1B57 | Genus

Total Genus 138

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	138
sequence length	358
structure length	346
Chain Sequence	SKIFDFVKPGVITGDDVQKVFQVAKENNFALPAVNCVGTDSINAVLETAAKVKAPVIVQFSNGGASFIAGKGVKSDVPQGAAILGAISGAHHVHQMAEHYGVPVILHTDHCAKKLLPWIDGLLDAGEKHFAATGKPLFSSHMIDLSEESLQENIEICSKYLERMSKIGMTLEIELGCTGGEELYTQPEDVDYAYTELSKISPRFTIAASFGNVHGVYKPGNVVLTPTILRDSQEYVSKKHNLPHNSLNFVFHGGSGSTAQEIKDSVSYGVVKMNIDTDTQWATWEGVLNYYKANEAYLQGQLGNPKGEDQPNKKYYDPRVWLRAGQTSMIARLEKAFQELNAIDVL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	PROTEIN (FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE II)
publication title	The crystal structure of Escherichia coli class II fructose-1, 6-bisphosphate aldolase in complex with phosphoglycolohydroxamate reveals details of mechanism and specificity. pubmed doi rcsb
source organism	Escherichia coli
total genus	138
structure length	346
sequence length	358
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	1999-01-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1b57A00

1E51A 4KFOA 4AF0A 3KVLA 4M7TA 5A8GA 4FEZA 4YMZA 4JEQA 3WJXA 3ATZA 3CPRA 4FNUA 1UJPA 2FPTA 3I65A 1GJPA 2YZRA 3O63A 3DKLA 1B57A 1PHQA 3W7RA 3INPA 4Z0JA 3PBYA 5DY2A 2E6FA 2TRSA 3NOEA 5I3FA 3P5ZA 5K9CA 3WK0A 4JY9A 4UTWA 3BLFA 4OT7A 3UWYA 4FNSA 1WBHA 4FNQA 4QAIA 4WOQA 2J9ZA 1TPEA 2QEZA 2Y88A 1LDCA 4FB7A 2BTMA 3NQFA 2VFGA 2V9DA 4GBUA 3NPXA 4UTTC 5CPMA 3DFOA 3NQAA 4GXMA 1B4KA 4UIOA 1X8FA 2OJPA 5CZ0A 1KFJA 1Q6QA 4NQ1A 2CFFA 2FIQA 4FX6M 1BWKA 2V2CA 1VGAA 1OFBA 5DLCA 4X22A 2ABAA 3GB6A 2ZA2A 4CNPA 4CCCA 1F05A 1Q6RA 2CLFA 4AMAA 3QSRA 2Q8LA 4JS3A 4OWGA 1CX9A 3QH2A 3DBPA 2Y85A 3ABQA 5E1QA 2EKCA 1OVDA 2YGYA 3FYPA 1Y0EA 5K2ZA 5FF0A 3ABRA 5HUPA 3WJZA 3PULA 4NUWA 2CZ5A 1ME7A 1BTMA 2P0OA 3WK1A 3L5MA 2HMCA 1EIXA 5F4WA 1OX4B 3FYOA 3BVJA 3NQEA 2G5WA 4O50A 5EPDA 1OG0A 1SO5A 3W71A 3PAJA 1Z42A 1EUAA 1ZFJA 3NL5A 