1C8VA

Crystal structure of the complex of bacterial tryptophan synthase with the transition state analogue inhibitor 4-(2-hydroxyphenylthio)-butylphosphonic acid
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
266
structure length
264
Chain Sequence
ERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystallographic studies of phosphonate-based alpha-reaction transition-state analogues complexed to tryptophan synthase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE; ALPHA CHAIN
total genus 99
structure length 264
sequence length 266
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 1999-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1c8vA00
2VELA 3W7OA 2QDHA 4UNKA 4NZJA 2ZZ6A 2GJNA 2NXHA 3DFTA 3LHVA 3IVSA 1KM3A 4UTKA 4BF9A 1I2OA 1XBVA 4RZ5A 2NUYA 3W1NA 6ALDA 2QUTA 3GDTA 1H62A 3E9AA 4G1KA 2H8XA 5KITA 1JUBA 3FOKA 3NDOA 4X3ZA 1M6JA 3Q2DA 4GJ1A 3LOTA 1QNVA 3PUOA 3W7NA 1KTNA 3LCXA 1TV5A 4DO5A 5CPOA 4N4QA 4IGHA 3GKFA 1FDZA 1G69A 2Y6ZA 4UMCA 1SFLA 1FQ0A 3TU9A 2OMAA 3GB6A 2E6YA 4UFMA 3LDVA 2WJZA 3GDMA 5AOUA 1O5XA 5LNWA 4BFAA 1XBZA 5BRBA 2GQ8A 1FWWA 4GUHA 2A7PA 3NO5A 3IRDA 3QPZA 2E77A 3OVRA 1P5BA 1W3IA 5BOOA 2Z6JA 5E93A 1NFBA 4FNUA 3LV5A 3LI0A 1A5SA 1F5ZA 4ZQCA 3DI0A 4K36A 1K7EA 3G3DA 4XWUA 3IEBA 4LNYA 1GYLA 2TSYA 3MP4A 1VGAA 4UUIA 3M5XA 5HJLA 3P67A 3W76A 3W86A 4ORMA 1NEYA 3OA3A 3NQMA 4MZ1A 4GUJA 1TPWA 4WX2A 1OX4B 5HULA 3P8IA 4I7VA 4MKNA 2HSAA 1W3NA 1J5TA 2VEPA 1DBTA 4RXFA 4MY1A 3KX6A 4JTGA 3S1UA 3HG2A 1MEHA 5AB3A 1WBHA 4CLMA 2EAWA 4AF0B 3LBMA 4GBUA 4O54A 4TMBA 5FEPA 3P8JA 4B5NA 3W7MA 3CU2A 5D02A 4W9TA 4UTUA 1ME8A 1H50A 4ICNA 2FDSA 2YX0A 3F4NA 4JS3A 1S3HA 2RDTA 3C8FA 2NV2A 5DBUA 1QCWA 3WK1A 1GJPA 4DPQA 3H53A 5EBUA 5I3HA 3G1XA 3PY2A 3NGJA 2X1TA 3TMQA 3EB2A 5AYXA 3IGSA 3UD6A 1BTMA 4BI7A 4IXHA 1UUOA 2QJHA 4ZQPA 3V75A 2FFCA 3W1QA 3NEVA 3HBLA 3PF3A 4YMZA 4OU1A 2FJKA 3CB8A 5K3VA 3U2OA 4WZHA 1G6CA 1GT8A 3FS2A 3TSMA 1N8FA 2A2IA 1ML1A 1W56A 3GNNA 3G8EA 1I2PA 4N9DA 1IXQA 3LX9A 5E0KA 4IXXA 1UJPA 1ZENA 