1EPXA

Crystal structure analysis of aldolase from l. mexicana
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
357
structure length
357
Chain Sequence
MSRVTVLQSQLPAYNRLKTPYESELIATVKKLTTPGKGLLAADESIGSCTKRFQPIGLSNTEEHRRQYRALMLEAEGFEQYISGVILHDETVGQKASNGQTFPEYLTARGVVPGIKTDMGLCPLLEGAEGEQMTEGLDGYVKRASAYYKKGCRFCKWRNVYKIQNGTVSESAVRFNAETLARYAILSQMSGLVPIVEPEVMIDGKHDIDTCQRVSEHVWREVVAALQRHGVIWEGCLLKPNMVVPGAESGKTAAPEQVAHYTVMTLARTMPAMLPGVMFLSGGLSEVQASEYLNAINNSPLPRPYFLSFSYARALQSSALKAWGGKESGLAAGRRAFLHRARMNSMAQLGKYKRSDD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE
publication title Structures of type 2 peroxisomal targeting signals in two trypanosomatid aldolases.
pubmed doi rcsb
source organism Leishmania mexicana
total genus 144
structure length 357
sequence length 357
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2000-03-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1epxA00
4OHQA 3DBPA 1IXQA 1XM3A 2VEIA 1WBHA 4YWIA 3I7SA 3HGRA 1QWGA 4DO6A 1RD5A 3BGGA 2NXHA 3RU6A 1EIXA 5AHLA 1F5ZA 4M6PA 5G2IA 1YLVA 4NX0A 1UJPA 2ZA1A 4P2VA 2NLIA 5CG7A 1Z44A 1PE1A 2V2CA 5AFDA 1FWRA 4UCGA 3CEUA 3CWOX 4UTWA 5HWMA 1ADOA 2ZCGA 3OVPA 3C2OA 1VLWA 1S3HA 3UY8A 3DHFA 3PVFA 5AHEA 3NDOA 1BEUA 1NFBA 4ORIA 3LM7A 2NUYA 2Y7EA 1RQEA 1YTDA 3UNDA 1TPEA 1L6WA 4FNSA 3CEPA 5F4SA 5CZTA 2FJKA 3GXNA 2OX1A 1K3UA 4JTJA 3EXTA 5L6UA 1KBJA 4O52A 2NX3A 1N8FA 1KFEA 4CQAA 1PIIA 4JTGA 3W7IA 2Y70A 4UFMA 4M6VA 4EVZA 4I7UA 1TJRA 3A5FA 3W85A 5AYXA 4X2RA 3IVUA 1UUOA 2V0TA 5EL1A 4TR9A 3WK0A 1EB3A 4WZHA 1Q6RA 1VZWA 2ISVA 3UWYA 3W6YA 3P80A 3M7WA 2CLLA 1SUXA 4N2YA 1ZAJA 4XBSA 4LVAA 1TV5A 2FB2A 3W88A 4M19A 3HBLA 2ZRZA 1SFLA 4MIMA 3UPWA 3NM3A 4UTIA 2YDAA 1W8SA 3STEA 3A9IA 3IV3A 3IGUA 2W0UA 2AAMA 5K3VA 4UTHA 5KZMA 3W7RA 4IMFA 3NO5A 4PL2A 1UUMA 3TIMA 2J27A 4BWLC 2VEKA 3NOEA 1PS9A 1JCLA 3QJAA 2QDHA 2JKAA 4UC5A 3INPA 4JDYA 3L67A 