1E5JA

Endoglucanase cel5a from bacillus agaradhaerens in the tetragonal crystal form in complex with methyl-4ii-s-alpha-cellobiosyl-4ii-thio-beta-cellobioside
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRESAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mixed-Linkage Cellooligosaccharides: A New Class of Glycoside Hydrolase Inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE 5A
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus agaradhaerens
total genus 121
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2000-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e5jA00
1E15A 1NP2A 3PZGA 4W5UA 3WSUA 5A6LA 4D6GA 2A3CA 1GHSA 1OBAA 1BGAA 3LMYA 1UUQA 3RIKA 3GDBA 1E3ZA 4B9YA 1C7SA 2J47A 3SCUA 4WJXA 3W53A 3VGFA 3OLIA 5CGTA 4NI3A 3CUFA 4RL3A 5ECUA 4PTVA 2WSPA 3DYOA 2W66A 3FHAA 4GZEA 1JZ5A 4UQ9A 4NF7A 1ITCA 3ZOAA 1QI0A 2X0YA 2XM1A 3VD9A 3PZTA 2XTKA 1KB3A 5BWFA 1QNRA 1PEZA 2ZWYA 2YA0A 1KXQA 1ZBCA 4UQEA 3LPGA 1VBRA 3WH7A 4FK9A 3ZT7A 1TE1A 6TAAA 2ZX8A 3VIIA 4Q22A 2BY1A 1JYNA 3ALFA 2FHCA 7A3HA 2FH8A 4B16A 3SCTA 3ZO9A 1C8YA 2EPOA 1M53A 1WE5A 3DC0A 3AXIA 3OIHA 3EDKA 3GXDA 4W8AA 1XD0A 3OGSA 3VM5A 1UKPA 3WD1A 3AOFA 4AZCA 1GOKA 4ATWA 3VGGA 3WY1A 3FW6A 4A3YA 2O9RA 2ZUMA 3M46A 4TX8A 2DSVA 2XPKA 3TA9A 2BHZA 1UD8A 1HKIA 4GZJA 2BFGA 1LG2A 3PZIA 1OGBA 4MDOA 2CNCA 2GK1A 8A3HA 4H8HA 1HX0A 4P8VA 5LA2A 1E4NA 3K46A 4U2YA 3VGEA 3WF4A 1BSIA 2DSKA 4PMXA 2XM2A 2A3AA 4E8DA 4Z2GA 1K6AA 3LPFA 1PIGA 2VOTA 4GO8A 1GHRA 2XWEA 3WDQA 1JDDA 1Q6FA 2X0HA 2DPEA 1WPCA 1VF8A 4AD1A 2XVGA 3CZ8A 2ZX9A 4ACYA 1J0HA 1QNQA 1F4AA 1LG1A 3ARZA 1GCYA 2XGIA 2YDRA 3AI0A 4JL1A 1PBGA 4P8UA 4UFMA 3SURA 2VCBA 1N82A 3SCSA 3CO4A 4EE9A 2J4GA 5FOOA 3GTNA 3ARYA 1W1PA 3G6LA 6A3HA 1J11A 3GNOA 3MS8A 4AIOA 1G01A 2V3FA 1QHOA 3OZOA 1HKKA 2VTFA 2WCSA 5CLTA 3AHZA 4CGTA 3TOPA 4BQ3A 4AEFA 1DHKA 1XRVA 1GOOA 2F8QA 4JIEA 4M8UA 1KCKA 3AMGA 3WNMA 2D23A 3O9NA 1FHLA 4M1RA 1YQ2A 1L8NA 2BV9A 1WCGA 2WC4A 4W7WA 5DMYA 4AXNA 3CHEA 1XCXA 3T0DA 3J7HA 4HMDA 2JIEA 1U30A 4DWSA 3GNPA 