2QCGA 1TTQA 2OCZA 1KM2A 2HTMA 3KVMA 2W6RA 3CQ0A 4O28A 5H2ZA 2GOUA 2QJHA 3QQ0A 2PRMA 1QDSA 3W1LA 1MEWA 3BLEA 3NQCA 2HS6A 3PSWA 1LOQA 1XBZA 4UFJA 1G4EA 3TROA 2OZ0A 4MLRA 3MP4A 3LRMA 2ZYFA 4QSHA 3LBMA 5LSMA 1SZFA 3EWZA 5DELA 3T55A 1NF0A 3LI1A 1UCWA 4R53A 4UTUA 4W9TA 5F4SA 5AB3A 1K7FA 3PSVA 4RV8A 1SZGA 4U28A 2R94A 2HS8A 1F5ZA 4Q4KA 4JTKA 4QISA 1CW2A 4GRSA 1JVNA 2YSWA 4O16A 4XTIA 4Y8FA 2Y7DA 2ZZ2A 8TIMA 4WQ6A 2XFWA 1PCWA 3TKFA 3L5AA 5FI8A 4O0ZA 3FOKA 4HPJA 1TQXA 2DU2A 1A5BA 4NJKA 3T4CA 1YDVA 3N73A 4NZFA 2EF9A 1GG1A 5ABTA 4ADUA 4X9SA 5HMSA 1MXSA 2ZRVA 3B03A 1EB3A 3SR7A 3PBUA 3LERA 1Q6OA 3HOJA 5LNRA 3HPXA 2Q3OA 3EWWA 3M1ZA 5D05A 3M16A 1U83A 2NXHA 4ZQMA 3S1WA 3NL6A 3P67A 1OX6A 3EWUA 2Y6ZA 2NWSA 3MWAA 1PHWA 1OK6A 4JX6A 2V81A 1SW7A 1U5JA 3LX9A 3GVGA 4LVAA 1KFEA 4M6PA 5KTLA 2Y70A 1DOSA 4I7VA 1G4TA 2E5DA 2QDGA 3LXCA 4FNRA 2C3ZA 3B8DA 3G1DA 3KXQA 3TMLA 1KM3A 3R89A 1D9EA 3E9AA 3OIXA 1TREA 2CU0A 3C2FA 4DPQA 4TMCA 3RLVA 3G1AA 3T78A 3PY2A 5K9XA 5D2VA 2NUYA 2ABBA 4UTMA 4XTDA 1KM1A 3SECA 1ICPA 2QF7A 1EWEA 4JD4A 1CI1A 4QJ1A 4XBKA 3U8GA 4JTJA 2OX1A 5HUOA 2H90A 3GXPA 1SO3A 4RX0A 5CSSA 1ZAHA 2RDTA 2H8ZA 3JRKA 1GTEA 1K03A 5AHLA 3GDLA 2GQ9A 1R46A 4XWUA 3FJLA 3KHJA 4I9AA 3DFPA 1VHNA 4N9CA 1MZHA 5DXXA 3O07A 1B9BA 4XUGA 3M5VA 4L4LA 2ZRUA 2OMAA 1VLIA 3W7OA 4JTSA 1O5XA 4IMFA 5D30A 3NL3A 4R34A 1J5TA 2CLHA 3P80A 1NF7A 2YDAA 3PG9A 5D33A 2TSYA 4O53A 1XUUA 3NEVA 3FJ6A 4CQ9A 3P81A 4DO4A 4IMCA 3RU6A 1ZAIA 1P1XA 3PBWA 2YCEA 2YXGA 2FJKA 4AEOA 2G97A 2J9XA 4UR7A 4JY8A 3CIWA 2A0NA 4K37A 3TR2A 1LP6A 3HG5A 2NXIA 3E0IA 3EX1A 3W7GA 5AHEA 2PCQA 2EGZA 3L5LA 2LLEA 2ALDA 3PBVA 5HR6A 1UB3A 4Q33A 2VFFA 4FNTA 3SGZA 2H8XA 3HPZA 5HJLA 3UXDA 3ZWTA 3ANYA 2QCDA 2E6AA 3W1XA 1T0OA 4QIUA 1GVSA 3G0SA 1LLWA 2ZA3A 5T26A 3QPZA 3BK0A 6TIMA 1W5QA 3DFQA 1OYCA 4A22A 3IV3A 3G1HA 4A21A 1AK5A 3P8JA 1KLZA 1H61A 4YL2A 4ZQNA 3TXVA 3P8IA 1YTKA 5F1VA 1LOLA 3BGJA 3P5YA 5HWNA 