1AQ0A

Barley 1,3-1,4-beta-glucanase in monoclinic space group
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
306
structure length
306
Chain Sequence
IGVCYGMSANNLPAASTVVSMFKSNGIKSMRLYAPNQAALQAVGGTGINVVVGAPNDVLSNLAASPAAAASWVKSNIQAYPKVSFRYVCVGNEVAGGATRNLVPAMKNVHGALVAAGLGHIKVTTSVSQAILGVFSPPSAGSFTGEAAAFMGPVVQFLARTNAPLMANIYPYLAWAYNPSAMDMGYALFNASGTVVRDGAYGYQNLFDTTVDAFYTAMGKHGGSSVKLVVSESGWPSGGGTAATPANARFYNQHLINHVGRGTPRHPGAIETYIFAMFNENQKDSGVEQNWGLFYPNMQHVYPINF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords 1,3-1,4-BETA-GLUCANASE
publication title Crystal structure of barley 1,3-1,4-beta-glucanase at 2.0-A resolution and comparison with Bacillus 1,3-1,4-beta-glucanase.
pubmed doi rcsb
total genus 102
structure length 306
sequence length 306
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.73: Licheninase.
pdb deposition date 1997-08-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00332 Glyco_hydro_17 Glycosyl hydrolases family 17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1aq0A00
2GJXB 3MV01 2WKGA 5ECUA 4Z2HA 4ZENA 3KEHA 2YL8A 1D7FA 1US3A 4H8UA 4W8BA 3WD0A 3BAJA 3GZAA 1BTCA 1HXJA 3ZJ7A 3CUFA 1FHDA 2BHZA 1ISWA 5ABEA 3AS2A 3L4XA 1HKMA 2E4TA 3BAIA 3SUTA 3LMYA 3OGRA 5I24A 4ML4A 3NJ3A 4AZCB 1QI5A 2WSPA 1DHKA 2EPKX 1RP8A 2XSAA 3QOKA 4GQRA 3PZIA 3AMCA 4LX4A 3PTKA 2W92A 3WEMA 1E6XM 4AZHA 2J8FA 3U7VA 1V3KA 1WNOA 3QR3A 3VIJA 3CHFA 4CU6A 1DWHM 4HMDA 2VVSA 3A3HA 4YHGA 3G6LA 5ABFA 5A2BA 2NT0A 4UQBA 1VEOA 1ZU8A 3GTNA 1DP0A 1UWIA 3VM5A 4WK9A 4UNIA 1VEMA 1HKIA 3BGAA 1C91A 4MB3A 1UUQA 3W27A 1EQCA 1QI4A 2XVKA 4P8WA 2ZOXA 1E1EA 3VDAA 4MPKA 2WMIB 4RE2A 5M5DA 3RM4A 3BCDA 3W24A 1XYZA 2QMKA 2CCRA 2ZUVA 3EDKA 4UCFA 2WHLA 3EMQA 2VMFA 2EBNA 1DWAM 3TP4A 2BFGA 2EO7A 1NOWA 3WUBA 2YDQA 3CZKA 3OLDA 5M03A 3ARVA 1NP0A 4UFJA 1GOKA 1P6WA 1V02E 3ZSTA 2AOSA 1OGSA 4WSKA 2J7HA 2VX5A 2WZEA 3PZTA 2XIIA 4D1IA 1BYCA 4H04A 3WUEA 3SCQA 4HPHA 3AISA 3L2LA 4QCFA 3RDKA 4PBGA 3EYPA 1UKQA 2G3MA 1VB9A 4HZ6A 1I1XA 4GI9A 1QBBA 4CN1A 1E5JA 4HTYA 3CO4A 5I5RA 3CZLA 3FAWA 3VGGA 1V6YA 1KGWA 1WO2A 4W93A 4PTVA 1W1PA 2DSZA 3AYSA 