1EX5A

Fructose 1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVAPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFISNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE
publication title A conserved glutamate residue exhibits multifunctional catalytic roles in D-fructose-1,6-bisphosphate aldolases.
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 121
structure length 363
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2000-04-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ex5A00
4PFMA 4JD4A 2ZRUA 3TX9A 4A22A 3B4UA 3TC6A 1R46A 2A0NA 1TPUA 4IWWA 1A5CA 3CB8A 1VJIA 5I3IA 4O14A 3UYCA 4DO4A 1MSSA 4Q4KA 3UWWA 4K8EA 1JULA 3D0CA 4JDYA 3NQGA 3C3NA 1OJXA 3KVJA 1G69A 1M5WA 4FNSA 2NXGA 2BSLA 4XTIA 4UTTC 5CSSA 1TJRA 2DZVA 2ZZ7A 5CSRA 1Q3NA 3LHTA 3QSTA 3TMQA 2TSYA 1VH7A 3LDVA 3W2KA 4Z1AA 4LT9A 1W0MA 2HMCA 4UFIA 1FUYA 3EWZA 1LRQA 3FS2A 3O6DA 1KTCA 1L9WA 1SZEA 1X7FA 2ZA2A 3AO0A 1TV5A 3W3OA 3FYOA 3SGZA 1QAPA 3EB2A 1Q6OA 1UCWA 4TR9A 3MW7A 2A85A 2QCFA 1TPEA 2A7NA 3VE9A 3W7JA 2W0UA 3PS7A 4TX9A 1TPC1 3EKZA 3S42A 3TR2A 2NUXA 3M5ZA 2E6DA 1TPB1 2QAFA 3EX6A 4UCGA 1FWTA 1OFPA 4LNYA 1X1ZA 1GQNA 4LV9A 1ME7A 3IVTA 1YLVA 3IGUA 4OU1A 3B0VC 3S8HA 3W22A 1ME8A 2QDHA 3GDTA 4YCPA 1HL2A 1TMHA 1OX5A 1TSIA 4AB4A 1F6KA 3PB0A 4O11A 4A2SA 2VEKA 1B4KA 2C0AA 4OWGA 3JR2A 1JCLA 3LTSA 1Z48A 4FNQA 1K8YA 3W07A 2VKZG 2P0OA 2Z2UA 3QF0A 4PL1A 3LLFA 4IMDA 4UTIA 5LHEA 3G1SA 2FTPA 3NPWA 1OFDA 3HB9A 3W2NA 3RFAA 4Z1BA 3W1NA 2X30A 3IV3A 5D33A 3TMLA 4X22A 4N02A 5C6MA 1ZFJA 4Z1DA 5BMWA 3T7VA 2TPSA 1XDLA 3GDLA 2WNZA 3UQNA 1PVNA 2I14A 1I2PA 1H5YA 2R94A 4YXGA 5F2MA 1YTEA 3HG3A 1SW7A 3UY7A 3W7HA 5HMSA 4LRSA 4OHQA 1OK6A 1GYNA 5I3KA 2VEIA 4AH7A 5LGXA 2CLEA 1AL8A 4BI5A 3NQCA 3LXCA 3C8FA 4MIMA 4LC8A 3CEUA 4XQ6A 1BKSA 4LC6A 3W23A 3DHFA 1KBJA 2V8ZA 4X2RA 2QCDB 1CW2A 2XFWA 1JQVA 3WJZA 1TTJA 5HJLA 1ZCOA 4CCCA 3O1NA 3KRZA 1AW1A 1WXJA 1VQTA 3KAOA 3F03K 2QCNA 1HO4A 3GZ3A 2A5HA 3P62A 1ICPA 2QCHA 1PL9A 4UXDA 