1FDJA

Fructose 1,6-bisphosphate aldolase from rabbit liver
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
AHRFPALTPEQKKELSDIAQRIVANGKGILAADESVGTMGNRLQRIKVENSEENRRQFREILFTVDNSINQSIGGVILFHETLYQKDSQGKLFRNILKEKGIVVGIKLDQGGAPLAGTNKETTIQGLDGLSERCAQYKKDGVDFGKWRAVLRIADQCPSSLAIQENANTLARYASICQQNGLVPIVEPEVIPDGDHDLEHCQYVTEKVLAAVYKALNDHHVYLEGTLLKPNMVTAGHACTKKYTPEQVAMATVTALHRTVPAAVPGICFLSGGMSEEDATLNLNAINLCPLPKPWKLSFSYGRALQASALAAWGGKAENKKATQEAFMKRAVVNCQAAKGQYVHTGSSGAASTQSLFTASYTY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Reaction intermediates of Rabbit liver D-fructose 1,6-bisphosphate Aldolase
rcsb
molecule tags Lyase
molecule keywords FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE
total genus 131
structure length 363
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2000-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1fdjA00
5KZMA 3L0KA 4OWGA 3LOTA 2BXVA 4XTDA 1OX4B 1KV8A 4UTMA 1K8YA 4JIQA 1R30A 4MZYA 4UFHA 1Z41A 3O6DA 3RU6A 3W7HA 3PSWA 4RZ4A 1J2WA 3C2FA 1S5VA 3SW6A 4IX0A 2H8XA 1OFBA 1GG1A 4XWUA 3KAOA 4UUIA 4FNRA 2OT1A 4OU1A 5CZSA 1K03A 1KFJA 1VYRA 3TA6A 1N55A 3NQMA 4LUJA 4K6AA 3NL5A 4MZ1A 4DPQA 4K36A 3SSJA 3S5ZA 5CGQA 3V1PA 2QR6A 4OGZA 3QC3A 2ZZ2A 3UZ5A 2EAWA 2B7OA 1C9DA 3MP5A 2R14A 2ZZ6A 5DXYA 1VRDA 5AFDA 2QJGA 5FI8A 5LHFA 1ZAJA 1WOAA 1YDVA 3CHVA 3W2MA 2NUXA 1H50A 2CLLA 2PC4A 7TIMA 1M6JA 3O63A 1ME8A 4AHQA 3ELFA 4QIUA 2PRMA 1H60A 4UMBA 3G1FA 1X1ZA 2XN0A 5LNWA 2FFCA 2ZRYA 3WFAA 3LHYA 1SFLA 1IF2A 2RDUA 3KXQA 3MMTA 2BX7A 3NQ2A 4M19A 4IGHA 3N9SA 1KFKA 1OFEA 1LOLA 2DZUA 3INPA 3S1VA 2NX3A 3MP3A 4NNAA 3TSDA 3TFCA 2QUVA 1FXPA 3QF0A 1F6PA 2V5BA 2DZVA 1LOSA 3LHVA 1SO5A 5KZEA 4LVBA 5AOUA 4QAIA 5AC7A 2FQIA 3BG5A 3GXNA 3P61A 4LRSA 3LXAA 1W56A 4YMZA 3UWVA 3I7RA 1TV5A 4NZFA 3N73A 4ZMGA 5AHEA 3A5VA 1FCVA 5EPDA 4AF0B 1O5XA 1W3NA 1YPFA 1M5WA 3MHUA 1BWKA 1VH7A 3LCGA 2VEKA 1N7KA 2QCDA 5AC6A 4BK9A 2RFGA 3EXTA 4PEKA 5K9XA 4LOCA 1GVOA 3P5ZA 2ZZ4A 3W72A 5TBOA 5BRBA 5FF3A 1BWLA 3EXSA 4JDYA 5EYWA 3ABOA 3UWZA 3MI3A 2R8WA 4K7VA 1EB3A 4QQ3A 3LHWA 