1FH9A

Crystal structure of the xylanase cex with xylobiose-derived lactam oxime inhibitor
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Detailed structural analysis of glycosidase/inhibitor interactions: complexes of Cex from Cellulomonas fimi with xylobiose-derived aza-sugars.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Cellulomonas fimi
molecule keywords BETA-1,4-XYLANASE
total genus 128
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2000-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1fh9A00
4J3TA 1B3XA 4MAZA 2FH6A 1RH9A 5IFPA 4QDMA 3N1AA 1BYBA 4D6GA 3S2CA 4U2ZA 1UD2A 1CTNA 1B3YA 1E6ZA 1NH6A 2EPOA 1WO2A 4DWSB 3VIGA 2BY1A 1GVYA 4OUEA 2WMJA 1CXEA 1W9BM 3N9KA 5A6SA 1QI2A 1EO5A 3ALFA 1VRXA 2ZWZA 4AZ5A 1OINA 3BLKA 4LYRA 1DHKA 1OWQA 4XZBA 5FD0A 1B90A 4W86A 2D0GA 1J01A 3WF4A 3VIMA 4ZFMA 1OB0A 1LLOA 2PF0A 2ZE0A 3WF1A 1UG6A 2G4FA 4NRRA 5HDRA 3WMBA 2X0HA 4PSRA 5CLTA 4CN6A 2WKGA 4PMZA 3A4WA 3MV11 1MQPA 1DEDA 1CLVA 2WVTA 3VGBA 4M8UA 4PMNA 4Z2HA 5IFTA 4MPKA 4FLOA 3SCRA 3ALGA 3OLGA 4P7LA 3RPMA 4J3UA 4CD4A 5LYRA 2V3GA 1US3A 4HMDA 2CBIA 1R8LA 2BV9A 1Q6DA 1Q6FA 1ZU8A 4M80A 2D3NA 3VIIA 3VGDA 2WCSA 1WZAA 1UWIA 5A2BA 3WFLA 1CWYA 4JHOA 3WUEA 1B30A 3T0BA 3WH8A 4E4PA 3GBEA 1V08A 4D6CA 5JIWA 2ZX9A 3MUIA 1K9TA 1V3MA 3HJEA 3BH4A 3SCWA 3AIEA 3FAXA 3SCNA 1PIFA 1UWQA 4HZ8A 1JZ8A 3CMJA 4AZBA 4UZUA 1N82A 3N17A 3VOCA 1V6YA 2W92A 2WHMA 4JZ5A 4TVDA 5FKYA 1KB3A 3VVGA 1WZMA 2OSWA 4ZXLA 3VD4A 4KH2A 4L4PA 1FHDA 2UY5A 3ZJ6A 3WKZA 4FMVA 3OGVA 3W82A 1HXJA 1WPCA 1KXTA 5KEZA 1ZL1A 4E2OA 2HVMA 1L8NA 5DT7A 2C0HA 1HVXA 4AIEA 6TAAA 3CHEA 5A6MA 1M04A 3FHAA 3K46A 3SUUA 4MB5A 1E72M 3CHDA 4P7QA 1E3XA 1H0IA 2Y4SA 3VIPA 1Q6CA 2Y8KA 5A6BD 2WVSA 3K4AA 1CGUA 2J7EA 4Z2GA 2E9MA 3VM7A 4NRSA 2WXDM 3ARYA 4Z2LA 2WWCA 1EOKA 1CXIA 2PB1A 