1ALDA

Activity and specificity of human aldolases
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
PYQYPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFVSNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase (aldehyde)
molecule keywords ALDOLASE A
publication title Activity and specificity of human aldolases.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 131
structure length 363
sequence length 363
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 1991-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1aldA00
1NFBA 3WK3A 3CC1A 1MEHA 5EMUA 3NO5A 5CSSA 1Z48A 1VZWA 3GIYA 4AB4A 2VFFA 4AHPA 5L9FA 4TX9A 5KMYA 2YZRA 1MXSA 1I45A 1QOQA 1JQXA 5U4NA 3BLIA 3LHYA 3E96A 3A22A 3LLFA 4K7YA 4WJEA 4O4VA 3NPUA 5L6UA 3W2KA 4X3ZA 5IM51 1IIHA 1W5QA 2CLFA 3S5OA 2GJLA 4NVTA 1N7KA 4ZQMA 3FS2A 2X2GA 3D0CA 4JDYA 2GQAA 2BX7A 1X1ZA 3INPA 4O16A 4RXGA 1G4PA 3PSVA 2O7SA 3L0NA 3NA8A 4LVFA 3VNDA 3W9ZA 3GVGA 3BG9A 3HGRA 2Q3RA 3L66A 3W74A 3B05A 4DPPA 4UTJA 4NQ1A 2CLKA 5F2IA 1LM1A 3GK0A 2ZRUA 1K7FA 1VYSX 3U6WA 5AC8A 3BLEA 3GDRA 1M7OA 1NAL1 3QW4B 1DJQA 4MY1A 1AW1A 1XDLA 3HF3A 2DORA 3UY8A 5AOUA 4PH6A 3EWUA 3EWWA 1YTEA 3P8JA 4A2SA 4ZZ9A 2GJNA 2Y63A 2P0OA 3M41A 4JTGA 4HHPA 3LGEA 4NNCA 5CGQA 4AWSA 4YCPA 4HKPA 1ICPA 1K8ZA 5I3IA 1QAPA 1H1YA 4KWVA 3NZRA 1T96A 4QIUA 4EIVA 3ABOA 3DFPA 1K03A 5F2LA 2FPTA 3QQ1A 2Y85A 1OX5A 4Z0JA 3FJ6A 5G2HA 3HPXA 2FPYA 4I7UA 3TMLA 4N2YA 4JIQA 3FA5A 5D2WA 1GVSA 1W8SA 4AH7A 2A7RA 1AG1O 2VELA 1OK4A 1Q6OA 3F03K 4IPIA 1Q6RA 2WKJA 4RK8A 4O19A 2PCQA 3N2MA 1OK6A 3F4WA 2A7NA 2VEMA 3MYPA 3QZEA 5SWUA 3MWAA 3Q2DA 4E0CA 2QCHA 5DBTA 2A21A 1O5XA 2NUYA 4IXXA 1QPRA 2NX9A 5IBXC 2DZTA 3WK0A 4Z1CA 2B7NA 1ML1A 2P10A 3UWVA 5C54A 3EWZA 2RDTA 5F2GA 1G67A 1PVNA 4O50A 4HN4A 3G1SA 2Z6IA 2ZRXA 3C52A 3DFTA 3OG3A 3CTLA 4K36A 4LVBA 4BI7A 3PC0A 2GQ9A 3NZ1A 3GDLA 3LRMA 4YMZA 3I7RA 4XBKA 3IGUA 2ZRVA 4FXRA 3LV5A 4FX7A 2C16A 3TSBA 4D2JA 3SR7A 2NX1A 5HULA 2C19A 2NWRA 3UY7A 5LZLA 1SFLA 3IV3A 1Q6LA 