1XC4A

Crystal structure of wild-type tryptophan synthase alpha-subunits from escherichia coli
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
268
structure length
240
Chain Sequence
MERYESLFAQLKERKEGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIEAGADALELGIPFVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNKGIDEFYARCEKVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNVAPIFICPPNADDDLLRQIASYGRGYTYLLSRAGAALPLNHLVAKLKEYNAAPPLQGFGISAPDQVKAAIDAGAAGAISGSAIVKIIEQHINEPEKMLAALKVFVQPMKAATRS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of wild-type and P28L/Y173F tryptophan synthase alpha-subunits from Escherichia coli
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
total genus 78
structure length 240
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2004-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1xc4A00
2ZZ2A 3TKFA 1DV7A 5D30A 1R47A 4JTLA 3BG9A 5I3FA 3TAOA 4UFKA 3EKLA 3CC1A 1YXYA 5AYZA 1YADA 3UQNA 3ZS4A 4A21A 1L9WA 2Y7GA 3A24A 2RH9A 4WXYA 2RKXA 3PSWA 2F7FA 2ZZ7A 5F1VA 3R13A 3PAJA 4HNVA 1Z48A 4LVBA 5G4WA 1SO6A 1VPXA 4BWLA 2C3ZA 2C16A 3IEBA 2ATSA 2PE4A 4GRSA 3W1XA 3EWXA 5A5WA 1XFBA 1TPDA 3BK0A 4N9DA 3DHFA 4C1KA 5CZTA 3G1AA 5KITA 1JUBA 3P82A 1WQ5A 2PURA 3LTYA 2WJZA 1FDJA 4N4PA 4XTDA 2V2CA 5DY2A 1IXNA 1TPFA 4M5PA 4X9SA 3W88A 2NV2A 4JGDA 3MUXA 4DO4A 1ZCOA 3OVRA 1TIMA 1M7PA 2NXHA 2EPHA 3W7RA 4MZ1A 1DORA 3CEUA 1SO5A 2A7PA 3HG4A 3O6CA 1VHNA 4IJBA 3UPBA 3KRUA 1W5MA 1BWLA 3PBYA 3EXTA 1QOPA 2QDGA 3W1MA 4AHQA 4JYDA 2X30A 3C0JA 1OK6A 3EWUA 1O4UA 1W54A 3O6DA 2VFEA 2WSRA 1FQ0A 2NX1A 1MEWA 5AOUA 4GUJA 4XBKA 2J88A 2WQPA 3I7RA 4NJHA 1ONRA 4K36A 2AQWA 4UR7A 2XN1A 3W76A 1NF7A 1MXSA 4JS3A 3LB0A 5DCEA 4WOZA 1F05A 3MO7A 1I4NA 1FCBA 4UNLA 3S5NA 5BOOA 2E77A 2XN0A 8TIMA 5HWNA 3SGUA 5DCBA 3L0NA 3W85A 1JCLA 1KFCA 3MHFA 3GAKA 1OF8A 6ALDA 4RLIA 5IBXC 4M7SA 1D3GA 2JKEA 3W22A 1C29A 1MEHA 5D2TA 2WSQA 3MHGA 5DELA 2WNQA 3TV8A 1W1ZA 4P2VA 4JXCA 3W7JA 4U4MA 2QR6A 5DBUA 3G1DA 1PHQA 5AHLA 2C6QA 3B05A 5TQLA 4FX8A 3IGUA 3HGSA 5CGQA 1JULA 3JS3A 3LBCA 