1A3H | Genus

Total Genus 120

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	120
sequence length	300
structure length	300
Chain Sequence	SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of the Bacillus agaradherans family 5 endoglucanase at 1.6 A and its cellobiose complex at 2.0 A resolution pubmed doi rcsb
molecule keywords	ENDOGLUCANASE
molecule tags	Hydrolase
source organism	Bacillus agaradhaerens
total genus	120
structure length	300
sequence length	300
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	1998-01-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1a3hA00

3OG2A 3S2CA 1UKOA 5CLTA 5ABFB 2ESCA 4WKAA 4BZYA 3LPOA 1VBUA 3N12A 2W63A 1KQZA 2WBKA 2J7EA 3FY1A 1GZJA 4CU8A 3ALGA 4ACZA 3KWXA 3SCWA 5LA2A 5I3DA 4RL3A 4XB3A 3BMVA 3B9DA 5GNXA 7A3HA 2IUZA 3E1F1 1QHOA 2BVYA 2FHFA 3RM9A 4J3TA 4JHOA 4E8CA 1OGGA 2XGIA 2XSBA 1J0KA 3T0AA 1L0PA 1W9PA 3PZNA 5FKYA 3WQ5A 3W27A 3CZEA 4C7DA 1HKJA 3A4WA 1MXDA 3FAWA 2FGZA 3WMSA 3EDJA 2XJ7A 2YDQA 3NDZA 1IZJA 3W26A 4L4OA 2CBJA 3NSXA 3ZR6A 2EBNA 2WCSA 1GOWA 2EJ1A 2ZUWA 3CGTA 2F2HA 2Y2WA 1CWYA 2WWCA 1Q6CA 3POCA 1QNSA 1TUXA 2ZWZA 4AZ7A 1WP6A 3W81A 2ZXBA 4WSKA 1UHVA 4UFKA 3VTRA 5LA0A 1W1TA 5M5DA 3VIIA 1W1VA 1HX0A 5BXRA 4MTVA 4JKLA 1DWIM 4D6DA 1GQIA 2W92A 1H09A 1O7AA 2O9OA 1J9YA 1LWJA 5I79A 1WZKA 2VZSA 1HT6A 1CDGA 3AISA 1UD6A 4OKDA 1CYGA 4UQEA 5DEZA 1UD4A 3SCQA 2EPOA 3W4RA 2J79A 2E9BA 1B3ZA 2VTFA 1C8QA 4B9YA 2JIWA 1LL6A 4Z2IA 1CEOA 3DYOA 3L4TA 5GQBA 3KL0A 1BYAA 2WSKA 2D2OA 2UWFA 3VINA 1PAMA 5A94A 1V0KA 1WZAA 3GXIA 1BTCA 4QLJA 1ESWA 1JZ6A 2D1ZA 4IPLA 4Y7EA 2YA0A 3VIFA 3U7VA 4LYPA 3K4AA 3VIMA 3MUY1 1GOIA 3L2LA 5I2UA 4UNIA 2YBUA 5E9AA 2YLLA 2O9PA 2YL6A 2ZX5A 1QBAA 3RJYA 4KH2A 3RM4A 1HVXA 3ARUA 1C7TA 5D8WA 