1ZAHA

Fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFISNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High Resolution Reaction Intermediates of Rabbit Muscle Fructose-1,6-bisphosphate Aldolase: substrate cleavage and induced fit.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
molecule tags Lyase
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 142
structure length 363
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2005-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1zahA00
3ZWTA 3SGZA 4R34A 4AH7A 4K38A 5TBOA 1OX5A 1QWGA 1SZFA 1ADOA 2TRSA 3UWWA 2WPBA 1LOQA 1TPEA 4NJIA 3FFSA 2WQPA 4K8HA 3O6DA 1OFEA 1JCLA 4LC8A 1VGAA 5AHMA 4GJ1A 5G1YA 3UWQA 5CZSA 1ICSA 2NV2A 5CPOA 1KM5A 2CZFA 4OBTA 1HG3A 1W5NA 1SW3A 3INPA 3IVTA 1LRNA 2A6LA 2GQ8A 3QEZA 3BGJA 3W2MA 2VFDA 5BRBA 4L4MA 1FCVA 1RD5A 3MMTA 1H7WA 4DF1A 5FEXA 1W56A 3S8HA 1D3GA 3FLUA 1OYCA 1SPQA 1O4UA 4JYDA 1JVNA 5F4SA 5FF3A 3BLFA 2QEZA 2WNZA 1QMLA 4JDYA 5D2TA 3SIZA 2NX9A 3SGUA 4UTUA 1X1ZA 4P61A 1DV7A 2V2CA 4HT3A 5E1QA 3MI6A 3IIOA 4O14A 1T96A 2RFGA 4IMFA 3A5VA 1H60A 1ALDA 2DZTA 4LT9A 4UTMA 3RNDA 1S3HA 1AW5A 4O1CA 1XBXA 1TREA 4UUIA 4HKPA 1R2RA 4UTLA 3QW4B 3LCXA 5U7SA 4NJGA 4MFDA 2CWNA 3O05A 2ATMA 1NFBA 2CU0A 4QQ3A 3TXVA 1NF7A 2QAPA 1TCDA 3NL3A 1P0KA 2YFNA 1DJNA 3HPXA 2YYTA 2O7QA 4DBDA 2YFOA 4IX0A 5G5IA 1KTNA 4FEZA 3W7DA 3M6YA 4H4IA 5A5WA 3FJLA 3VCRA 4I9AA 3GAYA 1A50A 3S0CA 3AO0A 3M41A 3PAJA 3ATYA 4MYAA 4O52A 4A2SA 1VLWA 3W7RA 3O6CA 3A9IA 3BW4A 3DBPA 4I7UA 3STFA 4TMCA 3GDTA 3PULA 2UV8G 4JTGA 2AQWA 1EUNA 1BTMA 3EEGA 2NXGA 4IJBA 1IXQA 3NPUA 1O60A 4IGHA 3CLMA 4ZQCA 1DL3A 5DY2A 1W5OA 4UNKA 5LSMA 3N34A 3NL6A 3PSWA 4YL2A 4PC8A 3QC3A 4LUJA 3HGJA 3L5LA 4M6PA 3DAQA 5I3KA 1W54A 1X8FA 3L66A 2ZA1A 1ME8A 2DJLA 4O11A 4ZZ9A 3LBCA 