4O4WA 2EAWA 1SZEA 3N14A 4FIRA 4UTTC 1EUNA 4NU7A 2V5LA 1JCNA 2CZ5A 1B57A 3TIMA 4N02A 2ALDA 5E93A 1XUUA 3HGJA 2QF7A 1H1ZA 5TIMA 1SFJA 2A7NA 3F4WA 2ZRUA 3SFKA 3DH7A 3NR0A 4MPQA 3NL5A 5C2XA 2ZZ6A 3O07A 2ZZ1A 5HUOA 4M7TA 3GKFA 4J9JA 1SPQA 1H60A 4GBUA 3A21A 3PUDA 2H90A 5DXYA 4UTMA 3G8RA 3GDTA 3WJYA 3NGJA 3JR2A 3RFAA 3P67A 5D02A 3F03K 2YZRA 4UFJA 2H6RA 2GJLA 3T40A 3NNTA 4PTNA 4UR8A 3P74A 1SU5A 1JQXA 2R94A 4Z1AA 4PCFA 3UD6A 4PC8A 4K38A 2PRHA 4XKYB 2Y7EA 4CQ8A 3NQAA 1OFDA 1GVOA 4LU0A 5AN7A 4ZQOA 1P0NA 3KRSA 3LHTA 5LNRA 2VFDA 2I14A 1PE1A 1PS9A 2NUXA 3HB9A 3BARA 4UIOA 5D05A 1SQ7A 1F6PA 4RX0A 4ORMA 5KZEA 1MO0A 1EPXA 4YCOA 3GKAA 1EWDA 4ZQNA 5HINA 1GWJA 1WA3A 2OT1A 3W75A 1OK4A 2QUVA 5F4SA 1NEYA 4LV9A 5EMUA 5LGZA 4O1BA 3TSDA 3STFA 4K8EA 4GUIA 4XKYA 4YXGA 1YTEA 4JIQA 3G8EA 4Q4KA 3W1UA 1KM5A 2FB3A 2DORA 4DBDA 2DZTA 4XTIA 1WBJA 3USBA 3I7SA 1TPWA 1TB3A 5E0KA 3HPZA 2ISVA 2YDAA 4FO4A 5FEPA 2QCEA 5HR7A 2X1TA 5LNVA 4AEOA 4S2CA 1M7OA 4MY1A 3TJLA 2B7QA 2HMCA 1K7XA 1B3OA 5D2VA 1TJRA 3NL6A 3G1HA 3W07A 4HPJA 2NWRA 1EB3A 2Z0IA 1RR2A 2Y63A 3H53A 1JR1A 4UTHA 2C13A 3W7MA 1OHLA 2VKZG 4WY0B 5EL1A 4CQ9A 5EPDA 4Y8FA 4MLRA 5ABTA 3O63A 3W7CA 5AB3A 2JGYA 4O11A 4UFIA 1ICSA 3MP5A 1LOQA 4K39A 1GT8A 1K7EA 4BI6A 3W7LA 1OF6A 4JTTA 1KTCA 2BX7A 2ZA3A 3S1WA 3ELFA 1WOBA 3P84A 5AFDA 1GEQA 4AXKA 2A1YA 3ZFHA 3N34A 1DL3A 1N8FA 2FQIA 3K30A 3TW6A 3HG2A 3OBKA 3W7PA 3LCWA 1JCMP 2QJHA 3UWYA 5DY3A 4QQ3A 4TR9A 2B7PA 3FOKA 2QCFA 1G4PA 1GVFA 5DCDA 4O8RA 1R2RA 3LHZA 3TFCA 2DP3A 3KFTA 2E5BA 1RD5A 4WY0A 5CSSA 3IIZA 1H50A 1SFLA 2ZTJA 4GFSA 3KVJA 1I2QA 5G4EA 1W0MA 3L0KA 2I9EA 3G18A 1LROA 3BW2A 3FKRA 3PG8A 4XBSA 1U5JA 1EUAA 4ICNA 4I7WA 3SZ8A 3CT7A 5G2IA 1WAUA 5BW6A 4LC6A 1WXJA 3DENA 1XI3A 2YYTA 3WK1A 4CCEA 3TSBA 4RCXA 3T7VA 3BG5A 3GXNA 4DO6A 2GJNA 4IMFA 4JTEA 3B04A 3C2RA 3PR2A 1MEIA 4JNMA 1FCVA 1WBHA 1XKYA 2I1OA 2QAFA 1H7PA 3VE7A 3TFXA 1ME9A 2GQ9A 4UUIA 3GZ3A 2JK2A 2VEIA 1EIXA 3VFLA 5D37A 2WNNA 4EVZA 2GPTA 4H3DA 4MFDA 3KXQA 5H91A 3ABSA 4WJEA 3DFTA 4Z0SA 1O60A 4U28A 3A9IA 4JTFA 3DFOA 5KZMA 1TCDA 3W87A 1G4EA 3W86A 