5IHSA 1QHZA 3VGEA 3PTMA 2DH3A 6CGTA 1W9XA 1R8LA 4CVUA 4PMRA 4ATLA 3MU7A 2BY3A 1E0VA 4M56A 3HMCA 1EQCA 1E6RA 1MXGA 3CLWA 2BV9A 2VC9A 1DWAM 1QW8A 4J3XA 3T0DA 1NP2A 4PMOA 5A3HA 1DWHM 1V6WA 4S3KA 3NIYA 3VIHA 3CBWA 1B1YA 1ITCA 2QF8A 1VFUA 1FFQA 1V6UA 5ABFA 1UZ1A 2YDRA 4PTWA 3CO4A 3N17A 2DT1A 3VIJA 1AMYA 4H8VA 3RDKA 2OSYA 4GQRA 1PX4A 3B9EA 4ML4A 4NRSA 2X2YA 3BH4A 2CKRA 1E4MM 2NSXA 3AHZA 1ODUA 4PN2A 1XH0A 2J47A 1KBKA 4MJ4A 3M7SA 4AY1A 5A6KA 3PBGA 4DM2A 1W9BM 4QAWA 3GBDA 2W66A 3AS3A 3L4UA 2YLAA 4PCTA 3VM7A 3WMCA 2WKGA 3TA9A 1UR2A 2YL5A 4Z2HA 4JHZA 4ZXOA 1UKPA 2PWDA 3VUPA 1B0IA 2WYSA 4GO9A 1D2KA 1CENA 3ZOAA 4CCDA 3CMJA 2AMGA 2BY0A 5LA1A 3SCTA 4W7VA 5AYBA 2W5FA 1CBGA 4DUVA 4FMVA 1QNOA 1WDSA 4LGXA 3WN6A 3SCPA 3VGBA 4AXNA 3WQ4A 1AVAA 1JXJA 5F7UA 1GOQA 3IJ8A 4UOQA 1BSIA 5CJ5A 1E0WA 1KGXA 1ZJAA 2YL9A 3ZJ7A 5A6JA 4PCSA 1KWGA 2C8NA 2ZUTA 3EDKA 3MV01 1GOOA 4KWUA 1CZ1A 3VPLA 1J0ZA 4TXEA 2DT2A 3OZOA 3QOMA 1ITXA 1GOKA 4AZ6A 4OOUA 4CN1A 1J01A 4B15A 1SMAA 4H8UA 3WIJA 2VMFA 3DYPA 3WH8A 5A8NA 2XIIA 3II1A 3TONA 1EHAA 2UY2A 1LLOA 3FAXA 3HJEA 2X8RA 4TX8A 3WKZA 1VBRA 3MMWA 3VD5A 1KXHA 1VIWA 1MQPA 1NWRA 3G6LA 1C91A 3FXYA 1DWGM 3A47A 4N0RA 4UR9A 2CBUA 3NUKA 2D0FA 1EXPA 5GNYA 1CGXA 4WJXA 3VNZA 4BQ4A 5D9PA 5DF0A 4FLQA 3MSGA 2D3NA 3ARVA 3AXIA 3WNKA 2X09A 2W62A 2CPUA 1IT0A 3VD7A 1J0JA 2WMIB 3SUTA 1W3KA 5C8BB 5I78A 3BGAA 2WHMA 5EFDA 4W86A 4WK9A 1TFVA 1JZ7A 3AIQA 2D23A 3DHPA 1E40A 3B8SA 4EKJA 1B31A 3ZSSA 2YIHA 4GKLA 3EBVA 1GJWA 1H1NA 1D3CA 3WD2A 2ZICA 1ZS2A 1ISWA 2J4GA 2PBOA 8CGTA 3EDDA 1Z32X 4URIA 3VD4A 2XM1A 3AMKA 5FIPA 2A3EA 5ABGA 3WENA 5JIWA 2QLYA 4MAVA 2V3EA 4PUDA 2VCBA 1ISYA 1E73M 5BXSA 1BHGA 4H2CA 3WQWA 2WBGA 4AD3A 1PX8A 1HL8A 1LL7A 1OBAA 1KR1A 2CETA 4AZIA 3WH5A 3WH6A 4UFHA 1OB0A 