1ZTVA

Crystal structure of a duf72 family protein (ef0366) from enterococcus faecalis v583 at 3.10 a resolution
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
279
structure length
279
Chain Sequence
HHHHMIRLGLTSFSEHDYLTGKKRSTLYEYASHLPLVEMDTAYYGIPPKERVAEWVKAVPENFRFVMKVYSGISCQGEWQTYYASEEEMITAFLESMAPLIESKKLFAFLVQFSGTFGCTKENVAYLQKIRHWFKDLPIAIELRNNSWYQPNFVKQMLQFMKENQFSLVIVDEPQIPTNPVPFYPYVTNPNLVLFRFHGRNAAGWLANDAEWRKKRTLYHYNTQEIADLSEAVLKMSQEAKEVGVIFNNNSGGDAAENALQMQKVLNLSYDDLNPKQLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of (29342463) from Enterococcus faecalis V583 at 3.10 A resolution
rcsb
molecule keywords hypothetical protein
molecule tags Unknown function
source organism Enterococcus faecalis
total genus 93
structure length 279
sequence length 279
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01904 DUF72 Protein of unknown function DUF72
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.410 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Protein of unknown function UPF0759 1ztvA00
1VPQA 1ZTVA 1VPYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PTQA 1XIGA 2R1MA 3NZQA 4QP0A 5AC4A 5KEZA 2Y7EA 1FWRA 3GHSA 2YL5A 3SIZA 1XLEA 1L2QA 1T8QA 2XIOA 5DXYA 4IPNB 2LLEA 4ACZA 4MLJA 1XLGA 3CLWA 4NX5A 3NQDA 1BPLB 3W7HA 4GUJA 3CUIA 2BTMA 2L5HA 3TYCA 3NYZA 1UZHA 4WY0F 1SZRA 3V5FA 1VFFA 3G1HA 5BZAA 1DOSA 4M6UA 2XZ9A 4IMGA 3CIXA 3LCHA 4XBKA 4JX4A 4IMFA 4DXKA 3TN3A 3DG6A 3BW2A 3MKCA 1Q6LA 5TF0A 2A5HA 1AJZA 3TV8A 4EPEC 5AYBA 4LVGA 3CYJA 3FLUA 1BXBA 4X60A 1J0IA 5TBOA 4I7UA 1S2UA 3LXBA 3LRMA 2YCIX 4IIGA 4Z2JA 1K9DA 3P7YA 1XIIA 2ZUMA 3AMDA 1S46A 1ADSA 4DX3A 1F73A 4GGBA 3DECA 4HZ8A 3SGUA 5I3GA 3WJSA 1W1YA 4RW3A 3CAVA 2PWDA 4QGCA 4QIUA 3KLKA 2XTKA 3A4XA 4Q6XA 5G4EA 3RR4A 2WNQA 1KQZA 4W84A 7TIMA 1XC4A 3MI3A 4JQ4A 3OPSA 3ZVHA 1H60A 3G1YA 1LM1A 4OUIA 5BU6A 3VIMA 3KBVA 2ZXDA 1LLOA 4PL1A 2XWDA 3V0SA 2PRMA 4OV4A 1K8CA 2PCEA 4FR1A 3ITTA 3PBGA 2WANA 5AYYA 3QF0A 1KGUA 3W2KA 4KCWA 3CBWA 1Q6EA 1PDYA 3B0YA 1AH0A 2QCFA 3VFLA 2Y0FA 2GGHA 1E9LA 1EC7A 3RCNA 3CPUA 1UWAA 2ZYFA 3QZ6A 3APYA 3VZZA 3TQKA 1V7YA 2AKZA 3OZYA 1HL9A 