3ZR4A 3LTYA 3W84A 4Z0JA 1TSIA 1LLWA 5LSMA 1I45A 5HR6A 2HS6A 3NZ1A 4A22A 3O6CA 5C54A 4DPPA 2ZZ3A 3M6YA 2FTPA 2BLEA 3HPSA 5I3IA 3GIYA 2C15A 1L9WA 3G8RA 5LNSA 1F7BA 1QPNA 3A5VA 4MLRA 3M16A 3DFQA 3PSWA 4O0KA 3W7RA 5L9FA 3NQAA 3P5YA 1LOLA 4DBDA 4QAIA 1WOBA 5D37A 1ME7A 1ONRA 3HPXA 3MWAA 1ICPA 5F4SA 4HN4A 1A5CA 3SIZA 3PG9A 3TW6A 4EOUA 4AAJA 3FFSA 3GR7A 5F2GA 1O95A 3ABSA 2YFOA 5AYYA 1M7OA 1R47A 4NNAA 1H7RA 4IMGA 2FPTA 3NA8A 3W2MA 3C52A 3LHTA 1V7YA 3MP3A 1W3TA 2QJIA 5MHBA 3MMTA 3LGEA 4Z1AA 3FJ6A 1R2RA 3TXVA 3T4CA 1R2TA 4JD4A 3W7CA 1OX5A 4FB7A 1VS1A 1BWLA 1SQ7A 1FCUA 3W07A 1ZAIA 1PHQA 3WK2A 3B0UX 4FNPA 1SUXA 4JTTA 4C1KA 2YW3A 4Y9AA 3UY8A 3L67A 3NQGA 2TMDA 3UZJA 1DJQA 2DP3A 2CWNA 4HNNA 4ZZ9A 3NOEA 4K37A 5D03A 2C19A 1O5KA 3C2OA 2E6AA 1YYAA 1JR1A 2Y88A 1MSSA 1LBMA 1AK5A 3OG3A 5K9DA 3AO0A 2Y7EA 5D04C 4TMCA 4TO8A 3LTPA 2YR1A 2V30A 4E2BA 3ABOA 1TPUA 1ZY9A 3HGOA 4RZ6A 4NX5A 5LKYA 2Y85A 4AHQA 4PEKA 5KZMA 3TW7A 1GTEA 1XL9A 2GOUA 5I3JA 1T0OA 3LRKA 1F05A 3DAQA 2W6RA 1W54A 1AG1O 3UZ5A 4UFLA 3G18A 1SU5A 4WXZA 1EWDA 3Q94A 1TJPA 1JCNA 2NV1A 4S2CA 4MJZA 1EPXA 1XUZA 3BLIA 2V82A 3H55A 4NJHA 1AL7A 1VJIA 1JQXA 3W2JA 5IBXA 3S6DA 2TPSA 3E12A 1FCVA 5DY2A 2VC6A 1XBYA 5G2WA 1HO1A 4YXGA 4O4VA 3VNDA 5LNUA 1F6KA 1QO2A 4MYAA 1ZAHA 2Y7GA 3PB2A 3WJXA 2CU0A 1OX6A 3H54A 3C2RA 4Z1DA 1IXOA 4MFDA 2FB2A 2ISSA 3NL5A 1D3HA 1QOPA 3JS3A 2EKCA 1W5QA 3QFEA 4RZ4A 3O1NA 4UMBA 3EX6A 5L6UA 4MUZA 4OV9A 3KHJA 5CZTA 5F2LA 1XUUA 3SR7A 1I2NA 1NF0A 4LW7A 2Z6IA 2CLKA 4KFNA 1LBLA 1GPWA 1W5NA 3QJAA 3NQFA 1TB3A 2WNQA 1HL2A 3OIXA 3R13A 4JX4A 2A21A 3DBPA 5IBXC 1R30A 4UNLA 3W7GA 4GWEA 5AHNA 1FDJA 3W2KA 3UWVA 3W1TA 2GQ9A 1RQHA 1JCJA 3G1HA 4H3DA 3WJYA 4ADSA 4DXVA 1A53A 1KLZA 3GXNA 5D2XA 2B7QA 4M6PA 2WO5A 3DHDA 1JUKA 2J9YA 3VE9A 5G4WA 4PFMA 3G0SA 3IIPA 8TIMA 2VEMA 2VFGA 3USBA 1YDVA 2A6NA 1FDYA 1I2RA 2C0AA 3PSVA 3BG3A 4UR7A 1JJKA 2FIQA 1TCDA 1VLWA 3LRMA 2QCCA 4O13A 1KFBA 4WUIA 3EKLA 2ZZ5A 3S5NA 4A2SA 4XKYA 3UQNA 3EX1A 4JTEA 3NM1A 1TPH1 4EF9A 3ELFA 2G95A 3BO9A 4QM1A 3THQA 