1XM3A

Crystal structure of northeast structural genomics target sr156
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
251
structure length
244
Chain Sequence
SMLTIGGKSFQSRLLLGTGKYPSFDIQKEAVAVSESDILTFAVRRMNIFLEQLDLSKYTLLPNTAGASTAEEAVRIARLAKASGLCDMIKVEVIGCSRSLLPDPVETLKASEQLLEEGFIVLPYTSDDVVLARKLEELGVHAIMPGASPIGSGQGILNPLNLSFIIEQAKVPVIVDAGIGSPKDAAYAMELGADGVLLNTAVSGADDPVKMARAMKLAVEAGRLSYEAGRIPLKQYGTASSPGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Northeast Structural Genomics Target SR156
rcsb
molecule keywords Thiazole biosynthesis protein thiG
molecule tags Biosynthetic protein
source organism Bacillus subtilis
total genus 67
structure length 244
sequence length 251
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.8.1.10: Thiazole synthase.
pdb deposition date 2004-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05690 ThiG Thiazole biosynthesis protein ThiG
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1xm3A00
4O12A 1SO5A 2P0OA 3T78A 1GOXA 5F2MA 3DKJA 3IV3A 3TQVA 3EB2A 1F6PA 3RU6A 4ZQMA 2CLIA 3OIXA 2P10A 3BLEA 5C2XA 5LGXA 1G4SA 3F4WA 4JTKA 2ABAA 1GTEA 2HMCA 1K8YA 4IMFA 3T40A 1PE1A 1RZMA 5LNSA 1PCKA 3KHJA 3QMRA 4UTTA 4G1KA 4YXGA 3NAVA 1TTIA 3LV5A 4O17A 1B4KA 3LBMA 1G6CA 4TO8A 3IIXA 4LC8A 3W87A 3OEXA 3QQ1A 5CKSA 4DO6A 4MY8A 1AW5A 3LI0A 2ZRWA 1THFD 1ZJIA 1SZNA 3M5XA 5LNUA 3HF3A 2A2IA 2G96A 1JCJA 3P5ZA 2C19A 3RFAA 1Q6QA 1ZAIA 2TPSA 1LBMA 3VCRA 2V81A 4R33A 4IXXA 4OE7A 4GC4A 5AHIA 2E5DA 4MLJA 2A7RA 1ADOA 3G1DA 5FEZA 5I3GA 2ABBA 3LBCA 2ZRYA 1VHCA 1OF8A 4YCPA 5K3VA 1EIXA 4C1KA 3GR8A 3HB9A 2OJPA 3UXAA 4UTKA 4KFPA 4IX0A 3EXRA 3LTPA 1B57A 3E0IA 3I7RA 3E96A 2ZRXA 2ZCGA 4PA8A 4X9SA 3PBUA 4OT7A 4JX4A 3U8GA 1LBLA 1ME9A 1KM5A 4ADTA 3KAOA 2OCZA 2BZNA 3W2MA 4BWLC 3EWBX 5I3FA 3NL2A 2FPTA 1VCVA 3EX1A 2RKXA 1VLIA 4AMAA 3C6CA 2YCEA 3UWUA 1LOLA 3W75A 4UMBA 3G1XA 2E6YA 1AL8A 1IXQA 4IMEA 4M7SA 1TQJA 3L5AA 3DXIA 3MW7A 3N34A 1CW2A 1KBJA 7TIMA 3EX2A 1AW2A 1OFAA 1A5BA 4E0CA 1ICPA 4RJEA 1ZCOA 1PV8A 5DXYA 3R89A 3M0ZA 1M5WA 1OG0A 2E68A 4AAJA 5D04C 4GUIA 3FIGA 1KM3A 1P4CA 4ORIA 