1CEOA

Cellulase (celc) mutant with glu 140 replaced by gln
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
340
structure length
332
Chain Sequence
MVSFKAGINLGGWISQYQVFSKEHFDTFITEKDIETIAEAGFDHVRLPFDYPIIESDDNVGEYKEDGLSYIDRCLEWCKKYNLGLVLDMHHAPGSTLFEDPNQQKRFVDIWRFLAKRYINEREHIAFELLNQVVEPDSTRWNKLMLECIKAIREIDSTMWLYIGGNNYNSPDELKNLADIDDDYIVYNFHFYNPFFFTHQKAHWSESAMAYNRTVKYPGQYEGIEEFVKNNPKYSFMMELNNLKLNKELLRKDLKPAIEFREKKKCKLYCGEFGVIAIADLESRIKWHEDYISLLEEYDIGGAVWNYKKMDFEIYNEDRKPVSQELVNILAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of a family 5 endoglucanase mutant in complexed and uncomplexed forms reveals an induced fit activation mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELLULASE CELC
molecule tags Cellulose degradation
source organism Clostridium thermocellum
total genus 125
structure length 332
sequence length 340
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 1995-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ceoA00
3VTRA 2WMIB 1GHSA 1V3MA 1FA2A 4UCFA 1HT6A 1KGWA 3AZSA 1GOMA 5AYBA 1C3FA 4MNKA 3RIKA 1DWGM 4ZENA 2AAAA 1V6XA 1CXEA 1UD2A 2DT1A 1C8YA 1TG7A 4TVUA 1HNYA 4QLLA 1G9HA 2BNJA 2ZUNA 1EO5A 1WZKA 1H1NA 4ZXLA 4J27A 1JDCA 1MW2A 3ARXA 2WBKA 3PZNA 1GVYA 3N11A 1DWHM 4OIFA 3WDPP 1E6RA 5A1AA 2A3AA 1MXDA 1OIMA 1M04A 3BLPX 1W9DM 7A3HA 3AIWA 2WMFA 3UEQA 1QOXA 3LPFA 1W91A 2G41A 3BAXA 3LPPA 3KL0A 3FHAA 1R8LA 2W62A 4XV0A 1MQRA 1D3CA 3U5UA 2PBGA 4NRSA 3CMGA 4M1RA 5C71A 3WDHA 4GI9A 1UHVA 3MMDA 4PMNA 1E43A 1HJVA 2WC4A 3VNYA 3WD0A 1WE5A 1YHTA 1LL4A 2UY5A 3ARYA 4EK7A 3JUGA 3K4AA 4PMDA 3VD3A 1CGXA 5D4YA 2ZUVA 2WB5A 3VX1A 2WMIA 3UERA 5BXRA 1BQCA 2D24A 2X09A 2FHBA 1Q6EA 1XD1A 3MUY1 5I77A 2ZUUA 2D1ZA 1V6VA 1TE1A 3ZM8A 4KGLA 1FFQA 1K9TA 3AHYA 3NJ3A 4Z2GA 4E8CA 1D2KA 2ZXAA 4CU8A 1JYNA 1EQCA 1E40A 3CUGA 2VCCA 1MQQA 3W26A 4AD2A 2FH8A 4AD5A 3VDAA 3DYOA 1B3XA 1CGUA 1B31A 1KXTA 2VX5A 