4IPNB 3MSDA 2XVKA 5KZ6A 4X0VA 1B3XA 2IXUA 2Y24A 4U5IA 1HP4A 1KQYA 1Q6FA 3CZGA 1NARA 1LJYA 2ZIDA 4UQAA 1V3LA 1XHGA 1MVYA 3F4VA 2O9TA 2XVLA 4EAMA 5I6SA 4OBRA 2VT0A 2XYLA 4OIFA 4DM1A 3AIWA 4TVUA 4TTUA 1CGVA 4QDMA 2J78A 6A3HA 4RE3A 1XC6A 1BG9A 3D5HA 4GZIA 3VOCA 1V6XA 3PZVA 1H3GA 1RP8A 1E71M 1W91A 3OGRA 4H7VA 3KE0A 1X6NA 2EEXA 2ZUNA 2VNCA 2DT3A 3OGVA 3CTTA 1MFVA 5AY7A 3WEOA 5ABEA 1HVQA 5D9NA 4Q22A 4F8XA 4ZEPA 5E6ZA 3CZLA 3ZJ6A 4PMQA 1W9DM 1PEZA 1E70M 4UQBA 2YKKA 2WK2A 3ZO9A 5A8PA 1B3VA 1GORA 5I24A 3T0BA 3RPMA 1V03A 5M3WA 4JKMA 5I5RA 4JFTA 3VIKA 1I1WA 1QW9A 1GQKA 1LF1A 1UH2A 4FF5A 3VIGA 4AZBA 3ARQA 3JUGA 1JYXA 3MKKA 5HDRA 3I3EA 4K68A 1V0MA 2V3FA 3KEHA 1UQYA 4MJ2A 4PMUA 5BRQA 1EDQA 4JFWA 3NSNA 1HJWA 3HU7A 2PC8A 2GJXB 1BPLB 1XH1A 2J7HA 2EPMX 1KXQA 2JE8A 3CHFA 1HP5A 4S3JA 4PSRA 5GNZA 3F5LA 1CIUA 1I1XA 1UYQA 2GK1B 5CSUA 1UA7A 1TA3B 4WIWA 3QHOA 1XSIA 1MWOA 4D6HA 2UY4A 3PZOA 3BAWA 2ZOXA 3WSUA 1GONA 1ODZA 1IZKA 2WVVB 2DDXA 5EBAA 3PZUA 4A3HA 1UR9A 1A3HA 1ZL1A 1JL8A 3AZTA 2X0YA 1VEOA 4MNJA 1RPKA 1W1YA 3KZSA 4J3UA 4UCFA 1IV8A 3BCDA 3QOKA 4E4PA 4AZCB 1V6YA 2WM0A 5BCAA 1ECEA 1C7SA 1HN1A 2CCRA 3GBEA 1KXTA 4GINA 2G4FA 1VFFA 3WEMA 3GNOA 5A95A 2A3BA 1H49A 2D3LA 3BLKA 2W4XA 2ZXQA 2WW5A 4W7WA 5AC5A 1V3JA 3DYMA 4Z2LA 1G1YA 1E4NA 3BAXA 1LG2A 2G3JA 4MADA 3WDPP 3NCOA 1CGWA 3AS2A 2V38A 1OINA 1GVIA 1AQ0A 2WAGA 5HOSA 3ZSTA 1FH8A 3AIBA 1FH9A 2YJQA 1ZBCA 3I3DA 2WLYA 5JBEA 1RD6A 2XSAA 6TAAA 4AZGA 4MB5A 3AMLA 4EK7A 1TE1A 1R85A 1UH3A 1VB9A 4W93A 3AJ7A 1GHRA 5EFFA 1JF5A 2JALA 3EMZA 3SURA 1CXEA 2OWXA 4DWSB 2E9LA 1CGTA 4HU8A 3AOFA 1DWFM 1J11A 2VRKA 4UOZA 5D9MA 2WMHA 2J25A 4PMVA 4W5UA 4W8LA 2QMJA 1J12A 2GJRA 3WF3A 4MAZA 3VD3A 1NOWA 3WBAA 3T09A 5A1AA 3VU2A 3W24A 5FL0A 2JF7A 1UZ4A 3UG4A 1WDPA 