1ADO | Genus

Total Genus 137

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	137
sequence length	363
structure length	363
Chain Sequence	PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTSSGQAGAAASESLFISNHAY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	ALDOLASE
publication title	Product binding and role of the C-terminal region in class I D-fructose 1,6-bisphosphate aldolase. pubmed doi rcsb
total genus	137
structure length	363
sequence length	363
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	1996-12-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1adoA00

3FJLA 2NX3A 1OVDA 2FDSA 2ZA1A 1Q45A 1FWWA 3C0JA 3DBPA 4N02A 4FHAA 3BO9A 1VC4A 3DFQA 3PBVA 4N6EA 1JJKA 5H2ZA 3TR2A 1JUBA 2ZRWA 3LCWA 2CLHA 1CX9A 3L65A 3BARA 3CHVA 1O95A 4JTEA 2QDHA 4NQ1A 3MMTA 3ZWSA 5LZLA 2PCQA 5F1UA 2GVGA 4MKNA 3LHTA 2EHHA 3L5MA 3EX6A 2JGQA 2PC4A 3DI1A 3LTSA 4ML9A 1U5JA 3TCEA 5E1QA 4K39A 4JEQA 1Q6OA 4R33A 1GEQA 4HNNA 2Z1BA 4N4QA 1NF7A 1XI3A 3C4UA 4CQ9A 5I3KA 3NL2A 4O19A 4A29A 3MHGA 2ATMA 4X3ZA 3NXFA 3NNTA 4AHQA 4GUIA 1WAUA 3G1SA 3TX9A 4MUZA 2YW3A 5AHIA 2FB3A 3M6YA 1SW3A 3SECA 3G22A 3OBKA 3W2NA 2NX1A 1KBIA 2GQ8A 4JN6A 2NV2A 3SGZA 4YWIA 1B4EA 2YGYA 4RXFA 4DO4A 4O53A 2J24A 5KINA 1SZFA 4NNBA 1R2RA 2OT0A 3TAKA 3NQ2A 3WK2A 1H62A 1G6CA 1K8YA 2Z2UA 4LRSA 5AB3A 1F05A 1UASA 4JD4A 1UJPA 1AK5A 4JIQA 3UWVA 4JYDA 3HO8A 5HWMA 3LI0A 1TRDA 1XDMA 2C13A 1KW1A 4AAJA 2A7PA 4MIMA 2PRLA 3JR2A 4NJGA 1GG0A 5C55A 1OFDA 2ZZ4A 3GIYA 3CWOX 3W75A 4IX0A 5D09A 1EWDA 1KM4A 1Z44A 1WBJA 4LUIA 4UTJA 3TJLA 2I14A 2QCDB 3M5XA 3CQ0A 4TR9A 6TIMA 1FUYA 4JYFA 5SWUA 3NPUA 5AC6A 4BK9A 3LGEA 5CGQA 4GBUA 4MFDA 2Q8LA 3DFNA 3O6DA 4OE7A 4TMCA 2QJHA 3M7WA 4UFLA 4UXDA 1JRBA 4QNWA 1NSJA 4DPPA 1SW0A 3OVRA 4LY8A 3U8GA 3C56A 1I8JA 4O18A 3M1ZA 1FQ0A 4UTHA 1G7UA 4NT0A 5DLCA 3G8RA 1A5SA 1DV7A 3P5YA 3G0SA 2WO5A 5A8GA 5D30A 2CWNA 5FEZA 3W7LA 4JGDA 2RH9A 5D2WA 3WFAA 1WX0A 1W5OA 3TU9A 4RJEA 3EX3A 4AHPA 5D38A 5HUPA 1AW1A 2R8WA 4BI5A 2H90A 4LTSA 