4QFUA 5JBFA 5A6BA 2YL9A 2YA1A 3ARXA 2VZUA 3WH6A 4W8LA 1B30A 1VBRA 2HVMA 3A4AA 3MSDA 1ITCA 4MAVA 2E40A 1BGGA 5BWFA 3M6DA 3VGBA 4Z2GA 4D6FA 1LG1A 4HMEA 5F7UA 4A3YA 1LWJA 2YLLA 1NWTA 2W91A 5JIPA 1HL9A 5A2CA 4PTMA 1JD7A 4F9DA 5A94A 1OINA 1KGXA 4HMCA 1K9FA 1EIBA 4UFIA 1EDQA 3VINA 1V0NA 3CLWA 3WQ8A 3W82A 1CNVA 3AHXA 3POCA 3U5UA 1NH6A 1OIMA 2XWDA 4MNMA 3PZQA 3WFLA 1TMQA 4PRWA 1UH3A 4FK9A 2V5DA 2XFYA 2YA2A 5GNXA 4MJ2A 4MB5A 3SCNA 1E70M 1CGUA 1E71M 2ZWZA 1H4PA 3N18A 8CGTA 2PF0A 2ESCA 1GUVA 2YLAA 1ODZA 5GQBA 1UH2A 1IV8A 4TTGA 5CPSA 3TTYA 3ZO9A 4HU8A 1PZ3A 1UKSA 1UG6A 3THCA 1TZ7A 1WAWA 3WEOA 1E6QM 4F66A 5A8NA 4Z2IA 3UESA 2BY2A 2J7DA 2Z1SA 1SMDA 3PZVA 2WW5A 1Q6EA 4GZEA 4C7FA 2WPGA 2W63A 4MADA 3ARUA 4WSJA 3WNOA 4JAWA 5LA0A 4DM1A 3VMOA 3EDDA 4P7OA 5BYWA 1ESWA 2A3BA 2DH2A 3WD2A 2WC4A 2X0HA 3PZUA 3VD3A 4OJYA 2V3FA 2RGMA 3BH4A 1M03A 2J78A 1B2YA 3VIMA 3ECQA 3DYMA 3F4VA 2ZX5A 1HN1A 2AAAA 3SCTA 1VENA 5CG0A 4XB3A 1GQLA 1HKJA 4TVCA 5CPQA 5HDRA 1CLVA 2VZOA 4AMCA 4MDPA 5AC4A 3ZOAA 1D3CA 3T2PA 1XSKA 1BF2A 5HOSA 2O9OA 1OD0A 4NI3A 5A8MA 1J9YA 2J7GA 3NYDA 1M7XA 4DWSA 1NARA 3I3DA 4M24A 1CTNA 1U30A 3PZGA 1H49A 2BY1A 2VQTA 1E55A 2VRQA 2QLYA 5FIPA 2VCAA 4Z2JA 1OIFA 1MFUA 2VC9A 4W87A 1NM9A 3N13A 1I1WA 2D20A 1GPFA 1UD2A 2CBIA 4QP0A 2ZXAA 1VF8A 2YJQA 1W1TA 2QHAA 3OG2A 1GOMA 1V03A 3AXXA 1XRVA 1J0YA 3GYCA 3AIQA 3AIBA 3WIJA 2VQUA 1LQ0A 1PIGA 4W7UA 3D3AA 5A8QA 3VNZA 4D6GA 1KXTA 1GQKA 4YHEA 4L4OA 4TX6A 1W3LA 4MTVA 1BSIA 3CTTA 3CBWA 3QOMA 1WPCA 2FH8A 1HF6A 4JHOA 2F61A 4GO8A 4AIEA 2PWEA 3M7SA 4OOUA 4R5EA 2YKKA 4OIFA 5HNNA 1UZ1A 3WF1A 4H7VA 1QNOA 1BG4A 4LYRA 4NF7A 4QLJA 4AD4A 1VJZA 5IHSA 3PZMA 1CZ1A 3PHAA 4JKLA 4UFHA 1YQ2A 4AZ7A 1LL6A 4KMQA 1EO5A 2PBGA 2CNCA 1HJUA 2OWWA 3L4TA 4UQCA 1JFXA 3WSUA 5E70A 3PN8A 5E9AA 4CVWA 3B8SA 3CUIA 2XTKA 2VTFA 4GO9A 1X6LA 4IUGA 2ZUNA 1KXVA 1UWTA 4JKKA 4UQ9A 1V6UA 1UR2A 2A3CA 2WVVB 2WBKA 1ZJBA 1C7SA 4N42A 1JF5A 3ARPA 1J0IA 1V3HA 4PMVA 4OBSA 1XCXA 4TVDA 4CKQA 1W9XA 3UR7A 4CN4A 2G4FA 2EJ1A 5D8ZA 1QHPA 2QV4A 4PCTA 2YBTA 2WZHA 2VX6A 2W66A 3O9NA 1IT0A 3ZMRA 1JYXA 2X05A 1OT1A 4LYPA 1JZ3A 1E4IA 3GNRA 1JZ4A 4W5UA 4GI6A 