3GDMA 3RO6A 3ZLFA 2P5NA 2BMBA 3LNPA 1RJPA 4HYWA 4B4HA 4C6PA 1NDYA 4PUKA 4RZ6A 4FR6A 4G1NA 5LNUA 3HGOA 1OHLA 3E0IA 4UFHA 1OB0A 4GFIA 1QOQA 2QPUA 2PGWA 2PLJA 2CFFA 4AIOA 5IOBA 3TR9A 1ADOA 4DM2A 2VURA 3V75A 2PI6A 1RPKA 3P5YA 2ZRZA 5E0CA 3W6LA 1NDWA 3LCWA 1I9CB 5GJPA 2VYOA 2Y85A 1EC8A 3IS4A 2GK1A 3JW7A 4O1DA 3BO9A 3EEGA 1QPKA 2YFOA 1FA2A 4UQ9A 4NHVA 3B8VA 1F61A 4V33A 1I2OA 5AFDA 2X2YA 1BTCA 5U4NA 2C7FA 3RNDA 2P50A 4Q8MA 1U5HA 1UPMB 4GABA 1FCUA 2UY4A 1X7FA 1H7RA 4H9YA 2QAPA 3RM9A 5C6MA 1XF0A 5REQB 3LDVA 3RPDA 3GVWA 3GVRA 4LBRA 4Q8TA 4K3ZA 3AQUA 3GE7A 1FH8A 2OWCA 3NQBA 3FN9A 3WQGA 3G24A 2EPKX 2V2CA 4EWJA 4AFYA 4J3UA 1KRBC 3IJDA 3WLRA 3WFZA 2V38A 4EP8C 3A9BA 2VGBA 1MW2A 1LT8A 1M03A 3OVRA 4C6MA 3C56A 1UZ4A 4V1YA 3C2YA 1ESWA 2PGFA 4ES4A 4AD4A 5C70A 3H7UA 2TSYA 1E0XA 1TPC1 4HA4A 5CPLA 2CXGA 3CT2A 2EAWA 4U5IA 3WNOA 4B2DD 4Z2LA 3WK3A 3W4RA 2WNWA 3CHCA 1GCYA 3LU2A 3STCA 4RZBA 1TPUA 2V3GA 4LAUA 1BF6A 4KEUA 5EY5A 5EMJA 1U1UA 3RLVA 2BASA 1XUUA 3VAVA 2QW5A 2X0HA 1LBMA 1KRCC 1G9HA 1WDDA 1TWZA 1VF8A 3VDGA 1AZ2A 1SJDA 3LA4A 4CUCA 3L21A 3VFCA 3O16A 2GWNA 3ITOA 5IDZA 5CCZA 1L6FA 1WKEA 1YX1A 5EMMA 3IJ9A 4J9JA 4EVZA 3MUY1 4XVDA 1CBGA 3TP4A 4DN1A 1SW0A 4RR4A 1LYXA 1XS2A 1ALDA 2UY2A 3WNMA 1J2BA 2Z25A 3MSRA 3VK5A 4ZXOA 2YR1A 1GJPA 3GB6A 5FOOA 4AY1A 4DJEA 2DEPA 3EPMA 4YS1A 4FOKA 3GBEA 3GY1A 1F4AA 1LL7A 4JTIA 1H61A 5F4WA 4UTUA 4JN8A 2HPMA 3T55A 2ZRYA 4AC1X 1YW1A 1BG4A 2G5WA 4YXGA 2I9UA 1UQYA 4Z2KA 1UR1A 2CZ5A 2PDKA 2ZA3A 3QMRA 2YBUA 6XIAA 1KC7A 2XVNA 2GJXA 1BYAA 4JN6A 4DAFA 3AAMA 2Z1WA 2XPKA 4IPLA 1RR2A 4ORIA 2PP1A 3EWZA 3G6MA 5I00A 2EPOA 3FJ4A 1DWFM 4J27A 2WQPA 1CLVA 2JIWA 2ISVA 3SUWA 3W2JA 4GI4A 3NGFA 1ZPTA 1S1PA 2Z2AA 2Q8ZA 4URIA 4G5DA 5J8LA 1ZU8A 2W3ZA 1QW9A 1C91A 1ME9A 4P8UA 2F9RA 1YLVA 2GL5A 3FS2A 3UPWA 1VZWA 5G1TA 4GRSA 4NJIA 4DYEA 2ZE0A 1QI3A 3HPSA 1WDWA 3KP0A 3TDFA 3NPXA 1W3KA 2X1IA 2CHRA 3EX2A 1KA9F 1JUKA 1TPH1 3NDYA 1VRXA 3UWUA 3T44A 1WXZA 4IP4A 3CV1A 1XGDA 1HL2A 3BARA 1Y5WA 4MWAE 1MXGA 4DWSB 1J0KA 3VI2A 3LEPA 1GQIA 4QNWA 3K46A 3TVAA 1FDZA 3CUGA 4XKMA 1TE1A 1V51A 1PJ9A 2Z1BA 4O17A 2WC3A 4UBPC 2F38A 4HD5A 2YW3A 1GORA 2BG5A 5DLCA 3DIPA 