1F2J | Genus

Total Genus 145

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	145
sequence length	357
structure length	357
Chain Sequence	SKRVEVLLTQLPAYNRLKTPYEAELIETAKKMTAPGKGLLAADESTGSCSKRFAGIGLSNTAEHRRQYRALMLECEGFEQYISGVILHDETVYQKAKTGETFPQYLRRRGVVPGIKTDCGLEPLVEGAKGEQMTAGLDGYIKRAKKYYAMGCRFCKWRNVYKIQNGTVSEAVVRFNAETLARYAILSQLCGLVPIVEPEVMIDGTHDIETCQRVSQHVWSEVVSALHRHGVVWEGCLLKPNMVVPGAESGLKGHAEQVAEYTVKTLARVIPPALPGVTFLSGGLSEVMASEYLNAMNNCPLPRPWKLTFSYARALQSSAIKRWGGKESGVEAGRRAFMHRAKMNSLAQLGKYNRADD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE, GLYCOSOMAL
publication title	Structures of type 2 peroxisomal targeting signals in two trypanosomatid aldolases. pubmed doi rcsb
source organism	Trypanosoma brucei
total genus	145
structure length	357
sequence length	357
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2000-05-25

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1f2jA00

3M9YA 4JN6A 4IMFA 1M7PA 3L2IA 3M5ZA 1GTHA 3I7SA 4NZJA 3C2VA 3PVFA 4G1KA 2Y70A 1CW2A 3FKRA 3BV4A 3EWUA 3JR2A 4IUOA 1SR9A 4OGZA 4RLIA 3HG5A 3MP3A 2V2HA 4N02A 2FLIA 4PA8A 2ABAA 3I7QA 1W8SA 3L0GA 3PULA 5DXYA 2P10A 2WJZA 3S5OA 3ABSA 1G6CA 2TRSA 1P5BA 5K9XA 1F73A 3LLFA 3S1XA 1O95A 1GVSA 4NJIA 3W88A 4UTWA 5F2IA 2RH9A 3W1TA 4UTWC 2I14A 2A85A 4UTJA 3QPZA 1QPOA 2JGYA 3W7NA 1EIXA 3PUEA 4AWUA 4O4WA 1YTEA 4UTTA 4MY8A 2V2CA 3NPXA 5HWNA 4UTTC 3GDKA 2ZA3A 2H8XA 5LNUA 1VJIA 5DY3A 5FEWA 1MEWA 3F4NA 5LNRA 5C6MA 1QNVA 3G1XA 2C0AA 2GQ9A 1XUUA 2PCQA 4UR7A 2YPIA 3KVJA 1KM5A 3DGRA 1TTQA 4AHQA 3W22A 1YDOA 3HIJA 1KM6A 4ZQRA 4JY9A 4CNOA 5LHEA 4X3ZA 1J4EA 2FTPA 3LOTA 3LV6A 3G1AA 3OG3A 5AC6A 2J27A 4PODA 2ZZ5A 5DCBA 1G4EA 4ZQMA 3PSVA 1XXXA 3W7OA 2CLIA 3NPUA 3W7CA 3QF0A 4LUJA 2CZEA 2FB2A 3EKZA 2QCCA 4NJGA 3DAQA 5D03A 2GJNA 4NZFA 4UTMA 1OYAA 1QR7A 2G97A 1TRDA 1VZWA 2DZUA 4GE8A 3NL5A 3GB6A 1VR6A 4MZYA 2A6LA 3NQGA 3ATYA 5AOUA 4DBDA 3W84A 4JYEA 4ORMA 4A22A 3O6YX 1FWTA 2WSYA 4QNEA 1VHCA 2R14A 1FCVA 3RU6A 2O7QA 4JGDA 3DBPA 1OK4A 5U7SA 1RR2A 2JGQA 2ZZ2A 3KRSA 1Q6QA 2FQIA 3MP4A 2DJXA 2KZHA 1I2PA 3LI1A 3UNDA 5AC7A 4UXDA 1PS9A 4FXSA 1FWSA 3GAYA 4DF1A 2JKAA 4HNTA 3GXNA 2GQ8A 3C61A 3QFEA 1OF8A 4MJZA 3W6YA 5G1TA 4JTHA 4OV4A 3SW6A 4JR5A 3P74A 4O12A 3S42A 1VC4A 3UWYA 3P61A 3CIXA 3MP5A 3P80A 4M7SA 1VS1A 5HR6A 2E6FA 1B9BA 1SO5A 2J9YA 1Q6LA 1I2OA 1SZEA 1LORA 4AHOA 5TIMA 1G67A 4O1DA 3W7MA 4UNKA 4NT0A 3S8HA 1O5XA 5FF4A 5LSMA 4NNCA 4JXCA 4QJ1A 4ONVA 5AFDA 2CZFA 2HS8A 1T96A 1JULA 1KLZA 4UFIA 3QW4B 3GKAA 3TX9A 1I2RA 1FWNA 4HNNA 4ZL1A 3QQ0A 3W23A 5K7JA 1ML1A 1ME7A 1LZOA 3S5ZA 4RZ4A 1KFKA 1X1ZA 3OEXA 3HF3A 3W75A 3G3DA 3TROA 2E68A 5CPOA 1NF7A 3LBMA 5AHNA 1ME9A 4UFKA 2WPBA 4ZMGA 1KTCA 3DFNA 1F7BA 1LM1A 1HUVA 1U5JA 3GNNA 5G4EA 4DO5A 2PRLA 1VLWA 3TE9A 3GZ3A 4UUIA 1QPNA 4Q33A 4CQAA 3NL3A 1GG0A 4N2YA 3W1LA 3E12A 3BLEA 1LOLA 1EP1A 2YFOA 3VFLA 4OQVA 3M7WA 2H3DA 3PF3A 4RV8A 1TV8A 5FF0A 3LHVA 1SUXA 5IBXA 1SW7A 3W85A 5T26A 5IBXC 1A5SA 3IV3A 4M6QA 4FNRA 3LRKA 4XBSA 3TFXA 3WJXA 1QMLA 1WBJA 3SECA 5C5YA 4O11A 2A6NA 4O19A 1TTPA 1OF6A 1AW2A 3H55A 5A8GA 3HGOA 5D30A 1GVFA 5CG7A 2A7RA 1FDZA 3LHUA 2FPVA 3TU9A 3MHGA 1JUBA 2QF7A 1H7WA 4U4MA 2ZDRA 3W76A 3WJZA 1H7NA 5D05A 3NZRA 1JCMP 4GUHA 1DQXA 3UWQA 1TPEA 3UXAA 1L9WA 4BWLA 1XM3A 1A5AA 2GUUA 4K38A 3QSTA 3W7DA 1X8FA 5DBTA 3STGA 2QDGA 3GK0A 3BG9A 3OBKA 4H3DA 4QIUA 3DKLA 4AXKA 2WNZA 3UXDA 3G8EA 1I45A 2DZPA 3PG8A 4FHAA 3EX3A 2QJIA 3A5FA 3QMRA 3UWUA 1SSDA 4GRSA 3FJLA 1IXNA 1M6JA 3TR2A 1SW3A 4LVDA 4ML9A 4I7VA 3M43A 4MYXA 4NXSA 5FEZA 3IIXA 3F03K 4NX0A 4CQ9A 1Y0EA 1H60A 4AAJA 2C16A 5I3JA 5AHEA 3Q58A 3LXBA 3RFAA 5L6UA 3NQFA 2A21A 4MYAA 4MKNA 1VQTA 2W6RA 4UMAA 3WK3A 1FY6A 5A5WA 1LRTA 2BX7A 4ALDA 3PSWA 4IMEA 3RK8A 3TDFA 4CNPA 5CZ0A 5H2ZA 3P7YA 3MW7A 2W79A 4C1KA 3OVPA 4JTLA 1TO3A 2DORA 3A23A 3HG4A 2QEZA 