1EGZA

Cellulase cel5 from erwinia chrysanthemi, a family gh 5-2 enzyme
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
SVEPLSVNGNKIYAGEKAKSFAGNSLFWSNNGWGGEKFYTADTVASLKKDWKSSIVRAAMGVQESGGYLQDPAGNKAKVERVVDAAIANDMYAIIGWHSHSAENNRSEAIRFFQEMARKYGNKPNVIYEIYNEPLQVSWSNTIKPYAEAVISAIRAIDPDNLIIVGTPSWSQNVDEASRDPINAKNIAYTLHFYAGTHGESLRNKARQALNNGIALFVTEWGTVNADGNGGVNQTETDAWVTFMRDNNISNANWALNDKNEGASTYYPDSKNLTESGKKVKSIIQSWPYKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Type II protein secretion in gram-negative pathogenic bacteria: the study of the structure/secretion relationships of the cellulase Cel5 (formerly EGZ) from Erwinia chrysanthemi
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE Z
molecule tags Hydrolase
total genus 119
structure length 291
sequence length 291
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 1999-03-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1egzA00
2WKGA 2J47A 4DM1A 4P7NA 4V2XA 2V3FA 1KXQA 4KGLA 1OCQA 2OSXA 1OBAA 2J7GA 2CERA 3AMCA 3ARSA 5D8ZA 4CN1A 4NSBA 2VMFA 1EDTA 2XWDA 5KZ6A 4L4OA 1OT2A 4J3XA 2OSYA 1LG2A 1RP9A 1VFMA 2J75A 3BAYA 3AIVA 2DQXA 2WWCA 3AMKA 3OIHA 1GPFA 4GKLA 4FF5A 1CECA 2WK2A 3NSXA 5IDIA 1UKTA 3T2OA 4D6DA 1FH7A 3VIGA 4AY1A 1MQPA 3PZUA 3A4AA 1E15A 3B9AA 4C7DA 3VGHA 1R7AA 1OWQA 2YL8A 2WSPA 1Q6GA 5CXPA 2G8ZA 7TAAA 2G3IA 1W2PA 3CLWA 2CYGA 3GH4A 3WDJA 1UR2A 3LPOA 3AHXA 4QLKA 1KFWA 3VD4A 1K9DA 1FHLA 3ARXA 2PWHA 1KWKA 1B0IA 1BG4A 1E4LA 4E8DA 3WNNA 4UQCA 1Q6FA 3A4WA 3WH5A 4P7OA 1JDAA 4GPNA 2ESCA 4D6EA 1GHSA 2VVNA 1XSJA 1DWIM 2YLAA 1VFOA 2E9MA 5DFAA 1QNQA 1J12A 2OYKA 3WIJA 1CGXA 4MAZA 3SUVA 4LPCA 4HPGA 2VZOA 2BVYA 5I6SA 1I75A 4DWSA 2DIJA 1CXIA 1M04A 1HX0A 1DWGM 4PYSA 1V0MA 3IJ7A 4WSJA 1B3ZA 2UY3A 5I78A 1E6ZA 4ATDA 3WH8A 5A8QA 3MU7A 3RMEA 4CD4A 4D6JA 1JXJA 1JZ8A 1AMYA 3THDA 5IFPA 3L4YA 3SUWA 2W63A 4JKMA 4F9JA 2DEPA 2PBOA 4CN4A 