1DOSA

Structure of fructose-bisphosphate aldolase
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
358
structure length
343
Chain Sequence
SKIFDFVKPGVITGDDVQKVFQVAKENNFALPAVNCVGTDSINAVLETAAKVKAPVIVQFSNGGASFIAGKGVKSDVPQGAAILGAISGAHHVHQMAEHYGVPVILHTAKKLLPWIDGLLDAGEKHFAATGKPLFSSHMSEESLQENIEICSKYLERMSKIGMTLEGCTGGEEDGVDNSHMDASALYTQPEDVDYAYTELSKISPRFTIAASFGNVYKAGNVVLTPTILRDSQEYVSKKHNLPHNSLNFVGSGSTAQEIKDSVSYGVVKMNIDTDTQWATWEGVLNYYKANEAYLQGQLGNPKGEDQPNKKYYDPRVWLRAGQTSMIARLEKAFQELNAIDVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords ALDOLASE CLASS II
publication title Novel active site in Escherichia coli fructose 1,6-bisphosphate aldolase.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 131
structure length 343
sequence length 358
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 1996-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1dosA00
3USBA 3P81A 4N02A 3KVJA 1FUYA 4JY8A 1W56A 2NUXA 3U6WA 4NQ1A 4R7JA 4RJEA 4ZL1A 3C4UA 3UWVA 3JRKA 4ZQMA 4CCEA 1P5BA 1YPIA 4QM1A 4O0KA 2B7PA 1R47A 1FX6A 1TTJA 1OFOA 2ZTJA 3W7HA 2ZRWA 3N2MA 5KITA 2ZZ7A 4H3DA 1ICQA 1A50A 2WO5A 3LHUA 3THQA 2CLIA 3BARA 1IIHA 2KZHA 3DBPA 1SZFA 3QPYA 3S1VA 2DU2A 4JTSA 3LI0A 3LCGA 4ML9A 3U2OA 5G4WA 3W1XA 3TMLA 3VE7A 4I7UA 3IGSA 1OX4A 2H3DA 1KM4A 3P62A 3EWYA 1TQJA 3M7WA 1G4SA 4FNUA 4XTIA 3W7QA 3TSBA 1PV8A 5K4XA 4I9AA 1O60A 3RLUA 1P0KA 2B4GA 1KBJA 3NPXA 4S2BA 4XWUA 3MUXA 4JTTA 3BG5A 2ZBTA 4LVDA 3M0ZA 1CW2A 5AYYA 4MZ8A 3EX1A 3SIZA 2V0TA 2V9DA 3DENA 5FEXA 1WOBA 3LHTA 3C6CA 4LWWA 5IBXA 5KSWA 3GNNA 4UMCA 3IIPA 1GVFA 2YW4A 3PB0A 3P84A 3U8GA 2J9ZA 1F76A 4IPIA 4UTIA 4MYAA 3CHVA 3M1ZA 1J4EA 5K9CA 3FJ6A 3NR0A 3V75A 4FEZA 4LC8A 2VELA 4JY9A 5F2IA 3W1PA 3CTLA 1DL3A 5J5DA 5G2HA 4ADTA 2HS8A 4RK8A 3ZR4A 4QQ3A 4M6QA 4O1CA 1JQXA 4O14A 1QCWA 4TX9A 4NU7A 5FEPA 2LLEA 2ABBA 4W9TA 1ZAIA 4JYDA 3GYEA 3DKJA 4RZ6A 5EKYA 3STGA 3M6YA 2VEPA 3GVGA 3WJWA 3R2GA 5LNRA 3EWXA 3B8DA 3HB9A 2GOUA 5DLCA 1MXSA 2GQ8A 1IIGA 3L0NA 1FCQA 1IGSA 2XN1A 5G1YA 1FCVA 3TW7A 3SGUA 1GT8A 2QJIA 3EX2A 3FKKA 1EWDA 1I2QA 1ONRA 3W2MA 