1B31A

Xylanase from penicillium simplicissimum, native with peg200 as cryoprotectant
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
EASVSIDAKFKAHGKKYLGTIGDQYTLTKNTKNPAIIKADFGQLTPENSMKWDATEPNRGQFTFSGSDYLVNFAQSNGKLIRGHTLVWHSQLPGWVSSITDKNTLISVLKNHITTVMTRYKGKIYAWDVLNEIFNEDGSLRNSVFYNVIGEDYVRIAFETARSVDPNAKLYINDYNLDSAGYSKVNGMVSHVKKWLAAGIPIDGIGSQTHLGAGAGSAVAGALNALASAGTKEIAITELDIAGASSTDYVNVVNACLNQAKCVGITVWGVADPDSWRSSSSPLLFDGNYNPKAAYNAIANAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Xylan binding subsite mapping in the xylanase from Penicillium simplicissimum using xylooligosaccharides as cryo-protectant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Family 10 xylanase
molecule keywords PROTEIN (XYLANASE)
total genus 130
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 1998-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1b31A00
1UH2A 4AISA 3PBGA 1BYDA 2YA2A 1V6WA 3SCTA 2XM2A 3SIMA 1W9BM 1J18A 1MW0A 1VENA 2OYMA 2EBNA 1VEOA 1H11A 1EHNA 4AIUA 1FOBA 1JZ7A 1UQYA 4HMEA 5A6BD 5C70A 3SCQA 1QW9A 3GH7A 2DT2A 3AXIA 1GVIA 2DIEA 2VCBA 3ZMRA 4PSRA 1TMQA 3WSUA 7CGTA 1FH8A 2UWFA 4W8LA 4CCCA 3VGBA 1IZJA 5ECUA 1VJSA 3NSMA 4RE2A 1QW8A 2YL8A 4TVCA 1CIUA 2JIWA 2XGIA 3PZTA 5E9AA 1E15A 2CKRA 2JF7A 2DT1A 1XCWA 1CGTA 1O6IA 2VI0A 2G3NA 3WDIA 1E55A 3KL5A 3SCWA 4HPGA 4UFJA 5JIPA 3WDHA 4C7FA 4GQQA 2ZX5A 3AICA 1ISXA 1OIMA 2YL9A 3MUZ1 4TVDA 1TG7A 2E4TA 4HPHA 2J78A 2E0PA 2J8GA 1QHZA 2QV4A 3RJXA 1B3YA 1E6ZA 3BGAA 5A8QA 3OLEA 2WMKA 3PZIA 3UCQA 1GOKA 1QVBA 4GZEA 4AIEA 4GKLA 3UEQA 5GNZA 3T0BA 1KCKA 1LJYA 5E6YA 2VMFA 2D22A 3SCUA 4JFWA 4PN2A 1TA3B 5A8PA 3NUKA 2D3NA 3GDBA 1PX8A 2QMJA 2J7BA 4DM1A 4MADA 3EDJA 3WDJA 1OIFA 3B8SA 4TUFA 2D3LA 1CYGA 1IT0A 2ZE0A 4JCMA 5HOSA 2YBUA 2DSKA 1TR1A 3UESA 3VGHA 4UQDA 4FLOA 1W9UA 3UERA 2OSXA 1BVNP 2YLLA 4V2XA 4J3VA 1UKSA 3IAQA 1DWGM 3K8LA 3AOFA 1EH9A 