1XYZA

A common protein fold and similar active site in two distinct families of beta-glycanases
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
NALRDYAEARGIKIGTCVNYPFYNNSDPTYNSILQREFSMVVCENEMKFDALQPRQNVFDFSKGDQLLAFAERNGMQMRGHTLIWHNQNPSWLTNGNWNRDSLLAVMKNHITTVMTHYKGKIVEWDVANECMDDSGNGLRSSIWRNVIGQDYLDYAFRYAREADPDALLFYNDYNIEDLGPKSNAVFNMIKSMKERGVPIDGVGFQCHFINGMSPEYLASIDQNIKRYAEIGVIVSFTEIDIRIPQSENPATAFQVQANNYKELMKICLANPNCNTFVMWGFTDKYTWIPGTFPGYGNPLIYDSNYNPKPAYNAIKEALM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A common protein fold and similar active site in two distinct families of beta-glycanases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1,4-BETA-D-XYLAN-XYLANOHYDROLASE
molecule tags Glycosyltransferase
source organism Clostridium thermocellum
total genus 140
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 1995-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1xyzA00
1UWQA 3W24A 3UESA 1R87A 2VZTA 2J7EA 2OLHA 3T0BA 4ZEPA 4KGJA 2OWXA 3WFLA 5A6BD 4Z2IA 4HOXA 3AMLA 3AISA 3N11A 4GZJA 5GNXA 1LWJA 3L4XA 4P7NA 4P7RA 4BA0A 4YPJA 5BWFA 1EH9A 2DEPA 4AZCB 5LA0A 3WQ4A 3E1F1 1BG4A 3AI0A 3IJ8A 1B0IA 1JYNA 3CO4A 3WQWA 2VX4A 4UFLA 3ZMRA 4W93A 1B3VA 1ZBCA 2ZWYA 3U57A 1HL9A 2DT1A 1WCGA 2E4TA 2G3NA 4J3SA 4GZIA 5D8WA 1UKQA 2E0PA 4DWSD 5ECUA 5E0FA 4AC1X 1ECEA 1UKSA 4D6FA 2DT0A 4GKLA 4W8AA 3WL0A 3PZTA 1XSJA 2JEQA 5DFAA 2WAGA 4AY1A 3O9NA 3VMNA 5HXMA 1E15A 3WDHA 1LF1A 3UEQA 1LWHA 3WD2A 1JD7A 1V3JA 2DPEA 4GQQA 2OSYA 2VVSA 4L4PA 2XTKA 5TD4A 1EDTA 1TG7A 1FP9A 3AZSA 1QPKA 4AD4A 4BQ3A 3VMOA 3TONA 2HISA 1MW2A 2WSPA 2J62A 3WF1A 4QP0A 4V2XA 5CQ1A 5ABFB 4PMQA 1FH7A 3AMKA 1MXGA 1NWRA 2D1ZA 3T2PA 1G5AA 4D6IA 1BYBA 2QF8A 3GNPA 2WKGA 5AC5A 4PTXA 1I1XA 1PIGA 3AICA 3SCNA 2EO7A 3NDYA 1W3KA 1W3JA 2BXZA 4WSKA 3VIMA 3SCSA 2WYSA 3CZLA 2XPKA 1UHVA 1WZMA 3VIGA 3BLKA 3QR3A 3IJ7A 2YA1A 1H4PA 2NW0A 