3WJXA 1ZJIA 4OGZA 3MMTA 2Q8LA 5AHIA 3M43A 1DV7A 1JR1A 4OE7A 2CZDA 1Z42A 2Y61A 4QAIA 1RPXA 2J24A 5CZ0A 4NNBA 1LP6A 1QMLA 1YDVA 1JVNA 3L5LA 4B5NA 4NX5A 2Z1BA 5D03A 4AWUA 1G4SA 1H7NA 4Q33A 5C54A 3LI1A 3FLUA 3TMQA 4NJJA 3GR7A 4JS3A 4LC8A 1PV8A 4NJHA 2WNQA 3LHVA 4UTMA 3W87A 3CHVA 5D2TA 4H6KA 3K30A 3F1QA 3RLUA 1W31A 3W2JA 4WOZA 4JX4A 3TW7A 1SW0A 3MI3A 4LU0A 1OFQA 3ABRA 4UTKA 3S9YA 4YCPA 1PCWA 4N6EA 2OCZA 5G2HA 1H50A 3M5XA 1NSJA 3EX6A 1AMKA 3B03A 1VJIA 2C15A 3GNNA 3G0XA 4CCEA 3W2KA 1WDWA 1QNVA 2FIQA 3CB8A 1W54A 4MY1A 1AW5A 4QJ1A 3UD6A 1EUAA 3B0UX 4JYEA 2AQWA 2NXIA 4Z1DA 4ZZ9A 4N9EA 5HJLA 4RKAA 3VNDA 2FFCA 1ZHAA 3PBYA 4NQ1A 2WJZA 3LB0A 2YCEA 4MFDA 4IX0A 2QCDA 2TRSA 2ZZ2A 4O1AA 4MYAA 1F6PA 1OYCA 4KWVA 4M6QA 4JTFA 3HGOA 4RLIA 2DZVA 1H62A 3FYPA 4IMDA 1Z41A 3NGJA 4LVGA 3W22A 3C2FA 4MUZA 2A6LA 3W1PA 2YR1A 2DZUA 2LLEA 4AVFA 2NWRA 1KFKA 1WAUA 5A8GA 3MI6A 2Q3RA 2FPTA 4FX8A 4O0KA 1H60A 1VGAA 1X7FA 4DPQA 3I7RA 3GLCA 1G4EA 4O50A 3M44A 3QF0A 1X1OA 2QAFA 1K8YA 1KBIA 1VQTA 3GDMA 3EEGA 3KHJA 3NQ7A 3HGSA 4AHPA 3OG3A 3P84A 4ONVA 4OBTA 3NQCA 3NA8A 3NQ8A 2QCGA 1X1ZA 5J5DA 5BRBA 3B4UA 2H6RA 4AWTA 4NXKA 1TQJA 2VENA 1UCWA 4JICA 1GYNA 3L65A 3WJWA 3VCRA 1GG1A 4WJEA 2PRMA 4JY8A 3IIOA 2E77A 4A3UA 1FDZA 1WV2A 2C6QA 3QC3A 1F76A 4MZYA 3ZFHA 1IGSA 5I3GA 1VH7A 3L21A 1EP1A 1PVNA 3NAVA 5BNKA 1TV8A 1DBTA 3G0SA 5LNVA 1U5JA 2WNNA 1LORA 3P5ZA 1FY6A 2Y6ZA 1P0NA 2A4AA 3W7EA 3B0PA 5AYYA 4DXVA 1QPNA 3DFPA 5BW6A 3LCIA 3OVRA 1LM1A 2QEZA 4K37A 1KM2A 1FBAA 2DZPA 3GAYA 1M7PA 4MZ8A 1BWLA 4LW7A 3EWUA 1KM5A 3LXBA 1SO5A 4I7WA 3NVTA 4M7TA 2ZA3A 3E9AA 2XN1A 3W71A 4PA8A 4JY9A 3CLMA 5I3JA 2P10A 3GNDA 3W83A 3O63A 4NUWA 3U8GA 1YYAA 3MP4A 2QCHA 2CLOA 3IGXA 3NG3A 3P82A 1OFBA 3CC1A 2VFEA 2ISSA 1YPFA 4IX2A 5F4WA 5AC6A 3GKFA 2C13A 3BG3A 1LRNA 3OBKA 1I2QA 3F4NA 5AHMA 1LCOA 2RKXA 3TH6A 2FDSA 1B9BA 3DI0A 3W23A 1MSSA 4BK9A 2A7PA 3IVTA 3N3MA 1T0OA 