1DQWA 3M6YA 3TSBA 1B9BA 3INPA 3S5YA 3TJLA 5D30A 3TFCA 4MY8A 4DPQA 5HQEA 3M5VA 2YFNA 3PR2A 3C2VA 2DJXA 3HGJA 3OVRA 2ZRXA 4CCEA 3MYOA 3M5YA 1HFBA 1SSGA 1TJPA 4JX4A 2NV1A 2A1YA 3NGJA 1X8FA 4QQ3A 2C3ZA 1I8JA 2GJNA 4IMCA 1HG3A 3MO7A 2PRLA 3NZ1A 4WOZA 3QPYA 4O10A 3C2RA 2J24A 3TSDA 3QM3A 3FFSA 3NL2A 3LRKA 5L6UA 2CW6A 2QCMA 2DORA 1WBHA 3KVLA 3SW6A 3L5AA 2O7QA 3P61A 3G8EA 4IMEA 3CHVA 4M5PA 5CPOA 3LI0A 4FNUA 4AMAA 4ADTA 3L0NA 4K8HA 3GXNA 5E93A 4PEKA 1YPIA 1MEIA 2H8XA 3CPRA 4EF8A 4JTHA 4Z1CA 5EA9A 5IBXC 1TREA 4H3DA 2JBMA 1LP6A 3TW7A 2QUUA 4UMBA 2ISVA 4XZ9A 4Z08A 1RV8A 5K9XA 4AHPA 1XBXA 4CNPA 5HWMA 2Q3OA 3DBPA 2H3DA 5DCBA 3PAJA 1GT8A 3IVSA 2XN1A 4E0CA 1EWEA 1WYIA 4RX0A 5EYWA 3WFAA 3W83A 1KFLA 4XWUA 1LROA 4KWVA 1H7XA 1TTPA 2V0TA 1AL7A 5I3GA 5E0KA 4UTJA 2HS6A 2C1HA 1H63A 3QRHA 3ZFHA 3WK2A 4DO5A 1SZFA 4UMAA 1JRCA 2DZXA 1VHNA 3SSJA 4UTWC 1DOSA 1I45A 3BLIA 2C6QA 3O6CA 3T78A 2YYTA 4MKNA 4UTKA 5ABTA 2YZRA 4N9EA 4BFAA 3NYZA 3QW3A 1SUXA 1EP1A 1NF7A 2V82A 3S6DA 2C16A 1R2TA 1Y0EA 5F4XA 3W1TA 4RZ4A 1RZMA 5U7SA 5KZMA 2DP3A 4ZQOA 5J5RA 1FXQA 1VS1A 5DBUA 3HG2A 1UUMA 1X6UA 2CWNA 3FEMA 5EPDA 3LOTA 5AHIA 2ZYFA 2RHGA 4JIPA 4MZYA 3LGEA 1D3HA 1EX5A 1GVFA 2Y6ZA 3C6CA 1I2RA 5AHMA 2ZQ0A 1K7XA 4GUGA 2WSYA 4XUGA 4CNNA 1VYPX 3GLCA 3SFKA 1QPRA 4LUJA 3EXRA 2WSQA 1WX0A 4AWUA 4IJBA 1A5BA 1TV8A 1ZAHA 2PE4A 3F4NA 4YMZA 1LDCA 4HPXA 3G1FA 3BG5A 4IPIA 3TJXA 3G0SA 1PHWA 3ZR4A 1DL3A 3DAQA 1GVRA 4Q33A 1L6SA 4C1KA 4N9BA 1DHPA 4O13A 1OX4B 2YDAA 4E2DA 3NXFA 4FNPA 3GVGA 3N2MA 2H6RA 3NM3A 3KOFA 5BOOA 1G4TA 3QQ0A 2H90A 3DFNA 3IGSA 2NV2A 3OIXA 3KX6A 1OFQA 3CLMA 2QJIA 1W5QA 3M47A 3QFEA 3EXTA 1QO5A 4M19A 4MJMA 1FWSA 1V5XA 4MJZA 4HNTA 4J9JA 4JXCA 1LLZA 3NM1A 4QIUA 5BMXA 1XBVA 2F7FA 2WNQA 4JTKA 2TRSA 4Q32A 3SY5A 4BF9A 1YXYA 2VENA 4FIQA 2TMDA 2H8ZA 1IF2A 3P5YA 3W7LA 4U4MA 1GVOA 2A6LA 1PHQA 4FF7A 3BARA 1FCQA 1F76A 3DFQA 2ZRVA 4O4VA 4RR4A 3ZWSA 3CWNA 1TPH1 4EIVA 3M0ZA 3W7CA 1O60A 4OV4A 1GPWA 3B8DA 5KMYA 1YYAA 5IM51 4I9AA 2QF7A 1O4UA 