2AMGA 2DT1A 3VIGA 4AZGA 5A95A 2PC8A 4U2ZA 2WNWA 3GXIA 3MKKA 1WZMA 1JXJA 1M04A 4GZIA 1LJYA 3KE0A 2VRJA 2O9PA 5BXRA 5M17A 3RIKA 3VM7A 3WKZA 1UR4A 2X8RA 5FCZA 2VR4A 3WNPA 1CPUA 5A69A 3THDA 3WH8A 1BPLB 3WMSA 5FOOA 3A4WA 1EO7A 3WQVA 1EA9C 4AW7A 1D2KA 3GH5A 3GNOA 4U31A 1CXLA 3WF4A 1TG7A 2CHNA 4TX8A 2DIEA 3WDJA 3AHTA 2O92A 1O6IA 3DHUA 2BNJA 2GJPA 3UG3A 5FL0A 4UR9A 3RM8A 3AS1A 5I6SA 1G9HA 1BAGA 4KH2A 1CGTA 4HPGA 1R8LA 1OGBA 3IAPA 4AWEA 1UWSA 2A3EA 2YIHA 5CSYA 4DUWA 1QNRA 1C90A 3AQUA 2ZXBA 2VURA 1ISZA 3HJEA 4YPJA 1OSEA 2VVNA 3TOPA 4DWSC 1NP2A 3L4ZA 1GHSA 8A3HA 4BQ3A 1KFWA 4CCDA 3N1AA 1B0IA 1DWIM 3UG4A 2PB1A 1XD1A 1ZJAA 1JL8A 2VI0A 4XV0A 4GI8A 5EBAA 1DEDA 4JFWA 1UR0A 3VDCA 3DYOA 1G5AA 4WKHA 4Y7EA 2VZVA 1G1YA 3OZOA 3WDPP 6A3HA 3AHYA 3AIRA 3BAKA 3WL1A 2C7FA 2WHJA 2DT3A 5ABFB 1JAKA 1H11A 1ZL1A 2X1IA 2CYGA 1PAMA 4PMOA 4D6DA 1H41A 1WB0A 1B3VA 3L4UA 3RCNA 5IHRA 4WF7A 4D6CA 2W61A 3AJ7A 5I77A 3VX0A 2PWDA 1EH9A 1XSJA 4AD5A 3U57A 3K8MA 1RP9A 3E1F1 1KWGA 1RPKA 3K4AA 5CPTA 1EOMA 1OCQA 2J75A 3WFZA 4XZBA 3W6LA 4EK7A 1CECA 2UY2A 5A6BD 3APGA 1C8XA 2WYSA 4HA4A 1R7OA 4J3WA 4HP5A 3L4YA 3O6AA 5E0FA 1WDSA 2D22A 5A6KA 2VX4A 4K68A 5D9OA 2WVUA 4U3CA 2JFEX 3VIFA 1E56A 1E6NA 3WL0A 4AXNA 2XGBA 1MWOA 4NRSA 2PWHA 2WXDM 4H8VA 3SCOA 1FH8A 1KQZA 3EDEA 3MSGA 1K9TA 4UZUA 3AYRA 1EHAA 1G94A 3GXMA 1DWJM 3VIIA 1JDDA 3AI0A 5GNYA 5GPRA 2YBUA 3VD5A 1H09A 2XUCA 4J27A 1BYDA 2VUYA 2OSYA 4HA3A 2DEPA 4UQAA 1NWUA 2WMGA 1E4NA 2XG9A 4CVUA 3KL0A 2XGIA 4E4PA 4M8UA 5A6SA 3TONA 2GJXA 1PZ2A 1C8YA 4W5ZA 1XH2A 1LF1A 3AS0A 1LWHA 3MS8A 4DM2A 1WDRA 3T09A 5CGMA 4F9JA 2DSWA 3WDRA 3W37A 3T0BA 2D3LA 3WBEA 1R87A 1JG9A 3VDHA 3WEZA 1JZ2A 1CXHA 1VFFA 2VCBA 2X2YA 3ZT6A 1WCGA 4D6EA 4PMXA 1GW1A 3ARQA 3SCSA 2BS9A 3VMPA 5JBDA 3VMNA 3AIEA 2UY4A 3AFBA 1BQCA 4KRUA 1UR9A 4AD1A 5AY7A 4R27A 4D6HA 4PSPA 4ZEPA 3SCVA 1HJWA 1AQMA 5I2UA 2GUYA 2XFFA 3GM8A 2BY3A 1F4AA 2B31A 2VZSA 2BVTA 1GOOA 1PJ9A 2G8ZA 2DGAA 2D1ZA 4PTXA 1XD0A 1KR1A 3FW6A 4LGXA 2GDVA 1NOUA 1W1VA 2ZX8A 2WMIA 4B16A 5CXPA 6TAAA 4JCLA 4DWSD 3MMUA 1KCLA 2O9TA 1HT6A 4P7QA 4QDMA 3ZR6A 4TTUA 3HN3A 3B9AA 3SUSA 4OKDA 4GQQA 3KL3A 2WC7A 