1CECA

A common protein fold and similar active site in two distinct families of beta-glycanases
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
339
structure length
331
Chain Sequence
VSFKAGINLGGWISQYQVFSKEHFDTFITEKDIETIAEAGFDHVRLPFDYPIIESDDNVGEYKEDGLSYIDRCLEWCKKYNLGLVLDMHHAPGSTLFEDPNQQKRFVDIWRFLAKRYINEREHIAFELLNEVVEPDSTRWNKLMLECIKAIREIDSTMWLYIGGNNYNSPDELKNLADIDDDYIVYNFHFYNPFFFTHQKAHWSESAMAYNRTVKYPGQYEGIEEFVKNNPKYSFMMELNNLKLNKELLRKDLKPAIEFREKKKCKLYCGEFGVIAIADLESRIKWHEDYISLLEEYDIGGAVWNYKKMDFEIYNEDRKPVSQELVNILAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A common protein fold and similar active site in two distinct families of beta-glycanases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE CELC
molecule tags Hydrolase (glycosyl)
source organism Clostridium thermocellum
total genus 127
structure length 331
sequence length 339
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 1995-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1cecA00
2BS9A 4JFUA 2BHYA 1BGGA 3K4DA 3GXFA 1V0LA 5A6BD 4PYSA 4GQQA 1X6NA 4OBSA 5D9NA 3UG5A 1HP4A 1JNEA 2VZTA 1G1YA 2W66A 3ARRA 2W63A 4AC1X 3W38A 3BAKA 1V3JA 1ZBWA 4RE4A 1E6RA 3WNNA 1W9XA 1SFSA 1WZAA 1DWHM 3N1AA 4WIWA 3U57A 2ZX7A 2WC3A 5IHSA 1HIZA 1F4HA 4KWUA 1FP9A 5JBFA 2QF8A 3AIBA 2OWCA 3L4VA 4ZFMA 3ARWA 1W3JA 4PMXA 1PBGA 1FH9A 4D6HA 3T09A 3PZIA 4J27A 5E09A 2W62A 4OKDA 1BYBA 2OLHA 1XSIA 4W86A 1I1WA 4KH2A 2E9LA 4HOXA 1JL8A 3FXYA 3VGFA 1DHKA 1UKTA 1B2YA 3WQ5A 1XGZA 2PC8A 3WH8A 3WF3A 1MVYA 1HKMA 1JYWA 1WB0A 2GK1B 2WC7A 1U30A 5JUVA 1V3KA 2XVKA 3VIHA 1KGUA 4QP0A 5FIPA 1UKPA 4PSPA 1OSEA 1V6XA 2VRJA 2J47A 1UZ1A 4HMCA 4M29A 4UQCA 4QCFA 3W24A 4D6FA 4UFJA 1KXQA 4MDPA 4WKHA 5BXRA 4PMOA 3VM7A 4HZ7A 2A3EA 1NWRA 1QI0A 4M82A 3TOPA 3HJEA 3QGVA 2QPUA 5DF0A 3W27A 4WKAA 4AD2A 3WDJA 1KWKA 3WDQA 4IPLA 3SUTA 4H8VA 3VD3A 3W37A 3WUBA 1JF5A 3AXIA 2CESA 1WZLA 3D3AA 