1ZAIA

Fructose-1,6-bisphosphate schiff base intermediate in fbp aldolase from rabbit muscle
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFISNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High Resolution Reaction Intermediates of Rabbit Muscle Fructose-1,6-bisphosphate Aldolase: substrate cleavage and induced fit.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
molecule tags Lyase
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 143
structure length 363
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2005-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1zaiA00
4UR8A 4O54A 4GWEA 1H51A 3STFA 2J88A 3WK1A 5LZLA 2V5LA 4JYDA 5LSMA 4RZ6A 2C14A 4UMCA 2Y61A 2AAMA 4M6QA 3BLEA 3W1MA 2BX7A 1K7EA 3DGRA 4RK8A 2RDWA 3HGSA 2E6FA 2O7QA 3W7QA 3LCWA 3CQ0A 1KW1A 1UUMA 2DJLA 5D02A 1SW7A 5FESA 3DI1A 4R7JA 3ZFHA 3R8RA 3W7PA 3ABOA 4TU1A 4UMBA 3ZS4A 5A8GA 3N2XA 4O19A 1PE1A 4JDBA 1HG3A 2EPHA 1L9WA 3WJWA 1KBJA 4Y90A 3U8GA 1KTBA 1OJXA 4UTTA 3S1WA 1G4EA 3IV3A 1JCJA 3TR2A 3NOEA 4MFEA 3LI0A 1F6KA 3L2IA 4Z08A 3DHFA 2X1SA 3ABQA 4LS2A 3UWZA 3VFLA 1ZHAA 4Y96A 2E6DA 1UUOA 4JTHA 1U5JA 1YLVA 1LM1A 3N3MA 1Z44A 1UBSA 1Z41A 4NNBA 1M6JA 3CIWA 3TAKA 3I65A 3P67A 4NT0A 1XDLA 5K7JA 3NL3A 3IGXA 1CX9A 3LHVA 1Q6LA 5AC8A 3C2RA 2Y88A 4O52A 4XWUA 1BWLA 3B4UA 5EL1A 3F1QA 2W6RA 1T8XA 2GQ8A 2Y7EA 2ZTKA 1RQBA 4FXRA 1LLWA 3QW3A 3SY5A 5L9FA 3M44A 3QMTA 3TC6A 1QPNA 3C52A 5D2TA 4A2SA 5E93A 2H8XA 1JQVA 2VFDA 2PRMA 4KFNA 1FWNA 3ABSA 4RKAA 4O50A 4ZL1A 1X7FA 4L4MA 1FCVA 1QAPA 5IBXA 5AN7A 5HWNA 4JTGA 4K39A 1VCFA 1K8ZA 3M1ZA 2JKAA 2VKZG 1FWTA 4A2RA 1S5TA 4LU0A 3NQCA 4HSNA 4JTLA 5F4XA 1OHLA 3WK3A 1F73A 3TUUA 3P7YA 2PE4A 4N6FA 2IQTA 1SU5A 4IMCA 3B0UX 4JX5A 2VFFA 2VEPA 2LLEA 2DZPA 2H8ZA 3S5NA 3NPVA 3NPWA 4LV4A 1K02A 3NQGA 1OYCA 3HF3A 1O4UA 