1H61A 4UIOA 3UWQA 2OZ0A 4BWLC 4DXVA 2YXGA 1K8ZA 4TU1A 1M7PA 4S2BA 3S1XA 4HN4A 5CG7A 2V2CA 1AW2A 2W6RA 3C52A 4Y6GA 8TIMA 3P60A 1W8SA 5CPMA 2YFOA 5DY3A 1DQXA 2Z6JA 4FX6M 5AHEA 1S5TA 3NPXA 1OG0A 3QSRA 1ALDA 3PC0A 4FXSA 4AHOA 2NZLA 5BW6A 2B4GA 4UFMA 4QISA 3BV4A 2C19A 4BI6A 4O1CA 2ZZ6A 1FWNA 3LHWA 2FLIA 3DGRA 4WXZA 1Z42A 3M7WA 3UZ5A 2WOQA 1H7OA 1OVDA 1WBJA 3THQA 1DJQA 3CIWA 4UNLA 3C61A 1WOAA 3DI1A 4XTDA 1VZWA 3IEBA 4A3UA 2X2GA 4POCA 1SPQA 2NWSA 4GBUA 4K37A 5HULA 4PC8A 2B7QA 2Y7DA 3A5VA 1C8VA 1TTIA 1MEHA 2FPVA 2QUVA 2Z6IA 1VCFA 4O15A 2QJHA 2Y63A 3QPZA 3B0PA 1JR1A 4JTUA 3DHDA 3WJSA 4N4PA 1LBFA 3KRUA 3MP4A 4A2RA 4IXHA 1WOBA 1JUEA 3QH2A 1ML1A 1VRDA 2G95A 4ONVA 1UBSA 2JGYA 1TCDA 4CLMA 2YW3A 4BI7A 4IQLA 1JCJA 5HUOA 4N9DA 4DELA 1F73A 4XBKA 1GG0A 3AJXA 4QITA 1LRTA 3TE9A 1YADA 1K7EA 5FF4A 3L2IA 1H7WA 4Y90A 3CEPA 4O50A 2Y61A 3STCA 5AFDA 3PBVA 4K39A 3TSMA 1KV5A 1FBAA 3M1ZA 1NF0A 5D32A 3F1QA 3S1UA 3QMSA 1ZJIA 2V2DA 4HSNA 4S2CA 4HIBA 4AWTA 1K8XA 1JCYA 4IGHA 2R8WA 3B05A 4UR8A 5FEXA 1TV7A 3QC3A 3KFTA 3KHJA 3W7DA 5D2WA 2B0MA 1H7NA 2I9EA 4TO8A 1EP2A 2X1RA 4EWND 2V5BA 1OYBA 1XBZA 4AF0B 4CQ9A 2CLIA 3T44A 3BW3A 3G1DA 1XKYA 3W2MA 4RZ5A 2A7RA 2W79A 3B0UX 1EA0A 3GXTA 2BZNA 1VYRA 5D2TA 1J2WA 1P0NA 2EF9A 3UD6A 3GB6A 5HUPA 1SW3A 3TKFA 4NZJA 1QPQA 4OQVA 4LWWA 1P5BA 2AQWA 1W5OA 3V1PA 2F84A 1NFBA 4LW7A 4RK8A 2C18A 1KFKA 2B7OA 4O53A 5TIMA 1O94A 5AN7A 4EVZA 4WY0F 4O1AA 2Y7GA 3L9CA 1XUZA 3E96A 3HJZA 3W86A 2PC4A 4NX0A 1IIGA 3M41A 1GTEA 3EX4A 1VCVA 4UR7A 5AC8A 1GG1A 3G1AA 3W76A 1IXQA 3HF3A 5G4EA 2J6XA 5H2ZA 3P8IA 1S5WA 3HMJG 5HWNA 3GKFA 3U2OA 1PCWA 1TRIA 3SR7A 1JUBA 4UTLA 5A5WA 1LTDA 1A5SA 3PVFA 5D03A 3TV8A 2CZDA 4Z0SA 1R30A 4O1DA 3L0KA 5K4XA 1FQ0A 4IMGA 3PBYA 2QEZA 1XUUA 1FWWA 3DZ1A 2QCGA 4N9CA 3M9YA 4H6KA 5IBXA 3W7RA 2ZRYA 3GR8A 3O16A 1RR2A 3A21A 3KVKA 1HTIA 3G22A 4M6PA 5CKSA 3RK8A 1LM1A 1XC4A 1B4EA 1N8FA 1SZGA 1ZAIA 2YPIA 1KM4A 3FJLA 4JTGA 1YXDA 3W2JA 3P7YA 3EX1A 4ZL1A 3W7QA 3PM6A 1FWRA 4UFLA 3W7KA 