1VHCA 3TK7A 3OA3A 3ATYA 2NLIA 4ZMGA 3LCIA 4MLRA 4FNRA 4DEFA 4AHPA 1RQHA 1ALDA 2PCQA 3HG4A 1U83A 2A0NA 3NL6A 2WQPA 3DHDA 1VZWA 2EKCA 3OEXA 4IMGA 2Y63A 3TIMA 3L2IA 1HO1A 1L9WA 2G95A 5LZLA 1Q45A 1BEUA 2WJZA 1O4UA 5CGQA 1XBZA 1UCWA 4FO4A 4KFNA 2JKAA 2QCFA 2O7SA 4DPQA 3LGEA 5F4WA 2Y7EA 1TJRA 3B0UX 4GFSA 4M7SA 2CFFA 2YDAA 3BLEA 5HINA 5DBUA 3E49A 4UNKA 2CLKA 4IX2A 4MJMA 3SY5A 1L6SA 3LBCA 3NQ2A 1W1ZA 1QPQA 1Z41A 4OHQA 3RNDA 4MFEA 4JX4A 3MHGA 4O15A 3PR2A 1J5TA 1SU5A 3GZ3A 3EWZA 1KTCA 5HUOA 3UPBA 2F84A 3BGJA 2YSWA 4N9EA 2AQWA 1TO3A 2OJPA 4O1BA 3TC6A 2QCLA 2V81A 3GDMA 4WD0A 5DY2A 5D03A 2H8XA 3VI2A 2QJHA 4UFJA 1P1XA 1B9BA 1W5MA 1DQXA 2CZEA 3GNDA 3TFXA 1TV7A 4HNTA 3MBDA 3NQCA 3W23A 5BNKA 1W54A 2A4AA 4MZYA 2Q8LA 1ZENA 4A22A 2ZCGA 3E9AA 4C1LA 1SFLA 2GQAA 3PSWA 2QCGA 1DQWA 1EUNA 1LTDA 3QQ1A 3GAYA 4O19A 2GVGA 3TJLA 5KZDA 2G96A 3T55A 2QUTA 4MJZA 1F74A 2RDUA 5E0KA 4AEOA 5A5WA 4O10A 1F7BA 1Z44A 5HR7A 2VENA 3BO9A 4JR5A 1B4EA 5AOUA 1CX9A 3EKLA 4XKYA 5KZEA 2OX1A 1QDSA 2NZLA 3UNDA 3HIJA 3TW6A 3LHYA 1JUBA 1G7UA 3EWWA 4FXRA 3P5ZA 3G22A 4E38A 3W1AA 1FWNA 3WJSA 2E68A 1TTIA 4NNBA 3O6YX 4AWSA 2C19A 1ICPA 2V2CA 4GJ1A 4DBEA 2VEMA 1DV7A 4LC6A 1OX5A 3N73A 3LDVA 4UCGA 1DORA 1VLIA 1OG0A 1H5YA 4NX0A 3PUDA 4O17A 1TQXA 2C13A 2CLEA 4IJBA 1H7XA 1OHLA 3IIXA 4TMBA 1Q6RA 3MI6A 1XCFA 1PS9A 5D02A 4FX7A 5D38A 4EF9A 4MYXA 4YMZA 3W70A 3YPIA 2VC6A 3I6RA 3NQEA 3N34A 4WOQA 1Q6QA 5F2GA 2DORA 2FB2A 1F05A 5L9FA 1C8VA 2ZZ5A 3S5OA 5EA9A 1OK6A 1A5BA 1HL2A 3CU2A 3LRMA 2Z2UA 3W7KA 4E0CA 2Y7DA 3P67A 1J2WA 1G7VA 1T99A 1KBIA 5G4EA 1TJPA 3TA6A 1K7FA 3MI3A 1OYAA 2OCZA 1I2NA 3NL5A 2CLMA 1X1ZA 3T7VA 1H1YA 2DP3A 5D32A 1G69A 2OMAA 2DJLA 4YCPA 1SQ7A 4LS1A 3MP4A 1YDVA 4Q33A 3W71A 2R91A 4JTIA 1RZMA 1OK4A 3G1VA 1Q6LA 2ZDRA 1F73A 1H62A 1ME9A 1NEYA 4RX0A 2JGQA 1YTEA 2TSYA 1YDOA 2A6NA 2YCEA 4GWEA 5D05A 1K8XA 4O1AA 1FQ0A 4JX6A 3W07A 2I14A 4OV9A 3KX6A 4HPJA 1XI3A 2Y7GA 2PRMA 4JN6A 3NXFA 2BWGA 4O16A 3VFLA 1XUZA 3LX9A 2NX9A 4GUFA 3EWUA 4NX5A 1R2TA 3I7SA 4NZFA 2OT0A 2NXGA 5J5RA 2XN2A 5EPDA 4UFKA 3JR2A 3ZWTA 1YXCA 3O07A 3L5MA 4Z0JA 