3IIXA 3PSVA 3EWUA 4KFPA 1VS1A 1XBZA 4ZL1A 2QAFA 2DZXA 2CLLA 3M5YA 1KM0A 3GDMA 4A29A 2YXGA 3LCWA 2YR1A 4MZYA 1W5MA 4CQ9A 4MOZA 2ZZ6A 3BV4A 5KSWA 3TDFA 2A21A 1BKSA 5FEZA 1RPXA 2EPHA 1H1YA 3IVUA 3C0JA 4XTDA 1Q3NA 3LTPA 3TX9A 3G0UA 1K3UA 3FIGA 3G22A 2NZLA 3IIVA 3N2XA 4KWWA 3QYQA 1T0OA 2CW6A 1XBYA 4H3DA 3UWVA 5KTLA 1QCWA 2C1HA 1YDNA 1CX9A 2VEIA 3UZ5A 3GDKA 3GZ3A 4A3UA 5AB3A 5EPDA 1LORA 4JTIA 3M0ZA 3FYOA 4YWIA 5F4XA 2Q3OA 3RLVA 1NEYA 3M44A 2LLEA 1EUAA 5AHLA 1KV5A 1FXPA 1GQNA 1VZWA 3L0GA 1GYNA 3BG5A 3OVRA 4JIQA 1EA0A 4AF0B 4C1KA 3HG4A 2Y88A 3USBA 3O16A 1JULA 4LU0A 5FF4A 1RQBA 4KWVA 2J9ZA 3S1VA 5D37A 3PG8A 1VH7A 3R89A 5F2IA 3P80A 1N55A 5FESA 2QCCA 3Q94A 4HSNA 2CLMA 4O1DA 1QAPA 3FA5A 4LVGA 2E09A 3W1MA 2ZTJA 3EWBX 2B7QA 3QJAA 4HPJA 3HPSA 1YXDA 1PHQA 5DXYA 3QSTA 3C52A 4MLJA 3MP3A 3P62A 2CZ5A 4IOTA 3LTYA 3W7PA 3LXAA 4PA8A 3ABRA 1PIIA 4ML9A 4E2BA 2J9XA 5D32A 3LXBA 4UXDA 1Z48A 4WY0B 3QMSA 3GIYA 3UXDA 3CPRA 3G8EA 3W3OA 4WY0F 4MKNA 1XDMA 2J27A 2QUUA 1EP1A 2CFFA 1EP2A 2Z6JA 1GT8A 3ABQA 4Y96A 4RZ6A 3BVJA 1WBHA 4JTUA 4NZJA 1Q45A 4LNYA 3IEBA 1KFLA 5HUPA 3S6DA 1FCUA 3SR7A 4Q32A 3WFAA 2A5HA 1I4NA 1LRTA 4IMGA 4PFMA 4UNLA 4ZQRA 3QQ1A 3W71A 2A7NA 4Z1BA 3UY7A 2ZZ4A 2E77A 2VFEA 3L65A 3LXCA 1JRCA 1ML1A 4PODA 3E49A 4DO5A 4NNBA 2C15A 2IQTA 3KX6A 3DI1A 3QZEA 3I7QA 4GXMA 3TC6A 5TQLA 3MP4A 3WJSA 3N19B 1JRBA 1QDSA 3DFQA 2KZHA 5KINA 1W3IA 1FWWA 4LVFA 1AW2A 1FWNA 1MZHA 1WYIA 1AK5A 2X2GA 3G1YA 1MEIA 1H5YA 3O8AA 4OQVA 2GQ9A 3VKJA 3LLDA 3NXFA 1KW1A 3F4NA 1FCQA 1HL2A 1HTIA 3DFNA 4K36A 3W2KA 4UIOA 3NR0A 4CNPA 3TKFA 2RDUA 3P74A 8TIMA 3FJ6A 1WX0A 3BLIA 4YLWA 1TTIA 1OYAA 3NQDA 3NG3A 1ONRA 1TMHA 1TV5A 1CW2A 1K8XA 2C6QA 2J24A 2NLIA 2H8ZA 3G18A 1F5ZA 2VEKA 1F76A 3DFPA 4M19A 4JEQA 3W2LA 5LNUA 5HUOA 4J9JA 2BLEA 2FDSA 4ALDA 3NQMA 2X30A 1QPRA 