1WV2A

Crystal structure of thiamine biosynthesis protein from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 63

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
243
structure length
230
Chain Sequence
TPFVIAGRTYGSRLLVGTGKYKDLDETRRAIEASGAEIVTVAVRRTNIPPDRYTILPNTAGCYDAVEAVRTCRLARELLDGHNLVKLEVLADQKTLFPNVVETLKAAEQLVKDGFDVMVYTSDDPIIARQLAEIGCIAVMPLAGLIGSGLGICNPYNLRIILEEAKVPVLVDAGVGTASDAAIAMELGCEAVLMNTAIAHAKDPVMMAEAMKHAIVAGRLAYLAGRMPRK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Biosynthetic protein
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title Crystal structure of thiamine biosynthesis protein from Pseudomonas Aeruginosa
rcsb
molecule keywords Thiazole biosynthesis protein thiG
total genus 63
structure length 230
sequence length 243
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.8.1.10: Thiazole synthase.
pdb deposition date 2004-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05690 ThiG Thiazole biosynthesis protein ThiG
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1wv2A00
4HIBA 3BW3A 3KVMA 3PM6A 4GNJA 1AK5A 1SW0A 1RQBA 1SZEA 5TQLA 2H3DA 4UTHA 2NX9A 1VCFA 4O53A 1XC4A 1KM3A 1OFPA 1O94A 3GIYA 4PC8A 4GUHA 2C14A 2ZZ5A 3BO9A 4JX6A 1X8FA 4Z1CA 1QDSA 1GJPA 3BVJA 2DZVA 2RFGA 3N14A 1LRQA 3W2UA 1PVNA 3C2RA 3DI0A 3UNDA 4YCPA 1G6CA 4UTUA 3LV6A 3GX9A 2TYSA 1UB3A 1M7OA 3STFA 3MI2A 3MP4A 3L5AA 2CLMA 3AO0A 1TMHA 3B03A 1RQHA 3CIXA 4E2DA 4JX4A 4LS2A 3N3MA 3GAYA 5LGXA 3LCWA 4BI5A 4RZ6A 2YW3A 3JR2A 4M6PA 2CLHA 2NV1A 3TFCA 3VI2A 1B4KA 1QPRA 3V1PA 2J27A 3MHUA 4MY9A 1QNVA 1DBTA 2YFOA 2QAFA 3P5ZA 5DBUA 2X1SA 4FX7A 4JTHA 2YXGA 3CC1A 1QPNA 1W31A 4A2RA 4I7VA 5AC7A 2GVLA 1RV8A 5CZSA 4LTSA 1MSSA 4HT3A 4IQLA 3EEGA 1A5BA 2DZPA 3LCHA 5I3HA 3NGJA 3L0KA 2QAPA 3LTSA 5EMUA 5FF4A 5HR6A 1FCQA 5I3JA 3FJ6A 5F1UA 1KV5A 2ISSA 3LHWA 3GNNA 4JIQA 5DY2A 1RZMA 1THFD 1GYLA 4K8EA 5FEPA 3CIWA 4UNKA 3ZWSA 1R2TA 3M1ZA 4A3UA 4O0KA 1GTHA 1K8YA 3W1RA 2E6AA 4N4PA 4WUIA 1TIMA 1TJRA 4G1KA 5BW6A 2A5HA 1I45A 3TC7A 3R12A 5LZLA 4WQ6A 2V5BA 1K03A 3OVRA 5FF3A 1W5MA 1HO4A 4MOZA 3C2FA 4YWIA 1AW5A 2FJKA 4RV8A 