1WV2A

Crystal structure of thiamine biosynthesis protein from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
243
structure length
230
Chain Sequence
TPFVIAGRTYGSRLLVGTGKYKDLDETRRAIEASGAEIVTVAVRRTNIPPDRYTILPNTAGCYDAVEAVRTCRLARELLDGHNLVKLEVLADQKTLFPNVVETLKAAEQLVKDGFDVMVYTSDDPIIARQLAEIGCIAVMPLAGLIGSGLGICNPYNLRIILEEAKVPVLVDAGVGTASDAAIAMELGCEAVLMNTAIAHAKDPVMMAEAMKHAIVAGRLAYLAGRMPRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of thiamine biosynthesis protein from Pseudomonas Aeruginosa
rcsb
molecule keywords Thiazole biosynthesis protein thiG
molecule tags Biosynthetic protein
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 63
structure length 230
sequence length 243
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.8.1.10: Thiazole synthase.
pdb deposition date 2004-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05690 ThiG Thiazole biosynthesis protein ThiG
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1wv2A00
3LRLA 1I2NA 4KWWA 2V8ZA 3STEA 2ZRVA 1HTIA 4BI5A 4TMBA 2R8WA 1KTCA 3UXAA 2CZEA 1Z41A 1OFDA 1S3HA 4Y6GA 2I14A 2GQ8A 4ADSA 4O16A 1X7FA 3M16A 2YSWA 3LTPA 4UTTA 4RCXA 1JVNA 1MO0A 1LCOA 4IMDA 1GVQA 2E77A 2QCNA 1H7OA 3RU6A 5AC6A 4LTSA 3UNDA 5AHLA 3TXZA 4E2BA 4RX0A 2CZDA 3NQDA 4IX2A 5TBOA 4DXVA 1NVMA 3A22A 1XDLA 3I7SA 3TE9A 4O15A 1TTJA 5FI8A 3QSRA 3DFOA 5AOUA 2ZRUA 3BK0A 4QQ3A 3VE7A 1EIXA 3W1XA 1Z42A 5D33A 5DBTA 3FJLA 3G24A 3WK1A 1XXXA 2VC6A 3G8RA 1TPVA 1OHLA 1OF8A 3I6RA 3EX3A 2R14A 3LDVA 4O50A 5DN1A 2D73A 3W75A 2ZZ2A 3DU0A 4IXHA 1MEWA 3TAOA 3IGSA 2X30A 2DJLA 1KFJA 1TV7A 1OFAA 1I2OA 3TW7A 4S1FA 2QCCA 5FEZA 2J9XA 4PL1A 1XM3A 4O52A 1GYNA 1BEUA 4UMAA 4ML9A 4O1BA 1FY6A 5HNRA 4CCEA 2YCEA 3EWXA 1GJPA 4O0ZA 3T55A 4Z1CA 3ZFHA 4A3UA 3KRUA 2YR1A 3P74A 4L4MA 1TPH1 1O5XA 4XBKA 4WZHA 3TC7A 4LWWA 5CSSA 1EUAA 2YYTA 1ADOA 1TCDA 3BLIA 3QW4B 2PRMA 5LNVA 4UFMA 1JUKA 1MZHA 1OJXA 