4YWIA 2R91A 5G2WA 4RXGA 1TPDA 4LVDA 1FDYA 1KM6A 2RDUA 1SO4A 4NNBA 3UWUA 4NJKA 1UB3A 2E09A 1T99A 4R34A 3W1XA 3BK0A 3ANYA 3IIVA 1K7FA 3V75A 3EXSA 3LERA 3LXBA 4UTHA 1AW5A 3P5ZA 2KZHA 2ZCGA 4TMCA 2RH9A 3W85A 1GEQA 4UFJA 4FX7A 4WY0B 3TC7A 3PBWA 5F1UA 2GOUA 5A8GA 4YCOA 4NJHA 1OX4A 3TQKA 5D04C 5AHLA 3G0UA 3PY2A 4M6QA 1TQXA 3OBKA 4QNEA 1PIIA 3NNTA 1XI3A 1EUAA 4FIRA 4OV9A 3FKKA 5AHFA 1X1OA 1QR7A 2PRHA 4KFNA 4PODA 2C15A 4PA8A 6TIMA 3SI9A 4YLWA 4JGDA 4O12A 4HHPA 3Q94A 4LS0A 2ATMA 4JY9A 3C2EA 4N2YA 2VFIA 1GVSA 1VYSX 2BLEA 4RV8A 3TQVA 4OE7A 3DKJA 1VC4A 1DJNA 1TRDA 2ZZ4A 3LTYA 3NO5A 4R33A 1KV8A 3HPXA 4IXXA 5FEZA 4DEFA 1G67A 4I7WA 1P1XA 2NX3A 3PBUA 2PRMA 5F2GA 2GQ8A 4M6VA 1VLWA 1MO0A 3PUEA 3LHUA 4NU7A 4PCFA 1W3NA 3UWZA 4K36A 1T96A 1SZNA 3A22A 2BXVA 3DFOA 3HG5A 4L4MA 3N34A 1UJPA 2EKCA 2CLOA 3UXDA 1KLYA 2E77A 2V81A 1LRNA 1KM3A 3UNDA 1QFEA 1JVNA 1OF8A 3CM4A 1YDVA 1OFRA 3NG3A 1LORA 4A29A 3S1VA 2E6YA 5AC7A 2FJKA 2A2IA 1W5MA 2QCLA 5HWJA 3TXVA 3BLEA 3S5ZA 3GDMA 5I3HA 3BO9A 1KLZA 2DJLA 1EUNA 3LV5A 3HGOA 1EEPA 4DF2A 3I7SA 4N6FA 3MWAA 1H62A 3E49A 2FPYA 3GR7A 4LTSA 4O18A 4RKAA 1YXCA 2VFHA 2GQAA 3WJYA 3TK7A 2E5BA 3WK0A 3M44A 4DO6A 2EPHA 1W31A 1XXXA 1W3TA 4UFKA 3TIMA 1EP3A 2QCCA 1DVJA 3EEGA 1KFCA 3W7NA 4BR1A 3NOEA 4HKPA 1LOSA 1C29A 3VCRA 4I7VA 5C54A 3NQ2A 3STGA 3LV6A 3ABQA 4QNWA 3N3MA 1KFJA 3E9AA 3NR0A 2CZFA 1QDSA 1THFD 3FYPA 2QUTA 3W74A 3FIGA 1KTNA 2FDSA 2EHHA 3FLUA 3NQAA 4WQ6A 3GDRA 4GE8A 4NT0A 4PL2A 5I3JA 1JQXA 3PG8A 1FX6A 3MP3A 5FF0A 3A9IA 4JYEA 1WAUA 5SWUA 1GYLA 3TH6A 1UASA 4MY1A 4RLIA 2Q8ZA 3BVJA 3G24A 1E51A 1W37A 1W5PA 3ABSA 3CQ0A 5CPNA 3ZS4A 2NUYA 3P80A 3W73A 3QW4B 3VNDA 4X9SA 1FY6A 3QEZA 3I7RA 3W9ZA 5K9CA 2VFEA 1FCUA 2QCEA 1WQ5A 4HNNA 1J4EA 5AHNA 1OFAA 3TU9A 4DQWA 1W54A 3KXQA 4QSHA 5C5YA 3LCWA 2Y62A 3BW4A 3BPWA 4FB7A 5CZ0A 3B06A 3NAVA 3W1LA 2E6FA 3C0JA 4ZMGA 1KTBA 4N6EA 2CLKA 3TROA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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