1XSIA 2XIBA 2BHYA 1JI2A 4AZIA 1ZBWA 1QVBA 1EQPA 2ZXBA 4D72A 1MFVA 2NW0A 3APGA 3WEMA 1OIMA 4LPCA 4A4AA 3VD7A 2VC9A 4HZ8A 2ZUVA 3N1AA 5E9AA 2CBJA 3VGBA 1GW1A 2ESCA 4AISA 2OYMA 4QCFA 4WF7A 4HOZA 2CPUA 3WNOA 4HPHA 3BAXA 3L4VA 1W3LA 1U33A 1WZMA 4AD3A 1GOMA 2WB5A 3FAXA 4GINA 4AMCA 4URIA 1H09A 5IDIA 5D9OA 3L4TA 4UTFA 4UFJA 2QHAA 3NUKA 1PZ2A 3K8LA 1CGUA 3MMWA 2DSUA 1UWRA 1TUXA 4V28A 1GORA 4GZIA 4JCLA 1GOWA 5FKYA 5D9PA 3W6MA 1V3HA 2DQXA 4ZFMA 3UERA 4WKAA 2VCAA 2D2OA 1QPKA 2MANA 3N9KA 5DF0A 1X6LA 1J12A 4TVUA 3ZMRA 1FFRA 1V3IA 1BVNP 1UD3A 4DWSD 3A47A 3VIJA 5A2AA 1GQJA 1H1NA 4AZHA 3VM7A 1BTCA 3WIJA 1DWHM 1F4HA 4M81A 1GJUA 2DT3A 3RCNA 3I3BA 1HVQA 2XIIA 1TVPA 1FH8A 3AZTA 3O6AA 3DECA 1K9TA 4FF5A 4Y7EA 2QMJA 3GZAA 3D5HA 1KR1A 1GQKA 4ATDA 3L4YA 3RJYA 1JZ2A 2J7GA 5AC5A 1R8LA 3FAWA 1VJSA 1EDGA 1RP8A 4EK7A 1LL6A 4NRSA 4TVCA 1TMQA 4CU6A 3ZM8A 1KBKA 2PI6A 3PBGA 5BXPA 2IXVA 1CEOA 1SMDA 5AYBA 3AISA 3F4VA 4H41A 1MQRA 2VRJA 3AYSA 4BQ2A 5A6MA 2DSWA 5BYWA 3SUWA 5A8MA 5A95A 4PTMA 1CGTA 1EA9C 1CXIA 4MB1A 3CUHA 2PWDA 5TD4A 5ABFA 3VD5A 3AFBA 1UD4A 2B31A 2X2YA 3D3AA 1PAMA 2EPKX 4W8LA 4JHOA 1HJXA 1ZBKA 3U5YA 4D71A 1JL8A 1V6WA 4BA0A 4HMCA 2VVSA 2YLAA 1UKOA 4OOUA 4W85A 3VPLA 2PBOA 4MB3A 1UWSA 3N13A 1QNSA 2J7DA 5I2UA 1EHNA 1M04A 3L2MA 3WKZA 4UZSA 3QGVA 1CXFA 2CBVA 3CHCA 4MNMA 1KWGA 1EOKA 3MO4A 4BQ5A 1TA3A 3AZRA 1VFOA 4N0RA 3OGVA 1E56A 3L4XA 1BPLB 5A8QA 1M03A 3AYRA 1UR2A 1ZB5A 1LQ0A 3VNZA 1JXJA 3EDEA 4AZCB 1H4PA 3AS3A 1NWSA 1H0IA 2NT0A 1XCWA 3CZGA 4L4OA 2D3LA 3IANA 4QFUA 2YKKA 4CD5A 4UQCA 1HF6A 3B9EA 4MJ2A 3DHPA 2DSZA 5A8PA 3POCA 1W1TA 2GK1B 2C7FA 4Z2JA 3M6DA 5IHSA 3K1DA 4PTWA 1XYZA 1FA2A 1E4LA 2BVTA 2J8FA 1MYRA 1J9YA 4PBGA 1XH1A 4MPKA 2W91A 3PZVA 3BAYA 1OT2A 1EXPA 4AD2A 2VL4A 1BG9A 3VNYA 3WL0A 3CHFA 1VFMA 4H2CA 1FH7A 4J3VA 4DUXA 5C70A 1BGGA 4WKHA 3JUGA 4DUWA 1J0YA 2A3BA 3WEZA 4BCEA 1UR8A 3AS2A 4W7VA 2WMGA 3WELA 1ZS2A 2VCCA 2RGMA 2WLYA 4W89A 4NRRA 5JIWA 2XYLA 3WFZA 3BGAA 2FGLA 3CIVA 1CGYA 2WHKA 3CH9A 4PTXA 3EBVA 1CYGA 1Q6CA 1TZ7A 4LX4A 4DWSB 3AIQA 3VMOA 