1GOWA 1CLXA 5EB8A 1QHPA 1PX8A 4XZBA 4PMUA 5E6ZA 3O9NA 1V03A 2X09A 3ARSA 4M24A 4BF7A 2GJPA 3ZR5A 4OZOA 2ZWYA 5CGMA 1JG9A 4ZENA 4DUVA 1NH6A 3MMWA 4NRSA 3MMDA 2Y8VA 1N82A 3IJ9A 4IM4A 4P7NA 3KZSA 3BSGA 4GO9A 1JD9A 1B3WA 5I23A 2EPKX 3UG4A 3MUAA 1KFWA 3RPMA 2J4GA 1LG2A 4PCTA 4AD5A 3OB8A 1E4NA 2WBKA 1CXLA 4BCEA 4GXPA 3ZT6A 2F2HA 2J7EA 4Z2JA 3NSNA 5A95A 2JIEA 3TTOA 1EGZA 4CN6A 2E4TA 1UQYA 4J3TA 1H1NA 2A3BA 3JUGA 4AISA 2G3MA 2J7FA 3ZT5A 1KR0A 1QW9A 1V0KA 2WVVA 5AYIA 2V3EA 1BFNA 3MSDA 3GNRA 4JFSA 1TVPA 4DWSC 2MANA 2VCCA 3K46A 5FKYA 3TA9A 3AIEA 1BG4A 2QHAA 2E0PA 4CCEA 3WEZA 3L4YA 1JI2A 3PZQA 5BROA 3VKKA 1HP5A 2C7FA 2C8NA 4WF7A 1UWIA 2CKRA 1FA2A 2WMKA 1ZL1A 1PEZA 2BVYA 1MW0A 3EDJA 2VR4A 4M1RA 1B3XA 1EOMA 1ISYA 4E4PA 2ZIDA 3W82A 1UWQA 2XVPA 1XV8A 5GPRA 4AY1A 4EANA 2VL4A 3ZSSA 1B9ZA 1WE5A 4RL3A 5DMYA 3OLEA 1EQPA 3N12A 1ZBCA 5E0CA 2AMGA 4HMEA 1W9UA 1E3XA 2GFTA 4MJ2A 2CBIA 1UH4A 3OZOA 4F66A 4QFUA 1O7AA 5A94A 4S3KA 4F79A 2DIEA 4P7RA 1JDCA 1PAMA 1M53A 4A4AA 3GXIA 3ZT7A 1J0HA 1WDPA 2HISA 3CZLA 3WH6A 3EMCA 5TD4A 2XFFA 1OM0A 2VI0A 3EDEA 1TG7A 3T2OA 1J18A 2YL6A 3ZM8A 1E72M 3POHA 3RO8A 4HA3A 3GH5A 4HOWA 1J0YA 3VGEA 3GTNA 3BGAA 3B8SA 1H0GA 1W3KA 3UEQA 3CUHA 3OG2A 5A1AA 5ABHA 4C7GA 3ARTA 3AIRA 3CZJA 4HMDA 1E1FA 1TMQA 2E8YA 2WHLA 4UFIA 2G4FA 1QI3A 3ARYA 1KB3A 2OYLA 1CTNA 2G3IA 1K9EA 1WPCA 2Y5EA 5HPCA 1QNRA 4PBGA 4Q7NA 3NDYA 2OSYA 5CPSA 2XM1A 3MS8A 4U2ZA 4P7LA 1ESWA 4CKQA 4QLKA 1B3ZA 3OLGA 4AIUA 4FLSA 4KGLA 4FMVA 2QMKA 1R86A 1KCKA 3AYSA 3KWXA 1C8YA 1H0IA 2OSXA 4W5UA 3RCNA 1JD7A 2WPGA 1E43A 3ZJ8A 3WBEA 1D7FA 3SCTA 2ZE0A 2CBJA 3VGHA 5AC5A 4JIEA 1GQKA 4PTVA 4AZCB 2ESCA 4GZJA 1GHRA 3L4ZA 3O6AA 2PWEA 3B9AA 3AISA 4W7WA 4BA0A 1OB0A 5BRQA 1GJWA 3BCFA 3TONA 1DTUA 1GORA 4DUWA 2VNCA 3AS3A 1E56A 3EYPA 5A6SA 4J3SA 4MPKA 4AZBA 3AHYA 3CLWA 2CITA 4C7FA 3OGRA 3ZIZA 3PZUA 1E15A 1J0JA 2BY1A 2ZUMA 4X0NA 4K68A 2WBGA 2DT2A 2WMIA 4D72A 2JF7A 