1WOAA

Structure of the loop6 hinge mutant of plasmodium falciparum triosephosphate isomerase, w168f, complexed with glycerol-2-phosphate
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYTGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLFAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of Unliganded and Inhibitor Complexes of W168F, a Loop6 Hinge Mutant of Plasmodium falciparum Triosephosphate Isomerase: Observation of an Intermediate Position of Loop6
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 93
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2004-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1woaA00
2B4GA 1R2RA 3MO7A 4ORIA 1KBIA 1OX6A 4LTSA 5ABTA 3O63A 5TBOA 1W1ZA 5CKSA 1VH7A 4JIQA 1W3TA 2C15A 1G7VA 2P1FA 4FHAA 4ZQNA 1H1YA 4A2RA 4A22A 3W87A 5D05A 4FX7A 3BG3A 1I2PA 4AHPA 4XBKA 4GUHA 3RK8A 1KM0A 1IXOA 1PVNA 5I3JA 2WPBA 4AWUA 1GG1A 2ZFAA 3HMJG 3AJXA 2FLIA 5G5IA 5F1UA 3GAKA 3TW7A 3A5VA 4IPIA 2RKXA 3N9SA 4UTKA 3ABSA 4YLWA 1NFBA 3B4UA 1BWLA 3NL6A 3BG9A 4M6PA 2QKFA 1M7PA 3BGJA 1RQHA 2NWRA 5I3IA 2BTMA 2J6XA 4BWLA 3LCLA 1S5VA 3DKLA 2CZ5A 2PRLA 2RDTA 1I4NA 1AL7A 3LRLA 4NJIA 5EL1A 4NZFA 1B3OA 4GNJA 1I2QA 3DXIA 4FXRA 3TC7A 2F84A 2VEPA 3LHWA 1TMHA 1SZNA 3PR2A 4AMAA 1SW0A 2BLEA 1XKYA 5DY3A 3DFNA 3GDKA 1C8VA 1FWSA 4DXVA 1G69A 3FKKA 4IXXA 1FXPA 4R7JA 4POCA 5DLCA 3NM3A 1EUNA 1HG3A 3G1SA 1GT8A 1KFJA 4QITA 4X22A 5KSWA 3CU2A 3W7KA 2C13A 1B9BA 5AN7A 1H7OA 4UR7A 1GEQA 2B7OA 1T8XA 3FKRA 2Y7EA 3QQ1A 4X3ZA 2YX0A 1IXNA 2P10A 1TPUA 1VHNA 5H91A 3DFQA 4LUJA 4LS1A 5BMWA 1YXDA 4FNSA 1LROA 1SZGA 4GXMA 4PL1A 5L9FA 2ZRXA 5FF2A 1ZHAA 4RXFA 1G4SA 3MP4A 1DJNA 3RFAA 1MXSA 4OV4A 2FB3A 3HPXA 4OBTA 5AHNA 3W2UA 3MYPA 3NL3A 3FOKA 1D3HA 4WD0A 4BI5A 5DXYA 5AC6A 3VE9A 3H54A 3NQGA 1PHQA 3HGRA 3G1YA 3GR7A 1SQ7A 5TQLA 1YPIA 5K3VA 1R2SA 2H3BA 1PCKA 1IF2A 1TPVA 5K7JA 5F2GA 4FX8A 3M5VA 1I2RA 3MHFA 3TAOA 4DBDA 4WOZA 2F7FA 1JCNA 4OHQA 3R89A 4O0ZA 3HGOA 1H1ZA 4Z08A 2DJXA 1SZFA 2V81A 3EXRA 4ICNA 1OK4A 4H6KA 1TTJA 