4HMCA 3VGFA 4ZFMA 4QCFA 1WDRA 4V27A 1ZBKA 4BA0A 3WDIA 3PTKA 2VX7A 1TMQA 2J7BA 5FD0A 1KCLA 1B3WA 1FHLA 3WL1A 3W53A 1OSEA 1EOKA 4C7GA 1JYVA 1QNRA 3GH4A 7CGTA 4QCEA 1BQCA 4Z2JA 1QVBA 1TCMA 3L2MA 3TTSA 3D3AA 2V3GA 3W37A 1R7AA 1EH9A 2OSXA 5E0FA 2WMJA 4NZCA 2DSKA 1E43A 1E55A 4PYSA 1RP9A 4MNLA 4OBSA 1CTNA 4M24A 5A8QA 1C3FA 1WDQA 3MMDA 3WUBA 5IDIA 5CGMA 5E70A 4M29A 2B31A 3CPUA 4KMQA 4IM4A 2WMGA 1MW2A 2FGLA 1ZBWA 2DGAA 4M8UA 3TP4A 1ZU8A 4P7NA 1MQRA 1U2YA 4JL1A 3W6MA 1J10A 2WVVA 4PTMA 3BMWA 1EO7A 2CESA 2WVTA 1X1NA 3F5KA 3O9NA 4UFJA 5A6AA 3WDHA 1W3JA 1TR1A 4HTYA 2QPSA 1FP8A 3IJ7A 1FOBA 1WPCA 1DEDA 1F4AA 1E6XM 3VGGA 3O2LA 1VF8A 1BFNA 4P7OA 4TX6A 2X0HA 4J27A 4JAWA 1JDCA 3SUVA 2YBTA 2D20A 3SUSA 2UY5A 2VJXA 4AD4A 1E6ZA 1JYWA 2WKLA 5A6MA 5E09A 1QBBA 4JKKA 1UKQA 4GI8A 5D4YA 4F66A 1HXJA 3CHEA 1JNDA 1BGGA 3BLPX 1LL4A 4LQ1A 3K4DA 3ZIZA 3T2OA 1E1FA 4D72A 1S46A 4XV0A 1WAWA 1VENA 2VZTA 2Z1SA 4XZBA 3GXMA 1NP0A 4M1RA 1NM9A 4P8VA 1E72M 1PZ3A 2BNJA 2FHCA 2HVMA 1QOXA 3WF4A 3GNPA 1E3ZA 2VL4A 2YOCA 1KGUA 2ZUSA 4OOZA 1SR0A 1XSKA 5DMYA 1ISZA 3MO4A 1B3YA 4RE4A 1VFMA 3UESA 1GQJA 3FHAA 1CXLA 2VR5A 2BHYA 4CN4A 3VD9A 3WUGA 3L4XA 3GTNA 1NH6A 3CZ8A 2DT0A 1F4HA 2VX4A 4P7QA 1ISVA 2O92A 2QV4A 1D7FA 3RMEA 4HOWA 4D1JA 3J7HA 4HPHA 3AFBA 1OGBA 1UD2A 4D1IA 3ARZA 4CKQA 1VJSA 1C8XA 4AYSA 4DWSD 3GNRA 2J77A 1HNYA 3ZMRA 1B90A 4D6GA 4XUYA 1HJXA 3G6MA 1JG9A 3L4YA 2Z1KA 1Q6EA 1HKMA 1EO5A 2DQXA 2EPKX 1MQQA 3WDQA 4CN6A 3WBEA 4AD5A 2OLHA 2J8GA 1BYCA 2J62A 3PZTA 2Q8XA 1E6NA 4PTVA 3OGSA 2WC4A 4AMCA 4NRRA 4UQDA 1E3XA 5A6SA 3VM5A 2JEPA 3ARXA 4Z2GA 2WZIA 3WD0A 5D9OA 5A6BD 4CD5A 4NSBA 3UG5A 4GZEA 1VJZA 4W88A 2D24A 3ARPA 4ACYA 3AIVA 1E56A 3WFLA 2WMKA 3AZSA 2WHJA 3OLDA 5CQ1A 4BCEA 3WY1A 3BCFA 2XUCA 4J7RA 3AHXA 4C7FA 4D6EA 