 2NX1A 1EPXA 3IIZA 4KFOA 1H5YA 2FDSA 2ZRUA 4IMCA 3NO5A 4ZVJA 2Y7EA 3QMSA 3QYQA 4UR8A 4Z0JA 2P0OA 1TTPA 2B7OA 4AXKA 1RV8A 3G3MA 3LHZA 1UASA 1OFQA 1ME9A 5K2ZA 2NWRA 1KM2A 3RLVA 3W1NA 1M5WA 1PHWA 3UWYA 1JQXA 3W7CA 2ZFAA 2V8ZA 1O95A 2QUVA 1EA0A 2A0NA 2NWSA 1F73A 3PULA 1SZNA 5LNVA 1WQ5A 3B8DA 4NJJA 4LNYA 4XWUA 3IGSA 1H1ZA 2ZA2A 4HN4A 4MJZA 4JIPA 3DI0A 3NAVA 4S2CA 4UTLA 1NVMA 3ZWSA 4ONVA 2BXVA 1N7KA 5HWMA 2GQ8A 3P8JA 2C1HA 5FF7A 3STCA 1SFJA 4MFDA 3W1AA 3OHIA 4QIUA 4AB4A 3G1HA 3T40A 5LZLA 3MO7A 4ORMA 5KITA 1EIXA 3THAA 1XM3A 2YCEA 3TMLA 1QFEA 1YYAA 2E6DA 3BO9A 3L67A 3LCGA 4IJBA 4DBEA 4LW7A 3C56A 4QISA 5C6MA 5G1TA 4O19A 4DPQA 3DI1A 2ZRXA 1JCNA 1N8FA 2Q3RA 1GG0A 4K6AA 3AJXA 2G5WA 4UFIA 5DLCA 1A5CA 2O7QA 2CLMA 4MZ8A 3TFCA 3NVTA 4OV4A 2VENA 1ZALA 3O16A 4ZQNA 3NPVA 3TC6A 3CWOX 4MVAA 3STFA 3W1XA 3BG3A 3ATYA 5LGXA 3G8EA 2B4GA 1P4CA 4N6EA 1UJPA 2OT0A 2OMAA 1YTKA 4A3UA 3YPIA 5EY5A 1TV5A 5FESA 3C4UA 4ZQOA 2E1DA 3NL5A 4FNSA 3GXPA 4G1KA 1JCXA 1W3IA 4WY0A 1W5OA 3S8HA 3GB6A 2YFNA 4R34A 3EWZA 2G96A 3O8AA 2WQPA 1QCWA 1G4SA 4LS1A 4DEFA 1WBHA 5HUOA 1GZGA 3NQDA 3MP4A 4JTJA 4ZL1A 3L0KA 2QDGA 2VXNA 3QC3A 1R46A 4XZ9A 1S5VA 3HBLA 3MI2A 5CSRA 4GJ1A 3L21A 3O07A 1W5PA 1O5KA 3GK0A 1M6JA 3LCLA 1GYNA 3QPYA 5IBXC 2ZCGA 3KX6A 3TIMA 1VZWA 5LHEA 3M0ZA 1OX4A 1VCFA 3E49A 5DBTA 3S1VA 3BW3A 5AYZA 3W86A 2V2DA 3LLDA 3A5VA 2I1OA 2DZPA 4RXGA 4XUGA 2UV8G 3TJLA 5EKYA 1BWLA 1EUAA 1TPVA 2YPIA 2KZHA 4LVAA 4RZ4A 3CTLA 5HR6A 1IIGA 3G1XA 5KSWA 4BWLA 4HNVA 2VFIA 4LY8A 2A7PA 2C18A 4TO8A 4IPJA 4O18A 3UY7A 4UTKA 3R13A 3B0PA 3LRLA 3L5LA 3PBUA 1VC4A 2NUYA 5BOOA 4QJ1A 7TIMA 3PB2A 3FKRA 2NZLA 3BW2A 3PBYA 1OABA 5AC7A 2WOQA 1Q6RA 3PY2A 1QOPA 2C19A 2DZTA 4NX5A 3MBDA 1S5WA 4O52A 3MBFA 3LXCA 2GOUA 3QEZA 1OYCA 4MYAA 2I9EA 3GDRA 1KA9F 3Q58A 1O4UA 1OYBA 1K8XA 4JY9A 5DCEA 3W7OA 3THQA 4ZMGA 5F1VA 1YDNA 5D03A 3SZ8A 5G2WA 2GVLA 1WXJA 2DP3A 3O6CA 4FNRA 3WFAA 5LNUA 1GVRA 4GUFA 3GYEA 3LRMA 4PEKA 1GJPA 4K7YA 1WAUA 1KM4A 1DJQA 2NX9A 2VFHA 3LCIA 1RD5A 3DU0A 2YFOA 1H7OA 2W0UA 2WNNA 3T44A 1XDLA 2Y7DA 4N9DA 3HOJA 5EMUA 5TBOA 3MWAA 6TIMA 4O1CA 3W1RA 4WJEA 5ABTA 4LUIA 3GVGA 3BG5A 4Y90A 3TFXA 1DQXA 1T99A 1SU5A 4NUWA 1VH7A 1G69A 4JDYA 4XKYB 5HWNA 3ZFHA 3STGA 1BEUA 1A50A 1UUMA 3M5XA 2DZSA 2F7FA 1ZFJA 2CLKA 5G4WA 2E09A 3L68A 3CB8A 3QRHA 3W1LA 1ICSA 1TPH1 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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