3OA3A 2G95A 4MY9A 4XKYA 1BKSA 4GUFA 5LGZA 1HO4A 1JCYA 1QWGA 3ABQA 2ZBTA 3MBFA 3HMJG 3KOFA 5AYXA 4XZ9A 2QCGA 4XBKA 5D03A 3W7LA 4P61A 5KZDA 1DBTA 4M5PA 1B3OA 2YYTA 3WK3A 3LXAA 1NF7A 3C2EA 1IXOA 3KX6A 3O6YX 4JY9A 1H50A 4JTIA 3M5YA 3CM4A 3TC7A 2A1YA 3RNDA 2DZSA 4IJBA 5AHEA 1VJIA 3PG9A 3W7IA 4UR7A 2C16A 1NSJA 3BLFA 3B8DA 2CLHA 4RK8A 4JTTA 2O7SA 1I8JA 3L21A 2AAMA 2A6NA 4UFHA 3OVPA 3B0PA 1VC4A 3W2UA 3P8IA 3ABRA 1PL9A 3DFQA 3STGA 1XBZA 3V1PA 3VE9A 4DPQA 2A21A 3P5YA 3BW2A 3T4CA 4DO5A 4NNBA 3L9CA 1ONRA 3INPA 4UFJA 1AL7A 3W1XA 4IUOA 2DZUA 2JGQA 5CPLA 4DF2A 3TCEA 3LX9A 2TSYA 1QMLA 2V5LA 1O60A 4BWLA 3NOEA 4O50A 2Y7DA 2V5BA 2PRMA 4A21A 4JTHA 1O4UA 1JQXA 5CGQA 3HGSA 1K7FA 3IGSA 2WNZA 2NZLA 3LCIA 3W7CA 5HR6A 4ZL1A 4JIPA 5DLCA 1H7PA 3W2LA 3JS3A 2Z6JA 2V8ZA 3CQ0A 1H51A 4OV9A 4QJ1A 3NPVA 3ZR4A 4O54A 3EX6A 1I2OA 3OBKA 5HULA 5KZMA 1ME7A 3TSBA 4RX0A 4CQ9A 4ZQOA 1R2SA 4O57A 4RR4A 3IGXA 3NQ7A 4NJJA 3G1SA 1ALDA 4ICNA 5HMSA 3NL3A 1XDMA 3QW4B 1QO5A 3MP5A 5H91A 4A3UA 2CFFA 1GVQA 1GVOA 2CLOA 3L0KA 3KRUA 1JUKA 3C2VA 3E9AA 1VLWA 3WJSA 3TXZA 1K7XA 4GRSA 3GDKA 1WDWA 1TQXA 3QPZA 2QDGA 1P1XA 1SZFA 5DBTA 1OX6A 3MMTA 5D33A 4Z1DA 3BARA 1EPXA 3PBYA 3FYOA 1K7EA 3QEZA 4QITA 5FF3A 3W3OA 4NJKA 5IBXC 5D2TA 3S1XA 4CCCA 2ZZ3A 5HJLA 1LRNA 1OJXA 3RF9A 3WJXA 1MZHA 1JR1A 1Z44A 2H8ZA 5T26A 5HWNA 4O10A 2X2GA 1KM2A 2NUWA 3QFEA 1DJQA 2H6RA 2VFEA 3W72A 4WY0F 5G1YA 1SW7A 4PC8A 1S3HA 5D02A 3DKLA 4MY1A 1L6YA 3BW3A 2VEIA 5BW6A 1SR9A 2B7NA 2HSAA 5FF4A 2OT0A 4FIRA 5LNVA 3THAA 2A0NA 2A7PA 4JICA 5D05A 4U4MA 3DBPA 4EWND 4AEOA 2RDTA 2Z2UA 2E5CA 3NYZA 3S6DA 3GXPA 1UUOA 5G2HA 3GXTA 2CU0A 3IIOA 3SW6A 3TXVA 2OX1A 1SU5A 1W5OA 3MJYA 5K4XA 5KTLA 3Q58A 4HSNA 3EWZA 3LLDA 3PB0A 1G4TA 1TJRA 1KFEA 5CSRA 3UWQA 3TUUA 2ZRZA 4DBDA 5CSSA 5K4ZA 2YFNA 1P0NA 1QFEA 2ZA2A 1V5XA 4UFKA 3NPXA 1GQNA 4JTLA 2LLEA 4QQ3A 1SFJA 4BI6A 2BWGA 4DXVA 1YXCA 1O5XA 3I65A 1KM6A 1VYSX 5HR7A 3A9IA 1CX9A 2J27A 1MO0A 1TV8A 3QRHA 2A7NA 1H61A 1DORA 3UYCA 1SZGA 2ALDA 2YXGA 4DF1A 4LOCA 5G5IA 4HNVA 4O52A 4IMGA 4LV4A 3W7HA 4H3DA 3ZFHA 3W7KA 1TPEA 2FTPA 4O11A 4HIBA 2GJNA 4ZMGA 5KMYA 