1G01A 2BVDA 3VGHA 3U57A 2C7FA 1WDSA 4U5KA 2CYGA 2E8ZA 4AZGA 1D2KA 4F9JA 4FLQA 3ARPA 4PTXA 1E56A 5I5RA 3DHPA 2EPMX 2YKKA 1K6AA 3CTTA 3EMCA 4P8VA 3ARSA 1KGWA 1E0XA 4FK9A 2X8RA 3NUKA 3AXXA 2OYMA 2VVSA 1MVYA 1C91A 1S46A 3CHFA 2QV4A 3EDJA 2BY2A 1NWUA 1IZJA 2HISA 3VIOA 2B31A 4AD2A 1MQQA 4PCSA 1LWHA 3SCUA 4JFVA 1UH2A 2QF8A 5DFAA 2PWFA 2A3EA 4CN4A 1MW3A 2VC9A 5DO8A 1E55A 4P7RA 4WSJA 2E9LA 5DT5A 2AOSA 2J8FA 5A8MA 3BCFA 3S6TA 1K9DA 1GJWA 2J74A 1LQ0A 3DC0A 3MMDA 3WD0A 2J7GA 5AY7A 3VUPA 4D1JA 2VRKA 1TUXA 2WK2A 3SCSA 3MANA 4GI9A 5IHSA 5M03A 4ZEPA 3VDHA 3GNRA 3GXFA 1R86A 5EFFA 4CUCA 2EEXA 1KQYA 1ISZA 1JFXA 4AZCA 2ZUWA 3A6OA 5GPRA 1MWOA 1KWGA 4LX4A 5JBEA 1X1NA 1WE5A 1W9XA 1HL9A 4N42A 1UD4A 2BXZA 2QMJA 2DSKA 2V38A 3UG3A 1NP2A 1OGGA 1U33A 4PMUA 4U2YA 4CU6A 3O2LA 2W4XA 4HZ7A 5EMYA 3RILA 4Q7NA 4CD7A 1XD1A 3WDIA 1KWKA 3DYMA 4M24A 2EPNA 3GH5A 2XG9A 4U3CA 2PBGA 3AOFA 2OWWA 4AIUA 4Z2IA 2G41A 4PMVA 2J25A 2VQTA 3VNZA 4Y7EA 2CERA 2DIJA 3WQ8A 3JUGA 1PX8A 3W6LA 2UY2A 3CUHA 3WUFA 3ZT7A 4CD5A 5FIPA 3AS3A 1UUQA 2VVNA 4F66A 3OBAA 1HIZA 3EDDA 4W8AA 1JYWA 3ARZA 1XGZA 1SFSA 1J11A 3F4VA 1E6XM 4AYSA 3A4XA 3WF0A 2D22A 4HMCA 3WEMA 1US2A 1H41A 5I77A 5D9OA 1UR1A 2BS9A 5FOOA 2XFFA 4H41A 1SMDA 1UR0A 1DWHM 1E6PA 2CBJA 7TAAA 4AXNA 2EJ1A 3PTKA 1ITCA 3VPLA 1LG2A 1UKQA 3SCQA 4Z2JA 2V3DA 2ZXQA 5FL0A 4ATLA 4NI3A 4HU0A 3O9NA 3EDEA 1GOKA 3NSMA 1CECA 2WC4A 3CUFA 1JL8A 1EH9A 1FP8A 3VDCA 1KGUA 1UD6A 3W0KA 3WL0A 3WENA 3RJXA 5HPOA 1D7FA 3UERA 2NSXA 4DWSA 1WDPA 4UFMA 1JGIA 4S3JA 3VIHA 3SUVA 2ZUMA 5BRPA 1BAGA 4LYQA 3D3AA 4QAWA 5HBFA 3N04A 1BYCA 1O7AA 1MQRA 2MANA 1V3IA 3GXMA 5DEZA 4PCTA 4UQEA 1JD7A 3WD2A 2Y5EA 4OZOA 4B15A 1C8QA 3FXYA 5ECUA 4E8CA 4KRUA 2VO5A 5ABFB 4CKQA 3PTQA 4IPLA 3BLPX 7CGTA 4ATDA 1K9EA 4QCEA 3CGTA 4PEEA 1EQPA 2FDMA 3DECA 4AD5A 2VX7A 3U5YA 