1SZGA 3LCIA 1OFQA 4WY0F 1W3NA 4PH6A 4E2BA 4NJJA 3PVFA 4GUFA 3LRKA 3GZ3A 1W5NA 2JKEA 4Q32A 3EWUA 4O1CA 1DJNA 3EWBX 3FEMA 3Q58A 1XCFA 5K7JA 1GVOA 3W74A 1JQVA 3CT7A 2C13A 2O7QA 2WOQA 3MHFA 3LDVA 2X16A 4RCXA 4BF9A 1XKYA 1H7PA 5F2GA 1MEIA 2VXNA 4MYAA 2V8ZA 1FXPA 1X6UA 1JULA 3WK1A 2J88A 3GDRA 6TIMA 4GUIA 3E12A 3WJYA 2TSYA 4OU1A 1LCOA 1VZWA 4A22A 2DZUA 2WPBA 4MYXA 2G96A 1P0NA 4UTKA 3TK7A 2HSAA 3KRZA 5C54A 3THAA 2Z0IA 4M6VA 5CGQA 4CQAA 1KM6A 4X3ZA 4ZVJA 3L21A 4RZ5A 4IGHA 4N4QA 5G2IA 3B05A 1HG3A 5KITA 4LS0A 5K2ZA 4U4MA 2DU2A 4IXHA 4O50A 4PEKA 3UZ5A 3DHFA 5LHEA 3B04A 3W7GA 3O8AA 4Z08A 4WXYA 4ORMA 3I65A 3FA5A 1JUEA 3O6CA 3BGGA 1GWJA 1F05A 4XUGA 1YXYA 3G0XA 2VEMA 5KZMA 2ZZ1A 5I3GA 4LVFA 1D9EA 3SFKA 1VQTA 2I9EA 1KFKA 3B4UA 2O7SA 3TQKA 5HWNA 3C61A 1KFCA 1SU5A 4ICNA 4FNUA 3S1VA 4GE8A 1KFJA 2ZRZA 3N19B 4I7UA 1GT8A 2VOMA 4UMCA 2HMCA 4RZ4A 3R89A 5F4WA 3EXSA 2WKJA 1S3HA 1VLIA 3ANYA 2A85A 3P84A 1H61A 3QEZA 1GTEA 2DJLA 3B0PA 1YLVA 1QFEA 1TV5A 4LW7A 2OT0A 5CPMA 1TJPA 1JCYA 5LKYA 1VYPX 1EUAA 5G4EA 3QFEA 3FYOA 4IMDA 4C1KA 3W22A 1MZHA 3A5FA 4M7SA 1ZNNA 3TAKA 4I9AA 4DO4A 1W56A 2WV8A 4O4WA 4AEOA 1H1YA 5EY5A 3PSWA 3QM3A 1LRTA 2YW4A 1WOBA 4EOUA 3MYPA 3QPZA 3CHVA 1ME9A 1Q6QA 3M41A 3PC0A 2TMDA 2WNQA 3LCLA 4PL2A 4TU1A 1K8XA 3C3NA 4Y96A 4O16A 4N6FA 1VYRA 4CQ9A 5J5RA 5FESA 4LVDA 3O07A 4HSOA 1L9WA 2V82A 3W9ZA 3TR2A 1M7PA 3GNDA 3W3OA 1ML1A 5AHFA 1ALDA 4RXFA 4PFMA 4UIOA 3T55A 3UWUA 3OVQA 3LHUA 4CNPA 4HPJA 1KM5A 5AHLA 2H3BA 3FYPA 1H5YA 3P61A 1KFBA 2XN2A 4UFLA 4CNNA 2VFFA 3S42A 3W7IA 1W5OA 2WSQA 1D3GA 2WO5A 3IGSA 4O19A 3T4CA 4BK9A 1TQXA 1VR6A 2V30A 5D03A 1RPXA 5K4ZA 3LHTA 4UR8A 5TBOA 1ZJIA 4DPPA 4LWWA 3NPVA 1Z48A 5AHMA 2C19A 1TB3A 2B0MA 4UCGA 4YXGA 3W76A 4K7VA 1F2JA 2LLEA 1FXQA 3DFSA 4RJEA 4BR1A 1VJIA 2RDTA 1LLWA 1A50A 3BLFA 2GVGA 2NZLA 2R94A 4NQ1A 3USBA 1TPB1 3MUXA 3BLIA 1JUKA 1I2NA 2F84A 7TIMA 2EAWA 1JQXA 4JIPA 5BNKA 3PG8A 3AJXA 1FCBA 3NZ1A 4ADSA 1TV8A 3W1PA 3INPA 3LGEA 1I2PA 3MWAA 4MVAA 5BMWA 3L0GA 2E5CA 3N34A 3DI1A 5EBUA 1BWLA 1R30A 4QSHA 4UUIA 4A29A 2YSWA 2VKZG 5LNSA 1EIXA 3IV3A 3A23A 2VELA 3IRDA 4MLJA 2W79A 3PBWA 1K02A 5AC6A 