1YXDA 2DJXA 4JTSA 4DBEA 3KRZA 2BXVA 4JNMA 3GDRA 4MKNA 1VPXA 3MHUA 2OZ0A 1EEPA 1H7WA 2H8XA 2JKPA 3W7DA 2FTPA 1M7OA 3O8AA 5G2IA 4ZQRA 2GPTA 4IMEA 1M7PA 3PVFA 1TPDA 3RLUA 4YCPA 3LBMA 3E12A 3GB6A 3N19B 4OT7A 1M6JA 3MBDA 2QR6A 5LGZA 5HR6A 3G1FA 5TIMA 2QUTA 1LTDA 1TMHA 2V5BA 3DFNA 1PHQA 3I7RA 4TMCA 2X1RA 1YLVA 1Q6QA 4BWLA 3H55A 2CU0A 4UTHA 3YPIA 1PE1A 3NVTA 5BRBA 4MY9A 1Q6RA 3LTSA 1LROA 3W1MA 1IXPA 4NJGA 1H1YA 1W5NA 1QO2A 2E6DA 4H6KA 3SJ3A 4NQ1A 4AF0B 1PV8A 5FEWA 1B3OA 3IGXA 3EEGA 4FEZA 1ZAJA 3A5VA 3B8DA 1QO5A 3SSJA 3TDFA 3SY5A 3LERA 3TMQA 1B9BA 2CZFA 1TV8A 1FWSA 2RDUA 2Y88A 1I45A 4JICA 3ELFA 2VEMA 2HS8A 3JR2A 1FCVA 4ORMA 3B0PA 3OVQA 4TU1A 4OHQA 4POCA 4M6QA 2A7NA 4UCGA 5F2GA 1SZEA 5G5IA 1F73A 2W6RA 1D3GA 1RD5A 3VNDA 4DELA 1ONRA 2J88A 4K36A 1PCWA 1X1ZA 3UWZA 1UUMA 1KFLA 2C13A 1LRQA 1KFEA 4WD0A 2A4AA 3NQMA 1KM6A 2Y85A 4LW7A 4O28A 3PG9A 3C56A 5AHNA 4NNBA 4GUIA 3LGEA 4QITA 5CKSA 1C8VA 2GVJA 4HSOA 5U4NA 3W2KA 3N2XA 1L6WA 2ZQ0A 4PODA 3BW2A 4JTTA 1GVRA 5FF7A 1S5TA 3LV5A 2JKEA 3NQFA 1OX4B 3O06A 4FNQA 3W7PA 2Y63A 4NZJA 5HWJA 1G4EA 1VCVA 3HPXA 1W1ZA 1H1ZA 1SFJA 3KVJA 4EIVA 2EGZA 3DH7A 3THQA 5SWUA 4LVBA 4IPJA 4X3ZA 5FF2A 1KM3A 4AB4A 4UTWC 5E0KA 3B0UX 3WK2A 4UIOA 1WXJA 4IWWA 4AWSA 4XQ6A 1T8XA 4FNSA 1OG0A 3WJWA 4MIMA 3UPWA 4IJBA 1FCBA 4D2JA 3PBUA 3W7HA 5AHMA 4JTGA 5IBXC 3EWUA 3DI1A 1VGAA 2VFFA 1JQXA 1TREA 4M7SA 1ZENA 1NAL1 4MZ8A 1UB3A 1OFEA 1FWTA 4GXMA 3BVJA 2QKFA 4JY9A 1SQ7A 2A5HA 3C3NA 1JRBA 2ZA1A 3QC3A 4CCDA 3PS7A 3BLFA 3DXIA 1DQWA 3GNNA 3RLVA 3O16A 3ATZA 3KVMA 1LP6A 5F4SA 1WBHA 1F74A 1J5TA 4PA8A 5HUPA 1MXSA 2TYSA 2YZRA 4Q4KA 4NUWA 5AYXA 4HHPA 3O6YX 2RHGA 3L5LA 2QCEA 4UTJA 2CLIA 1ME8A 4O57A 4MZYA 2WSYA 3NQ7A 4H4IA 1JUBA 2GQ9A 4UMCA 2A1YA 3NAVA 3G3DA 3LXCA 3E0IA 3PWAA 4OQVA 1TPWA 4O11A 1LBLA 1UASA 2ZTJA 4ORIA 4ZQMA 1OYBA 3FA5A 2ISWA 5DELA 2BZNA 4LRSA 4DF0A 1SR9A 3HJZA 1XI3A 1ICQA 3TFXA 4NJJA 5C2XA 4WY0A 