1LLOA 2BY0A 1SMAA 3QOKA 3AHVA 3ALGA 3MUZ1 4JL2A 5A69A 2WPGA 5BRPA 2WLZA 2WVSA 3KL5A 3TTQA 4K68A 1DTUA 4JFSA 3WL1A 1V08A 3EDFA 3WFLA 2Z1KA 4LYPA 5C71A 3SUSA 4OJYA 1HNYA 2IUZA 3VX0A 4ZE5A 4P7QA 3MANA 2YA2A 1I1WA 1BYDA 1MQQA 2WMKA 4J28A 4JKMA 2XG9A 5E6ZA 3SCPA 3BLKA 3CGTA 4UOZA 1UH4A 1J0IA 4PSRA 1E6RA 4BS0A 1ODUA 2CETA 1NOUA 2VZUA 3OB8A 3KZSA 3K8MA 2ZUUA 2GJRA 1MXGA 4U33A 5D8WA 1B30A 1JXKA 3CHDA 4PN2A 3RM8A 4OBSA 1C92A 3GNRA 2WZIA 1UG6A 3SCWA 2BXYA 2FDMA 5M17A 3WEOA 4HTYA 4HA1A 4M82A 1M01A 1B9ZA 4AIEA 1V6YA 2E4TA 1GQIA 4WIWA 2WAGA 2IXUA 4DM1A 4GI6A 1CLVA 2XHYA 3IAQA 1ZU8A 2UY4A 4CCCA 2G3IA 1V3LA 1XC6A 3VINA 4OBRA 4F9DA 1A47A 3W81A 4AEEA 4MDPA 1OIFA 4WKFA 2WKLA 3U7VA 1TG7A 1E9LA 1W1YA 5BRQA 4P7OA 2VRKA 4AZ6A 4N42A 2ZX7A 1JZ7A 2CHNA 3ARSA 1KXHA 2W62A 1FOBA 1M7XA 4KWUA 3VO0A 1NOFA 3PZMA 1B90A 2YL8A 3B9AA 2WVUA 1WDQA 2VZSA 1NWTA 4M24A 2GUYA 3K4DA 2V3DA 2W67A 3AIBA 8CGTA 4OIFA 2QLYA 1UA7A 5FL0A 3RM4A 4QLKA 2J74A 5ABFB 5ABHA 2DEPA 1WZKA 4PCSA 2YIHA 4CVWA 4S3JA 2FH6A 4LYRA 3W27A 4D1IA 1WDSA 3WQWA 1V0NA 3W29A 1VJZA 3ARQA 3O2LA 1UKQA 2ZUTA 2GJPA 4AD0A 4CCDA 2C0HA 2JEQA 2YBTA 1OD0A 4KGJA 4B9ZA 1CGWA 1CGVA 4CD4A 3CZLA 1VRXA 1DWGM 5EFFA 1HP4A 1JZ3A 2ZICA 2G4FA 3UR8A 5CG0A 4HU0A 4U2ZA 4AWEA 1QW9A 2F61A 2PWGA 5I78A 3NIYA 1TA3B 1W1VA 3IJ9A 5IFPA 1BVZA 4ACZA 1I75A 4PUEA 1KBBA 2XJ7A 1BHGA 2CYGA 1NOWA 1E1FA 3WDJA 4DWSC 4HA4A 1QI5A 1UD2A 2J7EA 1JZ6A 3IJ8A 4J27A 2X05A 1E4IA 1EGZA 1B3WA 1PPIA 2G3NA 2E9LA 1W9PA 3DYMA 5HXMA 1Q6GA 2V38A 3TONA 1G94A 2OWWA 4QDMA 4LGXA 1WNOA 4GI9A 5FL1A 5HBFA 1JAEA 2VRQA 3GH4A 4D6EA 2VQTA 3HU7A 3PTQA 3GH5A 3CTTA 4DM2A 3WDRA 2WSKA 4J3UA 2VJXA 3A3HA 3WUBA 1JYVA 2PF0A 2J62A 4WSKA 1UZ4A 3SUUA 1C91A 4JFVA 3S2CA 2D24A 4M56A 2VVNA 1OM0A 4HA3A 2VI0A 3VD3A 3WMCA 1V6UA 4QCEA 4QLJA 2E8ZA 5FIPA 3SIMA 4ML4A 1CXEA 4GXPA 2WC7A 3A4WA 5EB8A 1BF2A 1HT6A 2VZOA 4W7UA 2J79A 1ITXA 1Q6EA 4TTUA 4P8WA 4JHZA 1MW0A 2O9PA 3OA5A 3VD4A 2EPMX 2GFTA 4EAMA 2CEQA 2WCAA 4CCEA 4MNKA 3CZJA 1JNEA 3WBEA 1UD5A 1OCQA 3T08A 3BC9A 4D6FA 2JE8A 1NQ6A 1V03A 