1CI1A

Crystal structure of triosephosphate isomerase from trypanosoma cruzi in hexane
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
KPQPIAAANWKCNGSESLLVPLIETLNAATFDHDVQCVVAPTFLHIPMTKARLTNPKFQIAAQNAITRSGAFTGEVSLQILKDYGISWVVLGHSERRLYYGETNEIVAEKVAQACAAGFHVIVCVGETNEEREAGRTAAVVLTQLAAVAQKLSKEAWSRVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEVHELLRRWVRSKLGTDIAAQLRILYGGSVTAKNARTLYQMRDINGFLVGGASLKPEFVEIIEATK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of triosephosphate isomerase from Trypanosoma cruzi in hexane.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE)
molecule tags Triosephosphate isomerase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 88
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 1999-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ci1A00
1GPWA 1S5VA 4N6EA 1GT8A 3NEVA 2VFGA 4LY8A 4NJHA 3N14A 4QJ1A 5HWMA 4IQLA 3FJ6A 2HS8A 2HSAA 1TPFA 2VELA 2C16A 1YADA 3F03K 1V5XA 1K7XA 3DU0A 2J27A 1FUYA 2VFEA 1TTIA 1XM3A 3L5LA 2C13A 1N55A 3DGRA 5DXXA 4H6KA 4UMCA 2ISWA 3N9RA 4K8HA 3QH2A 4NNBA 1UUOA 2TPSA 3C2OA 1I45A 5LZLA 1TPC1 3ANYA 3IIOA 2O7QA 3GX9A 3LB0A 5FEPA 3PY2A 2C0AA 2PC4A 5CZJA 2CLFA 4FIQA 3IGSA 3BLFA 4TO8A 1ZENA 1AL7A 3T55A 4A2SA 3C3NA 1SZNA 4WUIA 5LNSA 3FA5A 2LLEA 3BW4A 4WOQA 1F5ZA 3HGRA 1Q45A 1WQ5A 4PH6A 1O94A 1PCWA 4WXYA 2ZZ4A 2DZSA 1ME8A 3S1UA 4O10A 4BWLA 3N19B 5D2XA 2Y7GA 1SZEA 2XFWA 1OHLA 2QEZA 4A21A 4MOZA 2YGYA 2FLIA 3LI0A 4FX7A 4O53A 1H7NA 4JTEA 1QDSA 2Z2UA 2D73A 1WXJA 1SFJA 2C6QA 1IF2A 3W7LA 2C14A 3A24A 4JTLA 3TW7A 5LNWA 3HPSA 4Q33A 4JNMA 3S0CA 3HGJA 3NAVA 2C18A 3KHJA 3NR0A 3UZ5A 4LS0A 3G3MA 2G96A 2O7SA 3DZ1A 1YDOA 3CWOX 1JJKA 3LERA 4UTJA 3W22A 1G4EA 4C1LA 5AOUA 3L0GA 3I65A 3M1ZA 3W74A 3NPUA 3TR2A 4UMAA 4JTHA 5F2IA 3QW4B 1YTKA 2A85A 4NXKA 5DELA 3NL3A 4JIQA 5DBUA 2WSQA 3TSBA 1VHCA 3NOEA 1ML1A 3CB8A 4UUIA 3I7SA 5BOOA 3W1NA 2VKZG 4RJEA 3LXBA 2DP3A 4K7VA 4RZ4A 2VXNA 3S1WA 4GRSA 1OX6A 2A0NA 4IUOA 2QCDA 5G2WA 1DV7A 3EWZA 1AMKA 1G4PA 1EP1A 3DKJA 4XTIA 1DKWA 1SO4A 5I3HA 4FXRA 3ZWTA 1KM1A 