4WXZA 4DF2A 4IPIA 4NNAA 1FXQA 2FB2A 3NZ1A 3B0VC 4HKPA 1FWNA 3TR2A 3BARA 1VHCA 2ZFAA 1EA0A 3MP5A 1DJQA 1LBFA 1BTMA 5CPMA 1FDZA 2XN0A 3GR7A 1I8JA 3IV3A 1GT8A 3W85A 5GVJA 1P0NA 5KITA 2O7SA 1R2SA 1F76A 1R47A 4P2VA 3W7JA 1Q3NA 1YPFA 1TSIA 3OIXA 2E1DA 1KV8A 4HNNA 1PIIA 3TKFA 4HNVA 3QMSA 4N9CA 1IF2A 3NM3A 4Y8FA 3RK8A 1MEHA 1NF7A 1WOAA 5D37A 2QCMA 4UTUA 3CU2A 1LRTA 3IIVA 4NXKA 5D2VA 3UY8A 5EKYA 1GTEA 2A21A 5EBUA 2CLMA 2C15A 5KMYA 3NPUA 2E6YA 2PCQA 1JCYA 4IOTA 1W56A 5G1TA 5I3GA 4MLJA 4YWIA 2DP3A 2E68A 4ADUA 3ZR4A 3H54A 4B5NA 1E51A 2PE4A 1KM1A 4MYXA 2YFNA 3HQ1A 5KZMA 3UXDA 1G69A 2HSAA 1PL9A 3GXNA 2ZZ6A 1SO3A 2Z6IA 2E6FA 4QSHA 4ZQCA 2ISVA 3LRMA 1ZAIA 2Z1BA 2CZ5A 1VQTA 1R2TA 1TTPA 3PC0A 4XBSA 3M47A 2YW3A 1AL8A 1SPQA 1QWGA 4LY8A 4N9EA 2CFFA 3L2IA 2VEIA 4FNTA 2LLEA 1OX6A 3TJXA 3SW6A 2DORA 3EWWA 1DHPA 5TQLA 1Y0EA 2ABAA 4DPPA 3LV6A 1RZMA 2VFHA 3FJ6A 4RKAA 3TXVA 2H90A 2V2HA 3C2OA 4UR7A 1D3HA 1KA9F 1LOLA 5HWMA 3W1PA 4FO4A 3LCFA 1HO4A 5CGQA 3IIPA 4BFAA 4IGHA 3HBLA 1W5MA 5HR7A 3N9SA 1F6PA 2QCDB 4O53A 1LLZA 3HGSA 5U7SA 4AHPA 5FF3A 4FHAA 4JDBA 3SGZA 1AMKA 4YLWA 3T44A 4K8EA 1H7NA 1W3IA 3TQKA 4KFPA 3MO7A 3W72A 3WK0A 1QPRA 1I2PA 4N6EA 4TIMA 4N2YA 2QUVA 2NUYA 1T0OA 2WO5A 3FS2A 3N14A 1SO6A 2X1TA 2BTMA 4LV9A 3C2RA 3S1UA 3RNDA 1EP2A 3HIJA 4Z08A 1KTBA 1TYGA 3K30A 1DORA 2VEPA 3MW7A 1VRDA 2ZZ5A 3LOTA 3EXRA 2QF7A 4JYEA 3L0NA 4RZ5A 4LS0A 3G1YA 5BMXA 3HMJG 3TNOA 3M0ZA 4UXDA 3T78A 2PURA 5I3HA 2V9DA 4XUGA 4QISA 5EMUA 3WFAA 3W6YA 4CNOA 3KRSA 3IVSA 1DV7A 5LNWA 4KKXA 3W7NA 5A8GA 1OYCA 3CTLA 5D32A 2QCFA 2VFEA 4RJEA 3TFCA 5LHEA 1TQXA 3WJSA 4JR5A 2WKJA 4N4PA 1H63A 5FEPA 3C0JA 3QPYA 3UPBA 2V5LA 4Z1AA 1G6CA 1C9DA 3CPRA 3UD6A 2H3DA 3CM4A 2GUUA 1OVDA 1AK5A 1H62A 5G2WA 1K7EA 3Q2DA 1HFBA 3C2VA 1N55A 1FDJA 1SZFA 3PSVA 5LZLA 2VKZG 2BWGA 2NWSA 2X16A 3TSMA 2A7PA 3DHDA 1YYAA 1H50A 3A23A 1ZHAA 4LS2A 3NL5A 3KFTA 4EVZA 3EWYA 4OV9A 3W7CA 2CW6A 