3SCWA 1XGZA 2VT0A 4ZE4A 2XIBA 1WZAA 4V2XA 1C93A 3VKKA 1I75A 1VFOA 3GBDA 5EB8A 1BGAA 4M29A 2Q8XA 3B9DA 2J7BA 4JIEA 4ATWA 4WIWA 1J0ZA 5E6YA 3I3BA 4C7DA 2W67A 1HIZA 2JIEA 3WH5A 2DSVA 3W53A 3OIHA 5BRPA 3VTRA 4GIAA 2W62A 2DSUA 3IJ9A 1UD5A 1JD9A 2Z1KA 2JIWA 1GOWA 3LPFA 4UZSA 5BXPA 2PBOA 2XVPA 4DUVA 3K1DA 1CWYA 1Q4NX 3WDHA 5AC5A 3W25A 4CCEA 3AMGA 4TVUA 5EFDA 5E0CA 3WF3A 1JGIA 3PZ9A 2FDMA 4HOWA 2RGLA 3SUUA 1RH9A 2E8ZA 1EDGA 5BXSA 5LYRA 3ARYA 3SCPA 4U3AA 3CIVA 3BC9A 1ISVA 1C7TA 6CGTA 1EXPA 5M3WA 1ZBKA 1OB0A 4PTWA 2J77A 1HP4A 3LPOA 3WN6A 4P8XA 1KBKA 1WZKA 3BAYA 1JYNA 4CD8A 2DH3A 4HU0A 1V0KA 4J3UA 2UY3A 1FA2A 5BRQA 4EKJA 4MNKA 2E9LA 4H8HA 2EEXA 2WMJA 2Y5EA 5DO8A 4KWUA 2J74A 5DMYA 2MANA 5DEZA 3ZT7A 1KXHA 2CITA 3ARRA 5DFAA 1QI3A 5FL1A 1W3JA 1R7AA 1W3KA 2DIJA 3OBAA 3AMDA 4JHZA 3POHA 2GDUA 3AICA 1GQIA 3T08A 4MJ4A 5BXTA 3MANA 1GOQA 1CYGA 4D6IA 4CD4A 1U2YA 2WMKA 4W89A 1PBGA 2YDSA 4ZFMA 2OYLA 2G3NA 3MMWA 4CGTA 2XWEA 1FFRA 1DWFM 3VU2A 2EPMX 3W0KA 7CGTA 4KRTA 3K8LA 3DYPA 5C71A 1VJSA 2ZXDA 4HZ8A 3EBVA 4H41A 2WBGA 3WNKA 3AXHA 3WF2A 5CGTA 3RILA 2HISA 1AQ0A 3VD4A 4TOQA 5HPCA 1C3FA 1CXIA 2DSKA 2XSBA 5BROA 2D2OA 3WBAA 4GPNA 1H0IA 3MUIA 3M46A 4V28A 1DWGM 1VFUA 1EDTA 3K4DA 3GH4A 4AEFA 1V6WA 3FAXA 3WQ4A 3FY1A 2CETA 1UWQA 4U33A 3WELA 4GINA 1E6SM 3GXFA 3AHVA 5A2AA 2G41A 2NT1A 4Q22A 4FLSA 1W9DM 4W85A 1UA3A 2Y2WA 4CD7A 2W4XA 1IZKA 5A6LA 3N04A 4MAZA 3WDIA 3W28A 3A4XA 3VVGA 2WANA 3CHEA 2UWFA 4UFMA 5IXEA 5KEZA 1UH4A 5A1AA 3RJYA 1Q6DA 1KCKA 1J0HA 3DECA 5KZ6A 2GSJA 2CHOA 4BCEA 1JF6A 1W2PA 2FHFA 4JFUA 2VZTA 1J18A 4PYSA 2D23A 4AZ5A 3SUVA 1MQPA 2NSXA 4BQ2A 2QF8A 3DHPA 3CZGA 5AYBA 1E0WA 2VCCA 1XCWA 1JNDA 3UEQA 3WD4A 3FHQA 2V3GA 4X0NA 1BG9A 2GK1A 1AVAA 1JYVA 3F5KA 2BVYA 1CXFA 4CU8A 3OA5A 4AD3A 4M80A 4D71A 3VUPA 3BAWA 1FH9A 1J01A 4BQ4A 2Y4SA 2WM0A 3RO8A 2OYMA 4E8DA 1FHLA 4LQ1A 1XC6A 3CHDA 2YL6A 3ZSSA 1BVZA 1JDCA 9CGTA 3BXWA 2QMJA 5HXMA 2J4GA 5FD0A 2WK2A 1WDPA 1TUXA 1J0JA 4UOQA 1MW0A 3PBGA 2W5FA 3VIKA 1WE5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2GJX B;  3MV0 1;  2WKG A;  5ECU A;  4Z2H A;  4ZEN A;  3KEH A;  2YL8 A;  1D7F A;  1US3 