1JUBA 4EWND 4JIPA 2C18A 1YXYA 3GKAA 2FTPA 4IPJA 2YXGA 3QRHA 4UTLA 5F4WA 2ISWA 5U7SA 3NL6A 4FO4A 1ICSA 1LCOA 3LTYA 5C55A 3FEMA 2ZZ4A 1VCGA 1X8FA 3GNNA 4Y6GA 3CB8A 2QCCA 2TMDA 2OZ0A 3G0UA 1YDOA 3M44A 3W1QA 3L5MA 3N2XA 1KM1A 1W31A 1ZENA 1PCKA 1KV8A 1W56A 4YCOA 3EX4A 2B7OA 1L6WA 2NWSA 3UWWA 4M6QA 4NZFA 3QSTA 3KRZA 4WXZA 1PV8A 1Q6QA 4JTKA 4DO4A 2R94A 5K3VA 3N34A 1BWKA 1OHLA 5F4SA 2Q8LA 2P1FA 1H7RA 5FF2A 3B0UX 1TJRA 2NUWA 2GVGA 1XFBA 2QF7A 3W84A 3KRUA 4N4QA 3DI1A 3W7LA 4UTUA 4RZ6A 1TO3A 3HPSA 5KTLA 2H8ZA 3T55A 3CEUA 6ALDA 1Y0EA 2D73A 2R14A 3IIPA 4UMAA 4AXKA 3GZ3A 1YXDA 4ORMA 4UIOA 3ZWTA 1H7PA 4TIMA 1P5BA 3HG2A 2VFEA 1TREA 1VLWA 5FF4A 4RZ5A 5LGXA 3QMRA 2CLLA 4IQLA 2G95A 1O60A 2YPIA 4CNOA 1O94A 3EWXA 2Y70A 5G4WA 3S5YA 2O7QA 2EPHA 4IMEA 2ZRYA 1RV8A 1CI1A 3NL2A 3M47A 3DFSA 4WZHA 3NM3A 2EHHA 5AYXA 4NJHA 1KM3A 3P82A 4FF7A 3S1VA 1M5WA 4LT9A 2CZDA 3NL3A 3O63A 1B3OA 3W88A 4LS0A 4N9BA 3DKLA 4GUGA 1WDWA 2VENA 3W7GA 3RK8A 3OVQA 3WK2A 5I3GA 4LRTA 3W76A 1DVJA 1ME7A 4S1FA 4WY0A 1FWTA 1R46A 4XUGA 4G1KA 4HPXA 5D05A 3NQ7A 1HTIA 5AHEA 1JRBA 3MHFA 4ZQOA 2Z0IA 2R91A 3MHUA 3PS7A 3G1XA 5FESA 2TYSA 4Z1BA 3RLVA 3L0KA 4MFEA 1KFBA 3C4UA 4R53A 1SSDA 2Y61A 4M6VA 1SW7A 1H7XA 3BARA 3KFTA 1ZHAA 4LNYA 2BSLA 4DQWA 3S5ZA 3L5LA 2AQWA 5F2MA 2CZFA 3M6YA 3QMSA 1MSSA 3LI0A 4IGHA 4DBDA 4JXCA 2B7PA 4UMBA 1F5ZA 1C8VA 1G7UA 3P5ZA 4UTMA 1OX6A 3L65A 5DY2A 1H7OA 3DHDA 2E77A 1XKYA 1FXQA 1OYBA 1FQ0A 4L4MA 1WQ5A 5A5WA 4WX2A 3LOTA 3TXVA 5BW6A 2H6RA 3IVUA 3HG5A 3P67A 3CEPA 1FXPA 5KSWA 4AHQA 4MYXA 5G5IA 4H4IA 1VYRA 4NUWA 4OHQA 3L0GA 1D3GA 4Z1DA 4UFHA 2V5LA 4NJJA 2V5BA 1SFJA 4FNUA 4N4PA 4R34A 4UR8A 1AMKA 3A23A 5K4ZA 1WBJA 4QNWA 2PC4A 3NG3A 1YADA 2CU0A 4BI5A 3QPZA 4RXFA 2NV1A 3KVLA 2ZZ5A 3IVSA 1QCWA 3B03A 4KFOA 1JCNA 5G4EA 3R8RA 3L67A 2G5WA 1YPFA 5F1VA 3GXPA 1LP6A 5H91A 4N02A 3NQVA 1XUUA 4JX4A 4UTIA 3A5FA 4O53A 2X1RA 2HSAA 2C0AA 3IRDA 4Y9AA 4YL2A 4WXYA 5D2YA 1WBHA 4OWGA 1ZAJA 2ATMA 1KFCA 4JICA 5D32A 3GDTA 3W86A 4LTSA 1SZFA 4S2CA 