3GXFA 3BCDA 4GO9A 4Z2HA 2E9BA 5I79A 5HPOA 3ZT5A 1X1NA 3AXXA 2Y4SA 5KEZA 1AQHA 4F66A 1WDPA 2BVDA 5A8OA 4TXEA 4PMNA 3EDJA 4YN5A 3WQ8A 3ARWA 3VIHA 3WD3A 3BMWA 4FLQA 3U5UA 3A4XA 2D1ZA 5ABGA 5I5RA 1UYQA 2A3HA 4C7FA 1CXHA 5M03A 1GJWA 1K9EA 1XSKA 1OB0A 4KRTA 1LWJA 5AY7A 1V02E 2VZVA 1SYTA 3BH4A 3ZJ8A 3ARTA 5JBDA 2JEPA 3OLEA 3VDHA 1U2YA 3L4UA 4UR9A 4E4PA 3WMSA 1QHZA 5E09A 4IISA 3BAKA 1O7AA 1LF1A 2EQDA 1HJWA 3QOMA 4AD5A 1V6XA 3N11A 1GOQA 1HVXA 1B3XA 1W3JA 2TAAA 4Z2KA 4X0NA 5M5DA 3VMNA 2E8YA 1UR4A 3B9DA 3UG3A 2PWEA 1E0VA 1JFHA 2DT2A 5A6SA 3VIMA 4P7RA 4PUDA 5GNXA 2V3EA 4PYSA 3WUFA 4Z2LA 1ISWA 1R86A 1R7AA 3VGHA 3VX1A 2JALA 1UR0A 3EYPA 4J3XA 4OKDA 5ABEA 2WVVA 2VR4A 1A3HA 1J0KA 2CIPA 1J0ZA 3FY1A 9CGTA 4HP5A 3MUY1 1EHAA 3W38A 2EO7A 3KE0A 3A6OA 3RMEA 3WDHA 1GQLA 3MKKA 2W63A 1H11A 1W2VA 2UY2A 3AQUA 4R27A 3WD2A 1JAKA 4ZE4A 3AROA 1B3VA 2OWCA 3VKKA 2UY5A 1CWYA 3UESA 3NYDA 3AIRA 1E71M 5BROA 4U5IA 4HU8A 4UCFA 1OGSA 3WNKA 1W3HA 5LA1A 2YLLA 1V3JA 1S46A 5BXSA 2G3JA 1VEOA 4UNIA 3N15A 1CLXA 3AHXA 1EO5A 5LA0A 3VMPA 2DT0A 2ZUSA 2WMFA 1MW3A 1E55A 2WZHA 1D3CA 2YOCA 1OWQA 3EDDA 1CIUA 1HP5A 3ZIZA 2EPNA 1FP8A 2VURA 3WQ6A 4P8XA 3WUEA 3PHAA 2J7HA 1RPKA 3AIEA 1UH2A 3W25A 3RPMA 2J8GA 5D9MA 1B3YA 1H2JA 4KRUA 3T0BA 1IZKA 1UKTA 3NCOA 5A94A 4NZCA 2DGAA 4V2XA 3UG5A 3II1A 3WDIA 4QLLA 4ACZB 1G5AA 3WQ4A 2EXOA 2W61A 1BYBA 1RD6A 4CN4A 2WHLA 2RGLA 3L4WA 2CXGA 1VIWA 2O9OA 1US3A 4AW7A 4J3SA 4KH2A 1UWIA 4TUFA 1P6WA 1JYXA 3WF0A 1VB9A 1H0GA 4GPNA 3U7BA 1J0JA 4PMRA 4ZXOA 1KR0A 3CMJA 3WF3A 2GDVA 1OINA 1Q6DA 4JFTA 4HPGA 4S3KA 5HDRA 1JI1A 3PZ9A 1E43A 3VOCA 3WF1A 5BXRA 2CITA 3FN9A 3SUTA 4Q7NA 3VIGA 2W4XA 1B0IA 2G41A 4TOQA 1JDCA 3ZR6A 4CN1A 3ZJ7A 2ZOXA 3ZJKA 3PTMA 4UOQA 3PTKA 1MWOA 1JD7A 1OT1A 1QNPA 2VUYA 3KWXA 4P7LA 4NSBA 5D9NA 2OSXA 1CXKA 3T2QA 3PZNA 4RE4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1E15 A;  1NP2 A;  3PZG A;  4W5U A;  3WSU A;  5A6L A;  4D6G A;  2A3C A;  1GHS A;  1OBA A;  1BGA A;  3LMY A;  1UUQ A;  3RIK A;  3GDB A;  1E3Z A;  4B9Y A;  1C7S A;  2J47 