A;  4H8U A;  4W8B A;  3WD0 A;  3BAJ A;  3GZA A;  1BTC A;  1HXJ A;  3ZJ7 A;  3CUF A;  1FHD A;  2BHZ A;  1ISW A;  5ABE A;  3AS2 A;  3L4X A;  1HKM A;  2E4T A;  3BAI A;  3SUT A;  3LMY A;  3OGR A;  5I24 A;  4ML4 A;  3NJ3 A;  4AZC B;  1QI5 A;  2WSP A;  1DHK A;  2EPK X;  1RP8 A;  2XSA A;  3QOK A;  4GQR A;  3PZI A;  3AMC A;  4LX4 A;  3PTK A;  2W92 A;  3WEM A;  1E6X M;  4AZH A;  2J8F A;  3U7V A;  1V3K A;  1WNO A;  3QR3 A;  3VIJ A;  3CHF A;  4CU6 A;  1DWH M;  4HMD A;  2VVS A;  3A3H A;  4YHG A;  3G6L A;  5ABF A;  5A2B A;  2NT0 A;  4UQB A;  1VEO A;  1ZU8 A;  3GTN A;  1DP0 A;  1UWI A;  3VM5 A;  4WK9 A;  4UNI A;  1VEM A;  1HKI A;  3BGA A;  1C91 A;  4MB3 A;  1UUQ A;  3W27 A;  1EQC A;  1QI4 A;  2XVK A;  4P8W A;  2ZOX A;  1E1E A;  3VDA A;  4MPK A;  2WMI B;  4RE2 A;  5M5D A;  3RM4 A;  3BCD A;  3W24 A;  1XYZ A;  2QMK A;  2CCR A;  2ZUV A;  3EDK A;  4UCF A;  2WHL A;  3EMQ A;  2VMF A;  2EBN A;  1DWA M;  3TP4 A;  2BFG A;  2EO7 A;  1NOW A;  3WUB A;  2YDQ A;  3CZK A;  3OLD A;  5M03 A;  3ARV A;  1NP0 A;  4UFJ A;  1GOK A;  1P6W A;  1V02 E;  3ZST A;  2AOS A;  1OGS A;  4WSK A;  2J7H A;  2VX5 A;  2WZE A;  3PZT A;  2XII A;  4D1I A;  1BYC A;  4H04 A;  3WUE A;  3SCQ A;  4HPH A;  3AIS A;  3L2L A;  4QCF A;  3RDK A;  4PBG A;  3EYP A;  1UKQ A;  2G3M A;  1VB9 A;  4HZ6 A;  1I1X A;  4GI9 A;  1QBB A;  4CN1 A;  1E5J A;  4HTY A;  3CO4 A;  5I5R A;  3CZL A;  3FAW A;  3VGG A;  1V6Y A;  1KGW A;  1WO2 A;  4W93 A;  4PTV A;  1W1P A;  2DSZ A;  3AYS A;  4QFU A;  5JBF A;  5A6B A;  2YL9 A;  2YA1 A;  3ARX A;  2VZU A;  3WH6 A;  4W8L A;  1B30 A;  1VBR A;  2HVM A;  3A4A A;  3MSD A;  1ITC A;  4MAV A;  2E40 A;  1BGG A;  5BWF A;  3M6D A;  3VGB A;  4Z2G A;  4D6F A;  1LG1 A;  4HME A;  5F7U A;  4A3Y A;  1LWJ A;  2YLL A;  1NWT A;  2W91 A;  5JIP A;  1HL9 A;  5A2C A;  4PTM A;  1JD7 A;  4F9D A;  5A94 A;  1OIN A;  1KGX A;  4HMC A;  1K9F A;  1EIB A;  4UFI A;  1EDQ A;  3VIN A;  1V0N A;  3CLW A;  3WQ8 A;  3W82 A;  1CNV A;  3AHX A;  3POC A;  3U5U A;  1NH6 A;  1OIM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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