3GLCA 3W07A 1NF0A 5EY5A 3CM4A 2J9XA 1ME7A 3PY2A 3F1QA 2OT0A 1ZNNA 4ZQRA 1JUEA 4FX7A 3NQVA 3IVUA 4ZQMA 5F4WA 2C19A 3F03K 4IX2A 5FEXA 2GJNA 4FX6M 3P74A 1J4EA 1DORA 3W7RA 1FCUA 2FTPA 2H90A 2ZTKA 3L5AA 3N9RA 2WSYA 4NXKA 5LGZA 1B3OA 3C56A 1WA3A 4MJZA 1B4KA 4RZ6A 3TAOA 1LTDA 4RLIA 4LNYA 1FDZA 2X1RA 3S9YA 2V5LA 3H54A 4ZQOA 2C3ZA 3A5FA 1H7WA 2ZYFA 4X22A 4Y90A 4WXZA 5F2LA 1RZMA 5FF2A 3BK0A 3QPZA 4MY9A 3NQGA 2QUUA 4Q33A 1JVNA 4JY8A 4NJGA 3ABQA 3PM6A 3WJWA 3GDLA 4E2BA 4QM1A 3NOEA 2ZBTA 2Z6IA 4MVAA 4O19A 1W3IA 1OFRA 2ZZ1A 1K3UA 4WY0F 3W2UA 4POCA 2A7NA 5HNRA 3QSRA 3NYZA 3S1XA 1WDWA 2E09A 4N9DA 1VCVA 4M7TA 4NJKA 2QCMA 1F05A 4UTTA 1ICSA 3TIMA 3O1NA 3RMJA 4AWUA 4DO4A 2J6XA 3HPZA 1S5WA 2RDWA 2YR1A 1OX6A 4ZL1A 2X1SA 3SFKA 4JYEA 2EKCA 1YYAA 4P2VA 5CZTA 1SW0A 1KTBA 3P8IA 1ALDA 5DN1A 1YLVA 2CU0A 5D33A 5D03A 3DHFA 3A23A 3G3DA 4NJHA 2V81A 4UFKA 4E0CA 3P7YA 4U4MA 3MHFA 1V5XA 2QCEA 1H1YA 5AHNA 1DJNA 2OMAA 1TPFA 4MZ8A 3HO8A 5J5DA 3CIXA 2C16A 2VEMA 3HPXA 3U2OA 3Q2DA 3E12A 5LNRA 2QCGA 3L67A 3BPWA 4JXCA 3ZWTA 1XFBA 1H7RA 3C2EA 3LLDA 4H6KA 3BLEA 3IIOA 2A2IA 4UTJA 3LV6A 3WJXA 4Z1AA 4GUGA 3EX1A 4JR5A 1OJXA 1PE1A 4E38A 1XBVA 4CCEA 3EKZA 3ABRA 3BV4A 5KTLA 4AWTA 4NT0A 3FIGA 3HBLA 3NQAA 1HG3A 2WNNA 1GWJA 4O16A 1H5YA 1QCWA 2ISVA 4ZVJA 1ZENA 3P82A 1GOXA 2J88A 2Q8LA 2NUYA 5CPLA 4O1AA 2VFIA 3BLFA 5D30A 2C0AA 3TSBA 4U28A 1QWGA 4K7YA 1BTMA 4AHOA 1SU5A 1ME9A 2WKJA 3DFPA 3TXVA 3BW4A 1TTIA 3CTLA 3JRKA 1HL2A 3MI6A 3B8DA 5DBTA 1BKSA 2A0NA 4ZZ9A 1YDNA 4IJBA 3GVGA 3NPWA 3S5OA 1GG0A 2V2CA 1MEHA 2B7PA 4ML9A 3W1PA 3NO5A 2BTMA 1IXNA 3O6CA 1FXQA 4NJIA 5AYZA 1JCNA 3W7KA 4RJEA 2ZRUA 4BFAA 4PFMA 3PG8A 4DBEA 3ABSA 4XTIA 3N14A 3LTYA 1O4UA 3C6CA 3R2GA 4MFDA 2NLIA 5BMXA 3STGA 3C2OA 3BGGA 1GJPA 5EL1A 4NU7A 2VFDA 1JRCA 4UCGA 1UCWA 2Y61A 3UWWA 1R46A 3KFTA 4IMGA 2R94A 2ZRVA 1OYBA 3M5ZA 3WJYA 4UFMA 3OA3A 2WPBA 3THQA 4UR7A 5G4EA 4HIBA 3M0ZA 2A6LA 2TPSA 4LC6A 2AQWA 3GK0A 3EX3A 5LSMA 1N8FA 2ZDRA 3NAVA 3S42A 1P4CA 1SSDA 2ZZ3A 3G1XA 1G7UA 2P0OA 5CPOA 1ONRA 3L0NA 1MEIA 3U8GA 1GTEA 3NQFA 3I7QA 5J5RA 1G6CA 2P1FA 5AC8A 