1X1OA 3DZ1A 4JD4A 1QNVA 3PM6A 5CPMA 3S42A 1GTEA 1TRIA 2LLEA 3GB6A 3P80A 3UY8A 1ZHAA 4MFEA 4YWIA 2FDSA 4LY8A 5KMYA 3W3OA 3TA6A 3LXAA 1DQWA 2E6DA 5D2YA 1BWKA 3UXDA 1YDOA 4UTJA 4MZYA 4DF1A 1FXPA 3NL2A 1GPWA 3BO9A 3M5VA 4LT9A 1OFRA 2P10A 4H4IA 2X16A 3NQEA 4Y9AA 5FEXA 3S6DA 4TIMA 4W9TA 3QQ0A 1FY6A 3Q2DA 4LC8A 3PS7A 3L0GA 1LOLA 5CSRA 4FNRA 4DF2A 2R91A 3G22A 3LCGA 4AB4A 1H5YA 3IIVA 4IMEA 5J5DA 2EKCA 4HT3A 1EEPA 1H62A 1EP3A 3CWNA 3BLIA 2B4GA 3WK3A 1TYGA 1TPEA 4IX0A 1T99A 3PG9A 4QJ1A 3NPWA 2C1HA 2AAMA 4FHAA 2RFGA 3G1FA 1LZOA 5HWMA 1ML1A 4OU1A 3G0SA 1JCJA 4P61A 3PUEA 1MZHA 1LORA 1SW3A 2QEZA 3M41A 4XUGA 4HSOA 3GAYA 1IIHA 4FX6M 1FX6A 4MJZA 3IIXA 3M16A 3PWAA 1IF2A 1THFD 1TPUA 3RMJA 4M19A 1O94A 1JUEA 3OVPA 5K9XA 3FFSA 1W56A 2VFHA 2Z2UA 4KFPA 1F73A 2D73A 1F6KA 4R53A 2X1SA 1SO4A 2VENA 1OYBA 1XCFA 3PULA 2RHGA 3EX4A 3W23A 3M7WA 2B7OA 3A5VA 2CZFA 3NDOA 3UWUA 3M43A 1M6JA 3WJXA 4RZ6A 4HNUA 1NSJA 1ZJIA 3Q58A 1GG1A 2CLFA 3FIGA 1KM3A 2OX1A 1VS1A 5K7JA 1HO4A 2BXVA 1JRCA 3P81A 4MUZA 1XM3A 3SI9A 1TQXA 3W2MA 4Z1DA 2WSYA 4JTHA 2ISWA 1E51A 4M6PA 4FNUA 4N9EA 3LXCA 3TQKA 2XN2A 2HS8A 4LOCA 2QCHA 4LW7A 4ADSA 5H2ZA 1FWSA 4RZ4A 5HMSA 5BMWA 4NJKA 3MI2A 2Y70A 4O52A 3R8RA 3TNOA 1PL9A 3QZEA 3UWWA 3W73A 4O10A 3M5XA 3MWAA 2AGKA 3RLVA 4E2BA 2WPBA 5L9FA 4ZQCA 2YR1A 1TRDA 3FYOA 2Y62A 2ZA1A 4NNAA 2NXIA 1TPVA 1SO3A 3QW4B 1JCXA 3WJSA 4NXSA 5CPLA 4GWEA 4Q33A 3SJ3A 2WNZA 3G3DA 1YDVA 2YW3A 3L2IA 1Q6LA 2QCNA 4G1KA 3PUOA 2OZ0A 5F1UA 3LLDA 1FCQA 5EA9A 4MIMA 1WX0A 3ZWTA 3KAOA 3GLCA 3NQVA 2ZCGA 3EWZA 1S5VA 2J9YA 3OG3A 3STCA 3TROA 3MI3A 1W5OA 5CKSA 1S5TA 2Z6JA 4UCGA 3G3MA 1BTMA 3RLUA 4IPIA 5K4XA 3QC3A 3FJLA 4I7UA 3T4CA 3NA8A 5AHMA 3C8FA 3GDKA 1GYLA 2WO5A 4ADUA 4UMBA 1PCWA 1LOSA 4UC5A 4BK9A 1QPNA 1JQVA 3MYPA 3ABRA 3IIOA 1FWNA 1ZFJA 4M6QA 4O14A 4PH6A 4IPJA 3IVTA 3ANYA 5BMXA 1VCFA 1YPIA 4Z1CA 3YPIA 3C2OA 1FWWA 3SR7A 1HG3A 4M6VA 1NF0A 2GQAA 5DBTA 4JDYA 5KZDA 2ZRYA 4ONVA 1F76A 1D3HA 5MHBA 3LHVA 3P5ZA 4O12A 4KWWA 1XUZA 3DKJA 1ZENA 5EKYA 4HHPA 3KVLA 3I68A 3S0CA 3HJZA 4MYAA 3GR8A 1AW1A 3L67A 3SW6A 4JX5A 3DHDA 4O1CA 