1VYSX 1B4EA 3BK0A 3EWYA 3W85A 3C0JA 2P0OA 4O15A 2X16A 3N14A 2TRSA 2B7NA 3QH2A 2OT0A 3TFXA 3RU6A 2A5HA 5CZ0A 1JRCA 4U4MA 2YYUA 1AW1A 3G22A 4N6FA 3I68A 1F76A 1PS9A 2C16A 3UXDA 3EWWA 3STFA 4HKPA 4ZL1A 4GFSA 4O0ZA 4IMEA 4BWLA 2PE4A 1KFCA 5AYZA 3LI1A 2RDUA 1VH7A 4RR4A 3ZS4A 3TUUA 3CEUA 1OFRA 2WPBA 3C6CA 1OFEA 3ZWSA 1XFBA 1L6SA 3R2GA 3G0XA 2WSQA 3W74A 1JULA 3UWQA 3NVTA 5FF3A 5KMYA 4IPJA 3NPUA 1N7KA 1YPFA 4HIBA 3GDKA 5FF2A 1ZAJA 4NJJA 3W88A 1QO5A 3G1YA 3P84A 1I2QA 5DCDA 1G4EA 5F4XA 4N02A 3LLFA 1YDOA 3O8AA 3A22A 4OGZA 4EF8A 4N2YA 2CLMA 4PCFA 1L6WA 2ZCGA 3QSRA 2VXNA 1W1ZA 3TC6A 2EGZA 3G1SA 3LHUA 4O19A 3FKKA 4FX8A 1Q6QA 4GUGA 2ZRUA 3TXZA 5G4EA 3FYOA 4IQLA 5D2TA 1YLVA 3SFKA 5AC7A 3F03K 1LZOA 3M5YA 3QM3A 2J24A 1OHLA 4ZQMA 3B4UA 4NQ1A 3AJXA 4MYXA 1B57A 5EL1A 4JYEA 1K3UA 3BGJA 4CNNA 4L4LA 4E0CA 2DZUA 1TPVA 2FQIA 2JGQA 4RV8A 3T55A 2ZZ2A 3T40A 4R53A 4O16A 4BR1A 4ZQNA 1G7VA 1W5PA 3I7RA 2CLOA 2QUUA 5TIMA 4LTSA 3BG5A 4MJMA 3I65A 2ZTKA 1DL3A 4ZMGA 2OX1A 3TAKA 1VCFA 4TIMA 2A1YA 4NXKA 4ADUA 3GXPA 1T8XA 1OABA 3QMSA 1SO3A 3EXTA 3NQEA 1LCOA 1GTHA 2C14A 3RK8A 1OG0A 5AHIA 3NQ7A 5D2WA 5IM51 4CNOA 5G2HA 3EX3A 4OQVA 5K4ZA 2YZRA 1D3GA 4HNVA 4WY0F 3O16A 5ABTA 3W2UA 1PHWA 4A29A 4UIOA 2YGYA 4PL1A 2NUWA 2QJGA 4UTMA 1KM2A 1NVMA 1KBJA 4LVFA 1WX0A 4WOQA 1RR2A 4RCXA 3W1MA 4JGDA 1ZJIA 4HNTA 2V5BA 4UFHA 1W37A 4IX0A 4LV4A 2C1HA 1ZHAA 2WKJA 2Z0IA 3W7JA 5A5WA 2PRMA 5DY3A 4FIRA 4K8EA 4CCDA 3NQ6A 3TMLA 3QQ0A 4LS0A 1KM4A 1QPQA 1FY6A 3S5OA 1OFAA 1K7XA 4UR8A 4WJEA 3L68A 3QZEA 1XBXA 3F4WA 1FX6A 4FX6M 2D73A 1TREA 4RX0A 1C8VA 2ZDRA 2V81A 2OT1A 3W7IA 4S2BA 5AC8A 4C1LA 4UFIA 5G1TA 2Y89A 1PVNA 5DLCA 2I14A 4MVAA 4TX9A 5DCBA 3HMJG 2QCMA 4GNJA 2PCQA 2ISWA 4KKXA 4JYFA 1FWNA 1L6YA 3W7HA 5FF4A 3OVPA 4OV4A 1OX4A 1W0MA 2LLEA 3LHWA 4JX6A 3GDLA 2CZ5A 2A7NA 4HSNA 1QMLA 3L0GA 2BTMA 2NWSA 1WAUA 1S5VA 1ME9A 3N2XA 2Q3OA 1KFEA 4AF0A 4QNEA 1OFBA 3IGUA 4IX2A 3N3MA 1TTPA 3BG9A 3S5YA 1XM3A 3WFAA 2YDAA 4U28A 5LNVA 4AXKA 2ABAA 2NXIA 3L2IA 4JIQA 4M19A 1YTDA 4I7WA 4K7YA 4JTFA 3TIMA 