3EMZA 2WW5A 1MXDA 3VIJA 3WKZA 4GZIA 5A6BA 3A3HA 3F4VA 3WH9A 1QHOA 3EBVA 4Q22A 1JYNA 5FL0A 2VX5A 4M8UA 2ZUSA 1HX0A 1QI2A 3CO4A 6TAAA 4TOQA 1JYVA 3VX1A 3WNPA 4AD3A 5CGTA 4NSBA 2YKKA 1W32A 1JZ3A 5KEZA 3SUUA 1KGXA 4F9JA 1LWJA 3VDCA 4MAVA 4M56A 3WNMA 1M03A 1LL7A 1E5JA 3AIUA 1OGSA 2E9BA 4LGXA 1C3FA 2WMGA 1HF6A 2Y24A 4AD4A 4JFWA 1RH9A 1MYRA 1VFFA 3FAWA 4NZCA 1CECA 4CVUA 3IJ8A 3VGGA 4CD4A 1TFVA 4H41A 1HVQA 2VX6A 2XUCA 2Z1KA 3VGDA 3QOMA 2WXDM 4MTVA 2J25A 3RJXA 2FH8A 3WUGA 5A6LA 1AQHA 2CHOA 4CCCA 4LPCA 2OSWA 7TAAA 3AXXA 2G8ZA 1PJ9A 3VGBA 3N9KA 1TA3A 5EMYA 1UD2A 3GDBA 3VUPA 3WQ8A 3IAQA 5A8QA 2YA2A 3SIMA 1D2KA 5FL1A 1S46A 2GJXB 1VEMA 3PZMA 3N11A 1NWUA 1NOWA 3AQUA 5IHRA 4HA4A 2DIJA 4YHEA 3RDKA 2CIPA 1XD1A 2Z1SA 1UR4A 2D3NA 1Q6DA 2X0YA 5DEZA 2WVSA 4TUFA 1UA3A 3WQ4A 4F9DA 4E8DA 3FHQA 4D6JA 1DWIM 5JBDA 1UYQA 1WDRA 3UR8A 2QPSA 4W8BA 1ECEA 1H41A 1TR1A 4TVUA 2VX4A 2OWWA 4AIOA 1GQIA 3MV11 3PZNA 2D0GA 4H7VA 4D6GA 3WNOA 5I77A 1HXJA 3CZEA 2JEPA 1NARA 2YA1A 3WF1A 2ZX8A 4URIA 2DSVA 4H8UA 5E70A 1EOKA 4Z2LA 4UZUA 4DM2A 2J8FA 3ARVA 4EAMA 3S2CA 4BQ3A 4Z2IA 3I3BA 3DHUA 1VEOA 3WD2A 2JFEX 3SUVA 3K8MA 2DQXA 3IANA 2W92A 4MB1A 2VZUA 2WKLA 2DGAA 3W0KA 5IFPA 1JFHA 1HJXA 2V38A 3W26A 3GXDA 4BZYA 3J7HA 2WVVB 2XG9A 4PCSA 1JI1A 2DEPA 4W84A 2D0FA 3I3EA 5I3DA 2WSPA 4TVDA 5IDIA 3SUSA 3ZR6A 5ABEA 2J7DA 2QMJA 4B9YA 3SCNA 3UR7A 1QOXA 2CBUA 2YA0A 3VDAA 1UR0A 3WMBA 3WDHA 4GIAA 4W85A 3WH5A 3L2MA 3MU7A 2ZOXA 3MV01 1BYDA 1FFQA 4AMCA 4AZ5A 4QCEA 3BAXA 4YHGA 1BYAA 3VD5A 1QHZA 2PWHA 3HN3A 3MMUA 3DECA 3WDIA 3M6DA 1HKKA 3NIYA 4B9ZA 1UKQA 1FP8A 3CZKA 1Q4NX 1C8XA 2CYGA 3DHPA 2WC4A 4ACZA 1OGGA 3APGA 4XUYA 1GZJA 2YLAA 4DUXA 2YOCA 3QHMA 1OINA 4GO8A 1VAHA 3SCPA 1WDSA 4HZ8A 5BXTA 3PZVA 2V5DA 5BXPA 4H2CA 1E73M 5D8WA 1CGXA 4JHOA 2EPLX 3ALFA 3OLDA 2JE8A 4EK7A 4JCLA 2V3DA 1AQMA 3OZPA 3GYCA 4RE3A 1EDQA 2PBOA 5CXPA 4J3VA 1HJSA 4W7VA 1OGBA 2J75A 4CU6A 1BLIA 