3NQCA 2RKXA 3EWYA 3UY8A 3B0UX 4YCOA 1JCXA 3LHTA 2W79A 4S2CA 4NXSA 1A5BA 3MW7A 2WJZA 3TU9A 3OVRA 3O6YX 2GQ9A 1KM4A 3RF9A 4ZQCA 1KFEA 3I65A 1T0OA 3Q94A 4OHQA 2RDTA 4MLRA 1LBMA 1G7VA 1TREA 2V2DA 3GX9A 4JTFA 1XDLA 2VELA 5GVJA 2DJXA 3SY5A 4XZ9A 2X1UA 2CZ5A 5CZ0A 5HR6A 3C4UA 3PSVA 3L5LA 4UTTC 1KW1A 3UWUA 3T4CA 3FOKA 4MIMA 1Z42A 4PL2A 2FPTA 3FKRA 5H2ZA 1EWDA 3NL3A 3LCHA 1VZWA 2TRSA 5E93A 1F2JA 2NXGA 4Q4KA 4O1CA 1YADA 2E5BA 3W1QA 2VFGA 3LLFA 3DKLA 3M1ZA 4Z1BA 3QH2A 3W71A 1RQEA 3R5EA 4Z08A 1TCDA 4A21A 2QDGA 3LRKA 1UBSA 1WAUA 4K37A 1TPVA 1IXQA 1MO0A 2E68A 2Z6JA 3SI9A 4CNPA 3HMJG 4M6VA 3MYOA 4DF0A 3A22A 2ISSA 3W7JA 2VC6A 5A8GA 2JBMA 4LV4A 1AL8A 4JTEA 3S5YA 3C61A 3A9IA 4IOTA 4N02A 1YDOA 3USBA 2RH9A 3CEUA 2R91A 1QR7A 2CLMA 3Q37A 4AWSA 1X6UA 4YXGA 5A5WA 4FXRA 1W5MA 3CPRA 1OYAA 3IIXA 1MSSA 3G18A 5T26A 5F1UA 1OFAA 4YCPA 1OK6A 2QCHA 4QSHA 4WX2A 1FCBA 3RLUA 5MHBA 4D2JA 3N19B 3UZJA 1XI3A 2ZQ0A 4KWVA 3G24A 3M5VA 4UTHA 1VYSX 1Q45A 2JGQA 1W8SA 2YGYA 1DOSA 2XFWA 3EXRA 3KRSA 5C5YA 1TSIA 1EWEA 1RD5A 4HPJA 1FWTA 1G69A 2PURA 3UY7A 4O1BA 1PCKA 4MJMA 2NXHA 1H51A 3R13A 1NFBA 1ZAIA 1KBJA 3NPUA 4NVTA 3SGUA 2ZZ7A 5F2IA 4WOQA 5HQEA 3B0VC 3QW3A 4O52A 3RLVA 3NA8A 5E1QA 3LHZA 5I3GA 2E6FA 1TJRA 2Z1BA 1W5OA 3IGSA 1ICQA 1TTPA 2OX1A 5D2WA 5DY2A 1KTCA 1WYIA 2GQ8A 5AHMA 2QEZA 4MFEA 5D2YA 2HS6A 4CCCA 1VHCA 2YDAA 5FF7A 2HS8A 2QJIA 1KBIA 3UNDA 2RHGA 4FNQA 4G1KA 4RCXA 3NM1A 3LRLA 2ABBA 1LCOA 4JTGA 1L6YA 2ATMA 3P84A 5C6MA 2X2GA 1QPQA 4EF8A 4LU0A 2PRLA 4MY8A 1F7BA 2TYSA 3DBPA 4FNTA 1HO4A 3HJZA 1IXPA 1AG1O 4KFPA 1S5TA 2NUWA 5EKYA 1OF8A 2HMCA 4UFLA 4DF1A 3LXCA 3NQ6A 5I3HA 3GNNA 4N9BA 1MXSA 2VENA 2NWRA 3W3OA 3W74A 5CSRA 5KINA 1DQWA 1LBLA 3ZFHA 3PVFA 3STCA 2WNQA 3M47A 3G8EA 3TQKA 2FDSA 4O17A 3LRMA 3HG2A 3PR2A 1JCLA 3SIZA 2QAPA 3B05A 5K2ZA 2GQAA 1EP1A 3TMQA 4DPPA 4QNWA 3QPYA 2Y85A 2WNZA 5F4SA 3IGUA 1AW5A 1VCGA 1FQ0A 4JTHA 3F4NA 4UTWC 2Y7DA 3W87A 2J27A 4R33A 3G0SA 5DXXA 4XBKA 1F76A 1XBXA 3GIYA 5FF0A 2VFHA 4QITA 2HSAA 4FXSA 3Q58A 2XN2A 2CLOA 3TC6A 2VKZG 2WSRA 3LHUA 5G2WA 4AH7A 4Y8FA 3UPBA 5I3FA 