1JUKA 4Z1AA 5I3GA 3GDTA 3Q94A 4TMBA 3C0JA 1TO3A 2BSLA 4PL2A 4JEQA 3FA5A 3HGJA 2P0OA 4QQ3A 5I3KA 4JIPA 1TPUA 3MUXA 4P2VA 3NVTA 4ORIA 1VZWA 3TC7A 2J6XA 2WSQA 4CCEA 1H60A 4IOTA 3DFPA 2Z6JA 4QSHA 1SO3A 4MZYA 3TV8A 2ZRUA 3W1UA 1O94A 3O8AA 5DXXA 4QISA 5K4XA 5TIMA 1G4PA 3DZ1A 3UXAA 3O15A 1VYRA 3HBLA 4XTIA 3C61A 1HL2A 1PS9A 5G4EA 1FY6A 4JTJA 3UWUA 1W5PA 1VYSX 2FJKA 2A6LA 5C55A 1W56A 4ALDA 3W1TA 1MEWA 4FX7A 1JUEA 3UY7A 5LNSA 1DJNA 1C8VA 3KVKA 4LVFA 3GDKA 1K8XA 2CLIA 2F7FA 2C16A 1IIHA 5EMUA 2W0UA 4ZQMA 3N9SA 5F2IA 3G18A 3LX9A 2VEIA 2GJNA 3G3MA 4I7VA 5C2XA 1JRBA 2RDUA 1I2QA 4PODA 1H63A 1L6SA 3A24A 5G4WA 4Z1CA 3G0UA 4CQ9A 1ZAHA 5BOOA 2QR6A 4O10A 1WOBA 3ANYA 4M5PA 2VFHA 3LHWA 1WXJA 3W1NA 4FEZA 3WJSA 1VJIA 3QC3A 2YSWA 3BG3A 1QPOA 3W85A 4OBTA 1XDMA 4MLRA 2CLEA 4LT9A 4DELA 4WXYA 1SZFA 1S3HA 3TDFA 2CU0A 1YPIA 3W2NA 4DBEA 5KZEA 4A3UA 4MY1A 5CSRA 4PL1A 1F05A 1FWSA 5CZSA 2A7NA 2A2IA 5AB3A 3TMLA 3MHUA 3CC1A 3EWWA 2WQPA 1SR9A 3HIJA 3GAYA 1XBXA 1LCOA 1DJQA 4Y8FA 1GEQA 3QYQA 3B0VC 5ABTA 2FTPA 4ICNA 4DQWA 4MLJA 4GXMA 1L6WA 2DZUA 4GNJA 1XCFA 3M41A 1JRCA 4EF9A 2VOMA 3QMSA 3O06A 3DKJA 3MBFA 1LOLA 4AB4A 2Z0IA 3NNTA 3IRDA 1OX4A 1VR6A 2P10A 5CPNA 1G4SA 5EPDA 3GXTA 1PL9A 3M6YA 1QO5A 4D2JA 2YW4A 2Q3OA 4DO6A 1TRDA 4UFJA 3GZ3A 4ZQRA 1W31A 1ICPA 4WJEA 3QW4B 5D32A 5FEPA 3PVFA 1RQHA 1FUYA 2ZRVA 4K8EA 4E2BA 1KM6A 4UFKA 4LC8A 3MI2A 3PBYA 3VE7A 1H61A 3W6YA 4BI7A 5HUOA 3A5FA 3T4CA 3KVLA 1EP1A 3M43A 1LBMA 3T78A 1B57A 1W1ZA 5A5WA 1F2JA 3KRSA 2ATMA 3N34A 3PR2A 3KAOA 2B4GA 4PTNA 3O07A 3HMJG 3HG4A 1DV7A 4EWND 4MY8A 3C8FA 4JY8A 3W75A 5AC7A 4NNAA 3HG2A 2A7PA 1A5SA 4JTEA 3W22A 1VH7A 2ZA1A 2BLEA 3HJZA 5L6UA 4IGHA 3W1RA 1SW3A 1P0NA 4JY9A 4FNPA 5DCDA 4TR9A 1G4TA 3MYPA 4RJEA 2WNQA 3W87A 2QCMA 2X30A 3NPUA 1TTIA 5D2VA 2PC4A 3QPYA 4RX0A 1IXQA 1S5VA 3O16A 1H7NA 2YYUA 