3CIVA 1DEDA 1R7OA 2DDXA 3A4XA 4GKLA 2EBNA 1LL4A 5HXMA 4DWSD 4PMVA 2WCAA 1XH1A 4BS0A 2F8QA 1IZKA 4J28A 5A69A 1G94A 4WSKA 5BXSA 4XB3A 4OIFA 2J7HA 3E1F1 3UESA 3VIGA 4N0RA 2XVNA 2VVSA 1JZ4A 1W3HA 1JZ8A 2UY3A 3BAJA 5GQBA 1QNPA 3UG3A 2E8ZA 2VVNA 1J0IA 2VQTA 1C8QA 1E3ZA 2J79A 4P8WA 2XWEA 3ZJ7A 3PZGA 1BAGA 1Z32X 4UOZA 2XVLA 3KL3A 1XSJA 2VZVA 1UD8A 4CUCA 1MFUA 4MAZA 2WM0A 1OBAA 3ZQ9A 3F5KA 4BQ4A 4U3CA 2AOSA 3BH4A 3WD1A 3N13A 5EFDA 1UWRA 4PMNA 2UWFA 4TX6A 1LG1A 4YN5A 2WHJA 1LQ0A 1RPKA 2X1IA 3AIVA 1DWJM 2CCRA 1MWOA 2EJ1A 2WHKA 3TP4A 2ZWZA 1UWSA 3AMDA 3A4WA 4W89A 4PRWA 1ITCA 3WN6A 1LJYA 4MNKA 4MB3A 3KL5A 5BYWA 2O92A 1UH2A 1VJSA 4ACYA 2X2YA 4PUDA 3BMWA 5GNXA 3WIJA 3GNOA 6CGTA 3VU2A 1W91A 2IXUA 2BHZA 8A3HA 1CXHA 1GQLA 1KXHA 1JXJA 3PTKA 5DO8A 1XYFA 3AS1A 1MW2A 4HOZA 2CERA 3F5LA 5BWFA 2A3AA 3AMLA 4UFHA 5IXEA 2TAAA 2BNJA 3CMJA 4GINA 3WF4A 4KGJA 4J7RA 3K1DA 1UHVA 1C7TA 2VMFA 2WMIB 4OBRA 3WELA 1UZ4A 1CXKA 4D6EA 1NOUA 4UFKA 3B9EA 1VRXA 4ATWA 2VRQA 1M01A 1Q6GA 3AZTA 3L2LA 4JKLA 1G5AA 2YL9A 3AIQA 3PZTA 2GDUA 5CQ1A 1Q6EA 1IT0A 2DSWA 1B3YA 1E6SM 2DPEA 2XGIA 1VF8A 1SMAA 1VFUA 3L4TA 3VILA 1JZ2A 3RM8A 1QNSA 3GZAA 1ITXA 3WEOA 2ZUVA 3A6OA 3FW6A 2CXGA 5HDRA 1XCXA 2BVTA 4A3YA 4JL2A 1UKOA 3ARQA 3RM9A 3GBEA 3MO4A 4LYRA 1H5VA 7CGTA 4L4OA 4MADA 1UKSA 4UQDA 5D9OA 3F5JA 2E40A 3DYMA 4V28A 3CBWA 4AZIA 1YHTA 2EPMX 1KXTA 1JAEA 3L4XA 4AWEA 5HOSA 3VMNA 2WSKA 3G6LA 3SUWA 1HJWA 3A4AA 1GONA 1H4PA 1GW1A 1HL9A 5CJ5A 3PBGA 1UD4A 3CHFA 3ECQA 1P6WA 3OLIA 5ABFB 1HKIA 4LQ1A 3VIMA 1ZJAA 3CHEA 2EQDA 1E9LA 1XSKA 4JL1A 3WY1A 1QNOA 4ZE5A 4CU8A 1X1NA 4GQRA 3BAYA 4OOUA 1EO7A 1HJVA 5JBEA 1VFOA 2J8GA 5C8BB 5D8ZA 3BLPX 5KZ6A 1W9DM 4ZXOA 1V6WA 3M46A 2WCGA 2JIWA 4R5EA 5A8MA 2Y2WA 3AI0A 1KR1A 3VNYA 4MB4A 3AYRA 2VO5A 2CKSA 4UOJA 1CYGA 2D2OA 1Y7VA 3WMSA 3D5HA 1BVNP 2BXZA 3WH7A 3VD4A 4UOQA 4UR9A 1W9PA 3LMYA 1UUQA 5M03A 5LA0A 4PMRA 1VIWA 1UA7A 1H2JA 2WWCA 1ZBKA 