1G0C | Genus

Total Genus 127

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	127
sequence length	358
structure length	358
Chain Sequence	PAGMQAVKSPSEAGALQLVELNGQLTLAGEDGTPVQLRGMSTHGLQWFGEIVNENAFVALSNDWGSNMIRLAMYIGENGYATNPEVKDLVYEGIELAFEHDMYVIVDWHVHAPGDPRADVYSGAYDFFEEIADHYKDHPKNHYIIWELANEPSPNNNGGPGLTNDEKGWEAVKEYAEPIVEMLREKGDNMILVGNPNWSQRPDLSADNPIDAENIMYSVHFYTGSHGASHIGYPEGTPSSERSNVMANVRYALDNGVAVFATEWGTSQANGDGGPYFDEADVWLNFLNKHNISWANWSLTNKNEISGAFTPFELGRTDATDLDPGANQVWAPEELSLSGEYVRARIKGIEYTPIDRTK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of alkaline cellulase K: insight into the alkaline adaptation of an industrial enzyme. pubmed doi rcsb
molecule keywords	ENDOGLUCANASE
molecule tags	Hydrolase
source organism	Bacillus sp.
total genus	127
structure length	358
sequence length	358
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2000-10-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1g0cA00

4ZFMA 1HL8A 4S3JA 1W1TA 1XD1A 4A3HA 4Q22A 1BG4A 1VJZA 1UD8A 4NZCA 2VI0A 2J7HA 3SCNA 3CHFA 3GTNA 2RGMA 4J3UA 4WIWA 2CETA 5F7UA 2GK1A 4IISA 1GJWA 1CZ1A 2VX5A 4GQQA 4JFSA 2ZX9A 1H41A 4NSBA 3CUFA 1J18A 3VD7A 7CGTA 4OIFA 5I23A 1BFNA 4QCEA 1PPIA 5AYIA 1GJUA 5JUVA 1FP8A 1XHGA 1JZ5A 1C8XA 2V3GA 3EDJA 4H8HA 4N0RA 1VAHA 1OBAA 3BC9A 4J3SA 4X9YA 1DWGM 1UD6A 4GZEA 1GOQA 2WWCA 2UY3A 3VIMA 2VJXA 4PSRA 4D72A 1HNYA 1JZ3A 4CD7A 1LL4A 4QLJA 3VDBA 3WH7A 4M29A 1BVZA 3QR3A 4X0NA 4UCFA 3DYMA 4AZHA 1JYVA 3AROA 3T09A 5E70A 4PMNA 1WE5A 1VFMA 2G3IA 2NT0A 1GCYA 4H8UA 1X6LA 4WF7A 3A47A 3W29A 3EBVA 1UOKA 1OCQA 5ABFB 1Y7VA 4AEFA 1EQCA 1E1EA 3APGA 2G41A 2GVYA 2MANA 1JFXA 4HOWA 2VVSA 4P8WA 3KEHA 4X0VA 3AIRA 1KXQA 3BCFA 3VIIA 4MAVA 3ZSSA 3DYOA 1CPUA 2YDQA 1E71M 3VNYA 3OGVA 5HXMA 1WKYA 3BXWA 3PN8A 1GW1A 3SCRA 5IHSA 4W7WA 4UOZA 1M03A 2DIEA 1TA3B 2YA1A 7A3HA 4BS0A 2D3LA 5LA0A 3WH9A 4P7QA 5FOOA 4B9ZA 4DM2A 3FY1A 4TX8A 1MFVA 1V3JA 2D0FA 2DQXA 4ATWA 2XWDA 4YHGA 1UD4A 4AZCB 2PWDA 5FCZA 4RE4A 3L4ZA 3AIWA 1E5NA 3ARZA 5A94A 1I1XA 2GDVA 3EDEA 3T0DA 3N1AA 1UR0A 