1GOXA 4XWUA 1G4TA 1PIIA 3RNDA 2E6YA 1SZNA 4UNLA 3L66A 2CFFA 3GNNA 3P74A 1H7RA 4H3DA 1DORA 5DELA 4IPJA 1JCYA 4N9EA 4EF8A 1TPFA 4JTSA 1I45A 4I7WA 4NU7A 1O4UA 3W73A 2QCFA 3R89A 4OV9A 1WDWA 4A22A 1I4NA 4HPXA 1ZENA 1KFLA 3ELFA 1IXOA 4WY0F 3TQKA 2E68A 3WJYA 3P61A 1ML1A 1FWRA 2G97A 1DJQA 4O52A 3HG3A 3P5ZA 5LSMA 3GXNA 3L68A 4GFSA 3M0ZA 3V1PA 4KFNA 5CSRA 1LLZA 4UTUA 1DJNA 2E5DA 4TMBA 1KM5A 2GVLA 4MZ8A 3QPYA 5ABTA 4CCDA 3TNOA 4CCCA 1K8ZA 4GRSA 1SO6A 1LYXA 1EEPA 1VR6A 2A7NA 3W7HA 1JCLA 4GNJA 4ORIA 3GKFA 3G8EA 1GVQA 4GWEA 3W7KA 1T8XA 2NX9A 2Y89A 1ADOA 3I7QA 4HNTA 2YYTA 3PS7A 1GVRA 2V81A 2G96A 1AW5A 1RZMA 1QR7A 3A23A 1RQEA 3RU6A 4P2VA 4EF9A 2E09A 1Q6QA 3B0UX 2ZZ5A 3W76A 1QAPA 5D2TA 3ZFHA 1OYCA 5LNVA 3P67A 1TB3A 1LDCA 2LLEA 4IXXA 4DF2A 3TXVA 1X6UA 1KFJA 1UUOA 3G18A 3W3OA 3LCIA 4JTGA 1MO0A 3TFCA 3I65A 3STFA 3I7RA 1XBXA 1HUVA 1AMKA 2OZ0A 4PFMA 3RFAA 4O4VA 4H6KA 1L6SA 2WPBA 2C15A 4JTIA 3W7OA 2ZRYA 4O0KA 4RV8A 3ZWTA 1TTPA 4PCFA 1K02A 3NQDA 3GAKA 4P61A 5CKSA 3HPXA 4ADTA 2QEZA 3IIPA 3DH7A 4O57A 4XTIA 1N7KA 5HWNA 2Y62A 1DVJA 1ME8A 4LNYA 1J4EA 3LBCA 2AQWA 1KV8A 4UFKA 1VCGA 3W83A 5D32A 3CIWA 1SO3A 4AB4A 4O13A 1TSIA 3GDKA 4BWLC 1TQXA 2Y61A 5FESA 2DZPA 2B0MA 3KXQA 4ZQNA 3G3DA 3VKJA 1VLWA 1SPQA 3W1QA 4FO4A 1MSSA 3C2FA 3L0NA 3VI2A 5E93A 1OFAA 1OX6A 3AJXA 2QCNA 3BVJA 3GXTA 2ZZ6A 3TQ0A 1TV7A 4LS0A 2JGYA 3MI3A 4WX2A 3W2MA 1SO4A 4IMGA 4O15A 3DFOA 5K4ZA 1N55A 4FNSA 1JQVA 5TBOA 1LP6A 3MBFA 1I2NA 4JTUA 4RCXA 1IGSA 5KZMA 3USBA 2QJIA 3HG4A 2E6FA 1XFBA 1IXNA 4N9CA 2C0AA 3YPIA 4RZ5A 2JK2A 1AL7A 2J6XA 5DY3A 3W74A 2I1OA 4WUIA 1LBMA 1YDNA 2NXGA 3HGSA 3TE9A 2Q3RA 1NVMA 4AWUA 1KTNA 4PEKA 2E77A 2NUYA 5K9DA 1EUNA 3DAQA 4A21A 5G4WA 4UTTA 3DZ1A 3W7RA 4HSOA 5K9XA 3VCRA 1GWJA 1M7OA 3O07A 4TIMA 5DY2A 3C2OA 4IOTA 4FX7A 3PBUA 4X22A 1B3OA 1XCFA 3FKRA 4IMEA 3UWUA 2TSYA 4UMCA 3FYPA 1XBZA 1T99A 4L4LA 3UNDA 2C1HA 4XBKA 4LVFA 3LERA 3L5AA 3GDRA 4UR8A 2ABAA 3LHUA 1A5CA 1S5VA 3UD6A 4UTMA 3WJSA 2J9ZA 1Y0EA 2QCDA 3LTPA 5LGZA 3O05A 5U7SA 1VRDA 2IQTA 