1DOSA 4IOTA 2C18A 3AO0A 1OG0A 3HBLA 2FIQA 1YPFA 1R2SA 2NWSA 3W7IA 4EWND 1JCYA 1F5ZA 4CNNA 3Q37A 1DQXA 3P62A 3EKZA 3QEZA 4RXFA 4PFMA 3W1AA 5C55A 1SZGA 2E5DA 3T55A 3BVJA 2YCEA 4AMAA 3S1XA 4HPXA 3B8DA 4UTKA 2A21A 2J27A 4AHOA 4OV4A 3F1QA 2GQ8A 1YTDA 1X1ZA 5HUPA 1OX4B 3FA5A 1KM6A 1AK5A 3IVSA 2H3BA 5K4ZA 3ABOA 3OHIA 5LZLA 3W71A 4N4QA 1AL7A 3V1PA 1J4EA 4FXSA 1IXPA 1VCVA 3W2LA 4NJIA 5BRBA 2CLKA 3M44A 4MKNA 2VFIA 5F2LA 1TTIA 4YLWA 2H8ZA 4R34A 4QNEA 4DEFA 3LCHA 3MJYA 2QCLA 2HS6A 2ZDRA 3LRKA 5C54A 2DZUA 1ICQA 1OX4A 4Q32A 4CNOA 4OV9A 5SWUA 3QRHA 1S3HA 4PA8A 1YYAA 3G1VA 2ISSA 4HIBA 3NQ8A 3R12A 4NJJA 3UWZA 3W84A 4ZQPA 2DJLA 3UNDA 4MY9A 4QIUA 1A5AA 3KRZA 3FEMA 3T44A 1EX5A 1VHCA 4EF8A 4FF7A 4FNTA 4FXRA 3PY2A 4QISA 1X8FA 1LBMA 3BGGA 3QSRA 2J6XA 1B4EA 2NUYA 1H7XA 2Y61A 3NPUA 3KVMA 3UYCA 2DZVA 5CG7A 3BLEA 4LS0A 3UZ5A 5IM51 3DFPA 3D0CA 3NQ2A 1QWGA 1LRTA 5HQEA 3NO5A 2ZZ5A 2CLLA 4DO5A 3DFQA 1TMHA 4X3ZA 1H7OA 2QUUA 4MYXA 5LNSA 2Y6ZA 3G0XA 2EHHA 3R5EA 2C19A 4HN4A 3NZ1A 1QPOA 1A53A 3EB2A 5HULA 2FTPA 5D03A 1G7VA 3TXZA 4JEQA 3PBVA 5DLCA 4K37A 4FNPA 2P1FA 1TPH1 1W3NA 2JBMA 2Q8ZA 3VI2A 5AHNA 3MBDA 3G1XA 3I65A 4NX5A 4CCDA 1I2NA 1G7UA 1VLIA 1RVGA 4UNKA 4MY8A 3R89A 4IUOA 3G1YA 1U83A 4D2JA 3QPZA 4LTSA 4S1FA 3GIYA 3L66A 2YGYA 4IMGA 1SW7A 4UTUA 3B0PA 1O5KA 3C61A 5HNRA 3EX6A 1JRBA 2G95A 2R8WA 2KZHA 4E2DA 3BV4A 5G2WA 7TIMA 1A5CA 4JYEA 5T26A 1VJIA 5K9CA 4KFOA 2XFWA 1VGAA 2J24A 2BSLA 2TSYA 1H51A 4A2RA 3W7OA 4N6EA 3QSTA 3TMQA 4S2BA 1PHWA 1JVNA 2E1DA 3GX9A 2BZNA 1UUMA 3VCRA 2FPTA 2V0TA 2ZYFA 1KFKA 3W7GA 4O18A 1TPB1 1H7RA 1KV8A 4RKAA 3P8IA 4AH7A 1N55A 2CLEA 4JX6A 4TMBA 3DU0A 4L4MA 2J9XA 4UFMA 2V8ZA 4RXGA 3TU9A 2A7RA 3DI1A 1EP2A 3PSVA 4OHQA 3CM4A 5G2HA 1WOAA 2VC6A 3IGSA 4ML9A 4FNQA 3W70A 2JKAA 3IIPA 4IXHA 1G67A 3QPYA 2ZRVA 1I2RA 4ALDA 1OFBA 3GDLA 3PVFA 3C3NA 3DFSA 4JTJA 1UASA 4GUHA 1L6SA 4QAIA 1UUOA 3LRMA 3W1TA 5D33A 2C15A 3E96A 2ZRXA 2NLIA 2P0OA 2FLIA 4KWVA 5FF0A 3W6YA 2DZWA 1HUVA 3HQ1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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