3ZT7A 4TTGA 2J74A 4UQ9A 5D8ZA 4ZE5A 1A47A 3AHTA 3WQ8A 2XIBA 5DT5A 2VI0A 3VILA 2VCCA 4P8WA 5BROA 3U5UA 4R5EA 3GH5A 3T2PA 3ARRA 4PMDA 4W87A 4CVWA 1W9UA 1CGUA 3IAPA 1WNOA 1V02A 2XVGA 3N1AA 3T08A 2ZX9A 1E9LA 1K9FA 2D0HA 4MNKA 4UFLA 4HPGA 3N11A 5CXPA 3SCUA 1SMDA 1EHNA 3OA5A 2RGLA 1NQ6A 2XFRA 3ARTA 2TAAA 5M03A 1JZ5A 1FA2A 4CD7A 5LYRA 2XFYA 3W28A 1R7OA 1JZ4A 2E4TA 3ZR5A 1GVYA 1B2YA 4MB1A 1PJ9A 1PIFA 4JFUA 3SCSA 2BFGA 4AWEA 2DSVA 2GDUA 4DUXA 5JBDA 3AYSA 2AOSA 5A6LA 2BY2A 1XRVA 4AIUA 1GOMA 3K46A 4HP5A 3MUZ1 1US3A 3AXXA 3M6DA 3RJXA 1OM0A 3NYDA 4CD6A 1NWSA 1XV8A 4TVDA 3N13A 3N9KA 4TVCA 2EXOA 4AZHA 2EPLX 4BF7A 1PIGA 4BQ5A 1NOUA 4QLKA 4W84A 3WDRA 4V2XA 4Z2KA 3CUHA 1NWTA 2VX5A 4RE2A 1YHTA 1V02E 1J0YA 1KXVA 5BYWA 4MB4A 3WF0A 1C8YA 1XYZA 4NF7A 4ACZB 1H4PA 1ZB5A 2VRQA 4CCCA 1BYBA 1MW3A 3DHUA 1UKSA 2PF0A 4J3WA 3OZPA 2QHAA 3ZJ8A 2WNWA 3WQ6A 4X9YA 4B3KA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1G9H A;  1FP9 A;  1QI0 A;  1WB0 A;  3TTY A;  1E4I A;  2XHY A;  4H04 A;  4JCM A;  2VVS A;  2OSW A;  2XG9 A;  2V5C A;  1EOM A;  2WZH A;  4OUE A;  1JD9 A;  4UFM A;  1MYR A;  1C90 A;  1CXH A;  3ARY A;  2GDV A;  1OT2 A;  1DP0 A;  3SCR A;  2PWF A;  3UG3 A;  1UD8 A;  4PMX A;  3MUA A;  2EPN A;  5E0C A;  1OCQ A;  5CSY A;  4J28 A;  1NWU A;  3OBA A;  2CYG A;  4CU7 A;  1UQZ A;  1OGS A;  3AXH A;  4PMN A;  4J3S A;  1KBB A;  3QHM A;  3PHA A;  4UZU A;  2VZU A;  1TVP A;  2CIT A;  2EQD A;  3GXF A;  1E4L A;  2IXV A;  4MNM A;  1K9E A;  1JI1 A;  2OYM A;  3BAI A;  5CG0 A;  3VDA A;  5DFA A;  2XPK A;  4HOZ A;  1M03 A;  3GXD A;  3AS0 A;  1G0C A;  5BXT A;  1V3I A;  2CHO A;  4U2Y A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1A3HA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations