1DOSA

Structure of fructose-bisphosphate aldolase
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
358
structure length
343
Chain Sequence
SKIFDFVKPGVITGDDVQKVFQVAKENNFALPAVNCVGTDSINAVLETAAKVKAPVIVQFSNGGASFIAGKGVKSDVPQGAAILGAISGAHHVHQMAEHYGVPVILHTAKKLLPWIDGLLDAGEKHFAATGKPLFSSHMSEESLQENIEICSKYLERMSKIGMTLEGCTGGEEDGVDNSHMDASALYTQPEDVDYAYTELSKISPRFTIAASFGNVYKAGNVVLTPTILRDSQEYVSKKHNLPHNSLNFVGSGSTAQEIKDSVSYGVVKMNIDTDTQWATWEGVLNYYKANEAYLQGQLGNPKGEDQPNKKYYDPRVWLRAGQTSMIARLEKAFQELNAIDVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Novel active site in Escherichia coli fructose 1,6-bisphosphate aldolase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
molecule keywords ALDOLASE CLASS II
total genus 131
structure length 343
sequence length 358
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 1996-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1dosA00
2NX9A 3STCA 3G1SA 2ZRZA 3QJAA 1FCUA 1SU5A 1V5XA 5EY5A 4UTWC 3W86A 1A53A 4CNNA 1WV2A 2NV1A 3S1WA 4FEZA 4FB7A 5HWJA 4Q4KA 3N2XA 3I7SA 4H4IA 4PL2A 2KZHA 2B0MA 1VLWA 2A1YA 1KLZA 4CQ8A 2P10A 3IRDA 4O14A 3TDFA 4GJ1A 4IMGA 5CPLA 1I2PA 1J4EA 4GRSA 3UY7A 1SO6A 2CU0A 1ML1A 3M16A 3G1VA 2Y89A 4JR5A 2V2CA 3MI6A 3NL5A 3NQVA 1T99A 1VHCA 1LROA 4O1CA 4DELA 4JTUA 1QAPA 1YTDA 4R53A 4Z1AA 5AC8A 1RR2A 3W1PA 3WJXA 3LI0A 4FO4A 2R91A 4LVDA 3DHFA 3CWNA 1B3OA 4RZ6A 4UTTA 5D05A 2YW3A 1XL9A 1SZNA 4S2BA 4MZYA 2PRLA 4PFMA 3S0CA 1OFBA 3S1VA 2BLEA 3TAOA 1UBSA 3DFSA 3HB9A 5E0KA 3S5ZA 5K9DA 3ZWSA 2CLEA 2NUXA 4HIBA 5LGXA 1SO3A 2NUWA 3W3OA 5TBOA 3W7KA 4CNOA 4GNJA 4YXGA 4TX9A 4EWND 1G7UA 2CFFA 3E96A 3GDMA 2YX0A 1TTIA 3LOTA 3W74A 2FB2A 2Q3RA 3PUDA 2VFGA 2OJPA 3UWWA 4NUWA 4FNTA 1VCVA 3DI0A 2ISWA 3P60A 4XTIA 4HNUA 3UWUA 1ZNNA 5K9XA 1H62A 3C2RA 3M7WA 3NYZA 3RU6A 3LCHA 1WX0A 3NZRA 1OABA 2ZRVA 2WQPA 5DXYA 3IGSA 5K4XA 2QJHA 2Y7DA 3KX6A 5AC7A 3OVQA 1PVNA 2X1SA 1DL3A 1VGAA 1GVFA 1K8YA 2ZZ3A 5DELA 2C15A 3C2VA 2Y61A 3TX9A 4Z0JA 5FF0A 1SR9A 3FFSA 4NJJA 1DKWA 4JX5A 3WK2A 3LB0A 3UNDA 4C1KA 4N4PA 2JK2A 4DEFA 1TJPA 1WQ5A 2YSWA 4LC6A 5DXXA 4O1DA 