3QF0A 3HO8A 3W2UA 1JCMP 1FXPA 1JRCA 5CZTA 4BF9A 5EY5A 3NOEA 4FXSA 1KLZA 1DVJA 4Z0JA 3L68A 5FF0A 3PB2A 2FFCA 6TIMA 4OWGA 3T7VA 4PL2A 1UJPA 3TIMA 2PRLA 4JIPA 1QPNA 4MY8A 2G96A 3SECA 3GYEA 2QCGA 5D2WA 3P84A 3NYZA 1P0KA 1JCLA 5HWNA 5CZSA 4S2CA 2B7PA 4JTUA 2C0AA 3CEPA 3M41A 4W9TA 2GOUA 4GNJA 3W83A 4FF7A 3LHVA 3W84A 3BW3A 4O4WA 4M5PA 4A29A 3FLUA 1YTEA 4M6VA 1FWRA 5AHIA 2J6XA 5KSWA 2FJKA 2ISSA 3MHFA 1D9EA 5D04C 3NGJA 1DL3A 1L9WA 1YPIA 4FXRA 4I7VA 4JTKA 1XL9A 3GXPA 3AJXA 3G0UA 4JTJA 4CQ9A 1VYSX 1H60A 2ZZ4A 2HMCA 1K7XA 4Z0SA 1HO1A 1O4UA 5F1VA 1XBVA 4NJIA 3UZ5A 2I1OA 2J9YA 3MYPA 3NO5A 4PCFA 1WX0A 2A2IA 1O5KA 3ZS4A 2RDTA 4UFLA 1CX9A 1M5WA 2A7RA 3CQ0A 2Z0IA 3N2MA 2BSLA 3SGUA 3OEXA 1KM0A 3IRDA 5CPNA 5H91A 1KM2A 1KW1A 2X1UA 2HS6A 3EKLA 3Q94A 4DO6A 2TRSA 3BV4A 4NXSA 1SW3A 3GNDA 4JX4A 5ABTA 4OGZA 4CLMA 1A50A 2E6AA 2P0OA 2WOQA 3G1SA 1WQ5A 4O4VA 4O10A 5IBXA 4ZQPA 3ABQA 3CIWA 2OT0A 3DKJA 2QCHA 1TB3A 4QNEA 1NSJA 3PB0A 4GC4A 1VJIA 1FDYA 1KM5A 4RXGA 4A21A 2FDSA 3PM6A 2FIQA 2EF9A 4PFMA 1GPWA 3C6CA 4AWUA 2QAPA 2OCZA 1FWWA 1CI1A 1QMLA 5AHFA 1W3NA 6ALDA 2B0MA 2J9ZA 4UC5A 3W23A 3NQ8A 3O1NA 3ABRA 2YYUA 4N6FA 3L21A 1RVGA 3P8JA 2A6LA 2Z2UA 3MI3A 5DBUA 4WUIA 2E09A 2PRHA 2B7QA 3W9ZA 3G8EA 3Q58A 5I3KA 2BX7A 5G4WA 5HQEA 1OYAA 1GVFA 3TCEA 5H2ZA 3R2GA 1W0MA 3PY2A 4JXCA 1LRNA 1W5PA 2CLKA 2RH9A 2QCLA 2RDWA 3L9CA 1KBIA 2OJPA 2C14A 4LRTA 3MP4A 4LUIA 3GR8A 3CC1A 4NZFA 1H5YA 2YGYA 2OX1A 3P5ZA 3E49A 3I65A 4UTKA 3BGJA 4BK9A 1FX6A 2GJNA 4YMZA 5E93A 5L6UA 3SIZA 1EWDA 5F4WA 2FQIA 3DBPA 3KVLA 3QSTA 1VH7A 4UTTC 3HG4A 3GVGA 2EKCA 1TPC1 3LCXA 5LNRA 1TPB1 3S42A 4LUJA 2QJHA 2RKXA 4UNLA 5LSMA 3TSDA 4GRSA 1T99A 1VLWA 4FX6M 1F6KA 2ABBA 1JCJA 5K2ZA 4M7TA 3C2FA 3PR2A 4HPJA 4LVDA 1K03A 3L5AA 1W5QA 3L67A 4RR4A 4XZ9A 4EF9A 3M5ZA 3M43A 1RPXA 2DZWA 1XBZA 2Q8ZA 2YXGA 1OFBA 3H53A 3W71A 3A21A 3KHJA 2FPYA 2PC4A 1GWJA 2AGKA 3PG8A 2DZPA 5KTLA 2OT1A 2VFGA 