2VI0A 1LL7A 1HT6A 4GZEA 1GONA 3BAXA 6A3HA 4AW7A 2VJXA 3GH7A 1GOWA 3POHA 1PIGA 1WKYA 2D3LA 3WEOA 1QW8A 4HOZA 3VD7A 1R87A 4GZIA 4QLJA 1CXFA 3K4DA 4EK7A 3OLEA 3WDPP 4AD1A 3W26A 4JFSA 1ZBWA 2GSJA 2WW5A 1BQCA 4TVUA 8A3HA 3W38A 1NM9A 2Z1SA 3AMGA 2WMIB 1VJSA 2J79A 2YBTA 2QMKA 3W37A 4B3KA 4D72A 1HKMA 3W6MA 1KR1A 1XSJA 2IXUA 1ISYA 1UQYA 1B3VA 5FL1A 1XCXA 2EO7A 5A6AA 1HVQA 4BQ3A 4BF7A 5KZ6A 3BMWA 4HOXA 5AYBA 4WF7A 1UYQA 1VEOA 1VBRA 1B9ZA 2Q8XA 3SEPA 2CITA 4AD3A 4XX6A 1NWSA 4D6DA 3VNYA 3WQ4A 4AZ7A 3NIYA 1J10A 1E15A 5GNZA 1W1PA 1V6WA 3AQUA 1UWSA 1UD3A 2PBOA 1GW1A 1HP4A 3N13A 1W3HA 4AEFA 1K9FA 3GDBA 4L4OA 1OD8A 2XVLA 3ARUA 4W88A 1PAMA 1W2VA 1XRVA 2NT0A 3VX0A 2XGIA 2V3EA 3AJ7A 1JF5A 2W91A 1XH2A 5E6YA 4HA4A 4LYPA 4ZE4A 2XYLA 1TR1A 3QHMA 1UR4A 5I24A 5BXRA 4ACYA 1MW0A 4AISA 1ZJBA 2DH3A 2DSZA 4JKLA 1B0IA 2DH2A 2O9RA 2ZX7A 1LL6A 3TP4A 2DEPA 4UQBA 2JF6A 4NSBA 2XM1A 5C8BB 1J0JA 1SYTA 3CUJA 5I0DA 2JFEX 3FHQA 2YDSA 3VMOA 2XVPA 4WSKA 4UQ9A 1EQCA 4GIAA 1U2YA 2W66A 3W27A 4TUFA 3VGEA 1UKTA 2XJ7A 2X09A 4CU8A 4JFUA 2OYLA 1E43A 3ZJKA 4QLKA 4Q22A 4OOUA 3PZQA 1ZS2A 4W7UA 1JG9A 3SURA 4LPCA 3VO0A 3WH6A 3TONA 1JDCA 1H0GA 2UY3A 1KBBA 4RE4A 2VX6A 2ZICA 3M7SA 1WB0A 5LA2A 1YQ2A 2D20A 1DP0A 4D6FA 1M01A 3RJYA 3BC9A 4JKMA 1V0KA 1VB9A 1UOKA 2EPLX 1W9DM 4UFHA 4UCFA 4B9ZA 5A6JA 2VZOA 3WBEA 3AISA 3TTOA 4TVCA 2IXVA 1V6XA 1C3FA 1TA3B 2WYSA 4B9YA 1QI4A 3N11A 1EA9C 2DGAA 2Y2WA 2WC7A 3AHZA 1BHGA 3W53A 1QPKA 5M17A 1C7SA 4DUXA 4HP5A 5C71A 1AVAA 1B2YA 1MXGA 4TX8A 3WNLA 1SR0A 3ARQA 3GTNA 3WD4A 2X05A 2ZXBA 3ZT5A 1W2PA 1W9PA 3WNMA 4AD4A 1EHAA 1UZ1A 3KL0A 2E4TA 2E9BA 1QNRA 4GI8A 1EDTA 2IUZA 1GORA 1PEZA 1E40A 3K8LA 4W7VA 4H8VA 1LG1A 3UR7A 3WQVA 4B16A 4GQQA 1OCQA 5A1AA 3QOKA 1PZ3A 5A8NA 3ARTA 1KFWA 1VEMA 5I2UA 2Y8VA 3CUIA 3W28A 3ZSTA 4LXFA 1J9YA 1MXDA 4P7NA 4OBRA 