4PTXA 3VDAA 3AHXA 3FY1A 3WEZA 5A6MA 4MDPA 5F7UA 4AWEA 4UQAA 1TFVA 4CN6A 1E5NA 4DWSC 4ATDA 2J7EA 3CUFA 2V3FA 1E0VA 5HPOA 3J7HA 3ARYA 1W1YA 4BS0A 3AIRA 4AZCA 1CXHA 1GJUA 3II1A 1NARA 1PX3A 3WIJA 3AROA 1XD1A 2XVLA 3D3AA 4OOUA 2WZHA 5A8OA 2RGMA 4LXFA 1HF6A 2YDSA 4PMXA 1C8XA 1KXQA 2C7FA 1NP2A 1HJVA 6A3HA 1XH1A 3DYPA 5EMYA 1WZMA 1PBGA 1R86A 4JFUA 1B31A 4UQBA 3BLPX 3AQUA 4OOZA 4UOQA 1JGIA 2CETA 4P7LA 1EO7A 1NH6A 3A4WA 1PAMA 1V3MA 2DSVA 1PJ9A 1MYRA 2J47A 2VT0A 3AMGA 3AMDA 3SUVA 2EPMX 5ABHA 2E9BA 1WE5A 2DGAA 2X09A 4QP0A 5ABGA 3TP4A 1GOMA 3HN3A 3OA5A 2XSBA 4M56A 2J8FA 1W91A 1UWQA 1HXJA 3B9EA 4AC1X 2VX5A 2ZX9A 4FF5A 1SFSA 3CUIA 4BQ5A 4GINA 1QNOA 1KCLA 5IFPA 3WNLA 4AY1A 2WB5A 4YN5A 5M17A 1SMDA 3BCDA 5LA0A 1XGZA 5DT7A 3MV01 5I0DA 3M46A 5I77A 3BSHA 1BYCA 4DWSB 2D2OA 5A2AA 3W4RA 1LG1A 3SUSA 2XVNA 1AQHA 1LL7A 3WKZA 1WCGA 3BSGA 2CHOA 1OT2A 1QNSA 1GPFA 1LWJA 1J0JA 2MANA 1JZ2A 5JUVA 4Z2LA 2W67A 2VCAA 2VURA 2XJ7A 2NW0A 2WVSA 3RCNA 2CESA 3CPUA 3WNKA 1UKTA 3LPGA 3L4ZA 3QGVA 1UKQA 4GZIA 1B90A 3DC0A 1UH4A 4L4OA 3WD0A 1CXKA 4P8WA 2A3BA 3UR8A 1ZBVA 4GI8A 1J0IA 2VC9A 3GXFA 4D6IA 4DUVA 2DPEA 2W61A 1E4MM 1QNPA 1KFWA 1WZLA 4W84A 3GXDA 4R5EA 1UR4A 1OM0A 1UHVA 5I79A 2G4FA 1NOWA 4H7VA 2ZXAA 2VX6A 4JFTA 4PMDA 3BAJA 1J10A 2WXDM 1E56A 4AEFA 2D24A 4GO8A 2CXGA 2E8YA 1GOQA 1H09A 3AS0A 4P8XA 2WSPA 4ACYA 3VUPA 1D7FA 4MAZA 4MB5A 1SMAA 1E0XA 4MB3A 4JL2A 2VZTA 3TTQA 1XYZA 1XD0A 2VVSA 1E6SM 4BA0A 4UFIA 2PWHA 3GM8A 1XCXA 3L4XA 1XV8A 1DTUA 3GH4A 1IV8A 2BY0A 4CKQA 1C8QA 1CGUA 4UQEA 3VGEA 1KQZA 4RL3A 3VIFA 4MAVA 1UZ4A 7A3HA 4DWSD 5EFFA 3WBEA 1J0YA 4RE3A 5KZ6A 2BS9A 4WLCA 3QR3A 4J7RA 3WUEA 4BQ2A 4JFSA 5A6AA 3ZR6A 2EQDA 1MFVA 2JF6A 4KRUA 1VB9A 5E0FA 4WK9A 4U31A 2YLAA 4KMQA 4GO9A 1UYQA 1BQCA 5DMYA 3AIEA 2OWXA 1QNQA 4U3AA 4AZGA 1QPKA 1CPUA 1JL8A 2BV9A 2YOCA 1HJSA 3B9DA 4ZXOA 2XG9A 4KWUA 4WSJA 1VBUA 4W7WA 4UCFA 3ZJ8A 1E43A 