1N7KA 3HGJA 4ZVJA 2P1FA 1VCFA 4OU1A 5AB3A 4AVFA 4AWTA 4JYDA 3GKFA 4WY0F 5DCBA 1XUUA 2VELA 2GVLA 4Y9AA 3R8RA 1GVOA 1N8FA 4HNTA 3TW6A 4OE7A 3S5YA 5KZDA 3W1QA 3HGRA 3P80A 3TH6A 3IEBA 4UFHA 3TAKA 3UYCA 4NNCA 3HG2A 4O17A 3VKJA 1UCWA 5CPLA 3GDLA 5EA9A 4HN4A 1WOBA 3W1AA 2ZZ1A 1VHNA 3W7KA 1WDWA 4A2SA 1AL7A 4MUZA 5IM51 3DAQA 4HSNA 2NUXA 2YDAA 2B7OA 4M19A 2E5CA 4WQ6A 3LCWA 1F5ZA 1C29A 5DXXA 4UFKA 4E38A 2JK2A 3FKKA 3OG3A 4X9SA 4NX0A 2ZDRA 4S2BA 1S5VA 3N9RA 2IQTA 4HPXA 4JYFA 3UQNA 1HG3A 1RQHA 3M7WA 5FESA 5AN7A 3T4CA 4K7YA 5EYWA 3PUDA 3GAYA 2WJZA 3S1WA 1TTQA 4WY0B 2ZA2A 4JTFA 2V81A 1H61A 2Z6JA 1ML1A 1GG1A 1J4EA 1A5CA 5C5YA 2G95A 2GVGA 1KFCA 2YFOA 3M6YA 3W2JA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3LRL A;  2OYL A;  4JQ4 A;  2ZRV A;  3LSC A;  4BI5 A;  4XX6 A;  4B2D A;  1UKP A;  1TIW A;  1RUS A;  1S3H A;  4Z2K A;  2E8Y A;  2I14 A;  4AZC B;  4ADS A;  3M16 A;  4GH1 A;  1MO0 A;  1WUE A;  2QPX A;  4DJF D;  4IMD A;  2E77 A;  3ZVH A;  3RU6 A;  1Q6G A;  4LTS A;  2PGW A;  4KRZ A;  4UQE A;  2PP0 A;  1AH0 A;  5AHL A;  1QI2 A;  3NDZ A;  3QC0 A;  4E4U A;  3NQD A;  5FSD C;  4CKQ A;  4F4R A;  5TBO A;  3TE9 A;  3WQF A;  4O15 A;  1C8Q A;  2FTW A;  3B8W A;  1VBH A;  4GK8 A;  5AOU A;  2G3N A;  2E67 A;  4QQ3 A;  3R10 A;  3W1X A;  3UR2 A;  3ZSS A;  2XPK A;  1TZ7 A;  1J10 A;  3G24 A;  1XIC A;  2CNC A;  1OHL A;  3AOF A;  1DWF M;  4C6L A;  3FEQ A;  4C6I A;  3EX3 A;  2GGG A;  5HAN A;  2D22 A;  2D73 A;  3T8Q A;  1MEW A;  4CQD A;  5A2B A;  2VQT A;  2X30 A;  5A94 A;  1TV7 A;  4CU6 A;  4XAY A;  3BLL A;  1R9Z A;  1S2U A;  2W4X A;  2J4G A;  4G7E B;  2YCE A;  2W5F A;  4Z1C A;  3RDK A;  4A3U A;  3UBP C;  1UWT A;  4M82 A;  5CPT A;  2DVT A;  4WZH A;  4LWW A;  2YYT A;  1EQC A;  4B15 A;  4PMO A;  4O0Q A;  1PXG A;  5BRO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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