2FPYA 3TC6A 4EOUA 5E0KA 1OFRA 2QCGA 4WQ6A 2XFWA 4MY9A 3WJWA 1SO6A 1UUOA 4LS1A 1ZAJA 3CM4A 1TJPA 4QAIA 2A1YA 1WDWA 1HL2A 4Z0JA 1F6PA 2ZA2A 2JKEA 2NXGA 1YDNA 1OFAA 1G4PA 3LCFA 3P81A 1JUKA 4ZQCA 3GIYA 3QSRA 1QFEA 2X1SA 3NPVA 3WJYA 3DI1A 4U28A 3W74A 5TBOA 3IVSA 1ZCOA 3ZWTA 3M16A 2ZTJA 5F2GA 1NEYA 2V30A 2VEMA 1XFBA 3SGZA 3PAJA 3C6CA 5D09A 3C2FA 4N9EA 4QSHA 3B06A 3MJYA 2GQAA 4WXZA 3LBCA 4O13A 4LW7A 3EX1A 5SWUA 2JBMA 3W71A 3DFOA 4K36A 4QITA 2R91A 3THAA 2J9XA 2EHHA 5HR7A 2VOMA 3QYQA 5LGZA 3OVRA 4JTEA 3M1ZA 4PL2A 3DH7A 3O6DA 3CC1A 1LLWA 3LTSA 4N6EA 1L6SA 4Z1AA 1UCWA 1IXQA 1AL8A 1D3GA 1X6UA 5D33A 1AG1O 2FJKA 3TUUA 1W54A 3CLMA 4KFNA 5CKSA 3O6CA 4XTIA 1GVOA 2B7OA 2J88A 1O5KA 2QCFA 4Y96A 3SFKA 4IMGA 3IRDA 2DZXA 3PB0A 3KXQA 2E5CA 4MY1A 2YR1A 4UTUA 3FA5A 3THQA 3P60A 3TFCA 3AO0A 4PCFA 2C19A 1VLIA 2NXIA 1N55A 1IF2A 3ANYA 2TSYA 3TAOA 5DCDA 3Q37A 4ICNA 2CLOA 2CU0A 4PEKA 1IGSA 5AYXA 1UASA 3CQ0A 3CWOX 1C9DA 1V7YA 2RFGA 3GDTA 3GDLA 6ALDA 4CCCA 1TTIA 3E96A 1SZNA 3FFSA 2YSWA 5KINA 2GVJA 2FIQA 5U4NA 3SSJA 3N2XA 5BNKA 4O28A 4JYFA 3BLIA 3KHJA 1ZNNA 3NGJA 3DZ1A 1A53A 2DJLA 2BZNA 4FF7A 4BI5A 1OFPA 5LGXA 5G1YA 2X2GA 5G2IA 1XBYA 2CZ5A 1AK5A 1YTKA 5F2LA 2NX1A 2ZRXA 4O4VA 2J24A 1KM0A 3GVGA 3WJSA 2ISVA 2WV8A 2FPTA 4HPXA 5I3GA 2VKZG 1GYLA 3HPZA 2ZQ0A 4DXVA 5LZLA 3C52A 1DL3A 1TB3A 4O50A 4N6FA 1V5XA 1NVMA 1LROA 3P5ZA 1QOPA 2B0MA 4RX0A 2NWRA 1FXPA 4IMCA 5E1QA 1BWLA 3W2NA 4LTSA 3HGSA 5CPNA 1TMHA 1YXYA 3NR0A 1SSGA 2B7PA 1K8ZA 2CLHA 1KV8A 3O06A 2DZWA 3A24A 3FKKA 3TSMA 4OT7A 5EA9A 3G1DA 2QCDB 1WV2A 2QAFA 3KRUA 3A22A 2R94A 4MPQA 1VCFA 3C0JA 3EKLA 1SU5A 2CLLA 1F6KA 1F2JA 1W5OA 2H3BA 1QOQA 2ZFAA 3W1RA 3RLVA 3KVKA 3H53A 4M19A 3PR2A 1NAL1 3HQ1A 4Z08A 3QMTA 3NL2A 2CLFA 1HG3A 4AWTA 5J5RA 2C13A 3W1NA 3NQCA 1QPQA 3PG9A 3A21A 1CI1A 3YPIA 2V0TA 1WBHA 1HO1A 2I1OA 1C8VA 3LM7A 4NU7A 4Q4KA 3BG3A 2PRMA 1W31A 1N7KA 1AMKA 1H7RA 4FNSA 