3EBVA 5D8ZA 1HJUA 1U2YA 2W61A 8CGTA 3RM8A 1UWTA 5FCZA 5DT7A 3IAPA 1ESWA 2C0HA 4TTGA 2E40A 2WMJA 1E40A 4LGXA 3W38A 3T2QA 1V3HA 1V6UA 1GHRA 1JI2A 1W9UA 4KWUA 1K9FA 1K6AA 2WMIA 4JKMA 2GJRA 3UERA 5D9MA 5M5DA 1V03A 1VIWA 4E2OA 4J7RA 4H41A 3ARVA 2BHUA 1VEOA 2ZUUA 4UNIA 3ARUA 1JAKA 1KXTA 2IUZA 3B9AA 1KXQA 4UR9A 2YL6A 3CH9A 1ZB5A 1BTCA 2YLAA 1KR0A 1E6RA 3WIJA 1OD0A 1RPKA 4HU0A 2A3EA 2XVGA 1V3IA 1GUVA 1MVYA 3SURA 1CGXA 3ARXA 3AROA 4ML4A 2BFGA 4E8CA 5FL0A 3ECQA 3M07A 1BYDA 1E6NA 2CESA 4AZIA 4PMVA 3S6TA 3L2MA 4UTFA 2J8FA 1PAMA 3VU2A 2WWDA 3GXDA 3VNYA 4AD0A 1JZ4A 1UZ1A 3WL1A 2WVUA 4P7LA 3GBEA 2JEPA 2YDRA 4AD2A 3WNPA 2ZE0A 3SUVA 3DHPA 1UR0A 4HOWA 3WKZA 2CHNA 1FFRA 1CWYA 2W91A 1JD9A 2XIBA 5E0CA 4OZOA 2WKLA 2VQTA 2WCAA 1C90A 1E0XA 1VBUA 4CN6A 2DH3A 4CU7A 1K9DA 1ODZA 3WQ8A 4XZWA 2F2HA 1H0GA 3IAQA 1VAHA 1KGXA 4GO8A 3W37A 1UR4A 2GJPA 1E6SM 4U5IA 4PMDA 2W92A 3UG4A 2VX5A 3FNDA 3WEMA 4BQ4A 1GCYA 4E4PA 3AOFA 4MDPA 1VEPA 3WEZA 3PZ9A 2GDUA 3VX0A 4HU8A 5JBDA 2W62A 1W2VA 5I2UA 2ZX9A 2VCAA 1UD3A 3CIVA 3MUAA 2OSXA 2YA2A 2O92A 3AHTA 1ZBVA 2D2OA 1JZ2A 1AVAA 4WF7A 5EBAA 1GVYA 2CPUA 3L4UA 4OBRA 2WMIB 1CGUA 3VM7A 4A3HA 3AIBA 1CPUA 2OWWA 1VFMA 4RE3A 2XUCA 1S46A 3PZOA 3WMSA 5I6SA 3QOKA 3AXHA 2G41A 1V3MA 2D3LA 1CLVA 2YL9A 1MW1A 2WVTA 2WC7A 3EYPA 5F7UA 3CMJA 3WSUA 1HP5A 5CSYA 3LPPA 1WZAA 1E6XM 1BG9A 3PZMA 3WD3A 3T0DA 1EIBA 2PI6A 2BY3A 1Q6EA 1QI3A 1UH2A 3JUGA 1WZKA 5BCAA 4N42A 2WB5A 1HF6A 2BVYA 3WDPP 3NSMA 5A94A 2VZOA 2XVPA 2J75A 4MAVA 2Y4SA 5A6AA 5ABEA 2DGAA 1JXJA 1O6IA 3BMVA 3TTOA 4IPNB 4OBSA 1MQRA 1UR8A 1UUQA 3VDCA 4W8BA 3F5JA 2QHAA 3SCRA 5IXEA 4CCDA 3WDIA 4ATLA 3OLGA 1NM9A 5IHSA 1XH0A 5LA1A 2XM1A 3AJ7A 5JBFA 4L4OA 1DWFM 1ODUA 2RGMA 2A3CA 4MB1A 3SUUA 3O2LA 4HZ6A 4FLSA 1FA2A 4R27A 4D6CA 5CG0A 2VI0A 4W89A 4D6EA 1VBRA 5E9AA 1GQKA 2IXUA 4P8VA 4V27A 1HKKA 5HNNA 1ISZA 3UG5A 3ZT5A 4Z2JA 2D20A 2EXOA 3PZIA 1U33A 2ZX8A 