3B05A 3G1FA 3FYPA 4GBUA 2W79A 4O28A 3S5YA 2CW6A 4FNTA 5CPNA 2WNZA 2CLLA 2Y7FA 3M5ZA 2YCEA 3I7QA 3G1YA 4HNNA 4IX0A 2PURA 5D04C 1TPDA 2A4AA 3E0IA 5CKSA 2G97A 1SSGA 2OMAA 3HIJA 4O52A 4ADUA 3TUUA 4CQ8A 4DELA 3ZWSA 1YLVA 3G0XA 1XKYA 1JVNA 1EEPA 3GIYA 2BZNA 4NX0A 3LCLA 4OT7A 2CFFA 3OVQA 2ISVA 4XKYA 1A53A 2Y7EA 5KITA 5BNKA 3QFEA 4PL1A 1I2RA 3N34A 1VHNA 3W85A 2ZA1A 3QMSA 5I3GA 1WA3A 5DLCA 1GG0A 2IQTA 3USBA 4MY8A 2WV8A 4O54A 2FFCA 3W7CA 4CNOA 2Y6ZA 4MYAA 4JY8A 3RLUA 1MEIA 1DOSA 3TROA 1GJPA 2KZHA 3P5ZA 3P61A 1GEQA 2B7OA 3TC7A 1S3HA 2BLEA 4UTWA 4XZ9A 2RKXA 3H55A 5LNRA 1OYCA 3CLMA 3TC6A 3WJXA 4PL2A 5K9DA 1JCMP 2C19A 2NXGA 1FWRA 1JQVA 1I4NA 5EMUA 1WAUA 4IMEA 4N2YA 2ZZ7A 1KM2A 1F6PA 4TIMA 1FWSA 3BVJA 1B9BA 3HG5A 1EP2A 1H51A 3LHUA 4IPIA 3THAA 3LCHA 5BMWA 1EB3A 1Y0EA 1FCBA 3DFQA 3DHFA 3IVSA 3L5MA 3L67A 3EWXA 4TX9A 5H2ZA 1AW2A 4HNTA 1SPQA 4EF9A 4NZFA 1YXYA 1GOXA 2QKFA 1LBFA 3R13A 4K7YA 4EIVA 1F6KA 2RDTA 2CLIA 5U4NA 1TYGA 1KTNA 1LORA 4LVAA 4QISA 5C54A 2OX1A 4UTUA 2FQIA 1C8VA 3EEGA 2C1HA 2A7NA 2JK2A 1Z41A 3O6CA 4IPJA 1FWNA 5TQLA 3QQ0A 1F74A 2DORA 1FX6A 4MFDA 4O0KA 1TPUA 3QMRA 4RLIA 1JULA 3L0KA 4Y8FA 1JCLA 3DXIA 3SFKA 4OQVA 3CEPA 1G67A 2A1YA 4WOZA 3T4CA 5BMXA 5HR6A 2B7QA 4S2BA 3W71A 5G4EA 2EF9A 1K03A 1XUUA 1AW5A 1LBLA 2E6DA 3L66A 1M7PA 2YW4A 5A8GA 3U6WA 3GAKA 1FXPA 1B57A 2FIQA 3BW2A 4JS3A 4KFPA 3W7RA 3S5OA 4XTDA 4JYDA 4AVFA 5HWJA 5D2YA 1TPH1 3QZEA 3UWWA 4FNQA 1G69A 4ZZ9A 3R2GA 3PBYA 1F73A 4PEKA 4WY0B 1LRQA 3TIMA 2ZRUA 3GKFA 5FF7A 3W76A 4AWSA 5IM51 5FF2A 3MP3A 5A5WA 4P2VA 4MFEA 5U7SA 4QAIA 1B3OA 3WJZA 2W0UA 2I9EA 3LXCA 3C2EA 3DFOA 3N73A 4AXKA 1OK4A 3GYEA 4S2CA 1NEYA 1KFCA 4FF7A 4NJKA 4Z1DA 4I7WA 4GUIA 2DU2A 3G8EA 4UNLA 2JKAA 2FB3A 3O1NA 3W7IA 3NZ1A 5HWNA 3TMQA 3HG2A 3HGSA 3KOFA 3M0ZA 3LCWA 2GQ8A 1BKSA 1QNVA 4HIBA 2FTPA 2V82A 3WJSA 1WBHA 4YLWA 2R8WA 3A5VA 1H7XA 3W23A 1D3HA 1F7BA 1O60A 4O1BA 2NUYA 3THQA 4IJBA 4PTNA 1UB3A 3MYOA 3MP5A 5C5YA 1O4UA 1QPRA 5I3KA 3C2VA 2ATMA 3BPWA 1V7YA 3CEUA 3LLFA 2YYUA 3MP4A 3RNDA 4O16A 4X2RA 5DXYA 2F7FA 5CG7A 3N2MA 4K39A 1SW0A 