1FH8A

Crystal structure of the xylanase cex with xylobiose-derived isofagomine inhibitor
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-1,4-XYLANASE
publication title Detailed structural analysis of glycosidase/inhibitor interactions: complexes of Cex from Cellulomonas fimi with xylobiose-derived aza-sugars.
pubmed doi rcsb
source organism Cellulomonas fimi
total genus 128
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2000-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1fh8A00
4LQ1A 2VX5A 4XUYA 3PTMA 2WBKA 1QNRA 1DHKA 4UFHA 4UFKA 3GXIA 3ZMRA 2VZTA 2WLYA 4JFTA 2DT1A 3VIMA 5I23A 5JIPA 1TG7A 3T2QA 4QAWA 1ODUA 3AIUA 1GOQA 2D23A 2WLZA 2W63A 1CIUA 1JZ3A 2QF8A 1UKOA 3AMGA 1KXVA 3VIFA 1VIWA 1C93A 3BLKA 3SCUA 5FCZA 3W0KA 3NYDA 1GUVA 1KXHA 3BAIA 3IAQA 3WH6A 3N04A 3NJ3A 1F4AA 3QR3A 3WDJA 3WD1A 1SFSA 2WSPA 3F4VA 1UOKA 2WVUA 4AZBA 2E9MA 3QHOA 4OIFA 3W82A 1JZ5A 1KR1A 2DT3A 4P8VA 1TA3B 4AEFA 1IZKA 4GI6A 4H7VA 4H04A 4CVUA 3TTOA 2E0PA 1TR1A 2YDSA 4PMDA 2FH6A 3FW6A 3W27A 2J7HA 2YKKA 4J3WA 3UESA 1ISWA 4AZ7A 3G6MA 3PZIA 3N15A 3EMQA 5E6YA 1V6XA 2WK2A 3VX0A 3WDRA 6A3HA 2NT0A 5CSUA 1L8NA 1BHGA 3WBEA 2WSKA 3ZOAA 1GHSA 2FHBA 5HPOA 4PCTA 3ZJ6A 2VR5A 4M80A 2VTFA 2CEQA 5DF0A 2V3FA 2GJRA 1Q4NX 1JDDA 3PZTA 3OLDA 1UWSA 2JF6A 5CSYA 5HNNA 4DUVA 1E6NA 1UQZA 1V3IA 3SCQA 3VIOA 4BCEA 1JDAA 5CPSA 1UHVA 1X6LA 1FOBA 3MUY1 3OG2A 3SCRA 4PTVA 5HOSA 4CUCA 2VJXA 4B3LA 1WZKA 1XSIA 3WSUA 1J9YA 4MB3A 4B3KA 4URIA 2WCGA 2BVTA 1LQ0A 4HOXA 4GI9A 1VFUA 2CIPA 2J7EA 1QHPA 2QPUA 3GNPA 3SUUA 1RP8A 3M6DA 1PZ2A 2ZUTA 2W5FA 3WF0A 5CZKA 3VO0A 2WMIB 2XM1A 3RJYA 3CMGA 1DTUA 3CHEA 4NZCA 5CLTA 2GVYA 3AICA 1CDGA 2G3NA 1BGGA 4AD1A 5JBFA 4FLSA 1TUXA 1HKKA 5JBEA 4QLLA 4CVWA 3UERA 1GQIA 1XCXA 1KCKA 5AY7A 3MUZ1 3VNYA 1VJZA 2W67A 4ACZB 1P6WA 4AXNA 