4GUIA 4N9BA 2C18A 2QKFA 3PS7A 3USBA 4RZ5A 2ZRYA 4LUJA 3R8RA 4HIBA 1FWRA 3B05A 4XQ6A 1OFAA 4YWIA 2QR6A 3PR2A 1GVFA 5FESA 3C52A 2CW6A 3IIXA 3W7HA 4IMGA 4WOZA 4P2VA 2WJZA 1EP3A 3MO7A 2BZNA 1SZNA 3EX4A 3LXBA 2A4AA 2QCFA 2VXNA 3TAOA 3W7QA 1QPRA 2B7OA 1O4UA 4WY0B 2GQAA 2XN2A 3B4UA 3S1XA 3W7LA 2QCNA 3BV4A 1MO0A 2QCLA 2RDUA 3G1FA 1GYNA 2VFIA 1P5BA 2OT0A 2WPBA 3GXTA 3GDMA 4Q32A 4U4MA 5E0KA 3EKZA 3OG3A 3W6YA 1TCDA 1R47A 1IGSA 1ZCOA 3L0GA 1HTIA 3DFNA 5CPOA 3HG4A 3HO8A 5AHIA 4RJEA 3M7WA 3M5XA 3QMTA 2CLEA 4RCXA 5L9FA 4ALDA 1EA0A 5AHFA 4KWVA 4O10A 1M7OA 3RK8A 5GVJA 1YXYA 4LW7A 4YXGA 1KM4A 1TYGA 1ME8A 1GT8A 2VEKA 4RXFA 3VI2A 1X1OA 3BARA 4ZQCA 1FCUA 4M6VA 2C16A 1UUOA 4O1BA 1IIGA 1GG0A 1VJIA 5C54A 1GZGA 1QAPA 5BMXA 1G6CA 5CZJA 1TPB1 4GUGA 3EWXA 4TIMA 4X3ZA 4BWLC 1M7PA 3B04A 4O0KA 5DCEA 4DBEA 1H62A 1DJNA 1GQNA 1OFEA 3STGA 3GZ3A 1H7PA 3T44A 3M5YA 1LLZA 3MJYA 3HBLA 2JGQA 3BW3A 1JR1A 2X2GA 4FO4A 3A23A 2A7PA 1DV7A 4HN4A 1ICQA 3ATYA 4E2DA 1FWTA 5KZEA 3LCGA 1JCXA 1KLYA 3W1TA 3VE7A 4I7UA 4A2RA 2PC4A 3I7QA 1XM3A 2ZZ6A 3MI6A 3C2VA 3VKJA 2A7NA 4EIVA 3KVKA 4IXHA 3SGUA 2CZEA 3A22A 4LV9A 1H7WA 3NM3A 4NVTA 4S2BA 2VOMA 1W37A 2AAMA 2ZDRA 3NZRA 3IIPA 2A6NA 4LWWA 1FWWA 5AC7A 1ME9A 5EYWA 3ABSA 4PL2A 5KINA 4O1CA 2NX3A 1RZMA 2ZRXA 3W7CA 3MP5A 1JUKA 2VEMA 3LCHA 3B0UX 3Q58A 4NZJA 3S5YA 2R14A 4AF0B 3I6RA 2BLEA 2YPIA 4AHPA 3I7RA 1A50A 5HWMA 2F7FA 3KOFA 3UYCA 4ZQOA 3W07A 4I7WA 1FDZA 3GNNA 3IEBA 4ZQPA 4BI7A 4NNCA 2CZDA 3E02A 4JTTA 1TRIA 1YDOA 4JXCA 1FX6A 3F03K 1DBTA 2ZQ0A 3UWUA 2ISWA 1LORA 2C19A 3LLDA 3FEMA 1PL9A 1TPDA 3C56A 3GDRA 4XKYA 5D2TA 2GJNA 4O4WA 4M19A 2RHGA 3TXZA 2E77A 5LKYA 1WQ5A 1KM5A 4UFLA 3KRSA 1T96A 1LRNA 4QNEA 3MYOA 3QZEA 2JKAA 4MJZA 1RQEA 3WJYA 2NUWA 2C6QA 4O52A 5K3VA 5G1TA 2FPYA 2Y61A 2YX0A 3C2EA 3O15A 1K8YA 1SFJA 5A5WA 3N14A 5CZTA 3QSTA 2VEIA 5G2WA 5MHBA 1XFBA 4UMBA 1PV8A 1NVMA 3QPYA 2RH9A 4O17A 5G1YA 1FDYA 4UTIA 1XCFA 2ZZ5A 2WO5A 