3MHGA 1K8ZA 1SO4A 1WBJA 2QCCA 3LI0A 3MMTA 1G7UA 4PL1A 4HSNA 4JTUA 1ZENA 3DFTA 1YDVA 1WV2A 2CLEA 3CU2A 1C29A 3NQ7A 2GOUA 1EA0A 3VE7A 2Z2UA 3TMQA 3RMJA 2VFEA 1OK4A 4L4MA 5AYYA 2FFCA 3TXVA 1TPVA 1Q45A 2HS6A 2VFHA 3W72A 3FFSA 1IXQA 1Y0EA 4HNNA 4TR9A 1QOPA 3P74A 5LNWA 1R2RA 1Z41A 3W84A 5H2ZA 3FS2A 4O8RA 3W7PA 3CWNA 5C6MA 4JTSA 1IXNA 4OT7A 3LHZA 1PV8A 1JCXA 3W1NA 1VGAA 4JS3A 3W85A 2QKFA 5D2TA 2X1RA 1GQNA 4JTLA 1QO2A 2QCNA 2JKPA 1UUOA 1RR2A 5D32A 3TNOA 1HO1A 2QCHA 1GVSA 1P5BA 3P81A 3L9CA 2P10A 2A4AA 1VH7A 2B7PA 1SFJA 2J6XA 4IMEA 1XBYA 1VHCA 3HPSA 3UQNA 2X1TA 3IGUA 3GDTA 5LNUA 1WQ5A 3NPUA 4WY0A 5KTLA 3NEVA 3W7KA 1OFDA 1K7FA 3OHIA 3P67A 1N55A 2GQAA 2DJXA 4MPQA 4JY8A 3GDKA 1OF8A 3E96A 3GB6A 4RR4A 3BG9A 2VC6A 3FKKA 3NQ2A 3PG9A 3ELFA 4FNSA 1XI3A 1MEHA 2YGYA 3I68A 1F73A 2Z6IA 1SZNA 2CFFA 1TPC1 2QCFA 1B9BA 4LOCA 3KRUA 4AWTA 3VCRA 2H6RA 1E51A 2YCEA 2YR1A 2GPTA 4BFAA 5IBXC 2NV2A 3G1SA 5DY3A 2E68A 2P1FA 1XFBA 2XFWA 4DPQA 2VFGA 1OFRA 3PBUA 3N2XA 2Y62A 1FDZA 4Y6GA 3ATZA 4FNTA 2Y63A 2CU0A 3KVLA 4GFSA 5HWMA 1I8JA 4KFOA 3W07A 5KZDA 3RU6A 1LOQA 4IMFA 3W1AA 1ZY9A 1JRBA 5F2MA 2C18A 3OBKA 3R5EA 3IIVA 5D37A 4JNMA 1CI1A 1LROA 3W7HA 4DBDA 1JCNA 2NX3A 1F74A 3LBMA 3BV4A 1FCUA 4LRSA 4N6EA 1OJXA 1YDOA 1F76A 1WAUA 3UYCA 3G1AA 1IGSA 1FWSA 3O16A 2DORA 3W7CA 4RX0A 1F5ZA 2AAMA 2QDHA 1ZAIA 4HNUA 3DFOA 3GYEA 2BX7A 1ZHAA 2ZRWA 3WK0A 2X30A 1OFAA 2ZZ3A 2XN1A 2C0AA 2V81A 5HWJA 3UWVA 1HFBA 1B4EA 3EKLA 3O06A 1X1ZA 1PCWA 1QMLA 3NOEA 1GVFA 1NAL1 3W70A 4AHOA 4TIMA 3TJLA 1B3OA 1WXJA 4IJBA 1OABA 3G0SA 3PY2A 3TIMA 2B7NA 3C52A 5KSWA 3M7WA 4ALDA 1NVMA 4NU7A 3W7EA 4FHAA 1ZFJA 2CLOA 1XM3A 3SI9A 2GQ9A 1H7WA 2BTMA 4XKYA 2ISVA 5AOUA 2E09A 2A7PA 1YPFA 2RHGA 1Q6RA 3QW4B 4A2SA 4UTMA 2CWNA 4OV9A 4IX0A 3U8GA 3Q2DA 5CZJA 4CQ8A 3S5OA 1H1ZA 3CWOX 3W7MA 5EPDA 2A0NA 5AHIA 1AW1A 4M6QA 2AQWA 1F7BA 3PUOA 5BRBA 3QSTA 1ME8A 2DZTA 3NNTA 3IVSA 3UXAA 2Y70A 1M6JA 4FEZA 2QUVA 3W7DA 3S6DA 1U5JA 3W7OA 3QC3A 3Q94A 3LXAA 1S5TA 4XTIA 2OMAA 1J5TA 3W2NA 3LLDA 2ZA1A 3G0UA 4R7JA 2Y85A 1JRCA 4X2RA 1UJPA 2CZFA 1JCLA 2J24A 4FX8A 5AFDA 3TW7A 3W1QA 1BTMA 3EXRA 1SW3A 4MY8A 1SR9A 4NUWA 