1Z41A 2CLIA 1F7BA 1JCYA 3O6CA 5DELA 4FNPA 4UTTA 3BLFA 3MI6A 3FYPA 1OJXA 4QSHA 1L6YA 5D30A 3P7YA 4XQ6A 3S0CA 4FNQA 3QC3A 3NQFA 4JX6A 4O13A 1C9DA 1OFRA 3DZ1A 1S5TA 1P0KA 3QPYA 4E38A 3OHIA 4NX5A 5K2ZA 2C13A 2CLEA 4PL2A 3SZ8A 3W22A 1EUAA 2A6NA 1FDZA 1BEUA 1P4CA 3MUXA 4JD4A 2ZCGA 2ZFAA 1T0OA 5I3HA 3U8GA 1TB3A 1KM5A 3NQCA 4O54A 3E9AA 3T40A 4PTNA 1OFDA 4Q33A 4OV9A 4K6AA 1ONRA 3G3MA 4E2BA 3LHWA 4FHAA 1KM4A 1VHNA 2NLIA 2JGQA 4UCGA 3LTSA 3STCA 4CLMA 1THFD 1I2PA 2C15A 2CZ5A 4TMCA 1DV7A 1JR1A 1FCUA 3NXFA 3HJZA 2C3ZA 3NQMA 4OU1A 4M7TA 3RLUA 4X2RA 2AAMA 1VCVA 3THAA 1LROA 2EKCA 3W72A 3M5VA 4JTLA 4DPQA 1BTMA 2YYUA 3QW3A 5DY3A 1ZY9A 4OQVA 1WV2A 3O1NA 5D33A 2VEIA 3E12A 1S3HA 4O57A 5AFDA 4Z08A 4WOQA 3ANYA 1W5OA 2TPSA 3UWQA 1FWSA 3AJXA 1EEPA 4FIRA 2VFDA 3M1ZA 1SW3A 1FWWA 1GZGA 2ABAA 3T7VA 2NX3A 1EB3A 2FB3A 3LXAA 2QCNA 5D09A 1TPB1 1FWNA 2DZXA 1KLYA 2YFOA 4EOUA 5LNUA 4JX5A 1FCBA 2CFFA 3KVKA 1TV8A 1RQEA 2NZLA 2ZQ0A 3IGXA 3NQGA 3TQVA 1TTPA 1L6SA 2J9YA 3W6YA 4MFDA 4ONVA 3FFSA 3S1WA 2X1SA 5EYWA 1TPWA 1XBXA 2BLEA 4UTWC 1W5PA 4UXDA 1ZFJA 4UFMA 3TE9A 4O4WA 1GVQA 4IUOA 4HSNA 5HMSA 2QAFA 4IMGA 3TXZA 1FY6A 4JTHA 5HJLA 2X1TA 3QSRA 1DQWA 3W7NA 1UJPA 3CHVA 3ABRA 2ZTKA 3GNDA 1SO5A 5FEWA 5LHEA 3GDKA 3FYOA 3LCIA 5HNRA 3B0VC 1H5YA 3W7CA 1DL3A 3OIXA 2JBMA 4J9JA 3TUUA 3W7OA 1VPXA 2NXGA 1GJPA 3TQKA 3DGRA 1ZJIA 4K8HA 3JS3A 3KRSA 4FXSA 2YGYA 4UR7A 1XCFA 5E1QA 4WOZA 1PCWA 1SZGA 2DJLA 2FDSA 3CIXA 3C2VA 1F2JA 4LWWA 4NJIA 3BW2A 1GVRA 4E2DA 1YTKA 1EUNA 4UUIA 1QDSA 1OABA 4HT3A 4K7VA 1WAUA 2V81A 1NF0A 3IIXA 3G1DA 2FPVA 4KFPA 2J9XA 5C6MA 1QPNA 4O28A 1TIMA 2NXHA 3MP5A 5BOOA 1IXQA 1K8YA 4OE7A 2HTMA 3ATYA 2G97A 2BZNA 3TCEA 2A4AA 3NQDA 4JY8A 1AW5A 4DO5A 2TRSA 1LORA 4JNMA 1XC4A 3LERA 3QJAA 3VE9A 2TSYA 3S5NA 2A2IA 4IJBA 5FI8A 3TC7A 3HBLA 1HL2A 3LRLA 3W1NA 2H8XA 1QR7A 2OMAA 1EPXA 2ZTJA 1J4EA 4L4LA 4P2VA 1OF8A 4MLJA 3T44A 1DKWA 2V2CA 5DBUA 2H90A 3QMTA 1B9BA 1F6KA 1GPWA 3C2OA 3PB0A 5AHIA 3P84A 1MO0A 1RZMA 3C2RA 3EXRA 1F6PA 2CW6A 1B4EA 