3W25A 3F5LA 3CUGA 1CGYA 5A8QA 5D9NA 2D0HA 4MDOA 1PX4A 4JL2A 2YBUA 4UOZA 3UR8A 3ZSSA 2PWEA 3WIJA 2XIBA 3AI0A 3AMDA 3WD3A 2VX5A 1B1YA 1EOMA 3T09A 1ECEA 2A3CA 1JNEA 4FF5A 2GUYA 3AFBA 1EXPA 2ZX5A 4RL3A 5CJ5A 2OSXA 1E73M 4TTUA 3AXIA 4YPJA 1VEPA 4URIA 2YOCA 4D71A 3ARRA 2G8ZA 5I6SA 1V03A 2ZWYA 4J3SA 1H1NA 1VF8A 1EIBA 1QVBA 2VRQA 4W87A 4R5EA 2RGLA 4AC1X 2ZXDA 7A3HA 4YHEA 4D6JA 3WSUA 1EO7A 3THDA 3W29A 3OGRA 2FGZA 2XSAA 1BG9A 4IPNB 4UR9A 1C8XA 3KE0A 1VFFA 2WB5A 4AY1A 4Z2KA 2DT2A 2CBVA 4P8UA 4PN2A 4ZXOA 3BAIA 4PMOA 1O6IA 2YLAA 3PZOA 4DM1A 3VKKA 3LPGA 2ZUTA 2A3BA 1JXKA 1GQKA 4ML4A 3PZUA 5ABFA 4E8DA 3I3EA 3THCA 2TAAA 2OWXA 1HKKA 1QHPA 2WANA 4AMCA 1QBAA 3WDHA 1C92A 1JYXA 4MADA 1AQHA 5GQBA 3NDYA 2D24A 2VR5A 2YLLA 4EANA 2WZIA 4W93A 2G3IA 3AIRA 1E6RA 4EE9A 3AIQA 3RCNA 1BSIA 3NSXA 3WUGA 1ISXA 3CHCA 4GPNA 4J3XA 2VL4A 4CU7A 3UESA 4CCDA 1H5VA 2GFTA 3N12A 3PZ9A 1J0ZA 3ZR5A 4A4AA 3BAJA 3AZRA 1WAWA 2VURA 2ZUVA 2WMIA 1UR8A 5E0CA 2VUYA 4H2CA 4ACZA 5I23A 2D0FA 4RE2A 2WMKA 3AIBA 3L2MA 3L4WA 1CENA 2J7HA 3KWXA 1H09A 3AS2A 2DQXA 3GXIA 1UZ4A 3VINA 5BXSA 4MAVA 3VU2A 1TG7A 1ZBVA 3EBVA 2VZSA 2UWFA 2W67A 1W3KA 1CGTA 1HJWA 1E6SM 4ATWA 5E9AA 1CIUA 3M07A 4DM2A 2J7FA 2VNCA 2NT1A 2JE8A 1HJXA 3PBGA 4QCFA 5E09A 4F9DA 4OIFA 1E4IA 3VMNA 3K1DA 1D3CA 4UFLA 5CXPA 2YDQA 4PMDA 2WBKA 1BPLB 4ZE5A 1V3JA 1XYZA 2J62A 3RO8A 4JAWA 5EBAA 5A69A 4MB1A 5CSUA 3PN8A 1V02E 1OBAA 3BXWA 1W9UA 1HKJA 5CLWA 4HZ6A 1WDRA 2J4GA 4ZENA 3AYRA 2EPKX 4IM4A 1OIMA 3AZTA 4BS0A 2CHNA 2CEQA 1OT2A 2GJPA 3GYCA 1VIWA 4AZ6A 5M3WA 2WC3A 2DPEA 1ODUA 3F5JA 3OG2A 4V2XA 3MUY1 4MJ4A 3J7HA 1JI1A 1UR9A 4PBGA 1WNOA 4FLRA 3GM8A 2XSBA 2JF7A 2FHFA 4UOQA 2BHZA 1BF2A 3BGAA 1ZJAA 4U33A 3T2OA 5IHRA 1V6UA 2BHUA 3MSDA 2JIWA 2O9PA 3VILA 4DWSD 3MSGA 4XB3A 4PTMA 5BCAA 4GO9A 3PHAA 3WH9A 4XUYA 2W61A 3AROA 1GNXA 