1EOKA 4AEFA 1W91A 3VD9A 2WLYA 3NDZA 1HN1A 1UKOA 3K4DA 4GIAA 7CGTA 3GM8A 3LPFA 4PMUA 4EAMA 4AIOA 2Z1KA 5GPRA 3WNLA 2IXVA 4FK9A 4JKLA 4TX8A 1NQ6A 3L4XA 3NSNA 5D9MA 1DHKA 1DTUA 2OYLA 1W2VA 4ZXLA 5FIPA 4AZGA 3UG3A 1UZ1A 4GO9A 1VEPA 2ZX6A 2CBIA 2VR4A 4P7RA 3VIMA 1BG9A 1VIWA 1CXKA 2DSKA 4EK7A 3VPLA 4D6IA 4PUDA 3SCSA 1U30A 4HU8A 3D3AA 2CETA 1JD7A 1N82A 3ARYA 4GZEA 4NRSA 2WZEA 4S3KA 4CD7A 3ZJ7A 1ITXA 4AD3A 2JEQA 1V0LA 1BQCA 2WMIA 3SUSA 4RE2A 3AISA 2OYMA 4LYRA 1US2A 1XSIA 4CU6A 1E4NA 5BXPA 4KRUA 1XH2A 3MUAA 1LQ0A 4QCEA 3UESA 2EPNA 2ZX8A 1H3GA 4XX6A 4CVWA 1IV8A 3GXFA 1CYGA 2JIWA 1EGZA 5DT7A 2PWGA 2WVTA 1I1WA 2GVYA 1V6YA 1E56A 1E70M 5E09A 1UA3A 4PMNA 3W37A 4P7QA 4JL1A 3I3DA 3GH7A 1PPIA 1VJZA 2VNCA 3BCDA 2J7EA 3AIRA 4GO8A 2BVDA 4JFVA 2FGZA 5BXTA 4AZ5A 1BVZA 5FD0A 5M5DA 4EE9A 1GJUA 1CXLA 2VURA 1VRXA 3B9EA 4JCLA 4V28A 5HXMA 1GUVA 4F66A 4GINA 3RM8A 4AMCA 3M46A 2FHBA 4D72A 1ZJBA 5HDRA 2WVSA 1WAWA 4AC1X 1QNOA 1J0HA 1ISYA 2WVUA 3VGEA 2J62A 1KB3A 4H8VA 2NW0A 3AROA 3W29A 3BAKA 1JYXA 8A3HA 3W25A 3MSDA 3WF3A 1UWQA 3BC9A 1UD3A 1U2YA 2EPOA 3NCOA 2OSWA 1WDSA 3IAPA 4C7GA 4JFSA 2BV9A 4PCSA 3BAXA 4P8VA 5AY7A 5HBFA 2V3GA 1CGWA 4V27A 4HTYA 1GCYA 1CLVA 3SURA 2MANA 1QBBA 2X8RA 3GXIA 2PB1A 2AMGA 2UY5A 5GQBA 2GUYA 5JIWA 2AOSA 1VAHA 4J3WA 4BQ3A 4ZENA 4Q7NA 4AZCA 2Y8KA 1CPUA 2YDQA 3WN6A 5C71A 1XSKA 4HZ8A 1EQCA 1EIBA 3IANA 2J7DA 4W8BA 1KXVA 2CPUA 2EBNA 4WLCA 1VB9A 3TONA 3ZT6A 2VUYA 3WNMA 2G3NA 4MAVA 3RILA 2YDSA 4TVDA 2E8ZA 4JCMA 2VZTA 4UFJA 7A3HA 3PZQA 2BHUA 2XG9A 3ZIZA 1V03A 3ZR5A 3RJYA 2J25A 3POHA 4E4PA 3MSGA 1NOWA 4AZIA 4ZEPA 2VTFA 1GONA 3ZQ9A 2WAGA 1MVYA 1ISVA 1JI2A 2J7FA 1V3JA 3VDHA 4NRRA 5LA0A 1V6UA 2EEXA 1JXKA 1QVBA 4J3SA 3WEZA 4D1IA 4HOWA 1BHGA 4GQQA 1B30A 1MQRA 4UFHA 4GZIA 2WC4A 1UYQA 4JHOA 2CEQA 4KGJA 2EQDA 3GYCA 1JAKA 1UR8A 3JUGA 3RCNA 4AEEA 3T08A 2XVKA 1C8YA 5IFTA 2RGMA 1LLOA 3VU2A 1VEOA 2V5DA 5F7UA 