1GQNA 4UC5A 3DFQA 1I2OA 4E2DA 1EUAA 4I7WA 1N8FA 4GFSA 2YDAA 3S5ZA 4JTUA 3BO9A 1L6YA 4UFHA 4ZQNA 4FO4A 4UTWC 1D3GA 5F2MA 1TV5A 3I68A 3NG3A 1XC4A 2QJGA 1EP3A 4QIUA 3W7IA 3EKZA 4RXFA 4OV4A 3TAOA 3PC0A 3GKAA 1YXYA 3P8IA 3G1AA 3QSTA 1MZHA 2J24A 3LTYA 4NZFA 4GUIA 4AF0B 2XFWA 2A0NA 3A9IA 5CZ0A 3W23A 2WPBA 1PCWA 1SPQA 3R2GA 4O4WA 2A21A 1EPXA 1TJRA 1YDNA 1W5QA 5G1TA 4N9BA 1SZGA 3W7OA 5F2GA 3LLDA 2H3DA 2FPYA 5K9DA 3LHYA 4E38A 5DLCA 1ALDA 1ML1A 5KTLA 5TQLA 3B0PA 3EXTA 1YPFA 3W7EA 1SFJA 4K7YA 2F84A 1DORA 1HFBA 1LZOA 4RXGA 5HUPA 3FEMA 5SWUA 4N9DA 5CSSA 4Z1BA 3RMJA 3KRZA 1EIXA 3NXFA 8TIMA 2QCEA 3W7JA 3M5VA 3P74A 4IXHA 1CI1A 3HG3A 3N14A 1ZJIA 5K4ZA 4ORMA 3HO8A 4HT3A 1VC4A 2FB2A 3W2UA 1TTPA 1WAUA 4FB7A 2Q8ZA 3GDRA 3BW2A 2YXGA 1Q45A 4PH6A 2TMDA 1PHQA 4GC4A 2ISSA 1JJKA 4OHQA 4Z1DA 3FKRA 2I9EA 2P1FA 3GNNA 2ZZ7A 5AYYA 4H6KA 2ABBA 1KFBA 1ZAJA 5F1UA 4WD0A 2J9XA 2V8ZA 2GPTA 3TE9A 3LBCA 4N9EA 5AHIA 1FWRA 3MP4A 4QM1A 1TB3A 1EEPA 3LI1A 3BGGA 4NJJA 1N7KA 1BWKA 4LC6A 3LTSA 1GTEA 4IMDA 4K7VA 3M5YA 1KLZA 3MMTA 2OMAA 4RZ5A 5D2WA 3U2OA 3NQ8A 3OEXA 1RPXA 3VI2A 4FF7A 5D2YA 1YADA 4CNNA 1YXDA 3RF9A 2A5HA 1WBHA 4TIMA 1Q3NA 3W73A 3LRMA 1A53A 1THFD 1E51A 3DH7A 3PUOA 4QITA 2GUUA 4RR4A 4O15A 5DY2A 2CW6A 2NZLA 2ZZ1A 1LBFA 5C6MA 1TCDA 2BWGA 1P1XA 4MIMA 5FF2A 4MYXA 1GG1A 1QNVA 1LOQA 4O11A 3NDOA 4JX4A 5LGXA 3S5OA 3STCA 1FQ0A 1W54A 5DN1A 2CZFA 2ZZ5A 4DF2A 3CTLA 4IMEA 4MZ1A 3T55A 1JCNA 1LTDA 1O60A 4FHAA 4NXKA 4AWSA 3R89A 3TROA 1O5KA 4IXXA 3W9ZA 4AHPA 3THQA 4YWIA 2X1TA 3IEBA 5CKSA 3HPSA 4FNSA 5U4NA 3WFAA 3N2MA 1AL7A 1AK5A 3TW7A 4NJHA 4O1CA 3LV6A 1JULA 3M0ZA 1F6PA 4KWVA 4M19A 1KFCA 3IIPA 2C3ZA 4S2CA 1LROA 3TIMA 3U6WA 4CQAA 3EWYA 1XM3A 2PRHA 3LDVA 2V5BA 4CCCA 3BVJA 5LNUA 3GDLA 4LUJA 5F1VA 1J5TA 2BXVA 5H91A 1OYBA 2NLIA 1TJPA 3W07A 3I7QA 3EWZA 2Y70A 4H4IA 