3LHTA 1A5AA 1MZHA 3LTYA 4R53A 1T99A 3W86A 4CQAA 3OIXA 1OFQA 4WQ6A 4N9DA 4FNSA 4IWWA 3CM4A 4O18A 1B4EA 1PS9A 2EGZA 1O5KA 3LXAA 2X1SA 1G7VA 1LDCA 4BI7A 4QM1A 3W87A 3L68A 1P5BA 5KINA 2P1FA 4E2DA 3OEXA 4O4VA 2CZFA 3FOKA 1ZY9A 3KAOA 1H7WA 5J5RA 4X9SA 4N9CA 1WX0A 3Q58A 3FKKA 2V5BA 1OFDA 2Y70A 3I6RA 3W1MA 2QR6A 1OX4A 5KMYA 1MEHA 3PB0A 1SUXA 3O05A 4HSOA 1W3NA 1ME7A 4L4LA 1JCXA 1ICQA 3A5FA 1KM6A 2UV8G 3S1XA 3VE7A 3PUOA 4ZQPA 1VS1A 2NWSA 3O63A 3O06A 5HMSA 2V0TA 5AYYA 1BEUA 4NZJA 4CLMA 4ICNA 2E5BA 2DZTA 1JQXA 3STFA 4JR5A 2ZZ5A 3VE9A 2WPBA 1JRCA 1RPXA 4QNEA 4BI5A 2VENA 3W1PA 3UWZA 1TPB1 3ATZA 3FYOA 3EX6A 3G1AA 2Q8LA 4MIMA 1VYPX 3W1QA 3WK0A 1H7RA 5CZSA 4PODA 1FWWA 1EX5A 3NQFA 4RKAA 3QM3A 4U4MA 1K02A 2V30A 3MHGA 3W7KA 1OYAA 5DCDA 4CCCA 1OYBA 2E09A 2BTMA 2CLMA 4G1KA 1AW1A 2V81A 1W8SA 2XN2A 1Z48A 3MHUA 1RQHA 4LVDA 1X1ZA 1OFRA 3IGXA 2AAMA 4UC5A 2ZZ6A 3S8HA 4JX4A 3TE9A 3SGZA 3PB2A 4LT9A 3BK0A 3P81A 4GUFA 3HF3A 1J5TA 2P0OA 3L9CA 4POCA 3IRDA 4EOUA 1OK6A 1TQJA 3KVLA 3M47A 4N4QA 1W31A 3FIGA 1THFD 1QOQA 3W72A 3LRMA 3VKJA 4O50A 2EHHA 5DBTA 2GPTA 1ZHAA 2V5LA 4UTHA 3ATYA 4AF0A 2BX7A 4JYFA 1EIXA 2VC6A 4ZQOA 1YXDA 3HO8A 5AHNA 4IX2A 3IV3A 3IIPA 2QUVA 4BFAA 1L6WA 3CQ0A 4K8EA 3TMLA 1TPEA 3GR8A 4XWUA 4IGHA 2YW3A 5EY5A 3KXQA 1QPQA 2Z6IA 4ZQRA 5LKYA 2Y63A 3NPVA 3CWNA 1OFOA 1LM1A 3QC3A 1ZAJA 3DFNA 3KFTA 3LTSA 2NWRA 2Y85A 3TSMA 5G4WA 4HN4A 4UTKA 1GVOA 2NX3A 2Z6JA 3GNDA 1S5WA 4LC6A 2NUXA 1JCYA 4NJJA 3T40A 1PL9A 4AAJA 4MZ1A 3EKZA 2GVJA 1KV5A 4NVTA 4M7TA 3MMTA 1PV8A 1G6CA 4DF0A 1FDJA 1DQXA 2RH9A 4AB4A 3G0UA 4JTGA 5K7JA 3W1LA 1MSSA 5DCBA 2HMCA 2VFIA 1ONRA 4RX0A 1NSJA 1E51A 1IXOA 4FB7A 1K8YA 2Y7DA 4Z0SA 1KFJA 2GUUA 5LHFA 2GJLA 3UYCA 5GVJA 3W1UA 4JX5A 1XBXA 5IBXC 3LOTA 1Q6LA 3LHWA 1LRNA 1WDWA 2C3ZA 3P7YA 4ONVA 4JD4A 4AHPA 5FEWA 1NF7A 1LROA 3JR2A 4EF8A 4UTTA 3MBFA 3I68A 4UFJA 5D37A 3SW6A 3SJ3A 3W1AA 2Y88A 3IVTA 3O6DA 3T7VA 3TU9A 2ZRVA 3V75A 2DZPA 3W7HA 3FFSA 3E9AA 2A21A 4H4IA 2NX9A 5D2WA 5K2ZA 3GXPA 3G18A 4NU7A 5MHBA 3TQ0A 1LOSA 3L65A 1L6SA 3LHZA 1WV2A 3LDVA 1QPOA 3CTLA 4NNCA 1PIIA 