1UR0A 3UR7A 5I79A 3HMCA 1WCGA 4D1JA 3LPGA 4MDPA 2X0HA 5I24A 2NT0A 1E5NA 3AMGA 5D9OA 4UQBA 3ALFA 3A3HA 1E73M 3T2PA 5M3WA 1GQIA 4YHEA 3WUGA 1O6IA 3W26A 2JALA 4U33A 2D3LA 4HMEA 1MYRA 1OT1A 1NM9A 2ZWZA 3SCTA 5I0DA 4DM2A 4H8HA 3FHQA 2V38A 2WCGA 4U5IA 4FMVA 1E0VA 3CZKA 5C8BB 3WMSA 2XFFA 1W9VA 1GHRA 1CEOA 1E5JA 2D23A 4WKAA 1HJVA 2VX4A 1HVQA 1HKKA 2WANA 3ZSSA 4XV0A 1E6XM 1E0WA 4AZ7A 5AYIA 3ALGA 1J10A 3AQUA 4AD0A 3OZOA 3SCPA 1AQHA 3A6OA 2RGLA 2YKKA 1ZBKA 4UQAA 4FLSA 4YHGA 5CG0A 4KWUA 2A3AA 3BAJA 1G1YA 1QI3A 3CUFA 2CHNA 4JFTA 3MUY1 5EB8A 3ARVA 1FA2A 1W1TA 4WK9A 4JFUA 1PX3A 1WNOA 1EQPA 2WVVA 3CBWA 3WUBA 5M17A 3WEOA 3AYRA 3SUTA 3T2QA 3VMPA 1VF8A 2UY4A 2E40A 9CGTA 1PX4A 6TAAA 1G9HA 1H0IA 4U31A 1JNDA 1NOFA 5BRQA 1DWFM 4U3AA 3AZSA 2WCAA 3PZ9A 1V6XA 3VX0A 3UCQA 3O6AA 2E9LA 1AQMA 3DECA 4DUWA 2XGIA 4CGTA 1JAEA 3K1DA 3ZSTA 2VO5A 4URIA 4B9YA 3L4TA 5A6MA 1LL6A 3CZLA 3W0KA 1EDQA 1PZ2A 2ZUWA 4R27A 3MMDA 3DC0A 3AS3A 1CENA 1XYZA 4W84A 4PMXA 1MWOA 3KE0A 1H0GA 1ISZA 2JIEA 4P8UA 1JGIA 1TCMA 4OOZA 3WUEA 2D0FA 2YL9A 4UNIA 1AVAA 1HP4A 3N12A 2Y5EA 4AD5A 1W9DM 1BF2A 3N04A 3MMWA 1B3VA 1B9ZA 3EBVA 2DDXA 3WEMA 2FH6A 5ECUA 2E0PA 4GI6A 3K8MA 1MQQA 2PF0A 1YQ2A 3CHDA 4W7VA 5FL0A 4MNJA 5A2CA 1QI0A 2W67A 3VM7A 2ZX9A 3D5HA 3SCVA 2ZXDA 3ARTA 4OBSA 1JG9A 1G94A 1LL7A 4M82A 1UZ4A 1OINA 3LPPA 3OLDA 4MB5A 1CXEA 1UHVA 3PZTA 1NWUA 2EPKX 3F4VA 4PMZA 5GNXA 4QP0A 4EANA 4Y7EA 3FN9A 1ECEA 1EOMA 4PEEA 3BSHA 3WD1A 1E0XA 3ARQA 1EXPA 1CXFA 3TOPA 1NWRA 2BY1A 2ZIDA 1R87A 1OB0A 3W24A 4L4PA 2WZHA 3RM9A 1XRVA 1CGUA 3BLKA 2E8YA 2WHKA 4WIWA 3VIPA 3SCNA 1QI5A 3MO4A 1QW9A 1XCXA 3TTYA 6CGTA 2YBTA 2C8NA 1WZKA 2WMKA 3PZIA 1FHDA 2QHAA 1XCWA 4BS0A 1W1VA 2QMJA 2ZX7A 1A47A 3TA9A 3AFBA 2D22A 2PI6A 3GXDA 2VX5A 3AMLA 3PZGA 3WQ4A 2BY2A 5FL1A 5A6JA 3VDBA 2J79A 2CESA 1UD8A 2WLZA 1C90A 3W53A 3A47A 1HVXA 4CD8A 1MW2A 5BXSA 1HF6A 5DMYA 5C70A 1NARA 1RP8A 2XIBA 3PZOA 