2HS6A 3HMJG 4JS3A 2XN2A 2IQTA 3P62A 3T4CA 4FX6M 4UC5A 5LNVA 4YL2A 2GPTA 3ATZA 4L4MA 4PTNA 4Z1CA 2V82A 1KFEA 1YXCA 5CSRA 3OVQA 4BK9A 5D32A 1LOQA 3FJ6A 1W5QA 5BMWA 3ABRA 3IEBA 2UV8G 2ZYFA 3G18A 4RK8A 2Y6ZA 1PV8A 4BR1A 3NQAA 1OX5A 2YW3A 4EF9A 4XBKA 2Y88A 5AB3A 5G2WA 4JEQA 4E38A 2CLMA 4LVBA 2X30A 1VYPX 1GT8A 3DFTA 3ZR4A 1LRQA 3L0KA 4A29A 4GXMA 1LBFA 5FF2A 3W1XA 3T55A 4ZZ9A 3NQMA 3QEZA 4NUWA 3O07A 2DZSA 5F1VA 3IIPA 2Z0IA 1KBJA 3UWWA 3M41A 2VFHA 1IXOA 1Z48A 1GZGA 2E6YA 3U6WA 1RZMA 1HTIA 3NA8A 3QM3A 1O4UA 4KWVA 3L65A 1XUZA 2H8ZA 1FDJA 4POCA 3IGUA 1Z41A 1JCLA 3G22A 4LVGA 4XUGA 3H54A 2YYTA 3W9ZA 4R7JA 4UFJA 2HMCA 2QUVA 1UJPA 3N34A 1O60A 1DORA 3RMJA 4MFEA 4L4LA 4LVFA 2F84A 5K4ZA 2QCNA 1XCFA 3R8RA 4O14A 2E5BA 2QCDA 2BXVA 5DELA 3VE7A 4CCEA 1H61A 2ZRZA 2JK2A 3M5XA 3V75A 3DXIA 1W37A 1FX6A 3T7VA 1L6YA 1PHWA 3EWYA 4IOTA 3PM6A 4AWSA 3B0VC 3L68A 3S1VA 3W1UA 4TO8A 1TRIA 5AC8A 2RDWA 3EWZA 4Z1DA 3LLDA 2OJPA 3TQKA 2J6XA 1ZAIA 4IX2A 4LUIA 4DPQA 4YCPA 2YDAA 3LV5A 4DELA 5C55A 4UTLA 1GPWA 5I3IA 1WQ5A 2YXGA 1GQNA 2VFDA 3W7RA 1WOBA 5D38A 4UTKA 1H51A 4N4PA 5BRBA 1OYBA 4JIQA 3PY2A 1TTJA 1JRCA 1ZFJA 8TIMA 2X1RA 3GDMA 3L5MA 3NQ8A 1TPFA 3NPWA 4IQLA 3V1PA 1SW0A 2QDHA 4RXGA 3NO5A 1H5YA 1KTNA 3HG2A 5CZJA 1WX0A 1CX9A 3N9RA 5AHFA 3IIOA 5E93A 4O1AA 3UPWA 4RCXA 4CLMA 2QCMA 4Z1BA 3EX6A 3B03A 3WK1A 1ZY9A 1TQJA 3M44A 3BARA 2TMDA 3HO8A 3QMSA 4KFOA 3W7KA 3CB8A 1JCNA 1H7OA 1VH7A 3LHZA 1OVDA 5K9CA 3ZS4A 2CLEA 4S2BA 3I7RA 5HMSA 1DKWA 2QUUA 4FXRA 3LB0A 4H6KA 1NFBA 1T0OA 1VGAA 1H63A 3HBLA 4TR9A 3DHFA 3W3OA 4E2DA 4TX9A 4HT3A 1JCXA 2A7NA 4DO4A 4RKAA 1TV7A 2ZA1A 1OFEA 1H1YA 4R53A 3B4UA 3CHVA 1HFBA 2Y7FA 3OHIA 3MHUA 3R2GA 2Q8ZA 3MWAA 2D73A 2WO5A 1K3UA 1PCKA 1FUYA 2C3ZA 2TYSA 4JYDA 1RQBA 2A2IA 3NM1A 1PE1A 3LTYA 4OE7A 1Q6OA 3I6RA 1OK6A 3C2RA 3HGJA 3O8AA 4MJMA 1ICQA 3GNDA 4LS2A 5C54A 3TK7A 3PB2A 1A50A 1KBIA 4MOZA 1D3HA 3L67A 4WY0B 