4Q33A 4GJ1A 2Y7DA 5J5RA 4UFLA 2WSRA 4LOCA 1G67A 4RV8A 5AYZA 1DHPA 1WDWA 1SSGA 1W5NA 3G22A 1GVQA 2YZRA 4K36A 1K7FA 1PCKA 4JYEA 4N2YA 5LGZA 1H1YA 3CHVA 3M5ZA 4JS3A 3LCIA 3W86A 3W7MA 1GVOA 1HTIA 4LY8A 2X1RA 4A22A 3RNDA 3NQ2A 2DZSA 3OA3A 1H50A 1UJPA 1GJPA 3G1FA 3W76A 1ADOA 4R33A 1NF7A 3DXIA 2VFIA 1OFAA 2WNZA 4DBDA 4FNRA 5D05A 2J9YA 5F2LA 5LNVA 4DF0A 3K30A 2I1OA 1XI3A 3EEGA 2R8WA 3TJLA 1Q6RA 2GVGA 2W79A 1GT8A 4NVTA 4S1FA 5AHNA 4AH7A 5BNKA 1N55A 1IF2A 1EWDA 2WKJA 5F4WA 5MHBA 1KM5A 3NYZA 3GVGA 5HMSA 1OF8A 2ZZ6A 3A21A 1XKYA 2C0AA 2CLMA 4C1KA 3EX6A 3N73A 5AC6A 1OK6A 1WX0A 3G0XA 1T0OA 3TH6A 3GNDA 4W9TA 3SSJA 1QDSA 3SW6A 1LBLA 3EWXA 1TTJA 3W7LA 3WK2A 5CPOA 3CWOX 1ZAIA 4DPQA 1LDCA 1LYXA 3W7RA 1G7UA 3NO5A 5IM51 3UPWA 1TPH1 3P82A 2QJIA 4LV9A 2FPVA 3GIYA 4OQVA 5E1QA 1WA3A 2QDGA 3G1XA 1YYAA 2RH9A 1RVGA 3UYCA 3QM3A 4IWWA 2I14A 1KM2A 4UTMA 1VHCA 2ZRYA 4UFIA 4AF0A 2DZXA 2V2DA 3KX6A 4UTLA 4UUIA 3I7SA 4JTKA 4KFOA 1OG0A 3P62A 5LNRA 1SZNA 2WO5A 1VLWA 2QCDB 4CLMA 1V5XA 4MYAA 3SJ3A 2V2CA 4IX0A 2ZZ4A 3DI0A 5C54A 1WYIA 4QNEA 2QCHA 1X1ZA 2NX9A 3PSWA 2RHGA 2X2GA 4MUZA 2ZTJA 3CIXA 3TXVA 1W5MA 3D0CA 5AFDA 3CU2A 3USBA 5FF4A 1RV8A 2JK2A 3LGEA 1FX6A 4X9SA 3IIZA 3TCEA 5KZDA 4K37A 5J5DA 4ZMGA 4JNMA 3H54A 4N6EA 1VRDA 2XN2A 4HIBA 3TK7A 3LXCA 1F74A 5AHEA 3EX1A 1TV8A 2DZTA 2RFGA 4XKYB 3MW7A 2TSYA 3GDMA 5I3HA 1KA9F 5D38A 3P5YA 2YR1A 1I8JA 1T96A 1FDYA 3CM4A 1SSDA 4N02A 2AQWA 3P80A 1QFEA 4QAIA 3M7WA 4OU1A 2Q8LA 5EY5A 1DBTA 1I2RA 3OVPA 3PB0A 5KINA 1LRQA 1TPFA 4X22A 3TMQA 3R5EA 3FYPA 3QEZA 3T44A 4AEOA 1MEHA 4XBKA 4IUOA 1OFQA 3LERA 2C13A 3FIGA 3E0IA 4JTTA 1Z48A 4AVFA 3QRHA 5DBTA 3IVSA 4Z0SA 3HOJA 1K7XA 1DOSA 4LVGA 4O0ZA 2DJXA 2Z6IA 3HPZA 4PFMA 2WV8A 3QJAA 1TREA 3B03A 4IMFA 4UCGA 4WY0B 3TNOA 2WJZA 3IGUA 3NL5A 3DU0A 3UD6A 3OG3A 1FCQA 1H7OA 1G7VA 3NM1A 1M7OA 