2JKEA 3G22A 2VFIA 4OWGA 1R2RA 2B0MA 1H7RA 3BK0A 4JTSA 1MZHA 2BLEA 3I68A 4LWWA 3SR7A 1B57A 4YXGA 4JD4A 5HNRA 2WSQA 3GX9A 2E68A 3CWNA 3W2NA 1I2RA 4LS0A 1A5BA 3BGJA 3O6YX 4ALDA 3LTSA 3QRHA 1VHNA 1ONRA 2C18A 3H54A 4IXXA 5LNWA 2ZRUA 4JTHA 1W5NA 3F4WA 3MWAA 2YW3A 5AHFA 5TIMA 2Y63A 4Z1AA 3UZJA 3NQGA 4WY0F 3WJZA 1YPIA 3PF3A 3DKJA 4FNUA 1KV8A 3DH7A 5AC7A 1N7KA 5CZJA 3LBCA 2WPBA 3N2XA 4CNOA 1JUBA 5FI8A 3IEBA 3Q94A 3LHYA 4UFLA 5I3KA 5HULA 5U4NA 3L2IA 4A2RA 5D32A 3W7DA 1BKSA 1M7OA 1TPC1 4BR1A 1SW7A 1QAPA 3IGSA 4R33A 4ZQRA 2GUUA 4UTUA 1W0MA 4ZQPA 3LX9A 3KX6A 3W7KA 3G8EA 5C6MA 1UBSA 3KVJA 2HS6A 5D33A 1B3OA 4PFMA 3EWYA 2OT1A 4KFOA 3S5ZA 2G5WA 2OZ0A 2GQ8A 4AB4A 1KLYA 3KVMA 5CSRA 1TPFA 1DKWA 4BI5A 1IF2A 1VRDA 2RFGA 3QYQA 1OX5A 3HQ1A 4Z08A 1Z48A 3NQEA 1DL3A 1T8XA 1I2OA 3WJYA 3W7HA 2A21A 3KVLA 3RMJA 4LV9A 3EXRA 3AJXA 2ATMA 1LBFA 3IRDA 5BMXA 2GVGA 2BSLA 2RDTA 1GPWA 4O11A 3S1WA 1GTHA 1ZALA 4HSOA 3G1YA 1OFEA 1NF0A 2J9XA 1GZGA 2A7NA 1A53A 1VYRA 2EGZA 2ZZ6A 2FPYA 4IWWA 4TMCA 4JNMA 2E5DA 2QKFA 1FCBA 1ML1A 4BI6A 4UTLA 5A5WA 3I65A 3QH2A 1KM1A 2ZYFA 2YFOA 4UMCA 3TK7A 4ZVJA 2ISWA 4JIQA 4I9AA 4MVAA 1WA3A 3FKRA 4K8HA 2WV8A 4MJMA 2GOUA 2Y62A 1PHWA 1GVFA 2OT0A 4Y9AA 2QCCA 2CLKA 3KFTA 1L2UA 3SIZA 5D2VA 4RJEA 3R2GA 3W1LA 1XCFA 5LHEA 4LT9A 1C29A 1GWJA 1JCJA 5CPMA 5FF0A 3UPBA 4IPJA 3TV8A 5G4EA 1KW1A 1OABA 3I6RA 4PTNA 1F74A 4JTEA 3Q58A 1KM0A 2TPSA 4LVBA 4IMEA 4RXFA 5HUOA 5K7JA 4FHAA 3UYCA 2ZZ3A 4AHOA 4DF0A 4TU1A 5KMYA 5DCDA 1R2SA 3ELFA 1AL8A 4UFHA 1OYAA 4XKYB 5K4XA 2QUUA 3BV4A 3SY5A 2ZZ1A 5FEPA 5K2ZA 4N4QA 4PCFA 1TRIA 3NQFA 3B05A 1SU5A 4ICNA 4HNTA 1K03A 3V75A 2QCLA 1M5WA 4XQ6A 1JJKA 4IXHA 5HWNA 2V8ZA 4DO4A 1TTQA 1SO6A 3E96A 3M1ZA 2E5BA 4LOCA 4ML9A 3UWUA 1VYPX 4MY9A 4LVFA 1G7UA 3LV5A 2V2HA 3S5OA 3ATZA 4ZL1A 1EWDA 3F03K 2ZA2A 5CPOA 1OHLA 5EYWA 3GVGA 4UMBA 5CKSA 3NXFA 5HWJA 3TAOA 3MJYA 1QR7A 2Y89A 2A85A 1Q6OA 3GZ3A 