3EDEA 4AD1A 1GNXA 3MUAA 1JD7A 3W38A 2ZUWA 1KCLA 1OWQA 1NQ6A 1CXFA 2D0GA 3VM7A 4AYSA 5DF0A 1FOBA 1RH9A 2DT0A 3AIVA 3VIGA 1FHDA 1EDTA 1JNDA 3E1F1 4AZCB 5I78A 2O92A 3VIMA 5GQBA 1UKTA 3QHNA 4UFLA 5I24A 5FD0A 1JF6A 2J8FA 3DECA 3K46A 5GNZA 4UQ9A 5FL0A 2V3FA 2J8GA 4JAWA 3DC0A 1WKYA 3HU7A 4MTVA 2C8NA 3BC9A 1ZL1A 3N17A 4AIOA 1CXLA 1WAWA 3ZJ7A 3DHUA 3ALFA 1BGGA 1UH3A 4JKKA 5DEZA 3RCNA 5HOSA 4FLRA 8A3HA 2XM1A 2VQUA 3T2PA 2BXYA 3S2CA 1EDQA 4F79A 3CO4A 4M80A 4S3JA 3ARTA 2VI0A 4MNMA 3AXXA 4PRWA 3SUWA 5BROA 1ISXA 2WVSA 4W5ZA 2G3JA 2VTFA 4PTVA 5C70A 1ZBVA 4KRUA 1FFRA 4PMXA 4D6HA 5A8PA 1VBUA 3ARUA 4WK9A 4ZEPA 1CXKA 2EQDA 5A8OA 3T0DA 2BFGA 2FGZA 3T2OA 3WDQA 5BRPA 4QLJA 4W93A 1B3ZA 2G3IA 4UZSA 1BVZA 3RJYA 5I23A 3O9NA 1CEOA 3B9AA 6TAAA 5EFFA 3FY1A 1KFWA 3VGEA 1QW9A 3VDHA 1GVIA 1HX0A 1WCGA 4TX6A 1UZ4A 4D6GA 2DGAA 1V3JA 1VFFA 2G3NA 2J4GA 3BH4A 1V0LA 4GQQA 4ATDA 4WF7A 4PBGA 2VOTA 2ZWZA 1R85A 2BVTA 1ISWA 3VNZA 1UKSA 2D3LA 1WO2A 2VZTA 1OCQA 4Y7EA 1V08A 1EOMA 4JL2A 3OGRA 5E9AA 4JFTA 3HJEA 2XJ7A 2ZE0A 1XHGA 1KBBA 4LX4A 1ECEA 3W25A 1JZ8A 3RJXA 1M01A 1MFVA 2PBOA 2VR4A 1UA7A 1VRXA 4DUXA 4AW7A 4GINA 5A2BA 4IUGA 1HP5A 2WW5A 3VD4A 4JIEA 3AMKA 4HOWA 2YDQA 2VR5A 4JFUA 1QNQA 1C90A 1BG4A 4A3HA 4GPNA 5E6YA 3WF0A 1GW1A 1CWYA 2WHJA 3AS3A 4NF7A 1CXIA 4J3XA 1CYGA 3NSMA 3WMBA 1CPUA 4NZCA 1BAGA 1PEZA 6CGTA 1XYFA 3SCNA 4PSPA 4W88A 4HP5A 2Z1KA 1HKJA 4E8DA 1C8XA 3II1A 2XG9A 2X0YA 1V6UA 2WC7A 2E9LA 2WMJA 3TONA 3W28A 3ZR6A 5A6JA 1BYDA 1C8QA 3WKZA 3VIPA 3FN9A 5I0DA 1TZ7A 5CZKA 1UZ1A 1BPLB 2ZX6A 4J3VA 3BLKA 1V3HA 2E9MA 3CH9A 1KQYA 1LLOA 1G0CA 4U5IA 1GZJA 2J7EA 3W27A 2A3CA 1E56A 3CMJA 5FOOA 1EQPA 3AS2A 3IJ9A 1J01A 4UFJA 2GJRA 3VPLA 1VIWA 1H49A 1UD5A 1UKPA 4ACZB 1UWUA 3VO0A 2QMKA 4DWSB 1OM0A 3L2LA 1WP6A 3GBEA 5A94A 1HL8A 1QNRA 4U2ZA 4CD5A 1XH2A 3WQWA 5M03A 3W81A 3J7HA 2IXUA 1LL6A 2BHZA 1E4MM 2XGBA 2WBGA 2XFYA 4NI3A 2YL9A 2J79A 4M8UA 3UESA 