1JRBA 5D38A 3R8RA 3BARA 1QOPA 2Y89A 3SR7A 3KVJA 1O60A 1IIGA 4CNNA 2WO5A 4JS3A 1Z44A 4C1KA 1YTKA 1AW1A 3G1VA 1AL7A 3BW2A 4ONVA 3B04A 3L65A 5LNSA 3GYEA 1TMHA 4K39A 4GC4A 1GTHA 3QJAA 1FWWA 1S3HA 3DAQA 2H6RA 3CT7A 1DL3A 3PF3A 1I2OA 2VEPA 1L6SA 3FFSA 4XUGA 3LTSA 2B0MA 4MOZA 3W2LA 1LOQA 3CQ0A 3TCEA 1DJQA 2WOQA 4ADSA 1LM1A 2B7NA 5BW6A 1I45A 3SECA 4KWWA 3E96A 4HNTA 3FYPA 4WXYA 1JUBA 1Q6QA 2O7SA 3NZ1A 2EHHA 2E5DA 1B4EA 1YXCA 5D32A 3UWYA 2A7PA 1OVDA 5HINA 3P81A 4R7JA 4A2SA 3MHGA 1FBAA 1TRIA 3UXDA 1KLYA 4AMAA 1A53A 3NL6A 1MEWA 3L66A 1SO3A 3HGJA 3S5NA 4DBDA 4KFOA 2YYUA 1KM0A 1XCFA 1WBHA 3A21A 4RXGA 1TYGA 2QCLA 4OT7A 4DEFA 3N2MA 2OZ0A 2I9EA 4YWIA 3T78A 4PCFA 5KMYA 1H7NA 2V8ZA 5K9CA 4NZJA 3OBKA 1W5PA 2E6DA 3TE9A 1FDJA 5K4ZA 1KTNA 2NXIA 4O28A 4RV8A 3TQVA 4R34A 4GFSA 2ABAA 3W84A 1XXXA 3STFA 3QSTA 2YCEA 2JGYA 2QCDB 1YXDA 4O18A 1AMKA 2PE4A 3NDOA 1L9WA 5I3KA 3W9ZA 2QDHA 5CKSA 3S8HA 4GUFA 4UTKA 2NX1A 4Y96A 1HUVA 1SO6A 4IUOA 1TPC1 4BI7A 3OIXA 1T99A 1JCJA 3IRDA 1PCWA 1RPXA 5IM51 3LV5A 4RZ5A 4HNVA 4Y9AA 2E1DA 1TQJA 1NSJA 5F2MA 2DU2A 4QISA 1KM6A 1P0NA 4R53A 4MYXA 5C54A 1GYNA 3DGRA 2VEIA 1GVQA 4BI6A 3STEA 3ZR4A 4JICA 4A3UA 2CZFA 1YPIA 2A6NA 3W1LA 4UMAA 3HGOA 4WQ6A 1QMLA 3KRUA 4H4IA 2EGZA 2JKAA 2Y7FA 1ADOA 4J9JA 3KX6A 5LKYA 4JTLA 3C8FA 3EX4A 1R47A 2ZTJA 4M6QA 3LBMA 4TMBA 3TNOA 3VKJA 4M7SA 2C13A 3CEPA 4M6PA 1Z48A 3W70A 3G8RA 1Q3NA 1ZJIA 1H7PA 1Q6RA 1VS1A 4FO4A 3FJ6A 4FX8A 1A50A 1LYXA 4IXHA 2A5HA 3G1HA 4DXVA 4MKNA 4UTLA 3OG3A 2A4AA 4K8HA 1TTJA 3UXAA 4UNLA 3PBUA 1I2QA 1VPXA 4FIQA 2E6AA 4ADTA 5LNUA 4XBSA 3WJZA 3G1SA 3W7LA 2CLFA 2QKFA 4ICNA 5G2IA 3TR2A 3IV3A 4ZQNA 4JX5A 5FEWA 4K38A 4NNBA 2Z2UA 3PAJA 3CWOX 4DELA 3IGXA 5K3VA 2NV2A 3I6RA 3WK2A 2CLKA 4S2BA 4I7WA 6ALDA 3C3NA 4BI5A 2J9YA 3EKLA 2QCNA 1G4PA 2Y6ZA 3GNDA 1F73A 2CLHA 3W85A 1LLWA 1W5NA 4EVZA 5I3IA 1W0MA 1HTIA 3CIWA 1W5QA 4BWLA 4EIVA 3PC0A 3TSMA 1LROA 4YL2A 4IMCA 1LRNA 3L2IA 5FEPA 3S1UA 3T7VA 3O07A 1GVSA 2B4GA 1JULA 4O13A 3QQ0A 2EPHA 5LHEA 4GJ1A 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 4ORM A;  3VI2 A;  2GVG