5AOUA 4IPJA 1P4CA 1ME7A 5CZJA 3LHYA 1JCXA 4UTWA 4DBEA 3STGA 4JX4A 1L2UA 3W7JA 4RZ4A 3ZFHA 1KTBA 1X1OA 1ZAHA 1QFEA 4FO4A 2V30A 3UNDA 4JTKA 4JTEA 4XTIA 2OJPA 1EWDA 1Q6LA 3W7CA 5K4ZA 4GNJA 4YCPA 1K8ZA 3OEXA 2A6NA 1XC4A 1A5CA 1AG1O 4TIMA 1LLWA 1BEUA 4NJKA 3HMJG 1KM4A 3LDVA 1OVDA 4O8RA 2C3ZA 3NZ1A 2V2DA 1SQ7A 4WJEA 5KZDA 4FX6M 3BPWA 1WA3A 1FWSA 4O17A 3KVLA 4Y90A 3G3DA 1OF8A 4RV8A 5CPLA 3W6YA 1OX4A 1OFDA 2E6YA 3LI1A 4OGZA 1M7PA 2BWGA 4C1LA 5BW6A 3W2UA 2ZZ1A 2BXVA 1IXPA 4RCXA 4OT7A 3PM6A 1OFBA 1VCFA 2QCFA 1IXNA 2QCEA 1A5BA 1OK4A 1S5TA 5K7JA 5DXXA 2HS6A 1GZGA 3U6WA 2RKXA 1TPC1 1Q6RA 3L0NA 1TPVA 1TRDA 3THAA 4UFLA 4UC5A 4GUHA 4QSHA 3HOJA 2AGKA 4WXZA 3IIZA 1DVJA 1NVMA 5BMWA 4MY8A 4HIBA 1RQHA 4RZ5A 5BOOA 4DO4A 1ZNNA 1OFAA 3ABSA 3TSMA 1ZALA 4A21A 3HG3A 2E5BA 5FF7A 4UFMA 3PB2A 3G24A 1VHNA 1H62A 3NQEA 4GC4A 4GUIA 1IIGA 3W1NA 3BK0A 2G95A 3MUXA 6TIMA 1F6PA 3S5YA 1SO5A 3N9RA 5D2XA 1DKWA 2JKPA 3DI0A 2PURA 3MHGA 3W23A 4QNEA 3F4WA 5HNRA 3BO9A 3W85A 2DZWA 4KFOA 3L2IA 3TQVA 3W73A 5E0KA 3P61A 5I3IA 3MO7A 1GG1A 5D02A 2QR6A 2Y70A 3HGSA 2I9EA 5HULA 2Z2UA 2VEMA 3NO5A 3W7HA 4JXCA 4Y8FA 2G97A 3HIJA 4HPXA 3W75A 4CNNA 2PC4A 3LRLA 3RMJA 4O54A 1KFCA 3WJXA 2YYUA 4S2CA 1THFD 2TYSA 3T55A 3B06A 1XXXA 2JGQA 1TPUA 2FPTA 4HHPA 3SI9A 3R8RA 5HR6A 4X3ZA 3IGSA 2O7SA 1EPXA 1H7OA 5I3JA 3LCHA 4AEOA 5IBXA 4O19A 2VEPA 2FTPA 1O94A 4NX0A 2YSWA 3TK7A 3STEA 2E6FA 1NF0A 2H6RA 3P67A 1B9BA 3NQ7A 4QAIA 5I3GA 1Q6OA 7TIMA 3BW2A 3NQCA 1Z42A 4HN4A 1KV8A 2OT0A 5C55A 4I7WA 3TQ0A 3CHVA 1T8XA 1X7FA 3UWUA 4UFJA 3MYPA 3W1XA 1LTDA 5I3FA 1JQXA 5AHEA 1Z41A 3TJXA 2OX1A 1LBFA 4PEKA 1UJPA 1F2JA 1TQJA 1FX6A 3MW7A 2A85A 4NZFA 3TV8A 1AL8A 5DCEA 3M5ZA 3TA6A 4NX5A 1F7BA 4TX9A 3TU9A 1AL7A 3SW6A 4MJMA 5LNWA 3LTSA 3GX9A 1GYLA 2WNNA 3M7WA 3PUDA 3KVJA 2BTMA 3CWOX 2VXNA 1VJIA 