5E0CA 1J0KA 4HU0A 4U33A 4PUDA 4B3KA 1LQ0A 3VVGA 3VGHA 1B2YA 4H41A 3VMOA 1E71M 3L4ZA 3IAPA 1ZS2A 3F4VA 1JYVA 1QW8A 1HKIA 1RPKA 4IISA 1WZLA 3B9DA 4W7VA 2ZICA 5JIWA 1E55A 1EHNA 1QHOA 5IHRA 5E09A 2XVLA 1JZ7A 1OINA 1XH0A 1K9FA 1GJWA 2XUCA 2CIPA 3W29A 1B9ZA 3SUVA 4MPKA 3MSGA 3L2MA 4D72A 1BYBA 4HPHA 1BLIA 2YBUA 1H0GA 1QI2A 3CTTA 3FAWA 1WNOA 1QI4A 5EB8A 3MSDA 4WKHA 2FHCA 2DEPA 1VFMA 1MQPA 2X8RA 3ECQA 5BRQA 1CLXA 2EPNA 4PSRA 4EAMA 4BQ3A 4DWSA 1CBGA 3PTKA 1CGVA 1E1EA 3VGFA 2W5FA 3IAQA 1ZU8A 3TTYA 2ZUSA 3WF4A 2WWDA 4AD0A 3BSHA 1JG9A 5A6BA 1C91A 2DSWA 1UWIA 4MNLA 1JFHA 4HZ6A 1G01A 4BA0A 4MNJA 5GNXA 3CGTA 3SCWA 4CU7A 1W1VA 3BMVA 2D20A 4BQ2A 4P8UA 1TR1A 2J7BA 4HZ8A 1VFUA 3W37A 4AIEA 2BV9A 2XVNA 5A8QA 3FNDA 1GORA 1ZBKA 4W85A 4A3YA 2E0PA 2PI6A 3WY1A 4H2CA 3RM8A 4LYRA 1VEMA 5AYIA 4DUWA 5CPTA 2DT3A 2OSXA 2BHUA 4B15A 3ZO9A 3VMNA 4URIA 3QHOA 4H8UA 2ZUMA 4GI8A 2A3EA 4PMRA 4C7GA 4DUVA 3POCA 3ZT5A 2DSKA 4GO8A 4H8HA 1ITXA 1U33A 3VIFA 1IV8A 1K9EA 3VIHA 3ARPA 4LQ1A 1SR0A 1G5AA 3EDFA 2DH3A 2VC9A 2CHOA 2ZX9A 2D0HA 1UH4A 1P6WA 1ODZA 4BS0A 2J25A 3RILA 2WVTA 5I6SA 1JZ2A 2EJ1A 1SFSA 4U31A 1XSJA 1IT0A 2CBIA 1OT1A 1ISYA 2XIBA 1W3LA 3W6LA 4F9JA 3GXFA 4D6CA 4HPGA 3CUJA 1JF5A 1W2PA 5A2CA 1HP4A 6A3HA 2NSXA 3A3HA 3AQUA 4P8XA 4DM2A 3WL1A 3AISA 5BYWA 1K6AA 1AQHA 1TFVA 4TVDA 3AROA 1HJQA 1FHLA 4OKDA 2VL4A 2WKGA 1CIUA 2WPGA 2JF7A 1LWHA 1UWRA 4UNIA 4TVCA 2YDRA 2O9TA 4M81A 5CSYA 1E0WA 2DQXA 5EFDA 4AZHA 4AEEA 5M17A 4P7RA 1J0HA 2BS9A 2GJXA 5DMYA 3SEPA 4MB1A 4QP0A 5I5RA 2YKKA 4J7RA 4CN6A 5E0FA 3FHQA 1JDDA 3NYDA 4J3WA 5FKYA 4D6FA 4M24A 4X9YA 1W3KA 3NCOA 1W9PA 4BCEA 3NSNA 3THDA 3VILA 1EOKA 4Z2IA 1LF1A 4GIAA 3APGA 3CUFA 3S6TA 3KL3A 3MANA 4GO9A 1BYCA 1UD8A 3ZT6A 4JFWA 4YPJA 1E15A 1QBAA 3AYSA 4OOUA 5CXPA 1JYXA 4P7OA 2Y24A 4JHZA 1UG6A 1Q6CA 3ARRA 4AZIA 4N42A 3VD7A 1J0JA 3CLWA 1PPIA 4FMVA 1W3HA 3W0KA 3WD2A 3T2QA 1GUVA 3ALGA 2V3DA 2GDUA 4JKMA 