3AMKA 3CO4A 1ODZA 1V0NA 1WDRA 3VIJA 3I3EA 4CCEA 4B9YA 3BAXA 4J3WA 1JNEA 3AIBA 1PX4A 3TOPA 1GORA 3CZLA 2QF8A 2XFYA 2D20A 4HOZA 3K8LA 4HA3A 7TAAA 4A4AA 3AXIA 4AD4A 3OZOA 4PMDA 1UA7A 1QI3A 4M8UA 2W5FA 1B3WA 3LMYA 5FL0A 2E40A 2VX4A 3GM8A 3ALGA 3IANA 5A6BD 2DH3A 1NWSA 5E6ZA 5D8WA 3VDAA 1E56A 4TVDA 1E4NA 3A4XA 4XUYA 1H3GA 1QHZA 3ZR5A 1EIBA 2B31A 4TVUA 5ABEA 5ABHA 5AC5A 3WFLA 4P7RA 4UOQA 4JKKA 2WM0A 1JYXA 1CXIA 1JD9A 3WBEA 3WQVA 4PMOA 1V0LA 2VRQA 2XGBA 3BMVA 3UR7A 4CD5A 4DWSB 1Q6DA 2BHUA 5FL1A 3L2LA 3ARXA 2PC8A 1ZBWA 3CH9A 1VEMA 3UETA 1LG2A 3W82A 3CGTA 9CGTA 2A3BA 1FFQA 3HJEA 2D2OA 2PWFA 5GPRA 4PN2A 1UR2A 4L4OA 4CGTA 2O9OA 1W1YA 4JCLA 2BXZA 5LA1A 1IZJA 2VX6A 3ZJ6A 1JL8A 1ZB5A 3AZRA 4J3VA 4H2CA 1BTCA 3W6MA 5A6JA 2ZUTA 5A6AA 4LX4A 1JAKA 1ZU8A 3VNZA 5A1AA 2EEXA 3NSXA 1FH8A 2ZUMA 2J75A 1BG9A 1UH4A 2AAAA 1E6SM 1XRVA 1KCLA 2XFFA 3RJYA 4D1IA 1W91A 4TVCA 2ESCA 2YL8A 4HP5A 1Q6EA 3FW6A 1V3HA 4UQEA 4MADA 3VD3A 3VINA 4BQ2A 3SUTA 1MFUA 4PMVA 4HTYA 2WCGA 1UKQA 5I24A 1E6ZA 3WUBA 1UHVA 3BAYA 5HPCA 2QPUA 3TTOA 1B9ZA 1VFFA 5FKYA 1EOMA 3WNOA 1M01A 3WY1A 4PBGA 1W9PA 3PZOA 4AIOA 2CPUA 2WZIA 4V28A 3SCVA 1EQPA 3GH4A 4A3YA 3SIMA 4PYSA 1W3JA 1BYAA 1DWFM 4WKFA 3U57A 3MUZ1 4BQ4A 1BGGA 4ZXLA 3L4YA 1VBUA 1UR9A 2D3NA 1NP0A 5ABFA 4MNKA 3A6OA 2QV4A 2FDMA 4W87A 2VR4A 4HMCA 4D6JA 1PIFA 1W9BM 3ZM8A 4QP0A 3NDYA 1CTNA 5A8QA 4CCCA 4LYRA 2GJPA 2W4XA 1E6RA 2WBGA 5BWFA 1GQJA 1HJXA 2ZE0A 2CKRA 1A3HA 1H5VA 5CXPA 5I0DA 3IJ9A 4MB1A 1ZJBA 1UKPA 1ITCA 4FLOA 3NSMA 3CUGA 3WH5A 2J78A 2ZUWA 4U5KA 3IJ7A 4E4PA 1JXJA 3T0AA 1TA3A 1CGUA 5IDIA 1KWGA 3WL0A 4AZIA 1KWKA 4Y7EA 3CZJA 5I5RA 2XJ7A 1JZ6A 1CGVA 3KL3A 3ARYA 1AQMA 1MYRA 2VCCA 3NSNA 1GNXA 2W91A 4RL3A 2C0HA 2WNWA 2VR5A 1VRXA 1QPKA 4KMQA 4UNIA 4AZCA 4AD2A 3N13A 3VMNA 3UCQA 2JFEX 4QLLA 1UD5A 3MMUA 4TTUA 1Q4NX 4W89A 3UEQA 5CJ5A 3WDRA 3MUY1 2D23A 3EDKA 3I3DA 1GUVA 1R7AA 3QGVA 3II1A 1XH2A 3EYPA 1OGBA 1MQRA 1NWUA 4HZ7A 3GXMA 1J10A 1AMYA 1KFWA 4XB3A 4HMEA 4D1JA 2Y5EA 3CUHA 4HU0A 4OZOA 3ZR6A 5JBFA 3T2PA 1MW0A 3M7SA 4W88A 4OUEA 1UH3A 1J01A 3FN9A 2D0HA 1WZMA 4MPKA 3L4WA 2YLLA 1EOKA 1ESWA 1E5JA 2WC3A 3VGDA 5A69A 3L4VA 2ZWYA 2WB5A 1TZ7A 5CLTA 1B3VA 1SR0A 4CUCA 1R85A 2XIBA 3GH5A 1W1PA 3S6TA 4H8VA 1B3ZA 3RMEA 2VL4A 4TXEA 4DWSA 1J0KA 4HPHA 1QNPA 3N04A 3WQ5A 1C7SA 1FH7A 3B9EA 4H41A 5D9PA 1CYGA 5LA2A 2OLHA 1M04A 1ZBKA 2PWGA 1H09A 4NI3A 3HU7A 4PCSA 2GSJA 4FK9A 1MVYA 2YIHA 4F9JA 3T2QA 2A3HA 5DMYA 1NM9A 2J7EA 1ZS2A 2PWEA 3OGSA 4IM4A 4TX6A 5E09A 1BYCA 5FD0A 4S3KA 4TOQA 4YHEA 3GH7A 3NDZA 6TAAA 1QBBA 3LPFA 1GOWA 1NOUA 2WC4A 3VGGA 3VMPA 1HKIA 1UH2A 1UYQA 3SCSA 4NRRA 4RE2A 3AMLA 1V6YA 1HP5A 5CPQA 4UQDA 2WLYA 3LPPA 1IZKA 3W0KA 3GYCA 3BAKA 3CZEA 2DIJA 2WLZA 4C7GA 5E0CA 3W81A 1GOIA 2NSXA 5BXSA 5C70A 3ARVA 2WC7A 3RM8A 2DSUA 2VZTA 1XSIA 3VU2A 3GXFA 3TTSA 3VIFA 4D6FA 2XVKA 1HVQA 4UFMA 4PSPA 3N18A 4IUGA 1BSIA 4AIEA 1HN1A 1CBGA 1KR0A 2WKGA 3L4UA 2AOSA 2WWDA 2A3EA 3M6DA 3NIYA 1XSKA 5A95A 5I78A 4B15A 1E6XM 4B3KA 5GNZA 2XTKA 1UQZA 4PMZA 5ECUA 1GOOA 3OB8A 1QI5A 3G6LA 2WXDM 1E1FA 1QI2A 1ZJAA 1JZ8A 1EO7A 2FH8A 3IAQA 4XV0A 3PZGA 3GBEA 4GZJA 3QOKA 2V3DA 2V5DA 4P8XA 2XIIA 3WKZA 3PBGA 1QI0A 2YL9A 1MW1A 4UFHA 3PZTA 4CD4A 4F79A 2WMHA 3AISA 4XX6A 4Z2KA 4BF7A 1C91A 2NW0A 1AVAA 5AY7A 1E0XA 2X0HA 5CGTA 1E55A 2FHBA 2YBUA 4W85A 1JYNA 4EANA 1TVNA 2Y8KA 2JF7A 2OWWA 1CGWA 1H49A 3ECQA 1TVPA 4F66A 1VFOA 2E3ZA 2ZXQA 3GDBA 3K8KA 1UR4A 3I3BA 1F4HA 1UQYA 2C7FA 4U2YA 3ZOAA 2JE8A 1OD8A 1E3XA 3NUKA 3UR8A 5BROA 1L8NA 1WCGA 1WZAA 5A6MA 3AJ7A 1JIBA 4CN4A 4CD8A 3MV11 5IXEA 2Y4SA 1TMQA 2YLAA 4JCMA 1EHNA 1UR8A 4PRWA 3GNOA 1EO5A 1JDDA 1QW8A 5I77A 1VBRA 4UZSA 1JNDA 4GQRA 2PI6A 4OBRA 3GBDA 1TR1A 2DPEA 3CZKA 4JIEA 2PWHA 1QW9A 4PMQA 4UFLA 1GOMA 3EMCA 4MAZA 3VUPA 4CU7A 3O6AA 5A2AA 1JG9A 1JF6A 1UWSA 3DYPA 5BXTA 3W28A 2CESA 3BMWA 4AZ5A 5GQBA 3CPUA 4AD1A 3D3AA 2VOTA 3ZO9A 2IUZA 1LJYA 3SUUA 4PMUA 1CIUA 2D0GA 4JL1A 2BY2A 5CPSA 1W9XA 1JDCA 1CECA 1QVBA 2DH2A 4R27A 1WB0A 3AIVA 3ARWA 2DSKA 4MNMA 1B31A 2BVDA 4PTXA 2HISA 1OT1A 1XYFA 3MSDA 1J0ZA 1S46A 3K8MA 3RJXA 2VUYA 3WD4A 3O9NA 4MNJA 2DEPA 5CQ1A 2WMGA 1WZKA 5EBAA 5HDRA 1HX0A 3VX1A 