1WA3A 3L2IA 1DORA 2VFDA 3HQ1A 1KV8A 3TC6A 5L9FA 3THQA 1H7XA 3W2LA 1KFEA 4MLRA 2C3ZA 2WSYA 4N02A 2F7FA 2KZHA 3N9RA 4FO4A 1I2RA 4YLWA 4FNRA 4Z1AA 5EKYA 3HB9A 1G4PA 3IGXA 4QNWA 3LXCA 4JX5A 2H90A 3E02A 2E6YA 2ZDRA 3QMTA 1H7OA 3RK8A 3M47A 4JYFA 1KTCA 3NPXA 1W5PA 1YPIA 4AHQA 4LV9A 5EA9A 3HG5A 3G8RA 3RNDA 3S0CA 2JBMA 5U7SA 2YDAA 5HMSA 3P60A 3S8HA 4HN4A 3LOTA 4XTDA 1L6WA 2VENA 8TIMA 4UTWC 4NNBA 5J5DA 4LNYA 3ZS4A 3F03K 4M19A 2UV8G 1KTBA 1VCVA 4HNVA 5U4NA 1YDNA 1K3UA 2GJNA 3LBCA 1SO3A 3GVGA 3DHDA 4O0ZA 2W0UA 1ME7A 3IVUA 1VHNA 3G3DA 4LUJA 5CPLA 4B5NA 3GLCA 2NXHA 4IUOA 3R2GA 1L6SA 3PB2A 4RK8A 1LP6A 2H8XA 2FQIA 3EX6A 2EKCA 2BLEA 3LTYA 5FF0A 4WJEA 1NEYA 2H8ZA 1FX6A 3W23A 1OHLA 4YCOA 5D09A 3W86A 5A8GA 3UWZA 2X1UA 2EPHA 1MXSA 1AW2A 3WFAA 1LBMA 4OE7A 2NUWA 3C4UA 1TPUA 4DELA 4NJKA 2TRSA 3WK3A 4WD0A 4UFKA 3KX6A 1KA9F 5HNRA 4GWEA 1T96A 5D33A 4UFMA 4MFDA 2VEPA 4NJGA 3P62A 1EP2A 2QCDB 3GDMA 3P82A 1R47A 3QF0A 3G24A 3NQEA 3DH7A 2B7QA 2ZBTA 2CZEA 3S9YA 4ZQNA 4NX5A 3QSRA 4K36A 2ZTKA 4XQ6A 3VE9A 1FDYA 2FB2A 4NXSA 3LXBA 3IEBA 2PRHA 2WSRA 4GRSA 3QQ0A 1KLZA 1PS9A 5DXYA 4C1LA 3P5YA 3G3MA 3IIZA 3T7VA 1IIHA 3LCFA 1UUMA 3M5ZA 4LV4A 4UTWA 3LERA 4KWVA 4AVFA 2C16A 1VPXA 3SR7A 1QOQA 5FI8A 1WOAA 3MI6A 3TROA 3MI3A 3ZFHA 1LZOA 1MO0A 3SGZA 1EEPA 3A24A 1GEQA 5F2LA 5BMXA 2YYTA 3UD6A 3W7RA 4IPIA 3NA8A 4W9TA 4IX2A 2QCLA 5CZ0A 2ISWA 4UC5A 2GVJA 3C8FA 3RLVA 3BGJA 3P8JA 4JDBA 1Z44A 2IQTA 3NYZA 3N73A 3CEPA 1WBHA 1XUUA 3PS7A 3W73A 4O1AA 1ICPA 1LOLA 3TJXA 5CZTA 2WNZA 2CZDA 2ZFAA 3RF9A 4JTTA 3F4WA 4MZYA 3IIPA 3T78A 5EL1A 1QO5A 4WXZA 1OX4A 3BARA 2ZA3A 4PA8A 1ZAJA 1YTDA 3PR2A 4CLMA 2QUUA 4IWWA 3DFPA 1H62A 1Z42A 4O11A 4MY1A 4NT0A 1ICSA 4MKNA 2RDWA 1BWKA 3KRSA 3KVKA 5DBTA 5T26A 5DCDA 3LM7A 3NDOA 5ABTA 4K37A 1CW2A 1GG1A 3F4NA 2V5LA 4QQ3A 3NQVA 4EF8A 1FQ0A 5C5YA 4ZQCA 4PTNA 4JY9A 4ZMGA 3LHYA 3TU9A 1CX9A 4AB4A 3LHVA 3I6RA 3QJAA 3LV5A 2I1OA 1DVJA 4UNLA 3KHJA 4WY0B 2CLKA 1QAPA 5D30A 3HG3A 1SQ7A 5SWUA 2ATMA 5F4XA 4JTKA 1OFEA 4FB7A 3ZR4A 3W1TA 3EX2A 1EP1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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