4JTSA 1WXJA 3EWBX 2E6YA 1KLZA 2CZEA 4UFKA 1RVGA 3FJ6A 3TJXA 5K2ZA 4TU1A 3W7MA 2DZTA 3O07A 3PG8A 2V2HA 4AH7A 5A5WA 2Y6ZA 1ZAIA 2EPHA 3N34A 5I3FA 1TTIA 4ZL1A 4XTIA 4EF9A 4NJKA 1F76A 4RZ6A 3S5ZA 2ZDRA 4GJ1A 3TA6A 1LOQA 1JCMP 4HN4A 4QSHA 3KX6A 4CQAA 3L9CA 4BFAA 2GOUA 1GTHA 3MI2A 3VI2A 1HFBA 2Q3OA 1LOLA 4UTWA 4M19A 1TSIA 4AAJA 3GNNA 1SPQA 1L2UA 3E96A 1LRQA 1ZJIA 1LRNA 5HINA 3DAQA 5D2XA 5BRBA 2NXGA 5BW6A 6ALDA 1JRBA 4XUGA 2J9ZA 3NXFA 3H55A 2ZRWA 3L65A 3F4NA 4IX0A 1ML1A 3LDVA 1F6KA 1QO5A 3S5NA 3NL2A 1X1OA 1HO1A 4K36A 5LGZA 4UFLA 4LUIA 4UNKA 4H3DA 1KFEA 1A50A 2XN1A 3TQ0A 2PC4A 2KZHA 4QAIA 2ZRVA 4UTMA 1SO6A 2J27A 3K30A 3L66A 5LNRA 3I6RA 4FNRA 4JIPA 2G97A 3KRSA 1AW1A 3L5LA 5KTLA 4Y8FA 3PWAA 2X1RA 4UFMA 3KVLA 1U5JA 2V5LA 2GVJA 3W1PA 3P74A 1Q6OA 1C29A 2J88A 3R5EA 1T0OA 2AGKA 2NX3A 1IGSA 5AHIA 3EXTA 2E09A 5EPDA 2EAWA 3EX6A 3A24A 5G2IA 2WNQA 1ZFJA 3P81A 3PSWA 5F1VA 4ZQPA 1OFOA 4LVDA 2OX1A 4A29A 3P62A 5BNKA 4ORMA 3EX2A 3THQA 4O54A 2JBMA 2NUXA 2RDUA 2A4AA 3W9ZA 1JVNA 1WDWA 4MFEA 2QCCA 2GUUA 3PULA 3PG9A 4UC5A 3W71A 1OX5A 2VOMA 3LCIA 4IMGA 2DZUA 1LBMA 1DL3A 3MJYA 2YSWA 2VFDA 3G3DA 4ZQMA 3B0UX 3GKAA 3L21A 4XKYA 5CSRA 3W6YA 1KV5A 1DVJA 1QCWA 2QUVA 2NUYA 3EWZA 3PY2A 5HMSA 1QOPA 1M5WA 4RV8A 3S1VA 4WY0B 1L9WA 1GVOA 4Z1BA 1FUYA 4TMBA 1ZENA 4FIQA 3TW6A 1FBAA 3FIGA 3S5OA 1ME7A 4RK8A 2WQPA 2YZRA 4UMCA 3O06A 5T26A 5D04C 4JTFA 2JKAA 5LGXA 1SR9A 1TRIA 3BLIA 1O5KA 4X2RA 5FEXA 4EIVA 3LXBA 4IMCA 2Y70A 3DI0A 1YADA 3EWUA 4JTUA 1P5BA 2YPIA 3I7QA 5HULA 1GJPA 4NJGA 4ADSA 4WXZA 4IPJA 1ME9A 4GUIA 2R91A 2E68A 5D2VA 1OFAA 3M0ZA 3W1LA 3HGJA 3DFTA 3W2LA 1E51A 4L4MA 3NR0A 1SUXA 4AWTA 1V5XA 1MO0A 4LW7A 5C6MA 1RPXA 1J2WA 1NF0A 2E6AA 4Y90A 1I2OA 4AHQA 1JQXA 3RLUA 4UXDA 4HNTA 4S2CA 3GXTA 3LOTA 3B04A 3IGUA 4ADTA 3GXNA 3IIVA 3W1UA 3B06A 1H50A 4FX6M 5C55A 4MKNA 4AEOA 3LHYA 3NPXA 4UTTC 1UASA 5E93A 3NQVA 1QMLA 1X6UA 3CC1A 3P82A 1MEWA 3W7QA 3W76A 3OBKA 4QJ1A 4DPQA 1JCYA 2YR1A 1QDSA 1AK5A 2CLEA 4IOTA 5F4SA 2Z6JA 1ICPA 3NQDA 4ZVJA 4LVGA 2CU0A 2XN2A 3UPWA 