1WDSA 3DC0A 1BPLB 2ZX5A 1F4AA 4ML4A 2CBIA 3ZQ9A 5M5DA 4LXFA 1VJSA 1E0WA 3DHUA 3KWXA 5A6SA 2XVLA 4PTVA 4W93A 2OWCA 1VFUA 1ODUA 1E6NA 4W5UA 4AWEA 2V38A 3OLIA 3L2MA 3DECA 1PZ2A 2Z1SA 1H4PA 3W6LA 1NQ6A 2JIWA 1OSEA 2OWXA 4D6GA 1D2KA 3VDCA 4MTVA 4JHOA 4IPNB 4Z2JA 1W3HA 3VPLA 2J7FA 4Z2IA 1I1WA 1CXHA 1HXJA 3AMCA 1GHRA 1H0GA 1O6IA 5HBFA 4FMVA 4AD0A 2VQTA 5AC4A 3AHXA 1YQ2A 5C8BB 5IFPA 2W66A 2VX7A 4UZUA 2EPOA 1KGWA 2WMKA 3QHMA 4AD3A 1SMAA 4W86A 1KCKA 2EJ1A 3MKKA 4D6DA 2BHZA 3VTRA 1GQLA 2GJXB 3HMCA 2WZEA 2EQDA 5KEZA 2EPNA 2ZX6A 1H11A 2BV9A 3RPMA 3LPOA 3F5LA 4D6CA 3ZIZA 5CLWA 1J9YA 3M07A 3WUFA 3O2LA 3AHYA 4D6HA 5A6KA 1AQHA 4DWSC 1OWQA 4GIAA 4RE3A 4TTGA 2D24A 2JF6A 4LYPA 3SUVA 1HJQA 3UG5A 1W9VA 4OBSA 2YL5A 1VEPA 1W9DM 3MU7A 5A2CA 5FIPA 3AS2A 1XSJA 2FHCA 4W8LA 2XWEA 2J25A 3MMDA 2W62A 1BVNP 3WBAA 2OSXA 3AXHA 3AIQA 2NT1A 4DUVA 5BRPA 4U33A 2VZUA 1VEOA 1J0JA 4QFUA 3U7BA 2E0PA 2HVMA 1JD7A 5M17A 1VENA 1KXTA 2D1ZA 5D9OA 2OYKA 3A4AA 5E9AA 1CXLA 1UWRA 5GNXA 1WP6A 1LL6A 4KWUA 5HPOA 5D9NA 1R87A 4HOXA 5I3DA 1HVXA 3WDIA 1TCMA 5EFDA 4HZ8A 1ZL1A 3AXXA 4URIA 5M3WA 1OGSA 2RGLA 2PBGA 4U31A 2PF0A 1JI2A 4JKMA 1IT0A 3CMGA 1DWIM 1ECEA 4MJ2A 2WVUA 3VGFA 2F8QA 4AY1A 1BF2A 1EXPA 3BLKA 2CKSA 5DEZA 4OKDA 2VZOA 1LWHA 1JXKA 4FF5A 4R5EA 2EPKX 1J0HA 3AHZA 3MMWA 3CUIA 2YA2A 2WW5A 1NH6A 3VGHA 1XD0A 1J12A 1C8YA 2VRJA 4IPLA 3UG4A 1X1NA 3AYRA 3BSHA 1HL9A 4U5IA 1PBGA 1JZ2A 1EDTA 4ATDA 3L4XA 3AS3A 3AZTA 4UQBA 4JFWA 2J47A 1OIFA 1M53A 4GI8A 3A4WA 1E6QM 5EMYA 5KZ6A 3MV01 1H0IA 2GJRA 1U30A 4JFUA 3K4DA 4N42A 4JAWA 3BAIA 2ZUNA 3W27A 4B16A 3BSGA 2EPMX 4JHZA 2VRKA 3ZT7A 2BHYA 2Y2WA 1WDPA 4P8UA 1E0VA 3FXYA 3AIUA 3U5YA 1B3YA 1E4MM 3WL1A 4QCFA 1XCWA 3OLDA 1ZBCA 3RCNA 1C3FA 3SCPA 4MB5A 1CWYA 1UWQA 2J7GA 5I2UA 1QHOA 2VT0A 1WDQA 3WENA 4AZ6A 3W38A 2XSAA 2UY5A 2J79A 2YA0A 4F9DA 1JAEA 2X8RA 1LL7A 2WHMA 3WD3A 2AMGA 2JIEA 1HKKA 1GOKA 1XV8A 3MUIA 1PAMA 3F5KA 8CGTA 3PTMA 4HZ6A 1KB3A 5I79A 2YDRA 4AZ7A 1HJSA 3WUGA 4AW7A 5A8NA 2DSVA 1EDQA 1V03A 4CN1A 1GPFA 1G5AA 3WF1A 3VD9A 3T08A 4OOZA 1B0IA 1R86A 