2CITA 4J3WA 5CPSA 5FD0A 3L4UA 4J3TA 4AW7A 4URIA 1C3FA 1FHDA 5FL1A 2PB1A 8A3HA 2X8RA 3ARXA 2GSJA 2JFEX 5A6BA 1UD8A 2D1ZA 3CBWA 4FLQA 3EBVA 1LQ0A 3FAWA 4HZ8A 2YA1A 1B3WA 1E0WA 5BYWA 3BAIA 3BMWA 1G0CA 1GORA 3VGFA 1BAGA 3RILA 4AEEA 1UH3A 3MKKA 3N15A 4HZ6A 1ISVA 2IXUA 4H41A 3UR7A 3ZJKA 1Q4NX 1XHGA 1UD2A 2VRJA 3AISA 2ZUSA 4TVUA 1PIFA 4JFVA 1K9EA 3KE0A 5I23A 2B31A 3FAXA 5A3HA 5FCZA 4QDMA 1FH7A 1HIZA 1ITXA 3W25A 3L4TA 1OBAA 2XM1A 5I3DA 1JIBA 3CZ8A 1UD4A 3AIQA 4NRRA 2YA0A 4KGJA 4A4AA 1EIBA 3N12A 1JZ3A 4JL1A 2W66A 2Z1KA 4E8DA 1W9PA 4PMYA 3F5KA 1HJXA 2WWDA 5C8BB 3RM8A 3EMCA 1NWRA 1PZ2A 4P7QA 3CMGA 1UZ1A 1E4NA 3M6DA 5IXEA 3GNPA 3GNOA 1W3KA 5HBFA 5D9OA 2J4GA 1E3XA 1JF6A 1LL4A 2VZUA 2Y8KA 1D3CA 2WMGA 2OYLA 1ISYA 3CHCA 4HA3A 3VX1A 2WK2A 3CZGA 4F8XA 2O9TA 3FHAA 2ZUTA 1V0MA 1GJWA 1LF1A 4PMQA 2CBIA 1E40A 5AC5A 3AXXA 4PCTA 5CSYA 4P7RA 4GI9A 4UNIA 1J0HA 1R87A 3ZSTA 1E6XM 1WPCA 2J79A 1D2KA 1QHPA 2WMHA 1IZKA 4YHGA 1MW3A 2GDUA 3BC9A 1GOIA 1VJZA 1BVZA 1HKIA 5A8MA 5EBAA 5CZKA 1GW1A 3VMNA 1GQKA 3W82A 1WAWA 4K68A 4UFKA 5DEZA 3ARVA 1ZBWA 2ZICA 5A6JA 1GQIA 1HX0A 2WKGA 4P7NA 3WD1A 4AD1A 4AD5A 5HPCA 4V27A 4J28A 2X0YA 2BNJA 4CD5A 3VIHA 1HKKA 3W28A 2X0HA 3PZMA 3VKKA 4LQ1A 1OGSA 3T2OA 3VM7A 4AD2A 3L4WA 3WDPP 2WHMA 1JZ5A 4RE4A 4BZYA 3EMZA 5BROA 5LA1A 4AIOA 1J9YA 5CGTA 5E0CA 2PWGA 3S2CA 1JNEA 3WNNA 2EPKX 4Z2HA 1H49A 1WDSA 3VX0A 1XYFA 1MWOA 3VIMA 5AY7A 1JXJA 3CZEA 1VIWA 3AHZA 1JYWA 1V0KA 1NWUA 2XWDA 5DF0A 1TA3A 1ZJAA 1UWUA 2J7CA 3ARTA 2VCCA 1GVYA 4Z2JA 3W38A 4BF7A 4U5KA 4F79A 5M5DA 1BGAA 1CXIA 1JDCA 2G41A 3QHOA 1NP0A 1GCYA 3PZGA 2EXOA 4KGLA 4CCDA 3WELA 4KRTA 2BY2A 1MQQA 2UY2A 5FIPA 3PZQA 2PF0A 4QCFA 1HNYA 3WEMA 5IHRA 3VMOA 2CBJA 3PTKA 2J77A 5DT5A 3MO4A 3UETA 3DHUA 4WSKA 1V6VA 1CGWA 2F61A 4AZBA 2JALA 2ZUUA 2J75A 3QHNA 5CPTA 5HNNA 3AS3A 3MUAA 3GH5A 1U33A 3ARPA 4JKLA 1F4AA 1C91A 3THDA 4TX6A 4F9DA 1H41A 3K46A 