1OJXA 4A21A 1R47A 2C14A 3S42A 3M1ZA 3U6WA 2YYUA 1JUEA 3UD6A 5K9CA 5DY2A 3C2VA 3LV6A 4JD4A 3LCXA 1YXYA 1H60A 2A7RA 2QCEA 2WNNA 3UWVA 3NZRA 3O1NA 1FDZA 3NPVA 1B4EA 1EUAA 1LYXA 4KFOA 2GVLA 1ME8A 2VEKA 4LC8A 1W54A 1XUZA 3LHTA 3JRKA 1SFJA 4UR8A 4DELA 1OHLA 1XUUA 3EWWA 1FQ0A 4HPXA 5U4NA 2CZDA 1NVMA 2R8WA 2NXIA 2B7NA 4RZ4A 3IIXA 3M47A 1OFEA 4EWND 3ABRA 3HB9A 1VRDA 3A9IA 1OX4A 3NNTA 4M6VA 2R94A 3OG3A 2GVGA 1VR6A 2QJGA 2ATSA 1FCQA 3USBA 3HGSA 4BI6A 1HTIA 3SI9A 1BWKA 4QNWA 5G4EA 2VXNA 4DQWA 4RCXA 3ZFHA 2OJPA 4EF8A 2C19A 1W31A 3DFSA 1JRCA 5HWNA 5FESA 3CIXA 4LY8A 4MYXA 3ELFA 4GUGA 4N9EA 3HIJA 4BR1A 1SFLA 4RXGA 3DBPA 2NV2A 3C8FA 5A8GA 2WO5A 3NDOA 4M5PA 4MPQA 1K8YA 2X1TA 3DI1A 2UV8G 4PC8A 2E5DA 4YCPA 1QPOA 3CM4A 4FNQA 1P0KA 1N8FA 1OYCA 3DGRA 3PBWA 3PUDA 3ATZA 1QFEA 2CLFA 3G1FA 5EKYA 1OYAA 2G95A 4ML9A 1G4EA 4MUZA 4GUFA 1V7YA 1UUOA 3MYOA 3TCEA 1MEIA 2DZWA 1TREA 2DJLA 1OABA 4XZ9A 5D33A 3KAOA 2C6QA 3W74A 4HSNA 1H5YA 4BI7A 4FXSA 5LHFA 1SSDA 1W56A 1YPFA 1YLVA 2ZQ0A 1RQEA 3TSDA 1GZGA 3VFLA 1GOXA 1SO5A 2ZRZA 3UNDA 2YXGA 5CZSA 2QCGA 4FO4A 3EKZA 1L6YA 4WY0A 1LORA 1VLIA 5IBXC 4LS2A 1MZHA 2A1YA 4JYFA 3FJLA 2I14A 3W22A 1VC4A 4CNPA 3QZEA 4O16A 3SGZA 2ZCGA 1XM3A 3O15A 3GX9A 5D32A 3R12A 4OT7A 4WUIA 4O4WA 1T99A 1L6SA 3WK1A 1P1XA 5LZLA 1QPQA 1KV8A 4XQ6A 3CB8A 1GTEA 4I7UA 2TSYA 3CLMA 2W0UA 2ALDA 3G1HA 3CT7A 2Y89A 1Q6LA 3UYCA 2CFFA 3G3MA 5F2IA 3M5YA 4CNNA 1XCFA 3LRKA 1W5MA 4UTIA 2FJKA 4GC4A 2Y7GA 4MIMA 2E5CA 3UWQA 2GJNA 4J9JA 4LNYA 3TH6A 2CLIA 4LC6A 2GPTA 3QYQA 3M7WA 3LXAA 2V82A 1F5ZA 4OWGA 3NQCA 2RDWA 3NGJA 2TMDA 3WK2A 4MYAA 1S5WA 3Q2DA 3HPSA 3WJYA 4Y6GA 3F4WA 3W2KA 3PBUA 2Y88A 5J5DA 1OFBA 3TV8A 2ZTKA 5BOOA 3PB0A 2Z1BA 1R46A 1PE1A 4WOQA 3OVRA 1XFBA 1WAUA 2YGYA 1XI3A 3G0SA 1SO4A 3LTYA 2TRSA 3MUXA 4JDBA 3P60A 1X7FA 2NWSA 4IX2A 3EB2A 2OCZA 3A23A 3D0CA 3TDFA 4P2VA 4O57A 3E0IA 3SECA 4MZYA 5L6UA 3W86A 3BGGA 4KWVA 2E6FA 4WZHA 2DZXA 4O52A 4Y9AA 5AB3A 4GFSA 1B57A 4IMDA 2Z2UA 4AF0B 1SU5A 3LGEA 3PM6A 5DXXA 3QFEA 4MY8A 3SIZA 3OHIA 3FA5A 