A;  3SCU A;  4WJX A;  3W53 A;  3VGF A;  3OLI A;  5CGT A;  4NI3 A;  3CUF A;  4RL3 A;  5ECU A;  4PTV A;  2WSP A;  3DYO A;  2W66 A;  3FHA A;  4GZE A;  1JZ5 A;  4UQ9 A;  4NF7 A;  1ITC A;  3ZOA A;  1QI0 A;  2X0Y A;  2XM1 A;  3VD9 A;  3PZT A;  2XTK A;  1KB3 A;  5BWF A;  1QNR A;  1PEZ A;  2ZWY A;  2YA0 A;  1KXQ A;  1ZBC A;  4UQE A;  3LPG A;  1VBR A;  3WH7 A;  4FK9 A;  3ZT7 A;  1TE1 A;  6TAA A;  2ZX8 A;  3VII A;  4Q22 A;  2BY1 A;  1JYN A;  3ALF A;  2FHC A;  7A3H A;  2FH8 A;  4B16 A;  3SCT A;  3ZO9 A;  1C8Y A;  2EPO A;  1M53 A;  1WE5 A;  3DC0 A;  3AXI A;  3OIH A;  3EDK A;  3GXD A;  4W8A A;  1XD0 A;  3OGS A;  3VM5 A;  1UKP A;  3WD1 A;  3AOF A;  4AZC A;  1GOK A;  4ATW A;  3VGG A;  3WY1 A;  3FW6 A;  4A3Y A;  2O9R A;  2ZUM A;  3M46 A;  4TX8 A;  2DSV A;  2XPK A;  3TA9 A;  2BHZ A;  1UD8 A;  1HKI A;  4GZJ A;  2BFG A;  1LG2 A;  3PZI A;  1OGB A;  4MDO A;  2CNC A;  2GK1 A;  8A3H A;  4H8H A;  1HX0 A;  4P8V A;  5LA2 A;  1E4N A;  3K46 A;  4U2Y A;  3VGE A;  3WF4 A;  1BSI A;  2DSK A;  4PMX A;  2XM2 A;  2A3A A;  4E8D A;  4Z2G A;  1K6A A;  3LPF A;  1PIG A;  2VOT A;  4GO8 A;  1GHR A;  2XWE A;  3WDQ A;  1JDD A;  1Q6F A;  2X0H A;  2DPE A;  1WPC A;  1VF8 A;  4AD1 A;  2XVG A;  3CZ8 A;  2ZX9 A;  4ACY A;  1J0H A;  1QNQ A;  1F4A A;  1LG1 A;  3ARZ A;  1GCY A;  2XGI A;  2YDR A;  3AI0 A;  4JL1 A;  1PBG A;  4P8U A;  4UFM A;  3SUR A;  2VCB A;  1N82 A;  3SCS A;  3CO4 A;  4EE9 A;  2J4G A;  5FOO A;  3GTN A;  3ARY A;  1W1P A;  3G6L A;  6A3H A;  1J11 A;  3GNO A;  3MS8 A;  4AIO A;  1G01 A;  2V3F A;  1QHO A;  3OZO A;  1HKK A;  2VTF A;  2WCS A;  5CLT A;  3AHZ A;  4CGT A;  3TOP A;  4BQ3 A;  4AEF A;  1DHK A;  1XRV A;  1GOO A;  2F8Q A;  4JIE A;  4M8U A;  1KCK A;  3AMG A;  3WNM A;  2D23 A;  3O9N A;  1FHL A;  4M1R A;  1YQ2 A;  1L8N A;  2BV9 A;  1WCG A;  2WC4 A;  4W7W A;  5DMY A;  4AXN A;  3CHE A;  1XCX A;  3T0D A;  3J7H A;  4HMD A;  2JIE A;  1U30 A;  4DWS A;  3GNP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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