1GQLA 4CU6A 1ZJBA 3AS1A 1GQJA 2ZX6A 4QCFA 2ZXQA 1XV8A 3QHNA 4D1IA 4PCTA 3VGFA 2VL4A 1GOQA 4XX6A 1HKIA 3B9DA 3WNLA 1RD6A 3VGEA 3EDKA 1W1VA 1KR1A 1WDSA 4M8UA 5EFDA 3ZM8A 2JIWA 4JKLA 3K4DA 4Z2KA 4ZXOA 1VF8A 1B30A 1DHKA 2WMFA 3OB8A 1WKYA 4EANA 3WNKA 2XVKA 2VZUA 2V5CA 1KWGA 4M29A 3K46A 4QFUA 4JCLA 1Q6GA 2YLLA 3D5HA 3BLPX 2PC8A 5A3HA 2D0FA 2AAAA 4A4AA 1TA3A 1V02E 2Y24A 2G3MA 1LLOA 4F9JA 1EA9C 2G3IA 2VRJA 3IK2A 1J01A 3I3EA 4C7FA 5FD0A 3TOPA 1V0MA 3I3BA 2VUYA 4HOZA 5CPTA 1IV8A 5HDRA 1EQCA 3UR7A 4H7VA 3BAXA 1I75A 1MFVA 4AZ5A 2X2YA 4KGLA 2OYMA 2VR5A 3ZJKA 1PX3A 3VVGA 1H11A 1JNEA 1QI0A 1Q6CA 4LPCA 1UD8A 1VEMA 3K8KA 3OA5A 4P8UA 1XH1A 5BXPA 5A6BA 3WH7A 2WZHA 1CGTA 3VIHA 1NOWA 1V02A 1TR1A 4AZHA 1R86A 3SUSA 3HMCA 3RDKA 5GPRA 1R7AA 2XM2A 1CXLA 4MNKA 1J11A 5A6KA 2JF6A 5CPSA 1KQZA 1H1NA 3QGVA 3QOMA 2VVNA 2WCSA 2J77A 3W28A 2Y8KA 4DWSA 2QLYA 1WDQA 2AMGA 3WH5A 1GOIA 3AFBA 5KZ6A 4EK7A 4F8XA 2PF0A 1PZ2A 2J47A 3N15A 2D24A 1B3XA 1F4HA 1UKPA 4U31A 1UYQA 3PZNA 3FXYA 4DUWA 1EGZA 1B9ZA 1E43A 3ZT7A 3WF4A 2DSKA 3HU7A 3MU7A 3TTSA 3FHAA 2VZVA 3AZRA 1R8LA 2PWEA 4WKFA 3VINA 2XG9A 2QMJA 3II1A 3W29A 4ATWA 2BV9A 2J79A 3BAIA 1DWGM 3W6MA 3AHXA 1E3XA 2Z1SA 5CLWA 1H09A 1W3LA 4LQ1A 2VMFA 2ZUNA 4PMOA 2ZICA 1E9LA 3OLDA 2XVLA 9CGTA 5A69A 4D1JA 4B3LA 5A8MA 4UOJA 3OGSA 3W25A 4WK9A 3FW6A 5D9NA 4GZEA 2XFYA 1QBBA 2XYLA 1HT6A 1TA3B 2DSZA 4MTVA 4KRTA 3EDJA 1JYVA 5A2CA 1WZLA 1GONA 1OGSA 1VRXA 5A6SA 4URIA 1BPLB 2V5DA 2YOCA 3LMYA 1XD1A 2CEQA 2B31A 1UKOA 3QHOA 4W5ZA 1UR2A 2D0GA 1OCQA 7TAAA 2C7FA 2XIIA 3ARTA 1E1EA 3L4VA 3ZOAA 1DWHM 3WENA 3SCPA 2PBOA 4MJ4A 5LA2A 3A4XA 1PBGA 4D6GA 1LL6A 1MWOA 4M81A 2FHBA 2YBTA 2BHYA 5BRQA 1LG1A 1W1YA 1BYCA 2ZUSA 1JYXA 3W6LA 3NUKA 4FLRA 1U30A 3OLEA 4K68A 1CXKA 2DH2A 1BAGA 2VRQA 1V0KA 4PMUA 2XWDA 1C91A 2EPLX 5ABHA 3AS0A 4DWSB 1FH8A 1E4LA 1E56A 2GUYA 4WSJA 2G4FA 3LPOA 1BVZA 4HMDA 3NSXA 1MYRA 1FHDA 2E3ZA 