3L68A 3TCEA 3IRDA 4NJGA 1UBSA 5KZMA 3SI9A 3DH7A 1QPQA 2A7RA 1SUXA 1GTHA 3VE9A 4KFNA 1QOQA 3W1NA 2Y62A 4JICA 2D73A 2BX7A 3G1VA 1KV5A 4MY9A 5KITA 4GE8A 2X1RA 3O8AA 3HPSA 1F6PA 1EX5A 3C6CA 4UFIA 2X1UA 1FDJA 2DZSA 1LYXA 1OFPA 1QCWA 4RZ4A 3RF9A 4X2RA 5G4EA 3CU2A 3LCFA 3L67A 1MSSA 2ATMA 3F4WA 1ZALA 3G0XA 3LOTA 1NFBA 1THFD 5K4XA 1H1YA 5U4NA 2H6RA 3DU0A 4H4IA 3LCWA 3THAA 1H7OA 5F1UA 1ALDA 3NR0A 1G67A 2DJXA 4LT9A 1G4PA 4KKXA 3NGJA 1EP1A 3HG3A 1BKSA 3NVTA 3KAOA 2ZBTA 3C4UA 1GVRA 4A29A 1WV2A 2VFHA 4JX5A 4TR9A 2X16A 3NPUA 4RKAA 4OE7A 3W1RA 1SFLA 2RKXA 5EBUA 3U2OA 3W3OA 4Y6GA 1S5TA 3GDTA 3NXFA 1ONRA 1IXNA 5D2WA 1K8ZA 4IMEA 1XBVA 1I8JA 4G1KA 4JTLA 2WNNA 3PB0A 1QNVA 1KFCA 4FX7A 4DELA 5LNSA 4ORIA 4M7SA 3UY7A 3MBDA 4B5NA 1G69A 2CLIA 3IGXA 2WQPA 3SSJA 2WKJA 4LNYA 1R2RA 1Q3NA 2Z1BA 1S5VA 1AL8A 3W2UA 1V5XA 4YCOA 2NX1A 4O1AA 4UFHA 4H6KA 4MFEA 1RPXA 3N9SA 4WX2A 1SW3A 5E93A 4OV9A 3NNTA 5CG7A 4DEFA 2ZA1A 2CZFA 2NUXA 4IWWA 4UNLA 3S1VA 4K38A 2Z6JA 4NXKA 1KV8A 4RLIA 3DHFA 1XKYA 3NQDA 3HQ1A 3TH6A 1YTEA 3HGJA 1GVOA 3P61A 2EAWA 4MVAA 1I45A 1QMLA 2VENA 4KFPA 5HINA 3ZWSA 2QUVA 4Y9AA 3CEUA 3C2OA 5IM51 1WOAA 1LBMA 1T8XA 3GK0A 1IF2A 2JBMA 3LI0A 3S1UA 4MPQA 4JIPA 1VYPX 4L4MA 5F4XA 4UXDA 3GAYA 1S5WA 1WA3A 3M43A 4LY8A 3W75A 2VEPA 1C9DA 4FXRA 4UUIA 5D03A 2A85A 1TQJA 3LLFA 5CGQA 2QJIA 2VFEA 3H54A 2V0TA 2B7NA 1OFDA 2A6LA 1MEIA 3O06A 1K02A 3GYEA 4JYEA 3W7IA 1TPUA 2VC6A 5LGXA 4AHQA 1PVNA 4O12A 4IMDA 3MI2A 1IIHA 3A9IA 3M6YA 1J4EA 1XBYA 3R5EA 4DPPA 2DZUA 3W87A 3G22A 1W31A 3MMTA 1Z48A 4Z0SA 3HGRA 3TJLA 3QMSA 1IXPA 3CLMA 2WV8A 3C61A 4HSOA 1O60A 3FS2A 2QAPA 2WNZA 3M41A 2RDWA 2ATSA 4E2BA 3FA5A 1K8XA 3GLCA 4A2SA 3SJ3A 1VCGA 4UC5A 2NLIA 2Y7FA 4O57A 4LV4A 1XBXA 3P74A 4ZQRA 5HULA 3UPBA 4IQLA 4N02A 4O13A 5DBTA 4NJJA 2TPSA 1GVQA 3DZ1A 3P84A 2V8ZA 3UZJA 4RR4A 1H1ZA 1TJRA 4IPJA 1WDWA 4ZMGA 3UD6A 3W72A 1AW5A 1KFBA 5D32A 2DP3A 1JCYA 2FDSA 3LM7A 3TDFA 5IBXC 2J24A 