1BEUA

Trp synthase (d60n-ipp-ser) with k+
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
268
structure length
253
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLANGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cryocrystallography and microspectrophotometry of a mutant (alpha D60N) tryptophan synthase alpha 2 beta 2 complex reveals allosteric roles of alpha Asp60.
pubmed doi rcsb
molecule tags Carbon-oxygen lyase
source organism Salmonella typhimurium
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE
total genus 98
structure length 253
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 1998-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1beuA00
2I1OA 4JTFA 4K37A 5AN7A 3G18A 2VFIA 2JKEA 1QNVA 4JX4A 4AB4A 1LBLA 1M6JA 1VHNA 1P4CA 1VZWA 3MHFA 2WQPA 3MHGA 5AC6A 1DKWA 3W7LA 3M5XA 4R7JA 3CQ0A 3L5AA 3UYCA 1HL2A 3KVLA 4EWND 4OE7A 3W70A 3NM3A 1H7PA 3BVJA 5HUPA 3W1TA 1KM0A 5KZDA 1IIGA 1C8VA 4MYAA 4QISA 3G0SA 4EF8A 1T8XA 2VFGA 5EL1A 4XZ9A 1DBTA 3GVGA 3UWUA 1RQBA 3JR2A 4AHOA 2F84A 3HIJA 2RDWA 1WXJA 1S5WA 1W54A 4WY0B 4QSHA 1ML1A 3UWYA 5LGZA 3PSWA 5D09A 5AYYA 2X1RA 2VKZG 4FXSA 3L0NA 1PHQA 2A5HA 3KOFA 3NQ7A 5G5IA 5DBTA 3IRDA 5C2XA 2C13A 2ZRYA 3I7RA 2ZA3A 4YMZA 3G1HA 1LBFA 3W7RA 5ABTA 4LVBA 2AAMA 2J9YA 4ADTA 2RFGA 3NPVA 4LU0A 5CGQA 4X2RA 1QOPA 1LZOA 1SZNA 3MI6A 1W5MA 1W8SA 5EMUA 2BWGA 4YCPA 2EHHA 2ZQ0A 3M9YA 1G7UA 1WOAA 3DKJA 2CLIA 4HHPA 2A21A 4O54A 4OBTA 3W3OA 3I68A 1VGAA 1FWNA 2OJPA 3W7DA 3GDLA 4M19A 2WNZA 1ONRA 1EIXA 1TPB1 4FIQA 3SI9A 1VYSX 4BWLC 1FWRA 3IIZA 3BG9A 5HUOA 4FNRA 4L4MA 1LCOA 5F2MA 2ZYFA 1F73A 4PA8A 1DVJA 1XBZA 2RH9A 3LCHA 1I2NA 5F4XA 4IMDA 3E9AA 4NNBA 8TIMA 1B9BA 1HO4A 3O6YX 1VCVA 2WNQA 4K8HA 4O14A 3FFSA 5D04C 4MPQA 3G0XA 1SO4A 4XWUA 1M7PA 2NXIA 4K36A 1Q6RA 1W5QA 2X30A 5FEWA 3T78A 3W22A 3EB2A 4TMBA 3HGRA 2Q8ZA 2OMAA 5D33A 2R14A 2QEZA 1B57A 4BI7A 2BZNA 2CZFA 3EX4A 4LV4A 4UNLA 3GK0A 3NNTA 3FA5A 5H91A 2CW6A 5CPOA 1KV5A 1JCLA 3KVKA 2B7OA 1AL7A 5I3IA 3W2LA 4O28A 3GAKA 4ORIA 4YWIA 