3AMGA 1UD6A 1GOMA 4KMQA 2NT0A 3KE0A 2EPKX 1WE5A 4BCEA 2QMKA 4U3AA 3MUY1 4JL1A 1UWIA 3PTQA 5A6JA 2X1IA 3GYCA 4OOZA 2BXYA 4N0RA 1CXEA 1KXVA 5E6YA 1IZKA 1L8NA 1ZS2A 3CUJA 1JAEA 4HPGA 5A6LA 3PTMA 2ZUMA 1GOWA 1H3GA 2E9LA 1RP9A 1RH9A 1UZ4A 2OSWA 5IHRA 2HVMA 3WH6A 1J0IA 1JDDA 1KBKA 4TVDA 2XFFA 1QNSA 1NP2A 1GW1A 1PZ3A 2BY2A 4UCFA 5A1AA 3POCA 3MS8A 3DYMA 1UQZA 3GBDA 2Q8XA 5E70A 1B1YA 3PZUA 2YJQA 3W0KA 1XYFA 4W86A 4AMCA 5M03A 1EOMA 5CGMA 3WQVA 1WB0A 1W32A 3CZJA 4JFSA 3WFZA 5GNYA 4P8XA 1AQHA 4CU8A 1OT1A 2J7FA 2YA0A 2WVVA 4P8WA 2YBUA 2YDSA 2JALA 1X1NA 3AHYA 4U3CA 3A6OA 1MXDA 4PMYA 3OLIA 3SCOA 4B16A 3GH4A 4CCCA 1JNDA 1P6WA 3I3DA 3NYDA 1W91A 1JDAA 3DECA 1EHAA 3ARPA 1XSIA 1BFNA 2VJXA 1AMYA 3WEOA 4H2CA 4UQCA 4V28A 4W7VA 1B3YA 3MANA 2X05A 1VFFA 3W26A 1M01A 1J18A 2W5FA 3W81A 4J3TA 1FOBA 3L4WA 4PSRA 4UQAA 1ISXA 4PYSA 1CXIA 4J27A 3U7VA 4LYQA 2Z1KA 3AIQA 2WSKA 1VFOA 5DMYA 2V38A 1JIBA 4J3UA 6CGTA 3M7SA 1EO7A 1W2PA 3NSNA 4F79A 4W5UA 1E5NA 4TVUA 4TX6A 2J25A 3AZTA 2YDQA 3CUFA 3W4RA 4UZSA 2MANA 1FFQA 1PJ9A 3AQUA 3LPFA 4LX4A 4CN4A 4NRSA 2G3JA 4GPNA 5I5RA 3CTTA 2E9BA 3B8SA 4PMRA 5FIPA 1J0ZA 4HA1A 1E72M 1E6PA 3BGAA 4AW7A 1ITXA 2VCCA 2E8ZA 3U7BA 4AISA 3K8LA 2OYLA 5FOOA 3CZEA 4EE9A 2WVSA 2ZXDA 3TTQA 3KL0A 1W9DM 3U5YA 4H8HA 4QDMA 3AS3A 1UD2A 4AZ6A 2WPGA 4MNJA 4GI6A 1V3KA 1OM0A 2FGZA 1E4MM 3WDJA 4OOUA 4F66A 1GVIA 4C7GA 3SEPA 1JZ3A 3WN6A 3AS2A 1CGYA 2WVVB 1A3HA 4KRUA 4TOQA 5C71A 3WDQA 5BROA 3ARYA 3DC0A 4MB3A 1G9HA 3POHA 2WK2A 1HNYA 4W88A 2CKSA 1V6VA 4UQDA 1E1FA 1QHOA 3VIKA 1M04A 2A3HA 1CIUA 4MB5A 2BVDA 1JI1A 4HZ7A 1PIFA 1UA7A 2J4GA 3MMWA 1A47A 4RL3A 2ZX5A 5LYRA 4DUXA 3AXIA 2W63A 4JFUA 3AYSA 1XRVA 7CGTA 2BS9A 4QAWA 7A3HA 1EXPA 2F61A 4D6DA 3ZIZA 4GO9A 2JFEX 1L0PA 3SCUA 3MSGA 2EBNA 1OINA 4P7QA 3VM5A 1DWAM 3L4YA 4KH2A 4A3YA 1CGWA 1FHLA 4PTWA 2CERA 1UG6A 2G8ZA 4CGTA 4IPLA 2XSAA 3VGGA 2GK1A 2VRKA 3CLWA 1B3WA 2EEXA 1DTUA 