3QZEA 2JGYA 2FPVA 1VCFA 2VELA 5K9DA 3OIXA 1O5XA 3EX1A 5DBTA 1R46A 4N9DA 1JCXA 4UMAA 3NL6A 3ATYA 3N9SA 4Y8FA 4E0CA 4NVTA 2HMCA 2E6YA 3TNOA 3GDRA 2IQTA 2CU0A 3LTPA 3W2LA 4ZQOA 1PCKA 4N6FA 4O10A 3BG9A 3GKAA 3PC0A 4JX5A 3QM3A 5G2WA 2O7QA 3BW3A 3FKKA 1MO0A 1A5SA 2WSYA 3B06A 2B7QA 3KVKA 3S5YA 4WX2A 3TQKA 3D0CA 4MOZA 4MY8A 4W9TA 1AW2A 1W3IA 5F4XA 3HPXA 3M5YA 1WXJA 2NWSA 4NZJA 3PS7A 5BOOA 3P60A 3UZ5A 3W2MA 3NEVA 1QOQA 1TSIA 1SR9A 2ZRVA 3VE9A 4XBKA 4IPIA 3VI2A 5LSMA 1BTMA 4GWEA 1S5WA 2YPIA 3ANYA 3HG5A 5CPLA 4JTTA 4FX6M 3O6DA 3OHIA 3W7GA 2X1TA 2YW4A 4U28A 4N9CA 3DKLA 2VEPA 1H51A 1XBZA 4EF8A 4BF9A 3FYOA 5EPDA 3JR2A 1K7EA 3SI9A 1CW2A 4DELA 3M5ZA 2B7PA 2PRHA 1TCDA 4FXSA 3LCGA 3LHTA 1WYIA 4GUHA 3C2EA 1O95A 3NL2A 4R34A 5DY3A 4NJKA 1SSDA 3TCEA 3TFCA 4GNJA 5J5RA 4HN4A 4WD0A 3LHZA 1KTBA 2EHHA 4CNPA 1U83A 1FQ0A 4E2BA 1F6KA 3MYPA 5AOUA 3W1XA 2TYSA 1YTKA 4HNNA 4L4MA 1FXQA 1W3TA 1NF7A 4JXCA 4WY0B 2E6DA 1WOAA 3ZWSA 2YYUA 3RNDA 3GR8A 1YADA 3USBA 3TAKA 1O5KA 4UTTC 1H7OA 1KFCA 1XL9A 1KTNA 2C19A 1G4TA 4O1DA 1V7YA 1FWWA 3QSTA 2ABAA 1EA0A 4QNEA 4O13A 3NPVA 4K6AA 3W7JA 3PULA 2C0AA 3NQ2A 3G1SA 2CLEA 3SGUA 1M6JA 3HOJA 3MW7A 4HNUA 2JBMA 3FIGA 4DBEA 3RK8A 3EX2A 3QMTA 1Q6QA 4LV4A 3TDFA 2VFDA 3C2RA 2QAPA 4AWSA 2ABBA 2DZXA 3TJXA 3NQVA 3O06A 1WOBA 1GTEA 2NUXA 3LRMA 4GJ1A 1JUKA 1TO3A 3CIXA 1K8XA 3P8IA 4WUIA 3SW6A 3L0GA 4H3DA 3LHUA 1SQ7A 1OX4B 3CPRA 3CQ0A 1OG0A 3WK2A 4UTWC 2YFNA 3PBVA 5EKYA 4A22A 2GPTA 4AXKA 4Q32A 4U4MA 2H8ZA 7TIMA 1JQXA 1FDYA 3C2VA 4FX7A 3W1RA 1S5TA 4K7VA 2WOQA 1UB3A 4JEQA 3W7PA 3NM1A 3PY2A 1LOSA 1P0KA 4D2JA 3KRZA 3PAJA 3LCLA 4DF2A 1LBMA 1VCVA 5CPNA 1W5OA 3MHFA 1OVDA 1AG1O 1VR6A 4C1LA 1G69A 1WX0A 1ZY9A 4OV9A 1W1ZA 3SECA 3PR2A 3ZR4A 3EWBX 1DVJA 5LGZA 1N55A 2E6FA 4LUIA 4O19A 5G1YA 1PL9A 1FWTA 3GB6A 2VFHA 5HR6A 3BARA 2ZTJA 3P5YA 2GJNA 1LTDA 4XKYA 1ICQA 1CX9A 3P62A 4UNLA 5D02A 3THQA 3CTLA 3VFLA 2YXGA 