1ME9A 1FDJA 4N4PA 1K03A 1V7YA 3TFXA 3KVMA 1TV7A 1EB3A 1VGAA 2ZA2A 4K6AA 3I7RA 4UFMA 5LKYA 2A85A 2HS6A 4TO8A 5F4SA 2R94A 3BPWA 3NL6A 4MZ8A 1XBZA 1IXOA 2Y6ZA 4UTWA 5DBUA 1B3OA 3IVTA 4GBUA 4NQ1A 4YL2A 1QOPA 4ZVJA 4O14A 3QQ1A 3EWUA 3JRKA 3RLVA 3DFNA 5I3IA 1VQTA 4O12A 3L0NA 4ADSA 1LLZA 3W7KA 3DFSA 3W1AA 4KWWA 4YCOA 4XZ9A 3LBMA 2YYTA 2B7QA 2YFOA 3H55A 3MHGA 3TJXA 3KOFA 1R47A 2A4AA 3TA6A 4AAJA 2ZRZA 2FDSA 4LWWA 1ZY9A 3STGA 2EHHA 4BK9A 2E1DA 3CEUA 5G2WA 1PHWA 3WJZA 1IXPA 3DENA 2VC6A 1EWEA 4MKNA 4JD4A 3W83A 2G97A 3WJXA 2VXNA 3W7GA 2ZRXA 1DKWA 3ZR4A 2OJPA 4AXKA 2JGYA 3HG5A 2PCQA 3LCLA 1R46A 1H5YA 4A29A 3BW4A 3MI3A 1OFDA 2OT0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2Y8V A;  3L7R A;  3C5Q A;  4O54 A;  4W5U A;  2EPK X;  1A5M C;  1BVN P;  2J88 A;  3OP2 A;  2O4M A;  2V5L A;  4W7U A;  4K3Z A;  4UQC A;  3SM0 A;  3R6I A;  1QWK A;  3B8S A;  1JD9 A;  2Z27 A;  4DNM A;  4M6Q A;  2BX7 A;  3VDG A;  1QI5 A;  4XIS A;  1NOF A;  1EOK A;  3DGR A;  1VFF A;  5A8M A;  2E6F A;  3IV8 A;  3W7Q A;  4PUU A;  1UUM A;  3PNU A;  5D02 A;  5FES A;  3GYC A;  1GHR A;  1OB0 A;  3ZFH A;  3TJI A;  3ABO A;  4XAG A;  3VNI A;  4G2D A;  3N2X A;  4K1G A;  1OZQ A;  4UBP C;  3ZMR A;  2XHY A;  3VGG A;  2FYM A;  1HG3 A;  2EPH A;  1KBJ A;  4Y90 A;  4KES A;  2DSW A;  3IV3 A;  1JCJ A;  3QQW A;  4MFE A;  2CBU A;  1BAG A;  2D2G A;  3DHF A;  3ABQ A;  3SCS A;  3UWZ A;  4Y96 A;  4LCS A;  3ARQ A;  4R27 A;  1YLV A;  3R10 A;  4AXN A;  1Z44 A;  1EJX C;  3TYU A;  1M6J A;  2ZDS A;  2Q6Z A;  4IQD A;  2DSV A;  1SJB A;  3P67 A;  4NT0 A;  5K7J A;  3AYT A;  1E6Z A;  1DJG A;  4O52 A;  4XWU A;  5EL1 A;  4JKM A;  2QMK A;  2YCL B;  3UP8 A;  4FXR A;  4RW5 A;  3ZLF A;  1EZW A;  4US5 D;  3AXX A;  3SY5 A;  3QMT A;  3OO2 A; 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