3NQMA 4J9JA 4DPPA 2OZ0A 3Q37A 4BI6A 3PULA 2V81A 2ALDA 3U2OA 3OG3A 2VFIA 3L5LA 2V2DA 1MO0A 1HTIA 4GUIA 1S5VA 4N9CA 5DY2A 4TU1A 3S9YA 3W1RA 1DVJA 1GWJA 3W1MA 1I2NA 2JKEA 4LY8A 3W1NA 5LNSA 2VEIA 4ADSA 3SFKA 3EWYA 2WSYA 1JCYA 5IBXC 2E09A 3L9CA 5DY3A 1MSSA 5K7JA 5LHEA 1W0MA 4JYDA 5DBTA 2ZFAA 5C5YA 3LRMA 5I3HA 1QPNA 2IQTA 5HULA 1H5YA 4WOQA 3M47A 2Z2UA 3G18A 1J2WA 4TO8A 1R30A 5AHEA 5HUOA 5K4ZA 3W7CA 5TIMA 3ZWTA 1FDYA 1N7KA 4X2RA 1A5BA 2CLMA 1B57A 3QH2A 4E2BA 1K7XA 2DJLA 1D3GA 4DF1A 1RD5A 3TXZA 1I2QA 3C4UA 5CKSA 1DOSA 2VXNA 1OVDA 3B04A 3UWVA 2J6XA 5E1QA 3MI3A 3FIGA 3P8JA 1H7NA 3HPXA 1VLIA 4JY8A 2H8XA 4DF2A 5AOUA 4E2DA 3G3DA 2CLHA 3U8GA 3N9SA 3DU0A 4AHPA 3QMRA 4UR8A 3PB2A 2TRSA 5E93A 3QF0A 4IWWA 2PRMA 2PC4A 1TPWA 1QO2A 5HR7A 4Q32A 4DPQA 1Q6RA 1Q6LA 4K39A 5D37A 5HR6A 3S1UA 1J5TA 1WAUA 4Z1BA 2EKCA 3SIZA 1VRDA 3LXBA 3CLMA 4FNUA 5D02A 4ZVJA 4H3DA 4O10A 3L5MA 4OV4A 1O5KA 1N8FA 3DFPA 1TQJA 1V7YA 5D04C 3KHJA 3NM3A 1KFJA 1ZHAA 3HGSA 1K3UA 3SECA 1RZMA 3KVLA 3TQ0A 1TRDA 3WJSA 3EWXA 1HG3A 3LCIA 3LV6A 3R89A 4Z0SA 4RCXA 4CCCA 1S5TA 2E68A 1NF7A 3LI1A 3FEMA 4IPJA 1LLWA 4O11A 3VFLA 3HG3A 4O54A 3T40A 3WJYA 2V5LA 1A5AA 2BWGA 3BW3A 1G4TA 3MP5A 3W76A 1OX6A 5D38A 4WXZA 1XXXA 1OFOA 1MZHA 4Z1CA 5CZSA 5J5RA 1TCDA 1TTPA 2GQ9A 1LOLA 4M7TA 3MHUA 2ATMA 1IXNA 1SSDA 2JKPA 3BLEA 1A50A 4LT9A 4UNLA 1DQXA 3SSJA 4PA8A 3STGA 2I9EA 3ELFA 2C3ZA 5HWNA 1EP2A 2QCCA 3PY2A 3USBA 1W5QA 2ZZ6A 2FPYA 1TRIA 3E02A 3M44A 5AHMA 4WY0F 1K7FA 3W88A 2Y6ZA 4E0CA 2DZTA 2QJGA 2DORA 5FF7A 4OQVA 4EOUA 1XBZA 3NA8A 2E5BA 5F2LA 1SZEA 1SO5A 4WOZA 3M43A 3MYOA 4YCPA 3DGRA 4N9EA 1D3HA 3W2MA 2B7OA 3QPYA 3NQAA 4ORMA 1F5ZA 3QW3A 4AAJA 3TXVA 3FKKA 1Q45A 3G22A 3EX2A 1KFLA 3TK7A 1TPB1 4PC8A 4A2SA 1TV7A 2DZVA 1THFD 4LTSA 1SW0A 1OX4B 1ZALA 1VYSX 1F76A 5BMXA 3P62A 5CPNA 1SSGA 2V9DA 3MBFA 3TW6A 5EA9A 5FEPA 3C2OA 3NQCA 3W73A 2QCLA 2R94A 2AAMA 1QCWA 4JTLA 2Y7GA 3M0ZA 2R8WA 3TV8A 2PRHA 2EPHA 3G1HA 1AG1O 3P61A 1H60A 3IV3A 3OHIA 3W7JA 4JY9A 4IXHA 1Q6QA 1G6CA 4CLMA 1GPWA 1GVOA 4JTTA 1RVGA 4JTGA 2X30A 4Y9AA 1TV8A 3NO5A 1RQEA 4FF7A 4AMAA 1EA0A 