1H0IA 3ZQ9A 2J7GA 5BXRA 1E0VA 1G1YA 4OJYA 1N82A 3VIIA 1TVPA 4WLCA 3CPUA 3SCWA 3OIHA 4UQEA 5A8PA 4TUFA 4GIAA 4B9YA 3ZJ7A 2VURA 1QW8A 5AC4A 4X9YA 2QV4A 1HKJA 3THCA 1Q4NX 3J7HA 2WMKA 1NH6A 5BXTA 2Y5EA 1GZJA 1BGGA 1QVBA 3EDDA 1EHNA 3HJEA 4AIOA 1HX0A 4JCMA 2CYGA 3ZJ8A 3VD7A 2CETA 4AD1A 2PWDA 3AIVA 4PUEA 1UH4A 2ZUTA 4MAZA 2J8GA 3WBAA 1BLIA 2CITA 1V6WA 4PCSA 4DWSC 3EDFA 3BAJA 3WNNA 4MADA 1E55A 3VX1A 2QPSA 1D2KA 5HBFA 1C3FA 4Q22A 3SUWA 2BY1A 5I24A 4TX8A 1D3CA 3TTYA 4RE2A 4YHEA 4JKKA 4ZE5A 4ZFMA 4CKQA 3AYRA 4M1RA 2EPOA 5I0DA 3G6MA 1OBAA 4PEEA 2DIJA 4Q7NA 2CBJA 3RJYA 1DP0A 1LQ0A 3ALFA 1V0LA 4CD7A 2O9PA 3NDZA 1BGAA 5IDIA 1D7FA 2VTFA 1GJWA 4OUEA 2XHYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UWQ A;  3W24 A;  3UES A;  1R87 A;  2VZT A;  2J7E A;  2OLH A;  3T0B A;  4ZEP A;  4KGJ A;  2OWX A;  3WFL A;  5A6B D;  4Z2I A;  4HOX A;  3AML A;  3AIS A;  3N11 A;  4GZJ A;  5GNX A;  1LWJ A;  3L4X A;  4P7N A;  4P7R A;  4BA0 A;  4YPJ A;  5BWF A;  1EH9 A;  2DEP A;  4AZC B;  5LA0 A;  3WQ4 A;  3E1F 1;  1BG4 A;  3AI0 A;  3IJ8 A;  1B0I A;  1JYN A;  3CO4 A;  3WQW A;  2VX4 A;  4UFL A;  3ZMR A;  4W93 A;  1B3V A;  1ZBC A;  2ZWY A;  3U57 A;  1HL9 A;  2DT1 A;  1WCG A;  2E4T A;  2G3N A;  4J3S A;  4GZI A;  5D8W A;  1UKQ A;  2E0P A;  4DWS D;  5ECU A;  5E0F A;  4AC1 X;  1ECE A;  1UKS A;  4D6F A;  2DT0 A;  4GKL A;  4W8A A;  3WL0 A;  3PZT A;  1XSJ A;  2JEQ A;  5DFA A;  2WAG A;  4AY1 A;  3O9N A;  3VMN A;  5HXM A;  1E15 A;  3WDH A;  1LF1 A;  3UEQ A;  1LWH A;  3WD2 A;  1JD7 A;  1V3J A;  2DPE A;  4GQQ A;  2OSY A;  2VVS A;  4L4P A;  2XTK A;  5TD4 A;  1EDT A;  1TG7 A;  1FP9 A;  3AZS A;  1QPK A;  4AD4 A;  4BQ3 A;  3VMO A;  3TON A;  2HIS A;  1MW2 A;  2WSP A;  2J62 A;  3WF1 A;  4QP0 A;  4V2X A;  5CQ1 A;  5ABF B;  4PMQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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