5ABFB 4DM1A 3W6MA 1XH2A 4RL3A 3WNPA 2ZICA 3APGA 1CEOA 1UD6A 2ZWZA 2J75A 2X1IA 4GI8A 3WNLA 3VGDA 4Z2JA 2CKSA 3NIYA 3BGAA 1FH9A 4YHGA 3WBAA 1NM9A 2YLAA 5DT7A 2HVMA 1CPUA 2YDQA 4CD7A 4CGTA 3B8SA 3WQVA 1E70M 3RM8A 1UKTA 3SUSA 1V0KA 4JAWA 2QPSA 1XC6A 4UOQA 3N12A 4UFLA 3T0AA 2CERA 1VEPA 1CGWA 3EMZA 4U5IA 3OGRA 4CCEA 3GXDA 3ZSTA 2ZXQA 2VUYA 1B90A 2VR4A 1FHLA 1R8LA 1PX4A 3SUTA 4UQEA 1W3KA 4B16A 1B3YA 2YDRA 2CCRA 3CLWA 5CXPA 1B31A 3RDKA 3VDAA 3WMCA 2CESA 2CITA 1UWQA 4CD5A 2W62A 4JKKA 2JFEX 3NUKA 2EQDA 3VM5A 1JYVA 4J7RA 1G01A 4Z2LA 1C8XA 3PZ9A 3M07A 1BYAA 1J11A 1FFQA 4PTXA 4QCEA 3VKKA 2CXGA 3WNMA 1EDGA 1PX3A 1V3JA 3L4UA 3DECA 3LPOA 1QPKA 5EMYA 3OLGA 4AEEA 5A6BA 3OZPA 1EGZA 3HJEA 1E40A 3NDZA 1GHRA 2F61A 1HKMA 4UFMA 2O9OA 1QNSA 3IJ9A 1B9ZA 3ZSSA 4OOZA 2B31A 3TTQA 3EDKA 4HP5A 2DIEA 2VX6A 4W93A 2A3AA 3MV01 4LYRA 4X9YA 3WF1A 2WZEA 4DUXA 3VD5A 1B1YA 1ZU8A 4OBSA 1HF6A 1BVZA 3CUJA 3VGHA 1E4LA 1QI5A 1XH0A 3LPGA 3PTKA 1ISZA 2WVTA 4PMVA 4J3UA 4KMQA 5D9PA 4HMDA 2WAGA 5JUVA 1NP0A 1C91A 2AMGA 4HZ7A 1XHGA 5AYBA 4KGJA 1V6UA 2BNJA 3NSNA 5A1AA 1Q6CA 4CU7A 4TVDA 4P7OA 1D2KA 4HOZA 4W8AA 4P7LA 1EO7A 1QVBA 1W9BM 2TAAA 4AZ5A 1JAKA 4JFSA 1C90A 4UOJA 4B9ZA 2EPKX 2W92A 3DHPA 3ARWA 4HA1A 4DUWA 3GH4A 3VGEA 2EPNA 2IXUA 4UFJA 1PEZA 4BQ2A 2WKGA 3AMCA 2JIWA 3GXMA 3ARQA 1JYWA 1I75A 1V03A 1XV8A 1KGWA 1CZ1A 1CXIA 2BHZA 1B2YA 1UYQA 4F9JA 1GOKA 3PZMA 1YHTA 4GIAA 1NOFA 1QHOA 2WANA 1Q6GA 2DT2A 3RM9A 2EXOA 3THCA 1JG9A 3VIIA 4M8UA 4OZOA 4WK9A 3QOKA 2VCBA 1KWGA 5F7UA 1ODZA 2YA0A 4TVUA 4PRWA 1V3HA 2QV4A 4PCSA 4U5KA 3VDHA 1UKQA 3T0DA 3AS0A 1QI0A 3PTQA 5ABHA 3ECQA 1FA2A 2WPGA 1BYBA 2VI0A 4R27A 1QNOA 1MXGA 4HU8A 2DDXA 1V6YA 4A3YA 4ATDA 3TTYA 2WZHA 3FN9A 1KFWA 4ATWA 2XWEA 3AIQA 4N42A 2O9TA 2ZX9A 2CBJA 2YIHA 1W9PA 2YA1A 1CYGA 3AXIA 5EFDA 1LL4A 1QW8A 1BVNP 