4G1KA 2QUUA 1EEPA 3M41A 4UMAA 1PHWA 4LVAA 1PE1A 2TSYA 5I3JA 1K7EA 3C52A 3PBVA 3V75A 4FNPA 1TIMA 3BW4A 1G4SA 3GAKA 4ZL1A 1TB3A 5F1VA 3GK0A 2DU2A 1DBTA 3UPBA 1UJPA 3W2NA 3R13A 3EXSA 5KZDA 5DCEA 3B0UX 1VYPX 1ME9A 3C2FA 5SWUA 1VJIA 1SW3A 2RDUA 3MUXA 1BWLA 3MBDA 5C6MA 2EHHA 1P0KA 1TTQA 3LRKA 4U4MA 3DKLA 5KSWA 1W5OA 4LVBA 3UZ5A 3W87A 3MMTA 1R2TA 1T96A 3HPZA 3PUOA 2NV2A 3PBUA 3P8IA 4MUZA 4OBTA 3P67A 1DJQA 2Q3OA 1ZFJA 4KFOA 2CZ5A 3W7MA 4UNKA 1TTJA 1H1ZA 1JCNA 3QYQA 5D32A 2WV8A 2DZWA 3EX4A 4XUGA 3GDTA 1SUXA 1OK4A 4M6QA 2J9XA 4WY0B 1IGSA 4IMDA 2QCGA 3IEBA 4WQ6A 4MOZA 4MY8A 5L6UA 1NF0A 1KV8A 1OFRA 1WXJA 3TJXA 1WDWA 1X7FA 2C13A 1JCJA 1K03A 1I2RA 4OGZA 1KM0A 4UFHA 4QIUA 3GDKA 4KFPA 3GLCA 5HQEA 2QUTA 2YW4A 3LXAA 3E0IA 2YZRA 3LLFA 3PM6A 1H7WA 5HJLA 1L9WA 2OMAA 3L66A 1FXQA 2YR1A 2GVJA 4BR1A 3UWYA 4KFNA 3O63A 1JCMP 5G2WA 3ABSA 3MP4A 3H55A 5EYWA 2HMCA 1EP3A 1VCGA 3W85A 4QITA 4FXSA 4UTHA 3CT7A 4MY1A 5H91A 4JTJA 2G5WA 1GTEA 3W1UA 1BKSA 1MEWA 2B7PA 3BLIA 2XN1A 4K8HA 1H61A 5AYZA 5FI8A 1EUAA 1L6WA 4DO4A 5AN7A 1LTDA 4LUIA 3W7EA 3PC0A 3KVMA 4JD4A 3GB6A 3W1AA 1GG0A 1C8VA 4RR4A 5FF2A 2VFFA 3LM7A 2QCNA 3HG2A 1JJKA 5G4EA 4M6PA 3MJYA 3QQ1A 2OX1A 4O50A 4ZQPA 1AL8A 1B4EA 3T55A 1WYIA 4E38A 4K38A 2VEPA 4NQ1A 4TR9A 4JYFA 5LNVA 2AGKA 4EIVA 4PODA 3G1XA 3TW7A 3THQA 3NPVA 1N55A 1TPUA 4MFDA 3ZS4A 3NM1A 3S42A 5LZLA 2C6QA 4AHQA 4MYAA 3NVTA 4BK9A 2RHGA 1OX5A 3VI2A 1IXPA 2WOQA 1TPVA 3G1FA 3HGRA 1GVQA 1VCFA 2A2IA 2E6FA 1KW1A 5KITA 1XFBA 1EP1A 5HNRA 2Y7EA 3ABOA 3WK1A 2ISVA 3W2JA 1X1OA 3C61A 3GDRA 1XBYA 1FWNA 4NNBA 2ZA2A 2H8ZA 4MPQA 2HS6A 1TREA 1ZAIA 4LRSA 3EKLA 4N6FA 3W2UA 3LHZA 2J27A 4UFMA 1VQTA 4RK8A 4ADUA 1CW2A 2Y85A 1WOBA 3MHFA 4MZ1A 3H54A 2V30A 4JGDA 3W7DA 1XDMA 3HIJA 4LRTA 4O1BA 2FDSA 4I9AA 4IMCA 1LYXA 1Q3NA 3DFOA 1W37A 3RFAA 1FUYA 2V2HA 3BLFA 4NNCA 5EKYA 4HPJA 4QJ1A 5CZTA 1I2OA 1YTEA 3G8RA 1TQXA 2Y7FA 2NWSA 5DN1A 3C2EA 3IGXA 1OFAA 2ZZ1A 4LV4A 2NXIA 4UTUA 1NFBA 4PCFA 2A4AA 3QSRA 4PTNA 4DF0A 3TA6A 3SGZA 3TJLA 1KA9F 1SZFA 2ZZ7A 2Y70A 2Z0IA 1ADOA 1AMKA 4AF0A 1QOPA 3A5FA 4CCDA 1XUZA 3MP3A 2BX7A 4X22A 