2VEPA 3SY5A 2EAWA 2Y7GA 3QEZA 5CG7A 4J9JA 4OT7A 1XDLA 5KZDA 3NQVA 1HG3A 1LRNA 1WQ5A 4MZYA 4WQ6A 3F4NA 3PWAA 3MBDA 3EWZA 2ISVA 1LTDA 3LHZA 3MYPA 1UBSA 1JQXA 2OMAA 4A2RA 1MEHA 4NNAA 3W84A 1RV8A 3T7VA 4IX2A 4D2JA 3VE7A 1P5BA 1EIXA 3BW3A 3NYZA 4IMCA 1KTCA 4LRTA 4JTJA 1TYGA 5DN1A 4JIPA 4M7SA 4OWGA 1CI1A 5KSWA 2J27A 3LHVA 1WOAA 1GT8A 2O7SA 2TMDA 3DHDA 2E5BA 3JRKA 3FKKA 4S2CA 3DKJA 3UY8A 5AN7A 3KVJA 2EGZA 5CSSA 1TJPA 4ZMGA 3QYQA 1LROA 1PHQA 2Y7EA 3KRZA 3UWYA 4JNMA 4O8RA 5AYYA 4IJBA 2VEKA 4R34A 3N9SA 4DPQA 1P4CA 2YXGA 3B8DA 1OFBA 2QCLA 2TRSA 4CNOA 2E1DA 3G1HA 3UWWA 3NL6A 4AXKA 2W6RA 5G2WA 4QAIA 2A2IA 1PCKA 2ALDA 3CLMA 5KMYA 3EKLA 3OIXA 1JUEA 1N8FA 3O1NA 1LCOA 3TJXA 3TSMA 3BW4A 1W5MA 4YMZA 5BNKA 2QKFA 1OK6A 3HQ1A 3LRKA 2E5CA 1CW2A 1VZWA 5EBUA 3GKAA 1LRTA 3B4UA 4KWWA 3L67A 2Y7FA 2RDWA 1H63A 4AVFA 1W37A 3LXAA 2CLLA 4ZQPA 5D2XA 3S5NA 2QUUA 3NPVA 2ZA2A 3QQ0A 4XZ9A 3CM4A 1OX4B 5K7JA 4DELA 5FF3A 4DEFA 2YW4A 3C2EA 3DHFA 3LM7A 5C2XA 3HOJA 3MO7A 2HSAA 4PTNA 3B0PA 4FNPA 3BK0A 1I2RA 3R2GA 5CPMA 5EL1A 1FWSA 4QSHA 1TPUA 4JTHA 3N2XA 1R30A 3R8RA 3PY2A 4PL1A 4LU0A 4NJIA 5FF4A 5KZEA 3TDFA 3W2KA 1YDVA 4BF9A 4DO5A 3BW2A 5G2IA 2TPSA 3W85A 2BXVA 3S6DA 5DCBA 2V5BA 2PE4A 3TKFA 5J5DA 5LNSA 3S8HA 3HIJA 1XUUA 1VS1A 4UC5A 5FEPA 1JUKA 2FB2A 1FXPA 1F6PA 1L6WA 2QJGA 1OFPA 3HBLA 2AAMA 4PL2A 1O94A 1RD5A 3ABQA 2BWGA 3TFXA 1L9WA 4O1CA 3HG2A 2V30A 1IIHA 3RF9A 4FNRA 3IIXA 3U6WA 3LOTA 2VFDA 3P8JA 1TV8A 4NZJA 4E2BA 2GQ9A 2OX1A 3LCFA 4JTTA 2A5HA 2H8ZA 5BMWA 3RMJA 5AC8A 3KRUA 2GQAA 1X1ZA 2DZSA 1PCWA 1H60A 3MWAA 2VFEA 3GZ3A 3PR2A 3RK8A 1TPB1 3ATZA 3TK7A 4GUJA 2DP3A 3W1UA 3IGSA 1DHPA 3MP5A 3HMJG 1VHNA 3P62A 3VFLA 1XXXA 3BGJA 1VYSX 3M5YA 3CIXA 3S9YA 2X1SA 4UNKA 2XFWA 1UB3A 4WZHA 4CQ8A 5FF0A 3NZ1A 3MP3A 1KV5A 3E49A 5BMXA 3RLUA 3HG5A 2RDUA 3W23A 3UY7A 3FOKA 4LC6A 5D2YA 4NJJA 1O5XA 1W0MA 3SSJA 3C52A 4MY1A 3A24A 5CPOA 2HTMA 1TPC1 3NQ7A 2PRMA 4EWND 3QW3A 4DF0A 1HO4A 2A7RA 2C3ZA 4DXVA 1YDOA 2E6DA 4O0ZA 3F4WA 3PB0A 3NL5A 1ICSA 4Y90A 3NOEA 3VE9A 