1DQXA 2JKEA 2YW4A 1K03A 3P62A 4LC6A 2CZ5A 3MI3A 4S1FA 4DF0A 1IIGA 3W2NA 2Z1BA 3E02A 1IXPA 3MYOA 5G4EA 3MI2A 3S1WA 1H7NA 3S5YA 1JJKA 4POCA 3DH7A 4IX2A 3CTLA 3KVMA 1G67A 3N14A 3MUXA 2H3BA 1FWRA 1L2UA 1KTCA 1TPFA 3W6YA 5U4NA 4Y9AA 4UTWC 2ZTKA 2Q3OA 4JDBA 3O6CA 4MIMA 3G18A 4MUZA 2FPYA 2D73A 4NT0A 5IBXA 4HPJA 1WOAA 1OYCA 3C2OA 3GR7A 4S2BA 5BOOA 1M7PA 3SJ3A 4GE8A 1F74A 4TR9A 1P5BA 2JKAA 3CLMA 1E51A 3PC0A 4UFIA 1OYBA 4UNKA 2VFDA 3HOJA 1VCFA 3WFAA 3NQDA 4UCGA 4TMCA 4S2CA 4PL2A 1XCFA 2ZZ6A 3FYPA 2VENA 1ME8A 3NQ8A 4LU0A 2EF9A 3PS7A 4EF8A 1FY6A 5G2WA 4QSHA 2E77A 3E12A 4GUGA 1LTDA 4E38A 1U5JA 2QEZA 5DELA 3IVUA 4O16A 4QAIA 3SGZA 3UNDA 3W22A 1RPXA 1KTNA 1M6JA 4JTGA 4YCOA 5K9XA 4IOTA 4GNJA 3LHTA 4O28A 3W7GA 1TPH1 3PR2A 5I3IA 2DU2A 3LLFA 3MHGA 4N4PA 3G8RA 2NXGA 2C18A 3EKZA 5E0KA 3W7OA 3DU0A 4MKNA 1PHQA 3TNOA 3UZJA 2EGZA 2J9XA 4A29A 4ADSA 4IQLA 5F2LA 1VS1A 2BSLA 3W1RA 4NNAA 4LY8A 3W74A 4NNCA 2ZZ2A 3NXFA 3L2IA 5DCEA 2BLEA 2IQTA 2Y70A 3LTSA 3UZ5A 1VZWA 1I45A 2CLEA 2V0TA 4CQ8A 1V7YA 4CNNA 3I6RA 1GVRA 1W5QA 1WQ5A 3NQ2A 4MJZA 1XUUA 5DCDA 2B7QA 4XKYB 3F1QA 2CZFA 4LVFA 4E2DA 1KFJA 4BF9A 3G22A 3R12A 5CZTA 4ZQCA 4ORMA 1YXDA 4GBUA 2H3DA 5DBUA 3W1PA 4L4LA 4NUWA 3HBLA 1M7OA 4B5NA 4NQ1A 3WJYA 2J88A 2ISWA 1GPWA 3I68A 5A8GA 4O14A 1OK4A 4DPPA 1TCDA 2ZA3A 4XTIA 2OZ0A 3HGRA 5D2XA 4QNWA 2NX3A 3FS2A 5G4WA 2QAFA 4DO4A 1WX0A 3S1VA 3L0GA 3SZ8A 1VCGA 4Y8FA 4UTWA 4C1LA 4O1CA 3NGJA 4JX6A 4PFMA 3P8JA 2ZDRA 3QMTA 1S5TA 3UWZA 1QAPA 4BK9A 4Z1BA 1OFPA 1S5VA 1VRDA 2ZRVA 5TBOA 3L5LA 2P1FA 1W0MA 3EX4A 4UTIA 2H90A 4M19A 3W88A 2FJKA 3SI9A 2W0UA 2WQPA 1TIMA 2YPIA 2G97A 3P61A 3UPWA 1TRDA 3AO0A 1EX5A 6TIMA 4N6EA 4WY0B 1W5MA 5DY2A 2OT1A 1EP2A 1DHPA 1QPOA 4PEKA 2TYSA 3QQ0A 5LSMA 5D38A 1TYGA 5FF7A 1R2RA 4FNRA 3H55A 2PRLA 1IXNA 3B0UX 3KRZA 1SQ7A 1WXJA 3THQA 3PBWA 2YX0A 3EWUA 2QDHA 3QH2A 5AHNA 1G7VA 4NXKA 3YPIA 3LM7A 3ABSA 2B4GA 4NJHA 2V82A 2PE4A 1LORA 1LM1A 2ISSA 1B9BA 2EPHA 1YPIA 3TA6A 1KA9F 1RD5A 1J4EA 3HO8A 2YDAA 1TO3A 1DV7A 4KFNA 1O5KA 1JULA 1VYRA 1R47A 3KVKA 4NZFA 1N55A 3C0JA 3VFLA 3HPXA 4ZZ9A 1GG0A 3MYPA 2DZXA 3W07A 4JN6A 3M5ZA 3SY5A 4JYEA 4UMAA 2R94A 1F73A 1DOSA 3F4NA 1DKWA 3W86A 4WQ6A 3CB8A 5HINA 2V2CA 1R30A 3NQ6A 3N9RA 2NXHA 1JCNA 3G0SA 1IIHA 1NFBA 1NAL1 2E6DA 3LRMA 5HWJA 3P81A 2YR1A 5ABTA 1I2RA 4LS0A 2ZQ0A 2O7QA 1WAUA 2QR6A 1FCUA 3CWOX 3KVJA 5F4WA 5DN1A 3DAQA 3W2KA 5LHEA 4QIUA 3LTYA 4RLIA 5CZ0A 4EF9A 4RZ4A 1EP1A 4N9EA 5C5YA 1OF6A 1T96A 3GDRA 5KITA 3QF0A 1OX4B 4K6AA 4MZYA 2ZZ7A 4HPXA 2RH9A 1R2TA 5DXXA 3QM3A 2NX1A 2V2DA 5J5RA 2HS8A 3PBVA 3S1UA 1YDOA 3FKRA 3NDOA 4MZ1A 1Z42A 3TX9A 3BG5A 3CWNA 3TK7A 1N8FA 3N73A 4GUJA 5G2IA 4OU1A 3GB6A 1X1ZA 3M9YA 1RR2A 4K8EA 4UTJA 1Q6LA 1WBJA 1LP6A 1ZY9A 3UY7A 3IIVA 1RV8A 4GFSA 4O1BA 1Q6OA 2Q8ZA 2Y61A 3NQEA 5CPNA 4MOZA 4NJGA 2X1RA 4GJ1A 3LB0A 1OFEA 3O63A 5U7SA 4DELA 1P0KA 4YWIA 3DGRA 3NL5A 3TROA 1WA3A 5HQEA 1YTEA 5F2IA 1FDJA 2QCEA 1UASA 3EXTA 4Q32A 3OVRA 1I2PA 5EYWA 3W1LA 4TX9A 3L68A 4JXCA 1KBIA 5D2VA 3HG4A 4ML9A 2QCDA 3A24A 1BTMA 1VQTA 4WY0A 2AQWA 3TSDA 4MLRA 2JBMA 3TC6A 4XTDA 4FX8A 1EB3A 1XFBA 2E6FA 3IIZA 4WZHA 4AVFA 1OABA 4I9AA 4WXYA 3TSMA 1LOSA 1W5NA 4U28A 5KZEA 2XN2A 2G5WA 2I9EA 5AOUA 2QCMA 1OFDA 1KLYA 1UB3A 1YPFA 4CNOA 1W37A 3GVGA 3W7PA 2ZZ1A 3NQCA 5C54A 3P67A 3QMSA 4P2VA 3HG3A 3PWAA 1WBHA 4AHPA 3FKKA 3DZ1A 4LVGA 4DQWA 5FEWA 2ISVA 1JUEA 1D9EA 3QYQA 1FXQA 1QCWA 3GX9A 2A85A 1NEYA 3DFSA 1QPNA 2QUUA 4AWUA 1SO4A 4JDYA 1TV5A 5F2GA 3ZWSA 3C8FA 1OFBA 2C0AA 2UV8G 2R8WA 2Y7GA 3LERA 2CLMA 5FEXA 3BGGA 2CZDA 1SUXA 3A5FA 4N9BA 2WSQA 2RDWA 3W7QA 1ZENA 4GUHA 4K8HA 1I2NA 4MFDA 1MXSA 4UNLA 4HN4A 5I3KA 1TTQA 1F5ZA 4BFAA 4AF0A 2DJLA 3FJLA 5LNRA 4R34A 4O53A 1J5TA 4O19A 4FNPA 3PY2A 3S9YA 3BW4A 3NVTA 3PF3A 1K3UA 4W9TA 4NJIA 1H7WA 1FCBA 4TMBA 3FOKA 3M44A 2VEMA 3TU9A 2Y63A 4LNYA 4BI7A 3RMJA 4Y96A 3O06A 2Y7EA 3PULA 2RDUA 1QDSA 3B03A 1KM1A 3D0CA 4WUIA 1FWTA 4OBTA 2KZHA 3CIXA 3W85A 4X22A 2ZA1A 4UTMA 1DQWA 3TKFA 3M5VA 3PM6A 3L65A 4WXZA 1TV7A 4HNTA 1OX4A 1Y0EA 1LOQA 2GVGA 1A5SA 4XUGA 4PCFA 4O0ZA 2GVJA 2CLFA 4M6PA 3MBDA 4N9DA 3G1FA 3JR2A 2VC6A 4JTFA 2B7OA 4X3ZA 2J24A 3P7YA 3P84A 1SSGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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