3O6YX 3CIWA 3I68A 4O28A 4MY9A 3LHZA 1KLYA 4PODA 4NXKA 5G4WA 3W1QA 3GAYA 2DP3A 1JQVA 1QR7A 1VYPX 4Z0SA 1T96A 3R2GA 1YYAA 3P7YA 3S1UA 3CTLA 5J5RA 4K38A 1ALDA 4TIMA 4EOUA 5C54A 2A21A 1LDCA 4N4PA 1DQXA 1K8ZA 2YDAA 1EIXA 1JUKA 3NQ6A 4K8HA 1A5CA 3KVJA 4NX0A 3IVTA 2WJZA 4JY9A 2X30A 1EWDA 1TPWA 2ZYFA 4TMCA 4LU0A 3A22A 1OK6A 2V0TA 3ATYA 3W73A 4JTEA 1NSJA 1GVRA 3GYEA 4JX5A 3W7GA 1H7RA 1I45A 3KVMA 3W7IA 1S3HA 2VFFA 4MLRA 4R33A 2A0NA 3T7VA 1WBHA 4GBUA 2J9XA 4ZMGA 1MSSA 1TQJA 4AVFA 1LLWA 2CW6A 3G1XA 4QM1A 2ZZ7A 4NT0A 1JR1A 2ZZ1A 2GQ8A 4UTHA 8TIMA 4XWUA 2PE4A 2Q3RA 2QF7A 3GLCA 5EY5A 1FCVA 3BW3A 3NM1A 5E1QA 6TIMA 1PV8A 3UPBA 2QCDB 4OV9A 3S1XA 3TFXA 2WNZA 3W23A 1TPEA 2QUUA 1KFLA 1A5SA 1TTPA 5K4XA 3UY8A 5D02A 2VFHA 2BSLA 3E02A 3S0CA 5AYXA 3ANYA 3TSMA 1IIGA 2ABAA 4JTJA 2V2CA 1G4TA 2CLHA 3RLVA 1EB3A 3HG3A 3RF9A 1F74A 2X1SA 2Y61A 1FDYA 4Q32A 3HBLA 1WYIA 3UZ5A 2VC6A 3WJZA 3CWNA 3GNDA 1M7OA 5AYYA 4O19A 4DBEA 3BLFA 4O18A 1UJPA 2Q8ZA 2QUTA 4NJHA 4LWWA 2NZLA 3P8JA 4DO4A 2DU2A 2Q8LA 2BWGA 2WSYA 5F4XA 1F73A 2H90A 3P5ZA 5C5YA 1WOAA 4CCEA 4PEKA 3WFAA 3HJZA 4MY1A 1FWNA 3C52A 1VS1A 3W3OA 1CW2A 1VYRA 4UFHA 1R2TA 3U2OA 3LHUA 3P84A 4K6AA 1N7KA 1VYSX 3MBDA 5CZTA 2E77A 3NQ8A 4YL2A 3MMTA 4HSOA 4XBSA 3W75A 1P0NA 4JTKA 3CPRA 3G1AA 4JY8A 1QO2A 4A2SA 5CPOA 5CZ0A 3N2XA 4O8RA 5FEZA 3IRDA 4LRSA 3QSRA 3W1MA 3MP5A 3QF0A 4DF2A 3TAKA 4UTJA 4O10A 5AC7A 1L6WA 3P67A 1LM1A 4FNPA 1FWTA 3W1AA 2BX7A 3NAVA 4CCDA 1Z42A 4RJEA 3QSTA 4JR5A 4O13A 4FEZA 1TV8A 3UWZA 1D9EA 1K02A 2QEZA 3HQ1A 1YDVA 3W7PA 3QW4B 3KXQA 3P8IA 3TKFA 2JGYA 2QDGA 3KFTA 1GWJA 1H61A 5HUPA 4UIOA 2ZZ3A 3W88A 4WJEA 4YCOA 1W5OA 1RZMA 3GR8A 4N9DA 1EA0A 5IM51 5DCDA 3OEXA 3M44A 2YFNA 4HNNA 3W1TA 2Y85A 3QMSA 4L4LA 1VCGA 3KVKA 3GXPA 4N2YA 2O7QA 1NEYA 5DBUA 2A6LA 1VQTA 3BVJA 3WK0A 4O0KA 3E9AA 2XFWA 3TIMA 2PURA 3M5XA 5DELA 1JJKA 1O94A 2WSRA 3NOEA 5LNVA 5LHEA 4JYDA 2ABBA 2E6DA 3NA8A 3NVTA 1W5PA 3T4CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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