2JK2A 3HBLA 3FKRA 2Y88A 2NUYA 5DY3A 4X9SA 4O11A 4UTIA 3LCGA 5KTLA 2KZHA 4GUIA 3TJLA 3FIGA 3IIVA 4PEKA 4LT9A 4CNOA 2CZEA 2VELA 3HGOA 3LCIA 3UWQA 2YZRA 2UV8G 2Y70A 3TW6A 1THFD 3CM4A 3TE9A 1MEWA 4WZHA 4BF9A 4RR4A 3W73A 1TTPA 4C1LA 3SECA 1LBMA 2Q3RA 4UCGA 4AWUA 2J88A 4O4VA 3YPIA 4IJBA 4O53A 2QCNA 2BSLA 5FF2A 3W1PA 1TPC1 2NV2A 2ZFAA 1ME7A 3QMRA 1RVGA 3W7NA 3UQNA 3NQ6A 4UMCA 3HGJA 3U2OA 2DORA 5CPLA 4NJHA 4XUGA 3QFEA 3U8GA 1YTDA 1ZALA 4GUJA 1Z41A 5A8GA 1GG1A 2ZA1A 2ZRUA 1OYAA 3UXAA 3GLCA 5G2IA 3LCWA 4UFJA 3TXVA 1IIHA 3P7YA 1YLVA 3LHTA 2WOQA 4O1DA 1T99A 5AYZA 3UWZA 4JYFA 4ICNA 5J5RA 1DQWA 2QAPA 3KRSA 3R13A 3GB6A 4LY8A 3NG3A 3TXZA 4LC6A 1F5ZA 2GQ8A 3M7WA 3G22A 3PSVA 2ISSA 1SW0A 3DENA 3MP3A 3N2MA 1H5YA 3CIWA 2Y7DA 4LW7A 1L6SA 3EX2A 1OYCA 2NV1A 3SZ8A 3W7KA 4KWVA 3NA8A 2PCQA 3CEUA 3GKFA 3NXFA 3O16A 2YCEA 3N19B 5DCEA 4DF1A 3GZ3A 4Y96A 5EKYA 1VYRA 3VNDA 3LHVA 1H62A 4QITA 3W1UA 3S9YA 4A22A 4M7SA 3R5EA 4WD0A 3VFLA 2E5BA 4Z08A 3CWNA 4MZYA 1FY6A 4FIRA 4O50A 1KFJA 4JR5A 1KM2A 2XFWA 5K7JA 5TIMA 4KWWA 1F74A 2OT0A 5F2LA 4I9AA 3W2NA 1X1ZA 3LOTA 3W88A 4Q4KA 1XCFA 3MJYA 5F2IA 4O1BA 2E6AA 3G1FA 3BLFA 3LRKA 5HMSA 3WJSA 4TX9A 1EWEA 5HINA 1HG3A 2QCMA 3C0JA 1DOSA 4YLWA 3W74A 2QCDB 3IVUA 3H54A 4M6QA 3LHYA 1X6UA 5EPDA 2G5WA 3WFAA 4HPJA 3PBWA 5AYXA 4BFAA 3I7SA 5A5WA 5KZMA 3EXTA 3SY5A 5KITA 3LRLA 1KM6A 3QPYA 1O5XA 3R89A 4D2JA 1S3HA 5F4SA 3C2RA 4LRTA 2EGZA 3W7MA 2YX0A 4FX8A 1K8XA 1VS1A 3FKKA 3I7QA 3TMLA 3PUDA 1JQXA 3RK8A 4NU7A 4UFMA 1H1YA 3GNDA 4IMGA 4LS0A 4ML9A 2GVGA 4LNYA 5D03A 1PE1A 5FF3A 4MFEA 1CX9A 3KVMA 3PUOA 1OFQA 3P5YA 5D2XA 5LKYA 2QCHA 2VC6A 4AHPA 1UUMA 1TPH1 5FEXA 3I65A 1XBYA 1Q3NA 3W75A 3Q2DA 4JS3A 3HJZA 3MBDA 3T4CA 4JTUA 4UC5A 5U7SA 1TSIA 4XKYA 1I45A 3K30A 4N4PA 3STCA 2X1TA 1O94A 2V2CA 1R47A 4O8RA 4RXGA 4OT7A 3P5ZA 4HSOA 3MI3A 1EP2A 1EX5A 4OU1A 3MO7A 2EF9A 3EWUA 1WQ5A 4CCEA 2Z2UA 4DBDA 5EYWA 4WQ6A 3BG3A 4IMFA 4MLRA 1SZFA 1MEHA 4AHQA 4PCFA 5DY2A 5G4WA 4FF7A 2O7QA 3PY2A 1KFEA 1SR9A 2J9ZA 3O8AA 1RQHA 3N14A 4MIMA 3VE9A 1FCVA 1KBIA 