1V6YA 1MFUA 1V6XA 3VIPA 3U57A 3SEPA 1JG9A 1ZBKA 3SCVA 3VGDA 2YL5A 4W5ZA 1TVPA 2F8QA 5E70A 3SCNA 2WHLA 5KEZA 2X2YA 3WH9A 1DWFM 4YHEA 4H8VA 3N18A 3DECA 3SCRA 3UG5A 1QNRA 3MANA 3TOPA 4GXPA 3POCA 3DYMA 2WZEA 2GUYA 1HN1A 2WLYA 4Y7EA 5C71A 3W6LA 1GQJA 2GVYA 3WNPA 4PMVA 3O9NA 2C0HA 1EQCA 2V3EA 2CNCA 1CDGA 1UR9A 2PWDA 4ATLA 1M04A 1UOKA 4U33A 3U5YA 2JEQA 1EDQA 2XVPA 2X05A 3VD5A 1XRVA 2QHAA 2DQXA 4E8CA 2W63A 3ZSSA 2VNCA 4QLJA 1WP6A 2V38A 3O2LA 3VU2A 1VEMA 3ARRA 2X1IA 2OYKA 3WY1A 3ZJ6A 5I24A 1KQYA 4PCSA 3U7BA 3WUFA 1CZ1A 2XHYA 1WO2A 2IXVA 1NOUA 5BRQA 1WDRA 4JHOA 3VILA 3OZOA 3AJ7A 2XVKA 4HOWA 2VZOA 1Q6GA 1UUQA 3OIHA 7TAAA 1V02A 3WEOA 3HJEA 4U5IA 3WL1A 1S46A 3ZOAA 4AD0A 2PI6A 4HOZA 1JYVA 4P8VA 2WNWA 4AZHA 1Q6DA 3OB8A 4JIEA 2BVYA 1JNDA 1ZJBA 2DDXA 2O92A 3NDYA 4ATWA 1J01A 3VDCA 2XSAA 1BYAA 1F4HA 3W6MA 4DWSA 4CU6A 2XGBA 4PSPA 1VFFA 1UWSA 4HZ7A 4QLLA 1WDPA 4CD4A 1DWIM 4TX8A 3WENA 4NZCA 3WFLA 2WW5A 3GXIA 4YPJA 4WF7A 4JKMA 1NWSA 2J7GA 2VQUA 3DYOA 3T0AA 4W88A 3A6OA 3VNZA 2GK1B 1G5AA 2CBVA 3MMUA 1CGXA 2J62A 4M24A 5E6ZA 1JD9A 3ARWA 4AZCB 5D4YA 1JI2A 2IUZA 3EDKA 3K8KA 4ZE4A 1MW2A 4U2YA 1KBBA 4GI6A 1H0GA 2XFYA 3A4XA 1LG2A 3WF1A 4FMVA 4NF7A 4AZ6A 1YHTA 2JEPA 4AMCA 5CLTA 3OLIA 3NDZA 3CUJA 1U2YA 2XWEA 1JYNA 1HJQA 3AFBA 4QCEA 1JAEA 1GQLA 1OGBA 5ABFB 1CECA 1OINA 3PZ9A 4XV0A 3WH5A 3N04A 1JXKA 3GYCA 4E2OA 5BXSA 2WSKA 1ITCA 2XTKA 4MPKA 1EHAA 2ZOXA 4W85A 2WBKA 3FXYA 1HT6A 3CMJA 5A2CA 3N13A 2YBTA 1HJUA 5IHSA 2WHJA 2FHBA 2PWFA 4QAWA 1TCMA 1KGUA 2EPLX 1US2A 3WDQA 3ZM8A 3FW6A 3VVGA 5A94A 1MQRA 1TVNA 1RP9A 1J0KA 5AYIA 1KB3A 4CVWA 4H8UA 4UZUA 1KGXA 3VIOA 4CU7A 4B15A 2C8NA 2WPGA 2ZXBA 4FLSA 2J25A 2WC4A 3BXWA 4AD4A 3NSNA 2EJ1A 5FL0A 1UKPA 2ZIDA 3EDEA 3W27A 1I1XA 2O9PA 3GNRA 4W93A 2XIBA 3PHAA 1LL6A 4PUDA 4W87A 4UFMA 4HTYA 1CLVA 1K9TA 2Y8VA 1OWQA 3AS1A 2WCSA 5D8WA 3SCSA 3VD9A 1JF5A 1XH0A 3CUHA 4PTVA 1H0IA 1EDTA 