3DU0A 3M16A 3NPXA 3R13A 1JRCA 4GWEA 5EKYA 1K7EA 3DBPA 5KITA 5CZ0A 4LV4A 1S5VA 3EKLA 2OT1A 3HG3A 3STEA 4N6FA 2KZHA 1LBMA 3LHZA 1IF2A 1IXOA 2QKFA 2W0UA 3I7SA 2QJGA 1CW2A 2ZYFA 2PE4A 1PIIA 3UPBA 4M19A 2CLOA 2HS8A 5LNVA 5DCEA 1H7WA 3LXCA 3W7PA 1OX4B 1WOAA 3NQEA 1SPQA 2QJHA 4JDBA 2VFHA 4WD0A 5HR7A 1YPIA 3LHUA 2Z2UA 4AAJA 2ZDRA 4O1BA 3P62A 3SI9A 3TW7A 1YDNA 4PA8A 1H61A 1GEQA 3MP3A 3OVPA 3Q94A 1OYAA 3G22A 2RH9A 4XTIA 4AVFA 1YTDA 3PG9A 3WJXA 4JTEA 2ZZ3A 1W3IA 2ZA3A 1JUKA 1SO3A 1VYPX 3L68A 2BWGA 4LC8A 1SR9A 2JKAA 3LHVA 3S8HA 2YYTA 3G18A 2C1HA 4FNSA 4O1CA 4JTIA 4IMCA 1TCDA 1LBFA 3TIMA 1TPDA 1LLWA 4O1DA 4M7SA 1XDMA 1JJKA 1R47A 1TRIA 3IIZA 3S6DA 3EX3A 2XN1A 3TR2A 2V82A 1JCJA 1MEIA 5K9CA 3M9YA 1VRDA 3O6YX 2ZZ7A 2DZWA 2W6RA 3BVJA 2Y6ZA 1GT8A 1LLZA 4BWLC 5EY5A 2J24A 3MW7A 3TJLA 2WO5A 3NPWA 1SUXA 4YXGA 3EB2A 1KM6A 4GRSA 5EL1A 1OF6A 4O18A 1GG1A 2HS6A 2QEZA 5E0KA 4UMCA 1YDVA 2AGKA 4IMFA 3EX6A 1EWEA 4GUIA 3CWOX 3GX9A 5CPNA 1GG0A 3NEVA 4AWTA 2GVLA 5CG7A 1XM3A 2XN0A 3PBVA 4JEQA 4CCEA 4N9CA 5F1UA 1F76A 2WNQA 3LB0A 3U2OA 3VKJA 3THQA 4ORIA 4ZMGA 3PVFA 3O05A 3UWZA 2YSWA 4MKNA 3C6CA 3GR7A 4ML9A 5G1TA 1IXPA 4AMAA 2B7QA 2Y7GA 1W3TA 5G1YA 4YWIA 4JYDA 4FB7A 1JUEA 4BK9A 1FDYA 3C2FA 2YR1A 5K7JA 4U4MA 3NOEA 3A9IA 3LCLA 3MYOA 1AL7A 4MVAA 4PEKA 5KZMA 1FWRA 1HO1A 2WV8A 3NNTA 4XZ9A 4H6KA 3W83A 2PRLA 2VOMA 4XKYB 3SGZA 2YX0A 2Y7DA 3ATZA 5DCDA 4CQAA 3LCWA 4GFSA 4W9TA 4O11A 3UPWA 1BWLA 4HNUA 3HG4A 5I3KA 5D04C 1VR6A 1H1ZA 2UV8G 2RFGA 5AB3A 3W2LA 3TFCA 4DXVA 3PBYA 4N9EA 1O95A 3B06A 4HNVA 1LDCA 3T78A 1I2QA 4IX2A 2QDGA 4JYEA 3P80A 1HG3A 3W23A 2Y7EA 3DI0A 3NL5A 2I1OA 1T99A 3M5YA 3VCRA 1MEWA 5DXXA 3LM7A 2GVJA 2WSYA 3TSDA 3G8EA 1W5NA 2FB2A 1QO5A 2JKPA 3OBKA 4UFIA 1WOBA 2EAWA 3EEGA 3LCGA 3W1UA 2CLMA 4LVAA 4PL1A 5IBXA 1LBLA 2QJIA 3C2EA 1QPQA 3I68A 1ICQA 3G0XA 4IOTA 2YDAA 2QCGA 3LTPA 1EX5A 2JGYA 5ABTA 1SZEA 3IIVA 3HGSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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