1RQHA 1ZCOA 4EVZA 1K03A 1SZEA 1X8FA 3R13A 1UCWA 1P1XA 5G5IA 1DKWA 4JXCA 3P81A 4PA8A 4AEOA 4KFPA 5LHEA 2QR6A 4UFMA 2YR1A 4RZ6A 3S1UA 3M16A 4AHOA 3WJXA 3BLFA 2VENA 3TC7A 1PS9A 4YCOA 1ZAIA 1SSDA 3GXPA 1XM3A 1QWGA 2P10A 5AC7A 5EPDA 3QMTA 3FIGA 4LWWA 5CZ0A 1DL3A 5IBXA 4WXZA 3FYOA 3DGRA 3NQEA 3PUDA 1WV2A 2FFCA 4AH7A 3NEVA 4LVBA 1H1YA 3QW4B 4WY0A 4FX6M 3LCHA 2CZ5A 3GK0A 3N73A 4LOCA 1LOLA 3L2IA 4GUHA 3Q94A 3EWXA 5DXYA 5G4EA 2ZZ3A 1VQTA 1KTBA 3CT7A 1XBVA 2NUWA 3HPZA 5E0KA 1GPWA 3G3MA 5AFDA 3UZJA 1ME9A 2GVJA 4OBTA 3W2UA 3LRLA 2DZUA 2Q3OA 2WV8A 1MEIA 2DORA 2TYSA 3GB6A 2BTMA 2F7FA 1GQNA 3T40A 1ME7A 4FX8A 1QCWA 1NFBA 1X1OA 5F4WA 3UQNA 5K3VA 1R2TA 2Y63A 4N9BA 4UTKA 1BTMA 2R14A 3IVUA 4CNPA 2DJXA 4XUGA 1YPIA 1OJXA 2QCCA 3PBWA 1YADA 2VELA 4JDBA 2X30A 3UXAA 4H4IA 3KRSA 4Z1CA 2O7QA 1L2UA 3I6RA 3PAJA 2FJKA 3PULA 3W7DA 2CLOA 1YXCA 2QUTA 2GJNA 2V82A 1Z42A 1IXQA 2BZNA 2VOMA 2ZZ2A 3LXBA 1W3NA 2J9XA 2RKXA 4NZFA 4LS2A 3K30A 3M41A 2HMCA 2YSWA 4BI6A 4BR1A 1K3UA 3BV4A 3C8FA 2X1UA 3UYCA 5LNRA 1Z41A 3TW6A 2YFNA 2E6AA 5G1YA 5I3JA 3STCA 3W72A 4UTLA 2GPTA 1R47A 1W31A 4UTWC 4AWTA 1KLYA 3EWUA 2QCGA 3R5EA 4O16A 1LOSA 3UPWA 1BWLA 3STEA 1F6KA 5CZJA 4S2BA 1TPDA 1AL8A 1QO2A 3EWWA 2WSYA 1W8SA 4JTLA 3W7JA 5MHBA 5HMSA 1LOQA 3UZ5A 3L9CA 3LBMA 3IVTA 1THFD 3QPZA 1VCFA 4N4PA 1P0KA 2QCEA 4HNUA 1J2WA 3C61A 3U2OA 1KLZA 4N6FA 4QJ1A 4KFOA 1OX4A 4PC8A 4FNUA 4UR7A 4Y96A 4B5NA 1JCNA 3TMLA 4UFIA 3STGA 3GDMA 3TA6A 4HKPA 1TPH1 1I2OA 1VYRA 2ZRXA 1OFEA 3WK1A 2NZLA 4IWWA 3NAVA 3DKLA 3N34A 2XN0A 1DQXA 3W7GA 3INPA 4YLWA 1LBLA 3LCGA 3A5VA 2C19A 2VEMA 3E9AA 1PV8A 3IIOA 4ZZ9A 2FTPA 2ZZ7A 4O50A 5LNWA 4QISA 4CLMA 4MJZA 4EOUA 2J88A 4EIVA 3BPWA 2WJZA 5BRBA 4U28A 1ZALA 1TCDA 2JBMA 3NL3A 4NXKA 5CZSA 1SSGA 6ALDA 2X16A 3O15A 4LT9A 4FB7A 5HQEA 3W1NA 2BLEA 1DOSA 1K7FA 3ABSA 2GJLA 3T44A 4JTFA 1LLWA 3A22A 1ZAJA 4HPJA 1RVGA 2QAFA 3THQA 2G95A 3E0IA 3WJZA 3NA8A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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