1K8XA 1LCOA 3B04A 3EXSA 1IIGA 2DZXA 1DBTA 1XBYA 3NM3A 3TXZA 1SU5A 4X3ZA 4K37A 4GUHA 1OFAA 1KBIA 1SR9A 1H50A 1R46A 1M7OA 3I7RA 5CPMA 4FHAA 2V2DA 3F4NA 1GVFA 1JUEA 2HTMA 1QMLA 2WNNA 2QDHA 4DEFA 3CIXA 3MI3A 3GDKA 5AHIA 5I3IA 4L4MA 1TO3A 3S5NA 1PHQA 4Y9AA 2X1TA 2Z1BA 3UPBA 2NLIA 1XFBA 2YR1A 4FNRA 3P82A 3IIXA 4DPPA 5CPOA 3NQ8A 4LS1A 1IXQA 3NQCA 1KBJA 2C15A 3UD6A 4FX6M 1U83A 3NPXA 3JRKA 2W6RA 1C9DA 3LCFA 3W75A 1TTJA 2V2CA 1K8ZA 5K4ZA 1TRDA 1OX5A 3DFSA 1VCVA 1W54A 3V1PA 1A5CA 3MWAA 3WJYA 3QSRA 3QW3A 1W5QA 1P0KA 5DN1A 2J24A 1TREA 5CGQA 1I2PA 2A5HA 5DY3A 2YSWA 1XC4A 5CZ0A 1W5NA 4XQ6A 4M6PA 4ZQCA 4IMGA 1DHPA 1TTQA 3SIZA 2E6FA 2QUTA 3RF9A 3VNDA 5AN7A 1T96A 3G1XA 3MW7A 2WKJA 2ZTKA 1W0MA 3NQMA 4IXHA 4Y96A 5HNRA 5FEXA 3W7PA 1R47A 1KM3A 3GDRA 4JTIA 4Z1AA 2CWNA 3W3OA 1GVRA 3ABSA 1M6JA 2B7PA 5KZMA 3MBDA 2R14A 1W3TA 4O17A 3C56A 3KVMA 2ZRYA 3RLVA 3EWWA 4DO4A 4OGZA 4ZVJA 5HR7A 3LHYA 3PAJA 4NX5A 1KTBA 2JKEA 4JXCA 5TIMA 3SGUA 1KM5A 3NQDA 3OA3A 4XKYB 3QRHA 5DCEA 2VFHA 4R34A 3W84A 1AL8A 1X8FA 3NQ7A 1J4EA 4MUZA 3LV6A 4KKXA 1Q6OA 2GQAA 3L5AA 2PRHA 3HMJG 4YCOA 2H8ZA 4LRTA 1VYSX 1DQWA 3EB2A 3NNTA 3W83A 3AJXA 2FPYA 4O1DA 2A6LA 1CI1A 1GVSA 2ZZ3A 2QCLA 1K7EA 4O14A 2GQ9A 4M7SA 1L2UA 4HPXA 4PCFA 4MLRA 1DVJA 4O15A 3EX1A 2ZTJA 3PBWA 2J6XA 4UTTC 2YPIA 3PSVA 5CSRA 2ZZ2A 1AK5A 3GDTA 4RZ5A 1YXCA 2XN0A 4B5NA 5LNUA 3OHIA 1ME9A 1TV7A 3HGOA 1Q6RA 3B4UA 1R30A 4LRSA 2J9YA 3NPWA 4GWEA 2ALDA 3G0SA 4RV8A 5E0KA 5FF3A 5EA9A 3W2JA 2AGKA 4N02A 3E02A 3RMJA 1KA9F 3SECA 1UCWA 5AC6A 1OFPA 1LLWA 4JTJA 1RQBA 1UJPA 3W9ZA 1SZFA 3IIVA 3B0PA 1KFKA 4FNUA 5F2LA 3R5EA 1F2JA 2GOUA 3TA6A 3C2FA 3TAOA 2F84A 4WJEA 3W7GA 4LOCA 1PCKA 2X16A 5TBOA 1G4TA 2E5DA 4XBSA 4HKPA 4HNUA 4D2JA 2VEPA 1OF8A 3R12A 4CQ9A 1HFBA 3VI2A 2OJPA 3NO5A 4WY0A 1JUKA 4AEOA 1TTPA 2I14A 1X6UA 3KVKA 2DZWA 3O16A 4DQWA 3E12A 2V2HA 2FPVA 1EUAA 1Z42A 3C2RA 1H1ZA 4RR4A 4Y90A 3NZRA 3W1TA 1A5SA 4JTTA 1W3IA 3CIWA 3YPIA 4ORIA 5BRBA 3LI1A 3W1XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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