4UIOA 3GLCA 1TPVA 3LTPA 1PHQA 1YYAA 3EXSA 4BI7A 4UTIA 1ICSA 1B57A 1TPH1 4O0KA 3VI2A 4FX8A 4NJHA 2C15A 3PUOA 1LP6A 3T44A 1LYXA 3PBUA 2EF9A 5D02A 5FEPA 4OBTA 1EWEA 2B4GA 1GG1A 3R89A 5HWJA 2Z6JA 3B0UX 2PE4A 3CWNA 4WD0A 3GR7A 1UB3A 5HJLA 5C2XA 2V9DA 1S5VA 1XDLA 2Z2UA 1OX4B 2B7NA 3NEVA 1GWJA 1THFD 1A5CA 2CWNA 4ZQOA 4LS0A 3C3NA 2OT0A 1MZHA 1LBLA 1JCJA 5DCEA 1LTDA 5I3HA 1MO0A 1PL9A 3UYCA 2DZTA 2V5LA 1OFQA 1FDYA 1EUAA 4P2VA 2QR6A 3NYZA 1YPFA 3R13A 4LT9A 4LOCA 1RVGA 4BI6A 3EWBX 3DFSA 3QQ1A 1W5PA 4FNTA 4XQ6A 4KWWA 4M6PA 5KMYA 1K7EA 3C2OA 1PCWA 5DXXA 3QPYA 3K30A 1OHLA 4A2RA 1TIMA 5KITA 2HTMA 4NJKA 3W07A 1OFBA 4YMZA 1SPQA 3B0PA 4QM1A 4E2BA 3W2UA 1O94A 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1T99A 1J2WA 4DBEA 2NLIA 3BLFA 3DENA 4LNYA 3NL6A 4WJEA 4GUJA 1YXDA 1SZGA 3VKJA 1GTEA 3W2LA 3L5LA 4LC8A 2E6AA 4AEOA 3TCEA 2FFCA 5BOOA 1Z44A 3S5YA 3NM3A 4FO4A 2NV2A 1W5NA 2VEKA 4HN4A 2DU2A 4GNJA 3W7JA 3P8JA 1TPDA 1XBVA 2NX9A 2Y63A 2Q3RA 2X1UA 2QAPA 1KFLA 3L21A 1K8XA 4TU1A 2YCEA 1GVRA 5KZDA 3PC0A 2NZLA 3CU2A 1K02A 5F4SA 3LCXA 5K9DA 3MBDA 3TQVA 1JJKA 2ZZ7A 2GVGA 2NV1A 3W2MA 4AMAA 1EPXA 1Z42A 5AYZA 3UZ5A 3BO9A 4LRTA 5G4WA 1DBTA 3W1MA 2VFIA 2W0UA 4LV4A 3WFAA 4LU0A 2G96A 1F5ZA 1ADOA 3MYPA 1QCWA 2OX1A 5I3KA 3A5VA 1FWRA 4HNVA 2NXHA 3G0UA 1W3NA 1G4SA 1AL7A 1P4CA 1KM2A 3E9AA 3QH2A 4N4QA 3MI6A 1KFJA 4O1CA 3TXZA 1MEHA 1P1XA 1OYCA 5J5DA 3P67A 4HNUA 3P82A 1YLVA 1SQ7A 2EGZA 1GYNA 3S5NA 4AF0A 2BWGA 5AHLA 4UTHA 5TQLA 4O15A 4GWEA 4LY8A 3WK0A 3O1NA 3BGGA 1EP2A 4ADUA 3PBVA 5HQEA 1DVJA 1H62A 3NAVA 3MUXA 2P0OA 1GJPA 2DZVA 4FNQA 4MFDA 1F76A 2R8WA 5D37A 4ADTA 1QWGA 2F7FA 3NQ7A 2QUTA 1MEIA 3MI3A 3N14A 1EP3A 4JTTA 3SIZA 1LBMA 3EWXA 4MVAA 3LCHA 2C18A 3LDVA 3NQ6A 1K7FA 1W3IA 4X9SA 3TV8A 2VFEA 1FCBA 3RLUA 3FYOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1F2JA

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