A;  3CU2 A;  3N3M A;  5BNK A;  4WD0 A;  1EP3 A;  3KVK A;  2J24 A;  1UB3 A;  1K7X A;  3WK3 A;  1YTE A;  5FF4 A;  3HG4 A;  2DZW A;  4NUW A;  4P61 A;  3SZ8 A;  2YW3 A;  1OFO A;  1BEU A;  3HG5 A;  6TIM A;  2Y7G A;  3VFL A;  1SW7 A;  1WV2 A;  4HSN A;  1LP6 A;  2E5C A;  3B03 A;  2CLI A;  3ATY A;  4DF2 A;  2FJK A;  2I14 A;  1VQT A;  2G97 A;  3CLM A;  3B0P A;  4FNP A;  4AHP A;  1T8X A;  3FYO A;  3EEG A;  3DXI A;  4C1L A;  3A24 A;  3HOJ A;  5D04 C;  2V82 A;  1OFD A;  1KM5 A;  4PTN A;  1FWN A;  4LVA A;  4QJ1 A;  1LRT A;  3W7P A;  5DEL A;  4EF9 A;  1PHQ A;  5U4N A;  4TU1 A;  1QPR A;  2QAF A;  1GVF A;  1FY6 A;  1FWS A;  4DO6 A;  3M7W A;  1VC4 A;  3HB9 A;  1ZAH A;  4JY9 A;  1KV5 A;  3JR2 A;  3LXB A;  2Q3O A;  4JNM A;  3W7D A;  4HHP A;  3NM3 A;  3G1D A;  4AF0 A;  3EWB X;  5C2X A;  1SSG A;  1DHP A;  5AHF A;  4WOZ A;  2V9D A;  1RV8 A;  1SW3 A;  3P67 A;  2YFN A;  3G22 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VIP A;  1HXJ A;  4GC3 A;  3UG5 A;  1OX4 B;  2X7V A;  3V18 A;  1FFR A;  3O6D A;  3UF9 A;  1FWC C;  1UWQ A;  4RZ4 A;  2I5G A;  1ECE A;  2D20 A;  3VNM A;  1DXE A;  4FI4 A;  5ECU A;  3SW6 A;  3ES7 A;  4IX0 A;  1GG1 A;  2KAU C;  3HTW A;  4XWU A;  3KAO A;  4C6B A;  2WW5 A;  1VYR A;  1M7X A;  4LUJ A;  4M24 A;  2CXG A;  2FGB A;  2CHR A;  2ISD A;  3CMF A;  4C6K A;  4Q8M A;  3V1P A;  4MG4 A;  3WLK X;  3GNR A;  2ZZ2 A;  2R82 A;  2EAW A;  1HKI A;  4IPL A;  5DXY A;  1S5M A;  5AFD A;  2QJG A;  4C91 A;  4GH1 A;  3A3W A;  4M56 A;  2FMN A;  3RLG A;  2QPX A;  3VKA A;  2OOD A;  3MVI A;  5A6K A;  3AJ7 A;  1GZ1 A;  4AIO A;  3FY1 A;  3LHY A;  2RDU A;  3OYX A;  3WEM A;  2YBT A;  3KXQ A;  3A4X A;  4KGL A;  4M19 A;  4IGH A;  3N9S A;  4IQE A;  3SUR A;  2EPK X;  1OFE A;  1LOL A;  2DZU A;  3MP3 A;  5JXQ A;  2Y0F A;  2P88 A;  1F6P A;  1I1W A;  2V5B A;  3LHV A;  1U1H A;  4LVB A;  5AC7 A;  4AZC B;  1NDZ A;  3ZVH B;  3GXN A;  3U7V A;  3ARP A;  1FP9 A;  1SFT A;  3GS6 A;  2DUX A;  3VNZ A;  4ZMG A;  3AMD A;  3FGC B;  4DUX A; 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