2JF6A 3EDFA 1GVIA 4EKJA 2VCAA 3VPLA 2WVUA 3II1A 1HL8A 4GZEA 1OWQA 1E6PA 1LWHA 1CXEA 3VMOA 2ZX9A 1M04A 2X8RA 3VD7A 2VX7A 1EA9C 1XHGA 4Z2HA 3WMCA 3VINA 1UWTA 1I1XA 2Q8XA 1KQYA 3NCOA 2RGLA 2YBTA 5M3WA 1E6ZA 2EPOA 2FHCA 3AHVA 1J11A 1J9YA 1E6NA 1W2PA 1BVZA 4LX4A 2ZUTA 2O9OA 1JFXA 2G3NA 2VC9A 2ZXAA 1OD0A 1E40A 2GJRA 3PTQA 4AYSA 3AS2A 3LPGA 2FH6A 1HJQA 4B3LA 2CPUA 4MJ4A 2D1ZA 1DP0A 1CGVA 3EDKA 3L4WA 1UR2A 1A47A 2YDRA 4AXNA 2YDQA 2Y8KA 2YL8A 4XV0A 3BXWA 4NRRA 3CZ8A 1KBBA 2YJQA 1B30A 5JIWA 3IJ7A 3UERA 4P8VA 4S3JA 3VVGA 4CD5A 3CUJA 1FHLA 4IPNB 4PTMA 5A3HA 4WSJA 1UR1A 1G0CA 1HJUA 1HT6A 8CGTA 1FOBA 4PMYA 4UQBA 2WMHA 1C93A 2EPNA 3KEHA 3WQ6A 4CD6A 1J10A 2A3CA 3WUEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2BS9 A;  4JFU A;  2BHY A;  1BGG A;  3K4D A;  3GXF A;  1V0L A;  5A6B D;  4PYS A;  4GQQ A;  1X6N A;  4OBS A;  5D9N A;  3UG5 A;  1HP4 A;  1JNE A;  2VZT A;  1G1Y A;  2W66 A;  3ARR A;  2W63 A;  4AC1 X;  3W38 A;  3BAK A;  1V3J A;  1ZBW A;  4RE4 A;  1E6R A;  3WNN A;  1W9X A;  1SFS A;  1WZA A;  1DWH M;  3N1A A;  4WIW A;  3U57 A;  2ZX7 A;  2WC3 A;  5IHS A;  1HIZ A;  1F4H A;  4KWU A;  1FP9 A;  5JBF A;  2QF8 A;  3AIB A;  2OWC A;  3L4V A;  4ZFM A;  3ARW A;  1W3J A;  4PMX A;  1PBG A;  1FH9 A;  4D6H A;  3T09 A;  3PZI A;  4J27 A;  5E09 A;  2W62 A;  4OKD A;  1BYB A;  2OLH A;  1XSI A;  4W86 A;  1I1W A;  4KH2 A;  2E9L A;  4HOX A;  1JL8 A;  3FXY A;  3VGF A;  1DHK A;  1UKT A;  1B2Y A;  3WQ5 A;  1XGZ A;  2PC8 A;  3WH8 A;  3WF3 A;  1MVY A;  1HKM A;  1JYW A;  1WB0 A;  2GK1 B;  2WC7 A;  1U30 A;  5JUV A;  1V3K A;  2XVK A;  3VIH A;  1KGU A;  4QP0 A;  5FIP A;  1UKP A;  4PSP A;  1OSE A;  1V6X A;  2VRJ A;  2J47 A;  1UZ1 A;  4HMC A;  4M29 A;  4UQC A;  4QCF A;  3W24 A;  4D6F A;  4UFJ A;  1KXQ A;  4MDP A;  4WKH A;  5BXR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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