4LW7A 2P10A 4XKYA 2A1YA 2ZRYA 2W0UA 4UFKA 5H2ZA 2W79A 4CNOA 2FB2A 1GTEA 3QPYA 5TIMA 4IUOA 1WXJA 3EWWA 4PCFA 1JUEA 2YGYA 4UTIA 1G6CA 3S1UA 1QO5A 3QF0A 3MJYA 2FJKA 4UCGA 2RDWA 5CZTA 3O07A 3W7QA 2PRMA 2YCEA 3PR2A 3W1RA 1TJRA 3LRMA 5EBUA 3KOFA 1I45A 2C19A 1U83A 2NV1A 1FDZA 3TQKA 1W31A 2Y7EA 3P8JA 3P7YA 2ZZ2A 4UMBA 3VE7A 3W1UA 2P0OA 3LHZA 3NYZA 1GJPA 3P5ZA 4FNTA 4W9TA 5DLCA 1SZNA 3LX9A 4AAJA 3PVFA 1ZHAA 1AW1A 4O13A 4JTJA 1G7VA 5AC8A 2NUWA 4BK9A 1R47A 5HR7A 1FUYA 3M5XA 2Q8ZA 3EX3A 5CZ0A 1FXQA 1OFQA 1Y0EA 4MYXA 2C16A 5E93A 1XL9A 3CU2A 1XI3A 1JQVA 1TPH1 5DELA 1R2TA 5CG7A 3WJYA 1H7RA 4XBSA 1I2PA 5IBXC 4JN6A 3LRKA 2ZZ3A 1L6YA 4N4QA 4HNUA 2ABBA 3H54A 1KTCA 4M6VA 1XKYA 2GJNA 1SFJA 2QCGA 1GVQA 4MFEA 3OA3A 5J5RA 3W2NA 3IGXA 1A53A 1K7FA 3LCFA 3WJWA 2Z1BA 3TR2A 4JTLA 4RXGA 1W5PA 4HNVA 1YADA 4TU1A 3P60A 3B0VC 2OT1A 4UTTA 2R91A 5DCDA 4Y6GA 4CQAA 5CPMA 5LZLA 1EEPA 2YPIA 1J5TA 3PBYA 1FBAA 4MIMA 2Y85A 2CLOA 4DELA 1KFEA 5F2GA 4WOQA 1WOBA 3C6CA 4HSOA 4O50A 2H3BA 3KXQA 1MEHA 3Q37A 1PL9A 1SU5A 1FQ0A 2ZZ5A 4UR8A 3WK3A 2VC6A 3GR7A 4EF9A 3C2EA 3PC0A 2E6DA 1TO3A 1YDOA 2QJGA 2W6RA 3A24A 3B4UA 3G1VA 1V7YA 2H90A 4DPPA 1AMKA 2QUVA 3B04A 3DFSA 1HUVA 1FDJA 4AHQA 3C3NA 1YXCA 3DFOA 4ADUA 5AYXA 3A5FA 3W1AA 2WJZA 1C8VA 3KHJA 3P84A 1HO4A 2BX7A 1XCFA 5EA9A 1YDVA 2DZUA 3LHVA 3F03K 5G2HA 4CQ8A 4OU1A 1SZGA 4BWLC 4FB7A 1XFBA 3TH6A 3R2GA 2QCDA 3THQA 4CCEA 2EGZA 3EXRA 3T40A 1H1ZA 2TSYA 1OABA 3S42A 4A2RA 2VFHA 3NPXA 4UMCA 3NZRA 2JBMA 2QDHA 1QPQA 4LVDA 1JCNA 4DF2A 1IF2A 4JD4A 4JY9A 1GWJA 1RVGA 1TTPA 2GVLA 2JK2A 4DO6A 2ZTKA 1ZAIA 3E0IA 2E68A 3FKRA 2ZZ7A 1UBSA 4EOUA 1UCWA 4FNUA 3NPVA 3TC7A 4WQ6A 3W7IA 3LV6A 4A22A 3O1NA 1VCGA 3QH2A 1KFKA 4CCDA 4OV4A 4NU7A 1YPIA 4Z1AA 2DZSA 4ZQOA 1SR9A 5AYYA 4BF9A 3AJXA 1WBJA 5F2LA 4XBKA 4D2JA 4JX5A 1SO4A 