3TFCA 4ZQCA 4XBKA 5BOOA 1GYNA 2G95A 1FWSA 1F6PA 4RKAA 5LGZA 3TQVA 5AHFA 3CWOX 1ME7A 4K6AA 1OYCA 5TQLA 3TC6A 1VPXA 2B7NA 2RH9A 4BWLA 4JTKA 3W23A 4OHQA 1K8ZA 5U7SA 1GZGA 4O16A 3P5YA 3A9IA 5LKYA 4MLRA 5F4XA 1RQBA 3ABRA 1OG0A 3W7GA 3GVGA 3IVUA 1LRQA 2E6AA 2A6NA 2A21A 3L65A 1VS1A 5DLCA 4O4VA 3W7RA 4UTIA 4I7VA 1OYAA 3PS7A 5K2ZA 5D2XA 1TPH1 3F03K 2X1TA 1QOQA 1SPQA 1PCKA 2E6YA 3SW6A 1GJPA 4O0ZA 3VKJA 5C54A 6TIMA 3YPIA 4UC5A 3GNDA 4DBDA 2W79A 2ZRXA 3W6YA 4M6VA 5F2MA 1KM4A 3R2GA 5F4WA 2ZRYA 1BWKA 2VEMA 3DAQA 3NL2A 4H6KA 1XI3A 2CW6A 1KTNA 3GX9A 3JRKA 1TPDA 3F4NA 3LBCA 2LLEA 3NEVA 3BGGA 5D2VA 1VC4A 3W1LA 2PURA 3W1TA 3LTYA 3C56A 4XKYA 2YFOA 4FHAA 3I65A 3CQ0A 3MO7A 4MKNA 4Y96A 1R47A 1EPXA 1OHLA 3A21A 1LRNA 4OE7A 3QW4B 1FQ0A 2BSLA 2QCFA 2BTMA 3TC7A 4UFJA 1LORA 3Q58A 1HL2A 2TYSA 4AHOA 5H2ZA 3PUEA 4XTDA 1I45A 4HKPA 2W0UA 4O0KA 2J9ZA 2NWRA 5MHBA 3KXQA 3W84A 4UTLA 1GT8A 3QFEA 4MLJA 2V5BA 5LNRA 3M1ZA 2E5DA 1O95A 3N34A 3T44A 3GR8A 3UWZA 1ZAJA 3FYOA 3UZJA 5LHFA 4CQAA 4A2RA 3BGJA 4AWTA 5CZ0A 2VELA 3R8RA 1QPOA 5AHNA 3MW7A 3NZ1A 3FOKA 4MZ8A 4EVZA 3GKAA 3BV4A 3OA3A 2QKFA 1P5BA 3KRSA 4NX5A 2I14A 4QQ3A 1PIIA 1BTMA 4UMBA 1YXYA 3LRLA 3NQ8A 4R7JA 1ZY9A 5KMYA 5K3VA 3NQ7A 1YXDA 1AW2A 1F2JA 4JDBA 2QDGA 2ZYFA 1LLZA 4GC4A 3L5AA 3W83A 1OFPA 2F84A 3NPXA 3PAJA 4JEQA 3DFQA 3FYPA 4ZQOA 1VYRA 1NEYA 3SI9A 5LNWA 4N9BA 1JULA 2ABBA 3B4UA 3RLVA 4C1LA 2J9YA 3WK3A 5F2GA 3P84A 2O7SA 2C0AA 3UXAA 3LCFA 1FCQA 1W31A 3VNDA 4UCGA 1UASA 3LCXA 2DP3A 3FLUA 1M6JA 2GPTA 1EX5A 2G97A 3CIWA 5FEWA 1W5MA 3DI1A 1C29A 4N4QA 3EX3A 5G5IA 4A3UA 3P5ZA 1U5JA 3H53A 3GXNA 5KINA 4MFEA 1FWRA 3NQDA 3QM3A 2HS8A 3C3NA 3O6YX 2OT1A 3BW2A 3I68A 2Z6IA 1LDCA 3R12A 1JRBA 1R46A 3IIXA 3V1PA 4JTSA 1KFEA 2FFCA 1OK6A 3RMJA 2A7PA 4IMFA 1JUBA 1ICSA 3G24A 4IOTA 4FX7A 1L6SA 2C14A 1FXPA 1WOAA 3WFAA 1OFEA 3JS3A 3QMTA 3W7IA 1LP6A 2YXGA 3GDLA 3HGJA 1P0NA 3LGEA 1P1XA 1YPFA 1GYLA 3S6DA 5FF4A 4JDYA 3UQNA 3KRUA 3TU9A 3IIPA 5C55A 4BWLC 3BPWA 3HGOA 3SJ3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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