2BX7A 3NNTA 1XKYA 1R47A 2PRLA 1BWKA 3DGRA 3R5EA 3DFQA 4JTUA 1OYBA 3QSRA 4QQ3A 2DZTA 4GUJA 3O15A 1XBXA 4A29A 3B04A 1K7XA 1W5MA 3A24A 4GUGA 4H4IA 1W37A 4CLMA 5F2GA 3G1AA 4Q4KA 2OJPA 1JRBA 2BXVA 3GXPA 4K38A 5IBXA 3HB9A 5AN7A 3W1NA 5K9XA 4XTDA 3NPUA 4AMAA 3W72A 2AGKA 1ZFJA 1J4EA 4IUOA 3QPZA 1S5VA 3DAQA 3KXQA 3TKFA 1SFJA 3TU9A 3CU2A 5C5YA 2V9DA 4YMZA 4KKXA 3C56A 5FF7A 3PBUA 1L6SA 4BFAA 2I14A 1I2NA 4JYDA 4IQLA 5ABTA 2CLFA 4NT0A 5DBUA 2R94A 4FO4A 1TPH1 3BW4A 4S2BA 2X30A 3W1QA 4UFJA 4MFEA 1G7VA 2CW6A 4JYFA 3QFEA 4EIVA 3QQ1A 3NQDA 4O28A 1QOPA 4HKPA 1XUUA 3TUUA 2I1OA 1VS1A 3FEMA 3W74A 3SJ3A 3UQNA 5AC8A 2NX9A 3T44A 4O15A 2V81A 2VOMA 4FIRA 3LV6A 2B7OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2FVK A;  3RUB L;  3FY1 A;  4B5X A;  3W4R A;  4YWI A;  2FZB A;  3BGG A;  3BAI A;  4NL1 A;  4IQD A;  2Z1W A;  3RM8 A;  3TYB A;  3VIF A;  1HW6 A;  5A8Q A;  5AHL A;  4GI4 A;  2WMH A;  1XH1 A;  4NX0 A;  3TYU A;  3CYV A;  4P2V A;  4UNI A;  4PUN A;  2IW0 A;  3HQN A;  2D20 A;  5CG7 A;  1PE1 A;  3P93 A;  3KM8 A;  1P1M A;  5HMD A;  2VL4 A;  3MT1 A;  4UTW A;  5DAN A;  5HWM A;  2OGY A;  4ES4 A;  4ORI A;  3S6O A;  2P88 A;  3ARU A;  4FNS A;  3WD2 A;  4PR4 A;  3GFX A;  2OX1 A;  5L6U A;  1T7L A;  1V6U A;  3MVI A;  4I5R A;  3ABZ A;  2PDB A;  3B9O A;  3BV7 A;  3WH8 A;  1UUO A;  2V0T A;  1EB3 A;  3H26 A;  3BQ5 A;  1Q6R A;  3VDG A;  1AA1 B;  1Q8J A;  2WW5 A;  3IUI A;  3TJI A;  1ZAJ A;  5DT5 A;  3KLK A;  1O12 A;  1TV5 A;  1PXG A;  2FB2 A;  2PI6 A;  2XUC A;  3UA3 A;  3DHU A;  1SFL A;  4DO7 A;  4UTI A;  4NAS A;  1W8S A;  1GEH A;  2BGN E;  1MXD A;  3A9I A;  4GX8 A;  1EYW A;  1BXC A;  2W0U A;  7CGT A;  1U33 A;  3PTQ A;  3I6E A;  4IL0 A;  4WEV X;  4QLJ A;  1AOD A;  2PDP A;  2WZT A;  3WDR A;  3CXO A;  2W27 A;  4B9Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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