1KBBA 3IAQA 2B31A 2F61A 3SCRA 4PRWA 1YHTA 3AHZA 1X6NA 2EJ1A 1H09A 2VCCA 3NIYA 1UUQA 5AYBA 1MW1A 2C7FA 3SCWA 3AIQA 4DUVA 4AW7A 3MS8A 1IZKA 3WD3A 3F5KA 4D6GA 3NYDA 1V02E 2W92A 1V3IA 3TTSA 1W3LA 3VVGA 4DWSC 2XVLA 2EO7A 2XM2A 3VM5A 3OB8A 3CZEA 1WB0A 3I3BA 2YIHA 2J74A 3FAWA 3WNPA 1LL4A 1JF6A 1SFSA 4MTVA 3CO4A 2DSWA 5A2AA 1J0IA 1KXHA 4MNKA 4AZHA 5JIPA 3WNKA 1WZLA 3KWXA 3BLPX 1JZ3A 2VL4A 1E4MM 2XSBA 4CCCA 5CLTA 2NT1A 1NWSA 2OWCA 1TE1A 3AZTA 4AZBA 1B3WA 4U5KA 5A6BA 4W89A 2X09A 5CSYA 4TVUA 3VUPA 5GNYA 4X9YA 4ZXOA 1XYFA 4HP5A 4H8UA 4UZUA 5LA1A 2YBUA 3CZ8A 5HOSA 1GQJA 3VMOA 1XH1A 3ZR6A 5IHRA 1D2KA 2BNJA 1BLIA 3G6LA 2X1IA 4AD2A 4IPNB 2DT1A 1MFVA 2WCSA 4E8CA 4F79A 3WDQA 3U5YA 1KWGA 2YA1A 1V08A 4XUYA 1DWHM 1ISXA 2WBGA 2GK1A 3BXWA 5JUVA 3NDYA 2VQUA 1V3HA 1S46A 4R5EA 1UH2A 3EMCA 5DT5A 2IXUA 4RL3A 2VRQA 3AXIA 4DWSB 3VNZA 3AIEA 4MDOA 1MXDA 1BYDA 5I5RA 1Q6DA 1EA9C 4A4AA 5LYRA 1E9LA 1GOQA 4ML4A 3WH9A 3GDBA 5ABGA 3VIOA 1EH9A 4CUCA 3W82A 1J0JA 5M03A 2ZUTA 1VJSA 2BHYA 1HNYA 2Z1SA 4WSKA 1V6WA 1J0KA 4MB4A 3GNRA 4UOQA 2W61A 4BQ5A 1RH9A 2FHFA 4D6CA 3EDDA 2XHYA 2X0YA 4Z2JA 2JEPA 5BRPA 3AYSA 3ARPA 1WPCA 1M03A 1XH0A 3VIKA 1OM0A 2W4XA 3N11A 1E1FA 3FAXA 3CZJA 2JFEX 2ZUNA 4RE4A 1ZBWA 1KR0A 2D20A 1OD8A 4N42A 3UEQA 3WQ8A 1O7AA 2CNCA 4UQ9A 4IM4A 3KL3A 4Z2IA 5CJ5A 3ZOAA 2Y2WA 4PUEA 3WY1A 1X1NA 5BROA 5A8PA 2EPMX 2WKLA 1CDGA 3VILA 1C8XA 1TMQA 1Q6CA 2TAAA 2ZICA 3VX1A 3WL0A 2BFGA 1W3HA 3CUHA 4J3TA 2WMIB 1PAMA 1JZ2A 3WDPP 2CBVA 1V0NA 1FP9A 5BCAA 3OBAA 4WKFA 3IK2A 1UR1A 4W8LA 4MNMA 5CZKA 5A6LA 2A3EA 3PTQA 3G6MA 4JFWA 4W5ZA 1WZMA 2XYLA 4CKQA 3MKKA 4TX6A 3WQ6A 3RO8A 2WC3A 2W91A 4MB3A 2J8FA 4OIFA 1E55A 1K9EA 1KCKA 1HKMA 2CCRA 1IZJA 4DUXA 3WH6A 3N18A 3ZJ8A 1TA3B 1UKPA 2VX7A 1GOOA 1WKYA 2OWXA 1C7TA 5A6KA 3ARWA 4DWSD 1BTCA 1H1NA 1W9UA 4AD1A 3RDKA 1E6RA 1NP0A 4HOXA 2BVTA 3VD3A 2O9PA 2BHZA 3QHMA 1QNPA 3DHPA 3W28A 1JZ4A 2J77A 