1KBIA 1KM6A 2O7QA 2I1OA 3C2RA 3IVTA 1SO4A 2FB3A 4QQ3A 1XXXA 4JDYA 3NO5A 2A21A 1TRDA 3STFA 4BF9A 1FY6A 5TIMA 2VFDA 1UUMA 4K8HA 1YXDA 1I2RA 3OHIA 2GPTA 1N8FA 1W3IA 3O16A 3H55A 5EL1A 1HFBA 4ONVA 5C55A 3LHYA 1IXQA 2E09A 1J2WA 1H7XA 2JKEA 2NWRA 3OBKA 3MHGA 3N3MA 3EWBX 4N9EA 4K8EA 3M47A 1HO4A 2DORA 1YYAA 1I2OA 4TMBA 5L6UA 1P0KA 3LTYA 3M44A 4AWTA 5TQLA 4JX4A 1VZWA 4UCGA 1XDMA 2V82A 1TPFA 2X1SA 2YFNA 2NZLA 1WX0A 2PE4A 1KM0A 3MHFA 4OV4A 3W1MA 4O11A 3HG2A 1OHLA 3NYZA 3A5FA 1F2JA 3S5OA 5U7SA 1VC4A 2V2HA 2FFCA 3UWQA 1RQHA 3DI0A 3OA3A 3BLIA 4PODA 1M5WA 1H5YA 4FHAA 1P4CA 3OVQA 4OHQA 3NDOA 4A3UA 2Q8ZA 4AVFA 4HNUA 1TTJA 1H60A 3OVRA 1W5OA 3LGEA 2AGKA 1IXOA 2XN1A 4NNAA 3QFEA 3MBFA 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2FB2A 5F2GA 1TTPA 2Z2UA 1YXCA 2WSRA 1P0NA 1EEPA 4AAJA 4GFSA 4XKYB 1FCVA 4PCFA 1VLWA 1OJXA 5KZDA 1TPH1 1OF6A 3TQVA 1W8SA 3WK2A 3TJXA 2I14A 1FCQA 1QPNA 1OABA 3W83A 4K36A 3UPWA 3PVFA 3NQMA 4POCA 3BW2A 3S6DA 1L2UA 4UFKA 5G2HA 3TK7A 1EWDA 3KFTA 3L2IA 2B7QA 4HHPA 1WAUA 4IGHA 4J9JA 1I2NA 1LROA 1OFQA 3NA8A 7TIMA 3EXRA 2YYTA 4AHOA 5CZSA 2QCEA 3NQVA 4GUFA 1LZOA 2KZHA 4ADSA 4KWWA 4K7VA 1VS1A 3QMRA 5FF7A 3L65A 4C1KA 2H3BA 1ADOA 5KMYA 1K7EA 3GX9A 4JTUA 4HPXA 2ZZ1A 4AXKA 4JGDA 3I7SA 1DVJA 4IOTA 1C8VA 1PE1A 1W5PA 1RD5A 2NV2A 1X7FA 1R2SA 2I9EA 2BSLA 3LB0A 5BNKA 4TU1A 5I3GA 1TV8A 4FX8A 1FUYA 3DAQA 4UTHA 2CLMA 4WUIA 2WSYA 4UNKA 2GQ8A 3O6YX 1W3TA 4O8RA 3STCA 4FF7A 3O1NA 3EX6A 2JK2A 2PRHA 3CC1A 5F2IA 5HR7A 3SW6A 1HG3A 4AB4A 2FTPA 4RZ6A 1O5KA 3G3MA 1K7XA 1KFLA 3U6WA 1TMHA 3NM1A 1Z41A 4MZYA 3W7KA 2ZRZA 3NG3A 1VRDA 4JR5A 4LS1A 1W54A 3GXNA 3CIXA 5AHMA 4Y96A 2E6DA 4MFDA 3NZ1A 2YW4A 5LGZA 1OFOA 3RLUA 3FKKA 1DKWA 2ISSA 4IX0A 4H3DA 3O6CA 3LHVA 2FPVA 3W23A 3LCIA 5D09A 4WXYA 4MKNA 3MHUA 1K3UA 3VCRA 3LRKA 4BK9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1B57A

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