3DHUA 3II1A 3AIRA 3BSHA 4XZBA 3WDIA 3IAPA 2ZUMA 4Y7EA 3I3EA 2D0GA 1CENA 1JZ8A 3K46A 4XZWA 4QLKA 4R5EA 3K4AA 3K8LA 4M29A 3WF3A 3WD4A 2WHLA 2OSYA 3ZQ9A 2VX7A 1B3XA 2XFYA 4MJ2A 1IZJA 4PMQA 1H09A 2ZX6A 3POCA 4UFIA 4DWSA 1E3ZA 1WDQA 1EA9C 1W3LA 1OM0A 4OJYA 4W7VA 2Y8VA 2GK1B 1JAEA 2CBUA 2VZUA 3ZIZA 2IUZA 3K4DA 2C8NA 1HL8A 4F9DA 4CN6A 1UR1A 1WKYA 1GOWA 4AZIA 4JCLA 2VZOA 1EHAA 3TA9A 3ZM8A 2YL6A 4W88A 1QHZA 4UQBA 1Q6FA 1HVXA 4EANA 1CBGA 1L0PA 1RD6A 3GYCA 4Q22A 2J7DA 1UKSA 4HZ6A 3BXWA 3OGSA 1E0WA 1LL7A 2VCAA 3HU7A 3VIGA 4GZEA 1JFHA 1B3WA 3DYOA 3WF2A 2CPUA 1W3JA 1HVQA 5TD4A 4MNKA 3VDBA 3E1F1 1WDSA 2DGAA 1KB3A 5GQBA 2XTKA 3N13A 3VD7A 2G41A 1JFXA 3AZSA 5CPQA 3WUBA 5CJ5A 1J12A 3W53A 4XB3A 4L4OA 4DWSC 4LXFA 1JZ2A 4M56A 5ABFA 1E73M 2DPEA 3TTSA 2V3EA 4PMZA 4P8UA 1VEOA 1QI2A 1KGXA 1WZAA 5D4YA 4D6JA 1J0YA 1H5VA 2Y24A 3CZEA 4JFWA 5DFAA 1GCYA 1J0JA 2PWFA 3M7SA 4FF5A 2AAAA 1B3ZA 1J01A 3QGVA 4AZCA 3SCVA 2WC4A 1ZS2A 4UCFA 4CD8A 1ESWA 1TVPA 5E0FA 1DP0A 4MTVA 5D9NA 2BY0A 1CXKA 2D22A 1CWYA 4UQ9A 2VRJA 2GSJA 5C71A 1UWIA 2WMKA 2VMFA 1BF2A 2XVGA 2OSXA 1CNVA 4J3TA 4E8CA 1E56A 4C7DA 3ARVA 5LA0A 1OWQA 3U7BA 2ZUVA 2BVDA 5KEZA 3M46A 1MW2A 4P8XA 3WY1A 2YL8A 1OB0A 1MYRA 1RPKA 3EDEA 2RGLA 1AQHA 4HZ8A 1Y7VA 1B30A 4Z2IA 1F4HA 3LPFA 4B15A 5BXTA 1H11A 1VBUA 1V3LA 3EBVA 3WIJA 4E2OA 5HPCA 4AD3A 3VIHA 3KWXA 3PZVA 4F8XA 3AIEA 1FFRA 1WO2A 1U33A 1NWTA 3SCOA 1GNXA 3NCOA 2YJQA 2BY2A 2XIIA 1UKPA 3O6AA 1PX8A 3GXFA 3D3AA 3SCNA 1LJYA 5AC5A 3GNOA 4YPJA 3BCDA 3W25A 2EJ1A 3WFZA 1MVYA 4RE3A 3F5LA 1FHDA 1EDQA 3WH8A 1UZ4A 3VX1A 2XHYA 4FLRA 3SUVA 3MUIA 3SCWA 1C7TA 1C8QA 1HL9A 1OINA 4D6HA 2C0HA 2NT1A 2PB1A 3ZR5A 3L4ZA 2E4TA 3VGBA 3WH5A 2OYLA 1E0XA 2UWFA 1I1XA 4W8LA 2XGIA 1CXFA 5A6LA 2DH2A 3CIVA 1BG4A 4QCFA 1BGAA 3WEOA 1K9FA 2WCAA 2A3HA 4GPNA 1V3KA 3IK2A 5BWFA 