1DL3A 1OFDA 3NPXA 1KTBA 1UB3A 1EA0A 3L2IA 2JBMA 4N6FA 3SR7A 2ABAA 3IEBA 3TFCA 2YFOA 2GVJA 1T96A 5E1QA 3LB0A 1IXQA 3UY8A 4UTHA 3M47A 2FFCA 4O10A 1N55A 4MJMA 5CZ0A 2ISWA 3TC6A 3NQ8A 1L2UA 1FQ0A 1UCWA 2B7QA 2QJIA 3EX3A 1VCFA 3LERA 3LCXA 3UWWA 1QPQA 4JX6A 4O0ZA 1UJPA 3CU2A 3W7OA 2JKAA 4WOQA 3FYPA 3O05A 1SW7A 2HS6A 3I6RA 1FDJA 5BMXA 3A9IA 5HJLA 4JIQA 2ZZ3A 5F2GA 2Y7GA 3L66A 5LSMA 3V75A 4C1KA 1NF0A 3O06A 1L6YA 2ZRZA 4A2SA 1MO0A 2CFFA 2XN2A 5DELA 2NWSA 3V1PA 3W7QA 2Y62A 1G67A 3NQGA 4IQLA 3TIMA 4OGZA 5HR6A 1ZHAA 4ZQNA 2X1SA 1RQEA 4O57A 3FJ6A 1G4TA 4JTEA 1WV2A 2C1HA 1I2OA 1TPVA 3CHVA 5K4ZA 1VHCA 4JD4A 4CNNA 1GZGA 5U4NA 3W7EA 3TFXA 1H7OA 5BW6A 3O07A 1BKSA 3NQDA 2I9EA 3PB2A 2YDAA 1E51A 1PIIA 1KTNA 1LROA 1A50A 4MLJA 2FPVA 2DZTA 1OJXA 1XL9A 4H3DA 1HO1A 4Z1DA 3STGA 3WJZA 2ZTJA 3GR7A 2B4GA 3A22A 2EKCA 2Y7EA 1FX6A 1WX0A 4JTSA 2YFNA 3OIXA 3IGSA 3P8IA 3PBYA 4QJ1A 1LLWA 2QDGA 2VENA 4O15A 1OFRA 3UY7A 2CWNA 1K7XA 2GQAA 4JYDA 1XI3A 2ABBA 3CC1A 5K9DA 1PVNA 1WYIA 1Y0EA 4NUWA 3N9RA 3Q58A 4QQ3A 3BLEA 5LNUA 1FWSA 1KFKA 2CLMA 1R2SA 4L4LA 4N2YA 1FDZA 1PHWA 1FUYA 3L68A 3CWOX 2CLFA 2NX9A 5K4XA 3W1MA 4IPIA 5D30A 2E77A 3Q94A 3QW4B 5LNSA 3R12A 3F03K 3DFSA 3P67A 4A2RA 1LRTA 1IGSA 3IIPA 1W1ZA 3UPWA 2A6LA 1W37A 1DORA 5HWJA 1WA3A 1H7XA 1SPQA 3G8RA 4LUIA 1G7VA 3IVSA 3PM6A 1X8FA 1W31A 2VFHA 3WJYA 4HIBA 3NPUA 4MY8A 5I3JA 4ALDA 4QAIA 3O63A 4JY9A 3ZFHA 3W7CA 1XDMA 1ZAHA 1TQJA 4IWWA 5AHMA 2ZDRA 4FO4A 3WK3A 4UMBA 3W7HA 2ZCGA 3PAJA 4DELA 2FQIA 5CG7A 4DPQA 3QSRA 3H55A 4WX2A 4LRSA 1QPRA 3QF0A 3KHJA 1MXSA 4GBUA 5LNRA 2TRSA 2V82A 1BWKA 2P10A 2FB3A 3E12A 4O0KA 5AC7A 3NGJA 4NT0A 5LZLA 3SGUA 3M5ZA 4QNEA 4WY0A 1P1XA 1SQ7A 1OG0A 1VYPX 3HG3A 3BPWA 2Q8LA 5I3HA 1JULA 4EF9A 1QAPA 4G1KA 1R2TA 3TCEA 4OWGA 4Q32A 1GQNA 1FCUA 1KM4A 2ALDA 3AO0A 3GX9A 4KFOA 1KW1A 3RMJA 1C29A 1F2JA 4PH6A 1JUBA 3S5OA 2P0OA 1V7YA 5CPNA 1KV8A 2HMCA 1K03A 5C5YA 1C9DA 3NQVA 4RX0A 5C55A 2E6DA 1WDWA 3NZRA 6ALDA 1XBVA 1GYNA 1K02A 2C16A 1QPOA 4WUIA 1UASA 2RKXA 3L21A 2CU0A 4IPJA 4ZQOA 2FPTA 3W71A 5D2YA 