4H00A 1D8WA 3FSTA 1UKPA 2PDGA 5AHMA 1QPRA 3DN5A 4D6EA 4N02A 1UIOA 2D1ZA 1OF6A 3OHIA 1XXXA 1L8NA 5HQLA 2H90A 2DP3A 3H53A 2G3MA 3PN8A 4UMAA 4XD4A 1JCNA 2OFJA 5I77A 1IQ8A 3HG3A 3HTWA 3W7QA 1R7AA 1EHNA 4J3XA 1RLCL 3BLFA 5C8BB 2ABBA 3AYVA 5J04A 3QC0A 5A8NA 3LV5A 5CSRA 3MC5A 2OO6A 1EIBA 3W1AA 1FCQA 1ZJIA 1WZKA 3APTA 4HZ7A 1EWDA 2ONEA 1DTUA 4GXWA 4ORMA 4PEKA 3STGA 2FMOA 3GKAA 3MMUA 2H8XA 3NO1A 1DJGA 1UKOA 5D38A 3FIGA 5AYXA 3RG6A 3MB9A 1WO2A 3GTFA 4D71A 1JDDA 3EX1A 4FLSA 4PUEA 4B5WA 2CLEA 1G7VA 5DT5A 2JEQA 1A5LC 4GJIA 2CXEA 3KTXA 5A8QA 1EP1A 1A53A 4LSBA 4E4FA 4KQNA 2DUXA 3EKZA 3DFTA 5H8PA 4NX0A 1X39A 2PC8A 1WUEA 2ZRUA 2OZ3A 1JQXA 1LL4A 1PUDA 1OADA 2ZX5A 3UT0A 1PHWA 4LS1A 4TX8A 3VMNA 1CZ1A 2BHZA 5A6JA 2QUTA 3N6QA 2Q3OA 3TR2A 3GDLA 3H55A 4HMNA 6TAAA 4MHBA 5T9BG 3TNBA 4UMCA 3LB0A 3LLDA 2UV8G 3MJMA 4W8AA 3LRLA 2QR6A 3VUPA 3O3RA 3U6WA 4A3HA 3C8NA 1XLDA 1K6AA 4IG2A 4JHOA 3FXGA 4D72A 3O07A 2A21A 4LUTA 2AL2A 3LBCA 4MKNA 4DLFA 4LEQA 1U22A 1UD2A 3QQ1A 2WMGA 4DELA 3B03A 6ENLA 1JQVA 4UUIA 1LL6A 7ODCA 4KRZA 4AD3A 2PDHA 2Z6JA 3W07A 2Z2BA 5I5RA 3CMGA 2X30A 3K8MA 4WXYA 4YLWA 2J7DA 5LXEA 2MUCA 2WCSA 1DWJM 4ZQOA 1IEWA 4XWUA 4PL2A 1HKKA 2IKIA 2CHOA 4WKAA 3L68A 3GRIA 1I1WA 2PDMA 4O0KA 3UJSA 4ZL1A 2IKGA 4CN1A 4D6HA 5H8UA 4HSNA 1EH9A 3E49A 4RL3A 1SO3A 1Z69A 3N17A 3MVIA 1TZZA 3F03K 5CPNA 5LKYA 3UG3A 5LNRA 2INFA 3CQJA 2DSUA 2FQIA 2F84A 1V6TA 2Y1HA 1MWOA 4A05A 1BTMA 5K2ZA 3CEPA 1W9PA 2XIMA 1G5AA 3EX4A 2C19A 4MNKA 3SCRA 5I6SA 1SYTA 5CJNA 2FKPA 4X9SA 3PK7A 4UTTC 1Q85A 1V0MA 1FWCC 4B90A 4GUHA 4AZBA 4CKQA 1JD9A 4LPCA 3E12A 1XLIA 4QCEA 4D6IA 4WOZA 2CBIA 3TEVA 3Q58A 1FWJC 3ARWA 3QSTA 3M46A 4GO9A 1XDJA 1HL8A 4P7LA 2GQ9A 2VELA 1KFJA 4M80A 4XAGA 3D3FA 1GOOA 3B0XA 4CVWA 1XH2A 1S5NA 2GGIA 3D6NA 4YNGA 4LRSA 1UR2A 4IGNA 2QCLA 2WYSA 3AIUA 4IPIA 5BXSA 3GNRA 4CN6A 2TYSA 4WDWA 3ZR5A 5CGMA 1C92A 4H41A 5H8MA 1VPQA 1DJHA 3GXFA 3PJXA 4ACZB 3T42A 1EOMA 1OQFA 3CUHA 1F7BA 1Y5VA 4C5YA 4J3WA 1GTHA 5DBTA 5G1YA 2EXOA 4X0NA 2BP1A 3LI1A 4OQVA 1K9EA 1WB0A 5A1AA 1B30A 1ZP4A 2WKGA 1NEYA 2ZRXA 1AL7A 2XVLA 4RNIA 3R79A 4GO8A 1DYSA 4PCNA 1PO9A 4Z0JA 4Z1CA 3N3TA 4HMDA 5JQ9A 2VEPA 