4J3SA 3UEQA 2WWCA 4IPNB 1EOMA 4M81A 2YBTA 3OLIA 4LYQA 3VNZA 5EB8A 1KBBA 5A8MA 3B9AA 2BXZA 2A3CA 2D3NA 3AOFA 4GZIA 1R85A 2D1ZA 1CLXA 1JGIA 4PYSA 2O9PA 1WE5A 1GONA 3RMEA 5IFPA 4HMCA 1UH2A 1OSEA 4QP0A 2PF0A 1HP4A 3ZT5A 3N17A 4S3KA 2Y2WA 1NWRA 1CXEA 2Y4SA 1ITCA 1JDCA 2CNCA 1MW1A 5M5DA 1UH3A 1GPFA 1VB9A 1WNOA 4GO9A 1E1EA 1W2PA 5M17A 4UQAA 5M03A 2G8ZA 4MDOA 3B9EA 5EBAA 3OA5A 3GBDA 3ARRA 4MNLA 1Q6EA 5BCAA 1DWIM 4JCMA 4ZEPA 5I78A 4KRTA 3UR7A 3F5KA 3WUEA 1HJXA 4P7NA 2UY3A 3CZGA 2DSUA 1BSIA 1J0IA 3CHDA 3U5YA 2O9RA 4FMVA 1H3GA 1KGUA 2J8FA 2VURA 5A6SA 1V0MA 3N1AA 1U30A 2YA2A 1M04A 3CMJA 4LGXA 2OWCA 4ZENA 4NI3A 4PN2A 4D71A 1HKJA 5FL0A 4ZXLA 5CG0A 1ZB5A 1M53A 3WD3A 1H2JA 1H0GA 2YOCA 3RCNA 3ARUA 1HX0A 1CTNA 2V3GA 5CGMA 1NH6A 1XRVA 3FHAA 4PSPA 4BQ5A 2J74A 4PMNA 2F8QA 1VFMA 4A3HA 1WB0A 4CCCA 3VD9A 1A3HA 1OGSA 2W61A 3T2OA 2J25A 5A6KA 2VVSA 2G3JA 1UUQA 1QOXA 4FK9A 3O9NA 4MNMA 4W5UA 5A2AA 4D6EA 3HMCA 1EO5A 1UA3A 4JL2A 1BG9A 4MDPA 1W1VA 1US2A 3TOPA 2D3LA 5AYIA 1EIBA 3VM7A 4D6IA 2GJXA 3W29A 1NOUA 1W9VA 1R87A 1W3HA 3MU7A 3UG3A 1OIFA 1V3MA 2ZIDA 4XX6A 1ITXA 3FAWA 3AROA 4A4AA 4GQRA 4AWEA 3WQ8A 1SMDA 3WNKA 4EKJA 3A6OA 3SURA 2X05A 3K1DA 2ZXDA 2JIEA 1E55A 5FD0A 2C7FA 3KE0A 3WNNA 2WVVA 4M24A 2CETA 4GO8A 3PZNA 1JD7A 4CN4A 1QNPA 1UQYA 3BMVA 3VUPA 2ZX7A 1JXKA 4B9YA 1UZ1A 2X2YA 2D20A 4D1IA 1LL6A 4MPKA 5IFTA 5GNZA 1C92A 2A3EA 4UQDA 1K9EA 4KWUA 3TONA 1W1TA 1TVNA 2JF7A 3LMYA 1KQZA 1E6SM 1EQCA 4EE9A 1ZL1A 2WCSA 4HTYA 3U7VA 2J7GA 1UR0A 5HBFA 4TTUA 4AD0A 1E6XM 2G3MA 3ALGA 4CKQA 2VZSA 2VC9A 5I79A 1UR2A 1WP6A 5D8WA 1RH9A 2VVNA 3GNRA 3O2LA 4Z2GA 1HJQA 3WUGA 3QHNA 2DSWA 3W24A 3PZQA 5A6JA 4W8BA 2WHKA 2V5DA 4GZJA 1JIBA 2E8ZA 4U31A 2X09A 4BA0A 4C7FA 1KCLA 1V0LA 1HKIA 3AIVA 3FHQA 3OBAA 1VEMA 3RO8A 2GFTA 1B3VA 1GQLA 1KXTA 4WKAA 4CD4A 2FDMA 