2CBVA 2VMFA 3WDQA 3VGEA 1BQCA 5CZKA 1V6VA 4CU6A 2YDSA 1GONA 4ZXOA 5JBEA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4BQ3 A;  4HU8 A;  1UWI A;  5CSY A;  2XVG A;  1V6U A;  3TA9 A;  3CHD A;  1B2Y A;  3PZI A;  4GZI A;  2Y24 A;  1EA9 C;  4UOJ A;  3WF0 A;  3ZMR A;  4CVW A;  1CGT A;  3HN3 A;  4QAW A;  4J27 A;  5DF0 A;  1CXF A;  5CPT A;  4AEE A;  1DWA M;  1B1Y A;  2CYG A;  3JUG A;  1KQY A;  3IJ8 A;  1QOX A;  2WVV A;  2XPK A;  5IHR A;  4HA1 A;  1TFV A;  4AD5 A;  1RD6 A;  1V3L A;  1E43 A;  1R7O A;  2V3E A;  1FP9 A;  4MNL A;  3SCT A;  1V02 A;  3AYS A;  3J7H A;  4Q7N A;  2XM1 A;  3F5J A;  3CLW A;  1UWU A;  1VB9 A;  4P7L A;  5DT5 A;  1HT6 A;  2W92 A;  2XHY A;  3VM5 A;  1EH9 A;  1W3K A;  4PUD A;  1FHL A;  2CEQ A;  1JF5 A;  1GQI A;  6A3H A;  2WAN A;  1UZ1 A;  3WD2 A;  2Y8V A;  1JDA A;  2CXG A;  1FHD A;  2XVP A;  3MS8 A;  4GI9 A;  3AMG A;  3TTY A;  1NOW A;  2FH6 A;  2J8G A;  1W9U A;  2ZX7 A;  1OB0 A;  1H2J A;  2ZUS A;  3VKK A;  2ZWZ A;  2QMK A;  3AIC A;  1C8Q A;  4KGL A;  1ISZ A;  1SYT A;  1C93 A;  1A47 A;  2CER A;  2WZH A;  2FGL A;  2WK2 A;  2DSW A;  1XYZ A;  2WHJ A;  2G4F A;  3WMC A;  2XUC A;  2CHO A;  1WO2 A;  3WF3 A;  4CVU A;  3WMS A;  4GKL A;  1BGA A;  2WSK A;  2ZID A;  8A3H A;  1V6X A;  1MXG A;  1JFH A;  1O7A A;  3GXD A;  4P8V A;  4ZEP A;  2IXU A;  5D9M A;  3B8S A;  4XZB A;  5A8M A;  1DHK A;  3W4R A;  1FH9 A;  1RP9 A;  2A3A A;  3RM4 A;  3AFB A;  3POH A;  4OJY A;  2V5C A;  4PTW A;  4K68 A;  1CEO A;  1SFS A;  1QNO A;  1JYW A;  3THD A;  2WCS A;  2EBN A;  3ZJ8 A;  3MUA A;  5CGM A;  4KRT A;  1L0P A;  5A8O A;  4P7O A;  4CKQ A;  3QHO A;  3NJ3 A;  3B9A A;  3ZJ7 A;  3ZJK A;  2QHA A;  4YN5 A;  4UQ9 A;  3F4V A;  3TP4 A;  1J11 A;  4L4P A;  5BCA A;  1D7F A;  3KZS A;  1IV8 A;  1NWT A;  3CUJ A;  1CNV A;  2WBK A;  1W32 A;  1FFR A;  1QNS A;  1HF6 A;  5A8P A;  4FLR A;  5HOS A;  2J7C A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1G0CA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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