4GNKB 2OT1A 1TV7A 4PA8A 3F2BA 3LHUA 3NQMA 4XV0A 3R25A 3CC1A 1XDMA 3K2GA 2J8FA 3GBDA 1HKWA 3NQ7A 4L6OA 7XIMA 2BGNE 4LUSB 1B1YA 3F2DA 5I3KA 1RAKA 1W9VA 2FYMA 1B0IA 3MSGA 4PGLA 1J18A 3AYRA 3SJ3A 4QROA 4B92A 4J7RA 4WJXA 1NWSA 3L0GA 5F2LA 4D8AA 4WJEA 4ZCWA 1EEXA 2CKRA 3EYPA 3OYZA 1AW2A 3M0MA 3L4TA 3VNZA 1JD7A 5CGTA 2Z00A 4O15A 1LQ2A 1ZAJA 5DFAA 1S1RA 5H6HA 2GFTA 5KSWA 4AEFA 3ES7A 4XAZA 1Q5MA 1FTXA 3EXRA 3LZ5A 3E0VA 3WDIA 1I75A 3L0NA 4NJKA 4ACYA 2E40A 4FEZA 2IPJA 1ME8A 3H7VA 4EANA 3W53A 3B8SA 4DO7A 1MXDA 2Y63A 3W24A 2OZ8A 4N4QA 3WLOA 4E3TA 2ZC1A 3E38A 3KOXA 5D8ZA 2IXUA 1WOBA 4O4WA 5EKYA 4QAWA 1U33A 4I8DA 4EAMA 1M9HA 1YDNA 3RU6A 3R58A 2VTFA 3UYIA 3LBOA 4GVHA 3EWUA 2EF9A 5ECUA 2PDYA 1E1CA 1Y65A 3IJQA 4PRWA 1US0A 1UUQA 3NO5A 1I2RA 3EKLA 5DXXA 4YTRA 4L5ZA 4EX4A 4JYEA 1SJCA 3RCMA 3CAQA 2Y8VA 2E1DA 2ISSA 4HOXA 2D2JA 4KGLA 3ELFA 1M65A 4AVNA 7REQA 4XZIA 3TFXA 4LVAA 4IFKB 3TYBA 3UWEA 5ABFA 2WK2A 3GD6A 3KFTA 3L4VA 2PSNA 1NFBA 1B2YA 3VGDA 5HJXA 3VOFA 1JUEA 3T40A 1CLKA 1P48A 4XSLA 4RK8A 4LEFA 1EQPA 4HK7A 1KFEA 4GFSA 1R3TA 1E4IA 4FAMA 2Z1XA 2YA1A 1RSCA 2VRKA 4B4FA 5A95A 3MO7A 2O7SA 1POJA 1UC5A 3WFLA 3DI1A 4O1BA 1V3IA 1AD1A 1QHPA 4K36A 1J6PA 5DMLA 1QHZA 1XYBA 5FF3A 4JTEA 3KE0A 4IICA 3BSMA 4OVXA 2C91A 1ZBWA 2VX6A 3PSVA 3TQVA 1GUVA 2OKTA 4D1JA 2YOCA 2XIBA 1ML1A 4D6CA 5KZ6A 3IAPA 3WNLA 3M44A 2HS8A 3K13A 2EHHA 5AZ1A 3GNDA 4EKJA 1QXLA 1LLWA 4N9EA 3DOPA 2QLYA 1H3GA 2ZRVA 3SFWA 2DH3A 3EWCA 1MDRA 4YHGA 2X1TA 4E8GA 4CCEA 1ZS2A 3A5VA 1DHPA 1C29A 5DANA 1L8PA 4HNOA 3HPZA 3VNMA 5LSMA 2ZICA 1J8VA 3SRHA 4PRTA 4CQDA 3JS3A 2NUYA 4BF5A 1FWWA 2I14A 4CVUA 4GLEA 3LCIA 4O28A 1ITQA 5XIMA 3UG5A 3CM4A 3P8IA 4A3UA 2B4GA 3KWSA 2QJMA 4GQRA 3MPGA 1KRAC 5C2GA 3GR4A 3NFUA 4PBEA 3TSDA 2ABAA 1PTDA 3RYSA 3PTKA 2BVDA 1QI5A 3HG5A 4JTJA 1A4MA 2WVVA 1XRTA 3TCEA 4C6BA 1RCQA 3DC8A 1MUMA 3KBWA 2EEXA 5F4XA 3NQ6A 5K9CA 1M04A 2R8WA 3DFSA 3URNA 3V35A 3KCLA 1E6SM 4LXFA 3MWAA 1WDPA 5I02A 3N13A 1DIEA 3KVMA 1XYAA 4GD0A 3WKZA 1ZCOA 3FEQA 3N9RA 4PMUA 3BICA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1VPQ A;  1ZTV A;  1VPY A;
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