1PEZA 2EO7A 3APGA 3VD4A 2WMJA 3IAPA 4TTUA 3PTQA 4NI3A 5JBEA 1EOKA 3IJ9A 1JD7A 2W62A 1Y7VA 3WQ8A 2FH8A 1B3XA 5EB8A 2WVVA 4IISA 2DT3A 1DWJM 1O7AA 1V3KA 1BPLB 1PX4A 1C7SA 1QBAA 2WHKA 4L4PA 4WJXA 3U7VA 2VX4A 3AZRA 3CTTA 2GJRA 3LMYA 3VM5A 3W81A 1E6PA 2GDVA 4UFHA 5DFAA 2BHYA 3K1DA 1V0NA 4OBSA 3T09A 3JUGA 3VIJA 3SCPA 3ZT6A 2CPUA 3T08A 1E70M 3WD4A 4M29A 4MB4A 5A6SA 1UD3A 4JKKA 1BHGA 1FA2A 1QOXA 5CQ1A 4D6CA 2NSXA 3MMDA 3WQVA 2UY3A 1H5VA 2WBGA 1TUXA 2GJXB 1UA3A 1LLOA 1HL9A 1X1NA 2O9RA 4N0RA 5E09A 4IPNB 1RP8A 1HP5A 3W37A 1E3ZA 3L2LA 2G3IA 3W0KA 1UR0A 1KXVA 3WNMA 4M82A 1BG9A 2WMIA 2G3MA 4CD6A 1JFHA 1WZAA 2V3DA 3L4VA 1OSEA 1YQ2A 1ISWA 2CHNA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UH2 A;  4AIS A;  3PBG A;  1BYD A;  2YA2 A;  1V6W A;  3SCT A;  2XM2 A;  3SIM A;  1W9B M;  1J18 A;  1MW0 A;  1VEN A;  2OYM A;  2EBN A;  1VEO A;  1H11 A;  1EHN A;  4AIU A;  1FOB A;  1JZ7 A;  1UQY A;  4HME A;  5A6B D;  5C70 A;  3SCQ A;  1QW9 A;  3GH7 A;  2DT2 A;  3AXI A;  1GVI A;  2DIE A;  2VCB A;  3ZMR A;  4PSR A;  1TMQ A;  3WSU A;  7CGT A;  1FH8 A;  2UWF A;  4W8L A;  4CCC A;  3VGB A;  1IZJ A;  5ECU A;  1VJS A;  3NSM A;  4RE2 A;  1QW8 A;  2YL8 A;  4TVC A;  1CIU A;  2JIW A;  2XGI A;  3PZT A;  5E9A A;  1E15 A;  2CKR A;  2JF7 A;  2DT1 A;  1XCW A;  1CGT A;  1O6I A;  2VI0 A;  2G3N A;  3WDI A;  1E55 A;  3KL5 A;  3SCW A;  4HPG A;  4UFJ A;  5JIP A;  3WDH A;  4C7F A;  4GQQ A;  2ZX5 A;  3AIC A;  1ISX A;  1OIM A;  2YL9 A;  3MUZ 1;  4TVD A;  1TG7 A;  2E4T A;  4HPH A;  2J78 A;  2E0P A;  2J8G A;  1QHZ A;  2QV4 A;  3RJX A;  1B3Y A;  1E6Z A;  3BGA A;  5A8Q A;  3OLE A;  2WMK A;  3PZI A;  3UCQ A;  1GOK A;  1QVB A;  4GZE A;  4AIE A;  4GKL A;  3UEQ A;  5GNZ A;  3T0B A;  1KCK A;  1LJY A;  5E6Y A;  2VMF A;  2D22 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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