3UR7A 1PZ2A 2JIEA 3CPUA 3WQ6A 4CD7A 5ABEA 5IFPA 1KCKA 2OSYA 1SYTA 3T08A 4OZOA 1J18A 2WLYA 1KWKA 1CTNA 1E73M 4XX6A 1Q6DA 3KZSA 2J77A 2BY0A 1BTCA 3CUIA 3PZIA 5AY7A 4DM1A 3VGGA 1FH9A 2ESCA 2VX4A 4AZ7A 2J7HA 3EDJA 4WKAA 1BHGA 3AHXA 3WF2A 1E6ZA 1RP8A 1Y7VA 3ZSTA 2JIWA 3SCUA 4CD8A 2X1IA 5A8NA 5ECUA 1C7TA 1OGBA 1CDGA 1EH9A 1I1WA 3CUHA 2VZOA 4TX8A 1A47A 5CLWA 1NARA 5ABGA 4W87A 3WH9A 3PZ9A 3BAJA 1KQZA 2DH2A 3PZUA 1WZAA 3NDZA 2QPSA 4R27A 3WMCA 2E40A 1DP0A 3ZIZA 5HXMA 4M82A 4R5EA 2DSVA 4GZIA 1E9LA 3VIOA 3WDJA 2JEPA 4EANA 5ABFB 1AQMA 1FP8A 4BZYA 1UH2A 1GCYA 1DWJM 4DWSD 3EYPA 2D2OA 3VINA 1UYQA 1UD4A 2BY1A 2OSWA 4CUCA 4RE4A 2Z1SA 3ZJ6A 5CPSA 3PTMA 4Z2JA 4OJYA 2V5DA 1EIBA 3AIBA 1TVPA 1VAHA 1MW0A 1JNEA 5A6BD 5D9MA 2YLAA 1BGAA 4V2XA 3OLIA 3SCSA 2UWFA 5TD4A 3M7SA 2PWGA 1QI5A 4AMCA 4S3KA 4IM4A 3TTOA 2OYLA 1WDRA 4QFUA 1MWOA 1LG2A 4DWSC 2WMKA 2IUZA 2XVKA 1R86A 4UOQA 1V6WA 1C93A 3TTQA 1GPFA 4AXNA 4XB3A 3OLEA 1VJSA 3ARSA 1KXVA 4AISA 2WAGA 3N1AA 2QMJA 2EPOA 1KGUA 5GNYA 4AD3A 2WXDM 1Z32X 5C8BB 4C7FA 1HVXA 4J3TA 1UR2A 4W8LA 3AMDA 5JBDA 3AXIA 1OIFA 3EBVA 2GJPA 1PJ9A 2J7GA 2Y2WA 1JIBA 1JZ6A 2D23A 1V6YA 4PTWA 5I2UA 2VMFA 3PN8A 2JEQA 1VBRA 2VO5A 2YLLA 3D3AA 4RL3A 1WB0A 1E6NA 4UQAA 3ZT7A 3VKKA 1HN1A 2V3GA 3BAWA 3CHDA 1IZKA 4MJ4A 1SMAA 4UZUA 4ACYA 1W9XA 1ODUA 4XUYA 3M6DA 2J7FA 1M53A 4HMDA 3AS0A 4E4PA 4ZE5A 3RO8A 9CGTA 2X2YA 3WN6A 2W92A 3WNPA 1PX3A 1QI3A 4PTXA 4CD6A 4AZCA 4WLCA 3SCPA 4QAWA 4P7LA 1UWSA 4W7UA 3VGBA 4LPCA 3WNKA 3VIKA 4Z2HA 1E3XA 1XCXA 4QLKA 2OYMA 1UR8A 4P7NA 1NM9A 2VZVA 2CBVA 3WD3A 3K8LA 3WMSA 1X6LA 2WZEA 1D7FA 1UUQA 4UOZA 3OA5A 4KGJA 3UETA 1GOKA 2AOSA 2CYGA 5FCZA 2OYKA 4QDMA 1KXHA 1JFXA 1OGGA 5HPOA 3WH7A 4UFMA 1HVQA 4JHOA 1UR9A 3DYMA 3OGSA 4EKJA 1R7OA 1SMDA 2QV4A 5A6SA 5E6ZA 2J7DA 1KB3A 1CGTA 4OUEA 1UWQA 3AIUA 1XD0A 2WHMA 4W5UA 4QCEA 1JZ5A 1W1PA 1PBGA 4W84A 4K68A 3MU7A 5HPCA 4FF5A 2V3EA 3WH6A 3SUUA 1NP2A 