2YL9A 3AFBA 1YQ2A 4PMYA 4UR9A 4W85A 3VIKA 3AMLA 3T2PA 2EEXA 2HISA 1CGVA 3CUFA 2CBVA 1H41A 1UA7A 1TFVA 4UNIA 2J47A 1X1NA 4HOWA 2UY2A 3BCFA 4ZFMA 3UCQA 3ZJKA 1TCMA 1WZLA 3S6TA 2XVPA 3ARXA 1DWGM 3TP4A 4ZE5A 3BSGA 8A3HA 3OIHA 1TA3A 2WHMA 3AI0A 2NW0A 5M3WA 3VD4A 5EFFA 3WDHA 2BV9A 4WKHA 5A6BD 4RE2A 3UETA 3NSXA 1CGYA 3B9DA 3ARZA 4S3JA 1K9DA 4W5ZA 3AHTA 1Z32X 2ZX8A 4EK7A 3AMKA 4M82A 1JI2A 4PSRA 3PZGA 5LA2A 2NSXA 4UTFA 5A8OA 4W7UA 3ARTA 1GJUA 7A3HA 3WDPP 1TMQA 2W4XA 3A4AA 4J3XA 2QHAA 2BHUA 4WKFA 1E4NA 3AXHA 4PEEA 1E5JA 2BY3A 2WMGA 2GJPA 1OGGA 1JZ4A 2BXYA 1C8YA 2ZWYA 3LPPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4LQ1 A;  2VX5 A;  4XUY A;  3PTM A;  2WBK A;  1QNR A;  1DHK A;  4UFH A;  4UFK A;  3GXI A;  3ZMR A;  2VZT A;  2WLY A;  4JFT A;  2DT1 A;  3VIM A;  5I23 A;  5JIP A;  1TG7 A;  3T2Q A;  4QAW A;  1ODU A;  3AIU A;  1GOQ A;  2D23 A;  2WLZ A;  2W63 A;  1CIU A;  1JZ3 A;  2QF8 A;  1UKO A;  3AMG A;  1KXV A;  3VIF A;  1VIW A;  1C93 A;  3BLK A;  3SCU A;  5FCZ A;  3W0K A;  3NYD A;  1GUV A;  1KXH A;  3BAI A;  3IAQ A;  3WH6 A;  3N04 A;  3NJ3 A;  1F4A A;  3QR3 A;  3WDJ A;  3WD1 A;  1SFS A;  2WSP A;  3F4V A;  1UOK A;  2WVU A;  4AZB A;  2E9M A;  3QHO A;  4OIF A;  3W82 A;  1JZ5 A;  1KR1 A;  2DT3 A;  4P8V A;  1TA3 B;  4AEF A;  1IZK A;  4GI6 A;  4H7V A;  4H04 A;  4CVU A;  3TTO A;  2E0P A;  1TR1 A;  2YDS A;  4PMD A;  2FH6 A;  3FW6 A;  3W27 A;  2J7H A;  2YKK A;  4J3W A;  3UES A;  1ISW A;  4AZ7 A;  3G6M A;  3PZI A;  3N15 A;  3EMQ A;  5E6Y A;  1V6X A;  2WK2 A;  3VX0 A;  3WDR A;  6A3H A;  2NT0 A;  5CSU A;  1L8N A;  1BHG A;  3WBE A;  2WSK A;  3ZOA A;  1GHS A;  2FHB A;  5HPO A;  4PCT A;  3ZJ6 A;  2VR5 A;  4M80 A;  2VTF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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