4E38A 1YTKA 2DJLA 4UMAA 2ZRWA 2QCDB 2CLFA 4I7UA 3PG8A 3KVMA 3MO7A 2VFFA 4LUIA 3NYZA 3RNDA 3O6YX 4HPJA 4PC8A 2JKAA 1R2SA 1YTEA 1P1XA 4M7SA 2YCEA 4RK8A 5HQEA 5I3KA 1LDCA 1TIMA 4ALDA 3PBVA 3M41A 4O53A 4ZQRA 4DEFA 1H5YA 4NJIA 4MPQA 2J9ZA 3KXQA 1VR6A 1VCGA 4DO4A 5K7JA 4YLWA 5AN7A 1P0KA 2BX7A 4YCOA 3LHYA 1KTCA 3R12A 2DZVA 3S1VA 3VFLA 2WV8A 2GVJA 4JTIA 2GUUA 1MEIA 4D2JA 4GUFA 3W7KA 2OZ0A 1EUNA 5CKSA 1TMHA 1Q6OA 3NPXA 3EKZA 4EVZA 1SR9A 2Q8ZA 1EWEA 5K9XA 2CW6A 4XTIA 1SFJA 4FHAA 2WSRA 1B9BA 4Y6GA 4LVGA 3U8GA 4O57A 1HTIA 4JTJA 3DKJA 3TJLA 1ZCOA 2CZFA 5F1UA 4ORIA 1W8SA 1TPC1 1F74A 4H4IA 5GVJA 2ATSA 4FXRA 1Z42A 1YDNA 3KVJA 3E02A 1VHCA 3LCIA 2J27A 3MBFA 4HT3A 4QJ1A 3W7QA 3TSBA 2EHHA 3FIGA 4UTWA 2EPHA 3T44A 1AW2A 3D0CA 4QIUA 3W1AA 4UTIA 2R8WA 3W73A 2XN2A 3KRSA 1LP6A 4O17A 2WSYA 1EIXA 3BPWA 2JKEA 3GK0A 3L5AA 3NQ2A 2QEZA 1EP2A 3E96A 5DXXA 3DHFA 1KV5A 3NQDA 4AHPA 3T78A 5LGZA 2R94A 4K7VA 4TR9A 1DOSA 4P2VA 4CCEA 5U7SA 1WXJA 3IVUA 1G4TA 3LBCA 1H7XA 4HPXA 3QSTA 1JRBA 3CLMA 3NQVA 4PODA 1H1YA 2J6XA 2ZA2A 1MZHA 3S0CA 1H7NA 3DKLA 1KFKA 4AB4A 4IMDA 3EXSA 4JY9A 4UTWC 2QAPA 3L21A 3M7WA 3GKAA 3R5EA 4JYDA 3VKJA 3CQ0A 3UPBA 1LRNA 3IIXA 3HGSA 3NPVA 3GX9A 3K30A 3MUXA 3UPWA 2GPTA 3NG3A 1ALDA 3QC3A 4R7JA 1HUVA 3SZ8A 1LBFA 3EXRA 4WY0B 3L66A 2VEKA 3MJYA 3PM6A 2E09A 3NL6A 3HGJA 1WQ5A 5BW6A 1XC4A 2R91A 1KV8A 3W3OA 4O14A 1THFD 3HF3A 5K4XA 3L5LA 1O4UA 1LOQA 2GQAA 1SO6A 3N34A 5G2IA 3Q58A 3QRHA 4JICA 3W7PA 3SGUA 2WOQA 1UBSA 1OYAA 3TX9A 4GXMA 7TIMA 1KFLA 1S5WA 2XN0A 1LTDA 4JEQA 4JR5A 4LVAA 1SO5A 1F73A 2VENA 2A85A 2BZNA 4JN6A 2IQTA 2JBMA 3O06A 3SI9A 1LOSA 4N9EA 2CFFA 2VKZG 3W9ZA 4A21A 2E5CA 2ZZ4A 1EP3A 1NAL1 3UWUA 1SZNA 3PUEA 4OT7A 3HG3A 3VCRA 4KFPA 4NT0A 4K38A 4OHQA 1S5TA 1DHPA 1SZGA 2ZRZA 1LLZA 3LCGA 1BKSA 5F4WA 1IIHA 3O63A 1YADA 4IUOA 1G4PA 2DZXA 2Q8LA 1KBIA 4MY9A 5BNKA 3LLDA 1HFBA 2UV8G 4K6AA 3OHIA 2AGKA 4RKAA 2H90A 2GVGA 3PB0A 3PULA 1H51A 2DZPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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