1ISZA 3I3DA 3PZOA 2VX6A 4BQ5A 5JBEA 2OLHA 2O9PA 3SURA 5GPRA 3W4RA 3KL5A 2J7CA 2WCAA 2CNCA 3WUFA 1CECA 2D22A 1GOOA 2YL6A 3CIVA 3IK2A 5A2AA 1K9DA 4MDPA 4D1JA 4L4OA 1FP9A 4RE2A 3WNOA 1JGIA 5HBFA 2GVYA 3RMEA 4W8BA 4B3LA 1V03A 4MB3A 1NWTA 4LXFA 4CU6A 4PMOA 2NT0A 1BFNA 4W8AA 4X0VA 1X1NA 1W1YA 1VEOA 1CXHA 1NOWA 2G4FA 1QHPA 3QHMA 2YA0A 3CZEA 4AEFA 4HOXA 2QHAA 1XSKA 1J0ZA 2E8ZA 3O6AA 1QNSA 1DWFM 3A6OA 5HDRA 1H2JA 5DFAA 3WH5A 2VRJA 4CVUA 2CHNA 2J78A 4X0NA 3ZOAA 1E6XM 2VX7A 3CZKA 4Q7NA 4PMVA 3U57A 1W9BM 2QPUA 4CN1A 3PZMA 2VVNA 2WKLA 3N9KA 2CKSA 4HMEA 2Y4SA 2CERA 5LYRA 2UY4A 3MUIA 3SCOA 2OWXA 2PWFA 1CNVA 1TA3B 5CJ5A 5A69A 3CZ8A 3GDBA 3N12A 3LPOA 1GOWA 1W1TA 1W3JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3VTR A;  2WMI B;  1GHS A;  1V3M A;  1FA2 A;  4UCF A;  1HT6 A;  1KGW A;  3AZS A;  1GOM A;  5AYB A;  1C3F A;  4MNK A;  3RIK A;  1DWG M;  4ZEN A;  2AAA A;  1V6X A;  1CXE A;  1UD2 A;  2DT1 A;  1C8Y A;  1TG7 A;  4TVU A;  1HNY A;  4QLL A;  1G9H A;  2BNJ A;  2ZUN A;  1EO5 A;  1WZK A;  1H1N A;  4ZXL A;  4J27 A;  1JDC A;  1MW2 A;  3ARX A;  2WBK A;  3PZN A;  1GVY A;  3N11 A;  1DWH M;  4OIF A;  3WDP P;  1E6R A;  5A1A A;  2A3A A;  1MXD A;  1OIM A;  1M04 A;  3BLP X;  1W9D M;  7A3H A;  3AIW A;  2WMF A;  3UEQ A;  1QOX A;  3LPF A;  1W91 A;  2G41 A;  3BAX A;  3LPP A;  3KL0 A;  3FHA A;  1R8L A;  2W62 A;  4XV0 A;  1MQR A;  1D3C A;  3U5U A;  2PBG A;  4NRS A;  3CMG A;  4M1R A;  5C71 A;  3WDH A;  4GI9 A;  1UHV A;  3MMD A;  4PMN A;  1E43 A;  1HJV A;  2WC4 A;  3VNY A;  3WD0 A;  1WE5 A;  1YHT A;  1LL4 A;  2UY5 A;  3ARY A;  4EK7 A;  3JUG A;  3K4A A;  4PMD A;  3VD3 A;  1CGX A;  5D4Y A;  2ZUV A;  2WB5 A;  3VX1 A;  2WMI A;  3UER A;  5BXR A;  1BQC A;  2D24 A;  2X09 A;  2FHB A;  1Q6E A;  1XD1 A;  3MUY 1;  5I77 A;  2ZUU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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