2PCQA 3W1PA 1KM2A 2G96A 2B7PA 3NNTA 1JCYA 1OF6A 1GOXA 3PWAA 5AC6A 4O16A 4GUJA 3GYEA 1K03A 4AF0A 5F1VA 3DHDA 1ZENA 3TAKA 3NM3A 3RLUA 1H7XA 2GQAA 2I14A 3SY5A 4UTTC 3EWYA 3LHTA 3E9AA 2E5DA 1TV8A 2CZEA 4JS3A 2DJXA 1DOSA 3QW3A 2WV8A 3FEMA 1DBTA 3DKLA 1H7NA 3UQNA 3MHUA 4N9DA 5LKYA 4PH6A 4NJJA 5F4WA 3W84A 2NWRA 4I7VA 4R53A 5AHNA 3HPZA 2RHGA 3TXZA 3R12A 2ZDRA 3EKZA 4AMAA 4FX7A 2QKFA 3BARA 2FIQA 2OZ0A 2V2HA 3EXTA 4U4MA 4WX2A 1LRQA 5CGQA 3W7KA 3H53A 3CIXA 4IMDA 5U4NA 1EB3A 1GG0A 4L4LA 4JTHA 3M43A 1VLIA 1PS9A 4WD0A 1EP3A 2ISSA 3NM1A 3TAOA 2YZRA 4AWTA 3W07A 4ZVJA 5C2XA 1KFJA 4AHPA 5KZEA 5C5YA 3TW6A 2ALDA 1CI1A 4QM1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1UP3 A;  1LWH A;  4R34 A;  4K38 A;  1OX5 A;  1IT0 A;  3CUF A;  3HUR A;  4QS5 A;  1ZPT A;  1UOZ A;  3NSX A;  6PTD A;  4CEU C;  1PYF A;  1TPE A;  2WQP A;  1EJR C;  3WNM A;  2PC8 A;  5G1Y A;  3UG8 A;  1OIN A;  4V33 A;  1ICS A;  1QK2 A;  4HZ6 A;  2CBJ A;  3H26 A;  1SW3 A;  1LRN A;  1VPQ A;  2GQ8 A;  3QEZ A;  2VFD A;  4PMO A;  5BRB A;  4PB5 A;  3A4A A;  4HA3 A;  3MMT A;  3EDK A;  4DF1 A;  1AQH A;  5FEX A;  3S8H A;  2VGF A;  2EBN A;  1OYC A;  3RX3 A;  3H70 A;  5ABE A;  4JYD A;  1JVN A;  3BWW A;  2WNZ A;  5D2T A;  3U4A A;  4MG4 A;  1OY0 A;  2QII A;  4XSL A;  3CJP A;  4P61 A;  3QZ6 A;  4HMN A;  1HJS A;  1RBL A;  4QP0 A;  5DO8 A;  3MI6 A;  1C9W A;  3M0M A;  3WQ6 A;  3SUS A;  1CTN A;  2DZT A;  2NT1 A;  3RND A;  1XSI A;  1AW5 A;  5A8Q A;  5A6K A;  4UUI A;  3QW4 B;  6REQ A;  3PP7 A;  1W17 A;  1PZ0 A;  2ATM A;  4QQ3 A;  3TXV A;  1EHA A;  3V35 A;  1ECE A;  4PUU A;  3HPX A;  2NQH A;  4FEZ A;  3W7D A;  2ZC1 A;  4H4I A;  2ACQ A;  3AO0 A;  3M41 A;  3KP0 A;  1UPM B;  3WQW A;  4MYA A;  4O52 A;  2WHL A;  1CB2 A; 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