2C0AA 1DJQA 1VLIA 3W86A 3JRKA 3HPSA 3W76A 1YTEA 2QCCA 1SSGA 4HKPA 2Z1BA 4IMCA 3TKFA 2WSYA 2A1YA 4CQ9A 1SU5A 1KA9F 1ME9A 3W7GA 4FX7A 4MZ8A 3TSDA 3C52A 4XBKA 3W2KA 2YYTA 2Y63A 3NYZA 3PR2A 3QRHA 4W9TA 3QEZA 3MBFA 3NO5A 2X1UA 4DEFA 2OT1A 3DAQA 3ZWTA 3FYOA 1FWWA 4ZQCA 1FCQA 3CTLA 3IGXA 2FPYA 3WK0A 4DF2A 2ZZ1A 4CCDA 2WV8A 2YR1A 3STEA 1GT8A 3UD6A 2B7PA 2QDHA 3DBPA 4JYEA 4JTGA 1I2PA 3EWBX 3UZ5A 1CW2A 3DZ1A 4ADSA 1VR6A 3G1YA 3W85A 3NL6A 5G2WA 4MOZA 4ONVA 1NFBA 4FB7A 2GVLA 1KBJA 3R2GA 2WKJA 1OF8A 5TQLA 3OVPA 2W6RA 4YL2A 1MZHA 2YPIA 3BW4A 1L6WA 4BWLA 1TTIA 3EX1A 1NF7A 1FWTA 3FJLA 3IV3A 3UPBA 3TAOA 3HOJA 1PCWA 4GUFA 2CLKA 3AJXA 3W1RA 3T55A 2DU2A 1ZAJA 2P1FA 4XTDA 4Z0SA 1TREA 2CZ5A 2W0UA 1EEPA 3L0KA 1X1OA 1QO2A 2QCLA 4E38A 3T40A 4OQVA 3W72A 4K39A 3W1LA 1Z44A 3MW7A 4M6VA 3MHUA 4GUGA 3G1VA 2GQ9A 1JCXA 3RLUA 3HG2A 5SWUA 1LRNA 1FBAA 3BW3A 3PVFA 3ABQA 1OYBA 3N3MA 1YDNA 1S5VA 5CZSA 4BI6A 1YYAA 3M41A 3PS7A 1TJRA 1GWJA 3NL3A 4HPXA 4UXDA 5G2HA 4AVFA 1UBSA 2WSRA 2QF7A 3G8EA 5CPMA 5G1YA 1LORA 1AK5A 4JDBA 3NVTA 5MHBA 4UFKA 1G69A 2V5LA 4JIPA 3C61A 1TRIA 1P0KA 1V5XA 1RPXA 2A7RA 3PB0A 7TIMA 2H90A 4WY0F 1TPWA 4A29A 2PC4A 4DO5A 4CNPA 2YW4A 3HQ1A 3E96A 4TU1A 5AHFA 1P0NA 1PL9A 4CQAA 1SW3A 3TSMA 2ZRVA 4Q33A 1GYLA 2YGYA 3QPZA 3THQA 4MY1A 1VC4A 5DCBA 5E0KA 2WO5A 1GVSA 3OBKA 3QC3A 1HFBA 1JCJA 1AG1O 3FLUA 3LV5A 4RZ6A 1R2RA 1K7FA 1PV8A 1A5SA 4YCOA 4FXRA 5AHEA 5KINA 3IVTA 5CZJA 4Y9AA 3GXPA 3LXCA 2GJLA 2PE4A 5DCDA 3NZ1A 3NM1A 5K3VA 3M6YA 4BK9A 1Q6LA 3EWWA 1GG0A 3ELFA 3KXQA 3W2JA 4LS2A 4ZL1A 1TYGA 2Y7FA 3TA6A 4AXKA 1IF2A 3S8HA 3BGJA 2Q3OA 1TPEA 1I4NA 3HGSA 1VCGA 4K8EA 1DQXA 1TIMA 1XFBA 2FJKA 4K6AA 1KLZA 3MWAA 4JEQA 1QWGA 4NJKA 3STFA 3T44A 2TYSA 3MP5A 3DXIA 2A4AA 2IQTA 3TDFA 3PWAA 3CB8A 4JTLA 1BEUA 4ZQRA 2V9DA 3QJAA 3NQFA 3G1DA 3G3MA 5DXYA 4O19A 3OVRA 3W2UA 4N9BA 4RXFA 3WJXA 3PBUA 1JCMP 1DV7A 1WBHA 2C19A 3W23A 2E1DA 4O13A 1RV8A 2EPHA 1XM3A 1YXDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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