1JYNA 1ISVA 4A3HA 1UH4A 2VZUA 1LL4A 3PZMA 2WBGA 4PYSA 5FCZA 1BFNA 1J0KA 4FLSA 5LA0A 4D1IA 4UOJA 3OLIA 3UG4A 1KR0A 4JCLA 2OSYA 4CN1A 4KRTA 3M46A 2EXOA 3VDAA 1RD6A 4NZCA 1MFVA 4UQDA 2C8NA 3L4XA 1NOFA 3FY1A 2W63A 3VD5A 1KGXA 1TA3A 1V0LA 4X0NA 1E4NA 3GXDA 2G3NA 2XVKA 3RIKA 1J0YA 4GO8A 2VOTA 1DTUA 2WVUA 4CD8A 2CKRA 1CGXA 4W8BA 3TOPA 4WIWA 4AZIA 1WDQA 3KEHA 2F61A 2W62A 3QHOA 1LF1A 4W89A 2WLZA 3CBWA 1JDAA 3LPPA 1UQZA 1VBUA 2WLYA 2YL6A 3WQ5A 1TFVA 2WAGA 4ACZB 1B31A 3WNOA 2QHAA 1E4LA 1TZ7A 2WVVB 3AHYA 2ZUNA 4UTFA 1IZKA 4JKKA 1KXHA 1GHSA 1LWJA 1CBGA 4EKJA 3WD1A 3T0DA 5HOSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4J3T A;  1B3X A;  4MAZ A;  2FH6 A;  1RH9 A;  5IFP A;  4QDM A;  3N1A A;  1BYB A;  4D6G A;  3S2C A;  4U2Z A;  1UD2 A;  1CTN A;  1B3Y A;  1E6Z A;  1NH6 A;  2EPO A;  1WO2 A;  4DWS B;  3VIG A;  2BY1 A;  1GVY A;  4OUE A;  2WMJ A;  1CXE A;  1W9B M;  3N9K A;  5A6S A;  1QI2 A;  1EO5 A;  3ALF A;  1VRX A;  2ZWZ A;  4AZ5 A;  1OIN A;  3BLK A;  4LYR A;  1DHK A;  1OWQ A;  4XZB A;  5FD0 A;  1B90 A;  4W86 A;  2D0G A;  1J01 A;  3WF4 A;  3VIM A;  4ZFM A;  1OB0 A;  1LLO A;  2PF0 A;  2ZE0 A;  3WF1 A;  1UG6 A;  2G4F A;  4NRR A;  5HDR A;  3WMB A;  2X0H A;  4PSR A;  5CLT A;  4CN6 A;  2WKG A;  4PMZ A;  3A4W A;  3MV1 1;  1MQP A;  1DED A;  1CLV A;  2WVT A;  3VGB A;  4M8U A;  4PMN A;  4Z2H A;  5IFT A;  4MPK A;  4FLO A;  3SCR A;  3ALG A;  3OLG A;  4P7L A;  3RPM A;  4J3U A;  4CD4 A;  5LYR A;  2V3G A;  1US3 A;  4HMD A;  2CBI A;  1R8L A;  2BV9 A;  1Q6D A;  1Q6F A;  1ZU8 A;  4M80 A;  2D3N A;  3VII A;  3VGD A;  2WCS A;  1WZA A;  1UWI A;  5A2B A;  3WFL A;  1CWY A;  4JHO A;  3WUE A;  1B30 A;  3T0B A;  3WH8 A;  4E4P A;  3GBE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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