3WMCA 4EKJA 1GZJA 3N9KA 3W81A 2XVPA 2XVGA 3W6LA 3CHFA 4WJXA 4MJ2A 2XFYA 1E72M 1VENA 2GJPA 3AS1A 3OLGA 3VIJA 3E1F1 3WD4A 2DIEA 2UWFA 1GOMA 4TTGA 1EHNA 4PMYA 4ATLA 2D24A 5FKYA 4U3CA 4U2YA 1E6NA 4LGXA 4M8UA 1UWTA 5JBDA 2A3HA 1E6PA 3CIVA 3II1A 2HVMA 2WC7A 4AZCB 1W3JA 3GXMA 1PEZA 4W93A 3DHUA 2VZSA 5CGTA 1JYVA 2EXOA 1CWYA 1UG6A 5BXRA 2GDVA 4IUGA 3W38A 1JZ5A 3EDEA 3PZNA 3WDRA 1ITCA 1BAGA 2VJXA 5EFDA 5DO8A 4ACZA 4CVUA 6A3HA 2ZXQA 3S6TA 3WF1A 1XD0A 4HPHA 2VCAA 4J27A 5D4YA 3QHOA 3PTMA 4PMQA 3WSUA 4W88A 4PMVA 3WBAA 4K68A 2WMHA 1J01A 4TUFA 1UD6A 1G5AA 1FH9A 1V0KA 1J0ZA 1WO2A 3GH5A 3ARUA 3LMYA 4J7RA 3S2CA 3U7BA 4JHZA 3EDKA 4PSRA 3OGSA 4W8AA 3L4UA 4E2OA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2WKG A;  2J47 A;  4DM1 A;  4P7N A;  4V2X A;  2V3F A;  1KXQ A;  4KGL A;  1OCQ A;  2OSX A;  1OBA A;  2J7G A;  2CER A;  3AMC A;  3ARS A;  5D8Z A;  4CN1 A;  4NSB A;  2VMF A;  1EDT A;  2XWD A;  5KZ6 A;  4L4O A;  1OT2 A;  4J3X A;  2OSY A;  1LG2 A;  1RP9 A;  1VFM A;  2J75 A;  3BAY A;  3AIV A;  2DQX A;  2WWC A;  3AMK A;  3OIH A;  1GPF A;  4GKL A;  4FF5 A;  1CEC A;  2WK2 A;  3NSX A;  5IDI A;  1UKT A;  3T2O A;  4D6D A;  1FH7 A;  3VIG A;  4AY1 A;  1MQP A;  3PZU A;  3A4A A;  1E15 A;  3B9A A;  4C7D A;  3VGH A;  1R7A A;  1OWQ A;  2YL8 A;  2WSP A;  1Q6G A;  5CXP A;  2G8Z A;  7TAA A;  2G3I A;  1W2P A;  3CLW A;  2CYG A;  3GH4 A;  3WDJ A;  1UR2 A;  3LPO A;  3AHX A;  4QLK A;  1KFW A;  3VD4 A;  1K9D A;  1FHL A;  3ARX A;  2PWH A;  1KWK A;  1B0I A;  1BG4 A;  1E4L A;  4E8D A;  3WNN A;  4UQC A;  1Q6F A;  3A4W A;  3WH5 A;  4P7O A;  1JDA A;  4GPN A;  2ESC A;  4D6E A;  1GHS A;  2VVN A;  1XSJ A;  1DWI M;  2YLA A;  1VFO A;  2E9M A;  5DFA A;  1QNQ A;  1J12 A;  2OYK A;  3WIJ A;  1CGX A;  4MAZ A;  3SUV A;  4LPC A;  4HPG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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