3DU0A 2FIQA 3DGRA 2A21A 4Z1CA 4QNEA 4RV8A 5AHNA 5AHMA 4OBTA 4LRSA 4JTGA 4CCCA 1VCGA 3EXRA 5DCBA 2ZZ6A 1GVRA 3N14A 3N2XA 5C6MA 2FFCA 1O94A 3NM3A 4MY8A 3G8RA 4K6AA 3NYZA 4O57A 3GDKA 2Z6JA 3BGGA 1XBVA 4MLJA 3IGXA 2OZ0A 2QCMA 3QZEA 3TDFA 1OYCA 3GAKA 1EIXA 4NJJA 4OQVA 1VCFA 5CPMA 2NV2A 4BR1A 3BLFA 3TC7A 4AAJA 1WV2A 2BX7A 2GUUA 2FTPA 1P4CA 1MEIA 5F2LA 3SECA 4WX2A 3KRSA 4CQ8A 3C2OA 5LNSA 3HQ1A 3IVTA 4KKXA 1DVJA 2WKJA 2QDHA 3O16A 1QO5A 3PBYA 4JTFA 4O4VA 4UTUA 3W74A 4IPJA 3N19B 5D2WA 3MW7A 3G1SA 1DOSA 3MJYA 4DO4A 2A7RA 3B0PA 4DBDA 3TR2A 1KFBA 2Y89A 2V2HA 3L9CA 3QF0A 1JUEA 2YX0A 2X1UA 5K7JA 1OYBA 2P10A 2F7FA 3UY7A 4O28A 1CI1A 1YTKA 5C5YA 3G1XA 3W75A 1YADA 1TV8A 4LNYA 3QH2A 4HNVA 5HR6A 1VC4A 1H61A 5BMWA 3W7PA 3SSJA 4IGHA 1EX5A 3KXQA 1M7PA 3W7OA 3TX9A 5FF0A 3S6DA 1SZEA 3QFEA 5K2ZA 1SUXA 1GZGA 4MZ1A 3R8RA 1BTMA 3W6YA 1H51A 2Y61A 3QSRA 1H63A 1KFKA 4LW7A 1LYXA 3LLFA 5BOOA 3W7JA 3L21A 4GRSA 3BW4A 5E1QA 3NQ6A 1FWSA 2O7QA 1HO4A 1VYSX 3LHZA 1PE1A 3O6DA 3FS2A 4CCDA 2X1TA 2ISSA 3NQVA 2H90A 1KV8A 4QNWA 1S5WA 3DKLA 4LS0A 3LHVA 2CLHA 3M5YA 5FEZA 3NQ8A 3KRUA 3FIGA 1FWWA 4NJIA 1QNVA 3CPRA 4C1KA 3CIXA 4LRTA 3N9SA 1H7RA 3HG2A 3MI2A 4LY8A 1GQNA 1LORA 3BW3A 4E2DA 2BSLA 2CLLA 1GWJA 4TMCA 2XN0A 3EWBX 2DZSA 3A23A 2ATMA 2NX1A 4GUJA 3P5YA 1UBSA 3G1FA 4O53A 4DF1A 3UXAA 3S42A 1ZY9A 1MEHA 3C2RA 3RF9A 3B04A 1TPFA 4ZQOA 1SO5A 1OFAA 3EXTA 4X3ZA 1TMHA 1TCDA 1UB3A 2EGZA 1RQBA 3PWAA 3FOKA 5F2MA 4DELA 1TPB1 4ONVA 1K8YA 3VCRA 2C15A 2QCCA 3CEUA 3O1NA 3F4WA 2YGYA 3OVRA 4IMDA 4EWND 1C29A 3W72A 3M5VA 4KFOA 3TH6A 4Y96A 4EVZA 1PCWA 1LOQA 3C56A 3GR7A 4BF9A 5LHFA 1OVDA 1AL8A 3S5ZA 1OFRA 1VLWA 1JVNA 1ZHAA 3R12A 2G5WA 4A3UA 3SR7A 4OE7A 1I2OA 1GYLA 5LNVA 3FYPA 4MKNA 3W83A 2E77A 2E6YA 4FF7A 4QAIA 4HHPA 3L0GA 1YLVA 3I68A 3F4NA 5D2XA 1F5ZA 4LS2A 2YYUA 3W22A 5G5IA 1FDJA 3FLUA 2C6QA 3DFOA 1YTDA 3S1UA 2I9EA 2ZQ0A 1XBXA 4FXSA 4EIVA 1H1ZA 3G24A 5EYWA 3SW6A 1QAPA 3WK2A 3WK0A 3T40A 3GKFA 1JULA 3OVPA 3QRHA 3TQVA 2ZRXA 3OBKA 4DO6A 4CNOA 1TV5A 2ZZ4A 4UIOA 3F03K 5HWJA 3WJXA 1H7NA 4JDYA 2QUVA 1PHWA 4RZ4A 1L6WA 1OFEA 4O1DA 1GPWA 3C3NA 1KFEA 5CPOA 5G1TA 1SSGA 3FKRA 1TTQA 1PIIA 4K38A 3G8EA 1ZAHA 4WUIA 2WSRA 5G2IA 4DXVA 2QR6A 4ZQCA 4JDBA 2DZVA 2QAFA 3W1MA 4K8HA 1KTNA 1N55A 1ME8A 2BLEA 3P8JA 1XBYA 3W2NA 2ZRUA 2H8ZA 2FPYA 2EHHA 2A6LA 4POCA 1D3GA 2V82A 1YXDA 1B4KA 2Z6IA 1DJQA 3C52A 3MO7A 1H50A 1H7PA 2WV8A 2C3ZA 3HGSA 5HWNA 1TPH1 2GVLA 4Z1DA 5LGXA 1TIMA 3HF3A 4JTLA 4PFMA 2RDWA 1VJIA 2E6AA 3OIXA 3GXTA 5FEWA 3KVKA 4K7VA 4UC5A 2ZZ1A 3LCLA 1OJXA 1JCNA 3QJAA 3R13A 3WK3A 5DXYA 1HTIA 3O05A 4IMFA 1FXQA 3C61A 3ZFHA 2VEIA 4RR4A 1A5CA 3W1RA 3O15A 5K9DA 3M16A 1W3TA 3TSDA 3P7YA 2CZ5A 1RQEA 3B03A 1VYPX 3PULA 1T0OA 4MVAA 4GC4A 3TJXA 3D0CA 1WAUA 1SO4A 2RKXA 4Y90A 3E96A 2DZTA 2Z0IA 2YXGA 4FIQA 2H3BA 1D9EA 1C9DA 1GOXA 1LDCA 3PBWA 5D2TA 3THAA 3HGJA 3NQ7A 3LERA 3PF3A 5FI8A 3GR8A 2X16A 3HPXA 1OF6A 1O5XA 2QDGA 5AYXA 1FBAA 2YZRA 3NDOA 4P2VA 3NQFA 1PHQA 1UJPA 3L68A 4EF8A 2DZXA 4FX8A 1WQ5A 3DFPA 3HGOA 2E5BA 1VH7A 3ABSA 3NZRA 2A85A 1TPVA 1TRIA 3NZ1A 2V30A 1TPC1 2X2GA 4X9SA 4Z1AA 3TFCA 3DFSA 3PVFA 4LVGA 1LBLA 3MP5A 4DQWA 4DO5A 1OABA 3W73A 3WJYA 5FF7A 2NUYA 2GVJA 5HUPA 3G1HA 3NQGA 4R33A 4YL2A 5BMXA 3M5XA 4AWUA 1VR6A 1SO6A 2PRHA 5D04C 5DELA 4MY9A 4HN4A 4M5PA 5CSSA 1XL9A 4M7TA 5CPNA 5H2ZA 4JTHA 4UTKA 1LLWA 3QM3A 4BI7A 3S1XA 5EMUA 1NF0A 1OX4B 3NEVA 2Y62A 1A5AA 3H53A 4KWVA 4UR7A 3PAJA 3KFTA 5IM51 3BV4A 3TCEA 1GJPA 4QSHA 4P61A 2OT1A 1NSJA 1MSSA 3M47A 1KFCA 4DF2A 1X7FA 2JGYA 2X1RA 1MZHA 3W1UA 3G18A 4Y8FA 2VEKA 3TE9A 1KW1A 5DXXA 2ALDA 1TPEA 3LCWA 4GXMA 1T96A 1OX6A 4N4PA 3CIWA 1W0MA 3LTPA 2RHGA 1H7OA 4FX6M 3TSMA 1I2RA 1JCYA 3E12A 4JIQA 5AC6A 1ZNNA 3ABRA 5DN1A 1JR1A 4AMAA 1OFQA 3C2FA 5L6UA 4XZ9A 3TQKA 1B57A 1X8FA 4ALDA 1XFBA 5KZMA 4K7YA 1ME7A 1R46A 3W1QA 1QWGA 1THFD 1RPXA 2VOMA 1ML1A 2DZPA 4HIBA 4AVFA 4BI5A 3UWWA 3L66A 3R5EA 1F6KA 3NL2A 5EY5A 1IXOA 1IXPA 2P1FA 3CEPA 3A22A 3PBUA 2ISVA 3ELFA 1XKYA 4MOZA 4DPPA 3NPWA 5CZ0A 5LSMA 4O54A 4OV4A 3VE9A 1ZAJA 4CNPA 2HSAA 3MHUA 2XFWA 1QOPA 4BWLC 1D3HA 3W87A 1VQTA 4JICA 3IIOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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